5A4EA

Dyrk1a in complex with methoxy benzothiazole fragment
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1
publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4eA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4eA01
3F3ZA 5M53A 3HA8A 4M67A 3VC4A 4CMTA 4AGWA 3NEWA 2PVHA 3OOGA 2RKUA 3ZUUA 2BR1A 3G90X 3DFCB 3VNTA 5JEBA 4R78A 3W8LA 4XH6A 3L8SA 4I6HA 4U8ZA 2EB3A 4CFFA 4JBOA 4L3JA 1YDRE 4MXZA 4QYHA 3E3PA 5EKOA 4J8NA 4KRDA 4YJQA 3TNQB 3EL7A 4P5QA 4EH2A 2OI4X 2YM5A 5F1ZA 5KMMA 1A48A 3KKVA 4ZS0A 3HP2A 3PY3A 3VN9A 1K3AA 4ZOGA 3GC7A 4K9YA 2YLFA 3NMUF 4IDVA 2BPMA 2ZAZA 1XKKA 3BX5A 3OCTA 4ASZA 2YA9A 2YFXA 4DT8A 4ZP5A 5J95A 2I1MA 2WMSA 4FVQA 5BNJA 4BI2A 4DHFA 4IM2A 3H9OA 3QZIA 4N6YA 4IAYA 4ZSGA 1CTPE 4RC3A 5BMSA 4B8LA 2GNJA 1FVTA 3Q3BA 3UMWA 2QOLA 3OY1A 1G5SA 1MUOA 3P0MA 3HL7A 3A2CA 3AT3A 3QL8A 2XNPA 2YM4A 3PJCA 1E1VA 3HVCA 2W1CA 5K4JA 2X7FA 2XK9A 4LGDA 5CEOA 4KS8A 4YO6A 3SOCA 2I7QA 4AX8A 2YIYA 2QG5A 4FYOA 1B38A 4RZVA 2BALA 2ZDUA 3GCUA 3MH0A 2ZJWA 3FXWA 4FG7A 5CWZA 3G6GA 4FSQA 4OLIA 2A27A 2VWZA 3JPVA 5IQAA 4O0SA 5HEZA 4PDYA 1ZMVA 3LCKA 3M1SA 3HMNA 5BVOA 5B2LA 3VS5A 3D5VA 2Z02A 1YI6A 3LFDA 4S31A 4XG9A 3H9RA 3TEIA 2R3NA 3D15A 1OKWA 3GU4A 3QQKA 1CSNA 4FTIA 3SV0A 4PMPA 4BTJA 2C5NA 4O7LA 2BIKB 2WD1A 3AD5A 4IDTA 3ACJA 3VUHA 4DC2A 3ELJA 3QZFA 1ZAOA 2WXVA 3ORIA 4QT1A 5A4TA 5KMIA 3EKNA 2WMRA 4O2PA 1JAMA 3EQPA 4PL4A 3R9DA 4ZTQA 2UW8A 3TKUA 5I9VA 2J4ZA 3HRFA 3OCBA 4FV9A 4RIXA 3TZ9A 2J90A 2C68A 4BCFA 4DAWA 3LZBA 1YXUA 5LVPA 1BX6A 2WQMA 4ZLYA 2WMTA 3CJFA 3C0GA 1ZMWA 2GHMA 4DLIA 5LQFA 2RIOA 4AT3A 2R7BA 2VTNA 3DZQA 3ORZA 2CLXA 4R7IA 5IDPA 4I92A 4D2VA 3K2LA 3O2MA 4D1XA 4DH1A 4O7WA 5CSXA 2Z60A 3CC6A 5BUJA 4C3PA 5J7HA 4PPCA 1ZZ2A 4IC7A 3D9VA 3LLTA 3ORPA 3OP5A 4YHJA 2I6LA 1PXOA 3MPTA 5E91A 3F3UA 4YJOA 3V8SA 4MXOA 1Q8ZA 2XCKA 5EYDA 2ZV8A 3SQQA 2PVMA 4HZRA 5F4NA 4ACCA 4G3CA 3M2WA 5LMKC 2EUFB 5KHWA 5AA8A 4X3FB 