The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Crystallographic and Spectroscopic Studies of Peroxide-Derived Myoglobin Compound II and Occurrence of Protonated Fe(Iv)-O
pubmed doi rcsb |
| total genus |
61
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-05-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UHY A; 1Y0W A; 3GLN A; 2ZFO A; 3DR9 A; 3V2Z A; 1CH3 A; 3HHB B; 4ODC B; 1SDL A; 3HYU B; 1X9F B; 1VXE A; 3OO4 B; 2HHD A; 4IRO B; 1YIH A; 3B75 A; 3VRF B; 1DO1 A; 3G4V A; 3UGY A; 1MLH A; 3GQP A; 5KDQ B; 1MTK A; 1NIH A; 2GLN A; 1H1X A; 1NAZ A; 4HBI A; 1FCS A; 1HHO A; 2HHB B; 1OUU B; 1JWN A; 1MOH A; 3GQG A; 1MDN A; 2MYB A; 4F6J A; 1HDA A; 1BAB B; 2YRS A; 2HBD B; 5E29 A; 5F2A A; 1IT2 A; 4AVE A; 1ABY A; 1VWT A; 1MNJ A; 1Y0T A; 3AQ6 A; 1Y5K B; 3BJ2 A; 3BOM A; 2W6W A; 1BZ0 B; 1O1L B; 1K0Y B; 2D5Z A; 3WCV A; 3ASE A; 3M39 A; 1SDL B; 1CIK A; 1Y83 A; 5AZR A; 1HBA B; 4HRR A; 1YIH B; 3B75 B; 1W92 A; 1HGB A; 1O1K B; 1WLA A; 3PI1 A; 5HY8 A; 2O5M X; 2Z6N B; 1N9I A; 2GRF A; 1Y2Z A; 1UMO A; 3GQP B; 1GBV A; 1IBE B; 1V5H A; 1HHO B; 2OHA A; 1V07 A; 3NMM A; 5EYS A; 3GQG B; 1EBT A; 3RJ6 A; 1HDA B; 2YRS B; 4MQC A; 5E29 B; 3D1K A; 2SPO A; 1YEU B; 1ABY B; 3HEO A; 5CHR A; 1VWT B; 3A9M A; 1KFR A; 1HJT A; 1HCO B; 3QQQ A; 1A3N A; 1IDR A; 3EDA A; 1ABW B; 1Y01 B; 3BJ2 B; 1HBS B; 1X3K A; 3BOM B; 2ZWJ A; 1MBO A; 1SDK A; 3KMF C; 4NI0 A; 3E4N A; 1A6K A; 3WCV B; 1NPF A; 3GDJ A; 1NZ3 A; 3A5G A; 1YOG A; 2D5X A; 1Y83 B; 4WJG 1; 1MLQ A; 5KKK A; 1JY7 B; 1XZU A; 2B7H A; 3W4U A; 1HBG A; 5D1V A; 1HGB B; 1BZP A; 5HLQ A; 2W6V B; 3QMA A; 1A6G A; 2AA1 B; 1MYZ A; 1G9V A; 1Y2Z B; 4MQJ A; 1Y8W A; 3WR1 A; 4C0N A; 3UHC A; 2HBS A; 1LFL B; 1MOA A; 4N8T A; 1J3F A; 2LH7 A; 4MQC B; 3D1K B; 5CN4 A; 2D6C A; 1CMY B; 2R1H B; 1BZ6 A; 1SPE A; 1A3N B; 3ZH0 A; 2ZLT A; 1HGC B; 2AV0 A; 2MHB A; 3G4R A; 1CP0 A; 1MWC A; 1O1I A; 2R4X A; 1FSX A; 4NI0 B; 1MLF A; 1A00 A; 3UHN A; 1MYJ A; 3GDJ B; 2Z6S A; 1S5Y B; 2W31 A; 2ZST A; 1QXE A; 2ZSS A; 3UH5 A; 1Y4G A; 2H35 B; 2FAM A; 3EU1 A; 3M38 A; 1XY0 A; 2BNL A; 1O1P B; 1XZU B; 4F69 A; 2B7H B; 2BLH A; 5MBA A; 1G08 A; 1G9V B; 4MQK B; 5CMV A; 2DHB A; 1J7S B; 2O5O X; 2V1I A; 