4IVCA

Jak1 kinase (jh1 domain) in complex with the inhibitor (trans-4-{2-[(1r)-1-hydroxyethyl]imidazo[4,5-d]pyrrolo[2,3-b]pyridin-1(6h)-yl}cyclohexyl)acetonitrile
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
302
structure length
291
Chain Sequence
GDIVSEKKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKETVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK1
publication title Identification of C-2 Hydroxyethyl Imidazopyrrolopyridines as Potent JAK1 Inhibitors with Favorable Physicochemical Properties and High Selectivity over JAK2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 291
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2013-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ivcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ivcA01
4TYHA 2XNMA 3ITZA 2JBPA 3OXIA 4U5JA 3LXPA 1XH9A 2V0DA 4F9BA 5LMBA 3BQCA 4MK0A 4ZTQA 2HW7A 2C6KA 5J87A 4GVJA 5AR2A 3UNJA 1PF8A 3EQPA 4D1XA 4QQTA 1FBNA 3KK8A 4Z7HA 4NW6A 1VEBA 4O0WA 4U0IA 4AAAA 5HIEA 4IVBA 2I7QA 3DA6A 2RSVA 3QX4A 2RFNA 4EOQA 3I6UA 3QTSA 4E6QA 3FYJX 3TM0A 3EB0A 4DCAA 2JEDA 2HXLA 4JJRA 3RPSA 1GJOA 5AWMA 5CNNA 4OAUC 2Z7RA 1QCFA 2F4JA 2X2MA 1OKVA 3ACJA 4UMUA 4L43A 3VC4A 1EH4A 1H24A 5I9UA 4YJUA 4XUFA 4LGDA 3NGAA 2YM8A 4WG3A 5TF9A 4ARKA 3W16A 4L3PA 3FQHA 4QTEA 4IH8A 2PMOX 1XWSA 2R3OA 1Y6BA 3DY7A 4TYJA 4CGAA 4FTIA 2VZ6A 3MPTA 4IADA 3TV6A 4KRDA 1GZOA 5AR7A 4AF3A 3L1SA 4WSQA 4IB0A 1J1BA 3DTCA 4EHGA 3VN9A 5AP1A 5AV2A 4QMZA 3E87A 2E9PA 2NRYA 2ESMA 4RC2A 2R64A 5M53A 2OW3A 2XJ0A 3UDBA 2XRUA 3IGGA 1OMWA 2REIA 4CG8A 1JKKA 5JGBA 4D4SA 3I81A 2BDWA 2QU6A 3HKOA 3NW6A 4EK3A 2E9UA 2V62A 3FXWA 3FAAA 4I0SA 4ZTHA 3ZS5A 2XA4A 4EWQA 3KMMA 4O83A 2HZNA 3FXZA 3H9FA 5FG8A 2IVVA 3OW4A 3D5WA 4FSZA 3R7UA 3IQ7A 5AUYA 2XYUA 1YXTA 1KUTA 1GOLA 3UQFA 3A7JA 4MWHA 3ZBXA 1H1RA 4ZLOA 2JDSA 3ALOA 4RVLA 