4LRKA

Bacterial effector nleh2 kinase domain
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
SPVPGNVIGKGGNAVVYEDMEDTTKVLKMFTISQSHEEVTSEVRCFNQYYGSGSAEKIYNDNGNVIGIRMNKINGESLLDIPSLPAQAEQAIYDMFDRLEKKGILFVDTTETNVLYDRMRNEFNPIDISSYNVSDISWSEHQVMQSYHGGKLDLISVVLSKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Effector NleH2
publication title NleH defines a new family of bacterial effector kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-07-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4lrkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4lrkA01
2GTNA 2QO7A 3ODYX 5T6KA 4EOMA 4YZMA 5LMAA 3A8WA 4BDJA 1A9UA 4AN2A 2C6OA 4YHFA 1ZOGA 4B9DA 4RIYB 1OBDA 3KL8A 3NNVA 2WMXA 3QAME 5E4HA 2B4SB 2FB8A 5EI6A 3UNJA 4Y83A 4W9XA 3KULA 3KCFA 2Z7QA 4FV8A 5TO8A 4CQGA 4JVGA 3QTRA 4RVLA 3VW8A 4XP0A 2FH9A 2GQGA 3CQUA 3I1AA 3JS2A 4DINA 2J6MA 4ACDA 3RK9A 4BWKA 4KA3A 3GU4A 3BU3A 3RZFA 4MXYA 3AD4A 3M11A 3L9PA 4GW8A 5FM3A 3PG1A 4NFMA 4U80A 4FTCA 3QTXA 3PSCA 3HA8A 3GP0A 4OTFA 1JSUA 2BIKB 3VBYA 4C4IA 5KX8A 3EL8A 2OZAB 2FSTX 3ZSIA 3P7CA 3ZZWA 5E8XA 3DK6A 1JWHA 3UP7A 3BPRA 3MIAA 1BKXA 4APCA 3DPKA 5HNGA 3DA6A 2E9PA 3QXPA 2QR8A 3ZYAA 2YN8A 2UW9A 3RZBA 4DGOA 2YDIA 4IVAA 1XH9A 2HWPA 2HY81 3ZO3A 1J1CA 4Q9ZA 3RAHA 2PUIA 3ORXA 3HZTA 4R7HA 3W2QA 3ANQA 3PRIA 3F2RA 4YZCA 4QTCA 3OP5A 2ZV2A 3DKOA 5EW3A 3HP2A 1ZAOA 4FGRA 1IEPA 3GOKA 4GG7A 3TJCA 4K18A 3VBWA 5HU3A 4G6NA 1PXPA 1MRYA 2A27A 4AW2A 3C0HA 4RMZA 5F94A 3PWDA 1QPDA 4KKGA 3BWFA 1I44A 5EHLA 4FE2A 4FSYA 4JXFA 1E9HA 3ENMA 4RSSA 3O7LD 2FUMA 2UVYA 4W4XA 4BB4A 3DXNA 4QP4A 5ITAA 5AUTA 3CS9A 3NIZA 4MHAA 4NJDA 4BI0A 4ZS4A 2UZVA 3M42A 5K4IA 5J5SA 3HV4A 2UW6A 2Y6OA 4AOTA 2Q0BA 2ZB1A 4BCJA 4D4SA 2XCHA 5GZ9A 4EOJA 3IW8A 3FQHA 3FZSA 3FLWA 1OM1A 3GCVA 4UB7A 4L00A 3BBWA 4D5HA 3QD4A 1G3NA 