4UBAA

Low-salt structure of protein kinase ck2 catalytic subunit with 4'-carboxy-6,8-bromo-flavonol (flc26)
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title A Note of Caution on the Role of Halogen Bonds for Protein Kinase/Inhibitor Recognition Suggested by High- And Low-Salt CK2 alpha Complex Structures.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 107
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ubaA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ubaA02
2YIXA 5E8SA 3O0GA 3WIGA 4CRSA 3FLZA 3R6XA 2GFSA 5D12A 2W0JA 2QKRA 2YJRA 3OW4A 4YZCA 2ZM1A 3O17A 2WEIA 5DI1A 4DCEA 5HNIX 3FMKA 3Q32A 4PQNA 2ZB1A 3VUIA 2BDJA 3OXIA 4PNKA 4EZ3A 4BBMA 4HVHA 2Q0BA 2C6DA 4R78A 1U5QA 4QMYA 2WNTA 2VO7A 3VS5A 4Q5HA 4WBBB 4K9YA 2X6EA 4RA4A 1XH5A 4DFUA 4XNEA 4BCJA 4X21A 2DYLA 3IS5A 5I9XA 2QU6A 4QMXA 4G3FA 2I7QA 5HTBA 4FK3A 4ANBA 3W2CA 4D4RA 3GC8A 5KZ0A 1DAYA 4L3PA 4FKRA 3NVKI 2ITNA 4MD7E 3EJ1A 2XIZA 3JPVA 3GU8A 3R7IA 5KE0A 4EOIA 4RFMA 3TUBA 4WA9A 2PYWA 5HI2A 3ZSHA 5CT7A 5FRIA 5GNKA 1KE9A 4BCHA 1BX6A 1WBSA 3E7VA 3RHXA 2R7BA 4J53A 4D0XA 5CWZA 3K5UA 3SRVB 2WMXA 3DQWA 3DDQA 2VAGA 2PVFA 3GC7A 3KN6A 3LIJA 4G16A 1PYXA 4IZYA 4L8MA 4EH7A 4DTBA 4FYOA 5K3YA 4ORKA 4A9UA 4DH8A 2H8HA 1XJDA 3EQHA 2RFSA 4UYNA 4AOJA 3MH0A 3VS1A 2X8DA 2BILB 3O71A 4BCOA 3MH1A 4FTAA 4F0FA 2IZRA 5GJFA 3KULB 1U54A 3B8QA 3QCQA 4FSRA 2Z7RA 5ACKA 1B6CB 4G5PA 2FO0A 3QTZA 4XLIA 4TT7A 3UOLA 5JGAA 4YTIA 4RFYA 4J52A 5DLSA 3I60A 5FM2A 1SNXA 3LXPA 2O5KA 5EDPA 2RSVA 3FLSA 4IFCA 3HRFA 3RPOA 2NPQA 3MFSA 4P7EA 4ASXA 4IX3A 4C4IA 1OKWA 3FXWA 4FIFA 5K4JA 4BTFA 4QMQA 4M3QA 5DEWA 2G2IA 2W06A 4ZP5A 4AZSA 2ZV7A 2OJGA 5FM3A 3E62A 4EOJA 4ANSA 2E9NA 3ZBFA 4HGLA 1G3NA 4FL3A 4C2WA 4FTMA 4PPCA 3BLQA 4Q2AA 2QOCA 4WNOA 3VUTA 1BKXA 2F7EE 3KRRA 5AV4A 2IVSA 5EYCA 2YITA 3RAIA 2VWYA 4DE4A 3M1SA 1YWRA 2QO9A 3QA8A 3TDVA 4ONAA 3ZUUA 1WVYA 3DBFA 4V04A 2WTCA 5HG8A 4YO4A 2RKUA 3VW8A 1ERKA 4C8BA 2X7GA 4BWXA 3F88A 5CVHA 5FXSA 3ACJA 