5L8LA

Aurora-a kinase domain in complex with vnar-d01 (crystal form 1)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
264
structure length
263
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTLAGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Aurora kinase A
publication title Allosteric inhibition of Aurora-A kinase by a synthetic vNAR domain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 263
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l8lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5l8lA01
2HY0A 1NVSA 3DKOA 1H26A 4U3ZA 1V0OA 3B8RA 3QKMA 4O0UA 3WF5A 3UP2A 1I44A 2F7ZE 3CD3A 3FLZA 2X9EA 2YEXA 4CG9A 4YSMA 5HKMA 3NAXA 4CCBA 1XJDA 4D4RA 3HAVA 4V05A 5ACKA 1U46A 4FTQA 3R7YA 2WTKC 3PPKA 3QKKA 4GT4A 3GVUA 4AT4A 5LVPA 4U8ZA 2R3NA 3O8PA 4BDEA 4CKIA 4X2KA 3VS0A 3BX5A 2RFSA 5TO8A 4KNBA 2Y4IC 5J9ZA 3DGKA 1OPLA 4RJ5A 5ANGA 3RI1A 5JKGA 3F5GA 4I6QA 2AC3A 2C4GA 4AZTA 3MVJA 4ZY6A 1PYEA 2W99B 2WQNA 2J4ZA 3UYSA 4CCUA 4CMUA 5EM6A 3LMHA 4ARKA 3KY2A 3PP1A 4F08A 3EL8A 3VW8A 3BHYA 3H3CA 3ZMMA 2OU7A 3PPZA 2XJ1A 1FOTA 1OB3A 4FC0A 4EK8A 4YZBA 2FO0A 3WF8A 4MWIA 4DH8A 2W06A 5C26A 2A2AA 4JAJA 3GU8A 4E26A 4S2ZA 4PL3A 5K0KA 2OBJA 4FKLA 4IMYA 4F64A 1VJYA 4JR3A 3FLWA 5EYMA 3UP7A 4KKGA 3NVKI 3ACKA 3RNIA 3MDYA 1WZYA 5BVNA 3G51A 3E92A 5L2SA 2CGVA 4TWPA 4FT5A 4EC8A 3RK7A 3LAUA 3SX9A 4FK3A 3T8OA 3RPOA 2J51A 4RIWA 3O2MA 3KGAA 4OTDA 1CSNA 4OTRA 4P4CA 3EIDA 4ASXA 4XNEA 4RQVA 5BVWA 5CNOA 4XEYA 1QL6A 3G9NA 2F49A 2CKPA 4IE9A 5CSWA 2GQGA 3DDQA 2J0JA 3RWQA 3ENHA 2OG8A 3EYHA 3L9LA 4E8AA 2PZ5A 4IWDA 3PRIA 1UWJA 2ZAZA 3OY3A 2BDJA 4DFZE 3Q32A 4TWNA 2R3GA 4Y72A 4AW5A 2YITA 3R9RA 4BR3A 3R22A 4M12A 4O96A 2W4OA 2XJ0A 3U8WA 4EJNA 4ZOGA 4M69B 4EK3A 5ETFA 4F7SA 2X81A 4XUFA 3VS4A 4WG3A 4EWHA 4Y5HA 4BI2A 4DFXE 4V04A 3UO6A 2UW7A 4RQKA 1PMEA 4QOXA 2CDZA 3IPHA 3KXZA 3MVLA 3NS9A 4QT1A 4LMUA 5CZIA 4J1RA 3SG9A 2R3KA 3FAAA 2A1AB 4L43A 3WOWA 1ZZLA 2EXEA 5IUIA 2JFLA 2FGIA 4BKYA 2JKOA 2O2UA 1WBVA 4AN3A 