1NVSA 5DH3A 4YO4A 3QRKA 3QGYA 4R8QA 4J99A 3PPKA 2W99B 1JQHA 3DQWA 3V5PA 1GZKA 2UZBA 2VO7A 5CU4A 4QMZA 1M2PA 5HIBA 4YHJA 2UUEA 3C9WA 3AOXA 3OHTA 5ANOA 3U4WA 2YIWA 3F5XA 4LYNA 4IB0A 3ZHPC 4HCUA 5DR6A 5J95A 3L8VA 1OPJA 3RNIA 4F9CA 3NEWA 4YZBA 4AXAA 4Z9LA 3QCSA 5D1JA 5BMSA 3FPMA 1ZOHA 2OH0E 3P78A 3N51A 1PXLA 5B2KA 2XRUA 4A9UA 5IA3A 4PNKA 4RJ6A 4OTPA 3ULIA 1JVPP 3PSDA 4MNFA 3EZRA 3GGFA 4KB8A 2V62A 4Z3VA 4YGAA 2JFLA 2ZDUA 4DITA 4E5BA 4HVSA 3EH9A 4MD7E 4G9CA 4H1JA 1SMHA 4QTEA 1PKDA 5J9YA 2OSCA 2YZLA 2IW8A 4KBAA 3IG7A 4O83A 1IRKA 2W5BA 4BKZA 3BIZA 3LKMA 1ZZ2A 3AQVA 5FDPA 2PVHA 1V0OA 4JX7A 3S4QA 3VW6A 2RIOA 1GNGA 4AX8A 2OF2A 1FQ1B 2QLQA 2P0CA 1BI8A 3H0YA 1KOBA 5FTGA 4Y73A 3MH3A 2OLCA 3AG9A 3WI6A 3NYOA 2PVRA 4RRVA 3MY0A 3FMNA 1Y8YA 2GNFA 3M2WA 4YJRA 3WBLA 3MGYA 2FYSA 4O1OA 3O2MA 1AQ1A 5J1WA 3V6SA 5I9YA 2YFXA 4ZSJA 3V8TA 1YHSA 2YZAA 3OT8A 3TKUA 4KRCA 2XIRA 1PRYA 2PVNA 4OLIA 5ANIA 4AAAA 3NW5A 2RF9A 4W4WA 1PHKA 4XV1A 2QURA 1YXXA 4EHVA 4BDGA 5EQPA 4D1ZA 5LMKA 3NX8A 2EXMA 4QP2A 5E90A 5HG8A 3FY2A 1PMEA 4E93A 3FMDA 4U9AA 4W4VA 3C4EA 3L8XA 2BFYA 3QL8A 3R9HA 2J4ZA 2B9HA 4I5CA 4W9WA 4WNMA 4DYMA 5KCVA 2W5HA 5AMNA 4FKVA 3HDMA 5JSMA 3NNXA 1O6KA 4B8LA 2X0GA 3VJNA 3UC4A 4FSRA 2VTOA 2IZSA 2XCKA 5HE2A 3RWQA 3SG8A 3P7AA 3E87A 4HGEA 4PPBA 3C7QA 3O7LB 5FTQA 2WMWA 4L52A 3EQPA 2OO8X 3UIXA 4F64A 2R3HA 3OFMA 5JFVA 4IACA 3RAIA 3N4UA 4KUJA 3GC9A 5BQ0A 1SM2A 3Q5ZA 4MNEB 3FYJX 3QQHA 4DE4A 4EWHA 4IM0A 4RA4A 4ZZMA 1PW2A 3D83A 2VUWA 4BCQA 4CCBA 4ZY5A 3FLSA 4U44A 4MF1A 1U54A 2ACXA 5LCJA 2A2AA 3C13A 2QODA 3QQFA 5L2TA 4TPTA 3THBA 3QGWA 3EKNA 4IWDA 1S9JA 1OIQA 4PPCA 5HVJA 3EJ1A 5DWRA 2R64A 2AYPA 2GHMA 4YLLA 3ZXTA 3R7UA 4QMOA 2XNGA 5GJFA 5EKOA 5IU2A 4NK9A 3SLSA 3MB6A 4FIGA 5J9ZA 4QMXA 4FUXA 2YJSA 2J90A 3HMOA 2OJIA 3OVVA 5HCXA 2CNQA 3JYAA 4QMLA 