3FBVA

Crystal structure of the oligomer formed by the kinase-ribonuclease domain of ire1
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
418
structure length
415
Chain Sequence
LKNLVVSEKILGYGSSGTVVFQGSFQGRPVAVKRMLIDFCDIALMEIKLLTESDDHPNVIRYYCSETTDRFLYIALELCNLNLQDLVESKNVSDENLKLQKEYNPISLLRQIASGVAHLHSLKIIHRDLKPQNILVSTSSRFTADQQTGAENLRILISDFGLCKKLDSGQFRNLNNPSGTSGWRAPELLEESTKRRLTRSIDIFSMGCVFYYILSKGKHPFGDKYSRESNIIRGIFSLDEMKCLHDRSLIAEATDLISQMIDHDPLKRPTAMKVLRHPLFWPKSKKLEFLLKVSDRLEIENRDPPSALLMKFDAGSDFVIPSGDWTVKFDKTFMDNLERYRKYHSSKLMDLLRALRNKYHHFMDLPEDIAELMGPVPDGFYDYFTKRFPNLLIGVYMIVKENLSDDQILREFLYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase, hydrolase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
publication title The unfolded protein response signals through high-order assembly of Ire1.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 112
structure length 415
sequence length 418
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fbvA02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 3fbvA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fbvA01
2YIYA 2IZUA 3DBEA 3C51A 2OICA 5KBRA 1YHVA 2ZDUA 3GT8A 4DFUA 3NW6A 4ZEGA 2CGXA 4FZAB 2FA2A 4EYMA 4FNXA 4F9WA 4Q9SA 5LQFA 4WOVA 2CKEA 3MY5A 3HKOA 3MH2A 4QMPA 3IOPA 3VHKA 5IPJA 2OKRA 4ACCA 4AZTA 3ZM4A 4DGMA 4J53A 5KHXA 1JKSA 3P79A 3Q60A 2B52A 2HXLA 3G2FA 2Y0AA 3FMMA 4O7ZA 3QQFA 4I23A 2CCIA 4EK4A 4USEA 4TW9A 3ZEPA 3R63A 4PL5A 1XH6A 3AG9A 3E8DA 4L00A 4RVMA 1VJYA 4CTBA 2QD9A 4IBMA 4ASZA 3QHRA 4BKZA 3TNHA 5C1QB 2V62A 3OCTA 4LV8A 4HPUE 3V5PA 3E62A 3WILA 4YNOA 2OF2A 4D2WA 2PVYA 2XM9A 4W8DA 4FEQA 4K0YA 4EONA 4HVDA 5AX9A 4WG5A 4IC8A 4BL1A 4O0UA 4XLIA 3LVPA 3MY1A 4EH4A 1YXVA 2C69A 4BYIA 1BUHA 5BVNA 2XNOA 2F2CB 3HP2A 4F0IA 2C6LA 5CQWA 3GQIA 3C7QA 4FV5A 3PJ2A 4IC7A 4KSPA 4YLKA 4OTWA 3VBTA 2ZMCA 3Q04A 1AGWA 1UKIA 2XIRA 3TN8A 3HA8A 4CFXA 2YAKA 2WEIA 4WA9A 4X21A 