4D5KA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 86
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d5kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d5kA01
5I4NA 4UX9A 4PDSA 2WTIA 5GIOE 1AQ1A 3GUBA 4AA0A 4EK8A 1DS5A 5CYIA 1IAJA 4KA3A 3DAKA 4MWIA 5E8WA 2F7XE 5AR3A 4QMUA 3UG2A 4CRLA 2VD5A 4A9RA 4PMPA 5LJJA 3OG7A 3S3IA 3M11A 3TTIA 1Q97A 3UC3A 3OBGA 5BQ0A 3R8LA 3QYWA 1YOJA 3EN9A 4EWQA 5HX6A 4P5ZA 2JDVA 1SNUA 2QG7A 3DBCA 1PY5A 3VF9A 4DEDA 4QQJA 4ZY4A 3LJ0A 3QRKA 2IN6A 4I4EA 3BCEA 4MKCA 1OBGA 4BCJA 2GMXA 2UVYA 4FZFB 4GMYA 4JDHA 4KKHA 5AP6A 4C33A 3UGCA 3R22A 4RLLA 4XBUA 3LHJA 3KRWA 5EM6A 3NAYA 2B52A 3UOLA 2WTKB 4ITIA 4TN6A 4PMSA 2UZVA 4XHKB 4Z7HA 1FGKA 4GFGA 3A62A 4X6QC 2O64A 4GUBA 4FUYA 1KUTA 5CWZA 1YDTE 3OUNB 5FTGA 3F9NA 2QOBA 2XB7A 3MFTA 2RFEA 4MVFA 5HG8A 4IAKA 5KCVA 4YO6A 4TWOA 3HLLA 3HL7A 3Q32A 4PPAA 5FTOA 1UA2A 2QOLA 3EQCA 3D5VA 3K2LA 5GIPE 3P7BA 3UYSA 3FYKX 3KA0A 3PXYA 1OL1A 3U51A 5HIEA 4YJNA 4BDHA 3QQKA 3V3VA 4F1TA 4MQ2A 5HCYA 3DKOA 1H24A 4F08A 2CHLA 3RPOA 5F94A 1JSTA 5GJDA 4F65A 3F5UA 5LVNA 4KIPA 4X2KA 4OBQA 1WBOA 2C1BA 2QU6A 4P5QA 5AUXA 4TNBA 4L7FA 2WQBA 4QOXA 3DLZA 4Y72A 1URCA 5EHYA 3ULZA 5IMXA 2C4GA 2X7FA 3FEGA 1TKIA 5A14A 3KF7A 4ZTHA 3B2TA 4RX5A 5JGAA 4Y5HA 2ZM1A 4QNYA 4R6VA 2WQOA 4I6HA 1XBAA 3NNWA 3VBTA 4AE9A 5JFVA 3EHAA 3QKKA 3U55A 5EHOA 4BCPA 4QQ5A 1JKKA 4XUFA 5DA3A 1QPJA 2UZBA 3QL8A 4IQ6A 2HY81 5IH5A 2A27A 1APME 2WEVA 1OKVA 3BE9A 4XV9A 4KIKB 5E9EA 4TT7A 3HV3A 2C6MA 1BL6A 3VBQA 3ZFYA 4XV2A 3OBJA 3QQGA 5TR6A 1OL5A 3D7TA 4I6QA 4BZNA 3G33A 1W83A 1ZAOA 3NZ0A 4FBXA 4IMYA 5CS6A 3DAJA 4CTBA 4ZAUA 3HMOA 4H39A 4W4YA 5G1XA 3T9TA 3R71A 4DTBA 4OGRA 1XH8A 3BEAA 1IEPA 3R7GA 1Q99A 4FTNA 4I93A 4IWQA 3DAEA 3T9IA 