2YLFA 4ZMEA 4RVTA 5IEYA 2PUNA 2PY3A 1PY5A 4F70A 3AMYA 3VIDA 1OKYA 2F2CB 4JX7A 5LVOA 1IASA 5J87A 1WFCA 3KXGA 4ALUA 2WIHA 4U43A 2OFVA 4YTHA 3PIYA 4G5JA 4KAOA 3FZ1A 4S2ZA 3A7FA 4DITA 4J8MA 3VW6A 4DEDA 4TNBA 4JAIA 4EHGA 5FXQA 4UY9A 4F9CA 3NCZA 1RW8A 3F61A 3AC8A 2YM8A 3POOA 3NPCA 2Y4IB 4QQ5A 4II5A 5H9BA 2JKOA 4S31A 5CI6A 2BCJA 4QP3A 3V5PA 3DOGA 2A19B 4BDHA 4EK6A 3R01A 3VUDA 2A2AA 4FV7A 2VWXA 4KKEA 4F7SA 2CN8A 4I22A 4F1MA 3FZPA 4L3JA 2C6IA 3WZKA 2C1BA 4X2FA 3ORXA 3SV0A 4I23A 2OICA 1XH9A 3ALNA 3E63A 2J51A 5CEPA 1U54B 4AA0A 1M17A 2WTWA 5JFVA 3HP5A 5FTGA 2J5FA 3I5ZA 3BKBA 3FMEA 2PVNA 5AMNA 3QQLA 3O7LB 3ZLXA 5CU4A 3EH9A 1UNLA 3VUGA 2JFLA 4NJDA 2QONA 1KOBA 1R39A 3QD4A 2BZHB 5J9ZA 5J1VA 4FZAB 4JR3A 1ZMUA 5EM5A 3R8PA 3N4UA 2UW0A 4BVUA 4O0SA 3D5WA 4O7YA 3CP9A 2WMVA 3CGFA 1H4LA 3ZYAA 2UUEA 4X3JA 4AFJA 4GK2A 5EFQA 2EXMA 2VO3A 3P86A 2J5EA 2BFXA 2ERKA 3F3VA 3EQFA 3HGKA 3NUUA 1WBNA 3BWJA 3OUKA 4KBAA 2VTIA 4YBJA 5DN3A 3RK5A 2B9HA 4Y5HA 3Q2MA 4BTJA 4A7CA 5JT2A 3ZO1A 3LMIA 3DNEA 1OUYA 5DH3A 4QPSA 4D5HA 3UNJA 3MI9A 5M06A 4O22A 4BKJA 5KKRC 4C62A 1SVEA 4HZSA 4WSQA 4JIKA 4FUXA 4PMMA 2OH0E 4PL4A 5BX0A 4H05A 3UYTA 4GKIA 4BDBA 3COMA 4MWHA 3DK6A 5ANIA 3HV6A 4AXAA 4EK4A 4O7LA 4MF0A 3NIEA 1NY3A 3Q4TA 3QC9A 3ZHPC 5AP5A 3DZQA 5IA3A 5LVMA 2VZ6A 3ORPA 4ACHA 2YIRA 5M57A 3HYHA 2OSCA 1T45A 5AWMA 4I5MA 2UV2A 3QUDA 5AR2A 3CKXA 2RF9A 3PPZA 4GH2A 1H1SA 3QC4A 5IA5A 2E9PA 2P0CA 5CU0A 4RWKA 2QOIA 4MXXA 3F2AA 4V0GB 5FTOA 1WBVA 3KF4A 4Z9LA 3CR0A 4XV1A 5KMIA 4OUCA 4IBMA 1UNGA 2YIQA 3E88A 1Q8UA 2UVYA 3NWWA 1JSVA 2ITQA 5CF8A 3DLZA 3QHWA 1FVTA 3GCUA 2I0HA 2WOTA 1PXPA 1GNGA 2I0EA 3O51A 4FL2A 3BE2A 3PJ1A 3VBYA 4IIRA 4DH5A 4WG4A 4O0YA 3LHJA 4R3CA 4DT9A 1OIUA 3EN9A 3QA0A 4EK3A 3AG9A 4XS2A 3SQQA 3MTLA 1PF8A 4XG8A 5HX8A 3IDCA 4AN2A 3ID6C 4GS6A 3A4OX 3H9OA 5TT7A 3C4XA 4E20A 4CT1A 1Z9XA 5KBQA 4KWPA 4HVSA 5FWKK 4OBOA 3GBZA 4FSZA 4DEGA 2R64A 4EKKA 2PZYA 4ANMA 4MEDA 2YZAA 5EYMA 1FMKA 4BBFA 4K11A 3ENHA 4RQVA 3VS4A 5IA1A 1FOTA 