The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTHFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
The structures of deoxy human haemoglobin and the mutant Hb Tyralpha42His at 120 K.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Oxygen transport
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molecule keywords |
HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN)
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total genus |
58
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structure length |
141
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sequence length |
141
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chains with identical sequence |
C
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 1998-01-22 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00042 | Globin | Globin |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Z6N A; 3WFX A; 1XQ5 A; 4C44 A; 1QXD B; 5HBI A; 3VAU A; 4FC3 B; 3E5I A; 3ECL A; 1CG8 A; 2OIF A; 1YEQ B; 1RSE A; 4M4A A; 4MQK B; 1RQA A; 4L7Y A; 105M A; 1QXE A; 3GOU A; 4F68 A; 4HHB A; 2SPO A; 2ZT3 A; 1YGF A; 1A3O A; 1F5O A; 1A00 B; 1V4W A; 1N9X A; 2HBG A; 1Y7Z B; 1Y4Q B; 5EE4 C; 4HRR B; 3GQP A; 2BK9 A; 2ZLW B; 2GTL B; 2MGJ A; 2DXM B; 2GNW A; 2ZST A; 5IKS A; 4UUR A; 2ZLV A; 1J7W B; 1A6G A; 1AJ9 B; 1A0U A; 4X0L A; 3S66 B; 4MBN A; 1YHU D; 3A9M A; 2HCO A; 3DHR A; 2G0S A; 3ARJ A; 2W72 A; 1K1K B; 3G53 A; 5C6Y A; 2VYW A; 3OO5 B; 1V75 A; 1CH5 A; 3GKV A; 1MNO A; 1D8U A; 4TYX A; 1MYH A; 1N9H A; 4MQC B; 3CIU B; 3WTG B; 5JGG B; 1HBS A; 1Y0W A; 3MKB A; 1LA6 A; 4MAX A; 3MYM A; 1O1N B; 1NPG A; 1YGD A; 1HDA A; 5EOH A; 3H57 A; 2ZLX A; 3GDJ A; 4PQC A; 3NFE A; 1MTI A; 3SZK B; 4U8U B; 1HSY A; 1J7Y A; 2V1G A; 1TES A; 3S1J A; 1YEV A; 2V1F A; 3WI8 A; 3D4X A; 5E29 A; 2R4X A; 1S0H B; 3UBC A; 1Y0C B; 1YEU A; 1O1P A; 4FH6 A; 4M4B A; 1XY0 B; 5CN4 A; 2LH6 A; 106M A; 1SHR B; 1FCS A; 1YHE A; 3MBA A; 2ZFO C; 3ARK A; 1PBX B; 2AUQ A; 2D2M A; 1IRC A; 1Q1F A; 1HAB A; 1YHR B; 1XCH A; 2HHD A; 5JDO F; 4G1B A; 2YRS A; 1QPW B; 5KDQ A; 3HEO A; 2D2N A; 1MDN A; 2FRJ X; 1W92 A; 1SDK A; 1HBH B; 1PMB A; 3M39 A; 1GCW A; 3AT5 A; 2CMM A; 1BUW B; 1DLY A; 5B84 A; 4KN3 A; 1LFY A; 1CQ2 A; 2D2N D; 2VYZ A; 5E83 A; 3G46 A; 3OZV A; 1CP0 A; 2HBF B; 1NQP A; 1LH3 A; 3ODQ A; 