5ITAA

Crystal structure of braf kinase domain bound to az-vem
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
271
structure length
250
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGLSILWMAPEVIRMNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
publication title An integrated model of RAF inhibitor action predicts inhibitor activity against oncogenic BRAF signaling
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 250
sequence length 271
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5itaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5itaA01
3QYWA 5HTCA 4W4XA 3ZFXA 3ALNA 3PXKA 4D2TA 2ZDTA 2JDVA 4V0GB 5ANGA 4C4HA 2LAVA 4ZAUA 2BRMA 4FG9A 3BV2A 2DYLA 1ZZ2A 4O1OA 4GG7A 4KIQA 4XMOA 3FC1X 5CT7A 4QQJA 4RWJA 1PMVA 5CEKA 5DVRA 3ZDIA 2VO0A 4O7TA 3KULA 3RZBA 1OB3A 2I0HA 3CBLA 2R3HA 1WBNA 4H58A 3C4ZA 3DBQA 2R7IA 3NEWA 4MXOA 2WEIA 4O22A 4QP7A 4FIGA 4BDAA 4MCVA 4FZDB 4MWHA 4ZTSA 3V3VA 1DAYA 4O0RA 5J9YA 3ZUVA 1OBDA 3ROYA 2YM8A 3DK3A 3EYHA 3ZU7A 3QC9A 3W33A 5A4LA 4KUJA 3VNTA 3CPCA 4DFXE 3TNIA 1BLXA 4KINA 3DDQA 3MH2A 4FKGA 3R28A 3S00A 3WI6A 2UZNA 1XH4A 5HTIA 3ET7A 4U41A 4FYOA 4UWCA 3R6XA 5CLPA 3TI1A 3QTUA 5HORA 3OROA 1JSTA 3RHXA 4EEVA 5CF6A 2DUVA 3RHKA 1XH6A 4R8QA 2CLXA 2G1TA 2XB7A 3LXPA 5DN3A 4D4VA 2F7XE 3BHUA 4QP3A 5AA9A 4FC0A 5DWRA 4E1ZA 2ZDUA 1XWSA 2QC6A 2YIYA 3F5GA 4WA9A 2V7OA 2Z7RA 1HCLA 4MH7A 4CLIA 3LXKA 5CAPA 2GQSA 3E64A 3T8OA 4BTKA 4CXAA 4I24A 4FSWA 2O8YA 3RNYA 3FQEA 2UVZA 4RG0A 4KSPA 5BYZA 3VW6A 1RDQE 4DH5A 4AZWA 4BCQA 4LGHA 1OVEA 5A3XA 4BDIA 5IDNA 5CU4A 4DT8A 4JG8A 5CTPA 3S1HA 3BEAA 2VTPA 4CFMA 3CS9A 4HW7A 5L6OA 4M8TA 4CTCA 3Q6UA 3MY1A 4MNEA 3ZCLA 3KB7A 2OI4X 3V8WA 2BZJA 4BCHA 4MD9E 4R6VA 4YO6A 1I09A 2Z7LA 4YNOA 5AV0A 3V5TA 4PP7A 1OPJA 1MQBA 4I94A 3WILA 4MTAA 4DEBA 4CCBA 3DXPA 2BHEA 3V5PA 2XIZA 2C1AA 4JL9A 3Q5IA 2VTRA 4A9YA 1P2AA 5JN2A 2JFMA 3OXZA 1APME 4HCUA 4L3LA 3OBJA 4EH6A 3U4WA 2XYUA 1CM8A 4IMYA 3I60A 1ZYJA 2XJ0A 2XKDA 4QYFA 3L8SA 4FEUA 4ZTRA 3ZO2A 