The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Direct observation of ultrafast collective motions in CO myoglobin upon ligand dissociation.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
61
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-07-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1A9W A; 2QSP B; 2ZSY A; 5JDO E; 2GTL A; 1C7D A; 3WCU C; 3NL7 B; 1BZ1 B; 1BBB B; 1CH7 A; 4N7O B; 4WJG A; 3WTG A; 1HRM A; 1CO9 A; 3PIA B; 1QI8 A; 1XZ5 B; 1R1X A; 2H8D B; 3MYM A; 1AJ9 A; 2OH9 A; 2MBW A; 5CHQ A; 2QSP A; 1GDK A; 1JW8 A; 1YMA A; 4DC7 A; 3EDB A; 3NL7 A; 1BZ1 A; 1BBB A; 1QXE B; 2WY4 A; 1NGK A; 1OFK A; 2ZLT B; 1O1L B; 4FWX A; 3PIA A; 2ZWJ A; 1XZ5 A; 1X46 A; 3MOU A; 2ZLW B; 2H8D A; 3ONZ B; 1MYJ A; 3A2G A; 2QFK A; 1GBU B; 3QJD A; 4HSW A; 3ORD A; 1JWN A; 1F63 A; 5M3S A; 2BLJ M; 2W6Y A; 1IRC A; 1Y7Z A; 2GTL D; 2YRS B; 1CBM A; 4MAX A; 4NXA A; 1VXF A; 1YHU C; 3UH5 A; 1A6G A; 1QXE A; 2O5M X; 1K0Y B; 1SPG B; 5F2A A; 1M6M A; 4MQK B; 1O1L A; 1MLK A; 1FSX A; 2ZST A; 1QXD B; 3LB4 A; 2QLS B; 2ZLW A; 1YCB A; 3ONZ A; 1GBU A; 3LB3 A; 1Y85 B; 4B4Y A; 1GJN A; 3A9M A; 2YRS A; 1UFP A; 2ZFB B; 3K8B B; 1XZ7 B; 1YHR B; 1MLJ A; 3U3E A; 1JZL A; 1A6K A; 1K0Y A; 1SPG A; 2HBE A; 2RAO B; 2E2Y A; 5HAV A; 1HGC B; 1MOA A; 2QLS A; 2Z6T A; 1MLL A; 1HHO B; 2SPL A; 1DLY A; 1BAB B; 4NZI A; 4HHB B; 1MCY A; 1MBC A; 2ZFB A; 1XYE B; 3QM5 A; 2W31 A; 1AJH A; 3K8B A; 1XZ7 A; 1YHR A; 2DN2 B; 1YE2 B; 2VLY A; 2HBC A; 1BZ6 A; 1JZK A; 3GDJ B; 5D5R A; 1A3O A; 5KDQ B; 1HGC A; 1HGA B; 2HHB B; 3V2V A; 3MKB B; 2R4Z A; 1HHO A; 2D6C A; 2Z85 A; 1BAB A; 2CMM A; 4HHB A; 1HBI A; 2AUR A; 1XYE A; 1BVD A; 1MTK A; 3O7N A; 2DHB B; 1MYI A; 4UIQ A; 1Y8H A; 3G52 A; 1BUW B; 1HGA A; 3MKB A; 105M A; 4DC8 A; 3HRW B; 1THB B; 1Y5J B; 1RTX A; 4FH6 A; 4PQ6 A; 1EBT A; 3A0G B; 1YGD B; 5HLQ A; 1GCV B; 2GNW A; 1DXV B; 5JOM A; 2DHB A; 4NXC A; 2LH2 A; 1V5H A; 2NRL A; 1MLU A; 1ECA A; 2LH7 A; 4G1B A; 3D17 B; 4FC3 B; 1Y0D B; 3HRW A; 2D2N B; 2JHO A; 3QM6 A; 1A6M A; 3ZJS A; 1THB A; 1ECN A; 5JDO D; 5ILP A; 2MYC A; 1MYH A; 1HJT A; 1YGD A; 2AUP A; 2OHB A; 1GCV A; 1DXV A; 1N9H A; 3D1A B; 1JF3 A; 1M9P A; 108M A; 1LFZ B; 3MJP B; 