The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
144
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structure length |
144
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Chain Sequence |
HLTAEEKSLVSGLWAKVNVDEVGGEALGRLLIVYPWTQRFFDSFGDLSTPDSVMSNAKVKAHGKKVLNSFSDGLKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPQVQAAYQKVVAGVANALAHKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structure and biophysical characterization of the Cerdocyon thous, a Canidae from Brazil.
rcsb |
| total genus |
54
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| structure length |
144
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| sequence length |
144
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-10-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BBB B; 1NPF A; 1HAB A; 1AJH A; 4FC3 A; 2VLX A; 4HSX A; 1A6K A; 1G08 B; 1Y45 A; 2ZSR A; 3QJD A; 3AQ8 A; 3PEL A; 4MBA A; 1G0B A; 1NQP B; 4YU4 B; 4H07 A; 1Y0D A; 2V1H A; 1GCW B; 1MLK A; 3GQR B; 2VRY A; 1Y2Z B; 1A6M A; 3HYU B; 5KDQ A; 3UHY A; 1XZV A; 3H57 A; 3PI2 A; 2V1J A; 2MGF A; 3D4X A; 3WTG A; 5MBA A; 2V1F A; 1YZI B; 2YRS B; 1BJE A; 5E6E B; 1Y8I A; 2ZS0 B; 5D5R A; 3FS4 B; 1HV4 A; 4MQH A; 1IBE A; 5HLX A; 1A9W E; 1C7D B; 1M6M A; 2ZFO C; 2KSC A; 2ZFB B; 4B4Y A; 3DR9 A; 1C7B A; 2W6V B; 5CN4 A; 3ODQ B; 3SZK A; 2ZLV B; 1V4X B; 3TM3 A; 4O1T A; 2EF2 A; 1Y7Z A; 1O1L A; 1MOD A; 1YHE B; 1YEN A; 2QRW A; 4IRO B; 1Y85 A; 1BZ1 A; 1ABW A; 1Y7D A; 3PI4 A; 1X9F D; 3VRG B; 1YVQ B; 1X9F A; 3TM9 A; 1YFF A; 1YGF B; 1BAB B; 1COH A; 2ZT2 A; 5EYS A; 3O7N A; 5JDO F; 2OIF A; 3EOK A; 1I3E A; 1GDL A; 1DTI A; 2Z8A A; 1XZU B; 1CP0 A; 3A5B A; 3G52 A; 1QPW B; 3HEN A; 1MOH A; 1O1P A; 2HHB B; 3D1K A; 2WTH A; 2VLZ A; 1S5Y A; 1J3Y A; 2OHA A; 1GZX A; 1MWC A; 2O5M X; 1CH3 A; 4KMW A; 3GQP A; 4MPM A; 3DHR A; 3BJ1 A; 2H35 B; 1NIH B; 1Y7G B; 1N9F A; 2Z85 A; 2H8D A; 1R1X B; 1MKO A; 2MGM A; 1YHU B; 2W72 B; 2HBE A; 3HF4 B; 3UI0 A; 3ZJQ A; 1CG5 A; 3MN0 A; 1PBX B; 1YHR A; 4NI1 B; 1MLF A; 3CY5 A; 1YGD A; 2QFK A; 3EDA A; 2HCO B; 2SPO A; 3BJ3 B; 3G46 A; 1HRM A; 3ZJL A; 4U8U B; 1SI4 B; 1MCY A; 5CN6 A; 4ODC A; 1HBG A; 3NMM A; 1S0H B; 4AVE A; 4F6F A; 1KD2 A; 5B85 A; 1NXF A; 4N7P A; 1AJG A; 3OK5 A; 4OF9 A; 1M6C A; 2QSP A; 3GDJ B; 1FN3 A; 3UHV A; 5HAV