2NRUA

Crystal structure of irak-4
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
295
structure length
293
Chain Sequence
RFHSFSFYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLAAMVDITTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGINFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFTAKISDFGLARASEKFAQTVMRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDKKMNDADSTSVEAMYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQEMT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Interleukin-1 receptor-associated kinase 4
publication title Crystal structures of IRAK-4 kinase in complex with inhibitors: a serine/threonine kinase with tyrosine as a gatekeeper.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 293
sequence length 295
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2nruA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2nruA01
1WBTA 3NVKI 3LFSA 4H36A 2FA2A 2XUUA 5LJJA 3GP0A 4IH8A 3POOA 4F9BA 4AGDA 4EJ7A 4HYIA 2P3GX 1TVOA 1JPAA 3JR1A 4U80A 3ZZWA 5FTQA 3CD3A 4F7SA 2XIXA 2OG8A 4IIRA 1BKXA 3A7HA 5C4LA 3OOGA 4B8LA 1M2QA 5DOSA 3JYAA 3VUIA 4USEA 3RM6A 4FF8A 4B4LA 1YXVA 4C0TA 3LCSA 2F57A 1YRPA 3E88A 1OZ1A 4ERWA 5KCVA 5CNOA 4RFZA 4BYJA 1OUKA 5IA3A 3DKFA 4ONAA 4ZTRA 4CFXA 4K11A 2R3NA 4FYNA 4CV9A 4BCGA 4TYHA 1ZYJA 2ERZE 1O6LA 2J0IA 2R3FA 2XJ2A 3FWQA 2C6KA 4G6NA 4IDTA 2WO6A 2WU6A 3GC7A 4D4SA 3GU8A 1H1WA 2VWWA 4AQCA 2UZDA 4PMSA 2OSCA 4YHFA 5BPYA 5EQYA 3G90X 5AR2A 5C01A 4LM5A 3ORNA 1OITA 2KULA 1V0BA 1ERKA 3R7OA 3OXZA 3LQ5A 5TR6A 5DE2A 3BV2A 3QCXA 1OKWA 3PFQA 4FV7A 4YC6A 1E1XA 3GU6A 3NX8A 2HY0A 2QHMA 2W1HA 4FZAB 4QTBA 5AV3A 4CMTA 3EQFA 3O51A 1KV2A 5CANA 4FEQA 4DTKA 2R4BA 3U51A 5HBHA 2UVYA 3HV7A 3B2WA 5AUXA 4BWKA 5D12A 5DR2A 2GMXA 3UDBA 2Y6MA 4NIFA 4FTLA 3P7CA 2QOKA 1OECA 5B7VA 3AGMA 5IF1A 2G9XA 3TNPC 5IG1A 2UUEA 3LJ0A 4BDIA 4PP7A 2QG7A 4D58A 3D2IA 4LYNA 4NYEA 3QQHA 3DBQA 