4IFCA

Crystal structure of adp-bound human prpf4b kinase domain
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
338
structure length
327
Chain Sequence
WTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEREKVTVMSTINPTKDLLADLILPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog
publication title Evaluation of Cancer Dependence and Druggability of PRP4 Kinase Using Cellular, Biochemical, and Structural Approaches.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 327
sequence length 338
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ifcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ifcA01
2VX3A 4II5A 3GB2A 3KRWA 3U6IA 3CY3A 3E8DA 4O38A 4NCTC 4PTGA 1OIUA 3ELJA 3NAXA 4FIGA 4PPBA 1ZZLA 3E7VA 3WE8A 4K6ZA 5D12A 1OUYA 2GFCA 3BHVA 3W2PA 2JBOA 3CTQA 4G5PA 4XP2A 2UV2A 3MYGA 3OG7A 3GCPA 1H0VA 4H3PA 4QTDA 4W4XA 4F65A 4RQKA 5K5NA 3JVSA 3PY1A 3VRYA 4FSUA 1G8AA 5EYKA 3ZYAA 5AR2A 2V55A 3QFVA 3ZCLA 1ZYCA 5CVFA 2XKEA 4FSTA 4XBUA 2W0JA 4EZ3A 2C5YA 2WMAA 2XYNA 1KOBA 4FT0A 5J9LA 3QC9A 2XS0A 4L43A 2YN8A 3QKKA 4YZDA 2YERA 4M3QA 4PV0A 3ZM4A 2PULA 4KRDA 5AA9A 1BL6A 2HY81 4BZNA 2O3PA 3IONA 4CFMA 4DH3A 4MWHA 4E73A 5A4EA 3MBLA 2IZSA 4EH4A 3CS9A 2VTJA 3BGZA 4IAKA 3U9CA 2PVYA 2ZDUA 3E8NA 5L2IA 3Q5IA 4H1JA 2GS7A 3QYZA 1WAKA 2O8YA 2P0CA 4GU9A 4AZTA 4FX3A 4YC3A 4WRGA 3P7CA 4CFXA 2GNLA 4PDOA 5AP2A 3V6SA 4EH2A 3RKBA 3NUXA 4JX7A 3UVPA 2PZYA 4NKAA 4PX6A 2JEDA 2CGXA 2Y0AA 3DKCA 3ZZWA 4RIWA 3D7TA 2GNJA 5CEIA 1BYGA 3WZJA 3PP0A 5HESA 1MQ4A 2UZEA 3E7OA 3FBVA 2YISA 3DZOA 3G0EA 3MV5A 4PDSA 5CT7A 4HVDA 1YDRE 3R21A 5J5TA 4D2SA 2R3RA 4ACDA 4BDHA 3BYOA 4DG2E 1BMKA 3NGAA 1PF8A 2QOFA 3KXNA 3Q4TA 2WXVA 4L9IA 1ZLTA 4JOAA 3OF0A 4O0YA 1GY3A 3DXPA 4Z3VA 3LCOA 2BMCA 2JBPA 4UB7A 2XK4A 3SXSA 4ANMA 5F94A 3PLSA 2VO6A 5CEQA 5HE1A 3VUIA 4F9WA 5L2WA 4CTBA 3R04A 4XYFA 3RNIA 5FTGA 2FUMA 4KNBA 4WNMA 3NUAA 5BYLA 2WAJA 5DI1A 1P14A 3ZEWA 3MH3A 5BX0A 4BFMA 5J79A 2YLEA 2CCHA 5IKWA 3VHEA 4QMQA 3ZMMA 2ETKA 1Y8GA 3O50A 4ANQA 3CTJA 4YZBA 