4PL4A

Crystal structure of murine ire1 in complex with oicr464 inhibitor
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
402
structure length
385
Chain Sequence
RMVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYKGMFDNRDVAVKRILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAHLGLEPITLLHQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILLSMPNAHGRIKAMISDFGLCKKLAVPGTEGWIAPEMLSPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGYHPFGKSLQRQANILLGACNLDCFHSDKHEDVIARELIEKMIAMDPQQRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKEALDGPIVRQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPVEVQETLGSIPDDFVRYFTSRFPHLLSHTYQAMELCRHERLFQTYYWH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase,hydrolase/inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
publication title Structure and mechanism of action of the hydroxy-aryl-aldehyde class of IRE1 endoribonuclease inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 110
structure length 385
sequence length 402
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4pl4A02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 4pl4A03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4pl4A01
5GJDA 3UDBA 4L3LA 4KSPA 1IA8A 3Q6UA 4TZRA 4GKIA 2OIQA 2OJIA 2OGVA 1H08A 3DU8A 4IH8A 4NJDA 3CC6A 2XNPA 3DJ7A 3ZM4A 2OU7A 5CY3A 2YDJA 5H8BA 5JEBA 5HLNA 2GTNA 3I4BA 4E7WA 4G5JA 5KMNA 2UZBA 4GU9A 4L9IA 2ZV7A 3ROYA 3ZM9A 5HD4A 2QR8A 4TXCA 3ZC6A 5CYIA 2GHLA 4IVCA 2HXLA 5CANA 3I79A 3ATTA 5M08A 5CSWA 5DFPA 3E63A 3DK7A 2C6IA 4O22A 4DC2A 2CNVA 2O3PA 3QD0A 2X1NA 3EN5A 2CJMA 1PXPA 3NYNA 3WYYA 3MTLA 2IN6A 4EZ7A 4YTFA 3SVVA 2FA2A 2BAQA 4GT5A 4J53A 1H0WA 4TPTA 3RAHA 3IKAA 4FNXA 5KZIA 3UTOA 4AFEA 3O17A 2XK9A 1ZOGA 4NZWB 2YISA 4ERKA 2PZRA 4WA9A 3QWJA 3PIXA 2J4ZA 3EMGA 5EI6A 5D9HA 2QONA 3DB6A 5HE1A 1HOWA 1ZMUA 1ZYSA 2X8DA 3TNWA 2HENA 3LFAA 5CI6A 3VW8A 3CGOA 5A4TA 3A7GA 1OVEA 2WMWA 2ZAZA 5AM6A 3TKUA 4RFZA 4K77A 5KZ0A 4EK3A 4RX9A 1APME 5M4FA 1WCCA 4YHFA 2R5TA 2XJ2A 3OXZA 4CMUA 3BQRA 2BHHA 3PXQA 5F94A 2UZOA 4C36A 2UVXA 3PJCA 2YWPA 2W4KA 4N4SA 2VO7A 4ZTHA 2HY81 3TACA 1OMWA 4EZ3A 5IH5A 1EH4A 1ZY5A 3QXOA 3S4QA 5HHWA 3TZMA 3HV4A 1YXSA 1ZLTA 4FT9A 1NVSA 4W4YA 2Y4IB 4E4XA 1LEWA 1GIHA 3G2FA 3HA8A 3NR9A 4I6BA 5JFSA 4ZTMA 3AD6A 3OT8A 3CCNA 4FIFA 3ZSHA 4QPSA 4EUTA 4C2WA 5HNIX 4LGHA 4ZTNA 2GSFA 5CNNA 4RT7A 3QQGA 4BGHA 1H24A 2C6MA 3ANRA 5LMKA 2QOBA 2V7OA 4CRLA 4EH7A 2OJFE 5CEIA 3G6HA 4E4LA 3BBWA 3NLBA 2CGUA 1VEBA 2HK5A 2JITA 3KRWA 3NEWA 5IA2A 4M14A 4AT3A 2VAGA 3VWAA 4BCMA 1VYZA 4WNMA 4NCTA 5AAGA 3DT1A 4J98A 1KOAA 2GU8A 2XNNA 3FLZA 1PY5A 4M8TA 4BIEA 3P7AA 4C59A 1SNXA 4I0RA 2XMYA 4OTQA 3OC1A 5JRSA 3IDPA 5CZIA 3BZ3A 4JL9A 1PMUA 5E8UA 4EOLA 4QD6A 4IC7A 3OUNB 5HEZA 4O0TA 5FTOA 4WSQA 1M2RA 4FKQA 2G2IA 1QL6A 2VN9A 4H3PA 1Y8YA 2EXMA 4UX9A 5CT7A 2VX3A 3D14A 3FZSA 2GS7A 1FQ1B 1MUOA 2VNWA 1L3RE 5J5TA 3B2TA 4YLKA 2QKWB 3FXWA 4K2RA 3R83A 5BYLA 4WNPA 5I0BA 2QKRA 3H0ZA 1STCE 4KIOA 5CZHA 4BCPA 4F65A 1ZMVA 3FLSA 4O2ZA 5AUWA 3UMWA 4Q5HA 4UMTA 4NW6A 5BVFA 3BI6A 3W1FA 4C38A 3LHJA 3PSBA 4WSYA 2R3LA 2FUMA 1P4OA 3VHKA 2J0MB 4A9TA 2KTYA 2Y4PA 4YGAA 2PZ5A 1YXTA 3NCGA 2PUUA 1CKPA 4GYIA 3AC4A 3K2LA 3PE2A 4JBOA 4O21A 3ZO3A 4U0IA 4X21A 4Y5HA 4ACMA 4AN9A 5M56A 3P78A 4V01A 1R0PA 3BGPA 2OSCA 3Q2MA 1B38A 1OKWA 3EQBA 5ACBC 4F08A 4OGRA 3VQUA 4AGWA 2AUHA 3EOCA 3HVCA 4K33A 3WZUA 4AUAA 4DYMA 3M42A 4FMQA 4F6SA 3QU0A 2FH9A 3DK6A 4XEYA 4IWPA 2JKQA 4KKEA 1LR4A 2NRYA 4GSBA 5E92A 2BPMA 4BKYA 4CTBA 2GPHA 4BDDA 3A8WA 3NYXA 4NUSA 4A4XA 2B9HA 5HTIA 3C50A 3QRIA 5CVGA 3JR1A 2CGXA 3D4QA 5JMSA 4DH3A 4KRCA 4MD8E 1W8CA 3LCDA 3P7BA 4J8MA 1FMKA 3ORXA 2C5YA 2G1TA 3UPXA 3DZOA 1PJKA 5AUYA 5AR4A 4NL0A 3RWPA 3ZO1A 4CGAA 4QTDA 2UZDA 4CLJA 5IA1A 4PPAA 2WMAA 4LFIA 3PFQA 4GFMA 4AW5A 4GJ3A 5AMNA 5CSPA 3OROA 4LV8A 5EM8A 2YIYA 3CD8A 3MIYA 4F1TA 2W17A 1ATPE 2X2MA 3O8PA 5EHYA 1VR2A 4EQMA 4UYNA 3QC9A 5C4KA 5BVDA 4F0IA 4C2VA 2Z7SA 4FTCA 4O27B 3D83A 4MBJA 4FTLA 4ZY5A 4AWIA 3RJCA 5K9IA 4ASEA 5EOLA 2EVAA 2WOUA 2FYSA 4D1SA 1UV5A 5JZJA 5AIKA 1BYGA 1XBAA 4A9UA 3AGLA 3WE4A 1YDSE 1RQQA 2C6OA 3E87A 1XO2B 3OT3A 4W4XA 5EFQA 4BY9E 2WMXA 4JQEA 4R3RA 3K54A 4IFCA 4W4WA 5ANDA 4R77A 3QAME 5DPVA 3DLSA 3B2WA 1P5EA 1JKTA 1ZY4A 4WRGA 2ZB0A 4FV7A 4EOOA 4YJVA 5F1ZA 2GTMA 3GB2A 5LARA 3L9MA 4I93A 5IQHA 4QTCA 3VULA 5FG8A 