4CSVA

Tyrosine kinase as - a common ancestor of src and abl bound to gleevec
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
265
structure length
244
Chain Sequence
KWEIPRSEITLERKLGSGQFGEVYEGKWRNYNIEVAVKTLKEGTMSVEEFLQEAQIMKKLKHPNLVQLYGVCTKEPPIYIITEYMSHGSLLDYLRDCVNAQALLDMAAQVASGMAYLESQNFIHRDLAARNCLVGENNVVKVADFGFPIKWTAPEAISYNRFSIKSDVWAFGILLWEIFTYGQVPYPGMSGSEVIEQVERGYRMPRPQGCPEEIYELMLQCWNKSPEERPTFAETLHALETMFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SRC-ABL TYROSINE KINASE ANCESTOR
publication title Kinase Dynamics. Using Ancient Protein Kinases to Unravel a Modern Cancer Drug'S Mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Synthetic construct
total genus 76
structure length 244
sequence length 265
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-03-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4csvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4csvA01
2E9UA 2X9FA 2WAJA 3BU3A 3CD3A 4AT3A 3CEKA 4Z7GA 3EIDA 4A9UA 2QR7A 4V0GA 2VTMA 4C4FA 5LVNA 4JX3A 2VTSA 2WGJA 3O51A 4ERKA 1UNHA 3FUPA 4FNYA 3KXHA 4L44A 3U6JA 2QOIA 3DBDA 2PZRA 2B52A 5HICA 2XBAA 3UYTA 4C4HA 4CFXA 3F2AA 4AZFA 2J90A 4XV3A 3VRYA 3KY2A 3OCSA 3E3PA 2V7OA 2WTJA 1DS5A 2YA9A 4EH3A 4FSTA 1NY3A 2CLXA 1YKRA 4QP9A 5E8SA 4BCJA 3RKBA 2R3MA 2UW8A 4FT5A 3TIZA 3NDMA 2RFEA 3VNTA 1ZMWA 5EQPA 1J7IA 2IVTA 3U55A 1CKJA 3POOA 4TXCA 2EUFB 2EVAA 4MWHA 4BCOA 5EQYA 4IZYA 1ZAOA 5LVPA 3EQBA 2HOGA 2JIUA 4E4XA 4AZSA 4Z55A 4U45A 3RHKA 3ZLSA 1RJBA 4GU6A 5A14A 5CEOA 5KMIA 1J7UA 4ANSA 4O0WA 4B8MA 4QTEA 5AP6A 4AT4A 3R9OA 5CYIA 4FTKA 3HMIA 2SRCA 4QRCA 2WTCA 4B0GA 4M68A 3GOKA 4CTBA 5CEPA 4GU9A 4FIHA 3F6XA 4OTFA 5CVHA 4BI2A 3QU0A 3EL7A 3OBJA 3PY1A 4MYGA 3PPJA 3ZLWA 5HNIX 1GIHA 1Q8ZA 3C7QA 3TT0A 3G6GA 4CKIA 2VO0A 4G5JA 2IZUA 5IA0A 4KINA 4IX3A 3EQRA 4WUNA 3OD6X 4TNBA 3UVQA 4C33A 4J8NA 2WB8A 4RIWB 4H58A 2W1DA 3H30A 2GS6A 2C6MA 5KZ0A 2VAGA 3C4XA 3FXXA 1QPDA 2YAAA 4FI1A 5HORA 4U3YA 2WMAA 2ZM1A 5DWRA 3BGQA 3C4CA 2VWZA 4H3PA 4TYHA 4F64A 3KF4A 4L52A 5C8NA 5L2WA 3UQGA 3BE2A 3H3CA 3CTJA 3OTUA 2XVDA 3O50A 4AZEA 