2E9VA 2JAVA 3CC6A 3RPSA 4PMPA 1Q8TA 1QMZA 3CEKA 3DK3A 4WKQA 3EN5A 2R3OA 2PVJA 2QLQA 3V3VA 2R3GA 3VJOA 3LQ8A 4R8QA 4LUDA 4E1ZA 5BMSA 4TYGA 1UKHA 4PP9A 4CVAA 2RG6A 4AZSA 4BDFA 3KMUA 3DBFA 4OT6A 2XK8A 2YAAA 2AC5A 3PSCA 3ZC6A 5HCYA 4EK5A 3DK7A 4GT3A 1OBGA 4KABA 5CF8A 4YJOA 2OF4A 4DTAA 3NCZA 4DGOA 1RW8A 3DDQA 2XNGA 3L9PA 4BWXA 2BAJA 3EH9A 3ZZEA 5DH3A 3D5VA 4L00A 2VTAA 4AZWA 5DBXA 3R8ZA 4WG3A 4AGUA 4C61A 2YCSA 3GGFA 5L2TA 4L01A 2CLQA 4E5AX 4HYHA 2I40A 2YJRA 2J50A 3QCYA 3R8LA 3R30A 4BGQA 5HE0A 1H08A 4HYUA 2CHLA 4BCNA 2WMBA 2WD1A 5IU2A 4FEUA 3OOGA 4NTTA 4R3CA 2B4SB 3LE6A 3SX9A 5EYMA 1SNUA 3P78A 5HX6A 2RKUA 4FICA 1WBTA 3OCGA 5E8ZA 4FIJA 5KBRA 3KFAA 2HOGA 2J5FA 3OCSA 1Q8UA 5M4IA 1M7NA 3HP2A 3SDJA 4TWCA 3LFDA 3DLSA 1R0EA 3W2QA 2BAKA 3QWKA 4CLIA 2RSVA 2VTTA 3R0TA 4F0FA 3HNGA 2YM6A 4O1OA 4APCA 2ITZA 4LOQA 4ZK5A 2OJGA 5I9XA 2PVLA 2WFYA 4IACA 4JI9A 4TXCA 4YLKA 3Q52A 3R9NA 3QUDA 3FMKA 2OU7A 1YOLA 5FP5A 3TKHA 3W2SA 2VNYA 3C4FA 3HV4A 3TEIA 2YABA 5ANOA 5CZIA 4O7SA 5IQAA 4B0GA 3V5PA 3VN9A 3I5ZA 4CEGA 1IA9A 4FKQA 5IA1A 2C47A 4EKKA 4BCHA 5AFVA 2HXLA 3FWQA 4X3FA 3F6XA 4FTLA 1B39A 4A9RA 4C2VA 3HMNA 5CAVA 3R9DA 3RTPA 4B6LA 4BBMA 1DI8A 4NU1A 4EZ5A 2X9FA 4BIEA 2JDVA 4TYEA 1WFCA 2Y8OA 4HGLA 3F7WA 5DRDA 3D0EA 4MCVA 1O6YA 3CQWA 5K3YA 4FEXA 3FJQE 3FQSA 3HMMA 4G3EA 4C2WA 5FTOA 4F1TA 4I5HA 5C26A 2FB8A 2XB7A 4NTSA 3CD8A 3OTVA 4ZP5A 5CNOA 1RJBA 1L3RE 5F20A 3UP2A 1SZMA 2W1FA 3O8TA 2X1NA 3BELA 4RJ6A 4J8NA 3UVQA 2G9XA 5CNNA 3FLQA 2XRUA 4IIRA 1YOJA 3DA6A 2E2BA 3LIJA 5KZIA 2WMRA 1DAYA 3OTUA 4Z9LA 1OUKA 3C7QA 3O7LD 3NPCA 3ZO4A 3G90X 3FPMA 4BL1A 4DBNA 4FUXA 2PU8A 3QRTA 2FGIA 3R7YA 4F70A 3OBJA 3POOA 5C8MA 4C58A 4YTCA 5JRQA 4AX8A 4MD9E 4E26A 4YSJA 3OC1A 4DHFA 2G2IA 4KWPA 3KN6A 2ZV8A 4L46A 1DM2A 4ZSJA 2B9FA 4JR7A 2IW9A 5EH0A 1P5EA 2IZTA 2VRXA 3A61A 4OTHA 1JQHA 4GEOA 2H8HA 3VVHA 4O7YA 4O86A 2XNEA 5G6VA 5HG7A 4BTFA 2VTLA 3DCVA 1OGUA 4GV1A 5C27A 4G17A 4OAUC 5CAQA 5LVMA 3KRRA 4DLJA 2REIA 5AP6A 3UOHA 4MNEB 3UPXA 4YBJA 4HPTE 4FZFB 4C4GA 