3DDPA 3DAEA 3U8WA 2VWZA 4GG5A 5HKMA 3ZEPA 4BWKA 4BVUA 5CAVA 3W16A 5KX8A 2A1AB 5IMEA 1P4FA 3R7VA 2JBOA 5CU3A 2BRMA 3RNIA 2BDJA 4Y95A 1V0BA 3FZPA 4QP4A 4AGUA 2BZHB 3PY0A 2VU3A 5HU3A 4DH1A 4ZMFA 3N4TA 2V0DA 4QMOA 2BAJA 2OICA 3N9XA 3KCKA 3NUSA 4G31A 4O7RA 4EH4A 1H01A 5H8GA 5CAOA 3MPMA 1TKIA 1HCKA 2YCSA 3PIZA 4RLKA 4DH8A 2QC6A 3LFQA 2GQRA 1GNGA 1I09A 1A06A 2QLUA 4FOBA 5A4QA 3SX9A 4LG4A 5EDPA 2QOQA 1I44A 2BKZA 2W7XA 3AMAA 3H0YA 3IGGA 4FSWA 4ZJIA 3AC1A 4AA5A 4HVHA 4NYEA 4IANA 1KUTA 3UYSA 4XCUA 3PG1A 1JKKA 4JR7A 4KIKA 5FBNC 4DG2E 3EKKA 4B8LA 3D5UA 1PXIA 2GNHA 4XH6A 4ZOGA 3R1YA 4CT2A 3EYHA 3FJQE 2WTCA 3E3PA 4CFXA 4BI1A 5DR6A 2R3HA 3KN5A 3MVLA 3KK9A 4YBJA 2JDRA 1W98A 5HG7A 1JQHA 5A6NA 4JQ7A 4K9YA 3PG3A 4G9RA 2QOLA 1J7LA 4HZRA 3ULZA 4BTKA 2YDIA 4RSSA 3ORLA 4BCNA 5AM7A 2XNGA 3ALOA 4X2FA 3G6GA 3SA0A 3QA0A 4LGGA 5FQDC 3NS9A 4V0GA 2YLEA 4KIKB 4EHVA 4XG9A 3ZTXA 1UKHA 2AC5A 4LRMA 3R04A 1LPUA 4RJ5A 5HG5A 4JG7A 3I60A 4G3EA 4R3PA 5IQEA 4OBPA 5IA4A 3CPCA 5AV1A 4EOSA 3RCJA 2PTKA 3T3UA 3BRBA 5ANOA 3O8UA 4YJQA 1Q41A 4XBRA 4DEGA 3BPRA 3G0FA 4ALUA 3MFUA 1CMKE 4RVKA 2IW6A 3TKIA 4B6LA 3V6SA 5JGAA 4M68A 3MESA 2WAJA 3DBEA 3IDBA 1WZYA 4V0GB 3VUDA 2B0QA 2ZV2A 5DVRA 3Q52A 4DN5A 1RE8A 3E8NA 3UODA 2WELA 2P2HA 4ZP5A 4W9WA 2HOGA 4XLIA 3UIMA 3E92A 3UPZA 5EKNA 4YNEA 4CMTA 4EK4A 3NW6A 4BZDA 2YACA 1R0EA 3NAXA 4UWBA 2YAAA 1DAYA 2X6EA 3Q4CA 3Q32A 2WTKB 4H3BA 2BHEA 4UMPA 4FIGA 4WT6A 5EI2A 4EL9A 2WU6A 3R21A 4PDSA 4D2WA 2XIKA 3UZTA 4O7WA 1V0PA 3Q9WA 4UV0A 2FGIA 2X4FA 3GU8A 4G16A 3COHA 3EQFA 3ACKA 4U5JA 3EL7A 3BKBA 5AA8A 4ACDA 3DAJA 3ZFXA 3I5NA 3G90X 1B39A 4YZDA 2DWBA 4QP3A 5A46A 3ACJA 3ORPA 3LLAA 4ANBA 4F0FA 2CKOA 5E8XA 2YM8A 2E9UA 3R8VA 2ITZA 2XK7A 3FLNC 4TYJA 4FTQA 3O8TA 1OBDA 2H9VA 4PMMA 4CCBA 3C13A 4EJ7A 1DAWA 3EIDA 3KXGA 4YC6A 3HDNA 5KUPA 2CSNA 4FV1A 4L46A 3POZA 4DTKA 3LLTA 4YHTA 4CXAA 3OY3A 3PXYA 4Y8DA 5GNKA 5J5SA 3LMIA 4X2JA 3FZ1A 3DXPA 1XH6A 2X6DA 3U4UA 5I9XA 4WUAA 3AXWA 5EM6A 5IQFA 3FMEA 2F57A 2IVUA 3LXLA 4MF0A 3KRXA 1JSTA 3PJ3A 2EU9A 3QCQA 1SM2A 5AP1A 2IZUA 3LM5A 3TIZA 2BR1A 5FP5A 3PZHA 3UP7A 2C1AA 3C7QA 3AGMA 4YJPA 2QO2A 3OCSA 2YCFA 4Z55A 4IZ7A 2PPQA 3TM0A 4L52A 