3CGOA 4KIKA 4FEXA 2UZDA 2KULA 3DZOA 4JG8A 3HLLA 3RPYA 3QQGA 1W98A 3PRFA 4FC0A 5HEZA 2JC6A 2QOHA 3VQHA 2X39A 4BDBA 4BCPA 3W2SA 3VUIA 4GKIA 3TM0A 2PE0A 3NUPA 3CTJA 4PF4A 4I21A 4IE9A 3O23A 5ANDA 2XYUA 3O8TA 4YJOA 1QCFA 5LOHA 3DT1A 4R1YA 2WTIA 3KKVA 3OCSA 4M12A 4YNEA 2ZAZA 3ZS5A 4MD8E 3ZLWA 5ICPA 1H1PA 5AP5A 5KMJA 2ZV7A 2H34A 1WBPA 4O22A 3UDBA 2Z2WA 4XEYA 5E7RA 3IONA 2C3IB 3DLZA 4NM7A 5EG3A 3GC8A 1FVRA 3NDMA 4L68A 4U79A 4X2GA 3DXQA 2E9VA 3C4FA 3NNUA 3T8OA 3GC0A 4RJ8A 3W2OA 1UNHA 2OWBA 4WNKA 2QOLA 4WBOA 1Z57A 1PXIA 4JDJA 1JNKA 3PLSA 3FKOA 3FPQA 4IAFA 3NYXA 3OROA 4FZDB 5E8WA 4QMTA 4ORKA 3OG7A 4BWPA 2BRBA 2QVSE 1ZOEA 2YIXA 4KRDA 4YHTA 5ANGA 3QXOA 1M17A 3G51A 5CVHA 3C5UA 4XRJA 2HYYA 5B0XA 3D2KA 3LMGA 3V01A 2XJ1A 2C6TA 5LVLA 2X9EA 5JZJA 1MRUA 1RW8A 2GSFA 2W17A 3IDBA 3R7OA 4YTCA 3AC4A 3RAKA 4DG2E 3QF9A 4FV5A 3AMAA 3R28A 4U43A 5CXZA 3HKOA 4PX6A 4I5PA 4JAJA 3B2WA 4I93A 4C62A 1XH7A 4MXAA 2SRCA 4MF0A 2C5NA 3VBQA 4BBEA 4ANOA 5GZAA 3DLSA 3MWUA 4EHZA 3BHVA 4LM5A 3MFSA 3AGLA 3DFCB 4DHFA 3BE2A 3FI4A 3U4UA 2OXYA 3SQQA 3HAVA 3MJ1A 2HWOA 1UNLA 4FSQA 4X3FC 2NPQA 2HAKA 2C4GA 3LOKA 1YWVA 4YMJA 3OEFX 5KMOA 4XG8A 1BL7A 3U54A 4FG8A 3FQEA 2QOOA 4XOZA 1KV1A 3BEAA 3VRYA 4IX4A 4WG4A 4ACGA 1OL2A 4FSTA 3QCYA 2UZNA 3DNEA 3IW4A 3R1NA 3F3UA 4HGSA 1TKIA 1Y6BA 3RPRA 2VNYA 3FMKA 3C1XA 3TKHA 5LMBA 3C0GA 5DGZA 4CKJA 4F09A 3BBTB 1HOWA 5JK3A 4CG9A 4YR8A 2QHNA 5KZ0A 4IFGA 4NZWB 4R3RA 3R1YA 3VBVA 4GMYA 4QD6A 2W4JA 4QTAA 4JBPA 3PVGA 3ZBXA 2PMLX 1I09A 5HZNA 4BICA 3L8SA 4QYFA 3V04A 4RWKA 5LWNA 3H3CA 2PU8A 3COMA 4CZYB 4DTKA 2BRNA 2WZJA 3FI2A 3ZUVA 3N4TA 5AR7A 1CDKA 2XKFA 1RDQE 3PXYA 4NM3A 3NNWA 3W32A 2OK1A 3KXXA 4GK3A 5JFWA 3OXZA 2UW8A 2BPMA 4E6AA 4AGCA 5EQYA 3DBDA 4FKGA 3EQIA 4RX5A 5BX0A 3DJ5A 4GYIA 3WZKA 1YHVA 5IF1A 4FYOA 4YTHA 4WG3A 3P4KA 5I9ZA 