1VZOA

The structure of the n-terminal kinase domain of msk1 reveals a novel autoinhibitory conformation for a dual kinase protein
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
QLLTVKHELRTANLTGHAEKVGIENFELLKVLGTGAYGKVFLVRKISGHDTGKLYAMKVLKKATIVQKAKTTEHTRTERQVLEHIRQSPFLVTLHYAFQTETKLHLILDYINGGELFTHLSQRERFTEHEVQIYVGEIVLALEHLHKLGIIYRDIKLENILLDSNGHVVLTDFGLSKEFVADETERAYDFCGTIEYMAPDIVRGGDDKAVDWWSLGVLMYELLTGASPFTVDGEKNSQAEISRRILKSEPPYPQEMSALAKDLIQRLLMKDPKKRLGCGPRDADEIKEHLFFQKINWDDLAAKKVPAPFKPVIRDELDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords RIBOSOMAL PROTEIN S6 KINASE ALPHA 5
publication title The Structure of Msk1 Reveals a Novel Autoinhibitory Conformation for a Dual Kinase Protein
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 319
sequence length 322
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2004-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1vzoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1vzoA01
4AGUA 3QCXA 4I1ZA 4JG8A 3DKCA 4PP9A 4QOXA 4Y5HA 3OXIA 3WZUA 1OITA 4FTOA 5J8IA 1FVRA 5IA5A 5KMKA 2UVYA 1PY5A 4NFNA 4XOYA 3VHEA 5BUIA 5LMKA 3KXMA 4EZ7A 4YJRA 1KE8A 4ZSAA 2BROA 3MIYA 2PMNX 3FE3A 3NUXA 4QMXA 2QOCA 4EZ3A 1XR1A 3DQXA 2BZJA 4QYGA 5JRSA 5LARA 2C6KA 3CQUA 2QONA 2CNUA 3GU7A 2FA2A 3GU6A 2W96B 3PXZA 4FTAA 2J4ZA 3A99A 4WG4A 4M8TA 5IEYA 3SGCA 4DGNA 3UDBA 2O8YA 3PJ8A 4FKRA 3FMLA 4ZP5A 5DT3A 2O65A 4EK3A 5EYKA 4I94A 4BBFA 4LGHA 1Y6BA 5HIDA 4YTIA 2YCQA 5A9UA 4M97A 2YDJA 2QO9A 3FZ1A 5JGDA 4EORA 1WMKA 5I9WA 1OL2A 3QBNA 2ZMDA 1FGIA 2WOTA 2QOKA 4F7SA 4HVGA 3UIMA 3CS9A 3NEWA 4FV9A 4AT4A 2R0UA 3ZSHA 3GCPA 4FVQA 2YLEA 2B54A 4M0ZA 3LQ5A 4FL1A 4J7BA 3L1SA 5BX0A 3MN3A 2CGVA 4PDOA 3SW4A 4HNIA 3FLNC 5AM6A 2WMSA 3C1XA 3DLZA 3UE4A 3V51A 3PG3A 4WO5A 4CEGA 3NUAA 3DT1A 4BC6A 3KXHA 4DFYA 4FV2A 4RA4A 4IX6A 3FQHA 5DVRA 2IO6A 2UW3A 4FKUA 2QCSA 2GS7A 4QP9A 