4DF3A 1VYWA 1PKGA 2C47A 2V55A 2Z2WA 3W2PA 2IVVA 3LM0A 4KNBA 4BKZA 3S1HA 1IAJA 2IVSA 3L9PA 3R1NA 4M66A 3HRCA 3PPKA 4RJ8A 5KMMA 5DEYA 3FY2A 5HI2A 3AD5A 5EKOA 3RALA 3UBDA 2PVJA 4RJ3A 3V6RA 3DBFA 3H3CA 2JKKA 5CF8A 1URCA 1XH4A 3R8PA 2X4ZA 4WRSA 2X8EA 4FV5A 4EJNA 3DFAA 3FEGA 2RG6A 2WMTA 4PQNA 2REIA 3NSZA 2Y9QA 5F4NA 5FXSA 2WZJA 3AC3A 4IBMA 3IQ7A 3H10A 3PA4A 5DHJA 2GCDA 4E5AX 4AOTA 2ZB1A 4JBQA 5C9CA 3QUEA 4AE9A 4L7FA 2YIRA 1YHWA 3DCVA 3G51A 2BROA 4BTMA 5M4IA 3FL5A 3GBZA 5HX6A 4G17A 2C6DA 3EQCA 3V5TA 3L8VA 4RX7A 4I20A 2VWYA 4FNWA 5CXZA 3LFBA 1Y57A 2C5NA 5KHWA 4DFBA 4RZWA 2NPQA 3R2YA 2VX1A 5JKGA 3NNXA 4C4EA 2WTDA 1IA9A 4FZFB 1R78A 4APCA 4F63A 4ZTRA 1TQMA 4ORKA 2QI8A 4QNAA 2QOCA 3RHXA 4FTTA 2BTSA 3HAMA 4L45A 5HLWA 2PE1A 3ROCA 1NW1A 2BRBA 5M57A 2PVMA 3NUXA 2RGPA 3EFWA 3KCFA 4R7IA 5CU6A 4Z16A 4XV9A 3DKFA 4L3JA 4DBXA 3OEFX 4XLVA 5DRBA 3ORTA 4A9RA 3DAKA 5DRDA 4I5PA 3BBTB 3C1XA 3R63A 4XG8A 3O2MA 2O63A 3QKLA 2X7OA 4N6ZA 4TNBA 4FL2A 4CLIA 4X2KA 2X0GA 3DK3A 2OXXA 2YABA 3QTQA 3VS2A 4RJ7A 3TJCA 2OK1A 4FKSA 3S3IA 2ONLC 4M15A 5EOBA 2WIHA 5EQPA 3Q4ZA 4FF8A 4GFOA 4MNFA 5HG8A 1Y6BA 3RAWA 3F5GA 3LXPA 2R3NA 1R1WA 3ZUUA 4ZS4A 1GZOA 3ZLXA 4D9TA 4AQCA 3HZTA 3PRIA 5AA9A 3D5XA 3RHKA 3NUYA 3A7FA 2QCSA 3LJ1A 4IM3A 2X39A 1KOBA 1ZRZA 2XKFA 4FKJA 5IQBA 1PXLA 2PULA 5FWKK 5D12A 3F5PA 4R1YA 5HQ0A 1F3MC 3D5VA 2JDTA 4WG4A 4WBBB 5ETIA 2W4JA 3M2WA 2B1PA 4QMTA 1TQPA 3KEXA 4EKKA 4NH1A 4UYAA 1KWPA 2XVDA 2QD9A 3LJ2A 2JDVA 3QGYA 2BZJA 2H34A 5CLPA 3QRKA 3TWJA 3C5UA 3ZMMA 4W9XA 3UIBA 4M13A 4LUEA 2EUFB 1FGIA 3FMJA 4Q2AA 2VWVA 3AQVA 1MP8A 4JIKA 2PVRA 4G6NA 5BUJA 2ITXA 4FKPA 2QG5A 3QLGA 4DFYA 3GU5A 5L8JA 3ZDIA 2VWXA 5BYZA 3VUIA 3QRJA 4P90A 2R9SA 5DR9A 4ERWA 5JQ8A 3F3VA 3A62A 2YCQA 2VTAA 2IWIA 3HL7A 3P4KA 4UN0C 4M7IA 3V04A 3BWFA 4DEBA 4E5BA 5LMAA 3U6HA 4PP9A 4AT5A 4GK3A 4F09A 3OXIA 2XNEA 1JWHA 2YLFA 4G6OA 2XRWA 2B54A 2B52A 2UZVA 4ASXA 3VBVA 2BFXA 5LQFA 1UVRA 3NUNA 3E7OA 3TNIA 2XB7A 3CD3A 2UZWE 4J1RA 2ZM4A 2QOIA 4HJOA 1Y91A 5E8YA 2B9IA 3VO3A 5J9ZA 3ID6C 2XP2A 3C4FA 1GIIA 2CNUA 2QODA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GJD A;  3UDB A;  4L3L A;  4KSP A;  1IA8 A;  3Q6U