2XNPA 1AQ1A 2ITWA 4DEDA 4O7SA 4DCEA 5L6PA 4RX5A 3ZTXA 3PA4A 4AFJA 4QP4A 3VBQA 2ERKA 3KMUA 4AACA 4AFEA 4D1SA 4FODA 5JT2A 4RC4A 3SVVA 2XF0A 3N9XA 3PP0A 4ZTMA 3IKAA 2B54A 1GZ8A 2OJ9A 4FTNA 4FV3A 4AZWA 1JSVA 4FICA 3C1XA 4WT6A 4JRVA 4QMTA 4YMJA 4AU8A 2C30A 3CXWA 4EUUA 5C4KA 4FV6A 4ITIA 3POZA 5CU2A 4ZP5A 4CRLA 2J9MA 3A62A 3TG1A 4QMUA 3TEIA 3VHEA 3BWFA 5KMIA 4ALVA 4JVGA 2BR1A 5HBEA 5FXRA 5J9YA 3D14A 1Q3WA 2ZV9A 3ORMA 5IMXA 3QKKA 1OB3A 1J3HA 2B9HA 3HMIA 3LJ1A 4I5CA 5F4NA 3ORPA 5IF1A 3PXZA 2E9VA 4ZY5A 4ZS4A 1PJKA 3VJOA 1Q61A 3PIZA 3SAYA 4O7ZA 5LCJA 3CIKA 4BGQA 2O65A 4K1BA 4BYJA 3UG2A 4EONA 3VS0A 2ZDUA 4X7QA 3C4EA 3JXWA 1PKGA 2J7TA 3DTWA 4QYGA 3MVHA 4O7LA 1DS5A 3E5AA 2WAJA 3I4BA 4RRVA 5J95A 3FLNC 4QYYA 5BPYA 1IR3A 2JAVA 4UB7A 4KD1A 4NKSA 4MQ1A 4R1VA 1ZMWA 4XG8A 3NUUA 4EK4A 3BEGA 3FKNA 3Q60A 5IQEA 4R5SA 3ORKA 3TI1A 3PG1A 3EOCA 2UZLA 3HLLA 3NYNA 4EH6A 3RAHA 3HAVA 1NT2A 4PDYA 5KMMA 1DAYA 4FEUA 2RG5A 1WAKA 5BYLA 4X2JA 2HXQA 2X2LA 5TT7A 3PSCA 5JN2A 4YJRA 3F2NA 5CF6A 3F5GA 3NWWA 2ZB0A 3QCSA 4D9UA 4PDPA 2XVDA 4I24A 4ASDA 5IMEA 4D4RA 2A27A 1ZMUA 2PWLA 3A7GA 1KV2A 1WVYA 2P33A 4XV3A 4F6SA 2IVUA 4FNYA 5TKDA 4AZFA 4LL5A 3V8WA 1SVGA 5A14A 2VRXA 3UOJA 3W8QA 1Q24A 3ZSHA 5J1WA 1ZOHA 3VUTA 3PDTA 2FB8A 1T46A 3OOGA 5DFPA 5EW3A 3UIBA 4FV8A 5L4QA 4OLIA 4RQKA 3F5UA 3LVPA 4P5ZA 3UC4A 5EQEA 1KOAA 3QD2B 2XRWA 4IXPA 4O0TA 3RCJA 3VBYA 4JDIA 3WZEA 3CE3A 5GNKA 5K5NA 3OC1A 2VTRA 3DZOA 1AD5A 1JSUA 3GC9A 2J50A 3PSBA 4JRNA 3RZBA 2B9IA 4ACDA 3KCFA 3R83A 1XO2B 4TYGA 4XG9A 1WBWA 2ITPA 4IB1A 4NM0A 4WBBB 3BLQA 1IASA 4FTUA 4G6OA 3OUKA 4BN1A 4FTLA 3REPA 5K4JA 3DGKA 3NYOA 5AR5A 3BYVA 1XR1A 2J5EA 2VNYA 3R01A 5HVJA 3FC1X 3TNWA 4EJNA 4RIWB 1GZKA 2WQNA 3QZGA 2IW9A 4DFZE 4BWKA 4FZ6A 3AC8A 1VJYA 2VO6A 3MJ2A 1MRYA 1URCA 1FPUA 5I9ZA 2HOGA 5A9UA 4AOTA 3BZ3A 3R02A 1OGUA 3RPVA 4BKZA 5BVFA 2RKUA 4MD9E 