5A54A

Dyrk1a in complex with nitro benzothiazole fragment
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1
publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a54A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a54A01
3A7HA 3B2WA 2YEXA 3EQGA 3UMWA 5LCJA 1RDQE 4R7BA 1ZARA 2IVTA 3P0MA 3DK3A 4FYNA 4F7LA 3JY0A 5H2UA 4E3CA 1UV5A 4Q9SA 5BMMA 4U44A 2ZMCA 3Q96A 4E1ZA 1JBPE 2ZM1A 5HO6A 4FTUA 3QC4A 3RGFA 4BIDA 2Q0BA 1QMZA 5HIEA 1QPJA 4PMPA 3QUDA 3ZUUA 1UVRA 5M4CA 4O7VA 2OG8A 4RFYA 3IKAA 3DTWA 2PE0A 5CWZA 4D2RA 5C9CA 3DXPA 5GINE 1DS5A 1ZYLA 2QO7A 2NRUA 4MK0A 1OVEA 5E8ZA 4BKZA 2GS2A 3T8OA 2XEZA 4J8NA 4XRJA 1OL2A 2QHNA 2UW8A 4BDDA 3NVMB 4WT6A 1QPCA 4UYAA 4Z16A 2CGXA 2WOUA 4EH4A 2OIQA 1CMKE 2H9VA 3CR0A 4HZSA 4IZAA 3FWQA 4L01A 4A06A 1TQIA 5IMXA 3AC5A 2X8EA 3FZSA 4OBQA 2YAKA 3O7LB 5LMKC 3ZSGA 4N4SA 3FXZA 4QP8A 4UB7A 3VUKA 4BCQA 4QQ5A 1JWHA 2VWXA 2QU6A 3HV4A 3MFUA 3L8SA 3H3CA 3POOA 5KKRC 4I92A 5EW9A 3GCSA 5C8NA 5L3AA 5K5NA 3C4ZA 1YHSA 3KFAA 1W7HA 1WFCA 4GUEA 4O82A 5D10A 4MNEA 3A7FA 4ZTLA 4XG6A 2W17A 4C59A 4RT7A 3WF5A 1XJDA 3KN6A 4M66A 5HTBA 4PQNA 4U8ZA 4I23A 3RINA 4O7NA 5LMBA 1H08A 2WPAA 4GRBA 3EN9A 2XS0A 3I4BA 3M11A 4EOOA 5DYJA 4FK3A 5J87A 3FSFA 4FKTA 4OTIA 4MF1A 4U7ZA 5CENA 3U9CA 5BVOA 5CEIA 3UVQA 3LW0A 4JX3A 3U87A 2YDKA 4N70A 2XKEA 3E92A 3QHWA 4F1OA 3PVBA 3GC0A 3D14A 3QX2A 4C61A 3TDWA 4NM3A 1FBNA 3KVWA 4HCTA 4E7WA 3N51A 2CGVA 4TXCA 3KB7A 4B6LA 4U42A 5CY3A 4ZXTA 4BIBA 3RTPA 3PIZA 4G3CA 2J90A 3E3BX 4DT9A 3DJ6A 3EN4A 5CVFA 4AXAA 2GS7A 2RGPA 2Y9QA 4I5HA 3V8TA 3TUCA 3UZRA 2C5OA 4JT3A 2BTSA 4QMNA 4R3PA 4KSPA 3ZC5A 4AA0A 4PPBA 5DLSA 4QMZA 3TJCA 4BCPA 2VV9A 3PVWA 4I6QA 5KE0A 5EOBA 3EFLA 1OIUA 3GC9A 4UZDA 3PWYA 2PVHA 4PPCA 5H9BA 3RHXA 5KMOA 3ZLSA 4RZWA 4A4LA 4MBJA 3KU2A 4IX3A 4I1ZA 2ZV9A 2ZVAA 2VTHA 3IW5A 3MH2A 4G16A 4I4EA 2C6KA 2ITOA 3ETAA 4FZDB 3EZVA 4J98A 4P4CA 5AP4A 3ZO2A 5M07A 3CGOA 3OTVA 4CMUA 