2C68A 3LKMA 2ITUA 5CAPA 3G15A 5HNBA 4RLKA 3KKVA 1XH9A 3FKNA 1VYWA 3PZHA 2BPMA 4GYIA 4RX7A 4YJOA 5G6VA 2B9JA 5KZIA 4IM3A 4RVMA 3HL7A 1CMKE 3DDPA 4TPTA 4FL3A 2CCHA 2VTAA 3QC4A 4KKEA 4AW0A 1G8SA 2X7GA 4FICA 2AC3A 4RIOA 4V01A 4CT1A 4BKZA 3QTZA 4ENXA 3BHTA 4IWOA 4WIHA 4C34A 4QYHA 3AMYA 5K4JA 3DK6A 2Y4IB 1IA8A 4EL9A 4UMUA 2NP8A 5HCXA 5HO7A 4PL3A 4FYOA 3PJ1A 5ACKA 4AN3A 4O2PA 5C9CA 4EH7A 3UNKA 4ZSJA 3PXRA 3A8XA 3I1AA 5EKNA 5GINE 5IU2A 5J8IA 5D7AA 3ZYAA 3QRJA 4DC2A 3R28A 3WF6A 4E4XA 1Q24A 5BVFA 4C59A 2XA4A 5FQDC 2FVDA 4WKQA 3H3CA 2JDTA 4QMUA 3Q6UA 3VJOA 2O5KA 3PA5A 4UB7A 4WHZA 5J79A 1XR1A 3DQWA 3Q52A 3NWWA 4BCKA 2X1NA 4TWPA 3F5UA 2W1ZA 2QC6A 3LW0A 4QMVA 3ZLYA 3C4FA 2A27A 5AV2A 5DYJA 2UW7A 2PVMA 2YISA 3SGCA 3H0YA 5E8XA 3D14A 3O50A 3RPYA 5CAQA 3OWPA 4FSUA 5DWRA 4ANNA 4FV5A 4XLVA 3W8QA 1OB3A 4NJDA 4QTCA 5BNJA 2C3KA 2A1AB 2HW7A 2YEXA 2ZV8A 4JG7A 4X21A 5HOAA 4ANQA 2R3MA 2C6IA 2XJ0A 3EOCA 4GJ2A 3TXOA 3ZONA 3W32A 2QHNA 4F9CA 4YSJA 1GAGA 3PUPA 4QMNA 5EDQA 2VWUA 5DMZA 3VQHA 1G3NA 4DBNA 3HKOA 1NT2A 4O7SA 4FKUA 2JAMA 2XP2A 1M7NA 2QG5A 2PSQA 3G2FA 3FPQA 4J96A 5IUGA 4O6EA 5AFVA 2HZ0A 2FSLX 4DH8A 4CKRA 2JKMA 5CU3A 4O0XA 4AFJA 4RX5A 2X2KA 4PMTA 4F4PA 5HNIX 1A9UA 4ZLYA 1DS5A 4MWIA 4YJSA 4FUYA 4UV0A 3S00A 2J0LA 3GNIB 3QZIA 3WIKA 3R8ZA 2YM8A 2VTSA 2FO0A 2V22A 3VWAA 3MW1A 3OC1A 1XWSA 4O96A 4W8EA 3R8LA 4IDVA 4MF0A 3UVQA 2XNGA 3SKCA 5BVDA 5AAEA 3TEIA 5HU3A 4JAIA 4F7NA 4G34A 1VR2A 2VV9A 4FGBA 1YXSA 4RGJA 4WBOA 4BBEA 4GT5A 1M14A 2G2HA 2OFUA 3ALOA 3QKLA 1WBVA 3UOHA 2NO3A 4BR3A 4UXQA 2IPXA 3DKOA 3E3BX 1RW8A 3U4WA 5CEIA 4E5AX 1M2PA 3G9LX 4LRKA 3EN6A 3C5IA 2XNOA 2YIRA 3O8PA 4KIPA 3ZZEA 5GJDA 1BX6A 3UZRA 2GS2A 1BYGA 4FKTA 1GNGA 2J90A 3I79A 4EK4A 2CGWA 3LCTA 3PRFA 4IB5A 1FMKA 3V8TA 4RIYA 4EQMA 4ID7A 1HOWA 2UZWE 2CN8A 3VBXA 5TO8A 4BFMA 2CKPA 1OPJA 1H01A 1Z9XA 5IQFA 4XG6A 3Q4TA 3DJ7A 5DN3A 1JKTA 3FQHA 1RQQA 2I0YA 3FZSA 2FSOX 2DYLA 4R5YA 