3BGZA 3O0GA 4GKIA 4EQMA 5EW8A 3QD2B 2PYWA 5E8WA 3VS4A 3R71A 2I7QA 4EHVA 5E92A 4J52A 2Z8CA 4ZTQA 5CF4A 2DWBA 4CD0A 1BKXA 3IW5A 5CAVA 2E9OA 3QZIA 4FG8A 2E2BA 2C68A 4H39A 4Q9SA 1JNKA 2BDWA 4ZEGA 5IUHA 4IB0A 3Q2JA 4R7HA 3PXYA 1GOLA 3PY0A 4JJRA 2E9VA 1FINA 4WSYA 2J0LA 2I0VA 3BBTB 2W1ZA 2CJMA 1ZOHA 4N4SA 3VW6A 5M08A 4OTFA 4L6QA 5I5ZA 3PVBA 3W2CA 2YDKA 3F5GA 4W9WA 3OT8A 3NWWA 3A2CA 5AUZA 4RGJA 1IASA 4HPUE 3UNJA 5L4QA 1OPLA 2BDFA 4EEVA 2OI4X 3NUYA 2YM6A 3QC4A 5IA4A 2PE1A 5FDPA 2W7XA 3BEAA 3U6HA 5C4KA 2OH4A 3K5VA 3POOA 4V05A 5ETIA 3QCSA 5F95A 3BWJA 3SC1A 3SQQA 3W55A 4EI4A 3AGLA 1GAGA 4JXFA 2WHBA 3SA0A 2P0CA 1OM1A 5TO8A 2BDJA 4XLVA 5DEYA 4PUZA 4C3PA 5LVNA 4DHFA 2ONLA 4YO6A 5BVEA 4QMQA 4EKKA 1UNHA 4UWYA 5AUVA 4YZCA 2Y4IC 3P0MA 3QD3A 3V5TA 5DE2A 3OG7A 1ZAOA 2C3JA 2XNEA 3GC7A 3AG9A 4KBCA 4U40A 4W9XA 1XKKA 5ETCA 3VRYA 2GNLA 2X8IA 3NW5A 3CKXA 2I1MA 4IC8A 4OBPA 3RI1A 4DTBA 2C6LA 2HWOA 3L8XA 3UIBA 4ACHA 3FMNA 2FSTX 1BYGA 1WVYA 3QRTA 4Y5QA 4NJDA 4ACDA 4D28A 3LAUA 3EL7A 4GS6A 4CT1A 3QUPA 3FEGA 5B7VA 1HCLA 2C3KA 4YJOA 2WTIA 4ASEA 5C4LA 5HU3A 3NDMA 2VRXA 4BDGA 3L8VA 3ZDUA 4PNKA 3G0EA 3MH2A 1RE8A 3WZDA 3ZTXA 4AN9A 4I24A 4QQJA 4OR5A 3ZFMA 2R3RA 1YVJA 5F4NA 4ANOA 4RIXB 4Z7HA 2QVSE 2X4FA 5HVYA 2FSLX 1ZXEA 3BWFA 3V5LA 3HMPA 4F7NA 5JGAA 3LXKA 4GRBA 4QYFA 2XYUA 3MFUA 5E8ZA 4I5CA 3EN6A 2J0KA 3DS6A 4F99A 3BYMA 2VTNA 5AR4A 4IIRA 3F5UA 4LM5A 3MYGA 4ZTMA 2VU3A 3WF7A 4NU1A 5FXSA 1ZY5A 2F4JA 3E5AA 5L2QA 1Y91A 3MJ2A 3E8NA 3BYUA 3CC6A 3RCJA 3MTLA 4DLIA 4KABA 4RVMA 2WTJA 4FTCA 3HVCA 4MQ2A 4AW2A 5FBNC 2XP2A 3NNVA 5C01A 1DAYA 5HU9A 5KBQA 4O1PA 5BVOA 4U79A 4QMUA 2IVVA 5HNIX 4IAYA 3TG1A 1XH6A 2C47A 3ZFYA 2ZM4A 4NH1A 3QQHA 4IACA 4WT6A 4OTGA 4FIEA 5IISA 4BCOA 3EQPA 3VQUA 3GC8A 2R3FA 3Q32A 4TYHA 4BYIA 2UZOA 1GIHA 4PF4A 3OWJA 5CI6A 1ZRZA 4V0GA 4F70A 3U4WA 1UU3A 4KAOA 4JOAA 2JD5A 2PVJA 3UZRA 3ETAA 2BZHB 2QR7A 3BHTA 3R9HA 2PMOX 