1ZOEA 4TRLA 4AG8A 4NM7A 4YHTA 2CNVA 3P0MA 3TM0A 5I9UA 2OXDA 3GXLA 3RP9A 4F1MA 4PY1A 3U6HA 4O0SA 3W2OA 5A6OA 5FEQA 3RK7A 3ZC5A 4QMNA 3CS9A 4QYGA 3R7YA 2O3PA 3MH1A 2WQEA 3IDPA 3KB7A 4OLIA 3MH2A 5K3YA 5CNOA 2QHNA 5ICPA 3Q4TA 3NYOA 2BIKB 3JY9A 4NK9A 3NYVA 3VBXA 5BUJA 4EJ7A 3OHTA 3UQGA 2YCQA 3FUPA 4FKJA 3ZDIA 2WELA 3PG3A 1PF8A 5HTBA 2PVKA 3Q52A 4DFUA 1QMZA 3HA6A 5KMOA 5L2IA 2PY3A 3CEKA 5C8MA 2UW8A 4IACA 3QQUA 5CSWA 3GQLA 5LCJA 2HZIA 2B0QA 2J7TA 3OZ6A 4IVBA 4IEBA 4AGWA 3EMGA 2XNBA 4PMMA 5DMZA 5AUZA 2R2PA 1ZYJA 3VO3A 5M44A 3Q2JA 3RPYA 4FSTA 2VX0A 3ZO3A 4D5KA 2JC6A 5L2SA 1G3NA 4QMSA 1S9JA 3PJ3A 1H07A 1P14A 3BU3A 3NPCA 5HLPA 3G51A 5HE1A 2B9FA 4ZP5A 2CGUA 1YI4A 2GHLA 2X1NA 4DH7A 4D2VA 3DNDA 2QURA 3CXWA 3DJ6A 4ZLZA 1OMWA 3R01A 4YZNA 4FKOA 2BAKA 2ZYBA 2E9VA 2YEXA 3BHYA 4EOIA 4CKRA 4YUQA 2ZOQA 4YLLA 5LWMA 4FG8A 2W06A 3KN6A 1VR2A 3ZXTA 4RVTA 5F4NA 4WNPA 4EQMA 4FEUA 3TNQB 4IFGA 3EB0A 4G9CA 4BC6A 5FG8A 4BIDA 4NFNA 4X3FA 4F9CA 5FDPA 5C01A 5AUUA 4FUXA 2VV9A 3DLSA 5HE2A 5GINE 4O6EA 4RX7A 2HZ0A 3E8NA 4ENYA 4JG6A 5CZIA 1XKKA 3SVVA 1G5SA 3SXRA 2OH0E 4AN2A 3QBNA 4QYFA 3MIYA 4RVMA 4IC8A 4C02A 1FQ1B 3E63A 3SA0A 4GYGA 1OIQA 3LJ1A 4LUEA 3TNIA 1URWA 4HW7A 4AZEA 4XH6A 4HVSA 3ROCA 5AIKA 2O0UA 3DDPA 5JK3A 5KNJA 2R9SA 4FTTA 2VWZA 3DOGA 2Z7LA 4O7NA 2E9NA 2QOKA 4X3JA 4FKTA 2PMNX 2NO3A 2R3HA 3TV6A 4EL9A 2RFDA 1NVSA 2DYLA 5L3AA 2Z60A 3KK9A 1KV1A 3QCYA 1FVRA 1Q41A 3PUPA 3ERKA 4DLJA 1GIIA 4CV8A 2X9FA 3AMAA 2EXEA 3CR0A 3MTLA 3UIMA 2ACXA 4EOJA 3VS5A 3UP2A 3VWAA 3HAVA 2ITZA 2ITXA 4XG2A 5AV2A 4BBMA 1H1QA 2QOFA 2GNHA 5KHWA 3HV5A 4I5PA 2XA4A 4H3BA 4QMYA 4U0IA 3OROA 4UYNA 3LPBA 4WD5A 4L52A 1H0WA 1MQ4A 4ASXA 4QO9A 4HGSA 4LGHA 3MA6A 1PJKA 4JX7A 3N51A 1OM1A 3GCQA 3ORLA 