4PMMA 4TWNA 1H26A 2WMBA 4GRBA 5FDPA 3SKCA 3EN9A 4RFMA 4W4VA 4EZ7A 1WVYA 5ANEA 2C5VA 3NAXA 2CGVA 3QQHA 1O6YA 4N6ZA 4JJRA 4E93A 1U46A 3DOGA 1DM2A 3W10A 4EOLA 4USEA 5EQYA 4XV1A 3LFQA 3CQUA 1PYXA 4PTCA 5EHOA 2OO8X 3BYVA 5CSWA 4O6LA 4E4NA 3LW0A 5AX9A 2W99B 3VAPA 3VBQA 3EHAA 3MW1A 4D2SA 5AA9A 3DKFA 5AAFA 3MDYA 4E7WA 3WE4A 3OWPA 1J3HA 4YLJA 5M44A 2IVTA 1KE6A 3AC4A 3C5UA 5IA3A 1OIRA 4EEVA 2HW6A 4LV8A 5M06A 3UQCA 2WMQA 3O23A 2H6DA 3DZOA 3QD0A 2XH5A 4AW2A 5JQ5A 5BVNA 2WHBA 3BWJA 3FZ1A 5FEDA 3CQEA 2WTKB 4FE2A 4KS7A 1WBWA 2XM9A 3R0TA 3LMGA 1WFCA 4FTCA 1W82A 5J8IA 4GSBA 2JDOA 4MAOA 4QMUA 3TTJA 4CXAA 3E8DA 1PXIA 4WO5A 4CT2A 4QTEA 3LFSA 3PVBA 4O96A 3UOKA 2QR7A 3PPZA 1NW1A 3FSKA 3ALOA 5L8KA 1UKHA 4UYAA 2W4OA 3HMMA 5IMXA 2R3IA 5DR9A 5CF6A 4A06A 4MNEA 4F9CA 2CJMA 5DIAA 3DTCA 2RFEA 3EFJA 4AS0A 2WU6A 3KVXA 4FV6A 2C3KA 4G6LA 3JY9A 4X2GA 4TYIA 4L9IA 3GT8A 2BAQA 4DFUA 1PKDA 3AT2A 5CI6A 1OKZA 5HNGA 4W9XA 4RX5A 2VU3A 2PULA 4GYIA 5AAEA 2QI8A 4RQKA 4N57A 1OKVA 2IPXA 3C51A 3DQXA 3RBWA 3DXQA 3SW4A 2QO9A 3TDVA 4A9YA 1PXLA 1IASA 2VAGA 3K54A 4ASXA 2ETMA 1H28A 5E8WA 1W8CA 2J7TA 1SYKA 1BLXA 3QA0A 3ROCA 2ETRA 3UVPA 4BWPA 5HBJA 5KO1A 3BLHA 4FUXA 4EH3A 5M4CA 2ITUA 2R3FA 2JDVA 4A07A 5AV1A 1XO2B 4ZMEA 2RF9A 3N51A 4IB5A 3VF9A 2O65A 1PMUA 4TW9A 3NUNA 1NVRA 5B7VA 2W1GA 5BUIA 2VX3A 4BYJA 3ZYAA 1T46A 2RFNA 4RZWA 4YJUA 2XMYA 3SC1A 3T8OA 4D0XA 5K5NA 4QMQA 3OT8A 3QUDA 2Y4IB 5EFQA 4C4EA 4U41A 4NL0A 1YI3A 3ZO4A 1UV5A 4E26A 2XIYA 4FL1A 3VJNA 2QLQA 2WQNA 4NUSA 5DGZA 3MB7A 3TJDA 2PUNA 2VTAA 2JC6A 2B55A 4YC6A 5GZ8A 3LIJA 2Q0NA 1R39A 5CT7A 4L7SA 2QOKA 5EDRA 3FXZA 4A9SA 4E8AA 4BCNA 2BILB 3RCDA 1H24A 4FI1A 4W8EA 4GT5A 3IKAA 4LMNA 3E62A 4MKCA 3DXNA 3MA6A 5M55A 3DKOA 3Q6UA 2GCDA 4P7EA 5J79A 3DGKA 3OXIA 2QHNA 5K0KA 5TOZA 5HLNA 4V0GA 3U6HA 1UVRA 1ZYLA 3CPBA 3OWKA 4H3PA 5L2QA 4FNYA 2HWOA 4L46A 2C69A 3W32A 4F9AA 4QP4A 4QTDA 3A8WA 1OI9A 5DWRA 4AZTA 4NJDA 3P78A 