2ZLX B; 1ECD A; 3ZJP A; 3D17 A; 3BJ3 B; 1Y0D A; 4HRT B; 1Y22 B; 2GDM A; 1Y01 B; 2OHA A; 3GKT A; 1O1P B; 5JGG B; 1Y0C B; 1RQ4 B; 1RQ3 A; 1V75 A; 2VLX A; 1Y7C B; 2EKU A; 1MZ0 A; 1LFZ A; 1HAB B; 2ZLX A; 1JDO A; 1YOG A; 3HF4 B; 4HRT A; 2NSR A; 4F6J A; 1LH6 A; 5JGG A; 1A3N B; 1SWM A; 4VHB A; 1Y0C A; 1R1Y B; 1G08 A; 110M A; 3E5I A; 3HEO A; 1YFF B; 5EUI A; 1Y7C A; 1HBS B; 1IT2 A; 1Y83 B; 4XS0 B; 3IXF A; 4N7P B; 1X3K A; 5E6E A; 5ILR A; 1JY7 B; 1X9F B; 1DXD A; 1Y4P B; 3E5O A; 2D2N D; 1CP0 A; 2ZS0 C; 3ZH0 A; 1MLN A; 3UHW A; 1XCH A; 3W4U B; 1A3N A; 1VWT B; 1R1Y A; 4NI1 A; 3CY5 B; 1FDH G; 5CNE A; 1YFF A; 1NPF A; 1BIJ B; 1HBS A; 3A5A A; 1FHJ B; 5CN9 A; 1Y83 A; 1XY0 A; 4XS0 A; 3A59 A; 4N7P A; 1MLH A; 3GOU B; 3QM8 A; 1X9F A; 2NRM A; 2EVK A; 4YU3 A; 3UHC A; 1YHU D; 4UZV A; 4G1V A; 4TYX A; 2HBS B; 3W4U A; 2VHB A; 2VYZ A; 1LJW B; 1VWT A; 1NPG A; 3RGK A; 1JZM A; 1BIJ A; 3LR7 A; 1NZ5 A; 4X0L A; 2V1J A; 3GOU A; 1J40 B; 1MLS A; 2V1K A; 1VRF A; 1GLI B; 1FAW B; 1ABW B; 2AUQ A; 2GRF A; 3R5I B; 2RI4 B; 4HBI A; 5CNB A; 3BJ1 B; 1SPE A; 3KUO A; 1YMC A; 3LQD B; 1NWI A; 4H07 A; 3WCT A; 3ZJN A; 3SZK B; 1X9F D; 1J40 A; 2ZT1 A; 3ZJJ A; 1XZ4 B; 4MQC B; 1GLI A; 1FAW A; 3UBC A; 2G0V A; 2MGF A; 3R5I A; 2RI4 A; 3UHT A; 4AVD A; 5KKK A; 3BJ1 A; 1JP9 A; 1Y0A B; 1Y35 B; 1GBV B; 3PI2 A; 1LHS A; 1XXT B; 2LHB A; 2ZLV B; 1EBC A; 1V4U A; 1NWN A; 1I3E A; 3OO4 B; 1GDJ A; 2D5X A; 3SZK A; 3OGB A; 2IN4 A; 2G14 A; 1XZ4 A; 5F0B A; 4F6B A; 2Z6N B; 1YOH A; 3IC0 B; 1Y8I A; 1F65 A; 4M4B B; 1W92 A; 1DWT A; 4IRO B; 1Y0A A; 2OH8 A; 1Y35 A; 1GBV A; 1XXT A; 2ZLV A; 3OO4 A; 5B84 A; 1GZX A; 1V9Q A; 3EOK B; 1HV4 B; 3QJE B; 1FDH A; 2Z6N A; 1HGB B; 3IC0 A; 1CQX A; 4M4B A; 1RQA B; 1NZ4 A; 4IRO A; 1J7S B; 1K1K B; 2R4X A; 3UHB A; 3R0G A; 1YHE B; 1MWD A; 3S1J A; 3EOK A; 1NS9 B; 3ZOM A; 3QJE A; 4O35 A; 1Y4G A; 4MXK A; 1HGB A; 2MYA A; 2GL3 A; 5ILM A; 1V07 A; 2VM0 A; 1WMU A; 1J7S A; 1K1K A; 1HSY A; 1Y0W A; 3HEP A; 1QSI B; 4SDH A; 1B86 A; 2R1H A; 4MBA A; 2XKG A; 2G0X A; 1YHE A; 4PNJ A; 1HDA B; 1NS9 A; 3MVC A; 3H58 A; 2HHD B; 1JL6 A; 5CN5 A; 1YMB A; 3UHX A; 1QSI A; 1BIN A; 1URY A; 2R4W A; 1G9V B; 1NEJ A; 1Y31 B; 1NZ2 A; 3UH3 A; 4WJG 