A; 1V4W B; 1RVW B; 2BKM A; 2ZSS A; 1YEV A; 3WFT A; 1NWN A; 4WJG A; 4MU5 A; 4F4O B; 2G0R A; 1Y4Q B; 3S66 A; 1YEQ B; 1DKE A; 4MAX A; 1Y01 B; 1C40 A; 3VRF B; 1LFZ B; 2ZLU A; 1XZ4 B; 1M9P A; 1YVT A; 2ZFO A; 1ASH A; 3IC0 B; 1Y46 B; 3OO4 A; 3AT6 B; 3D17 A; 4F69 A; 1A0U B; 1HBR A; 1EWA A; 4YU3 A; 1L2K A; 2W6X A; 1JY7 B; 1ECD A; 3UHE A; 1WMU A; 1RTX A; 4KN3 A; 3A59 B; 1DLY A; 2HBC B; 2BW9 M; 1BZ0 A; 5ILE A; 1MYT A; 2ZLX A; 4WJG 1; 1BIN A; 3DUT B; 101M A; 3GKV B; 2HHE A; 1BZP A; 4NS2 A; 1S56 A; 1Y4P B; 3BCQ A; 1OR6 A; 1XZ7 A; 3ZJM A; 2ZSP A; 1LFV B; 2B7H B; 1Y4V A; 3UHC A; 5CNF A; 3D7O B; 1OR4 A; 3NFE A; 2O5O X; 1J52 A; 2DN3 B; 1QXE A; 3IA3 B; 3ONZ B; 4N7O A; 1SPG A; 4AVD A; 1HDS A; 3ZH0 A; 2IN4 A; 4DC8 A; 1BIJ B; 2QSS A; 2AUO A; 1ABY A; 2H8F B; 3ASE A; 1DWT A; 5AZR A; 1A3N B; 4FWX A; 1DTM A; 1YMB A; 2MYC A; 1SHR B; 4G51 B; 3ZOM A; 1SDL A; 1J3Z B; 2ZST A; 4MQG B; 1Y31 B; 3WCV C; 4N8T B; 1RPS B; 3KMF C; 2D5X A; 110M A; 2EKU A; 1YDZ A; 1MNK A; 1BUW B; 4PQB A; 4HHB B; 3H58 A; 1Y7C B; 1I3D A; 1NAZ A; 2DHB B; 3UHW A; 4NXC A; 2BLI A; 2ZLT B; 2W6Y A; 1LTW A; 1OUT B; 3GOU A; 1UMO A; 4H2L A; 2HBD A; 3ZJO A; 4MQK B; 2EVK A; 1MNI A; 3B75 B; 4TWV A; 3VRE A; 1J7W A; 4MBN A; 1HBH B; 5HLQ A; 1YCB A; 2G0X A; 1QXD A; 3OGB A; 3AQ6 A; 3QJE B; 1Y22 A; 1YIE B; 1Y09 A; 1O1O A; 1A0Z A; 5CN5 A; 1UX9 A; 5CN7 A; 1LH3 A; 4UUR A; 1S5X B; 3K3U A; 1MYG A; 1YHU C; 3ECX A; 1MOC A; 4IT8 A; 4M4B A; 1QI8 A; 2MGH A; 3QJB A; 1O1K B; 3G4U A; 1HGC B; 5HU6 B; 3MYN A; 4HRR A; 1DXT A; 3A5G A; 1Y83 B; 3S48 C; 2EKT A; 1IWH A; 4N7N A; 2D2N B; 4FH7 A; 1CLS B; 1BBB A; 1Y0W B; 2MYE A; 4XS0 A; 2Z6S A; 2DN1 A; 5SW7 A; 1AJ9 A; 1G09 B; 4ROL A; 5EU2 A; 4O4Z A; 1G08 A; 1EMY A; 2AUP A; 1A6N A; 4ROM B; 5EUI A; 1DXU B; 1XQ5 B; 3M39 A; 1NQP A; 1MWD A; 1X9F C; 1SDK B; 1GCW A; 3GQR A; 2DN2 B; 1IRD A; 104M A; 3WCT B; 3IC2 B; 2MHB B; 1VXA A; 4NXA A; 3CIU B; 2GRH A; 1IT3 A; 1F63 A; 2ZT1 A; 2PGH B; 1OBM A; 2ZS0 D; 3QQQ A; 1RQ3 B; 1CH4 A; 1MWB A; 3RJ6 A; 1YMA A; 1YZI A; 2YRS A; 1LA6 A; 1DXD A; 3BA2 A; 5E6E A; 2G3H A; 1Y4G B; 2O5L X; 1URV A; 1VXH A; 1FLP A; 2M6Z B; 2XYK A; 3FS4 A; 1DM1 A; 4MXK A; 2D2M B; 2D5Z B; 4MQI B; 3EDB A; 1Y4F B; 2ZFB A; 3K8B A; 2W6V A; 4JAC A; 1O1M B; 3ODQ A; 3E5I A; 1V4X A; 1HHO B; 2HZ2 A; 1CO9 A; 2MYB A; 1GVH A; 1LJW