3POOA 3IS5A 4ZTRA 4DYMA 3ZLXA 5IQIA 3P86A 5L8JA 3VQUA 5E8SA 3G6HA 4IX6A 2BKZA 3HYHA 2BMCA 4JX3A 4D4RA 4C02A 1Q3WA 5HD7A 2YM6A 4A4LA 4QPSA 4F70A 4PQNA 3AXWA 4W4YA 3NX8A 4WKQA 2J51A 2GHLA 4TTHB 1Q8UA 4O0TA 2OWBA 3F2AA 3LXLA 1ZYCA 5A46A 4XG3A 5I9ZA 4EH8A 2C6EA 4QQ5A 5JK3A 3ODYX 2J5EA 4DH8A 4IC8A 2HZ0A 3D7TA 4FKTA 3QTXA 4LRKA 3FI4A 2BZHB 4LOOA 4BCPA 4G5JA 2W1IA 3QKKA 3D5UA 5EYMA 3R6XA 3FMMA 4FKRA 3ZMMA 5C26A 4J98A 1O9UA 3FI2A 5CXZA 2C0IA 4XG7A 5LWNA 3R04A 1PW2A 5D7AA 1WCCA 4EI4A 4Z55A 4GEOA 4RVTA 4AN2A 1LR4A 3NYVA 4IH8A 4RT7A 5FWKK 2UVYA 4QMSA 4JQEA 4BKYA 2OK1A 3HECA 4OTGA 5HIDA 5I3RA 1FMOE 5KMKA 3Q53A 4XG8A 4U45A 3OWLA 1UU8A 4GK3A 5DNRA 4M97A 5FXSA 4HVHA 4G17A 5C8KA 4RC4A 4BCIA 5LXMA 3FPMA 5IQBA 5HGIA 2XEYA 4QYGA 5E9EA 4ZSAA 3QZGA 4DEEA 5J5TA 4JBVA 3EYHA 3VS7A 4R1VA 4AA4A 4IJ9A 1NY3A 4UY9A 4IW0A 4LL5A 4AW1A 1Y6AA 2IJMA 1FMKA 3Q4CA 1ZOHA 3GOKA 1H27A 4ZY4A 5H9BA 2ITVA 4CMUA 5IH6A 4BDEA 4KNBA 4BN1A 4NM5A 3NIEA 2BZIB 3F7WA 3GU5A 5C03A 3PG1A 4W8DA 3D2IA 2XK6A 3FYKX 4IWPA 1B6CB 3FKNA 4MD9E 4CMOA 4PNIA 5JSMA 5EQEA 4JL9A 4TXCA 5TO8A 5FTGA 1YI4A 2O8YA 3A60A 1G8AA 3ZSGA 4O83A 1L8TA 3RVGA 4XUFA 5D9HA 4F6WA 2ERKA 3CGOA 3NNWA 3OOMA 4G3FA 5DRBA 3ANQA 3EQFA 3PP0A 1LEWA 3FPQA 4ALVA 2F9GA 4R5YA 2PPQA 4NKSA 2ERZE 3QTSA 4FBXA 4WT6A 5E8XA 2W9FB 4FT3A 2W1ZA 3H30A 2PMNX 3PJ2A 3PWYA 2VTIA 3PE1A 4G3GA 2ITZA 4FKVA 4II5A 4WNMA 3RNIA 4CFXA 5AP2A 5IZFA 3UVQA 4FOBA 3RHKA 4C4HA 3POZA 2UW0A 2QOBA 2Y9QA 3PJ1A 2UZEA 4EOOA 3V6SA 4RWJA 2JKOA 4BDAA 4AU8A 3R71A 3KXHA 5FXRA 4K8AA 2J0IA 3BELA 3EN7A 3RPYA 2OH0E 4OT5A 5HU3A 4YZCA 1OECA 3NDMA 3K5VA 3LJ0A 4FOCA 1FGIA 2QODA 4ID7A 3KRXA 3ZXZA 3MVMA 4EHVA 4JR7A 4E3CA 5HO8A 5LWMA 3UTOA 4RJ8A 3QCSA 4WRSA 2OZAA 5L6WL 3UPXA 3ZEWA 3MB6A 4JIKA 2NPQA 3QFVA 3VUKA 1ZMUA 4DGMA 1YDSE 4UMRA 4FNWA 2YAKA 3FV8A 4IAAA 5IQGA 5BX0A 1QPJA 4AA5A 3HUCA 3UNZA 3KFAA 3E7OA 3HMPA 4MVFA 4M12A 2X2LA 4EOSA 5CU6A 3HEGA 4XMOA 