3Q4UA 2WU6A 4RIXA 5CXZA 5A4QA 3R0TA 3U8WA 3QRUA 4FV5A 3R63A 2IW8A 3DAEA 5EI8A 3LE6A 5HCXA 3VBWA 1IG1A 3MPTA 2PU8A 4PDPA 4W4VA 3TNPC 1NVSA 4KBKA 1ZLTA 3PFQA 4O0SA 3CXWA 3Q9ZA 4M84A 5EKNA 2UV2A 4WRSA 2YM4A 2OBJA 4PNIA 2IW9A 4C2VA 5LWMA 3ZZEA 5HTCA 3VNTA 5AEPA 2BALA 4M13A 5A6NA 4QNAA 3ZM9A 2OJJA 2YWVA 2W4KA 3GBZA 4KS7A 4E6DA 4XG7A 2R2PA 4RX7A 3DY7A 4K11A 4MEDA 3DPKA 4Q5EA 4ZTMA 4D0WA 2B53A 3DQXA 4LRJA 4ACGA 4ZP5A 2R3QA 3R21A 4DGLC 3N4TA 3L1SA 3GCUA 2HIWA 2V0DA 1J1BA 3C4FA 3VS3A 4KAOA 4MD9E 1KWPA 1ZY4A 4MHAA 1SZMA 2IZUA 2UVYA 5CZIA 4C4FA 2BAQA 2BDJA 2EXEA 2WMUA 3NWWA 3FC2A 4HYHA 1FVTA 2O8YA 4JX7A 1LUFA 3IOKA 4L44A 3UO4A 4IB0A 3MV5A 1HOWA 2B52A 4CG8A 4Q9ZA 3ZHPC 4BR3A 4RJ3A 3KEXA 4FKWA 3RM6A 4LGDA 2JFMA 3SX9A 2A2AA 3LM5A 1YDTE 2BCJA 5HESA 5CALA 2XIKA 4PMTA 2VO0A 3RPOA 2OZOA 2JDVA 3HX4A 4N0SA 3FZ1A 2X4FA 5AAFA 3B2TA 4AS0A 5EOLA 1M14A 4DBNA 3ZRKA 5EHLA 2LGCA 2WTKC 2H34A 1O6LA 4H3BA 5I0BA 5L4QA 3RPSA 5L6PA 4D4VA 3PA3A 4EEVA 4BBEA 4F1TA 5A3XA 5KKRB 5IA4A 4IAYA 3F3WA 5FXRA 1TVOA 4O7SA 1MRYA 4EYJA 4Y46A 3VW8A 3VHEA 5HVKA 1PRYA 4CZYB 3T3VA 4EKLA 3KN5A 3CTJA 3VN9A 1Y57A 2PULA 5BUEA 3JXWA 3QX4A 4B8MA 3P86A 4FZAB 1KE5A 3AGMA 3CTQA 2IW6A 4JR7A 1X8BA 5HEZA 4BDKA 4CNHA 1H1WA 4EKKA 5DT3A 5EH0A 3VWAA 1H28A 3ANQA 5BVEA 3VBVA 3DBQA 3LXPA 4ZSJA 4IE9A 1E1VA 4GJ3A 2AC5A 2B4SB 3LCTA 1YI4A 1WCCA 4XV3A 4Y85A 4O22A 3FEGA 4BCOA 2WTDA 4BBMA 4YO4A 4EHVA 4RIWA 2GQSA 1W84A 4U80A 4QP9A 4DYMA 3ALOA 4C4IA 4AG8A 2XNNA 4R7IA 4JVGA 4D9UA 2HELA 1YI6A 2VWUA 3AT4A 1PW2A 4NCTA 3UG1A 5AR4A 1R0EA 4FG7A 4F63A 4AZFA 3LFEA 2JAVA 4IB1A 2PZPA 3BKBA 1YOMA 3ET7A 4WBOA 5LQFA 5E1EA 1S9IA 4BKYA 5J8IA 3ORXA 4YTIA 3EN7A 2EB3A 3NYOA 4FSMA 4V05A 5IPJA 3G2FA 4CFXA 3KQ7A 4E93A 5DR6A 1G5SA 4W9WA 4BI0A 4O96A 5CANA 5HTIA 2PHKA 5IQIA 1Y6AA 3ZXTA 5B2MA 4BDIA 3QBNA 2IPXA 4FTQA 1CM8A 4BCHA 5K4JA 1YDSE 3O8TA 3QA8A 3QKKA 4FKRA 3CP9A 4JDJA 4JG6A 4ONAA 4D1XA 4NWMA 4RIYA 