2UW8A 5J79A 4KRCA 5JK3A 3MB6A 4FT7A 4UMPA 4EC8A 5K4IA 3GU5A 3MDYA 3QQLA 2RFEA 4OT6A 4ACGA 4BKJA 2R7BA 4IAIA 5BPYA 4YR8A 3NS9A 5D9HA 5KMMA 1YDSE 2YISA 2JDOA 1RJBA 3IDBA 4FTLA 4FTUA 4OLIA 4PPBA 4J97A 5BVEA 4EH4A 4EJ7A 3MH1A 4IAZA 3TZ7A 3I6WA 2JC6A 4DFZE 4QMYA 3EHAA 4EKLA 4QPSA 4B99A 1W82A 1DI8A 3OWJA 3UIXA 3FYJX 3FMHA 4M3QA 5HCYA 1M14A 2O65A 1H1WA 4FNWA 3IGGA 4LOPA 4YSMA 4QD6A 1FPUA 3BI6A 3OXTA 2ESMA 2XK3A 4RZVA 5LVPA 3F2AA 2X1NA 4FOCA 5ANOA 2HIWA 5H2UA 3K5UA 5AV3A 3MFRA 4CYIA 2C68A 5AIKA 3EQIA 3TNWA 5IPJA 3DAJA 3VS4A 3F7ZA 5B2KA 4QYGA 3VIDA 3U6HA 3QZHA 4J71A 1PXIA 3DV3A 4JQEA 5J87A 3MN3A 5HD4A 2YCQA 2A0CX 3DK6A 5IUGA 4FV5A 4G5JA 4YTIA 4XG7A 2R3JA 3PIZA 1U5QA 4M67A 4BFMA 3PP0A 5BVKA 3SXFA 4ZMFA 4XG3A 3BU5A 3PXZA 3JPVA 5HE1A 4D1SA 4JDIA 4DEDA 4DG2E 4JG6A 3L9NA 4RWLA 4FK6A 4I22A 3MPMA 4JX7A 4YPSA 3OW4A 4K33A 3QLGA 3PRFA 2WTWA 2PTKA 4G3CA 5M08A 4LI5A 4AUAA 3DCVA 4UMQA 5L2WA 5LMKC 2YCRA 2XZSA 3S0OA 4K1BA 4JLCA 4ACMA 5J9ZA 3WF8A 3AD5A 2XNOA 5E8UA 5G1XA 5GINE 3HA8A 4RVMA 4ANBA 5J9LA 5HBJA 3TNHA 3RAKA 4L43A 4V0GA 4JBOA 2F7EE 3ERKA 1V0BA 3NUSA 4EQMA 3BQRA 4MF1A 3BHYA 3EL7A 4KNBA 4FK3A 4QMLA 3WF9A 3P4KA 5DMZA 4PX6A 2B9FA 5B7VA 5LMAA 1BL7A 5GIOE 3ZLXA 4ZSLA 5C1QB 1H25A 1P5EA 2EVAA 4OTRA 3FLQA 3S3IA 3TIYA 3ZRMA 3NRMA 3F66A 1G8AA 5AMNA 3ULIA 1SNUA 4PP9A 2X9EA 3UYSA 2H8HA 4GMYA 4HZSA 3BWFA 2QLQA 2BIKB 2F2UA 3BYVA 3TM0A 2YDKA 4ZEGA 3FMDA 3QA0A 4P90A 2PHKA 3Q60A 1UU3A 4FTQA 4L67A 3S2PA 4D1ZA 5C8KA 5IU2A 4C4IA 4V05A 5G6VA 4AXAA 2C6IA 4DTBA 3UODA 4MF0A 4RPVA 3EN5A 2BFXA 1URWA 2B52A 1WMKA 2NRUA 1UNGA 2W06A 4USDA 5BVWA 4LUDA 4F1OA 3HMOA 5EFQA 4TYGA 3D2IA 3UG1A 4ZIMA 3IPHA 4BCMA 5JQ5A 4FL2A 4G3EA 1VYWA 3UIMA 3CQEA 3ZUTA 4XS2A 3OT3A 1GZNA 2P2IA 3O17A 4X2KA 5KZIA 3R9DA 4I23A 2JIVA 4O7YA 3TCPA 3NNUA 3RBWA 5IQFA 1U59A 2VWUA 2O2UA 4O1PA 2YWVA 1H27A 1B38A 4IWOA 2GDOA 4EZ3A 1WVYA 3EJ1A 3K2LA 4JS8A 4R5YA 2JLDA 4L44A 4XG6A 2BPMA 4OAUC 3UOLA 4RX9A 3VS3A 2HZ4A 3U9CA 5BYYA 5HNIX 4BCOA 2WMQA 4YTCA 2W1GA 3KRWA 1M7QA 