3QRTA

Cdk2 in complex with inhibitor nsk-mc2-55
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qrtA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qrtA01
3FQEA 4CFUA 1IAJA 1UKHA 2G01A 4G34A 2OJJA 5ACKA 3MJ2A 2C3IB 4G6OA 3WE4A 2NRUA 1TVOA 4KA3A 2WEVA 3QFVA 4EK4A 2GDOA 2NPQA 4DN5A 1G3NA 2ZM1A 3FXWA 3QCQA 3E3PA 5IA3A 5JT2A 3FZOA 4RJ6A 3LOKA 4PP9A 4RWKA 4QTBA 3C5UA 1P2AA 3QHRA 4O7LA 3ZOSA 4HCTA 3R71A 5AUXA 3IDPA 3AD4A 1LEZA 2BROA 2G1TA 1W84A 2CKEA 2UW4A 2XRUA 3IO7A 3P7BA 3GC8A 3SOCA 4C3RA 4C59A 3SA0A 5IU2A 5GINE 3BE9A 1ZLTA 4M8TA 3ZC5A 5HOAA 5HU3A 5E4HA 4JDIA 4F6WA 4GFOA 3UVPA 1CM8A 2XBJA 2PUNA 5AADA 2JKOA 1FBNA 4RC4A 5CWZA 5HESA 4DGLC 4F9WA 3UE4A 1Q8WA 4M0YA 1GIIA 3I5NA 2WIHA 5KBQA 3CC6A 4IB3A 5AP4A 4ACDA 4E1ZA 3ZH8A 5EI2A 3BKBA 1XHAA 2X9EA 3R7UA 4DTBA 4JBOA 2W1HA 3C0HA 4D5HA 1KE7A 5CLPA 3SV0A 4S30A 1H28A 4RFMA 3UNZA 2PSQA 4MQ1A 2V7AA 2HZ0A 3CSVA 3FPQA 5A4CA 4GSBA 4EOLA 3WF5A 4BKZA 4BKYA 3U8WA 5JFWA 3WZEA 4BCNA 2J50A 1XWSA 4PV0A 4QQJA 4QTDA 2VX3A 3D5XA 1QCFA 3EFKA 3DBDA 5AAGA 1PY5A 3ZO3A 4O83A 3C0IA 3W2RA 1YDSE 4D4RA 1W98A 5JGBA 4CMTA 3NNXA 3RZFA 3HECA 2QO2A 3QU0A 3BX5A 3COHA 4WNKA 3MY0A 4PY1A 5LVNA 4L46A 4QMLA 1M2PA 3E7VA 1E1VA 3UMWA 4JX3A 4C4JA 3AD5A 4ZY6A 2UVXA 2CKQA 3BYMA 5FEQA 4ZJJA 2VO6A 4MTAA 3A4PA 4AZWA 3RCJA 4QMMA 4EOKA 2BZKB 5FXQA 4AN9A 3CGFA 3FMEA 1GZKA 3P23A 3W2QA 4DHFA 5CF6A 1P4FA 5CNNA 2BILB 2WU6A 4FKRA 3ZRKA 2O65A 5J9ZA 4IZ5A 4XP3A 2Q0NA 4YURA 1OPLA 4CT1A 4O7NA 5AP1A 3ZFMA 5L8KA 5EG3A 2ZM3A 3PIXA 4W4XA 4FKUA 5AR3A 4YTIA 3VIDA 5JFSA 2QU5A 3AT3A 3GFEA 4FVRA 2ITYA 3ORIA 2B54A 1YXXA 3BHYA 4FNWA 1OIUA 3P78A 1U46A 3FEGA 3GEQA 2ONLA 2FGIA 5HLPA 3R0TA 4XLVA 3CQEA 3RI1A 5LVOA 3C4EA 3IOKA 4HCVA 1SVHA 1OPKA 1GZNA 5IMXA 4RWLA 3P4KA 3QZIA 3NIZA 1Z57A 3F61A 4KS7A 4YLLA 3QTXA 2BRGA 4D9UA 3TT0A 4FKWA 2JBPA 4QMUA 4A4XA 2OZOA 3A4OX 2IW9A 4FTJA 4XG3A 4MXZA 4DA5A 3MBLA 3ENHA 