3RK9A 1ZRZA 3E5AA 4I0RA 5EHOA 1IA9A 4DEDA 2PVYA 3SC1A 2X6EA 4WKQA 4IB3A 4CFVA 4BYJA 3T3UA 3GENA 4PNKA 3UQCA 4I5CA 4JRVA 1FMKA 2CKQA 2OF4A 4RX8A 4W8DA 4XS2A 1FVVA 5ETAA 2X39A 3ATTA 1Q5KA 3ZO4A 4M3QA 5E4HA 1YOJA 2RFSA 4QMOA 5ANOA 4CFFA 3N9XA 5AR2A 5L6WL 4YZCA 3CPBA 2UZDA 5T68A 3PLAE 2R3NA 5DWRA 2W1CA 2C0IA 3OY3A 4YJRA 4YO6A 5DOSA 5AA9A 3BBWA 3FAAA 4AW1A 4H36A 3TUBA 2XP2A 4F7JA 3PA4A 5KUPA 3FMMA 2GSFA 2JD5A 2YERA 3H9FA 3I6UA 4JR3A 3VUMA 4ITHA 2ZV7A 4O83A 5EHYA 3U51A 3V5PA 1Z57A 3F2AA 3BLRA 3CQEA 3TM0A 3LPBA 1OPKA 4JBPA 4QMYA 4F4PA 3DKGA 5LCKA 5AAEA 2YN8A 4G3DA 3SXSA 5HD4A 3MBLA 5LVMA 4GK4A 5HLWA 4MXOA 4O7LA 4H3PA 5CSVA 5FGKA 3FBVA 3W32A 3ZM4A 3MJ2A 4DG3E 4IWOA 1V1KA 2IZSA 2BRBA 2V62A 3EH9A 3G33A 3V5WA 4D2PA 4U5JA 2VNWA 3FLQA 4TWNA 5CZHA 3KK9A 1FVRA 4FSTA 4O86A 2EB2A 3R2YA 1QCFA 4QP4A 3PWDA 5DN3A 4GSBA 1XWSA 2ZDUA 1TQPA 1OB3A 2WGJA 5FBOA 4WUNA 2VTJA 3UBDA 3R1QA 4G3EA 4LYNA 4YR8A 2CKPA 4KRCA 3DOGA 3VF8A 3A7GA 3FL4A 2W1IA 1WVWA 4USDA 2CCIA 3PVGA 2GPHA 2WTKB 2ZM4A 4NT4A 2XYNA 3EL8A 5DHJA 4D58A 4QYYA 2R5TA 1ZMUA 2GNIA 2Z2WA 3PXRA 3VS0A 3TUDA 1VYZA 3FI3A 4AE9A 2PTKA 2YDIA 3NUNA 3OCTA 4FOCA 4NJDA 4FR4A 4QMPA 4Y72A 1TKIA 1J7IA 3PTGA 3UTOA 4ANBA 2JDOA 3BYUA 2VWVA 2OGVA 5I9YA 2G9XA 2B7AA 4BVUA 3PG1A 4IC8A 2OJ9A 4YTFA 4D55A 2OJGA 1GY3A 3Q04A 3Q3BA 4GK3A 4Q2AA 3MJ1A 2GS6A 5KNJA 4M68A 1RJBA 3KXMA 3V5TA 3QLFA 1P2AA 4A9YA 3DJ7A 3VRYA 4EUUA 2PUNA 3PE2A 2OSCA 2F4JA 2OFVA 2HWPA 3ACKA 2WTVA 3OW3A 4UXQA 4I94A 2UZUE 1Y8GA 3F3UA 3CD8A 3HMPA 2UZTA 5HE1A 3TV6A 3UGCA 2XF0A 3W2SA 1XBBA 2I0HA 4ANSA 3CJGA 2WMVA 3SG9A 3D5UA 2G2HA 2WKMA 3R02A 4NL0A 4FOBA 4PV0A 4BTKA 3HV5A 4BY9E 4AZVA 4NFNA 1PXOA 3V5QA 1Q8TA 4HZRA 2XM9A 5H8EA 3MVMA 2A1AB 3I79A 4S30A 3EQIA 5IUHA 3F3ZA 3EN5A 2R3MA 4IAFA 4ASZA 4RJ7A 4PTEA 4Y5QA 4XOYA 3NGAA 4TY1A 4USFA 3NEWA 2A4LA 4QPAA 2VWWA 2YIRA 2JITA 3FQSA 3PYYA 5TF9A 1OIRA 2UVXA 1KSWA 3FMJA 5CF8A 5C8MA 3QRTA 3DFAA 