4FTLA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
278
structure length
263
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 263
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ftlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ftlA01
1OPLA 4FTRA 3UIXA 1H8FA 3I0QA 4J99A 5AP2A 3ZUVA 4G3EA 3NVMB 3EZVA 4QYGA 5HIBA 3WBLA 5FEEA 3QXPA 5E8ZA 3R8ZA 3EQCA 2E2BA 3Q6UA 2BFYA 3H10A 4AZFA 1XH9A 3F88A 3GOKA 4DEAA 4O83A 1YI4A 2OWBA 1URWA 4C4EA 3WF9A 3JUHA 3VUIA 4DGOA 2I1MA 4U42A 2C6OA 3FEGA 3UQFA 4D58A 2VGOA 4RQKA 4C3RA 4YLLA 1LR4A 1OMWA 1H1RA 1NA7A 3NVKI 4AS0A 4NCTC 1GIIA 3DQWA 3FMNA 5G1XA 5HICA 4ENYA 2R3JA 4HYUA 4AGDA 4BHNA 4X21A 2WXVA 3W10A 1Y6BA 2CCIA 2WQMA 2VTMA 4OTHA 5D7VA 5BVNA 3E3PA 4UWCA 2FVDA 3P86A 3E92A 4I6BA 4OT6A 3UO4A 4KS7A 1P2AA 2JC6A 4BIDA 4CV8A 4ZLOA 3VW6A 5AA8A 4HVSA 3G90X 3GU5A 4K11A 1TQIA 3IKAA 3UQCA 2XNPA 4TY1A 4J97A 4Z55A 3G6GA 5A9UA 3LCOA 2W1IA 2XK6A 3A60A 2PMNX 2WIPA 3VAPA 4IC8A 4K2RA 3ROCA 2KULA 3FUPA 3WZJA 4D1SA 1H1WA 4PNKA 1XHAA 2B7AA 4FTUA 3PVUA 4AF3A 2ZB0A 3IPHA 4JBQA 4L46A 4E6AA 2QU5A 2CPKE 4JRNA 4DITA 3F2RA 4UALA 4YZ9A 4CRSA 5AP1A 3FXWA 4AAAA 4C7TA 5FUTA 3EQDA 1WBSA 3KMWA 3QC9A 1UWHA 2C5OA 4DEIA 2W1HA 2QO9A 1PF8A 3QD2B 5C03A 4FVRA 3PIXA 3TEIA 5EFQA 4GU9A 2HXQA 3ZXZA 2C4GA 2GMXA 4OBOA 4CKJA 4RQVA 4WNKA 3JVSA 4LV5A 1OKVA 3PP1A 2UZDA 4NFMA 4YTFA 2XVDA 3ANQA 5FM2A 3UVRA 4ZZOA 2QOFA 4MXYA 3RWQA 4XX9A 4F99A 3Q04A 5JGDA 3O23A 5A4TA 2XRWA 3RK9A 2VTNA 3VUKA 3IDPA 5H3QA 2OXXA 2B55A 4UMPA 4JG6A 3C13A 2J0JA 1PXJA 3IOKA 1Z9XA 1LEWA 3MWUA 3O50A 4KS8A 4QRCA 2RF9A 3DBFA 1XR1A 1OL1A 4I24A 2BDFA 4RPVA 4RIWA 3DY7A 4I0SA 4TYJA 3RK7A 3ZFYA 1PY5A 3I1AA 3L1SA 5JK3A 2PU8A 4QMNA 5AAEA 4ITJA 4YO4A 2BHHA 3BE9A 3OG7A 5L8LA 4DA5A 1RJBA 3QCXA 