1; 2H35 B; 5EYJ A; 1JL7 A; 2HHD A; 1HBH B; 1EW6 A; 1VXB A; 3AQ9 A; 1Y4R A; 3HEN A; 1YVQ B; 1OR6 A; 3MN0 A; 2W6V A; 3LR9 A; 1UC3 A; 1I3D A; 1DTI A; 1G9V A; 5CN6 A; 2D2M C; 2H35 A; 1O1M B; 3HXN A; 3NG6 A; 1HBH A; 4M4A B; 3UHH A; 1EMY A; 2Z8A A; 1LH2 A; 4U8U B; 1YVQ A; 3QQR A; 1MBA A; 2G0R A; 2ZS1 B; 1O1M A; 4N8T B; 1QPW B; 3OZW A; 1MLF A; 3WCW B; 4N7O A; 3ECL A; 1S5Y B; 5CN8 A; 3HC9 A; 2ZSS A; 3UHG A; 2FAM A; 1MYT A; 4U8U A; 1J3Z B; 1MOD A; 1DUK A; 1HBR B; 3FS4 B; 5JDO F; 111M A; 2FRK X; 5EET A; 1CBL A; 2QSS B; 5EU2 A; 3MBA A; 1S61 A; 2AUO A; 2QMB B; 4N8T A; 5HLX A; 1UIW B; 3WCW A; 3OZV A; 1S5Y A; 4MQJ B; 2ZLT A; 3SDN A; 2O5S X; 1J3Z A; 5CMV A; 1HBR A; 3FS4 A; 3QMA A; 3LB1 A; 3PI8 B; 1CQ2 A; 1Y8W B; 1MLR A; 3G4W A; 1MKO B; 1MOC A; 4MQH B; 3S66 B; 1KD2 B; 1SDK B; 2ZT0 A; 1Y2Z B; 2QSS A; 2ZT4 A; 3E55 A; 3KMF C; 3ARL A; 2HZ3 A; 2O58 X; 2W72 B; 3WFU A; 5ILE A; 4MQJ A; 3P5Q B; 4MQK A; 3WFT A; 1V4W B; 4U8U D; 5CN7 A; 1QXD A; 1MOB A; 2O5O X; 3PI8 A; 1Y85 A; 1Y8W A; 3S66 A; 1KD2 A; 3PT7 B; 1SDK A; 2ZS1 D; 1NS6 B; 3GQR B; 1YOI A; 2W72 A; 4OF9 A; 3WCW D; 3OZU A; 4ILZ A; 1A0U B; 4YU4 B; 1F5P A; 3PI1 A; 3P5Q A; 2RAO A; 1V4W A; 1WLA A; 3ODQ B; 1DXC A; 3WCP B; 2WTG A; 1VXE A; 2MGL A; 4O4Z A; 3PT7 A; 4O2G A; 1ABS A; 1UMO A; 1XZU B; 3UHV A; 1MBS A; 2DN2 A; 1NS6 A; 103M A; 3GQR A; 1YE2 A; 1V4X B; 1YVT B; 4YU4 A; 1CH9 A; 1YEN B; 2MYB A; 3GDJ A; 5KDQ A; 1YH9 B; 2HHB A; 1MYM A; 2H8F B; 3M3A A; 3WCP A; 3WCU B; 3ZJQ A; 2V1E A; 1J3F A; 1XZU A; 2O5Q X; 1BZZ B; 3WR1 B; 2BNL A; 1C7B B; 1FN3 B; 1V4X A; 1U7R A; 4LPI A; 1MLG A; 3WCT C; 107M A; 1YH9 A; 3K9Z A; 1BUW A; 1A00 B; 2H8F A; 3DHT B; 1KFR A; 1L2K A; 2MGH A; 2VEB A; 3UBV A; 3WCU A; 1S0H B; 1H1X A; 1O1O B; 1Y5J A; 3WR1 A; 4QAU A; 3A0G A; 1C7B A; 2EF2 A; 5EOH A; 3MYN A; 3KUN A; 1CG8 B; 3WHM B; 2XKH A; 3D7O B; 5C6E B; 1LA6 B; 1HBG A; 1CO8 A; 4F4O B; 2SPN A; 4FC3 A; 3DHT A; 4H2L B; 1GDL A; 2D2N A; 1YHU B; 1LHT A; 4ZVA A; 1G0A B; 1MTI A; 5CN4 A; 2BLI A; 3WCV C; 1CG8 A; 3D1A A; 3WHM A; 3D7O A; 2HCO B; 5MBA A; 5C6E A; 2ZFO C; 1LA6 A; 3UHI A; 3MJP A; 1Y4Q B; 4F4O A; 3BJ3 A; 3WCU D; 4H2L A; 1Y22 A; 2G10 A; 1YHU A; 1O1P A; 2DN3 B; 4FWY A; 