4ZSLA 3RAHA 5D41A 2DUVA 3EQIA 3EFWA 4W9WA 4B7TA 4IX6A 4AZFA 2ZV8A 4TXCA 3ELJA 4NCTA 4IAIA 2ITQA 4YC6A 4XRJA 5LCKA 4JBQA 2RKUA 2YLFA 5JQ5A 3SD0A 3R7EA 2RG5A 3VS2A 4BDIA 3DTCA 1H26A 3FY0A 4XG9A 3T3UA 4A4XA 4TYJA 4C4HA 4DG0E 3AD5A 1H0VA 5E92A 2PMIA 3PZHA 4GT4A 4AFEA 3OWPA 3LFSA 3ZRKA 4UWYA 4F09A 1KE9A 5IEVA 5M08A 3BGQA 2OO8X 4IB1A 3QZGA 4YJVA 4CT2A 3ZM9A 5BVNA 4IDTA 2ZMCA 4JDKA 4IJ9A 4IFCA 5GNKA 1GNGA 1W98A 3AT2A 4IXPA 4S30A 4ACGA 1JVPP 4EYJA 2FH9A 5CLPA 1QCFA 5I9YA 3MB6A 4GK2A 3G0EA 2B7AA 3FMMA 5JGBA 4RQVA 3UNZA 2P0CA 3BYSA 3Q60A 4QMTA 4U43A 4JDIA 3N4VA 3IW8A 1WBNA 4FTIA 3BX5A 5A46A 2ERZE 2Y9QA 3QKMA 4BCFA 4DEBA 4OBPA 5EKNA 3TIYA 3WI6A 2OLCA 2BFYA 1XBCA 2CPKE 3IKAA 4CG8A 2YM5A 4IZYA 4U81A 1YQJA 3AGMA 3E3PA 5HIDA 4KIKA 1VJYA 3G6GA 4C2WA 3OCBA 3MFRA 5HLWA 3L8XA 4J99A 3NGAA 4KABA 2G2FA 2VTIA 1E1VA 3O2MA 4CG9A 3DK7A 4ANSA 2PUPA 3VJOA 4I1ZA 3OFMA 2BRBA 4O22A 3FLQA 1Q8WA 2PWLA 2R3KA 3DB8A 4L3LA 4WUAA 3TACA 3KMWA 3W8LA 3IW6A 2CDZA 2QODA 2IJMA 2C3KA 3ATTA 4MWHA 3FXZA 4O7TA 3BV3A 3KN5A 4UMUA 4C0TA 4D4SA 2F2CB 5EYKA 4UALA 3UZTA 4UZDA 1RJBA 5CF8A 3ZHPC 4JJRA 3HRCA 2IPXA 3PTGA 5IU2A 4YJTA 4JQ8A 2WIPA 4H05A 4U3YA 5CNNA 3OWJA 1J3HA 2CCHA 3G15A 2OF2A 3P1AA 1WVWA 2HAKA 4HPUE 4A4LA 3R04A 1JNKA 4D0WA 4ZSGA 4F4PA 2WMAA 1W82A 3L9MA 1W0XC 3K54A 3LCDA 2QOQA 5EM8A 5ANGA 3OW3A 1MRYA 2FSLX 2XK4A 3PPJA 5E8UA 3K3IA 1V1KA 4EK5A 4DTAA 5IQEA 4E73A 4GKIA 3R1NA 2BPMA 1YOMA 4OTGA 5IQAA 3TUBA 3QD4A 3WF5A 5C4KA 4QD6A 3F3ZA 4Y73A 3ZZWA 5C1QB 5KMMA 1UV5A 2VWBA 2CKPA 2J6MA 3ZLWA 5AJQA 4APPA 1AD5A 3D15A 3FLYA 4WRGA 4JAIA 4X2GA 1ZYCA 3LW0A 4PL4A 2UZLA 3GB2A 4ANLA 4WKQA 1R0EA 3OY3A 2GNLA 2GTNA 2XNEA 3S4QA 4DAWA 3NUXA 2YM3A 3LFFA 5DT0A 4HNFA 4RIXB 2OJGA 1VEBA 1T46A 