4E4LA 2UVZA 4TXCA 4BVUA 4WKQA 4M97A 2R3MA 2GSFA 2REIA 5AAGA 5HG5A 4E1ZA 2WMUA 2PZIA 3BLQA 2PMOX 3MJ1A 4FA2A 3E7VA 3EB0A 5HE3A 1V0PA 5CF5A 5HGIA 5LMAA 3KRLA 4A9RA 2OH4A 3ZUUA 4FTCA 1PYEA 4Y46A 4WG4A 4EOMA 5HI2A 3BZ3A 4EZ7A 1LP4A 5CQUA 4QMQA 1ZXEA 3E64A 5EQPA 2J6MA 3DKCA 4FF8A 4XRLA 4YHFA 3UGCA 3KXHA 3PG1A 3N4TA 3UG1A 2CN8A 2ZV7A 4F09A 4NIFA 1K2PA 2VTIA 2WMAA 3RNYA 4YZMA 2OSCA 3ODZX 3ALNA 1AQ1A 4HPTE 2PMIA 4L42A 4GKIA 2Y9QA 1OPJA 4Y95A 4V0GA 1G5SA 1Q8TA 3KXNA 4G1WA 2G15A 5HTBA 2ITWA 2PVHA 1UU8A 4XEYA 3UYTA 4WHZA 4USEA 3FI8A 3BQRA 2WTWA 3PXFA 4A06A 3V5TA 5K5XA 4QO9A 2YHVA 4X6QC 5L2IA 3F66A 1F0QA 5C8MA 1MUOA 2ONLC 5HHWA 2XBAA 2W5AA 2JGZA 5IA3A 2ESMA 4JLCA 3ETAA 3OT3A 2ZVAA 4NK9A 4WNPA 4HYSA 2C3KA 5F95A 5FRIA 3R8MA 3DXQA 4QTCA 4N6ZA 3HV6A 4C4JA 3NUUA 3AXWA 3SW4A 4BWPA 4J52A 3BYMA 3TKIA 1OL6A 3DGKA 1FVRA 3UMXA 1ZYSA 4U6RA 4C61A 5J87A 3ZTXA 2FSLX 4BDHA 3HVCA 4EH7A 5EW3A 1W82A 1ZOEA 2VTLA 3A8XA 3DV3A 3EOCA 3CTHA 3G9LX 5DFPA 3R8UA 5AEPA 3ZBXA 3QKMA 3I4BA 3W18A 1TVOA 3FMEA 4MQ2A 5I5ZA 5M56A 3FPQA 3VHEA 2YIQA 3GCPA 4GT3A 3ATTA 3PWDA 4OGRA 1YXUA 3RP9A 3C4ZA 4LI5A 1GZNA 4OTRA 4XG2A 2XB7A 3WIKA 4L3JA 3FSKA 2UVXA 4WNMA 4UXLA 4ZTMA 4DFXE 2WMSA 4GG7A 3OT8A 2FSOX 4WD5A 3TNWA 4U41A 3VN9A 5IH5A 3E63A 3O71A 4F63A 3HEGA 4FSRA 4ZIMA 4LM5A 5TE0A 3BEGA 4TRLA 3P7CA 3PLSA 5HX8A 2J0KA 3BYSA 2IW8A 4RIYB 3QKKA 4RA4A 3UPZA 4KSQA 2W5BA 1J7LA 1XH8A 3P23A 4OT5A 4YU2A 3A2CA 3QCQA 4QYFA 2P2HA 3VVHA 4P5QA 4FKOA 5EYDA 2R3PA 2VO0A 2ZMDA 4JAIA 2X2LA 5DMZA 2A1AB 4CFNA 4C3FA 3AD4A 2BZKB 4ZSEA 4D0XA 4RX8A 1CTPE 3EWHA 1P14A 2C0TA 2XH5A 2YM5A 3GVUA 4M12A 3A4OX 3CCNA 1LPUA 4U0IA 4OUCA 3P7AA 4G16A 4LL5A 2IWIA 5JGAA 2ERZE 3CS9A 3ZCLA 5IA2A 5KO1A 4L7FA 5LARA 4EOLA 5E8WA 2BKKA 5LWNA 2DQ7X 4H39A 4LOOA 1YDSE 5E7RA 3BWFA 4XBUA 3SKCA 3W8LA 4ZLYA 3UNJA 3MPTA 5KMIA 1OKYA 2J90A 5JKGA 4J53A 3QD3A 5GZ8A 3BYVA 5KHWA 3F2NA 2ETRA 3GEQA 5DEWA 4HNIA 4D9TA 4QMSA 3AGLA 4R3CA 3EQBA 3R21A 5AUXA 4BTFA 3QZFA 3OZ6A 3SXSA 3LFCA 4J96A 5C8KA 3PPZA 3R0TA 2WQBA 4O2ZA 4ZTHA 4BWXA 4EYMA 3SVVA 3NUXA 5K3YA 5D7AA 2X7GA 4WUNA 5A6OA 4DFBA 3E8CA 1NT2A 2ITYA 4O0WA 5B7VA 3HYHA 4G9RA 4FTJA 5IQIA 4A9YA 2GPHA 3QL8A 2W1FA 4RT7A 4UN0C 2GQSA 2RG5A 3SG9A 3ROYA 3A7FA 3FL5A 3RPVA 4I4EA 4F4PA 4DTBA 2WKMA 2VRXA 4FIHA 2QU6A 3NCGA 4Y85A 5CX9A 2QR8A 4FG9A 3QA8A 5CF4A 3KY2A 4XNEA 3AMAA 3N51A 3NAXA 3OW4A 2ITOA 3EFLA 4ACMA 1W84A 1BUHA 5DLSA 2P33A 4HCVA 4O0VA 1S9IA 2R3OA 4RVKA 1PMVA 5DG5A 1WVWA 4Z7GA 3OXIA 1WZYA 4IHPA 1PKDA 2RGPA 4WSQA 5A14A 1J91A 4DN5A 3R9OA 3VWAA 4ERWA 4FSTA 3ZC6A 3S95A 5HG8A 4KBCA 3FAAA 3RJCA 4EK3A 2UVYA 4U7ZA 5FTOA 3DOGA 4J7BA 4UWBA 2O65A 5JMSA 5KKRC 2UW5A 4AZTA 4AT4A 4J1RA 2QOCA 3TKUA 3AMBA 3CD8A 2IVVA 5K0XA 2OFUA 3MVJA 1PXMA 3PY3A 3WZEA 2PL0A 3FL4A 2C47A 2HCKA 3OROA 3REPA 4BDAA 5LVNA 3QKLA 3BELA 4I6QA 3TI1A 4BB4A 4XS2A 4YPDA 4FV9A 1WBOA 4HGLA 4D55A 4D4VA 5IQFA 3JXWA 2QKRA 4ANSA 4BYJA 2EU9A 3DU8A 5EDRA 3RBWA 4PPBA 3RMFA 4O7YA 1J1CA 1KE8A 4EI4A 2PY3A 5KKRB 3V6RA 4IM0A 3QRJA 5JRSA 3EN5A 3FI2A 4EH4A 4YTHA 3MA3A 4X2NA 3V8TA 5CU0A 2UZEA 3A4PA 1OPKA 2C6EA 4PMPA 4CGAA 3UPXA 5KMNA 2A2AA 3G33A 4DLJA 3KN6A 4EQCA 5EYMA 3KRJA 2XK4A 2PZYA 5IZFA 3TUBA 4CEGA 4II5A 1VJYA 4CQEA 4I20A 2WB8A 4L67A 5TR6A 2PTKA 5JRQA 4FYOA 4DCAA 2R3KA 2F7ZE 4DFLA 4DEHA 1DAYA 1R0EA 2BAQA 3DT1A 2JBOA 5LVOA 1XJDA 5BYLA 2J51A 3QWKA 1NVSA 3D7ZA 3DBQA 4BBEA 2NPQA 4J8MA 5J7HA 2BPMA 5HLNA 4FG7A 4FTOA 4WRSA 4X2KA 2PPQA 5CXHA 4M8TA 2PZPA 1IG1A 3DLSA 3EQGA 4ZTLA 4ASXA 4FL2A 1Q8ZA 4XJ0A 4BYIA 3ZSHA 4C4HA 2X6DA 2R7BA 3MB6A 