4YNOA 4DF3A 4MEDA 2YCRA 5FLFA 1WBWA 4IX3A 5L8LA 4JLCA 3R0TA 3VUGA 2X1NA 4ZY6A 2HZIA 3CKWA 5IEVA 4IZ7A 3H4JA 3UOLA 4EOMA 5AJQA 2WMUA 3LMGA 5IQBA 4GVJA 4BCIA 4I6QA 4C37A 5GZAA 1STCE 4PL5A 1RJBA 3W2PA 3DXNA 4CMTA 3R8UA 3ORZA 4L00A 2J9MA 4OTQA 2ZMCA 2YISA 3C51A 4DEAA 2EUFB 4FV3A 5F94A 2X81A 3EIDA 5HX8A 3TDVA 2EXEA 2J51A 4ZSJA 5F1ZA 3E92A 4QTDA 4TYEA 4ZSEA 4AZSA 5F20A 3TKHA 3OTVA 3WBLA 2V7AA 1LR4A 2XBJA 3TZMA 2ITYA 2FO0A 3WIGA 3RINA 5LJJA 5ETFA 3F3UA 4OW8A 3OC1A 4M7IA 3OXTA 5JFXA 3D5XA 4P5QA 5G6VA 1FQ1B 2XK7A 3ALOA 4ID7A 4H05A 4O0SA 3CXWA 4BHZA 4YZNA 4FBXA 2W9FB 3ZRMA 4X2FA 4DAWA 4G3CA 3FLYA 2CGWA 2XH5A 1YXUA 3TNHA 5CQWA 1RW8A 5LMAA 3QLGA 1O6KA 4I6FA 4M12A 4QNAA 5E8XA 4I92A 3FMEA 3E88A 3R9OA 4EH9A 4BBEA 1S9JA 2LGCA 3DDQA 5HGIA 2C0IA 4ZJIA 3F7WA 5CVHA 4AACA 4AUAA 4Y72A 4MBIA 2WMXA 4G5PA 4JRNA 4KSQA 4MHAA 4X2KA 3RK5A 3UZTA 4XP3A 3ZLSA 5AP4A 3PP1A 3TCPA 1VZOA 2CHLA 2IPXA 4U97A 3UMWA 4NT4A 3R8LA 3FYJX 4LOQA 3MH0A 5HIBA 2YACA 4QP2A 3FPMA 4FKSA 4BGGA 3QTRA 3PE1A 3WYYA 4D1XA 1YW2A 2GTNA 2XK9A 4D4YA 4I5PA 1UV5A 1QCFA 4LRJA 4YC3A 5FTQA 3R28A 4NW5A 4HGSA 4JX7A 1ZYLA 4GT4A 4AZWA 4ZLYA 3HRBA 3PWDA 4F9YA 3ROCA 4ANMA 1IAHA 3TDWA 1TQPA 3Q4ZA 4H3QA 4O7VA 5AUXA 2UVZA 2WO6A 3SAYA 3GFEA 4QMYA 2QODA 3FAAA 1ZLTA 4TYHB 4ZK5A 4ZY5A 3OCGA 4FKIA 3VO3A 4DH3A 2ETRA 1TQMA 2OZAB 5CNOA 3PJ1A 1Q8YA 4MF1A 4O0YA 4U0IA 3GFWA 2J0JA 5L6WL 3BU3A 5BUEA 3EN9A 2EU9A 3L8SA 3OY1A 3GBZA 4RJ7A 4U42A 3VBQA 5E8SA 3VUTA 5B2LA 2BRNA 2PWLA 2J6MA 1PMNA 2J7TA 3RTPA 3UIUA 2C6EA 4C4EA 4O0XA 1GJOA 4QMLA 5A4TA 2NPQA 4YZDA 3F3WA 5HG8A 1SMHA 3ZLWA 2VZ6A 3PYYA 1OUKA 1GIIA 3MY1A 3SKCA 3T3UA 5HLWA 3N9XA 2OXXA 5AP6A 2QO2A 3EN4A 3C0HA 2GFSA 3VULA 1YWNA 4N6YA 4N57A 4JIKA 1YI6A 3QQLA 4FIJA 2XF0A 1B6CB 2H8HA 2R3MA 4D4RA 3UO4A 5C26A 2OW3A 3R30A 5HQ0A 3MVMA 2GFCA 3OY3A 3TTIA 1YI4A 3LE6A 5A14A 4MF0A 2UZWE 5CSWA 5AUWA 2E9NA 3RPVA 4IVBA 1U5QA 1GY3A 