1OKVA

Cyclin a binding groove inhibitor h-arg-arg-leu-ile-phe-nh2
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Insights Into Cyclin Groove Recognition. Complex Crystal Structures and Inhibitor Design Through Ligand Exchange
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 295
sequence length 295
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1okvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1okvA01
4AF3A 4ONAA 1MQBA 1YI6A 4F6SA 2XKEA 4MQ2A 4L00A 4M97A 4C3RA 4F0GA 4O27B 4ZMEA 3PWDA 2WQNA 3DCVA 3MY0A 1XBBA 3QRJA 5I3OA 2UW7A 3GU4A 2XRUA 2WTVA 2EWAA 1MRYA 3UNJA 3WF7A 2PL0A 4ZS0A 3EQRA 3EL8A 3G15A 4LL5A 3KVXA 4KIPA 4GJ3A 1WFCA 4NM5A 3TJCA 4C4HA 2R5TA 2X8IA 4UMQA 5FXSA 4N70A 3RMFA 4BDAA 4BI0A 2F7EE 4R3RA 5AUWA 1JNKA 3T8OA 4NSTA 1YXUA 2XRWA 4G6NA 4I41A 3O7LB 4FEUA 4OTDA 2JLDA 3NRMA 4M7IA 2WQBA 3O50A 4QMYA 3SA0A 5E4HA 4QMXA 3UJGA 4DT9A 4NEUA 3CR0A 5BVOA 3DKCA 4FSYA 4S30A 5B7VA 5KUPA 2R4BA 3PJ3A 2V7OA 4NFMA 4FEQA 4XMOA 5M07A 3PTGA 5DT4A 5J1VA 4FNYA 4R1YA 1GZ8A 1IEPA 5GJDA 4FOCA 4BYIA 2QO9A 2W05A 1UNGA 2H9VA 3LJ1A 3W8QA 4F4PA 3A61A 5CU6A 2QNJA 4C34A 2X8DA 4Y85A 3ETAA 5C8KA 3E64A 5ANOA 5CAOA 1BYGA 3SG9A 4G3EA 5ETFA 4HGEA 4EK4A 4BL1A 4HVHA 2R3GA 4K0YA 2JKOA 3R63A 3IG7A 4QTCA 3DOGA 3LFQA 2OJ9A 4LGHA 3ORTA 4FL2A 4LV5A 4FTUA 4C2VA 4FKSA 3ZDUA 4AS0A 2OJGA 2VWXA 4L44A 4I6QA 5M53A 3VBVA 4LM5A 3ELJA 4IM2A 3TWJA 3D7TB 4CKIA 1PMEA 2R3MA 3FYJX 4U40A 2G9XA 4TYEA 1IG1A 3R73A 3W2PA 3UC4A 2P3GX 3CGOA 3KXMA 3DBDA 5EOBA 4U81A 3QD3A 4MBIA 4A07A 4EOQA 1ZMVA 4ZY4A 4JQ8A 1WVXA 4I5PA 3ZC6A 4ACGA 4FIEA 2QODA 2W1DA 3HDNA 4QMTA 2ZM3A 3R8PA 4A4OA 4TW9A 4DEEA 2CKPA 5TT7A 5F94A 3NAXA 5IA2A 4EHEA 3NW6A 1J7UA 1J3HA 3F88A 5TOZA 4YC8A 4I21A 5ANEA 4ENYA 2O5KA 5AFVA 2UVYA 4OTWA 4KRCA 3ZHPC 4GIHA 3VQUA 4DEBA 2JEDA 2BHHA 3QD0A 1VEBA 3QRKA 2OW3A 5AA9A 3ULZA 3CD3A 2P2IA 4ZZMA 2Y4PA 3ZLXA 4Z55A 2PY3A 4QYEA 4QQ5A 1Y91A 2FGIA 3C0IA 3H10A 3LW0A 4U97A 4JBQA 4DCAA 5C26A 