1A6K A; 1MLM A; 2MBW A; 4NI0 B; 2O5O X; 1JEB B; 1MWB A; 2GLN A; 1Y4P A; 1VXD A; 1MLF A; 2PGH A; 3FH9 B; 1CIO A; 3TLD A; 4YU4 B; 1NEJ B; 1K0Y B; 1J7S B; 4G51 B; 1V4W B; 2ZSZ A; 1SPE A; 2G3H A; 1ECA A; 3H58 A; 4OF9 A; 3WCU C; 6HBW A; 2AA1 B; 2MYE A; 2PEG A; 5C6E B; 2GKN A; 4MU5 A; 1Y5K B; 1YHU B; 3B75 B; 1GLI B; 1YH9 A; 1MBI A; 3HEP A; 1MNJ A; 3ZJP A; 3BCQ A; 1HBB A; 4X0L B; 3QJE B; 1IT2 A; 1HBR A; 3WFW A; 1MLH A; 2H8F B; 1YMA A; 4H07 A; 4GZG A; 1MYI A; 1UFJ A; 1DKE A; 112M A; 1O1I B; 3RGK A; 1MLO A; 3QM7 A; 1YZI B; 5KKK A; 1MOB A; 1XXT A; 1ABW A; 3S65 A; 1UMO A; 1RQ4 A; 1V4U B; 2LH3 A; 2HBC B; 3KUN A; 1H1X A; 1VWT A; 3MJU B; 1CPW A; 1VXH A; 1J52 A; 1Y4V A; 1HHO B; 1UVX A; 1BZ1 B; 1HGC A; 3QMA A; 1HBA A; 1HDA B; 1Y0D A; 3AQ6 A; 1FN3 B; 2ZS1 A; 1T1N A; 1HCO A; 1HLB A; 1Y09 A; 1EW6 A; 1R1X B; 1UT0 A; 1CH2 A; 1Y8K A; 2LH1 A; 4F6B A; 1Y45 A; 5HY8 B; 1H97 A; 5SW7 A; 2O5Q X; 3RJN B; 3WCT A; 2H8D B; 1JZM A; 3DUT B; 3PI8 B; 1C7D B; 1YE2 A; 2GL3 A; 1DXV A; 2H35 A; 2EB9 A; 3ZJI A; 2QU0 A; 3UHR A; 3WCT D; 3LHB A; 3WFT A; 1YOH A; 1MBS A; 3QM8 A; 109M A; 1VXE A; 4MXK A; 1CO9 A; 1QXD A; 1G0B B; 1WMU B; 4FC3 A; 3WCV D; 3ECZ A; 3QJD B; 1CH4 A; 3MJP B; 2HHD B; 3K8B B; 1Y8W B; 3OZU A; 2D2N B; 1A00 A; 1Y7Z A; 1QSH B; 1NZ2 A; 5D1V A; 1Y4Q A; 3OO4 B; 4HRR A; 1LFY B; 1G09 B; 4H2L B; 1J3F A; 1NQP B; 3EU1 B; 3IA3 B; 1MTJ A; 1COH B; 2ZLW A; 3ODQ B; 1NZ3 A; 2GTL A; 1Y0A B; 1CG5 A; 1JPB A; 2V1H A; 2MGC A; 2MGM A; 1NAZ A; 3UHK A; 104M A; 1V07 A; 1YVT A; 1S5Y B; 1J7W A; 1MOA A; 3S66 A; 5HLU A; 1M9P B; 1FDH A; 3MYN A; 4G1V A; 4FH7 A; 4F6I A; 1HBG A; 3AT6 B; 5EV5 A; 1K1K A; 1JZL A; 3QJB B; 1B0B A; 1GBU B; 3OO5 A; 1Y7D B; 1U7S A; 1LFV B; 2ZS0 C; 4PQB A; 6HBW B; 1X9F D; 1F5P A; 1JP9 A; 1HRM A; 4MQC A; 3CIU A; 3WTG A; 5CNC A; 5JGG A; 3M3B A; 1O1N A; 2G0Z A; 2G10 A; 3IXF A; 2QMB A; 2BKM A; 1LUE A; 4BJA A; 1C7C B; 1MNH A; 2HBD A; 1Y4G A; 2V1I A; 2ZT4 A; 2OH8 A; 1DKE B; 2LH2 A; 4U8U A; 1MLN A; 2Z8A A; 1RPS B; 3G4Y A; 4FWY A; 3AQ5 A; 2Z6T A; 2D60 A; 1LTW A; 1S0H A; 1RQ4 B; 1Y0C A; 5CNE A; 3UHN A; 1XY0 A; 2GTL C; 5EYS A; 1Y5J B; 1KD2 B; 1VWT B; 4UZV A; 2NSS A; 5EET A; 2BW9 M; 2OHB A; 1PBX A; 3QM5 A; 3UHC A; 1HBA B; 1Y0D B; 2W6Y A; 1AJH A; 4ROM B; 4KMV A; 1X46 A; 1YHR A; 2VLY A; 1A3N B; 1XYE B; 2BNL A; 1BBB A; 3IC0 A; 5CNF A; 1YFF A; 3HC9 A; 