2OXDA 3QALE 3WYYA 3NW6A 4AW5A 3UNKA 2Z8CA 4DEGA 5KMOA 4F1MA 3GCUA 4TYEA 2W5HA 4IZ7A 1OI9A 1OIQA 3DA6A 3Q6WA 4U3YA 4V05A 3GNIB 3N9XA 2HW7A 4RVLA 4DH8A 2OF2A 4QP8A 3UZTA 4YR8A 4RA4A 4YTFA 3VUDA 2Z02A 3QCXA 4ARKA 3OBJA 3KKVA 3QCYA 3F3VA 1REJA 4CFNA 4X2GA 3WF8A 4AFJA 1APME 3R02A 4MK0A 5IEXA 4BZDA 4MYGA 4FEWA 2BKKA 3VUIA 4RIXB 2FVDA 2QONA 4L67A 4QTAA 4CKIA 3GENA 5AR7A 5BUJA 2PE2A 3A7IA 1PMNA 1ZZ2A 1BX6A 1Q99A 2HELA 2VO0A 1VZOA 4JDHA 5B0XA 4BF2A 5M57A 5GIPE 3QQLA 4ANBA 3GOKA 3GCSA 3QTQA 4X6RA 3ZCLA 4Y8DA 5C27A 4BI1A 3G90X 2Z7SA 1CKJA 3R28A 4YNEA 4QP4A 5HI2A 4LGGA 4FZFB 3AGMA 3HA8A 3HUBA 2XK8A 3L8PA 3QD3A 4MNFA 3MH0A 3ALOA 5HE1A 1B38A 4F08A 4X6QC 4CSVA 1Q8UA 3LFDA 4TYHB 1REKA 2F7ZE 3H10A 4CCUA 2VO3A 4AUAA 4LUEA 5GZ9A 4USFA 2I0YA 4FEVA 2IJMA 3EKKA 3NSZA 4QMPA 2IZUA 3AMAA 4BN1A 5ANGA 5HO7A 4FSTA 5IKWA 3OHTA 1JSVA 2G2HA 2O8YA 2WPAA 2X8IA 3D7ZA 4IAFA 3O8UA 4D2VA 3W2CA 1QMZA 4FV9A 4UMPA 4NU1A 5GJFA 2QURA 2LGCA 5LWMA 5ETAA 4CD0A 3KK9A 3UO4A 4F4PA 3NYXA 1OUKA 3D7TA 2B55A 4G1WA 4MBIA 4RBLA 2X81A 5C26A 3FHIA 2OJIA 2PZPA 2VNWA 4YTHA 2DYLA 2OO8X 3ZTXA 4U44A 1TKIA 4RG0A 5GJDA 3RHKA 4K9YA 1P14A 3TJDA 2VUWA 2X39A 3MWUA 5BMMA 3MY1A 4WSQA 4FKIA 4ASDA 1SZMA 4OGRA 4EOJA 3ORMA 5E8XA 5HNGA 3VUTA 5BQ0A 3VN9A 5DEWA 3Q3BA 4AOJA 2QOLA 1HCLA 1UU7A 4BCQA 2VO7A 4U6RA 4CTCA 2VN9A 4O0XA 3MPTA 1M14A 3KXNA 4L42A 5EW3A 5M07A 3CR0A 3V04A 2GCDA 5I9YA 5ITAA 3FYKX 2YCSA 4NCTA 1Y6AA 3KRRA 5CF8A 2BAJA 4LUDA 4Y73A 2C3JA 2W1FA 4ZJVA 4YJOA 5K3YA 3UVRA 3BBWA 2AUHA 2JGZA 4G3GA 4HZSA 4BCPA 4KIQA 3Q53A 4Y95A 4M97A 4QNYA 4MWIA 3QWJA 2QCSA 4OTWA 4IAAA 4UXQA 3A7FA 3F7ZA 5HVKA 2H6DA 4BDIA 4ZSJA 3JR1A 3RGFA 1Q97A 2NRYA 5CI7A 4LRKA 5K4JA 1Q62A 4GKIA 3SW7A 2VZ6A 3MDYA 2HZ4A 3UG1A 3KFAA 4USEA 1H08A 1RW8A 4L00A 4NTSA 4S32A 2A1AB 5LCJA 3TEIA 1XJDA 2HY81 4EWHA 3QX2A 2WMXA 3OXTA 1ZAOA 4ACMA 2PUUA 3DLSA 3LCKA 3FMNA 5BVKA 3C1XA 4IX4A 5AP0A 3PSCA 