1RQQA 4C0TA 4IVCA 4M69B 1U5RA 4AA5A 2UW5A 5LMBA 3AOXA 4AW1A 5D7VA 1H00A 1PXOA 1Q61A 2IZUA 4AACA 3PVBA 5CEOA 3JUHA 2J0IA 2UZWE 4V04A 2ONLC 3B2TA 5IF1A 2WGJA 2BRBA 3GOKA 3NGAA 2XNGA 1J7LA 5IA1A 4CV9A 4U7ZA 4IQ6A 3G90X 3NIZA 4CEGA 2Z2WA 2QU6A 1QL6A 4YC3A 2PVKA 3B2WA 4BZOA 4IZYA 2OJIA 3KN6A 4PMTA 1PF8A 3R9OA 3JVSA 4U97A 3P7CA 5DEWA 4TPTA 3SOCA 2OXDA 4F64A 5LQFA 3ODZX 2B0QA 3RJCA 2VU3A 3MV5A 4IX4A 3DS6A 3ORLA 3O0GA 3QTSA 5CVHA 1Q3WA 1XHAA 2RF9A 4EL9A 2IN6A 3ACJA 3U8WA 3AXWA 4BTJA 4FKVA 1OIRA 2CMWA 4QMUA 3PY3A 4X2NA 3V6RA 1W0XC 4C35A 2VTHA 4JVGA 3UQFA 4PTEA 1IAJA 4QMMA 1KE8A 3PSCA 2XF0A 5LVMA 2P3GX 5FTGA 3KVXA 4QTBA 4Y72A 3TJDA 4XV9A 3HV5A 3PFQA 5CNNA 4FIJA 4P4CA 5CU0A 2Z02A 5CS6A 4ARKA 4S32A 4RVTA 3GB2A 3HNGA 3MYGA 4NFMA 2SRCA 3CD8A 3UNKA 4IH8A 1J1CA 2C0OA 2GNIA 3LCTA 1ZXEA 4O84A 3LQ3A 4J95A 3FYKX 2Z7QA 4RIWA 3PUPA 4A06A 4C38A 5K0KA 1KE5A 2XMYA 3DKGA 5I4NA 2KTYA 4HCVA 4AFEA 3L8XA 3ZYAA 3DFAA 1ZYDA 4GT4A 5CF8A 5CF5A 1WVWA 3QGWA 4FT0A 1X8BA 4JDKA 1YRPA 3NNXA 4XG4A 3ZSGA 4C3FA 1XH5A 4D58A 1ZMVA 4O6EA 2XK9A 3QBNA 4FTJA 3C0IA 4M66A 3AD6A 3PA3A 4RLKA 4QYHA 4XCUA 4A07A 5I3RA 2AC5A 4BYIA 4BR3A 3MPTA 4AGUA 3JY0A 2VTTA 4PDOA 3EFKA 2DS1A 4F6UA 4R3CA 2IVTA 4FOBA 3E8NA 4FV6A 3G9LX 4IACA 4A9RA 2VO6A 4FICA 4E73A 2XNBA 3C13A 5BVDA 4D4RA 5CSXA 3CTHA 4BDDA 3LFBA 3PZEA 5E8VA 2JD5A 1YHWA 4K2RA 3F2NA 4AQCA 3DLZA 4W8EA 4ACCA 4PDYA 5DOSA 3DJ6A 2HWOA 3UOKA 4IVDA 4O82A 3FKOA 4FKRA 2V62A 1VYZA 3T9IA 2W1IA 3GCQA 1YXVA 3NW7A 3PIXA 4QMXA 3PY0A 4IE9A 4JDHA 5KBQA 1LEWA 2X8EA 2X7OA 4U5JA 1OITA 4G6LA 5FP6A 1JKKA 1Y8YA 1S9JA 4BDHA 1G5SA 3OF0A 3VO3A 5DIAA 4CNHA 3HRFA 5HVKA 3RKBA 2R0IA 3QRUA 3DB6A 5ETIA 4FYNA 2I1MA 2R5TA 4JJRA 3HGKA 4V01A 3O50A 4C61A 5HIEA 3DBFA 3LPBA 3ORTA 3P0MA 4RZWA 1RW8A 3CEKA 1MRVA 3OW3A 4NM7A 3BV3A 4M97A 4HYSA 3E92A 3HL7A 3HRCA 4KRDA 4BZDA 2XP2A 1JOWB 2OU7A 2QOFA 3BIZA 5DRDA 4CCUA 2PU8A 3A99A 3D0EA 3QA8A 4Y83A 4KIOA 3HP2A 4GVAA 4PTCA 2G2HA 4YZCA 2VAGA 2BZKB 3ZONA 2ETMA 3NUUA 4PMSA 3EQCA 2O3PA 2RL5A 