1CKIA 4JT3A 2IW6A 3ORMA 1GOLA 4A4XA 2WOTA 5DR2A 3AGMA 2PUIA 2VTQA 3CPCA 4QMWA 3TZ7A 2CGUA 4O2PA 3FLWA 3F88A 5CF4A 3TG1A 3QALE 4NEUA 3VBYA 4G6OA 5D7VA 4W4YA 4FVPA 5DT4A 4AN3A 5EI2A 4FODA 3ZFMA 3FE3A 3DB6A 3PIZA 5CYIA 1UWJA 5HBHA 4QMPA 4KRCA 2JIIA 3HGKA 3R2BA 2GNIA 4M84A 5HIDA 2YAKA 5TR6A 4D1XA 2FVDA 4I41A 4QTAA 4ALUA 3BHYA 4QMVA 4NW5A 2C30A 5BVNA 3HEGA 4UY9A 3PSDA 3DU8A 4NSTA 3VS2A 4FSQA 4N0SA 1MUOA 3O2MA 5KKRC 5AV4A 5T68A 3BPRA 5CAUA 4FVQA 3QD2B 4MQ1A 3UPZA 2HAKA 4XCUA 4RRVA 2ZV7A 2BZHB 3BLHA 3TL8A 3CJGA 5DN3A 2JDSA 3A7IA 4YGAA 3RAHA 4DFNA 4FV3A 1J1BA 5EDQA 2R3NA 4TPTA 2O64A 2OZAA 4D2WA 4D5KA 4YHFA 2F9GA 4A06A 1O9UA 2FSTX 4LMNA 3EYGA 2VWWA 3KK9A 2P4IA 3VS1A 2UZOA 4H36A 4D4RA 2HYYA 3H0YA 3UO5A 4GG5A 5CVGA 2WMUA 3ZFXA 3RI1A 1XH4A 3BRBA 1W8CA 3DBQA 4KKHA 3GU4A 4FKGA 3BYMA 4FTIA 2RFNA 4ANBA 4G5JA 1QL6A 2OXYA 5M09A 3QD0A 4IFCA 3U8WA 3MFRA 4GK3A 4GFGA 2WOUA 4U7ZA 5JRSA 4AGDA 4EHGA 3HRCA 5HI2A 5LOHA 4O84A 3CKWA 3SOCA 1XBCA 2ZAZA 4M8TA 5AM6A 3VUGA 4ALWA 5AV3A 4YO4A 4XV1A 2A1AB 4X2GA 3FXWA 3D5WA 4RWIA 3UBDA 5HG9A 4O2ZA 2WTDA 4O7LA 3LFQA 3PJCA 4YJPA 3HECA 4IWDA 3EQRA 4XG8A 4C0TA 4EEVA 1SVGA 5GZAA 4DFLA 5CVHA 4IAYA 3TNHA 4ZS0A 3BWFA 2UZBA 1A9UA 2YM4A 3IDPA 5EQEA 3KULB 3MTLA 3S95A 2JD5A 1QPJA 3FYKX 1PXMA 4IXPA 3JPVA 5E91A 4F7JA 5CU0A 3GI3A 3AT4A 4FK6A 3GFWA 2LAVA 4AP7A 2R3LA 3P9JA 3TACA 4D4YA 4EOSA 4IMYA 3HMIA 3WZEA 5CF5A 2ERZE 2R3JA 2QOLA 4JDJA 5JEBA 1W83A 2OO8X 2WEIA 3G0FA 4GL9A 4E4XA 2ZMCA 3NZ0A 1SM2A 4U8ZA 3F66A 1YVJA 4AWIA 4IAAA 4QRCA 3MPMA 3EFKA 3DQXA 3NYXA 3QTSA 4I4EA 4EQUA 4R3PA 4RFMA 1L8TA 2NNWB 4G3CA 3F3WA 4NW6A 5ANIA 2WNTA 2XJ2A 3ORKA 4FV2A 2JKKA 4BICA 2ITTA 5BYYA 3QLFA 1PXKA 4X3FC 5ANGA 4PWNA 1S9JA 2VAGA 5KMJA 1RQQA 5IPJA 4FTCA 2CNVA 5AP4A 3C5UA 4YHTA 3I5NA 1UNHA 1ZYLA 2B54A 4YZMA 3UIBA 3W33A 3ZBXA 3QCXA 4F7LA 4F7NA 5DLSA 1YWRA 3ZO3A 3I81A 3V5LA 5LWNA 3GU6A 2ZDTA 4N6ZA 3UG1A 5IZFA 1DI9A 4OGRA 2O2UA 3VNTA 4C3FA 4QP3A 4FZAB 4M7IA 2C3JA 3PXRA 4EQMA 2F49A 1PJKA 4UYNA 3MVHA 4ZSAA 5KKRB 2YDKA 3ZRMA 