3L9MA 5LWNA 2VTQA 4D2RA 3NYVA 5ETCA 4AW0A 2XK7A 3W10A 3EQDA 2BFYA 4W9WA 3FMEA 2DUVA 1NVSA 2XCHA 3NSZA 2NRUA 3B2WA 4TWOA 4XG9A 3MFRA 5FD2A 4Y46A 2ETMA 2WFYA 4M15A 2HZ4A 3Q2MA 3RPSA 4KIKB 4DH3A 1UU3A 5AAGA 5DRDA 4ITHA 4C4JA 5DG5A 1PKDA 2VTSA 5FEEA 3UYTA 2YCSA 2CNUA 3VS7A 3Q4ZA 1IR3A 4FKJA 5EW3A 2RL5A 3P4KA 2P2HA 4YBJA 3PFQA 3VIDA 1H27A 4Q2AA 2I7QA 5M08A 3FI8A 4I5HA 1FGIA 1TQMA 3UOHA 3MWUA 4ASDA 1Q61A 4CFWA 1RE8A 4ERKA 2UZUE 2BTSA 2OSCA 3AT4A 4IAAA 5HBJA 4YZDA 4F6WA 4WOVA 3Q60A 3A7FA 4EZ5A 4ZLOA 3LFAA 4II5A 4RX9A 3U54A 3W2SA 4ZTNA 3HEGA 4FUYA 4Z7GA 2OXXA 3OTUA 3OVVA 5HIEA 5EDPA 2RSVA 4FNZA 4M14A 5EDQA 3EQFA 1ZY4A 1GZOA 1Y6BA 2JBOA 4LOOA 4MD9E 3BYUA 4FK6A 3F5GA 3RHKA 2PE2A 3MJ2A 4PNIA 3CJFA 5GHVA 4QYGA 4W4WA 2ZV8A 2YDIA 3VS1A 4FTQA 3KRWA 3ZC5A 3TKUA 4O7SA 3H4JA 3WYYA 4HVSA 5D10A 1PHKA 2JD5A 2XK3A 3U9NA 3W2QA 4IM3A 1FPUA 5E1EA 2WQOA 3K3JA 5EW9A 2OK1A 2XNGA 3EFJA 3R9OA 5BVDA 5E8XA 3IK3A 4GJ2A 4YJNA 5H9BA 5J5SA 4F0FA 4JDJA 2PUPA 5FRIA 1Y8GA 2C6LA 4O0YA 3NIEA 3SC1A 5K3YA 3MVJA 4Q5HA 5HO8A 4BB4A 5AX9A 2FSOX 3O51A 2IVTA 1BX6A 1ZYDA 3KMMA 2CLXA 3M1SA 4ID7A 3QGYA 4KIOA 3TIZA 5IEYA 1YXSA 4NIFB 4RIXA 5IMEA 4K9YA 4H58A 4O2ZA 5CF6A 4ZSLA 3H30A 5KHWA 5A4LA 4X3FA 4WBBB 4BIDA 3LQ3A 4YNOA 4EHZA 3FZOA 1NT2A 5DH3A 3TZ8A 3NS9A 3UIMA 5HEZA 5TE0A 4AGCA 4EH5A 1BMKA 2AC3A 2XS0A 2Z7SA 3ATSA 2OJFE 3TN8A 3MY1A 2WTIA 1KWPA 3QRIA 4IAIA 2HENA 4CCBA 4GG5A 2QR7A 4LRMA 3PIYA 1QPJA 4E6CA 5KE0A 3EFLA 2WMUA 1PXIA 3IW8A 3V6SA 4DHFA 3QKKA 3ORZA 2WPAA 4G3CA 4GT3A 2C0TA 4RWIA 3ZTXA 3G0EA 4GFMA 1WMKA 4ZY6A 4EH6A 2FB8A 5EQPA 2P55A 5BVFA 3UDBA 4RJ3A 5EQEA 3WOWA 3BHVA 3G2FA 1OZ1A 4G6OA 5A46A 5CAPA 3LMIA 4AX8A 4NJ3A 1YI3A 4O82A 2E2BA 1H1WA 1QPCA 1ERKA 3POOA 3LXNA 4ZP5A 3E87A 4P7EA 4ANQA 4L67A 4RJ7A 2H34A 3TI1A 4EH9A 4CGAA 2ZYBA 3TCPA 3U8WA 4C0TA 3LZBA 2RIOA 3MH3A 3ERKA 4JR3A 4EOIA 2JAVA 4D4RA 4JG8A 4NCTC 3FZPA 3BRBA 3OW3A 4GW8A 4M69A 4MF0A 4IWOA 2QOCA 2X9FA 5FBNC 3RK7A 3DXNA 3T3UA 3FJQE 1YHVA 