3D9VA 4JG8A 2Y7JA 2R3MA 2AC5A 2YJRA 3OVVA 4CGAA 3V5LA 1KE9A 4O82A 4USDA 4MQ2A 5HIBA 4AA4A 1UV5A 4GJ2A 2BDFA 1U5RA 2R3IA 5JQ8A 5CF4A 3DBFA 1WBSA 1A48A 4ANNA 4P90A 5DHJA 2A2AA 3EQFA 3MVLA 3SXRA 4OT5A 1EH4A 3QHWA 4X2NA 2PE0A 3P08A 2E9PA 4IE9A 4FV8A 4PDPA 3AC1A 2XMYA 3O23A 2IN6A 2WTDA 3IS5A 5HZNA 4ZAUA 5JZJA 3R9RA 4ZIMA 5EHLA 5I3RA 4YJQA 5KCVA 3A8XA 3I60A 2CN8A 2EVAA 1JSTA 2XJ2A 4ITJA 4BL1A 3QUDA 1DAYA 2CDZA 2VTSA 2HENA 4X3JA 2IW8A 2JBOA 5AWMA 1V1KA 4X21A 1PKDA 3CPBA 3RVGA 5B2MA 1ZOEA 4FL3A 3Q4TA 3GQLA 4ERWA 5A4LA 5IA2A 3U51A 5KHWA 1OKWA 4TKSA 5AAFA 3CJGA 5KMMA 3PJCA 3MFUA 2C68A 4I6QA 1G8AA 3C13A 4PPBA 4YLKA 4LQMA 5K5NA 4FT0A 3VQHA 5HE3A 4QOXA 4I41A 1Y91A 2VNYA 5IH5A 2HXQA 4YTCA 5I9XA 3GU8A 1FINA 5EM6A 1YQJA 2W96B 4MD7E 3HDNA 4PPCA 2HXLA 3CGOA 1YXSA 2C4GA 4LOPA 5L2WA 1GIHA 3DFCB 3KEXA 3PY1A 4AN2A 4BHNA 1B6CB 4QYGA 4ZJIA 4D55A 4FBXA 4DH3A 1ZMWA 3HMMA 3ZS5A 5BVWA 4FV7A 3QLGA 4QMZA 4WBOA 1YRPA 5IDPA 1JAMA 4IVBA 5DRBA 5KBRA 5HBEA 3NW5A 4G9CA 3DJ7A 4DEDA 3RK9A 1OKZA 3GUBA 4YZMA 4UXLA 3M11A 4BCGA 5AA9A 1H1WA 4UMUA 1Z9XA 3GU4A 2O0UA 2W7XA 1OKYA 2WO6A 2WMTA 4PPAA 4QMSA 5CSHA 3EHAA 3ZZEA 4UN0C 2VTJA 3OXZA 4P7EA 4EWQA 3OT8A 5IQHA 3DBCA 4KBKA 1QPEA 2YIXA 2IVUA 2PVFA 2RG6A 1J91A 1JKTA 3GP0A 1NXKA 2CNVA 4E3CA 3CJFA 2WD1A 3SXFA 4PMSA 4GG5A 5BYLA 5T68A 2QQ7A 3P7CA 3Q4UA 1VYWA 1UNGA 1PXJA 2QOOA 3HDMA 3N4TA 2PZYA 2ZB1A 4GUBA 3I4BA 4IB1A 1F3MC 1XBBA 5BYZA 4B8LA 5GZAA 3TDVA 2OICA 5EQYA 4AT3A 3MPAA 4IB0A 2BR1A 2GQGA 4WD5A 3TZ8A 3C5IA 2EB2A 3OS3A 5BVEA 1WBTA 2I0VA 3E8EA 5FEEA 5EDPA 3MTFA 5CT0A 4O1PA 4ANQA 4BI0A 2PU8A 4FG8A 2CJMA 2WQBA 4H3QA 4TPTA 4IH8A 3OMVA 5LJJA 4CKRA 2ITZA 3FQHA 1B39A 3CQWA 2QOBA 3SGCA 1FGKA 2JIVA 3F88A 4FUYA 2PHKA 4QP6A 4QP9A 5EYKA 3OXIA 3Q4CA 4RZWA 3ZSIA 3ZUVA 5EFQA 3SG9A 4NW6A 4QP7A 3F6XA 3NLBA 3LAUA 4IADA 4IQ6A 1ZARA 2E9VA 3OFMA 4TL0A 5A46A 1FVTA 4ZTRA 4DGMA 4CFVA 4FKTA 2XYNA 3EN9A 