3G9LX 2QODA 4M13A 2VO7A 3FUPA 5ETFA 4BKYA 2YM5A 4GK4A 1JVPP 4FIEA 4WNKA 3Q9ZA 2W4JA 2YLFA 4RVMA 3VUKA 4AA0A 4D9UA 4E4NA 3TV6A 2DWBA 3FXXA 4DGLC 5L8KA 2EB2A 2W06A 4N6YA 1TQMA 4YSMA 5JH6A 5H3QA 5LVOA 3ORLA 3UNJA 5JGBA 1J7UA 3FMJA 2IG7A 3A4OX 2ITUA 4BTMA 2WO6A 3HKOA 3NCGA 4XJ0A 3BGPA 4GIIA 4K2RA 4XG3A 2GHLA 3BX5A 5EK7A 3JVRA 3JY9A 4FOCA 5DMZA 2ZV9A 3NUNA 3MIAA 3ROCA 5KX8A 3JUHA 4BVUA 4EH3A 4O6LA 1B6CB 2GSFA 3PPKA 4QPSA 2WMTA 2P55A 2I0VA 4UV0A 4LRKA 4E6AA 2QHNA 2XM8A 3QZIA 2JKQA 4HCVA 4J98A 4JQEA 3L8VA 4KIKB 3ETAA 3PVWA 5T3QA 1NVSA 2B9IA 2C6TA 1JBPE 1PMNA 3VS7A 2W1HA 4UYAA 3BLRA 5M4UA 1STCE 4FNYA 4NL0A 4DA5A 2J6MA 3A4PA 4QMXA 4YPDA 3FXZA 3EQCA 3BCEA 4BKZA 5ANEA 4YPSA 2AC3A 3DJ7A 3R1NA 4JJRA 4S31A 4IWQA 4RX7A 4Q9SA 3NVMB 1Q3DA 4WNOA 3MY0A 4ZSLA 3QCSA 4Y8DA 4FTTA 3OWJA 4H05A 1OKYA 1PKDA 4QP6A 5IQCA 4ERKA 2OWBA 4WA9A 5CWZA 4FL3A 4GU6A 2C6MA 4JXFA 2JFLA 2WQMA 1UV5A 4UWYA 3UE4A 3VUDA 4AGWA 5JQ5A 3SG9A 4E6DA 4QYYA 5D1JA 5EHYA 5BYZA 5FD2A 2V0DA 5AP5A 4ZEGA 4RX9A 2GNFA 4GW8A 5HHWA 4U41A 2WTIA 1SNXA 1OI9A 4ASXA 3NYOA 5ETIA 4ZMEA 3HLLA 2IN6A 3TCPA 3E8EA 4DT8A 2BR1A 4FT5A 2QG7A 2ZM1A 2A0CX 4DLIA 3LLAA 3IO7A 4BF2A 4X7QA 1V1KA 4X3FB 1UWHA 3SD0A 5BVOA 2W4OA 2X39A 3A99A 3HV3A 4RG0A 2QOCA 2PVFA 1WBWA 3R83A 4FKRA 4J53A 2P2IA 2W1GA 3P86A 4MHAA 5EHOA 3R7OA 2PMOX 2JGZA 1YDSE 3QWJA 4IM2A 1U5RA 3GFEA 4KIOA 4AOTA 3O8UA 3FEGA 2OJ9A 1MRVA 3QD4A 5I9UA 4YBKA 2BIKB 3HVCA 1UU8A 3IW8A 3PVBA 4G16A 4L7FA 2Y7JA 4LRJA 4CZYB 4MD7E 3N4VA 3RM6A 4X6QC 5AR4A 2BIYA 4FG8A 4TW9A 4EL9A 5IA4A 4Y46A 4QTBA 4XP3A 2C1BA 4QQ5A 2BFYA 3Q96A 3R7GA 2QR8A 2SRCA 3MDYA 3TKIA 3EFWA 5C4LA 4WIHA 4X6RA 3UIXA 4AU8A 3AC1A 1NA7A 4CCBA 3C4CA 4IEBA 3FI4A 3L8SA 4GMYA 3E3BX 3ID6C 2ZV2A 2ITPA 2RF9A 4S30A 1OKZA 4O7ZA 1Y57A 4H58A 3OEZA 4LI5A 3R22A 4DH5A 3QKMA 4AA5A 4UXQA 5DYJA 3MJ2A 5B7VA 2PE2A 1JKSA 5EW8A 2PVNA 3R1SA 4CD0A 4DH1A 3GCVA 4D0WA 3QTZA 4DGGA 3MFUA 1TKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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