4MQ2A 1Q8ZA 2WQMA 3K3JA 2IW9A 2ACXA 3LMGA 5CU2A 3KXZA 3Q53A 3A7GA 3HKOA 3WI6A 3NGAA 2C0TA 5D7AA 1DAWA 4DGNA 4GT3A 5GJGA 3DXQA 2HZNA 4K8AA 2CCIA 3KVWA 4D2VA 3BE9A 3PVBA 3BX5A 3OCTA 4YPDA 4M68A 5B7VA 3MB6A 5J7HA 1CKPA 3Q9WA 3AXWA 4IW0A 3DBEA 4MX9A 4KS7A 4DLIA 1WBTA 3G51A 1FGKA 3C50A 2OJIA 2PVKA 2W9FB 2I0YA 4YBKA 5HCZA 3PIZA 2JGZA 5FD2A 1TQIA 3FDNA 2ITZA 3ANQA 4H1JA 4Z55A 4AGWA 3QZGA 4D2WA 4NKSA 2XK8A 4EH5A 3KRWA 4BIDA 4H3PA 3MVMA 4BCIA 3I81A 3MS9A 3F3TA 3V8SA 2WTJA 4C4JA 4UB7A 1WBOA 2YM3A 3VJOA 5BVKA 2XA4A 4QP6A 1H8FA 3BQRA 3PJ3A 4G3GA 3L9PA 3UZRA 4IVAA 5JEBA 5AV2A 4FOCA 4EOQA 4IM0A 2R3JA 3EQBA 1JNKA 3KVXA 3WZUA 2RFNA 3MIAA 3CCNA 4Y5QA 2B4SB 4N70A 3W2OA 5A6NA 1XH7A 1SNUA 4PUZA 4QNAA 3EKNA 3LJ2A 3FSFA 3SKCA 4JRVA 4CQEA 3LM5A 3OP5A 2Z2WA 4LFIA 1VEBA 2EB3A 4TYIA 4YNEA 5IMXA 4O7ZA 3MBLA 1OKZA 3O8PA 4WOVA 3HAVA 1PXMA 2J90A 2WHBA 2PVHA 4U3YA 5JFSA 5BMMA 4E6QA 3R1NA 3ZXZA 4D4YA 4PDPA 4YHTA 4IB1A 3BQCA 3QD2B 3P4KA 3HMMA 4E6CA 4JIAA 4TWPA 3F7WA 1UWJA 1XKKA 1Q3DA 4EZ5A 3UG1A 5M4UA 5CEMA 3IW4A 5FG8A 2XYNA 4U81A 1CKJA 4DHFA 2HZ4A 3GNIB 2YLEA 2GNJA 3TTIA 1Z57A 3ZZEA 2UZVA 4BB4A 2GNFA 4PMSA 5FEQA 3V04A 4Z7GA 4JBOA 4GIHA 1Y8GA 3SGCA 3HAMA 2YCRA 3QTUA 2OWBA 3TZ7A 5IEXA 4KIQA 4MKCA 5IH4A 4NM5A 3U51A 4EBVA 3RI1A 1S9JA 2GQSA 4FZ6A 3IW5A 5IQBA 1G8AA 2X2MA 4ZY4A 1H00A 2R3RA 1A9UA 4FC0A 3NUNA 3R00A 3A61A 5JFWA 3UZTA 4CRLA 4PV0A 3FL4A 5HZNA 4YNOA 4D0WA 5KHXA 2YISA 4W4WA 4U8ZA 3VC4A 4TL0A 1I09A 4C0TA 4I4FA 5L2SA 5KZIA 2OBJA 3O8UA 5ACBC 2OLCA 2XMYA 4C3RA 5AR8A 2JIIA 3MY0A 3AMAA 5EYKA 5IH6A 4QRCA 1MRYA 5JQ8A 1R0EA 3RK7A 2QR7A 3K2LA 1GOLA 2PVJA 5FXRA 1H0VA 4OBQA 4AFEA 1W98A 4BWPA 4MK0A 5M07A 2WMAA 3NUSA 2QD9A 3EWHA 4D55A 4FG9A 4PDOA 3U6IA 5IQAA 4QT1A 5AA8A 2OIBA 3FYJX 4FTLA 4XHKB 4FVPA 3AC5A 4IDVA 3OUNB 3DT1A 4I93A 4MD8E 4FSMA 3DTCA 4FVRA 3NRMA 4NSTA 4UWCA 3I4BA 4CZUA 2B53A 4U44A 4K18A 1X8BA 2XP2A 3FC2A 2XIKA 2W1CA 4I4EA 4O6EA 2I0VA 3R7YA 2QG7A 4WT6A 1W7HA 5FQDC 1BMKA 4ZSJA 4IAYA 5C8KA 