The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the Human Hemoglobin Mutant Hb Providence (A-Gly-C:V1M; B,D:V1M,K82D; Ferrous, carbonmonoxy bound)
rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| total genus |
57
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-08-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZFO B; 3OO4 A; 1XXT B; 3HXN B; 2ZT1 A; 2ZT3 A; 1NS9 B; 1GBU B; 1Y7G B; 1YE2 A; 5AZQ A; 2W6X A; 1ABW A; 1XYE A; 2HZ2 A; 1O1M A; 3GK9 A; 2R4X A; 1YFF A; 4N8T B; 1HBA B; 1Y0C A; 3ZJN A; 5F2A A; 4G51 B; 1MLR A; 1CH4 A; 1Y4V B; 1GDL A; 3WFT A; 1JEB B; 1GDJ A; 1Y46 B; 1SDK A; 1R1X A; 1C40 B; 5EOH A; 2Z8A A; 3KMF C; 2XKH A; 3FH9 B; 3LQD A; 2R4Z A; 4M4B A; 1A3N A; 1SPG B; 4ROM A; 1GCV B; 2V1J A; 1JZM A; 5ILM A; 3GYS A; 2W6W A; 2DXM A; 1YGD B; 1HDS A; 1Y7D B; 4LPI A; 3D1K A; 2ZLT A; 3ZH0 A; 2ZSQ A; 3HYU B; 4TYX A; 2SPL A; 2DN1 B; 3VRG A; 1T1N B; 2GNV A; 4NK1 A; 1C7C B; 1HAB A; 1N9X A; 3PT8 A; 1J3Z A; 1JZK A; 1M6C A; 4MAX A; 1Y85 A; 4N7N B; 3UHB A; 1Y4G A; 1A00 A; 2KSC A; 1MKO A; 2O5Q X; 1SI4 B; 2G10 A; 3PIA A; 3QJB A; 2H8D A; 3NL7 B; 1CBL A; 3TLD A; 2NRM A; 4B4Y A; 1HDB A; 2DN2 A; 1Y22 A; 2ZSS A; 1J7Y B; 1MBC A; 3WTG A; 4AVD A; 1V75 B; 3E5O A; 1HV4 B; 4UZV A; 1JL6 A; 1X9F D; 3S48 C; 3D17 B; 1BZ6 A; 3WCV C; 1AJ9 A; 2ZFB B; 2FAL A; 1HBG A; 4L7Y A; 2ZSX A; 1RQ3 A; 4F69 A; 1Y0W A; 4N7O A; 6HBW A; 5HLX A; 1RQ4 B; 2VLZ A; 1J7S A; 2OIF A; 1NZ4 A; 2IN4 A; 2BLH A; 3OO4 B; 1Y45 A; 1G9V A; 2O5B X; 4XDI A; 1GDI A; 1OR4 A; 1A6M A; 1ABW B; 1DWS A; 2O5L X; 1IDR A; 2PGH B; 1VWT A; 1MBI A; 1Y8I A; 1MWC A; 5JDO D; 1SHR B; 1LA6 A; 1FAW A; 1IRD A; 1MLO A; 4F4O B; 1BZZ A; 1A4F B; 2QFN A; 1FSX B; 3QJD A; 4FWZ A; 1CH1 A; 4M4B B; 3BCQ A; 1Y8H B; 2EKU A; 3NG6 A; 2HBE A; 3PEL B; 1H1X A; 1MYF A; 1Y0T B; 1YOI A; 1A0U B; 1XZ5 A; 1YVT A; 4AVE A; 1C7D A; 1HBB A; 3EOK A; 2FRK X; 4TWU A; 3CY5 A; 3OO5 A; 1O1I B; 2GDM A; 1Y4B A; 3QJC A; 1NPF A; 1DKE