4E5WA 4IX4A 2R3RA 4F9YA 3TUBA 2VTLA 4U8ZA 3UPZA 1FMKA 2XNBA 1R78A 5B7VA 2OJJA 2ITOA 1OGUA 5DIAA 5CAPA 3R8MA 2EVAA 5HESA 3QD3A 4PTCA 5D12A 2A1AB 3TTIA 2VTAA 4XG6A 2ZJWA 4AGCA 3CGOA 1UU7A 4XNEA 5BUIA 5CSHA 4DGNA 3F82A 4QMQA 3TIZA 4G9CA 2QI8A 2VTNA 1GZ8A 3VRZA 5HU9A 3GUBA 5KX8A 3NCGA 4O7RA 2HIWA 3ERKA 3FZPA 3SXFA 4RFYA 1CKIA 1FINA 2B55A 5J9YA 4DGOA 3PG1A 3EFKA 4NYEA 3FQSA 3ITZA 5CU0A 4CKRA 2YM8A 5LVLA 3FQHA 5M55A 4DEDA 3QC9A 2WMUA 3RWQA 2UVXA 4XYFA 4DH1A 4H3PA 1UKHA 2DS1A 4X7QA 3TI1A 5EKOA 5KUPA 5AUZA 5HBEA 3ZOSA 4BDHA 1W8CA 3FI2A 5BMMA 2JDRA 3EB0A 2XIKA 1K9AA 3V04A 2C68A 2UW4A 3E88A 1QPCA 2BR1A 4EK8A 2V5QA 5I9YA 4QMYA 1ZYSA 3SXSA 2OBJA 3OCBA 5IEVA 2IN6A 5EHLA 5B2KA 1WFCA 3QTSA 4L42A 4KIOA 4MBLA 3W33A 5CAVA 4J98A 4YJVA 4F9CA 3FMHA 3VUIA 4FIHA 3H4JA 4C4FA 4ZSAA 5HVKA 1BYGA 2QCSA 4FV6A 5HU3A 5C26A 4FE2A 2X4ZA 4YPDA 5HE2A 1Q41A 1BI8A 4GIIA 5HBHA 3RK5A 3UMWA 3UZTA 1IA9A 4FV7A 2YCQA 2IZTA 4L01A 4K33A 4YZNA 4YP8A 4RJ3A 5E1EA 4ZTRA 3RNYA 1OUYA 3A7FA 2OGVA 3PG3A 4I5CA 4M67A 4O91A 3N4VA 3EN5A 2E9UA 3VC4A 4BTKA 2GHGA 2BAQA 2J0LA 4RJ5A 2BHHA 1UA2A 2BCJA 4UZDA 5CF8A 5HTCA 5FUTA 4N0SA 4CLIA 4ZJVA 3IOKA 4HVSA 4C38A 3KXXA 3WBLA 2G2HA 4PTEA 3E7VA 2ITPA 5BYZA 4MYGA 3UIXA 1KE6A 2KTYA 3Q4CA 3V5TA 3VIDA 4HCTA 4XRLA 3NYOA 4YLLA 3RAIA 5CEIA 2CKPA 3UP2A 5AUUA 3A8XA 4FSYA 4GCJA 4MXAA 2VTHA 3VBQA 3DKFA 3K3JA 3PIYA 3LJ1A 3RAKA 4OAVB 3BHUA 4RFMA 1UU9A 5EOBA 1M52A 1V1KA 1MRUA 3DAKA 3LCSA 3MJ2A 3KRJA 4FNZA 4ZTSA 5BVWA 3FAAA 3QTWA 2Y6OA 3GFWA 4MD7E 1JBPE 4E6AA 5HORA 3KA0A 5CU6A 4L3PA 5IA1A 4D0WA 4FOCA 5FDXA 3ZLYA 2C47A 5J7BA 2YDKA 2PVLA 3ULZA 5BPYA 3RPVA 3UTOA 5J9ZA 1OKYA 4YTHA 3LZBA 5IA3A 4D2RA 1PMNA 1DAYA 4CV9A 3TV4A 4AX8A 4G17A 5LARA 3RCDA 4G1WA 2YWVA 3MH1A 5JK3A 3CTQA 4KUJA 3HL7A 2YWPA 1YXSA 1XJDA 3KRWA 1J91A 4U3ZA 2JKKA 4MBJA 4EQUA 4R8QA 2JAMA 3VN9A 4F63A 2UW9A 3OY3A 4HZSA 3B2TA 2QO2A 2BDWA 3RINA 4FTCA 4NCTA 3I6UA 4W9XA 4G3CA 1FBNA 2P3GX 