3ZS5A 5IF1A 1ZMWA 2FA2A 5FQDC 2YM5A 2BKZA 3KXHA 4GUBA 1PYXA 1UNLA 2JKMA 5EG3A 1W8CA 4G34A 4HCUA 4XG8A 2YIWA 1OIQA 1S9JA 2J5EA 2RL5A 1PY5A 2W5HA 3P08A 1OKYA 4J8MA 4EONA 3HRCA 3R7UA 5E8YA 5E8XA 2O0UA 1PMVA 3MFTA 2PVKA 3UNJA 5LXMA 1LPUA 1Q3DA 1Q4LA 3R8MA 5M57A 2FB8A 2LAVA 2QR7A 3MTFA 5KMIA 2GNLA 1CTPE 2I7QA 1YKRA 3AC8A 3FLYA 4F65A 3EWHA 1Q8WA 2C3IB 4ZK5A 4ALUA 2IN6A 2JIVA 2XK8A 3HMIA 5KZ0A 3FJQE 3RAKA 3ZSHA 5IH6A 2C0TA 4CCUA 5HG7A 3ZO3A 3R71A 4E20A 3MY1A 5E1SA 4RLKA 5EM7A 4DT8A 3RNYA 4YJTA 3Q2MA 4L42A 4GV1A 4FTIA 4BDEA 2IVUA 4I0TA 4RG0A 3FHIA 4BCGA 2C4GA 3OD6X 4AFJA 1XH6A 5JRSA 3WYYA 5KMLA 3WZDA 2QI8A 1BL6A 1U5RA 1OL7A 3GQLA 4AX8A 5IMEA 4GFMA 3IQ7A 2W5AA 3E93A 4FUYA 2R3LA 3W1FA 3EQCA 3P9JA 4CRLA 4KUJA 5HCYA 3KCKA 4L8MA 2EXCX 3CKXA 5DEYA 1PMUA 2P33A 5EYKA 5HX8A 5HVJA 3F9NA 4X6QC 3TN8A 4EQMA 3HA6A 4TWCA 3HMOA 4FNWA 4JOAA 3RCJA 3UYSA 4DGNA 4JBVA 1XQZA 3QWJA 3ZONA 3R9HA 4EZ3A 1H25A 4GJ2A 2R3GA 4DH5A 1AGWA 1T46A 4FK6A 5C4KA 4TZRA 3DT1A 4FT7A 4KIKB 3VBTA 3TTJA 4AAAA 2XB7A 5LJJA 2G1TA 4KKEA 4O6EA 3SHEA 4E4NA 4GIIA 3MPAA 2KULA 3NUXA 4FEWA 1XH5A 2WD1A 1YQJA 2HY81 3FC1X 3F5XA 4MWIA 4ZSGA 2BZIB 5HQ0A 3Q9WA 3D5VA 3RWQA 4L3LA 4HJOA 2CN5A 1VYWA 2W4JA 4IDTA 3DDPA 4Y83A 2F2UA 4E26A 3IW8A 5EKOA 4ZZMA 2PZ5A 2B0QA 2BFXA 5CTPA 2VZ6A 1PMNA 4R77A 5HKMA 1WBOA 3C0HA 3R8UA 2WEVA 4YNEA 1OL6A 3TNIA 4E73A 2JFLA 4DITA 4W4WA 4WIHA 3AD6A 1ND4A 5KMJA 3DJ5A 4RWKA 5EW3A 5HGIA 1KUTA 5E8SA 3GGFA 2Y7JA 4NCTC 4JBQA 5CASA 1Q99A 2ZAZA 5CNNA 2CGUA 4E8AA 3GP0A 1WBWA 3Q32A 3F5PA 4FSWA 4H05A 5CF5A 4L9IA 3KXGA 1XKKA 1WMKA 2YABA 4WNKA 3HV3A 5AWMA 1H1QA 4BBFA 2BDFA 5C4LA 3POZA 4QMUA 4RZVA 4RJ4A 5IQGA 4IADA 4EZ7A 3NCGA 3KRWA 2C6IA 2C47A 3FI2A 3PXZA 2ITWA 2YM8A 3QKLA 4B4LA 4L67A 3QZHA 5E9EA 3CD3A 2BRGA 3QC9A 4LUEA 3BLHA 3GOPA 2R3HA 5GZ8A 3LMIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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