2IG3 A; 1YIE A; 4N8T B; 5CNE A; 4AVD A; 3AG0 A; 1GCV B; 5JDO C; 2HBG A; 1DUO A; 3S1J A; 3WFU A; 3UHT A; 3HEP A; 2ZLT B; 2MHB B; 2V1G A; 1MLM A; 2R80 B; 1HBI A; 1A00 B; 3PIA A; 4F4O B; 1NXF A; 1S0H A; 2HZ1 A; 2G14 A; 3K9Z A; 1RVW A; 1XY0 B; 1A9W E; 2MGA A; 3K3U A; 1AJG A; 1MBN A; 3DHT A; 4KJT A; 5JGG A; 1V4W A; 1F65 A; 1L2K A; 2LH1 A; 1G08 B; 3HXN A; 2DHB B; 1YIE B; 1CH2 A; 1CP5 A; 2ZSY A; 2DXM B; 2QMB B; 3R0G A; 2VYW A; 3OK5 A; 2BKM A; 4MBA A; 4U8U C; 4TWV A; 1Y4R A; 1BZ1 A; 4FH6 A; 1J52 A; 3PIA B; 2QSP A; 3ONZ A; 1QPW B; 1LFV A; 1B86 B; 1JZM A; 5JDO D; 2D2N C; 3ZJM A; 3HRW A; 2W6Y A; 3IC0 B; 2ZT4 A; 1DXT B; 1RVW B; 3QJB B; 3EDB A; 4ZVA A; 3ZJR A; 2GTL C; 1Y5J A; 4MQI A; 1O1O A; 4MAX A; 1DLY A; 1Y8H B; 2HBC B; 4FWZ A; 5JGG B; 1O1N A; 4PQB A; 2MGM A; 1YZI B; 105M A; 4H2L B; 4FWX A; 2MBW A; 1J41 A; 3WHM A; 1D8U A; 3G4Q A; 1CH4 A; 4FWY A; 2R50 A; 1XZ2 A; 1A01 A; 3BJ3 A; 3MJU A; 103M A; 1FHJ A; 4O35 A; 3TM9 A; 2MYD A; 1BZ1 B; 2QSP B; 3TM3 A; 1LFT B; 3CIU A; 1CG8 B; 3HRW B; 1SI4 B; 4U8U D; 1S61 A; 1IWH A; 1TES A; 3O89 A; 1OR4 A; 1Y5J B; 2D2N D; 1MOC A; 3WTG B; 1Y4V A; 1GVH A; 2WTG A; 3QM5 A; 1YHE B; 2OHB A; 1O1N B; 5CN9 A; 2ZSZ A; 2Z85 A; 1S5X B; 2GTL D; 4SDH A; 4F68 A; 1J41 B; 3WHM B; 1ASH A; 1FN3 A; 1XZ7 A; 5CN8 A; 1Y0D B; 1Y4B A; 1JEB B; 2MGC A; 1YFF B; 1Y0C B; 3V2V A; 1RQA B; 3D7O A; 1GLI A; 1FDH A; 1CIO A; 1Y8K A; 1EW6 A; 3BJ3 B; 1CBL A; 2ZSN A; 1OBM A; 1MKO A; 3ED9 A; 1IOP A; 2ZS0 A; 5IKS A; 1J7W A; 2V1J A; 1FLP A; 3MN0 A; 5CNB A; 1GDK A; 4MQH A; 3S66 B; 1DO3 A; 3UHK A; 3HYU A; 101M A; 3A2G A; 2RAO A; 4IRO A; 3VRF A; 1Y8I A; 4HHB B; 2NRL A; 3U3E A; 4NXC A; 1F5O A; 3MVC A; 4O1T A; 4YU4 B; 5EV5 A; 1YEV A; 5KDQ A; 3NML A; 1FN3 B; 6HBW B; 3ZJQ A; 4F6I A; 1YHU C; 1A9W A; 1Y4B B; 1Y4F A; 1BAB A; 1Y4Q B; 1HBB B; 1GLI B; 1Y8K B; 2MGF A; 5EET A; 5JOM A; 2ZFO C; 2D2M C; 3LHB A; 3D17 A; 4NK2 A; 2V1F A; 1BZR A; 1Y5K A; 2ZS0 B; 1J7W B; 1BZ0 A; 1O1L A; 1LFY B; 3ZJP A; 1URV A; 1K0Y A; 1C40 B; 1HRM A; 1OFJ A; 4MQH B; 2MB5 A; 1Y0A B; 1QSI A; 3OZW A; 1Y46 A; 1JP6 A; 1JF3 A; 2PEG A; 1HBA A; 2RAO B; 1CLS B; 1UIW B; 1YEN B; 1Y8I B; 3ECZ A; 3P5Q B; 1YGF A; 1FAW A; 1O1K A; 2MGJ A; 1OJ6 A; 4MBN A; 2BWH A; 106M A; 2Z6N A; 1SPG B; 1YEV B; 1YHR A; 1LTW A; 1IBE A; 5HBI A; 1J3Y B; 1CBM A; 1Y4F B; 2G0S A; 3UHQ A; 1QSH A; 2IN4 A; 1YEU A; 2KSC A; 2D60 A; 2ZS1 C; 3UH3 A; 4G51 A; 1YHU D; 3D17 B; 1HCO A; 3GQR B; 1ABW A; 3ORD A; 1HBS A; 4N7N A; 2V1K A; 5JDO E; 3SZK B; 3VRG B; 2QFN A; 2ZFO D; 1Y22 A; 2D2M D; 3ZJH A; 2EVP A; 2BLI A; 3QJC B; 1QXD B; 2NSR A; 1YHU B; 3RGK A; 1QSI B; 1T1N B; 1Y46 B; 1MTJ A; 1HV4 A; 2PEG B; 2XKH A; 1JY7 A; 3LB1 A; 1CPW A; 4O4T A; 3UHB A; 4N7P A; 1YGF B; 1FAW B; 1DO7 A; 1MGN A; 5AB8 A; 2QFK A; 2OIF A; 2D2M B; 2W6V A; 2AA1 A; 1LH5 A; 4ESA A; 3M3B A; 1Y85 B; 2G0X A; 1Q1F A; 1YHR B; 1HDS B; 1UVX A; 3GOU A; 1HAB A; 1MCY A; 1LFL A; 1DTI A; 1V4X B; 3WCU C; 1UX9 A; 5EOH A; 1GDL A; 4IT8 A; 1HBH A; 1QSH B; 3DUT A; 3IXF A; 3ZOL A; 5CNG A; 3FH9 A; 1CMY A; 1KR7 A; 2D60 B; 2R1H A; 1A0U A; 4G51 B; 2GDM A; 109M A; 1MYH A; 3GYS A; 1EMY A; 2DC3 A; 2GKN A; 1HGC A; 1VXH A; 4OF9 A; 4N7N B; 1G09 A; 2FRI X; 1XXT A; 5EUI B; 3S1I A; 2ZS1 D; 1Y22 B; 1RPS A; 1S5Y A; 3HEN A; 2DN1 A; 1YE0 B; 1XZ4 B; 1N9H A; 3VHB A; 1NEJ B; 2H35 A; 3HF4 A; 1GZX A; 1MYF A; 1HV4 B; 1UX8 A; 1O1P A; 3UI0 A; 3ZJS A; 4N7P B; 3QM6 A; 2O5L X; 1N9X A; 3QJD A; 4UIQ A; 1O1J A; 4B4Y A; 4ESA B; 3UHG A; 3QM9 A; 3OO5 A; 4MQK A; 1J7S A; 1CH1 A; 1MBI A; 3GOU B; 1YEO B; 3KMF A; 2R4Y A; 1HAB B; 3OGB A; 2CMM A; 112M A; 1GBU A; 2VHB A; 1A0Z B; 3H57 A; 1HBH B; 3BJ1 A; 3DUT B; 2O5Q X; 1YOH A; 3FH9 B; 1X46 A; 1GCV A; 1A0U B; 3GYS B; 1MLG A; 3WCU D; 1XQ5 B; 1G09 B; 2R80 A; 1M9P B; 1XXT B; 4F4O A; 1MLO A; 1RPS B; 2VLZ A; 2DN1 B; 4NI1 A; 2W72 C; 1DTM A; 3HF4 B; 2NSS A; 1GZX B; 2FRK X; 1HGA B; 1DWS A; 3AQ8 A; 3ZJO A; 1YG5 B; 3QJD B; 1O1J B; 2MGB A; 3OO5 B; 2E2Y A; 1I3D A; 1CO9 A; 2HCO B; 1YDZ A; 5HLU A; 1SHR A; 1NWI A; 1GBU B; 1NZ4 A; 2DXM A; 4ROM B; 3UBV A; 2QMB A; 3BJ1 B; 3NG6 B; 3FS4 A; 3PEL B; 4YU3 B; 5ILP A; 1MLJ A; 1YCB A; 3DHR B; 2XYK A; 3HC9 A; 2QLS A; 1QPW A; 1B86 A; 4M4A A; 4NI1 B; 3IC0 A; 4OOD A; 1I3E A; 1GJN A; 1Y7G B; 1DXT A; 2VEB A; 3QJB A; 2G0R A; 3QZX A; 1LA6 B; 3UHD A; 5M3S A; 2ZSO A; 1Y8H A; 2HBC A; 2ZLU A; 3BA2 A; 3G46 A; 3WCW C; 1WVP A; 4H0B A; 1YZI A; 1IRD A; 3WFT A; 1YDZ B; 4H2L A; 4WJG A; 1SHR B; 2HBF A; 3R5I B; 3IC2 B; 1ITH A; 3K8B A; 2HZ3 A; 1MWB A; 3FS4 B; 4VHB A; 2WTH A; 3D1A A; 1THB A; 5CN6 A; 2QSS A; 1J40 A; 1JZK A; 1QI8 A; 4QAU A; 2QLS B; 1EBC A; 1LFT A; 3GKV A; 4XS0 A; 1DWR A; 2MGE A; 1CG8 A; 2ZT1 A; 3UH6 A; 3PI3 A; 1SWM A; 1SI4 A; 4M4A B; 2EKU A; 4NK1 A; 2ZLX B; 3ZHW A; 1JPB A; 2BMM A; 3WTG A; 2ZLU B; 3UHR A; 1YHE A; 1JDO A; 1V9Q A; 4U8U A; 1AJ9 B; 1JL7 A; 1IRD B; 1S5X A; 4FC3 A; 1UC3 A; 4N7O A; 1A3O B; 2HBF B; 2RI4 B; 3WCW D; 2GNV A; 1MNO A; 2OH9 A; 3K8B B; 2D2N A; 1Y0D A; 1MNK A; 1JEB A; 1YFF A; 1Y0C A; 1RQA A; 3LB2 A; 1XYE A; 3D1A B; 3BCQ A; 1THB B; 1O16 A; 2VM0 A; 2GTL A; 2QSS B; 5HAV A; 5EQM A; 1J40 B; 3ODQ A; 2SPM A; 1HAC B; 1QI8 B; 3WCW B; 3UHE A; 3GKV B; 1YEQ A; 3WI8 A; 4XS0 B; 3ECX A; 4DC7 A; 3UHU A; 3PI4 A; 1Y4P B; 1DM1 A; 3S66 A; 1WMU A; 111M A; 2AUR A; 2V1H A; 4TYX A; 4HHB A; 1YMC A; 1M6M A; 1MYI A; 4H07 A; 4U8U B; 1VXG A; 1A4F B; 2SPL A; 4FC3 B; 4YU4 A; 2G0V A; 4MQG A; 4N7O B; 6HBW A; 2O5S X; 1Y7D A; 1ABS A; 4L7Y A; 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3ARK A; 1YHU A; 1DLW A; 1T1N A; 1YCA A; 1Y7C B; 3LQD A; 1DXV B; 3AT6 B; 1MYT A; 3UHX A; 4DWT A; 1LHS A; 2D2M A; 1JP9 A; 3UHV A; 2OLP A; 1Y85 A; 2EB8 A; 2MGD A; 1CH7 A; 2Z6T A; 1HDS A; 2MGG A; 4MPM A; 1GCW A; 1J3Z B; 1G0B B; 1V4X A; 4G1B A; 5SW7 A; 1YVT B; 1MBS A; 3D4X A; 1NS6 B; 4HRT A; 3WCV C; 1RQ4 B; 5KER B; 2VYZ A; 3WCT D; 1H97 A; 1DXC A; 1MLS A; 1LH3 A; 3MJP A; 1MBA A; 5EUI A; 1NQP A; 3SDH A; 1C7C B; 4KMV A; 1YE0 A; 1XZ4 A; 1S56 A; 3WCT B; 1DKE A; 1NEJ A; 2QU0 B; 4O2G A; 4M4B B; 110M A; 3LQD B; 1UVY A; 4XDI A; 4NXA A; 1Y0W B; 2SPN A; 5F0B A; 2G11 A; 2ZFO B; 2ZS1 A; 1VXA A; 4O4Z A; 1YEO A; 2ZLV A; 1A6N A; 1GCW B; 2HHD B; 5SW7 B; 1VRE A; 1MLR A; 1A0Z A; 3D4X B; 2O58 X; 4HRT B; 3MOU A; 3A0G A; 3ZJI A; 2ZSP A; 2LH5 A; 102M A; 5ILE A; 1NIH B; 5CHQ A; 1XQ5 A; 3QQR A; 4FH7 A; 1VHB A; 3UHH A; 3MJP B; 1M9P A; 3WCV D; 1LHT A; 1NQP B; 1U7S A; 2NX0 A; 3MBA A; 1MWD A; 3OZU A; 2NRM A; 3ZJN A; 1Y0T B; 1NZ5 A; 3E55 A; 1DKE B; 3UBC A; 3SDN A; 3WCU A; 4L2M A; 3AQ9 A; 1HGA A; 2ZSX A; 2WY4 A; 2D5Z B; 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