4ROM B; 2AV0 A; 1N9F A; 1C7C B; 1URV A; 3ECZ A; 1FCS A; 1YEV B; 1RQ4 A; 2C0K A; 2MGE A; 1G0A A; 2GRZ A; 1Y0T B; 3PT8 B; 1GDI A; 3AT6 B; 1ECO A; 1Y46 B; 4L2M A; 5AZR A; 1ASH A; 2HCO A; 1UT0 A; 2M6Z B; 1HAB A; 2OIF A; 1Y4Q A; 2GRH A; 3HF4 A; 2W6W A; 4N7N B; 1NXF A; 3RJ6 A; 1LH5 A; 1MWB A; 2GKM A; 2HBD B; 4ROM A; 2BLH A; 3VAU A; 5EQM A; 2QRW A; 1YEV A; 2ZLU B; 3OJ1 A; 1Y0T A; 2ZSQ A; 1UVX A; 3GK9 A; 4TWV A; 3AT6 A; 1COH B; 1Y46 A; 1MDN A; 1T1N B; 1IBE B; 2M6Z A; 2MGA A; 4MQI B; 5D1V A; 1JY7 A; 1MBO A; 1Y4P A; 2PGH B; 4N7N A; 2BK9 A; 1A6N A; 2GKN A; 3UGZ A; 4C0N A; 1D8U A; 3S48 C; 2HBD A; 3GQP B; 3AG0 A; 5EE4 C; 2G12 A; 3PEL B; 3UHR A; 4MPM A; 1A0Z B; 3CY5 A; 1YE0 B; 1CH2 A; 4NI0 B; 3UHZ A; 1T1N A; 1FHJ A; 1IBE A; 4MQI A; 4KMV A; 2HBS A; 2WTH A; 3GQP A; 1IWH B; 1LJW A; 1DXT B; 1A0Z A; 3M38 A; 1Y7D B; 2ZSN A; 3GQG B; 3UH7 A; 4TWU A; 1YE0 A; 2EB8 A; 2BMM A; 1Y5F B; 3G4Y A; 2NX0 A; 1DO4 A; 2GTL C; 3VRG B; 3O89 A; 1ABW A; 1DUO A; 3AQ5 A; 1IWH A; 1DXT A; 3S65 B; 5CHR A; 1BVC A; 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4HRR B; 2BWH A; 3BOM B; 3UH6 A; 1IRD A; 1VRE A; 3GYS B; 1YGF B; 5HY8 B; 2VLZ A; 2ZS0 D; 1YZI B; 3RJN B; 1MNH A; 3CIU A; 1U7S A; 2AA1 B; 1Y31 A; 1LFT B; 4OOD A; 1S5X A; 3OO5 A; 1XQ5 A; 4MQG B; 3WTG B; 1RSE A; 1VXD A; 1HBB A; 4G51 B; 4HRR A; 1PBX B; 2DXM B; 1AJ9 B; 3LB2 A; 2D60 B; 1DO1 A; 3BOM A; 1MBN A; 3GYS A; 1YGF A; 5HY8 A; 1YZI A; 2AA1 A; 3UHK A; 3HYU B; 2HHE B; 1LFT A; 5EE4 D; 4MQG A; 4PQB A; 1MBI A; 1YCA A; 1UX8 A; 2O5B X; 1Y7G B; 1MNI A; 1OR4 A; 4G51 A; 2LH5 A; 4M4A A; 1PBX A; 1S56 A; 2DXM A; 5E29 B; 3QJD B; 2D60 A; 3QQQ A; 3M3B A; 1Y7Z B; 3PI9 B; 1LH3 A; 4F68 A; 1DO7 A; 1BJE A; 3ASE A; 2D2N C; 3VRF B; 3V2Z A; 3HYU A; 2HHE A; 3ZJM A; 1CP5 A; 2ZS1 A; 1KR7 A; 1JP6 A; 1QPW A; 1FSX B; 1Y7G A; 1OJ6 A; 4F6I A; 1JF4 A; 3D1K B; 5E29 A; 4O4T A; 5B85 A; 3G4R A; 3PI9 A; 3G4Q A; 4JYQ A; 3VRF A; 2HBE B; 3ZJO A; 2QMB A; 1LUE A; 1UIW A; 1N9X A; 4O1T A; 1HLB A; 1JPB A; 3D1K A; 2FAL A; 2MYD A; 2KSC A; 1BZ0 B; 1MKO A; 4MQH A; 3QJB B; 2V1I A; 1Y2Z A; 2HBC B; 5AZQ A; 1CPW A; 1HDS B; 1A3O B; 1TU9 A; 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