1R1WA 4H05A 2XBAA 4B7TA 3OFMA 3E63A 3RNIA 4C7TA 4EK6A 2C5NA 4BCNA 4QTEA 3COMA 1OM1A 2WMBA 5M44A 2XRUA 4FZ7A 4YHFA 2JBPA 4UB7A 3GENA 4ANMA 5HIEA 3E8EA 2OWBA 1YDSE 3JXWA 3TZ9A 4M69A 3NUPA 4YJRA 2B53A 5KMKA 1MP8A 3NZ0A 3VRYA 4H58A 3B8RA 5L8KA 1YWNA 2WD1A 2WXVA 5HGIA 2J2IB 4KAOA 4M15A 3BYUA 5CU4A 3OCSA 4R1VA 1IAHA 3DAJA 4C4IA 5M4UA 2IWIA 3V5JA 3KU2A 1KOAA 2A27A 4O6LA 2OFUA 2ITQA 3GC0A 4IVDA 3RTPA 3V5WA 4IAIA 1GIJA 3II5A 4IVCA 5LVNA 4BCIA 2GSFA 3ORKA 3PPZA 3POOA 4AGUA 4O86A 3VUGA 5CALA 4CCBA 5HG8A 3RPYA 5DGZA 1ZMVA 5JGBA 2VUWA 5JN2A 2PVRA 5HLNA 3KK8A 4YNEA 3F5UA 5IH4A 3D2IA 3VHEA 4WBOA 4CFFA 3RKBA 4P5ZA 5D41A 4FA2A 4DFZE 3HV6A 2X1NA 1YI4A 5CU3A 3F5GA 1Q97A 4BDFA 3ZUUA 2JIIA 5I9VA 3I1AA 2XNGA 4RFZA 3CC6A 2ETKA 4JLCA 3IW6A 4WNOA 3FMDA 3R8UA 2VTIA 2EWAA 3GCSA 1YI3A 2WMWA 3AD4A 3EFJA 4YZCA 1BLXA 2HY81 5HLPA 5A9UA 4USDA 4I6HA 5CASA 3LFCA 3FEGA 4DC2A 2JDOA 1Q62A 5DHJA 4KKGA 2C30A 1ZY5A 1Z5MA 1TQPA 4D1XA 4AWIA 4UWBA 5HCZA 4BZNA 2W9FB 2YFXA 4OT5A 3G33A 1DI9A 2BDJA 4RX5A 1DM2A 4DN5A 4C37A 4O6EA 5IEYA 5J1WA 3ATTA 4Y95A 2YHVA 4J99A 3F61A 3D15A 3RPSA 3IG7A 4L43A 1YDRE 5G1XA 3FKOA 3HDNA 4QP4A 3H9OA 2XUUA 4R7BA 3BRBA 2ZM3A 2Z7SA 1OL1A 1UU8A 4F65A 2QHMA 4AZWA 3W2PA 5K9IA 3HZTA 3Q9XA 4P5QA 5IZFA 3UC3A 3G15A 2JDSA 4EWQA 3A99A 4U41A 4JDIA 4EOQA 3EYGA 4MHAA 4N6ZA 4F6UA 4M0YA 3FDNA 4ZSEA 4LL5A 1JQHA 2F7EE 3Q2MA 4NM7A 4OR5A 3TNPC 3ANRA 3EQCA 3P08A 3IQ7A 5GIPE 2QQ7A 2WZJA 2R0IA 4YZ9A 3F5XA 2WQBA 2YDIA 3HECA 4RVTA 3O50A 5DR9A 4IM0A 4LI5A 3ID6C 3PPKA 3PJ8A 4IZAA 4EC9A 5JRQA 3A8WA 3TKHA 2PTKA 4MBIA 5IQFA 3MFRA 4PDOA 5JEBA 1GY3A 4QTDA 2R7IA 2XP2A 3JY9A 5EKNA 4EBVA 5AV1A 3GQLA 3EZRA 2WMAA 4RLKA 4H36A 5ETFA 2ITXA 2OJFE 2C1BA 1TKIA 4TT7A 4G6OA 2RFEA 3QL8A 4C59A 2WFYA 5TT7A 5AAGA 3MVJA 5EM6A 3TNQB 2UZOA 4QYGA 4MXYA 3BHVA 5AAEA 3H3CA 3GC7A 2HXQA 5ANOA 3PPJA 3RZFA 4QMNA 4GEOA 1M14A 4OTQA 1XH8A 2OU7A 4OUCA 4UZHA 4O0TA 4L53A 2J9MA 3C4FA 3I5NA 3LFFA 2P2IA 