5BYYA 2PZRA 3IW7A 4HZRA 4C59A 3CQEA 5EOLA 4UXQA 4L52A 5HLPA 5AA9A 1BI7A 4F9WA 2IZTA 3V5WA 4E1ZA 2W5BA 3Q2JA 1YDRE 3QALE 4DEAA 3FHRA 5LMAA 4M67A 4DCAA 5GIOE 5ANGA 3D9VA 3WARA 4ZLZA 1IAJA 1PHKA 4FTRA 4W4YA 4BY9E 3LFEA 4RIWA 2XNGA 3GFEA 3MJ1A 4IB0A 3WF8A 3ZRKA 2UW4A 4FKGA 1Z5MA 3NDMA 2NRYA 4NM3A 4P4CA 3TV6A 3W55A 5KMOA 4AF3A 3TJCA 3OXTA 2LGCA 4AT4A 2WMBA 3BEGA 3W10A 5L2WA 1ZY5A 1K2PA 3PP0A 3TUDA 3MH2A 5CNOA 1W82A 2XNEA 3I7BA 3VS6A 4E6AA 3UQGA 3KRXA 2XUUA 4ACDA 4F7JA 4PWNA 4FTKA 5KNJA 4XCUA 1QPCA 4RT7A 2C5XA 4ZIMA 3IGGA 2C3JA 3W32A 5L3AA 4EI4A 5D10A 5A14A 2CNQA 5C4KA 4PPAA 3D4QA 4AT3A 4LGGA 2BFYA 3OEFX 4L9IA 1M7QA 4XH6A 4N6YA 2F49A 2B9JA 2QLQA 2V5QA 2X8IA 5H8GA 4I20A 1ZOHA 1Q8YA 1OPKA 4JRNA 3DS6A 4L3LA 4LMUA 4DG0E 3DLSA 3ZBXA 3VHKA 4FV2A 2X9EA 5AP3A 4E3CA 5I9VA 2CPKE 4G2FA 2QR8A 3MY1A 4XV3A 5DT3A 3U9CA 5LCJA 5A4LA 5HG9A 4RVMA 3NEWA 4RMZA 1W8CA 3JUHA 3PVWA 1PMVA 2YCQA 3AC4A 1KV2A 4N4SA 5F1ZA 4KSPA 2GNIA 3UNKA 3EQCA 3SC1A 5KX8A 4FVQA 4XP0A 2IG7A 3F7ZA 3AT3A 2WTIA 3BHYA 2XKDA 2F2UA 4G6LA 1SM2A 2EVAA 4K0YA 1JLUE 5AIRA 3S3IA 4DT8A 4MQ1A 1I44A 4FTOA 3D15A 5GINE 4WKQA 1KOAA 2B54A 3QD0A 3RWPA 2ITOA 3QRTA 3NMUF 2XKEA 5CAVA 3I6WA 3DXPA 2ONLC 4JOAA 5E7RA 4EHVA 5HVKA 2HAKA 5GHVA 2IVTA 4FKQA 2HZIA 2C5OA 4ZTHA 5LJJA 2GNLA 4L01A 3NS9A 3E92A 4NIFB 5ITAA 1TVOA 4JDJA 3LXNA 2J2IB 2WELA 4DEIA 4HNFA 3DK3A 3VF9A 4LGDA 4A9YA 4OTHA 5EKNA 3W16A 3R7VA 4FTTA 3LJ0A 2VTPA 2W96B 4S30A 3RINA 4ASEA 3AMBA 1NVRA 4GUEA 3SXSA 3DJ7A 2IJMA 4F65A 3DAEA 5LVLA 2C6MA 2QCSA 4JL9A 5G1XA 3T9IA 3MGYA 4FNXA 4PL5A 4F99A 4R3RA 3PTGA 3C5UA 3IW8A 4JVGA 2CN5A 5CLPA 3V51A 5AUWA 4L00A 3V5QA 5JGDA 3A4PA 1BI8A 3ORZA 3PA5A 4MXOA 3C51A 3DNDA 3CD3A 3OS3A 5CX9A 5C01A 4XG4A 1JKKA 4BCQA 4PDYA 5EDRA 3R8VA 1YXUA 4AZVA 5DA3A 3DJ5A 4QP2A 2ZDTA 3LMHA 3UIXA 1SYKA 2BIYA 4JNWA 3DKFA 3BYMA 1UKHA 3KRLA 5A54A 3UO4A 3BYSA 1ZMWA 4BZDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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