1ZMVA 5HVYA 2A2AA 3F61A 3QKLA 4FNZA 3UBDA 3ZLXA 4BL1A 3FUPA 3D83A 3MFRA 4M66A 4BZOA 2VD5A 4BB4A 4CCUA 5A46A 4M69B 2IZUA 3Q3BA 2JD5A 3U4WA 4BIBA 4BHZA 5H8EA 4JS8A 5L3AA 5KO1A 4EC9A 1APME 3E3PA 3LFDA 4J95A 4DFXE 2QR8A 2Y4IB 5DR6A 2GTMA 2UW8A 2W1EA 3PA5A 2BDJA 4TL0A 5CAPA 4BIEA 3TZ8A 3LMHA 2J0IA 3RKBA 5IQDA 4LUDA 2WQBA 2XIKA 4RWLA 3R28A 4AP7A 4C3FA 4F64A 2Z02A 3A7IA 2Z2WA 1Y57A 1LEZA 4IQ6A 4O0RA 2C0IA 4W4WA 4ID7A 1OL6A 3DLZA 3ZZWA 4F6WA 5HE3A 5IPJA 5D9HA 1VYZA 5M44A 2ITVA 4Z9LA 3TDVA 2HY81 3HDNA 3OBGA 3NSZA 3HV5A 4JQ8A 1JNKA 4TWCA 3DCVA 1KE7A 2WU7A 2B53A 1Q8TA 2PSQA 4A9TA 3GNIB 4BBMA 3FI4A 4DGGA 2QOKA 4DINA 5AUUA 5KMOA 4CZYB 5CALA 5EDPA 2OBJA 4W4YA 1CKIA 3A99A 1H07A 2HCKA 3BELA 4X3FB 4Y5QA 4YNEA 5BMMA 3SA0A 5L6OA 4DYMA 4QMNA 3LZBA 5KMLA 1UNLA 4IX4A 3DXNA 5DT4A 5J7HA 2W05A 3FMDA 2PTKA 3NMUF 2W4JA 5DRDA 3ELJA 3O7LD 2R3HA 5CU6A 4DH3A 2WQEA 3QQHA 3I1AA 4AWIA 5JQ5A 5H3QA 3FBVA 3PLSA 5DHJA 4ZLYA 4FX3A 4GK2A 4EBVA 1H1PA 1V0PA 3UP2A 3MIAA 1BYGA 3QU0A 2DQ7X 3FY0A 3QZHA 2X6EA 3G2FA 3TNPC 4YHTA 2UVYA 3QQJA 3QL8A 4FIHA 4R6VA 5E8YA 4E6AA 1RDQE 2OO8X 3O2MA 5CS6A 3QRIA 4PNIA 4QMOA 4BZDA 5K3YA 1VZOA 4EH3A 4PDSA 3G51A 3LAUA 3NYVA 4KS7A 3WYXA 4HGSA 1GAGA 5DEYA 1H4LA 3AGLA 3LOKA 5CVGA 5L6WL 4AT4A 4FVRA 5HLPA 3OT8A 5FXQA 4HZRA 3DAJA 5LQFA 1QPJA 4Q2AA 2BVAA 2C5YA 4GFMA 5DG5A 4F1TA 5JGDA 2YWVA 5FTGA 3L9MA 5IZFA 3F5PA 3KEXA 2QCSA 4GU6A 5ANOA 3ORTA 3P7BA 3UJGA 4D2TA 4DH7A 4UWYA 5JFSA 2CCHA 4DBNA 5F20A 5CAQA 3IW7A 4M0YA 5J9LA 5IQAA 2GNFA 3M1SA 3PIYA 3GUBA 4FL2A 4H1MA 3LM5A 3COIA 4DA5A 4F99A 2VTPA 4OGRA 2FSTX 3DK3A 4NWMA 3LJ2A 4Y85A 2YDKA 4DFUA 4XOYA 1YQJA 3AT4A 3WIKA 3ID6C 3N4TA 4OTFA 4ANNA 3TV7A 3U6IA 4J53A 4PL3A 5HQ0A 4AW0A 4CFWA 4EBWA 4O7TA 4ORKA 1V0OA 2BAJA 3PIXA 3MWUA 3PYYA 3P4KA 4FT3A 2PPQA 4NFNA 4RX8A 5E8ZA 4D5HA 3NDMA 4PP9A 2PZ5A 3DOGA 4FV0A 3LPBA 4IEBA 3RK5A 3D7TA 