2F9GA 4AT5A 1K3AA 4D55A 4F7JA 4AG8A 3NUUA 2R3QA 3M2WA 2R0UA 3NS9A 4M69B 2PZYA 2ZDTA 5BYLA 4ITIA 2WTWA 3FKNA 5DT0A 4KNBA 5CXHA 4F99A 2W7XA 2PE1A 4RJ7A 4DH8A 1H28A 2QODA 1VYWA 5AIKA 5K4JA 1OBGA 3A4PA 5FQDC 3UVPA 3R21A 4F7NA 4FICA 5HZNA 5H8GA 2WTKB 2W06A 5C01A 3MBLA 4BDBA 5K0XA 4BN1A 4M0ZA 2YM3A 1PXKA 5DNRA 2H6DA 3V01A 3MYGA 3V6SA 4IAZA 5A6NA 3MFSA 1ZRZA 4ZZMA 3QXPA 2XNMA 5EH0A 2WNTA 3QFVA 2IW9A 1LUFA 3P7AA 4FKPA 4MWIA 4XHKB 3SA0A 3PY3A 4RX8A 4DEBA 1H1QA 3KVXA 1H07A 4FODA 4ERWA 4WUNA 4GU9A 3UGCA 3AC5A 3LFEA 4Z7GA 3NYVA 3AT2A 3Q32A 2XJ0A 4FSNA 4LFIA 4E5BA 1OL2A 4CCUA 4ERKA 2OF4A 3UNZA 4R78A 4GYIA 4O81A 2OH4A 2QR7A 4WO5A 4RWJA 3MY0A 3R01A 1GNGA 4NM5A 1OI9A 3OUNB 3QALE 1V0OA 4V0GA 4I6BA 1W83A 3DBQA 4JR3A 2C3IB 2X2KA 3R28A 4D0XA 3PY0A 5FGKA 1PXOA 2ITYA 4YJTA 4TYGA 3F6XA 3FLZA 3ZCLA 4C8BA 4BCJA 4DEHA 2XIYA 1U59A 5M56A 5EOLA 2VU3A 2C3JA 4MF0A 1XH7A 3EKNA 3GU8A 3KXHA 2GCDA 2VX0A 1T45A 3VULA 3AGMA 3I81A 1YXTA 4V01A 1ZOEA 5LVPA 4FTKA 4BWXA 4L3LA 3KKVA 1WVXA 4WG4A 2R3NA 4DGLC 3E87A 4FIGA 4A7CA 1OB3A 4D2PA 3DZQA 4FF8A 2G2IA 4E4MA 5M53A 4QMOA 5KKRC 3T9TA 4IFGA 5C9CA 3THBA 4CD0A 5BUJA 3E8CA 4XBRA 3TDVA 2IO6A 4QQJA 3P4KA 5L6WL 3RHXA 4AFJA 3HMNA 3IKAA 4Q5EA 1P14A 2AYPA 4KBCA 4YGAA 5LWMA 3U54A 4O2ZA 4BDEA 3EQFA 4D4YA 5JQ5A 3W2RA 4BHNA 4YR8A 3ZFYA 1P2AA 2QURA 3PSBA 4MNEA 3C5UA 4FKWA 3NX8A 2PULA 4Z9LA 4BFMA 3LOKA 4IB0A 3QKKA 4E6CA 5D1JA 4IZ7A 3KN6A 3VUMA 3F3ZA 3FY2A 5LXMA 5BMSA 1ND4A 4BVUA 3Q9WA 4F64A 3CPBA 5HX6A 4IXPA 1JSUA 3H0ZA 2BILB 3ZC5A 2NPQA 4Y46A 3UMXA 5M07A 4FKUA 3LCOA 3UO5A 4A06A 4ZSJA 1T46A 3HX4A 4CZTA 4NH1A 2OJ9A 4M13A 3R9DA 2UZNA 2F57A 4P4CA 2G1TA 3E7OA 4U79A 4Y5HA 1FVTA 4LRJA 4EH7A 4O0RA 4TNDA 1CM8A 1VEBA 4RQKA 5J7HA 4FOBA 3MPAA 3NSZA 4OT6A 5HE1A 5I3OA 3ODYX 4J96A 2LAVA 1FVRA 3W10A 4CFMA 3E8NA 3R1QA 4KA3A 4FEUA 4JRVA 4YBJA 1AQ1A 4PTGA 3JR1A 3GU4A 3VS4A 3GI3A 2WMXA 4AZSA 3KXMA 5E90A 2XMYA 5IH6A 4F1OA 2VTPA 3A62A 3Q6WA 