1PXPA 2WXVA 4ORKA 4N6YA 2EWAA 4W8DA 2B9FA 4GFMA 4DGMA 4EOQA 4RX5A 2F7EE 1H28A 2IWIA 3MJ1A 4Q2AA 4XJ0A 3D7ZA 4G5PA 1FQ1B 3AMAA 4O2ZA 4IBMA 3Q96A 3RPSA 2W9ZB 3EQGA 3WIKA 3OCTA 4FV4A 5IH6A 3MESA 1OZ1A 1PHKA 4DBNA 3GEQA 3FMNA 3M11A 3FQEA 4MH7A 3ZZEA 4JBOA 5AADA 5CWZA 1JKTA 5EI2A 3SXRA 4PQNA 4E7WA 4LRKA 3WBLA 5HU3A 5GIOE 4EQCA 1G8SA 3LXLA 5CU3A 3TZ9A 4C58A 3LCDA 2ERZE 2G1TA 4IVCA 4BYJA 2C0IA 4HCTA 5I9WA 3P0MA 1VYZA 2V22A 4BI1A 4R6VA 4D2WA 4DF3A 5JEBA 4BL1A 2DS1A 1S9IA 3RVGA 1JAMA 5L8LA 5A4EA 2OJFE 3QL8A 2QG7A 4QMVA 3BWJA 2VWWA 2BFXA 4RVMA 5LVMA 2NRYA 4I5MA 4EC9A 3OMVA 3DZQA 4DT8A 4EONA 1XBBA 4MEDA 4JDKA 4TTHB 3REPA 2GTNA 4M3QA 3TWJA 4CV8A 4YJRA 2C1BA 3PJ3A 2VGPA 4LQMA 3QALE 3UGCA 5FDPA 2WNTA 2JIVA 4U42A 4ACCA 2A4LA 5IZFA 2WQOA 4RVLA 4AZEA 3C50A 1UA2A 2XIKA 4ZP5A 5TR6A 4I20A 4AGDA 1IAHA 2FSOX 2XNMA 3DB8A 5AFVA 4FSNA 4C8BA 4I4FA 5DH3A 3S0OA 1LEWA 4DGLC 2BILB 3HGKA 4FKRA 4NT4A 4DITA 4BY9E 4GYIA 4FVRA 2WAJA 4BCJA 4YJUA 4BCIA 3LFSA 2FVDA 2BRNA 4EZ3A 3EFLA 5E8XA 5HNIX 4O1PA 1RW8A 3KRRA 1Z57A 3O96A 4GKIA 4IACA 2IG7A 3ZM4A 4G2FA 5KZIA 3TKUA 2I0VA 4FIIA 4C62A 1TVOA 3W2CA 2Q0NA 5L3AA 4ZSGA 4D2RA 2BKKA 4PDYA 3GCVA 3BHHA 2ERKA 3R8MA 4O38A 3MGYA 3MB7A 3DKCA 3I79A 5E8SA 5K0XA 1PMUA 3TNIA 5KMMA 4Q9SA 3MA6A 4FV9A 5F94A 3TI1A 2Y4IB 2X8DA 4PMPA 4NSTA 4IWOA 4UMPA 5LXMA 3FI2A 2QOFA 3OW3A 1Z5MA 4FKPA 3HV4A 3V5QA 1J7LA 2ITPA 1W84A 2UW5A 4PMMA 3U9CA 4K1BA 4PTGA 4BCHA 4QQ5A 1BYGA 4DFUA 5C8KA 3ZO1A 4DEDA 4I1ZA 2QQ7A 3GFWA 4MXYA 4L46A 5J95A 3PE2A 3H9RA 5FM3A 4BB4A 4RIWB 5JFSA 4ZMEA 4RJ4A 4CGAA 3DJ7A 3A7GA 4FV7A 2J5FA 5ETCA 4R1VA 5A6OA 3AMBA 2LAVA 4QQCA 2ZV2A 3PIYA 2C6OA 3DU8A 4A9TA 3SW7A 3KRWA 3O51A 3TZMA 3QCSA 3KF7A 4AA0A 4BDFA 4ITIA 4J53A 3R9HA 3RAIA 2F9GA 4L7SA 2VTQA 4OBPA 5HD4A 3VAPA 2YLFA 1H1RA 3E8DA 4KRCA 4IB0A 4IWPA 4HVHA 3DFCB 3QA8A 2JDVA 2BHHA 4TYHB 3WYXA 4ZTSA 3W2RA 4BDGA 3VUMA 5AWMA 4GL9A 2B0QA 2VO3A 5AR7A 5H8BA 3HYHA 4EHEA 1G3NA 2OXDA 1YHSA 3PXRA 4TZRA 3UQCA 2CKQA 4WD5A 3MFUA 3VS2A 4ZZNA 