2HELA 3C4EA 4U0IA 3OEFX 5KO1A 1LP4A 3UNKA 3KC3A 5B2KA 1MQ4A 4FV4A 4EH4A 4QP9A 4MWIA 4K2RA 5T3QA 3O8PA 2R0UA 4IM0A 1W84A 3KF7A 3LCDA 3PXZA 4O2PA 3I0OA 3QQKA 4EQCA 5JGDA 3HV4A 4MXYA 5KMKA 2R3OA 3C13A 2PZYA 2BHEA 3I7BA 5DHJA 2QOKA 2FUMA 4UYNA 2FH9A 5CU0A 3A99A 2OU7A 3NR9A 5DR9A 2YLFA 2G2HA 4J97A 4M8TA 4BYJA 4DH8A 1F3MC 2XP2A 4AUAA 2PPQA 5FLFA 4BTKA 2R3RA 5DOSA 3QU0A 3P79A 4L7SA 2VZ6A 2CHLA 3BEAA 5HORA 4JAJA 4TNDA 3DJ5A 4E6QA 2OBJA 3QTXA 5AIRA 2VNWA 4DGOA 3CIKA 3E8EA 3FZSA 2X7OA 2F4JA 2BVAA 5CU2A 4FKTA 2G2IA 2C1BA 4FG7A 5CXZA 5GINE 1NA7A 2W1ZA 3EMGA 2IZRA 4YNEA 2NPQA 4HPUE 2XK4A 4UEUA 3HAVA 2YAKA 5BMMA 2JKKA 1IRKA 4BIBA 5DR2A 3OUKA 2RFSA 3CSVA 4FEVA 4KA3A 2C6EA 5K4JA 4ACMA 4KB8A 3ZZWA 3UQFA 5CVGA 3FPQA 4GKIA 4EJ7A 4C7TA 5CQUA 2C6MA 4K8AA 2G2FA 5CS6A 5AR2A 4YJVA 1JQHA 5D11A 4B7TA 3C4ZA 4EZ7A 2OZOA 3W2OA 5I9UA 3JY9A 5JRSA 4FE2A 3LCKA 4G3FA 3PZHA 1OB3A 1R0EA 2OI4X 4OTRA 4YZNA 2E9UA 3TL8A 4EK8A 1OL1A 2X2LA 1FVTA 5EHLA 1PXLA 5C8MA 3R04A 5E8ZA 3F3UA 2BALA 4GCJA 4KBAA 4ZTLA 5E90A 2BROA 3PIZA 1U54B 4KWPA 2Y4IC 2ZB1A 4C58A 5EM8A 3EJ1A 3Q96A 4I94A 1A48A 4YHJA 5FP5A 3PVGA 2PWLA 3EKNA 2PMNX 3ORLA 3VHEA 1SVEA 3NUSA 2QURA 4W8EA 2VWUA 3FL5A 4BTMA 3DJ7A 4ANNA 3P7BA 4IBMA 5JK3A 3KL8A 2F7XE 4TL0A 1OBDA 3OHTA 1B38A 4LI5A 3K2LA 4TWCA 3QHWA 3Q2JA 3HECA 3QCSA 4BCQA 1G5SA 4BZOA 3ORKA 1JKTA 2OICA 1OM1A 4U7ZA 4BC6A 4XV2A 4YJPA 2CCIA 4QTAA 4F7LA 3OZ6A 3MPAA 2RF9A 3POZA 3RKBA 4V0GA 4V05A 3GVUA 3OFMA 2BTRA 3QCQA 2W5HA 4QMMA 3UG2A 3ID6C 4IZAA 2P0CA 3IKAA 2Y9QA 3LMGA 5A14A 5AUUA 2XNPA 3BGZA 5AP6A 2H6DA 3WIKA 5DEYA 2O63A 3P08A 2EVAA 3RVGA 2F7ZE 3EZVA 5BQ0A 2V0DA 3BKBA 2CGXA 4WRSA 4Q9ZA 4FIIA 3O96A 2VTLA 2VD5A 3F82A 1VYZA 3ZDIA 3Q32A 4CYIA 5IMXA 3GQIA 3V5TA 2BZIB 4DT8A 3R1SA 3FKNA 2W17A 5FUTA 3QX4A 2GNFA 4FKGA 2YWVA 4O1OA 4YHFA 3AMYA 2W4JA 1MRVA 2X0GA 4KAOA 3ULIA 3UIBA 3LCSA 4ACCA 1YXVA 4FVQA 3RAKA 5JH6A 4RA4A 2BKKA 3JUHA 4CLIA 3OS3A 2BDJA 5EI6A 2QOFA 2J0LA 4DG3E 4ZLZA 4KD1A 4S2ZA 