2ITNA 3KXGA 4GCJA 2EXCX 4O0VA 4WOVA 2JFLA 3UGCA 1H25A 3FL5A 4IANA 3RAIA 2XUUA 1PXIA 4BHNA 5IA0A 5KNJA 1XBBA 3WZKA 3BLRA 3QHWA 2XIYA 2DYLA 3DK7A 4FTTA 4YJUA 3PTGA 2IJMA 4S33A 5AP2A 4V01A 1DI8A 3QZFA 1JPAA 1YXSA 1FOTA 2JC6A 5CF8A 3HAVA 2Y4IB 2PVKA 2V62A 3ZDIA 3EYHA 3C4WA 2CGUA 3T9IA 1JSUA 4D2RA 4R3RA 5AV4A 2XK8A 2PVLA 4FTIA 4JR3A 2XIKA 4RQKA 3DBCA 3NNUA 4F7JA 4QT1A 3RPSA 4R1VA 3T9TA 3GCSA 4NKSA 4U43A 3CJGA 5D11A 3VC4A 4CV8A 4DINA 2OIQA 3D5VA 5L6PA 3KMWA 2WELA 5C03A 5DNRA 4M13A 2X4ZA 4K0YA 3I60A 4A4XA 4DITA 2ZV9A 2QURA 2VGPA 2CKPA 5J7BA 2W5AA 2O3PA 4GU6A 2J50A 2PPQA 4D0XA 3GB2A 3VUHA 1O9UA 1MQBA 4XG6A 4F9AA 5BVFA 5E9EA 2SRCA 2GNJA 4FNZA 4CQEA 1G8AA 5CEKA 5KZ0A 5EM8A 4NEUA 4XRJA 3E93A 1LPUA 4M0YA 2PVYA 2P2IA 5IUGA 4ANBA 4EOOA 1QMZA 5GJGA 5D12A 3PJ3A 3BLQA 2YERA 3KF4A 3SV0A 2W1IA 4J8NA 4CFVA 3R22A 3QRKA 4L42A 3BPRA 4TNDA 4YJNA 2R3IA 4G6LA 1W8CA 3EOCA 3KULA 3TJCA 2IW8A 5HLNA 2VWXA 2JFMA 3R00A 4O7ZA 5KMLA 2CLXA 4MD8E 4PMSA 3AGMA 2BRBA 3DK3A 4LUEA 3GOPA 2B0QA 1XQZA 5AIRA 2UZVA 4TYJA 5CSVA 3BX5A 3V3VA 3EHAA 3TJDA 3D15A 2X6EA 1KV2A 1PKDA 4YU2A 4QQ5A 3C4FA 2QOBA 4YJQA 2W99B 3R7UA 4G34A 4O7NA 3AT3A 5JMSA 4FZ6A 4EYJA 2X9EA 2AC3A 1B39A 4XBRA 1JKKA 1ZMUA 3VF8A 4R77A 2EB2A 4YHTA 5IQGA 4CQGA 3SXRA 5CZHA 4O7RA 4HZSA 4KBAA 5CT7A 2VD5A 2QU6A 4UMTA 5CVGA 1WBSA 3ZS5A 3KKVA 4QTCA 4BCNA 2CKQA 3FJQE 1E1VA 2GHMA 3EH9A 3P7BA 2YJRA 5BVWA 3VF9A 5JT2A 1PXOA 4AW1A 3C5IA 3TV6A 1KE6A 3QXOA 2X2KA 5H8BA 4E1ZA 5M07A 2DS1A 1SVHA 4F0IA 3FYKX 2HXQA 3MSSA 2PULA 2YA9A 4AU8A 3U6IA 1J7LA 3TACA 2WMVA 4DG0E 3NZ0A 3KRLA 4JDHA 4JT3A 4RWLA 3H9FA 3SLSA 3ZMMA 4C62A 1TKIA 2JKQA 3ZO4A 4KIQA 2P33A 2BKKA 3RPRA 4TL0A 3MPAA 4YJVA 2QOHA 3PFQA 4YPDA 3L8PA 4BTJA 3OEFX 4JBPA 5L2SA 3PJ2A 2RIOA 3RBWA 3FKLA 3M2WA 2R3PA 1GNGA 1KSWA 5E8TA 1WBNA 3UC4A 5C8NA 1VR2A 2PHKA 1FGKA 3FUPA 3UTOA 2W0JA 3U87A 4BDDA 4CSVA 2ZDUA 2XKFA 1RDQE 2LAVA 2WOUA 3LJ2A 