3EN9A 1CKJA 2YA9A 3FKNA 2WTIA 4Y73A 3U51A 1YWNA 2F2UA 4D9TA 4CLJA 3QZGA 3DAJA 4QNYA 2RFDA 5CF4A 3G5DA 2G9XA 4O6EA 4L44A 3FPMA 3KULA 4BC6A 3ORPA 3WF6A 2G01A 3HVCA 2X7OA 3FJQE 5G1XA 4DAWA 3DLSA 4HGTA 2RL5A 2JBPA 4QYFA 3CLYA 4TPTA 2PUUA 3FLSA 4DGOA 5ANDA 5B2LA 2UZWE 3PWYA 2XH5A 4YTCA 3ZDUA 4GFGA 3ZSIA 5FWKK 4AZSA 1U4DA 3CTJA 3LJ0A 5AV1A 4CFXA 2Z60A 4EBWA 1U54B 4S34A 4DLJA 4JLCA 4YHTA 3R2BA 1P5EA 5IQBA 2Z2WA 3ATTA 1ATPE 2QO9A 4HVSA 1R1WA 4LOOA 2WKMA 4PV0A 4V0GA 2GHGA 4FSWA 4O82A 3QD3A 4MQ1A 3F2AA 4M14A 5AP7A 3UVQA 4BHZA 5IKWA 4I0SA 4BCQA 5CAQA 3K2LA 2UVYA 1PKGA 1NW1A 1YXVA 3G0FA 3SOAA 2CHLA 1ZWSA 4I3ZA 3DJ5A 3ROCA 3FXWA 3ZOSA 1J7IA 1X8BA 5CYIA 4FSYA 3PLAE 2C68A 2AC5A 3CY2A 3S3IA 1Q8YA 4JG7A 1SZMA 3TV7A 2VV9A 3E87A 1ZYCA 4UV0A 5AUXA 5HG8A 3UVPA 5IDNA 4EHVA 5JN2A 4DBXA 2BTRA 4J99A 1PF8A 3SRVA 2QOLA 2YABA 1G5SA 3LCTA 5LWMA 3R6XA 3DLZA 4H36A 5DIAA 2XIXA 2QR8A 4A9RA 4E6QA 5HE1A 3RM7A 4ANSA 5IDPA 5L2QA 2LGCA 5L8JA 5IU2A 1OL1A 3FL4A 3QFVA 2UZTA 5I5ZA 5FQDC 4BCNA 2YLEA 1KE6A 3C4FA 4FSQA 4OGRA 5JQ5A 1GJOA 3EQBA 1K2PA 3HMNA 3RHKA 4KBKA 4CKRA 3ZLYA 2C47A 4EOPA 1ZLTA 2R7BA 4UBAA 4AX8A 1H00A 3RZBA 4NW6A 4F1OA 3LCKA 5HGIA 2WMRA 5GIPE 1T46A 2YCQA 4ZTRA 4ZLZA 5EI8A 2A27A 4E73A 1YXUA 1ND4A 1E1XA 1YI4A 4G1WA 4LV8A 3U9NA 5CZHA 1YXSA 3IOKA 4BYIA 1YDTE 5HX6A 3OOMA 1H1SA 1XWSA 5FBNC 5LCKA 4CYJA 5A4LA 4TNDA 3V51A 4YNEA 3GT8A 4CRSA 3BHVA 4Q5EA 4R7HA 2YJSA 4PDOA 2YWPA 5CSVA 5BPYA 2RIOA 4KSQA 3UIUA 4FEUA 2ZB1A 3ZM9A 4IAFA 3W18A 4RX7A 4DYMA 4D1SA 2HZ4A 3ZRLA 4AE6A 3BLHA 3R9NA 4BI0A 3LKMA 1Q8ZA 2Z7SA 4IXPA 3VJOA 3RALA 3ZTXA 3LCSA 5IQAA 3DNEA 4QPSA 5HI2A 2RKUA 2JAVA 3HDNA 3Q9ZA 4I6HA 5AJQA 5EW3A 2W7XA 4K33A 4KBAA 4EORA 4PP7A 5M08A 3A61A 2VX1A 4HJOA 3TV4A 5IISA 4MBIA 3GBZA 3Q4TA 3V8WA 4O7LA 5EQPA 4UMTA 5HE2A 3UPXA 4IZAA 3AMYA 1P2AA 4L9IA 4M8TA 4TXCA 4YJVA 5KHXA 5DGZA 3VUTA 2QURA 2ZJWA 5E8TA 4RLLA 4ZTMA 4GIHA 3NYNA 2UW6A 3HP2A 5CQWA 5FEQA 3TJCA 4DE4A 3HRBA 2VTPA 1DS5A 4IH8A 4CFVA 5AP2A 5AUUA 2G2HA 3KMUA 