2XP2A 3P08A 4YPSA 1FPUA 3ZO4A 5ANKA 2WMSA 3RPVA 5HORA 3MVJA 3PY3A 5TO8A 3SW7A 3F3VA 5LWNA 1XH7A 2YISA 4CFMA 4USFA 3NW6A 3U6IA 2R3RA 3M1SA 3QC9A 4P2KA 1SMHA 1XHAA 4W4XA 4MEDA 3R9OA 3ZFXA 1P4OA 3C1XA 2GHGA 1WBPA 2V7OA 3IGOA 3PWDA 5CVGA 3BLHA 4WBBB 3QC4A 1P2AA 4IB3A 4N6YA 4CQEA 5BPYA 4FSNA 1PKDA 4UV0A 4XYFA 4Y8DA 3Q9ZA 3UIXA 4YJUA 5JRSA 3VVHA 2WTVA 2QG5A 3HMIA 5IQCA 2XM8A 4ALVA 2HCKA 4BCMA 5EQEA 3V5TA 4DFXE 1H1WA 3C0HA 2LAVA 5DI1A 2BCJA 3P86A 4QTBA 1YDRE 5L2TA 3ZMMA 3UMXA 4G3GA 3OUKA 5IA3A 3LQ5A 3GNIB 4C57A 5TT7A 5HVKA 4BIEA 3R28A 3BYUA 4W4VA 2BRMA 1H08A 4GKHA 4RJ5A 4QP8A 3P79A 3EFLA 1LEZA 1SM2A 2UZUE 1MQBA 2ZMDA 5BVDA 3MWUA 5K4JA 5JFWA 2XKFA 2R3QA 2HOGA 1PW2A 4MXZA 5DR6A 3AOXA 2H96A 2R64A 2VRXA 4IM3A 5IUGA 4U9AA 2C5VA 2VO7A 3GU8A 1DI8A 3ET7A 3UC4A 3FI4A 3PSDA 2XCHA 5E7RA 1UU7A 4GJ2A 5JH6A 1OUKA 5IZFA 2VTHA 2XIRA 3Q5ZA 5BVKA 3EN6A 3UE4A 4A06A 4D55A 1ZOHA 5EM7A 4LMNA 4QP4A 4BF2A 4FSUA 4DC2A 4D1SA 4ACDA 3FMKA 4FT3A 3BYVA 1OPLA 5I3RA 1ZYLA 3ZBXA 4ERWA 4I5MA 2BTRA 5AM7A 4YO4A 3PJ8A 4UXQA 2IVVA 4MD7E 4BKZA 1R0PA 2B1PA 3OP5A 4IWOA 1UNHA 2EXCX 2JKQA 1V0OA 4HYUA 3R7UA 4RIWA 2X8EA 4ANOA 4C3PA 3C5IA 1KOBA 1K9AA 3H4JA 2C6IA 1J91A 2DS1A 5HI2A 5HICA 5B7VA 2PPQA 5E4HA 4YP8A 4M84A 5JN2A 4EHZA 3QUPA 1J7LA 3R00A 3D2IA 3ANQA 4WG5A 4QQTA 1STCE 4DEEA 4HGLA 3E3BX 1JLUE 4BKYA 4BDEA 1W8CA 2NPQA 2X4ZA 2YITA 4QMQA 2JIUA 3W2RA 3TNWA 1JOWB 4J8MA 4G16A 1XH6A 3ZUTA 4YNOA 4CMOA 4H1MA 4C4FA 1MRVA 1XR1A 2CGVA 4IW0A 5LMAA 1GIJA 2IW8A 2C5YA 1WAKA 4DFBA 4RMZA 2VAGA 5CSHA 1YOLA 4DG2E 1ZMUA 3QWKA 4RWKA 5DEYA 3I0QA 3DPKA 4FIJA 4NEUA 4D9UA 1Q4LA 4YLKA 3TZMA 3BLRA 3FMLA 2XNOA 5AADA 3PE2A 4J8NA 2VTPA 4F6UA 4YGAA 2RSVA 3V04A 3FHIA 3U4UA 4HVDA 3W2SA 4QP1A 1X8BA 3ZONA 4A07A 