1UWJA 2QI8A 2HW7A 3OD6X 3VRZA 2J5EA 1YXUA 3T3VA 4BZOA 4AZWA 5LVMA 4I41A 4C4FA 2OZOA 4K9YA 4U42A 5LCKA 5IUGA 3BYVA 2IVSA 4J1RA 2IW6A 2J9MA 3SAYA 4DEBA 4USFA 3RJCA 4O1PA 3RK5A 4C37A 5GINE 4G31A 3LZBA 5CASA 4XG6A 3ZUTA 4BTMA 1VYZA 4ANQA 3LFFA 2JIUA 4BGQA 2DYLA 2R3GA 1V0BA 2WELA 4C35A 4U6RA 1UU3A 3HX4A 4FV6A 3ZLSA 4HVDA 4RX9A 2P2HA 3VHKA 5C26A 4G5JA 1IAJA 2W1GA 5C1QB 2RL5A 2CPKE 1OL7A 2VWYA 4AA4A 3KRXA 2OZAA 3LJ0A 2GNLA 5E8TA 3OY3A 3SV0A 5I0BA 5J7HA 2VD5A 2JBPA 5CQWA 5GJGA 4PWNA 4WRSA 2OBJA 2YABA 1EH4A 4F63A 3F5PA 3QRJA 3WILA 3FMLA 5BVWA 2XA4A 4WNPA 3AXWA 3NUXA 5DLSA 2BKKA 4GIIA 3E8CA 5HESA 2PE1A 2VGOA 4EUUA 4ASXA 1MUOA 3QRUA 3ORPA 5BVNA 3FY0A 5L2QA 3R30A 4QP3A 2C1BA 5CVGA 1YWRA 4ERWA 3ZSHA 3FLYA 3WOWA 2WAJA 4MWHA 4U81A 4LOPA 3R00A 3Q4CA 5KMIA 2XBJA 3QTWA 5DRDA 3VQUA 3C5IA 4AFEA 4AZSA 2C6KA 3QRIA 3F2AA 3UOHA 4EK3A 3NLBA 2XH5A 3TXOA 2XJ0A 4DCAA 2G15A 1FMKA 1GZNA 3DAEA 2GNGA 2NO3A 5J8IA 5EDQA 4ZXTA 4K6ZA 5CNNA 5IMXA 4HPUE 4BDAA 3RNYA 4ITIA 5AP2A 2W1IA 3LFBA 4R1VA 3HV7A 1DAWA 1H4LA 5CQUA 4M0ZA 2YAKA 3LE6A 4BCIA 4ZMFA 3SG9A 2ZV8A 4ZTNA 4A4LA 4I1ZA 3PXRA 4OUCA 4GIHA 5KUPA 3GNIB 4A7CA 4GJ2A 3VUMA 3TG1A 3TKIA 1XWSA 4CNHA 5CEIA 5JT2A 2WQNA 3LQ5A 3QYWA 4FKRA 4XG7A 2I6LA 4BI1A 1WFCA 3FC1X 5D11A 2BAQA 4DGLC 4R77A 4PMTA 3EYGA 2FA2A 3LMHA 5IH6A 5G6VA 4TYJA 2C5OA 3L8PA 2JLDA 2B9FA 3IW7A 4UALA 3E7OA 4EZ5A 2UVXA 3ZTXA 1B6CB 4IFCA 5AAEA 2YM3A 1GAGA 2Y8OA 4FNYA 4PV0A 4NTSA 5HCYA 4Z7GA 2QO2A 2JDRA 2O3PA 4EH5A 5A4CA 3O50A 4UN0C 4C4GA 1PXKA 3H10A 5IQAA 4F0IA 4LQMA 3I0QA 2C5XA 4L42A 3W2RA 2C30A 4UV0A 3DZQA 3OCTA 1LEZA 1OL6A 3G5DA 4HVGA 3TDWA 2HIWA 4ZEGA 2REIA 3QWJA 4A9YA 5KHXA 3VC4A 4PDSA 1QPJA 2W96B 3G6GA 4G2FA 4BDEA 2ERKA 3ZC6A 3A7IA 3GFWA 2IG7A 2C3KA 3Q9XA 1ZLTA 3QRTA 1XO2B 3A2CA 4DAWA 3UMWA 2B0QA 4XG9A 2BROA 2QC6A 4FKPA 