5JH6A 2C4GA 3IQ7A 5I0BA 2X7FA 4D9TA 3FV8A 3PIXA 2QOBA 4M0YA 4ZOGA 5E4HA 1CTPE 5FTOA 5HE0A 2BFXA 2JC6A 5IUHA 3ORMA 1ZOHA 1KSWA 3A7FA 4DH8A 1FBNA 4RG0A 4QQTA 4JNWA 4L9IA 3GU8A 1PXIA 4AOJA 5HX6A 4YTIA 2BALA 2F9GA 5IUIA 4IZAA 3VF8A 4WRGA 5GZAA 5GINE 4APPA 2O65A 4IB1A 1OI9A 3GOPA 5BVEA 2Y4IB 1H8FA 1JSUA 4OTGA 1J91A 3FMNA 5KUPA 4RLKA 2CGVA 4FTNA 5AUTA 2VRXA 1P4OA 2DYLA 4BFMA 3AC8A 3KEXA 4KKGA 3RINA 5FM3A 2WMUA 2C0OA 4ZSAA 2FH9A 3U8WA 3RWPA 5EW8A 3GC7A 1ZMVA 2EB3A 3DAEA 2BAKA 3QWKA 4AZTA 4OTWA 4MNEB 3AXWA 3UC4A 4E7WA 2PYWA 2C6OA 4BBFA 4AXAA 4HNIA 3RPOA 3DLZA 2WFYA 4FSMA 4ZS0A 3W2CA 2BROA 1YVJA 5DGZA 1U54A 5DR2A 4USEA 3FLQA 4IXPA 3Q32A 2FA2A 5AP7A 2BCJA 4CT2A 1OGUA 3ERKA 4HYIA 4J95A 1DAYA 2V62A 5DA3A 4YPSA 3NCGA 4X0MA 1BKXA 4D1SA 3AC4A 5AIRA 5GJFA 5K9IA 5IA2A 4U3ZA 4AN3A 2PPQA 2XK9A 5BVOA 4FZ6A 4YMJA 5BUEA 5L2IA 4RX7A 3VUIA 2ONLA 3IW6A 1XH9A 1V1KA 2YM4A 3O23A 5IZFA 3PXKA 2B53A 1RW8A 1OITA 3AC5A 3CLYA 5BVWA 2WQMA 4ACDA 2G2FA 5KHXA 3FXZA 1XKKA 4L42A 4DBXA 4R77A 2VWBA 1PXMA 4PTCA 1MUOA 2QHNA 3ANQA 2IG7A 3ZMMA 1LR4A 3D5XA 5IISA 3HP2A 3FHIA 3FKNA 1GIJA 5EM6A 5CF6A 3PA5A 3UP2A 3UZRA 2Z7RA 1HOWA 4R1YA 1PXKA 3LXPA 5EHLA 3SW4A 3WZJA 4XG8A 4DFZE 4KSPA 5AX9A 3NUNA 4Z9LA 2ETKA 3TN8A 2HW7A 3AMAA 4USDA 3VS2A 4CXAA 4ZSGA 4Z3VA 3OVVA 3F2RA 2CMWA 2I0EA 2QOOA 3EB0A 4J99A 2BRHA 1TKIA 4IADA 5FLFA 3SRVB 3MFSA 1OIUA 2YERA 4QQJA 4AU8A 3Q2MA 2VTHA 3TDVA 1H27A 2PZPA 2HIWA 4RWLA 2VX3A 2X1NA 4EH2A 2XNNA 4QNYA 4JL9A 4BDAA 5FXRA 4RJ6A 2WTKB 5ANDA 4YC8A 3PJ2A 3LCSA 1UV5A 2AYPA 4V05A 3R71A 3BZ3A 5J1VA 3WF8A 2VV9A 3ENHA 3KXZA 2WU6A 3DK7A 2VTTA 3DBCA 4NIFB 2OXYA 3AC3A 1EH4A 3MS9A 3QLFA 5KO1A 5KX8A 3QCYA 2YAKA 3E63A 3KCFA 3ZOSA 3AT2A 1FPUA 3QCSA 5K4IA 1WBPA 4WOVA 3BGPA 1PRYA 1BYGA 4CV8A 2ZVAA 5KMJA 3DPKA 5IQHA 5KNJA 3QWJA 4FK6A 4IB0A 4HGEA 4BCIA 3TI1A 4FKQA 2WHBA 4J97A 4RLLA 1BI8A 3HA6A 3LFDA 3GU6A 5AP2A 4IB5A 4YUQA 3D2KA 5HTIA 4XYFA 3NIZA 4XP2A 4ITJA 3KRJA 2XK7A 1Q24A 3GC8A 2O3PA 3QTSA 4LM5A 2GTMA 3R9RA 2PHKA 3F2NA 3FAAA 4O0SA 4IAKA 2X0GA 3TG1A 5FTQA 5BVDA 5L8KA 1Y6BA 3BEAA 3U51A 2ZM4A 4YLLA 3DU8A 3KXMA 4S32A 