4GYIA 2LGCA 4BDGA 3BRBA 4LL0A 4L00A 5CEMA 2YM7A 3GOPA 2XH5A 4FG7A 5AP6A 3A4OX 3VWAA 5A4CA 5GZAA 2EXCX 3KU2A 5FDXA 2AYPA 2QVSE 2XNMA 2W96B 3OWKA 2CGUA 2UZEA 4OTWA 4GW8A 5AM6A 4ANQA 1JVPP 4BDKA 3L8VA 2VWIA 3LFEA 4UZDA 1IRKA 3OOGA 1UU8A 3OWLA 4DFBA 4J96A 3O51A 3TTIA 4FEVA 5FUTA 4FZ6A 3CE3A 5L6PA 3FPQA 5JRQA 1Q62A 4LRJA 2X8IA 1E1VA 2GFCA 3LCKA 5EKNA 4F08A 5FXSA 3AC1A 4XG8A 4IWDA 5DFPA 1MUOA 4F09A 4RA5A 2WB8A 3SGCA 2WTCA 4EBVA 1U54A 2GFSA 3E93A 2PMNX 4EOPA 2UW0A 2VWBA 2VTOA 4F7LA 3F3TA 2PMOX 4HVIA 5LOHA 4KKEA 3E87A 3PP1A 1WBWA 3HUBA 4IIRA 3FZTA 1AGWA 2J0JA 3BYMA 3D4QA 3QTQA 5LMKA 4WHZA 5LVOA 3PJ3A 4YJPA 4IW0A 2IPXA 4O81A 5CQUA 2F4JA 4BCIA 4IC8A 4BDBA 4F9YA 3QRKA 5IQIA 3G33A 2UV2A 4S31A 3S95A 5AFVA 3NR9A 3DU8A 2IZRA 2NNWB 3NSZA 1OIQA 2WQEA 3H4JA 4O38A 2CLQA 4I0SA 2OIBA 3QXPA 2PK9A 2R9SA 1JSUA 5HG8A 2FSMX 2HXLA 5HICA 2GU8A 4LM5A 1OKZA 2ACXA 5DA3A 5EG3A 2IWIA 5ETCA 1VEBA 2XNEA 5L8LA 4IFGA 4I6BA 3DNDA 2ERZE 5I0BA 1OGUA 4GFMA 4J99A 4OBQA 1OECA 3KULB 2UW6A 3DT1A 2WTIA 1TQMA 2BKKA 5KMJA 3Q4TA 5HNGA 4AZEA 5EI6A 4CMUA 3LOKA 3A4PA 3FQSA 4ASZA 3DKFA 3SRVA 3ZUUA 3FMJA 3R2YA 3RPOA 2W1CA 2O64A 2X6EA 1PXMA 3IDCA 3MTFA 2Z8CA 4KABA 4QPMA 2VTSA 4L3PA 3W8QA 5DEYA 3L9MA 3OBGA 4GU9A 2VTAA 3DKOA 4QMVA 3GCSA 4WT6A 3DXNA 1R3CA 1JBPE 2OZAA 5AUTA 4JT3A 5ANDA 5H8GA 3PWYA 5KX8A 3OCTA 4TWNA 5DR2A 3VS1A 3R9RA 2Z7SA 2UZOA 3HX4A 1PMUA 1R1WA 3IO7A 2QG5A 4MKCA 4H3QA 4LOQA 4R3PA 1ND4A 3AMYA 4WKQA 4XBRA 4YLLA 3KMUA 4FT9A 4MEDA 3DZQA 4D5HA 4Y8DA 4QP2A 3FLWA 2XM9A 4JQ8A 4J8NA 3R7OA 4O86A 1UV5A 3R0TA 3A7GA 1Q24A 4C7TA 1O9UA 4JBQA 3BX5A 5AAEA 5F1ZA 4CVAA 4KAOA 2I40A 4R77A 4WG3A 2GHGA 4ZXTA 3WIGA 1IA9A 2WXVA 3FJQE 3DA6A 4KIKA 3W2SA 3RWPA 2RG6A 2WTKC 5FXRA 2CKOA 3Q4ZA 3QKKA 4E5WA 3O7LD 3NUNA 5K3YA 3OD6X 3HAMA 3UIUA 2PVJA 4IEBA 3FHRA 5J7HA 3DAKA 3QZGA 4O6LA 1FOTA 4HVDA 4RJ8A 4MNEB 4Z16A 3TV7A 2RFSA 1PY5A 3PPKA 3ETAA 3M42A 5EYKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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