3BU3A 3NDMA 4QD6A 4FZ7A 2WPAA 1IRKA 2VWZA 3VBQA 2ZAZA 4TZRA 4O2PA 3R7UA 5FDXA 4I1ZA 4E5WA 3PFQA 4YHJA 1JKLA 2VTQA 4HVIA 5IA0A 1MQ4A 1YRPA 3ITZA 3KRXA 1ZWSA 3L9NA 1XH4A 3NUSA 3QU0A 4TYHB 4IZ5A 4M15A 1H4LA 3JPVA 2R3RA 4BCKA 4CFFA 3V3VA 2Z7SA 4BN1A 3HV7A 1K9AA 3JYAA 4WBOA 1QPEA 3PSDA 2PYWA 4EH9A 4JR7A 1ZLTA 5K4IA 4BCQA 4O7SA 3MH3A 2PVNA 2BTSA 4X3FA 3Q52A 2HWPA 3Q3BA 4MXCA 4QT1A 2OJJA 2FA2A 4CYJA 5J5TA 2CNVA 3PRFA 3BGQA 2J4ZA 4MNEA 4CVAA 3RI1A 5C26A 1QPJA 3CTJA 3QF9A 2X4FA 4RA5A 5CQWA 3UVPA 1W7HA 2B9FA 4H3BA 3D2IA 5HKMA 3EQFA 4FKUA 3EHAA 3EN4A 4XV1A 4UMUA 2BRBA 2OJGA 3PXKA 4R7IA 5EYKA 2R3QA 3UP7A 4QYEA 4C36A 3U8WA 3QQJA 4I6HA 2YCRA 1JSVA 3ZMMA 4BDEA 2QOBA 4CCUA 1QL6A 4M7IA 4QP9A 4QMVA 3M2WA 5CWZA 4FIIA 4FKSA 5K0KA 3RPRA 3VS6A 3AC1A 3BV2A 3TZ8A 5AV0A 3FWQA 3QBNA 4DHFA 2X2KA 5B2KA 3CEKA 4GFGA 4RZVA 5CAPA 4KUJA 3HMNA 4X6RA 2I40A 3ZM4A 4B8MA 3I79A 5KUPA 4RWLA 4W4YA 5H8EA 4F70A 5DWRA 4O1PA 3E3BX 2XK7A 3IDBA 5HNBA 5IUIA 3GI3A 4HNFA 3F5UA 4OTGA 1F3MC 2UW9A 4TWCA 3T8OA 3CXWA 3UO5A 4AW2A 4TWPA 1FVTA 5J5SA 2WTDA 5HG7A 1SVHA 4AZEA 1J7UA 4KIKA 5LXMA 4AA4A 4QPSA 4WBBB 2R7IA 4ENXA 4Z3VA 2BCJA 5LQFA 4W8DA 5AP3A 3LKMA 4IAKA 4XG4A 3ACKA 4JXFA 4DGNA 2UW4A 3GU4A 3MB7A 3UDBA 3VBYA 5AV3A 2IZSA 2Y8OA 4BTJA 1U4DA 4LV8A 4RBLA 5FGKA 4S34A 3R30A 3FLSA 3LHJA 3A7JA 4D1XA 2OO8X 3ZLXA 1Y6AA 4BDFA 2GNFA 1JWHA 4U3ZA 3P9JA 1U5RA 4FBXA 2UZVA 2UUEA 3S3IA 2FH9A 3WZUA 4FT0A 1PMNA 2R0UA 3OBJA 5EI8A 5IQCA 3I7BA 3M1SA 4PV0A 4EHVA 3MH2A 1Q8YA 4IH8A 3OY3A 3LPBA 4FIJA 3PG3A 4Z9LA 3WE4A 1Q8UA 1M2RA 3KEXA 4AOJA 2UW8A 4YJRA 2J0IA 2OKRA 5HOAA 4BC6A 3D15A 3OF0A 1YXTA 4LGDA 4ZY6A 3IW7A 3H0ZA 4AUAA 2PHKA 2VWUA 4JS8A 2GTMA 4IAIA 1ZAOA 1H01A 2BRHA 3QRIA 3ZO3A 5JFSA 4U5JA 3D4QA 3OUKA 2YITA 5IEVA 4LMNA 4FIFA 