5DT4A 5CEKA 3TUDA 3DOGA 5D1JA 3V5TA 5LWNA 2OFUA 4S30A 2YITA 4F9BA 4IB3A 5HHWA 1F3MC 5L2TA 1KE5A 3P5KA 4FV6A 4TKSA 5T6KA 4ITIA 4OBPA 5FQDC 4AOIA 4O0YA 2WIPA 4PPBA 4QMQA 1GZKA 4DITA 5DBXA 4AGCA 4ZJVA 4XLIA 5IQAA 2LGCA 3ZUVA 4R3RA 4DH7A 3TDWA 1PKGA 4RIWA 2WMQA 2O5KA 3QL8A 3R8MA 3LFNA 5C9CA 4E5BA 2BFYA 5LMKA 3O8TA 3R04A 4BI0A 5HU9A 3B2WA 3R7YA 3AG9A 3F61A 2WXVA 4DEIA 2Y4PA 5E8WA 5JMSA 1K9AA 4I5MA 2XP2A 4N6YA 4H05A 2XK6A 1PXNA 3ZO3A 4FV0A 4JG6A 4HZSA 4LGHA 1O6LA 4RWKA 2A2AA 3TZ9A 5CSPA 4O7VA 3HAVA 4IC8A 4HVIA 4PP7A 1JKTA 3COKA 3SQQA 4DLIA 4CKRA 3HV7A 4WO5A 4FX3A 4WBBB 4YHJA 4DFNA 2BDFA 4EOKA 3CJFA 4ASDA 4RPVA 4BCHA 3OWJA 1WBVA 2YWPA 4FT3A 5HOAA 4A4XA 4ASZA 2KULA 2IPXA 3ELJA 1XJDA 3G90X 3PA3A 2G1TA 4I94A 1LUFA 3DKGA 4QMNA 5AAEA 3SC1A 1PW2A 3Q6UA 1ZY5A 4F0GA 3DKOA 2QVSE 2XS0A 4QMSA 3NPCA 5A9UA 4EHEA 2W06A 4ANBA 3NYXA 3QQJA 2HZ0A 3QQHA 4RZWA 4W4XA 5ANKA 3P86A 4RWJA 2IW9A 4TPTA 4MNEA 2YN8A 3BIZA 4RJ7A 3TEIA 1U5RA 2BR1A 3MFTA 3DFAA 2I7QA 5FD2A 4KBCA 4MXOA 3EQFA 3QXPA 5A6OA 5HO7A 2EU9A 4YJNA 1JBPE 4WNOA 4MTAA 3BLQA 3GGFA 3IW4A 5IUGA 3KN5A 2ITWA 2RFNA 4D9UA 2HK5A 1PMVA 5EYMA 4F7NA 4XG3A 2WMRA 2Y8OA 5KKRC 1URWA 2UW0A 2YDKA 3RVGA 2UZNA 2UW3A 4YZMA 4B99A 5IEYA 3JPVA 4N57A 4BTMA 1YXTA 3WF9A 2VGOA 5EDRA 3ZFMA 4QMYA 3VWAA 4V04A 4F99A 2XA4A 2ETRA 1R39A 4O86A 5EHYA 3FI2A 4XJ0A 4E6CA 2R2PA 3QTRA 4O7WA 1UNLA 1XH8A 2C69A 1BUHA 3H0ZA 5E90A 3W2PA 1ZRZA 3ET7A 4FOBA 3DNEA 4PNIA 4O91A 3COMA 4L68A 2E9OA 5A4CA 4XG7A 5HBJA 2JEDA 1CKIA 3SDJA 4CNHA 4F9WA 4GFGA 5L2SA 4C62A 2X6DA 3SRVA 3CR0A 4HYUA 2IVUA 4RA4A 3TNIA 1UVRA 2WTWA 3REPA 2GNLA 4BDGA 5CXZA 4FMQA 4D5KA 2JFLA 2O63A 3Q9YA 4EYMA 2IWIA 2BAJA 3ZBFA 5CAPA 3Q9XA 1U4DA 2QOLA 3MB7A 2NNWB 2PMOX 3F9NA 4U79A 5CSVA 2BILB 2PZYA 2XCHA 2OXDA 2PVKA 5ANJA 5TE0A 2XNBA 4M14A 2RGPA 3H9RA 1IAHA 1OL5A 3EQDA 4OT5A 5F9EA 2CHLA 5HO6A 1H26A 2BRNA 2QOKA 3IGOA 4MF0A 1MRVA 1UWJA 2EWAA 2JIIA 3HRBA 3NW5A 4FBXA 3FXWA 4B9DA 4GSBA 3P78A 3HP5A 3IW7A 3KULB 3QQUA 4NIFA 3R7IA 5FM2A 5HKMA 3W10A 2QLUA 4DE4A 4E6DA 2PE1A 3L8VA 1YXSA 4RQVA 2UZLA 5E8UA 3LFAA 3FL4A 3T3VA 4QYYA 3HEGA 