5J9YA 2J0IA 3Q4UA 3UO4A 2VTJA 2W99B 3EKKA 3PLSA 2BZHB 4RZVA 4X0MA 3SQQA 2I6LA 4LM5A 4PNKA 5DRDA 4C4GA 2ITTA 1PMVA 2VTRA 5FLFA 4O7RA 4FKUA 2OXYA 5J1VA 3AG9A 2C6TA 3CGFA 4L43A 3RHKA 3NEWA 4L7SA 4XG3A 5GZ8A 4FKSA 3FI3A 2X7GA 4RIYB 3SAYA 1M17A 4MYGA 4DEIA 2JBPA 1NVRA 4M0YA 4G6NA 4BFMA 2AYPA 4DN5A 1UWJA 4FTLA 1YWRA 3LVPA 3R73A 3P23A 4FIFA 2R3IA 3M42A 4MNFA 3MW1A 4X2FA 3R8VA 4C59A 4NM3A 5LQFA 1Q5KA 4AWIA 2ITPA 2WXVA 4W4WA 2XYUA 3EIDA 2CCIA 2C3JA 3F5XA 4FT0A 1M2QA 4R8QA 4EORA 3PDTA 2EB2A 3QWJA 4ANNA 1H4LA 2NRYA 2R3MA 3H0ZA 4JR3A 3GU6A 4ITJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5I4N A;  4UX9 A;  4PDS A;  2WTI A;  5GIO E;  1AQ1 A;  3GUB A;  4AA0 A;  4EK8 A;  1DS5 A;  5CYI A;  1IAJ A;  4KA3 A;  3DAK A;  4MWI A;  5E8W A;  2F7X E;  5AR3 A;  4QMU A;  3UG2 A;  4CRL A;  2VD5 A;  4QDE A;  4A9R A;  4PMP A;  5LJJ A;  3OG7 A;  3S3I A;  3M11 A;  3TTI A;  1Q97 A;  3UC3 A;  3OBG A;  5BQ0 A;  3R8L A;  3QYW A;  1YOJ A;  3EN9 A;  4EWQ A;  5HX6 A;  4P5Z A;  2JDV A;  1SNU A;  2QG7 A;  3DBC A;  1PY5 A;  3VF9 A;  4DED A;  4QQJ A;  3UDZ A;  4ZY4 A;  3LJ0 A;  3QRK A;  2IN6 A;  4I4E A;  3BCE A;  4MKC A;  1OBG A;  4BCJ A;  2GMX A;  2UVY A;  4FZF B;  4GMY A;  4JDH A;  4KKH A;  5AP6 A;  4C33 A;  3UGC A;  3R22 A;  4RLL A;  4XBU A;  3LHJ A;  3KRW A;  5EM6 A;  3NAY A;  2B52 A;  3UOL A;  2WTK B;  4ITI A;  4TN6 A;  4PMS A;  2UZV A;  4XHK B;  4Z7H A;  1FGK A;  2X0P A;  4GFG A;  3A62 A;  4X6Q C;  2O64 A;  4GUB A;  4FUY A;  3W0M A;  1KUT A;  5CWZ A;  1YDT E;  3OUN B;  5FTG A;  3F9N A;  2QOB A;  2XB7 A;  3MFT A;  2RFE A;  4MVF A;  5HG8 A;  4IAK A;  5KCV A;  4YO6 A;  4TWO A;  3HLL A;  3HL7 A;  3Q32 A; 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