5FXRA 1BL7A 2XKEA 1OM1A 4GYGA 2UW5A 3R2BA 2RGPA 1IG1A 2R7BA 2A4LA 3KXMA 3MFRA 1J7UA 1ZOGA 4JDJA 4FEXA 3EL7A 3TIZA 3NUPA 1TQIA 4XBUA 4U81A 3AT2A 5LXMA 4H3QA 4J53A 1WBPA 3DA6A 4ZSEA 4W4YA 5DIAA 3L1SA 4YO4A 4ZY4A 2HW6A 3LFBA 3Q9XA 4C2WA 3JY0A 4CCBA 2QOQA 4A07A 5FP6A 3BQRA 3NCZA 3NUSA 3OEZA 2VUWA 3Q53A 5EI6A 3ZSIA 4CVAA 5IA2A 1Z57A 4CG8A 1APME 4IXPA 3IGOA 2YERA 5ANDA 5A14A 4C4FA 5JFVA 5AADA 5HBEA 2XEYA 3L9PA 3R7IA 3MB7A 4X2NA 4XS2A 4RX9A 3TJDA 4U6RA 4UXLA 2OJ9A 1XO2B 4PRJA 4L7SA 2J6MA 3TWJA 5GJGA 1LEWA 4RA5A 4D2TA 5A6OA 4OAVB 4FKLA 1OUYA 3AMAA 1WZYA 3K2LA 4IVDA 3RPVA 4NKSA 3UG1A 2EXMA 3MPTA 5EHYA 2PZPA 5E8YA 4C35A 4G6LA 2OIBA 1PRYA 5KX8A 5BMSA 4IZ5A 4CZYB 1PMUA 2O65A 2YITA 3Q32A 3HA6A 4EOKA 3RTPA 1DI8A 5ICPA 3R02A 3CD8A 5EYCA 3ZUVA 1GJOA 4DGOA 3IS5A 5BUIA 4TTHB 2RIOA 4RJ4A 3WARA 3V8SA 1PMVA 2R3IA 5L2QA 2YIQA 5J9ZA 4U3ZA 2JC6A 4M15A 4FV4A 4Y95A 2R0IA 3UOLA 3VULA 4F08A 2YZLA 3Q2MA 3DB6A 4FT0A 4FG7A 2GDOA 3RJCA 1O6YA 5FXQA 3SW4A 4FR4A 1W82A 5EDPA 5AUYA 5KHXA 1G8AA 4H1JA 3QGWA 3Q4ZA 5EW8A 4F9WA 3NMUF 1I44A 1JSTA 4EH6A 4JX7A 1J91A 1QPCA 4FMQA 1R3CA 2B9FA 4O7RA 2BUJA 1IAHA 2DUVA 2XNMA 4FVPA 5HVYA 3RAIA 3ZO4A 5IQGA 3ZFXA 3OG7A 4ANLA 2V62A 3E63A 5L2SA 4O82A 5LMKA 4YC3A 2X9FA 1KOAA 1VEBA 4P90A 2XJ1A 3R2YA 2WB8A 4U97A 2QLQA 2W1FA 3O96A 4UX9A 3BHHA 4XLIA 2PZRA 4QPMA 3U4UA 4YTHA 4EK3A 3QD2B 4K8AA 3WF7A 1J1CA 3PLAE 5ACBC 2OIQA 5HGIA 1DAWA 5J87A 3TNQB 1ZYSA 4XG8A 1LR4A 1L3RE 2B53A 2HWPA 2VTLA 4QD6A 1KUTA 3A7JA 2W5AA 4I6QA 2KTYA 3DXQA 1OIQA 2XK8A 3VBYA 2PZ5A 3UO6A 3CQWA 3HA8A 3PP0A 3CKXA 5I4NA 3SRVA 4JX3A 4TW9A 5IDPA 4O22A 3CSVA 3OXIA 4PX6A 2HXQA 3FMKA 2CSNA 3IW7A 3UP2A 3IO7A 4EWQA 5KZ0A 3P08A 4PP9A 3EYGA 4U79A 2PVFA 2R2PA 2ACXA 2WTKB 4Z3VA 3TNWA 4E73A 1S9IA 2BZHB 3PG1A 2HAKA 2A0CX 1YXXA 3F9NA 3KRJA 4R3RA 4R78A 4I23A 4CFUA 3DAEA 4N0SA 1PYXA 4TYGA 4XRLA 3UO5A 2GS6A 2Z02A 1KE8A 1O9UA 5CALA 3HV4A 3II5A 3IW4A 1MP8A 3AOXA 3BBWA 