3FZRA 5C27A 2UZUE 3AGMA 3R1QA 2B9HA 2PUUA 3SGCA 1GAGA 2DUVA 3ZXTA 4IAAA 1OECA 1YDTE 2VX0A 4FZAB 4GIHA 3KN5A 5I9UA 1KSWA 1O6YA 1IA8A 2QOHA 2QO7A 2JIVA 2WMQA 3LVPA 1ZRZA 2C6DA 2OZAB 3PE1A 3GCVA 4MAOA 2HENA 4QMYA 4XRJA 4D4YA 3SV0A 5KHXA 3MJ2A 3AOXA 5DE2A 4F64A 2QURA 4IX3A 4HVGA 3HRFA 4AA0A 2GNHA 3FY2A 3NWWA 1ZZ2A 2VAGA 3BYOA 2PK9A 2P4IA 3C1XA 3L9PA 5DYJA 5FEQA 5HVKA 2JLDA 2YFXA 5IKWA 2R3NA 4E4XA 5HORA 2YM8A 3AC5A 4ANOA 4O7NA 2CGUA 4A9SA 2V7OA 4FOCA 5KE0A 4G6OA 4Y8DA 4LRMA 5G6VA 2ZYBA 2QG5A 2XMYA 2JKOA 4JRVA 3LFQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OPL A;  4FTR A;  3UIX A;  3BL9 A;  1H8F A;  3I0Q A;  4J99 A;  5AP2 A;  3ZUV A;  4G3E A;  3NVM B;  3EZV A;  4QYG A;  5HIB A;  3WBL A;  5FEE A;  3QXP A;  5E8Z A;  3R8Z A;  3EQC A;  2E2B A;  3Q6U A;  2BFY A;  3H10 A;  4AZF A;  1XH9 A;  3F88 A;  3GOK A;  4DEA A;  4O83 A;  1YI4 A;  2OWB A;  1URW A;  4C4E A;  3WF9 A;  3JUH A;  3VUI A;  4DGO A;  2I1M A;  4U42 A;  2C6O A;  3FEG A;  3UQF A;  4D58 A;  2VGO A;  4RQK A;  4C3R A;  4YLL A;  1LR4 A;  1OMW A;  1H1R A;  1NA7 A;  3NVK I;  4AS0 A;  4NCT C;  1GII A;  3DQW A;  3FMN A;  5G1X A;  5HIC A;  4ENY A;  2R3J A;  4HYU A;  4AGD A;  4BHN A;  4X21 A;  2WXV A;  3W10 A;  1Y6B A;  2CCI A;  2WQM A;  2VTM A;  4OTH A;  5D7V A;  5BVN A;  3E3P A;  4UWC A;  2FVD A;  3P86 A;  3E92 A;  4I6B A;  4OT6 A;  3UO4 A;  4KS7 A;  1P2A A;  2JC6 A;  4BID A;  4CV8 A;  4ZLO A;  3VW6 A;  5AA8 A;  4HVS A;  3G90 X;  3GU5 A;  4K11 A;  1TQI A;  3IKA A;  3UQC A;  2XNP A;  4TY1 A;  4J97 A;  4Z55 A;  3G6G A;  5A9U A;  3LCO A;  2W1I A;  2XK6 A;  3A60 A;  2PMN X;  2WIP A;  3VAP A;  4IC8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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