A;  4TZR A;  4GKI A;  2OIQ A;  2OJI A;  2OGV A;  1H08 A;  3DU8 A;  4IH8 A;  4NJD A;  3CC6 A;  2XNP A;  3DJ7 A;  3ZM4 A;  2OU7 A;  5CY3 A;  2YDJ A;  5H8B A;  5JEB A;  5HLN A;  2GTN A;  3I4B A;  4E7W A;  4G5J A;  5KMN A;  2UZB A;  4GU9 A;  4L9I A;  2ZV7 A;  3ROY A;  3ZM9 A;  5HD4 A;  2QR8 A;  4TXC A;  3ZC6 A;  5CYI A;  2GHL A;  4IVC A;  2HXL A;  5CAN A;  3I79 A;  3ATT A;  5M08 A;  5CSW A;  5DFP A;  3E63 A;  3DK7 A;  2C6I A;  4O22 A;  4DC2 A;  2CNV A;  2O3P A;  3QD0 A;  2X1N A;  3EN5 A;  2CJM A;  1PXP A;  3NYN A;  3WYY A;  3MTL A;  2IN6 A;  4EZ7 A;  4YTF A;  3SVV A;  2FA2 A;  2BAQ A;  4GT5 A;  4J53 A;  1H0W A;  4TPT A;  3RAH A;  3IKA A;  4FNX A;  5KZI A;  3UTO A;  4AFE A;  3O17 A;  2XK9 A;  1ZOG A;  4NZW B;  2YIS A;  4ERK A;  2PZR A;  4WA9 A;  3QWJ A;  3PIX A;  2J4Z A;  3EMG A;  5EI6 A;  5D9H A;  2QON A;  3DB6 A;  5HE1 A;  1HOW A;  1ZMU A;  1ZYS A;  2X8D A;  3TNW A;  2HEN A;  3LFA A;  5CI6 A;  3VW8 A;  3CGO A;  5A4T A;  3A7G A;  1OVE A;  2WMW A;  2ZAZ A;  5AM6 A;  3TKU A;  4RFZ A;  4K77 A;  5KZ0 A;  4EK3 A;  4RX9 A;  1APM E;  5M4F A;  1WCC A;  4YHF A;  2R5T A;  2XJ2 A;  3OXZ A;  4CMU A;  3BQR A;  2BHH A;  3PXQ A;  5F94 A;  2UZO A;  4C36 A;  2UVX A;  3PJC A;  2YWP A;  2W4K A;  4N4S A;  2VO7 A;  4ZTH A;  2HY8 1;  3TAC A;  1OMW A;  4EZ3 A;  5IH5 A;  1EH4 A;  1ZY5 A;  3QXO A;  3S4Q A;  5HHW A;  3TZM A;  3HV4 A;  1YXS A;  1ZLT A;  4FT9 A;  1NVS A;  4W4Y A;  2Y4I B;  4E4X A;  1LEW A;  1GIH A;  3G2F A;  3HA8 A;  3NR9 A;  4I6B A;  5JFS A;  4ZTM A;  3AD6 A;  3OT8 A;  3CCN A;  4FIF A;  3ZSH A;  4QPS A;  4EUT A;  4C2W A;  5HNI X;  4LGH A;  4ZTN A;  2GSF A;  5CNN A;  4RT7 A;  3QQG A;  4BGH A;  1H24 A;  2C6M A;  3ANR A;  5LMK A;  2QOB A;  2V7O A;  4CRL A;  4EH7 A;  2OJF E;  5CEI A;  3G6H A;  4E4L A;  3BBW A;  3NLB A;  2CGU A;  1VEB A;  2HK5 A;  2JIT A;  3KRW A;  3NEW A;  5IA2 A;  4M14 A;  4AT3 A;  2VAG A;  3VWA A;  4BCM A;  1VYZ A;  4WNM A;  4NCT A;  5AAG A;  3DT1 A;  4J98 A;  1KOA A;  2GU8 A;  2XNN A;  3FLZ A;  1PY5 A;  4M8T A;  4BIE A;  3P7A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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