3UVPA 3PVWA 4RWIA 4OW8A 4EHEA 4J71A 5J1VA 3F3WA 2EB2A 2IW8A 2LAVA 1PXIA 4CMOA 4YPSA 5AR7A 4D4RA 3PJ2A 1JOWB 3KK9A 4XRJA 2QOCA 2YIYA 3VS4A 4NEUA 4RIYB 3C51A 4RWKA 3F2RA 3GCQA 4TWOA 5DPVA 2UVXA 1Q4LA 3OWKA 4RWLA 4B99A 4IAKA 4BDBA 3OZ6A 2RFDA 4O83A 2Y0AA 3LZBA 4KBAA 4X3FA 4YBJA 3TIYA 5CF6A 2UW3A 3UTOA 4I6FA 3TG1A 4KNBA 3MJ1A 3RCDA 4IZ7A 4DH3A 1IASA 3ZM9A 3HDMA 4PTGA 2VZ6A 3F7WA 4FX3A 4OBOA 1VZOA 4IWDA 5CVHA 5BVEA 3RZBA 1NVQA 3ZC6A 4D5HA 4BI1A 3KRWA 4V04A 3EN4A 1H26A 4TKSA 2RFSA 4BDKA 5L2IA 3QCSA 2ETKA 3OY3A 4JIAA 5CU6A 4TWCA 5HO6A 3Q4CA 1WVYA 3NVMB 3VNTA 4IJ9A 3QX2A 4FNZA 1WBSA 1WBOA 4KIKA 4I24A 4LI5A 5BX0A 5LQFA 3DBCA 3LQ3A 3OT3A 1OL7A 3N9XA 4DBXA 3F5PA 2QU6A 1TKIA 3U55A 1KWPA 4TYEA 2ZOQA 3PWYA 5C03A 2W1CA 4JQEA 3R8VA 2PPQA 1H08A 5KBQA 4F1OA 3B2TA 2R3PA 4II5A 3EQBA 2YCFA 4XV9A 3U6IA 3BZ3A 1BI7A 3DY7A 4FV0A 3QTQA 3JXWA 4FT3A 1P5EA 4IAFA 4GS6A 4I5MA 5DHJA 4DYMA 4IX6A 3QLGA 2R3LA 5IA1A 5B2LA 3QRTA 3OP5A 4TXCA 4F0GA 4FI1A 4EK6A 4M66A 3RI1A 2YCQA 3LXLA 1YXUA 2X4FA 3MY0A 3F5XA 4Y85A 3ZSGA 2VNWA 3WIGA 5IQHA 4ENYA 5CSPA 3QQJA 1K2PA 2GQSA 4LOPA 2J50A 2R3OA 4HGTA 5DEYA 4ASXA 5FXSA 2G15A 2ZVAA 3DCVA 4F9AA 4V0GB 3E93A 2NRUA 3VO3A 5J5SA 4L42A 5AP5A 2XIRA 4NW5A 4EZ5A 3BELA 3ZLSA 4OT5A 2J5EA 4YZMA 3HEGA 5EH0A 5FBNC 3BBTB 4G3CA 1B6CB 3H10A 4BZNA 3CEKA 4J99A 1UNLA 4FSYA 3ZU7A 2VX0A 3GVUA 4LGDA 1UU3A 3HVCA 5CQUA 1A06A 4RVTA 2PWLA 5AV4A 4M0YA 4GKIA 3ZO2A 1ZAOA 2X6DA 3BYMA 5A46A 2YIWA 2F7XE 3ORXA 4JLCA 3MTFA 4YTFA 1Q8TA 2GU8A 5H9BA 4LGGA 2YM3A 1PXMA 5AAFA 3ZBXA 5TOZA 4I0SA 2B0QA 3WF9A 4EWHA 3F88A 3K5VA 4Z55A 2XRUA 1ND4A 3SD0A 4QT1A 3MY1A 3PA4A 2OGVA 3B8QA 4DG3E 4CRLA 4MBLA 3AMBA 4IX3A 4C2VA 2VGOA 5AX3A 3TDVA 2XNNA 2XVDA 5AV0A 1Q3DA 3CQUA 5E91A 3RHXA 2WTWA 2B9IA 4RQKA 4RJ8A 3AD6A 4AZSA 4ZOGA 3UIXA 3ORZA 3EQPA 4RVKA 5EFQA 4E8AA 2V7OA 4AZFA 4EHGA 3DK3A 5AEPA 5LCJA 3F3TA 4K77A 4W4VA 3OOMA 3QGYA 4UWBA 2C0TA 3R73A 2QKWB 3R8MA 4FV6A 