4GU9A 3MY5A 5CS6A 3VS1A 2R3PA 2VRXA 3KRWA 3MS9A 4CGAA 4EHZA 2GPHA 3L1SA 3PVUA 3AMYA 2YCQA 2JDSA 1YHSA 3EN4A 2YWPA 3H0ZA 4JNWA 5HO6A 1WBVA 4M13A 2B1PA 2YISA 4X2KA 4FG8A 3CQWA 3VS2A 3ZFXA 4EJNA 5IDNA 2R2PA 4E4LA 1W84A 4I41A 2PVKA 4J96A 4IM3A 5IF1A 5AM6A 4MXYA 3QX4A 5A54A 2ONLC 3GFWA 4PPAA 3EH9A 3M42A 2HIWA 5CNNA 3V8TA 4O0YA 4HVSA 3MVJA 4FSRA 1MQBA 3MFSA 4S34A 4EWQA 1OIQA 2C6KA 4L45A 2PMIA 3LFFA 5HX8A 3BBWA 2J0LA 3NVMB 2YAAA 3UG1A 4M8TA 4EK8A 4BZDA 1ZYJA 4BCHA 5CAPA 3QRJA 4TYEA 1M7NA 3QTRA 1AD5A 4FKLA 4U97A 3IQ7A 1OGUA 5HICA 1NXKA 4YHFA 5DFPA 1J7LA 2JKQA 2YM8A 3PE2A 4Y95A 5FM3A 2W5AA 4FIEA 3ZM4A 4ANNA 3UP7A 2FB8A 1Z57A 5J7BA 3PVWA 2XEZA 3UG2A 1GZNA 4D9UA 4QP6A 1ZWSA 4O38A 2YLEA 4GJ2A 4OTRA 4CYIA 3GCQA 3NYNA 4DEGA 3FKLA 3OTUA 4UMPA 1OBDA 2W1HA 4WSYA 3GXLA 4GFMA 3UGCA 3RPVA 3ZFMA 3KRLA 3OBJA 5AR2A 3VRZA 3FQEA 4YZ9A 4QMOA 3COKA 4IAFA 4ZEGA 4DH5A 3A4OX 2WOUA 3SGCA 1P4OA 4C37A 3OUKA 3BHHA 2QKRA 2W96B 3PYYA 4FA2A 3E3BX 5HBHA 3LM5A 2BRNA 4N4SA 1WBOA 4I0RA 3U9NA 2C6LA 4Y72A 3VW8A 4XX9A 3COIA 4Z3VA 2HXLA 4KBKA 4CKRA 4D2PA 3O7LD 1DS5A 3A61A 4U7ZA 4P2KA 1JWHA 4FV1A 4BB4A 1XWSA 4LGGA 3UE4A 3LAUA 1CKIA 1OPJA 1PF8A 1XH5A 3KULA 3R00A 5C01A 3ZRLA 5LOHA 4O7ZA 4R77A 2YACA 3FEGA 4GFGA 3AGMA 5AP6A 3K3IA 1NA7A 2VTQA 4ITJA 4HCTA 2C3IB 4WUAA 5ANDA 3S4QA 3QALE 3E63A 1YRPA 1URCA 4FTTA 4V04A 5HTIA 5H8GA 2CSNA 2QO2A 2YIRA 5CVGA 5EG3A 4D1ZA 5CX9A 5CF5A 5DOSA 4K18A 2CPKE 2C6DA 4Y83A 4IANA 3A8XA 2C6IA 3WYXA 4O7SA 2A0CX 5BVFA 4FKGA 4JG8A 3OUNB 4TWPA 4YU2A 4OTHA 4FTRA 5HE3A 3AC5A 4AP7A 3ACKA 3GGFA 4FZDB 2BHEA 4G3EA 3QHWA 5EYKA 4CFMA 4BI0A 4DINA 4EYJA 2XCHA 3F9NA 3LPBA 5JRSA 3ZHPC 4C61A 4JIAA 4EC8A 4YSMA 3ZLSA 1MP8A 5FQDC 3Q9WA 4EORA 3P1AA 4RC2A 4UX9A 3I4BA 4J8MA 4R3PA 3V51A 4ZJVA 2CKPA 4FIFA 4RJ7A 4U9AA 3SDJA 3P7CA 4KIKA 2V5QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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