2RKUA 3SW7A 4EJNA 2ZMCA 3VUIA 2GFSA 3QL8A 5HCXA 5AX3A 4AWIA 2WTCA 4J96A 3RM7A 5HG5A 4FSMA 3NDMA 4RIYB 3ZM4A 4HCUA 4JL9A 3P78A 3ZU7A 5E1SA 4M0ZA 1BL6A 3OUNB 3TNWA 2GTNA 5GJFA 5K5NA 4MH7A 3P7CA 3D7TA 4XP2A 5L2WA 2WXVA 5CU3A 3SX9A 2X4FA 4A9SA 4F9AA 4RFZA 1K2PA 2VWBA 4ZSJA 5JZJA 2XIZA 3AC5A 4XG7A 3NCGA 3LXLA 1Q8TA 4MBLA 5J9ZA 5FTGA 3EKKA 4YLJA 2OJIA 4DTAA 3DDQA 5IA5A 1LR4A 4C62A 3MJ1A 3VRZA 4ZSAA 1XH9A 4G5JA 1DS5A 2W1IA 5CEKA 2J4ZA 5IUGA 2VNYA 1OPLA 4AOIA 5C8NA 3JS2A 3MFTA 4NK9A 2OWBA 5DN3A 3QZIA 5ACKA 3KU2A 2OIQA 4WSYA 5H3QA 3C5IA 4BKYA 4MEDA 5BPYA 2O3PA 5CNOA 4C38A 2DYLA 5CAQA 4C35A 3F7ZA 3DFCB 4HPTE 5HBHA 3Q4CA 4FNXA 3VUKA 3ZSHA 3SXSA 4F1MA 2HW7A 1V1KA 5F9EA 2J0JA 4GEOA 5M4FA 2JAMA 1OI9A 4O7VA 1XQZA 3E8DA 4KIKA 1NW1A 4FL1A 4WG3A 4PP9A 3LM0A 3CBLA 2BCJA 5LCKA 3RGFA 3WF9A 3NYOA 2Y6MA 1Q8WA 4L01A 1IAHA 3EIDA 5FM3A 2WMXA 3FYKX 3OD6X 4FTCA 4QYYA 2BKZA 1YVJA 2VTMA 4RX8A 4BWPA 3OBJA 2BFXA 3KY2A 4O0XA 5TO8A 2JDOA 4XS2A 1NVQA 5M55A 3BYVA 4DG2E 2XIRA 5H2UA 4N0SA 2UW8A 3DK7A 1P2AA 2B55A 2OFUA 3HGKA 3QQLA 5AUYA 2VX0A 2WMBA 3BLRA 1JSVA 4GIIA 1PXPA 4IC8A 3BCEA 4JVGA 5DA3A 1ATPE 1YKRA 3L9LA 4G1WA 3KGAA 2W1FA 4KIQA 2IPXA 3Q6WA 3QZHA 4FKOA 4G9RA 4XOYA 3BWJA 3G5DA 2ERZE 4JRNA 4BCHA 3QRTA 3VW8A 3BELA 3QC9A 5HZNA 1PYEA 4I6BA 4M0YA 3VUTA 5IA1A 5LVOA 3V5JA 4EOLA 3FI4A 3RBWA 1Q62A 3VJOA 5IH6A 2FYSA 3D0EA 3PJ2A 5AP1A 3E93A 3LFBA 2B53A 3C7QA 4BKZA 2ITTA 2X2KA 4CTCA 1X8BA 2VGPA 3DAJA 4YURA 4BFMA 4BY9E 2UUEA 2WTKB 3E3PA 1FINA 4D9TA 3QUEA 2VTNA 1YOMA 4RWKA 3ZRKA 4IDVA 5HE1A 4M67A 3PJCA 4QPAA 5HO6A 4ALUA 3BHTA 1H1RA 3FC1X 3TACA 2NRYA 3E8NA 4H3BA 4U8ZA 2B9FA 3UGCA 4EHGA 3SDJA 3D15A 3UPZA 3BGQA 2WTWA 1R0PA 3SXRA 4C59A 1W8CA 3CKWA 5C4KA 3KVWA 2FSMX 4LFIA 4XP0A 1PXNA 4YC6A 3ZO1A 1R78A 3OP5A 2ZV9A 3E3BX 5M4CA 4R7IA 4DF3A 3W2CA 1Q99A 1VR2A 2WTKC 4EL9A 4CT2A 3LFNA 2HW6A 4CG8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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