3FMNA 1H25A 3SLSA 3WF5A 4XV1A 4HCVA 4KWPA 4E3CA 3OBJA 5AV1A 4PQNA 2BDJA 3O23A 3SRVB 4H39A 4FNXA 4FV3A 5K5XA 5DG5A 1Y8GA 2QU5A 2Z7RA 5TF9A 5IUHA 4MK0A 2CCIA 3KXHA 5G1XA 1KE9A 5CEOA 5E90A 3G6HA 2G1TA 3PZEA 2ONLC 4MNEA 4QMWA 5FTGA 3O7LD 1LUFA 4E4NA 5CEPA 3MN3A 3R04A 1Q8YA 5EM5A 1WBNA 3DFCB 4U44A 4X0MA 4ZTNA 2BALA 2ITWA 4FZ7A 4MHAA 4LQMA 4MXZA 3RAWA 3HMIA 4AGUA 4HZSA 2XKCA 3W2RA 3OY1A 4O0SA 4EH8A 1UA2A 2OZAA 3BCEA 1PXPA 4WA9A 4MEDA 5TE0A 3R9OA 5A3XA 4D1ZA 4CT2A 2C6EA 4M69B 4ZMEA 2QO7A 3RK5A 2WXVA 1UKIA 5KE0A 4G16A 3F69A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4YJV A;  2C3J A;  3A7G A;  4N6Y A;  4NCT C;  1XBB A;  1Q3W A;  3KRX A;  4MBJ A;  4S2Z A;  5HID A;  1UNG A;  1U54 B;  1FGK A;  3VRZ A;  4MD8 E;  3ANQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3PJ1 A;  5ACK A;  4AN3 A;  4O2P A;  5C9C A;  4EH7 A;  3UNK A;  4ZSJ A;  3PXR A;  3UDZ A;  3A8X A;  3I1A A;  5EKN A;  5GIN E;  5IU2 A;  5J8I A;  5D7A A;  3ZYA A;  3QRJ A;  4DC2 A;  3R28 A;  3WF6 A;  4E4X A;  1Q24 A;  5BVF A;  4C59 A;  2XA4 A;  5FQD C;  2FVD A;  4WKQ A;  3H3C A;  2JDT A;  4QMU A;  3Q6U A;  3VJO A;  2O5K A;  3PA5 A;  4UB7 A;  4WHZ A;  5J79 A;  1XR1 A;  3DQW A;  3Q52 A;  3NWW A;  4BCK A;  2X1N A;  4TWP A;  3F5U A;  2W1Z A;  2QC6 A;  3LW0 A;  4QMV A;  3ZLY A;  3C4F A;  2A27 A;  5AV2 A;  5DYJ A;  2UW7 A;  2PVM A;  2YIS A;  3SGC A;  3H0Y A;  5E8X A;  3D14 A;  3O50 A;  3RPY A;  5CAQ A;  3OWP A;  4FSU A;  5DWR A;  4ANN A;  4FV5 A;  4XLV A;  3W8Q A;  1OB3 A;  4NJD A;  4QTC A;  5BNJ A;  2C3K A;  2A1A B;  2HW7 A;  2YEX A;  2ZV8 A;  4JG7 A;  4X21 A;  5HOA A;  4ANQ A;  2R3M A;  2C6I A;  2XJ0 A;  3EOC A;  4GJ2 A;  3TXO A;  3ZON A;  3W32 A;  2QHN A;  4F9C A;  4YSJ A;  1GAG A;  3PUP A;  4QMN A;  5EDQ A;  2VWU A;  5DMZ A;  3VQH A;  1G3N A;  4DBN A;  4AXE A;  3HKO A;  1NT2 A;  4O7S A;  4FKU A; 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