3A59 B; 1A9W A; 1QPW A; 3KMF C; 3WCT B; 5E6E B; 1O1L A; 3QJC B; 1LFQ B; 3OK5 A; 1DXC A; 5JDO C; 2QFK A; 1HBH A; 1NS9 A; 1BUW A; 3ZJJ A; 3WCV B; 3M3A A; 1GCV B; 2HBF A; 5KER B; 3ORD A; 4PQ6 A; 1EWA A; 5CHQ A; 2DN3 B; 2GDM A; 4NI0 A; 2FRK X; 2W6X A; 3ZJL A; 3UHD A; 1JEB A; 1SPG B; 3K9Z A; 1OUU B; 1JP8 A; 1G9V A; 2V1K A; 1OR6 A; 3UHE A; 3VRE B; 3FH9 A; 4YU4 A; 1NEJ A; 1K0Y A; 2VEE A; 3E55 A; 2R50 A; 1MLQ A; 1SI4 B; 1J7S A; 4G51 A; 3AQ8 A; 1EMY A; 4NXC A; 1DXU B; 2O5T X; 5CN9 A; 1IRD A; 1HBI A; 1RVW B; 2AA1 A; 1OUT B; 1UX9 A; 3LR7 A; 2OHA A; 1CG5 B; 5EQM A; 5C6E A; 1FAW B; 1Y5K A; 4MQH B; 1BZR A; 1MZ0 A; 1YHU A; 3HRW B; 3B75 A; 1GLI A; 2MGF A; 1YVT B; 1U7R A; 1Y5F B; 4F4O B; 3A0G B; 3QJE A; 2H8F A; 1MWD A; 1GBV B; 2DN2 B; 1X9F B; 4ILZ A; 5HU6 B; 3W4U B; 2C0K A; 1O1I A; 3G4U A; 3QQQ A; 1J41 A; 5AB8 A; 1YZI A; 1JF4 A; 3MOU A; 1ABY B; 3SDH A; 1MBA A; 2ZFO D; 1NS6 B; 1V4U A; 2NRM A; 1EBC A; 2HBC A; 3QZZ A; 1YVQ B; 3MJU A; 3AG0 A; 2XKH A; 1HHO A; 1BZ1 A; 1GVH A; 1LFL B; 1NZ4 A; 3UHB A; 2QMB B; 1FN3 A; 2AUP A; 2RI4 B; 4NS2 A; 2EB8 A; 1YG5 B; 3NG6 B; 1O1M B; 2IN4 A; 3UHS A; 2HBD B; 1R1X A; 1GJN A; 1Y4G B; 1CH3 A; 3GYS B; 1Y46 B; 5HY8 A; 1BIN A; 3OZW A; 1LJW B; 2ZSX A; 4DWU A; 2H8D A; 3DUT A; 3PI8 A; 1C7D A; 3GK9 A; 1DWR A; 2MHB B; 3A5G A; 2QLS B; 2D60 B; 1G08 B; 3DHT B; 110M A; 5CMV A; 3GQR A; 1Y22 B; 3HEN A; 3NMM B; 4N7P B; 4WJG A; 2VLZ A; 1A4F B; 3NML A; 1G0B A; 1WMU A; 1G0A A; 2AV3 A; 1MYF A; 3MVC A; 1A01 B; 1HAC B; 3QJD A; 1YCA A; 3MJP A; 2MGL A; 1BBB B; 3IC0 B; 1YFF B; 3K8B A; 5EU2 A; 1VXF A; 3UHV A; 1Y8W A; 4NK2 A; 2WY4 A; 3WCU D; 6HBI A; 2W72 C; 3D1A B; 3UHW A; 1O1L B; 1IT3 A; 5HLX A; 3EDA A; 1LH2 A; 1QSH A; 1NS9 B; 2M6Z B; 3OO4 A; 5CN6 A; 1BZZ B; 2RAO B; 4HRT B; 1G09 A; 3PI3 A; 1Y85 B; 4F6J A; 4H2L A; 3EU1 A; 1COH A; 3PT7 A; 1CP5 A; 1XZ7 B; 2D5Z B; 1Y0A A; 3TM3 A; 3PI9 B; 1OJ6 A; 5AZQ A; 1BZ0 B; 4O35 A; 1DUO A; 3UHT A; 1G9V B; 1S5Y A; 1Y4B B; 3ARL A; 4NZI A; 1MLR A; 4N7O B; 2HZ3 A; 1OFK A; 1M9P A; 3AT6 A; 3EOK B; 2OH9 A; 1QSI B; 3QJB A; 1GBU A; 3UGZ A; 1DO7 A; 1Y7D A; 1LFV A; 2ZLU B; 1IRD B; 3NL7 B; 5ILR A; 1WVP A; 2VLX A; 3UBV A; 3HHB A; 3WCW A; 1MKO B; 2D2M C; 1MBD A; 3RJ6 A; 2GRZ A; 1UIW A; 1HJT A; 4IT8 A; 3QM9 A; 4FWX A; 1HGB B; 1FSL A; 1J3Y B; 3WFU A; 1YEN B; 1CO8 A; 3WCW D; 1C7C A; 3D17 A; 3WR1 