4DTBA 3VO3A 1SYKA 2YERA 4K6ZA 3V5QA 1REKA 4I5MA 4E5AX 5CVHA 1W82A 2AC3A 4TWPA 4ZSEA 4J8NA 1BUHA 3LFFA 5JFWA 5KKRC 1XBCA 5AMNA 5EFQA 1MQBA 3DAKA 3BBWA 4FIEA 4BCOA 1G5SA 4CRSA 1ZAOA 5B2KA 3RGFA 2Y9QA 5K0KA 1RW8A 2YCFA 3DBFA 5FTOA 4CFVA 3SXRA 3EQDA 2ZVAA 5IA5A 2HWPA 3RK9A 3MGYA 1PXPA 2GHGA 4FEXA 3V5JA 2LAVA 4Z16A 1ZLTA 3A4PA 3IGOA 3KXXA 2O0UA 3E64A 4QMLA 4TNDA 4GUEA 5A4TA 4EH9A 4FG9A 4YC3A 4QT1A 4BI1A 4U43A 3Q9XA 4HYHA 2DUVA 4FVPA 5DI1A 4FKGA 5HCZA 4DEIA 5HORA 3BYOA 5IA4A 4H3QA 3G90X 4CZTA 4ZTLA 3ULIA 1OVEA 4PTCA 3QTIA 4LOQA 1Y91A 2WZJA 3PJ8A 3JR1A 5JZNA 3FHRA 5HICA 2IO6A 2UW4A 4O2ZA 4O81A 3VWAA 5DH3A 4IZAA 4I6QA 1H28A 3HMNA 3KRJA 1NVRA 3UOHA 4F0IA 3TT0A 5AR3A 3Q96A 4IFCA 2H6DA 2W5BA 3UP7A 5HD7A 5FQDC 2QG7A 3MJ1A 4KINA 3TN8A 3WE8A 3CSVA 4L67A 3PXYA 3NUSA 4IE9A 4QYHA 5BVWA 4AXAA 5CXZA 5JH6A 1VR2A 4EOKA 1O9UA 3FMHA 3KXHA 3GCUA 5L8JA 5LARA 4D0XA 4E26A 4UWCA 5E92A 3QD3A 3OXTA 4LV5A 5E8TA 5BX0A 5EH0A 2Z7SA 2Z8CA 3AMYA 4RX7A 4XRLA 4LM5A 5E1EA 3EQFA 3HV7A 4J7BA 4GUBA 2ERZE 2CCIA 4EHZA 4RVKA 3S1HA 4OAVB 3BGZA 4L9IA 3U9NA 4HGEA 5M4CA 3P0MA 4JBQA 4UMQA 4BDDA 2KTYA 5F94A 4IAAA 4C8BA 5HZNA 2ZV7A 3MY5A 2WB8A 4J96A 3NW5A 3V3VA 5GIOE 5AJQA 3G0EA 1KE6A 2ETKA 3LCKA 4IAFA 2HZIA 3GC8A 5AX9A 2PMLX 4CMTA 4EQMA 5I3RA 5L8KA 2EWAA 4KSPA 4EH7A 2QHMA 2JKOA 4G16A 2QR7A 4FA2A 4L7FA 4FIJA 3RVGA 5I4NA 3N51A 4WA9A 4L8MA 3R7YA 3OUNB 3WZUA 4EKKA 3AG9A 3ZCLA 1FQ1B 2RFEA 2YM5A 2XM9A 3P23A 4C35A 5J5TA 4WHZA 4K8AA 5LVOA 3C4FA 3M2WA 2PVJA 4FSWA 3FLWA 4R7BA 4HCTA 1Q3DA 3U8WA 4KBCA 1TQMA 4FNWA 4RG0A 5HLWA 2WQOA 4CTCA 1ZY4A 2R7BA 1XQZA 2IZTA 4GIIA 3QTXA 4O27B 5HLNA 5L2TA 4ONAA 2WGJA 4U81A 4V01A 4XNEA 2JKMA 3B2WA 4N4SA 3EN5A 3Q53A 4FIIA 3T8OA 3NS9A 3KU2A 3DB6A 5HBJA 2X8EA 4LL0A 3SG9A 4K11A 3KXGA 4PMTA 2XIRA 3CD8A 2KULA 3NX8A 3QYZA 4IM3A 2I0YA 4S33A 2QURA 5IA0A 4G3FA 3HP5A 4CVAA 4JDHA 3UOLA 