3P08A 4R5SA 4X6QC 3QLGA 3O17A 5E8XA 1KUTA 1Q8YA 3ORNA 1YRPA 2A27A 3PJ8A 4R78A 3W2RA 3MIAA 4EONA 5HG9A 4ZZOA 2YM6A 3OXZA 4MH7A 4RVLA 2XIXA 4OTQA 5AWMA 4FTJA 3E64A 1H0WA 3EN7A 1REJA 3M2WA 3Q5IA 4TW9A 3C13A 4PWNA 2X2KA 3MVHA 3OC1A 5BX0A 3MVLA 3ZLXA 3SAYA 4OAUC 5B2MA 3P7CA 4AW1A 1ATPE 4KIKB 2BRMA 2XIKA 5AAFA 4CEGA 1WVYA 2X9EA 3FMJA 3AT3A 4EWQA 1NA7A 3BHYA 1BX6A 4QOXA 1P14A 4NH1A 3VUGA 4BZOA 4DFLA 4MXAA 3IOKA 1OBDA 4G3DA 3AGMA 3F3UA 3LXLA 4CT1A 4ZTLA 2XB7A 3PXQA 4WNMA 3ZBXA 3P9JA 3MVMA 4RJ8A 3OY1A 3I0QA 5AA8A 2BUJA 3GCUA 3WI6A 5AV0A 5BYZA 3BHVA 2WD1A 3FMKA 4XG2A 4FUYA 4TYIA 4BCNA 3CSVA 3PXZA 3BPRA 3CY3A 3TWJA 4LQMA 4J96A 2RSVA 2OG8A 4BZDA 2FO0A 2HZ4A 3FLNC 2C47A 2PY3A 2OZAB 3D7ZA 3F7WA 4GFMA 3RNIA 4ZAUA 1KV1A 5LQFA 5HTBA 4ZS4A 3ZU7A 4RC2A 5EW3A 5I9UA 4BDDA 5LVOA 3VBWA 5DYJA 5I9ZA 5CAQA 5KZIA 1WBNA 2UZBA 4BL1A 3SW7A 3NUUA 2E9NA 1H07A 3CCNA 3P0MA 4EUUA 5CANA 3HRFA 4FIGA 4X2KA 1WBSA 1XH4A 3OWKA 4UYAA 2FSTX 5GIOE 4XNEA 3DB8A 5M07A 2VWIA 5EYKA 4W9WA 4D5HA 3N4TA 2UZOA 2J0MB 3FYKX 2YHVA 3ODYX 5EH0A 2OW3A 4ZLZA 3FKLA 2R3HA 2W1ZA 3U4WA 4EC8A 3QD0A 4H3BA 5EM8A 5ETFA 3DKFA 1DI8A 3ZO2A 4TRLA 4GMYA 5E92A 4RWIA 1LPUA 4X3JA 1OL6A 4U97A 2DS1A 3M42A 4FG7A 3H10A 3D14A 4FICA 3MFRA 3SXFA 2EXMA 2ITVA 4FTTA 4FTAA 3MSSA 2C3KA 2HCKA 3LIJA 2XKCA 2QLQA 3QD4A 1WMKA 1Y57A 4FG8A 4XBRA 5C27A 4QTCA 2A19B 5HEZA 4D1XA 3FI4A 3OOGA 2WNTA 4IWPA 4M13A 4YJQA 2VWXA 3SV0A 4U8ZA 5HCYA 4RVTA 4AE9A 3ENMA 5CEQA 2JKOA 3HMPA 4K6ZA 5HO8A 3HMNA 3Q5ZA 2W9FB 1H4LA 1SVGA 1W84A 2WEIA 3TZ7A 3HV4A 4AA4A 3TKIA 4UMPA 5DPVA 3GB2A 1PF8A 3RPYA 4C37A 2PVLA 4M67A 3SG8A 1PYEA 4FV7A 4JR3A 4QP3A 2GQRA 3VS5A 4BICA 5A54A 3KC3A 3QQGA 2YIXA 4N0SA 3CKXA 5CENA 3COIA 3N51A 4FTMA 4M0ZA 3I5ZA 5KKRB 1JOWB 3VS1A 3HUCA 1GIIA 3CQUA 3NUPA 5E91A 5CEIA 4NCTA 3C0GA 3QZGA 5G6VA 4MCVA 1JKLA 4HGLA 4MVFA 4UEUA 4WKQA 5DVRA 1P5EA 3V5QA 2XCKA 4II5A 2R9SA 4F9AA 1PYXA 3ZXZA 2P0CA 4Q9ZA 2W4OA 4CSVA 3UO4A 2PVRA 4I6FA 3TKHA 3MFUA 5LMBA 2X39A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E9U A;  2X9F A;  2WAJ A;  3BU3 A;  3CD3 A;  4AT3 A;  3CEK A;  4Z7G