B; 1MYT A; 3UHI A; 1J40 B; 2D2N C; 1A0Z B; 4HSX A; 2ZFO B; 4MQJ B; 1GDJ A; 4FWZ A; 1J41 B; 3D7O B; 1RPS A; 1VRE A; 1YE0 B; 3ZOM A; 4UIQ A; 1XZV B; 3ZHW A; 1YOI A; 1Y35 B; 1Y5J A; 1GZX B; 1KD2 A; 4TWV A; 2GRH A; 3LB1 A; 2R4W A; 5CN5 A; 1Y7C B; 1MYM A; 1HGA B; 2ZT2 A; 2EVK A; 4ROM A; 1S5X A; 3FS4 B; 1A3N A; 1XYE A; 1Y4F B; 2ZSN A; 3VRG B; 2FRF A; 1EBT A; 5JDO E; 2HBS B; 3A59 A; 5E6E A; 1KR7 A; 3QJC A; 2D6C A; 4N7N B; 1LFQ A; 4O4T A; 3PI1 A; 4NXA A; 1MLL A; 3S1I A; 1FHJ B; 3CY5 B; 3WCV A; 3GQR B; 3UH6 A; 1GCV A; 5KER A; 1IDR A; 5ILM A; 1LFT B; 3UH5 A; 2DN3 A; 4QAU A; 1G0A B; 5CN7 A; 5MBN A; 1SPG A; 1OUU A; 3WCU B; 2MGD A; 3VRE A; 1DO3 A; 4HSW A; 4JYQ A; 3HXN B; 2ZS0 D; 3BJ1 B; 1SI4 A; 1V9Q A; 2G0R A; 1DXU A; 1MNI A; 5F0B A; 3ZJN A; 1Y8H B; 2B7H B; 3G4R A; 2W6W A; 1RVW A; 2QRW A; 1OUT A; 4AVD A; 3PT7 B; 1F63 A; 1LHS A; 1DTM A; 1FAW A; 4YU3 B; 4MQH A; 2BMM A; 3HRW A; 2MGE A; 1ITH A; 2OLP A; 2ZS1 C; 3U3E A; 1MBC A; 4HBI A; 1MBN A; 1Y5F A; 1NWN A; 1OBM A; 4F4O A; 3A0G A; 1YEO B; 3ED9 A; 1RTE A; 2W31 A; 3LB2 A; 1VXB A; 1GBV A; 4ODC A; 1Y8I B; 3WCT C; 2DN2 A; 1X9F A; 2MYD A; 5ILP A; 1B86 B; 5HU6 A; 1CBM A; 3W4U A; 2LH7 A; 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2GRF A; 3HF4 B; 1JW8 A; 2ZSR A; 3A5A A; 1O1K B; 5JOM A; 1Y4B A; 1JWN A; 1HV4 B; 4N7O A; 1YIE A; 4VHB A; 4O4Z A; 2DC3 A; 4MXL A; 3QZX A; 1L2K A; 4U8U C; 2XKI A; 2HHE B; 3EOK A; 1CH7 A; 1YDZ B; 1QSI A; 1FLP A; 2VM0 A; 2E2Y A; 1LH1 A; 2ZLU A; 2NSR A; 3G52 A; 3NL7 A; 2LH5 A; 2BWH A; 1ECD A; 2O5B X; 3BJ2 B; 1YMB A; 4F6F A; 2HZ2 A; 2G0V A; 2LHB A; 3WHM B; 1MKO A; 5CHR A; 1Y83 B; 3OGB A; 1Y7G A; 1ECO A; 5F2A A; 1UVY A; 2SPL A; 2AUO A; 1HGB A; 2MB5 A; 1J3Y A; 1YEN A; 1LH5 A; 2MGA A; 3VRF A; 103M A; 3WR1 A; 2BLH A; 4ODC B; 1J40 A; 3R0G A; 3BOM B; 1C40 B; 5D5R A; 1A0Z A; 1VXG A; 2ZFO A; 3IC2 B; 4MQJ A; 2MYC A; 4B4Y A; 3D7O A; 1YE0 A; 1MTK A; 1JF3 A; 1M6M A; 4TWU A; 3PIA B; 1XZV A; 2AV0 A; 4MQI B; 1NXF A; 1Y35 A; 1M6C A; 1A6M A; 1GZX A; 1JZK A; 1NIH B; 4NK1 A; 3LQD B; 1JL6 A; 1C7B A; 1Y7C A; 1HGA A; 3E4N A; 1MCY A; 1DTI A; 3FS4 A; 1Y4F A; 1QI8 B; 1RTX A; 1MYJ A; 1LFZ B; 1XZ2 B; 3VRG A; 2ZT0 A; 4C0N A; 2HBS A; 3OJ1 A; 1XZU B; 1IWH B; 1OFJ A; 1BZ6 A; 3R5I B; 1SDL B; 3HYU B; 1SWM A; 2VRY A; 1GDK A; 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