B; 2XKG A; 1CMY B; 5KKK A; 1YHE A; 4QAU A; 2BWH A; 4IRO A; 5EV5 A; 1DUO A; 4M4A B; 1HBS A; 1G0A A; 3MKB B; 1ABS A; 3VRG A; 5JDO E; 1WLA A; 1MTK A; 3SDH A; 1LFQ B; 3M38 A; 1R1Y B; 1K1K B; 4BJA A; 2VM0 A; 3LHB A; 1V5H A; 4ESA A; 1BAB A; 1MNH A; 3WCV A; 2GRF A; 3KMF A; 3OO5 A; 103M A; 2DXM B; 1NS6 B; 1YCA A; 1BZZ A; 5E29 B; 3G4Q A; 1UIW B; 3WHM B; 1QPW A; 4VHB A; 1XZ5 B; 1YEU B; 1GLI A; 1Q1F A; 1GBU B; 1MLQ A; 109M A; 1FSX B; 5HY8 B; 1OUU B; 4UZV A; 1Y5J B; 1MYJ A; 2FRK X; 1YOH A; 1Y7G A; 1Y8K B; 1YHU D; 1R1X A; 2BMM A; 2FRJ X; 1J40 A; 1T1N B; 3PT7 B; 1YHU A; 2GTL B; 2W72 A; 4ILZ A; 3S65 B; 1JP9 A; 2R1H A; 5CHR A; 3HF4 A; 3UHQ A; 1LFL B; 3G4V A; 2RAO A; 1PBX A; 1LH6 A; 1XYE B; 1A00 B; 1MBC A; 1V9Q A; 3WCW B; 3LQD A; 2GKN A; 3QM7 A; 2HCO A; 1J7Y B; 4U8U D; 4L7Y B; 4XDI A; 1N9I A; 2ZS1 B; 4UIQ A; 2BNL A; 3E5O A; 1SWM A; 2V1E A; 1Y8W B; 4U8U A; 1CH7 A; 3AQ9 A; 2GLN A; 4O2G A; 111M A; 1S0H A; 3HRW B; 1MTI A; 3NG6 B; 1Y5K A; 1XCH A; 3OZV A; 5MBN A; 1GJN A; 2R4W A; 1MNJ A; 1CH1 A; 2NRL A; 3PI3 A; 1MYI A; 1MLN A; 3QM5 A; 3DHT A; 2ZT4 A; 3S1I A; 3GDJ A; 3QM8 A; 2HBF B; 1YIH B; 5AZQ A; 3AQ7 A; 3OVU C; 3GYS A; 3WFW A; 4MQC B; 1C7C A; 3VHB A; 5ILM A; 4F4O A; 2MGD A; 1QSI B; 1Y4Q A; 1JEB B; 3OZW A; 2ZT3 A; 1YEQ A; 3BOM A; 1O16 A; 3WR1 B; 2Z6N A; 1GCV A; 2VEB A; 4X0L A; 1FAW A; 4MQJ B; 1GDJ A; 3GKT A; 1LFZ A; 1OFK A; 2XKH A; 5F0B A; 1XZ4 A; 1HAB B; 2PEG A; 4FC3 B; 4F6D A; 3ECZ A; 3AT5 B; 1Y46 A; 3M3B A; 6HBW A; 1Y8H B; 1MLG A; 4LPI A; 1A0U A; 3UH7 A; 3UHI A; 3ARJ A; 1JY7 A; 3PEL B; 4G1B A; 2GNW A; 1D8U A; 1Y0D B; 2HBC A; 1MYH A; 1Y35 B; 5EOH A; 2D60 A; 2G10 A; 2BLH A; 3MVC A; 2AV0 A; 5JGG A; 5KDQ B; 2HBS B; 4PNJ A; 1XZV B; 2AUR A; 1VWT A; 3DUT A; 1O1J B; 3GKV A; 1HDA B; 2EB8 A; 3K9Z A; 1JP6 A; 3HHB A; 1HLM A; 4KJT A; 1G9V A; 1Y4P A; 1WVP A; 1Y8I B; 3A9M A; 4NZI A; 1HV4 B; 1LFV A; 1B86 B; 2B7H A; 1RQA B; 3ORD A; 3D7O A; 7HBI A; 4F6I A; 1C7B B; 2LH2 A; 1MGN A; 1S61 A; 2DN3 A; 3MJP B; 3ONZ A; 1O1L B; 3KUN A; 1NS9 A; 1JPB A; 2MBW A; 1BZ1 B; 1JDO A; 3W4U B; 1LFT A; 4FWZ A; 1RTE A; 3UHG A; 1YG5 A; 102M A; 6HBI A; 5E83 B; 4G51 A; 1YE2 B; 3PI9 A; 1COH B; 5IKS A; 1CO8 A; 4MQG A; 4FH6 A; 1Y31 A; 3UHT A; 4N8T A; 1UVX A; 1JWN A; 2AA1 A; 3MJU A; 3PT8 B; 3ZOL A; 1BZ6 A; 2HHD B; 2O5S X; 1LH1 A; 1O1P B; 