A;  3EID A;  4A9U A;  2QR7 A;  4V0G A;  2VTM A;  4C4F A;  5LVN A;  4JX3 A;  2VTS A;  2WGJ A;  3O51 A;  4ERK A;  1UNH A;  3FUP A;  4FNY A;  3KXH A;  4L44 A;  3U6J A;  2QOI A;  3DBD A;  2PZR A;  2B52 A;  5HIC A;  2XBA A;  1VLR A;  3UYT A;  4C4H A;  4CFX A;  3F2A A;  4AZF A;  2J90 A;  4XV3 A;  3VRY A;  3KY2 A;  3OCS A;  3E3P A;  2V7O A;  2WTJ A;  1DS5 A;  2YA9 A;  4EH3 A;  4FST A;  1NY3 A;  2CLX A;  1YKR A;  4QP9 A;  5E8S A;  4BCJ A;  3RKB A;  2R3M A;  2UW8 A;  4FT5 A;  3TIZ A;  3NDM A;  2RFE A;  3VNT A;  1ZMW A;  5EQP A;  1J7I A;  2IVT A;  3U55 A;  1CKJ A;  3POO A;  4TXC A;  2EUF B;  2EVA A;  4MWH A;  4BCO A;  1XML A;  5EQY A;  4IZY A;  1ZAO A;  5LVP A;  3EQB A;  2HOG A;  2JIU A;  4E4X A;  4AZS A;  4Z55 A;  4U45 A;  3RHK A;  3ZLS A;  1RJB A;  4GU6 A;  5A14 A;  5CEO A;  5KMI A;  1J7U A;  4ANS A;  4O0W A;  4B8M A;  4QTE A;  5AP6 A;  4AT4 A;  3R9O A;  5CYI A;  4FTK A;  3HMI A;  2SRC A;  4QRC A;  2WTC A;  4B0G A;  4M68 A;  3GOK A;  4CTB A;  5CEP A;  4GU9 A;  4FIH A;  3F6X A;  4OTF A;  5CVH A;  4BI2 A;  3QU0 A;  3EL7 A;  3OBJ A;  3PY1 A;  4MYG A;  3PPJ A;  3ZLW A;  5HNI X;  1GIH A;  1Q8Z A;  3C7Q A;  3TT0 A;  3G6G A;  4CKI A;  2VO0 A;  4G5J A;  2IZU A;  5IA0 A;  4KIN A;  4IX3 A;  3EQR A;  4WUN A;  3OD6 X;  4TNB A;  3UVQ A;  4C33 A;  4J8N A;  2WB8 A;  4RIW B;  4H58 A;  2W1D A;  3H30 A;  2GS6 A;  2C6M A;  5KZ0 A;  2VAG A;  3C4X A;  3FXX A;  1QPD A;  2YAA A;  4FI1 A;  5HOR A;  4U3Y A;  2WMA A;  2ZM1 A;  5DWR A;  3BGQ A;  3C4C A;  2VWZ A;  4H3P A;  4TYH A;  4F64 A;  3KF4 A;  4L52 A;  5C8N A;  5L2W A;  3UQG A;  3BE2 A;  3H3C A;  3CTJ A;  3OTU A;  2XVD A;  3O50 A;  4AZE A;  5JH6 A;  2C4G A;  3IQ7 A;  5I0B A;  2X7F A;  4D9T A;  3FV8 A;  3PIX A;  2QOB A;  4M0Y A;  4ZOG A;  5E4H A;  1CTP E;  5FTO A;  5HE0 A;  2BFX A;  2JC6 A;  5IUH A;  3ORM A;  1ZOH A;  1KSW A;  3A7F A;  4DH8 A;  1FBN A;  4RG0 A;  4QQT A;  4JNW A;  4L9I A;  3GU8 A;  1PXI A;  4AOJ A;  5HX6 A;  4YTI A;  2BAL A;  2F9G A;  5IUI A;  4IZA A;  3VF8 A;  4WRG A;  5GZA A; 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