3U55A 4D28A 3BU6A 3PE1A 3A7GA 4ENXA 3KQ7A 3EH9A 3HUBA 3PVWA 4FSZA 5J79A 4C4HA 5EI6A 3BEAA 5DFPA 5CT7A 2F7XE 3OW4A 3Q96A 2JDVA 4RVKA 4MX9A 1YVJA 4DFLA 4CFWA 1U5QA 3BLHA 4HYSA 4TWOA 3TJDA 4QMMA 4BZDA 2ITTA 2XIXA 4JBOA 5KMMA 3QKLA 2R3OA 4FV8A 4DA5A 5AR8A 2CLQA 2ITWA 1OIYA 2R3HA 2VWIA 3DOGA 3OC1A 3QZGA 3VS2A 4O0SA 4RJ4A 3AGLA 5F4NA 4EOMA 2I1MA 4ZJIA 4I6FA 1OITA 3HAVA 3RWPA 5E9EA 3T8OA 3E64A 4LM5A 4GT3A 2Y4IB 5HG7A 3FKLA 1QCFA 3ORIA 4JIKA 5D10A 3DXNA 2X8IA 2RG5A 4BI1A 3C1XA 5GJGA 2PVJA 5IQHA 4LV5A 5C8MA 4AGWA 1JVPP 4FX3A 4IX3A 4GW8A 2WU7A 4FTTA 2VRXA 2YCSA 2Y9QA 2YDJA 1HOWA 3I0QA 4QNAA 3EWHA 5IA4A 4D9TA 4EHZA 3ZC6A 1SM2A 3I0OA 4V0GB 3KFAA 2HZIA 3NRMA 4FT3A 3VQHA 4LOOA 1PJKA 3G90X 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YIY A;  2IZU A;  3DBE A;  3C51 A;  2OIC A;  5KBR A;  1YHV A;  2ZDU A;  3GT8 A;  4DFU A;  3NW6 A;  4ZEG A;  2CGX A;  4FZA B;  2FA2 A;  4EYM A;  4FNX A;  4F9W A;  4Q9S A;  5LQF A;  4WOV A;  2CKE A;  3MY5 A;  3HKO A;  3MH2 A;  4QMP A;  3IOP A;  3VHK A;  5IPJ A;  2OKR A;  4ACC A;  4AZT A;  3ZM4 A;  4DGM A;  4J53 A;  5KHX A;  1JKS A;  3P79 A;  3Q60 A;  2B52 A;  2HXL A;  3G2F A;  2Y0A A;  3FMM A;  4O7Z A;  3QQF A;  4I23 A;  2CCI A;  4EK4 A;  4USE A;  4TW9 A;  3ZEP A;  3R63 A;  4PL5 A;  1XH6 A;  3AG9 A;  3E8D A;  4L00 A;  4RVM A;  1VJY A;  4CTB A;  2QD9 A;  4IBM A;  4ASZ A;  3QHR A;  4BKZ A;  3TNH A;  5C1Q B;  2V62 A;  3OCT A;  4LV8 A;  4HPU E;  3V5P A;  3E62 A;  3WIL A;  4YNO A;  2OF2 A;  4D2W A;  2PVY A;  2XM9 A;  4W8D A;  4FEQ A;  4K0Y A;  4EON A;  4HVD A;  5AX9 A;  4WG5 A;  4IC8 A;  4BL1 A;  4O0U A;  4XLI A;  3LVP A;  3MY1 A;  4EH4 A;  1YXV A;  2C69 A;  4BYI A;  1BUH A;  5BVN A;  2XNO A;  2F2C B;  3HP2 A;  4F0I A;  2C6L A;  5CQW A;  3GQI A;  3C7Q A;  4FV5 A;  3PJ2 A;  4IC7 A;  4KSP A;  4YLK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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