3D1K B; 3RGK A; 2HZ3 A; 4F6B A; 1S5Y B; 2MGK A; 1GZX B; 1MTJ A; 4NI0 B; 3WCP B; 2ZLT A; 3GQP B; 3MBA A; 1OUT A; 2G0Z A; 3DHR B; 3B75 A; 2QLS B; 1BVC A; 5KER A; 1THB B; 2LH1 A; 2IG3 A; 1K0Y B; 5AB8 A; 3UH6 A; 1YIE A; 3R0G A; 1LFY A; 1HBA A; 1FCS A; 2HBE B; 5EET A; 1S5X A; 1CH5 A; 1CQX A; 2LH6 A; 1N9X A; 1JZM A; 1UFJ A; 1YHR B; 1JF4 A; 1XZ2 A; 1F65 A; 3BJ2 B; 2ZS0 C; 1CIO A; 3CY5 B; 3P5Q B; 3WCU B; 2MB5 A; 2JHO A; 1O1K A; 1QSH A; 1HGC A; 5HU6 A; 3LB3 A; 1V07 A; 1HGA B; 1NPG A; 2MYA A; 1UFP A; 2D2N D; 1HDB A; 3O89 A; 1Y83 A; 3EU1 A; 1YH9 A; 3NL7 B; 5ILP A; 1N9H A; 1ECA A; 2VHB A; 1Y4R A; 1YEO A; 1KD2 B; 2R4X A; 1G09 A; 3FH9 A; 4ROM A; 3HXN A; 1A3O B; 4PQC A; 2ZWJ A; 4F68 A; 3WCT D; 2ZSY A; 1SDK A; 1Y0T A; 5C6E B; 2EVP A; 4DWU A; 3IC2 A; 2MHB A; 2D6C A; 3ZJJ A; 1MLS A; 3CIU A; 1HCO B; 1DKE B; 1O1N B; 2PGH A; 1J41 B; 4DC7 A; 1MZ0 A; 1O1I B; 1C40 B; 3ED9 A; 3ZJH A; 1LH7 A; 1RQ3 A; 1DLW A; 2ZSQ A; 4C44 A; 2D2M D; 1YVT B; 2ZFO B; 3A0G B; 2E2Y A; 1VXB A; 2D2M A; 3QM6 A; 2D5Z A; 4DWT A; 1FDH A; 4MQI A; 1Y4F A; 3D17 B; 5HBI A; 4SDH A; 3SDN A; 4YU3 B; 1YE0 A; 1HHO A; 2G11 A; 1KFR A; 1A9W A; 3HEP A; 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5CHQ A; 5B84 A; 1MLM A; 4MQC A; 5HLU A; 3GLN A; 1BZR A; 1QSI A; 1JEB A; 1W92 A; 4HRR B; 3WCU C; 1XZU A; 1GBV B; 1MLH A; 1NEJ B; 2ZLW B; 2LHB A; 3WR1 A; 4JYQ A; 5EE4 C; 3MOU A; 4N7N B; 2HHB A; 4MQJ A; 3ECL A; 4XS0 B; 2DN1 B; 3UHU A; 5SW7 B; 1MBA A; 1AJ9 B; 1EW6 A; 4F6J A; 5F2A A; 4ROL B; 3AT5 A; 1DO1 A; 1Y8H A; 2H35 A; 1HLB A; 1NIH A; 106M A; 5EUI B; 1PMB A; 4NK1 A; 3UHR A; 3UHX A; 1VXD A; 3LR7 A; 1F5O A; 1LUE A; 2NSS A; 1IRD B; 1Y35 A; 3UHH A; 3V2V A; 3G4Y A; 1DXC A; 2HBS A; 4NI1 A; 1XY0 B; 3QJC B; 1RQ4 B; 1O1J A; 3WFX A; 1A4F B; 1HDA A; 3BJ3 A; 2CMM A; 1LA6 B; 3MYM A; 1SI4 A; 3E55 A; 2NSR A; 1B86 A; 1RQA A; 2FAL A; 2NRM A; 3K8B B; 3R5I B; 4ZVB A; 5CNB A; 4B3W A; 3MJP A; 1CH9 A; 3QZX A; 1J3F A; 1V4W A; 1HBS B; 1G0A B; 1NGK A; 1CIK A; 1RVW A; 1CPW A; 2G12 A; 3W4U A; 5CMV A; 1S6A A; 1VXF A; 3UHZ A; 1TU9 A; 3VAU A; 1EBC A; 5E83 A; 1VXC A; 2HBG A; 1YE2 A; 4ESA B; 3VRF A; 1ECN A; 3WCV B; 1NZ3 A; 3OO5 B; 1UC3 A; 3ZJP A; 2D2N C; 4H0B A; 1BZZ B; 5JDO C; 3IC0 A; 3ZJN A; 1X3K A; 1Y45 B; 2LH7 A; 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