2BVAA 1B38A 3JY0A 2XYNA 2J7TA 4P5QA 1CM8A 2X6DA 4PMSA 5DPVA 3ROYA 3UQGA 4F9WA 4QYGA 4BDBA 4QTCA 4FKSA 3UOLA 5K9IA 4ID7A 2GNFA 4FR4A 3EN4A 4FV8A 3V3VA 3BV3A 3CGOA 4I22A 3HMMA 3U6HA 3WZUA 1ZZ2A 4GVJA 4RBLA 3BLQA 4FVPA 4ZSAA 2OZOA 3KULB 5IEXA 3NVMB 3HECA 2B9IA 1JPAA 4NUSA 5K4IA 4ZXTA 4DA5A 3CKXA 4H3PA 5DHJA 4E4MA 3M42A 4J52A 5JGBA 4WOVA 5JRSA 2IVTA 3VBTA 2J9MA 4ZSLA 3ZUVA 1UU3A 4G6LA 4JX3A 4XV3A 3UE4A 3LFDA 2C3IB 4E4XA 3MPTA 2YM5A 3CS9A 3R1QA 4FTLA 2E9OA 4YLKA 5EI6A 2WIPA 5M4CA 5FUTA 3NUNA 3TT0A 4RA4A 3UO4A 4DGNA 2DYLA 4K8AA 2ITOA 3NUPA 3SAYA 4BKJA 3FY0A 1LEZA 3ENMA 4I6FA 4IAZA 4IVAA 5E1EA 4UYAA 2QHMA 2XNOA 4V0GB 4ZEGA 2XKCA 3ERKA 4ALUA 4TN6A 3PIXA 2QOIA 1SM2A 3JVRA 4WBBB 4F9BA 3D4QA 5HOAA 5B0XA 2BZJA 2HWOA 4QMPA 3DK6A 2YIYA 3PXQA 3QD0A 4XH6A 2QLUA 5KX8A 4HOKA 3LXKA 5EW8A 4FIJA 3GCSA 4XG2A 3DTWA 4IADA 3E88A 4YC6A 4BDCA 2JIIA 4YZMA 3FYKX 2W1CA 5L2IA 3Q3BA 3GQLA 5DT3A 5HBHA 3DBDA 3FDNA 3ZH8A 5AX9A 1Y57A 4IQ6A 3ELJA 4GYGA 5F1ZA 4IFCA 4WNOA 5BVFA 2OIDA 4L3LA 2YAAA 4RPVA 2C5XA 3OWJA 5DOSA 2NP8A 3JR1A 4Q5HA 4H58A 4O27B 2JD5A 1Q62A 3G9LX 3ZHPC 3LM5A 2Y8OA 4NW5A 4IB3A 4AA4A 5J1WA 5C4KA 2WMWA 3S4QA 2PHKA 3UG1A 5DR9A 3R7GA 3DJ6A 4OAVB 3HUBA 4ZTNA 4LYNA 2CCIA 2W5AA 4EH3A 2CLXA 4DEHA 3F69A 5FTGA 3CPBA 4LG4A 4U97A 3G6HA 4AOJA 3EN5A 3MY1A 2OZAB 3NUSA 5DI1A 5M57A 5FEDA 5KKRC 4EQUA 1WBSA 4MAOA 3F3ZA 4BWKA 4KAOA 1IRKA 1SVGA 3E7OA 3RAWA 3ZUTA 2VX0A 3R7UA 2FH9A 4C36A 4O86A 5IEVA 3DXQA 3ORTA 4UMRA 3I6UA 3PG1A 2WQBA 3ZLWA 1CKPA 4NM0A 2IO6A 5FXSA 2GMXA 4ZJVA 5J7BA 2GNLA 4GSBA 5I3RA 4BCKA 3BQRA 3FZOA 3ZLSA 5E4HA 5M53A 3OOGA 3P7CA 2DQ7X 1R0PA 3R00A 1ZY4A 4FNYA 2O64A 4W4WA 4YJPA 4IWQA 3ZONA 4C34A 4IAIA 4RJ7A 4R8QA 4BBEA 2R5TA 1J1CA 2BPMA 3IDCA 5DNRA 5I4NA 1WBTA 3S1HA 4E6CA 4FEVA 4XV1A 2OI4X 4FZDB 4BDDA 1IA9A 4DG0E 2VWIA 4FIFA 4YGAA 4DH5A 3LFFA 3KCFA 4MBJA 4RWIA 1JOWB 3GOPA 5BVOA 1FMOE 3MWUA 4FTOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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