3GU7A 5DOSA 3OMVA 3F66A 4KAOA 2VWXA 1R0EA 4G3GA 2QKWB 3NRMA 2JGZA 4FSWA 5CENA 1OB3A 5A14A 4Y5HA 4OT5A 4AZVA 4AP7A 2QCSA 3BHHA 5EW8A 5CI7A 3MI9A 4ITJA 3WE4A 1B38A 2WNTA 3UVQA 4ANLA 2BZJA 2XNBA 3D5UA 2WMSA 4R78A 2V55A 2ERZE 3KF4A 3S95A 4D2VA 1H25A 2ETKA 4G1WA 4BDIA 3QKMA 5CT0A 4XOYA 3SD0A 3OWPA 2WTJA 4XBRA 4DH7A 1YXVA 1XBAA 3TL8A 3DK7A 3MFTA 4B7TA 3GEQA 4ZSAA 2WEVA 3C50A 1M14A 3E88A 2G2HA 5D7AA 4KINA 3TZ9A 1JBPE 3NAYA 4GH2A 5BYYA 3P1AA 5AP6A 5H2UA 4BDHA 3KXNA 4W8DA 3EWHA 5HQ0A 5CXHA 5K5NA 1FVTA 3ZM9A 3FZ1A 5TKDA 4DF3A 4QP8A 4EI4A 4UWCA 4QMNA 5JQ8A 3I5ZA 2CNVA 5FP5A 2RFNA 2W1FA 4QPAA 3AGMA 5AA8A 2C0TA 2J0MB 2VWIA 3EQRA 3F5UA 3GB2A 3NUYA 3EQGA 2IWIA 4FG9A 3ZZEA 1HCLA 5I3RA 5IA2A 2WMUA 3CQEA 4MNEA 4XV2A 5E8YA 4AE9A 1IR3A 1OBGA 4YJTA 4M0YA 4FTLA 1T46A 4Q2AA 2YIRA 4JIKA 3QTIA 4FR4A 2BRMA 2XIYA 3BELA 4GSBA 4II5A 2GS2A 4J98A 4KBKA 4PTCA 1W84A 3EIDA 4D9UA 4L67A 1OL5A 2J50A 4KD1A 4A06A 4F1TA 2X4FA 4HVHA 2VRXA 2CN5A 3FJQE 5L8JA 2Z7LA 3BLHA 3S3IA 4DGMA 4P5ZA 2BR1A 5LWMA 3P23A 4EZ7A 3TUCA 4H39A 4JLCA 2WFYA 1ZMWA 3ANRA 4MXZA 3D2IA 3UIMA 1NA7A 4HYHA 2IO6A 1PF8A 1H08A 4P7EA 5DEWA 5E1EA 3W8LA 2RKUA 3UIUA 3FLZA 2WIPA 3FMHA 3DQXA 4FZAB 5HG7A 3LFEA 2CSNA 2IN6A 3DTCA 2OKRA 3H30A 4R3CA 1ZZLA 5AV0A 4EQMA 4LMUA 4JBVA 1Y6AA 2PPQA 2PZYA 3PJ1A 1T45A 2GS7A 4AT4A 1KE9A 1Y57A 4MAOA 2FSLX 4FT0A 3DU8A 4QYGA 4O2PA 1OPLA 3RKBA 3VNTA 4CT1A 3Q9ZA 1SZMA 4IBMA 2QOFA 3TNIA 4E4LA 2XYNA 2J0IA 5EYMA 2PVYA 3U8WA 4C0TA 5AV2A 2QKRA 4XV3A 4FTUA 3NYNA 2PK9A 4ZY4A 4L3LA 1OI9A 2J0LA 2ZB0A 4JRNA 4NEUA 5KMLA 2GHGA 1SNXA 4YJPA 1GZOA 2OFUA 2CGUA 3F61A 4AN9A 1Q61A 4QP1A 3FI8A 5EYDA 2IW9A 2QLUA 3R9OA 4U0IA 4V05A 2P4IA 3PJ2A 5FXQA 4BCMA 4TYIA 2YLEA 2FSMX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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