4XMOA 1H8FA 4F0GA 3V01A 3Q5IA 3MFTA 2WELA 4BCJA 3NUAA 3ODYX 4AGUA 5CAVA 3QLGA 4BTMA 1H1QA 4UXLA 3RP9A 2W7XA 2G9XA 3BWJA 1YDSE 2WMBA 4FG8A 5IKWA 3RINA 2X9EA 3LFNA 5HE1A 5J8IA 4G3CA 3RBWA 3UZRA 3VHKA 4MD8E 2XBJA 4GH2A 1FVRA 2HW6A 4EWHA 3C4CA 5JSMA 3L8SA 4D55A 3QQLA 3EKKA 3G9NA 4HCVA 3TACA 4XRJA 4GT3A 3UVQA 4CYJA 3VS7A 4YUQA 1KSWA 3C50A 1YW2A 4IM0A 4OTDA 5GZ8A 1BX6A 1PXMA 1K9AA 1YRPA 3QWJA 4BZNA 2WMVA 3TJDA 3R9RA 3FSFA 1PMEA 3ZONA 4HGTA 2XK8A 2VTQA 3CTHA 3TDWA 4YJNA 5EYKA 2F2UA 3D94A 4V0GB 3IG7A 4B99A 3ATSA 3CKXA 4DBXA 2C5XA 3EN4A 4ANMA 3DNEA 3GGFA 4N70A 5EI6A 4DC2A 4TZRA 5HU9A 4IJ9A 4F9AA 4IX5A 3SOAA 5KZIA 2X0GA 4FIGA 3MY1A 4ALWA 4EL9A 1FOTA 2C6IA 1Y6AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2R64 A;  5M53 A;  2OW3 A;  2XJ0 A;  3UDB A;  2XRU A;  3IGG A;  1OMW A;  2REI A;  4CG8 A;  1JKK A;  5JGB A;  4D4S A;  3I81 A;  2BDW A;  1XML A;  2QU6 A;  3HKO A;  3NW6 A;  4EK3 A;  2E9U A;  2V62 A;  3FXW A;  3FAA A;  4I0S A;  4ZTH A;  3ZS5 A;  2XA4 A;  4EWQ A;  3KMM A;  4O83 A;  2HZN A;  3FXZ A;  3H9F A;  5FG8 A;  2IVV A;  3OW4 A;  3D5W A;  4FSZ A;  3R7U A;  3IQ7 A;  5AUY A;  2XYU A;  1YXT A;  1KUT A;  1GOL A;  3UQF A;  3A7J A;  4MWH A;  3ZBX A;  1H1R A;  4ZLO A;  2JDS A;  3ML1 A;  3ALO A;  4RVL A;  2XNP A;  1AQ1 A;  2ITW A;  4DED A;  4O7S A;  4DCE A;  5L6P A;  4RX5 A;  3ZTX A;  3PA4 A;  4AFJ A;  4QP4 A;  3VBQ A;  2ERK A;  3KMU A;  4AAC A;  4AFE A;  4D1S A;  4FOD A;  5JT2 A;  4RC4 A;  3SVV A;  2XF0 A;  3N9X A;  3PP0 A;  4ZTM A;  3IKA A;  2B54 A;  1GZ8 A;  2OJ9 A;  4FTN A;  4FV3 A;  4AZW A;  3PFY A;  1JSV A;  4FIC A;  3C1X A;  4WT6 A;  4JRV A;  4QMT A;  4YMJ A;  4AU8 A;  2C30 A;  3CXW A;  4EUU A;  5C4K A;  4FV6 A;  4ITI A;  3POZ A;  5CU2 A;  4ZP5 A;  4CRL A;  2J9M A;  3A62 A;  3TG1 A;  4QMU A; 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