2PVNA 3KULB 3PFQA 3WYXA 2BCJA 1M7QA 5A6OA 5LMBA 3DAJA 3R9OA 2OXXA 4MAOA 5E8YA 4TY1A 4L3PA 2H96A 3A7HA 4AGUA 1H00A 4FG9A 2R3KA 3Q32A 1UWJA 1YW2A 4BDGA 1JLUE 3TNWA 5ICPA 2JKQA 3KXHA 4M7IA 1AGWA 2ITWA 2CLQA 4F63A 3R1NA 1JKLA 3WIKA 3R8PA 2I0HA 5DH3A 3NW7A 4W4VA 4BB4A 1BLXA 2P2IA 2NP8A 2QOQA 3QQKA 2I1MA 3T9TA 5KKRC 4ZLOA 3D15A 5BMSA 2PZ5A 3G6HA 5EOBA 2J51A 2YABA 4BGHA 4O21A 3GT8A 2PWLA 3CXWA 4IWQA 3RP9A 4RQKA 3LM5A 4C8BA 4C3FA 1WAKA 4W8DA 2FO0A 3LXPA 5GZ8A 3RNYA 4Y46A 5FDXA 3G6GA 4EC8A 4OBQA 2JFLA 4BDEA 2R3NA 1XR1A 4O81A 2XVDA 4ZOGA 1W82A 5CZIA 4PDSA 2V0DA 1OGUA 2Y6MA 2J7TA 3BGZA 3VS7A 2BALA 3RBWA 2UW8A 4YJPA 4ALUA 4GG7A 4Z7HA 4O0TA 2DQ7X 5CEQA 4IX6A 4EOOA 3TZ9A 3VS5A 4FNZA 3D4QA 5TF9A 3TWJA 4FTQA 2UW3A 3IDCA 1MRVA 4K18A 5J5SA 4KUJA 4EYMA 4UZDA 5D7VA 1SNUA 3BYUA 1URWA 4EI4A 4AZTA 1W7HA 4JBPA 2ITTA 3O8TA 4HNIA 2XK3A 2OWBA 2OI4X 3GU7A 1YXUA 5CU3A 3R7IA 4DH5A 1UU3A 3UBDA 4J52A 2FB8A 4C4GA 3FZPA 2EU9A 4U43A 1XH8A 5HX8A 3PXQA 2QD9A 3V5PA 4W8EA 3ZONA 1Q24A 4F9BA 3TDWA 3Q2JA 5JRSA 2BZIB 4TWCA 4OTIA 2RGPA 3COMA 4J96A 4FKVA 1IA9A 5D9HA 1ZWSA 3PVGA 5JH6A 2WMQA 5A54A 5HD4A 3DBEA 3MS9A 2VRXA 4ZP5A 3OY1A 3TV4A 5I9ZA 2C6TA 3HRBA 1PXIA 3BHVA 3QD4A 4RLKA 4QTEA 3NNUA 1XBCA 5EI8A 3KXXA 1BI8A 5KZIA 3R9DA 1J7UA 2J5EA 2X4FA 4FI1A 4QT1A 5AV4A 3LFCA 4BWXA 2XNEA 1BUHA 4I24A 5B2KA 4IX3A 4S31A 2OIBA 3HRFA 4M0ZA 3E88A 2P33A 3D94A 1RQQA 3HNGA 4CV9A 3ZMMA 2Q83A 1O6KA 1H26A 2YA9A 4F7NA 3DXNA 3GGFA 2CKOA 4JOAA 2JDOA 2J5FA 5BVOA 2GS6A 3RWQA 4ZZNA 5D12A 2R9SA 4CLJA 1OL6A 2OG8A 4LL5A 3LMGA 3DGKA 2PVJA 4HNFA 5J9YA 4A07A 1MQBA 2YCQA 4HCUA 4J1RA 3RPOA 3FL4A 2QNJA 3DCVA 4PNIA 5LCKA 3WARA 5K4IA 1Q3DA 4XBRA 3KL8A 1ZYCA 2WFYA 4K33A 4PF4A 3VS4A 3B8RA 5FP5A 5DT4A 3GFWA 3LJ2A 4UWCA 3UC4A 3UQGA 3BZ3A 3DPKA 4ZS0A 4GW8A 3MV5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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