4JI9A 5JKGA 4GMYA 3OW3A 4LQMA 4E5BA 3VS5A 2C6MA 3MVLA 2QKRA 3W8LA 4E6AA 2OJIA 3MH3A 3ZUVA 2Z7SA 2HCKA 5BQ0A 5KO1A 4KIPA 3UQCA 3TNPC 2VTIA 1OKVA 2QD9A 3BV3A 3EJ1A 3F7ZA 2UZBA 4JDKA 4BDIA 4BCQA 3I6WA 4O27B 3PLAE 3QALE 1Y8YA 3CGOA 2XKCA 2RKUA 4Y73A 4BL1A 4FGBA 3PXQA 2O63A 4QPAA 5FDXA 4U80A 5T6KA 3UQFA 2OJ9A 3IQ7A 1XH8A 4JQ7A 4YSMA 2WTDA 4C57A 4X3FA 5DRDA 4G3GA 4X2NA 1UKHA 5LMKC 3ANRA 4MTAA 4EH6A 4XG3A 3FZPA 3G5DA 3RALA 4AWIA 2PU8A 3KULB 4DE4A 4MBLA 3HA8A 5AX3A 3CPCA 3FQSA 3OVVA 3W2QA 1OPJA 3EQIA 4J1RA 4RIYA 3W33A 4F9CA 1IR3A 3BKBA 5HCXA 5IQFA 4FKQA 4Y8DA 3A4OX 5IH6A 4YZ9A 4EQUA 2WQBA 2FH9A 4P90A 4ZJVA 2QOQA 2V22A 4FKJA 5CSXA 4G6OA 3WI6A 2J2IB 5FEDA 4TT7A 2B53A 4CFUA 2X8DA 5I3RA 3Q9ZA 2PVHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AGU A;  3QCX A;  4I1Z A;  4JG8 A;  3DKC A;  4PP9 A;  4QOX A;  4Y5H A;  3OXI A;  3WZU A;  1OIT A;  4FTO A;  5J8I A;  1FVR A;  5IA5 A;  3AKJ A;  5KMK A;  2UVY A;  1PY5 A;  2X0Q A;  4NFN A;  4XOY A;  3VHE A;  5BUI A;  5LMK A;  3KXM A;  4EZ7 A;  4YJR A;  1KE8 A;  4ZSA A;  4FRF A;  2BRO A;  3MIY A;  4MUQ A;  2PMN X;  3FE3 A;  3NUX A;  4QMX A;  2QOC A;  4EZ3 A;  1XR1 A;  3DQX A;  2BZJ A;  4QYG A;  5JRS A;  5LAR A;  2C6K A;  3CQU A;  2QON A;  2CNU A;  3GU7 A;  2FA2 A;  3GU6 A;  2W96 B;  3PXZ A;  4FTA A;  2J4Z A;  3A99 A;  4WG4 A;  4M8T A;  5IEY A;  3SGC A;  4DGN A;  3UDB A;  2O8Y A;  3PJ8 A;  4FKR A;  3FML A;  4ZP5 A;  5DT3 A;  2O65 A;  4EK3 A;  5EYK A;  4I94 A;  4BBF A;  4LGH A;  1Y6B A;  5HID A;  4YTI A;  2YCQ A;  5A9U A;  4M97 A;  2YDJ A;  2QO9 A;  3FZ1 A;  5JGD A;  4QEB A;  4EOR A;  1WMK A;  5I9W A;  1OL2 A;  3QBN A;  2ZMD A;  1FGI A;  2WOT A;  2QOK A;  4F7S A;  4HVG A;  3UIM A;  3CS9 A;  3NEW A;  4FV9 A;  4AT4 A;  2R0U A;  3ZSH A;  3GCP A;  4FVQ A;  2YLE A;  2B54 A;  4M0Z A;  3LQ5 A;  4FL1 A; 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