A; 107M A; 1YH9 A; 2HBG A; 1J3Z B; 1VXF A; 2MGA A; 1EW6 A; 3VHB A; 3GQP B; 3ARK A; 1MKO B; 1YEN B; 2G0V A; 5CN6 A; 1AZI A; 1S61 A; 4N7P B; 1XY0 B; 2WY4 A; 4NI1 A; 2W31 A; 3OZW A; 1KFR A; 1Y4F A; 1UFP A; 1DO4 A; 5EQM A; 3MOU A; 1DO3 A; 2V1I A; 2ZLU A; 5E29 A; 3WCT D; 5EV5 A; 4MQJ A; 1LFT A; 1AJ9 B; 3UHZ A; 2MGM A; 4U8U C; 3K8B A; 4O1T A; 5HU6 A; 1ITH A; 2MB5 A; 5EET A; 1BZR A; 2GTL D; 5D1V A; 1SWM A; 1G9V B; 1HRM A; 1BVC A; 1RVW B; 1OR6 A; 1HCO B; 2LH2 A; 1MNJ A; 4NXA A; 1Y4P B; 1R1Y A; 2W6V B; 1TU9 A; 1Y8I B; 4F6B A; 1HAC A; 1OUT A; 1VRE A; 1FAW B; 2ZFO C; 3G4R A; 1BZZ B; 1FHJ B; 3HF4 B; 1OJ6 A; 1VRF A; 4YU3 B; 3FS4 A; 4X0L B; 1DXV B; 4ILZ A; 1RSE A; 3PI1 A; 1LTW A; 3MN0 A; 1X9F B; 3S1I A; 3IA3 B; 3BJ2 B; 3NG6 B; 2HBE B; 1XCH A; 1BJE A; 108M A; 1LFQ B; 3G52 A; 1A3O A; 1YVT B; 3SDH A; 3S65 A; 1C7D B; 3EOK B; 1MLG A; 1N9I A; 5B85 A; 3ZJI A; 3V2Z A; 3UHV A; 1Y4B B; 3A9M A; 2HBS A; 1LUE A; 1MDN A; 3K9Z A; 4H2L A; 2BWH A; 3VRF B; 2ZWJ A; 1LH6 A; 2HHB A; 2VM0 A; 1Y5K B; 2VHB A; 5C6Y A; 5M3S A; 3WCW A; 1JY7 A; 1LFZ B; 2DC3 A; 1MNK A; 3AT5 B; 1WLA A; 1ECD A; 2MGC A; 2MGD A; 1DXD A; 2LH6 A; 2AUQ A; 1UIW A; 1BZ1 A; 1RTX A; 2QSP A; 3OJ1 A; 4HHB A; 3HRW A; 5CN7 A; 1Q1F A; 2DHB B; 4NI1 B; 1Y4R A; 1GBV A; 1DUO A; 3E5I A; 1HJT A; 4F6J A; 1BZP A; 2MYA A; 1MYT A; 1CLS A; 2BW9 M; 3PI9 A; 5JDO F; 1NWI A; 1RQA B; 1VXC A; 1VXG A; 1HGA B; 4IRO A; 1MNO A; 1HBS A; 3VRE B; 3WR1 A; 1Y8W A; 5HU6 B; 1CH2 A; 1FLP A; 1ECO A; 3GQG A; 5E6E A; 3WCP B; 5HLU A; 2ZLV A; 2C0K A; 4F6I A; 1A6N A; 4ROL A; 1QPW B; 2V1G A; 1L2K A; 4MPM A; 4QAU A; 1MWD A; 1X46 A; 1COH A; 1Y31 B; 1YE0 A; 5MBN A; 1FN3 A; 2R1H B; 2ZSP A; 1JDO A; 3NML A; 1IBE B; 2MGJ A; 1LFL B; 2AV0 A; 5B84 A; 3GQR A; 4NZI A; 1YOG A; 2B7H B; 4OF9 A; 4MQI A; 1XZ2 B; 1YHU A; 3FS4 B; 1K0Y B; 1NPG A; 3QM9 A; 4C44 A; 1Y35 A; 3WCT B; 2O5M X; 1YHR A; 1HSY A; 1LHT A; 2D2N A; 1MOH A; 1O1O A; 2ZSZ A; 2MGE A; 4HRT B; 1A3O B; 5HY8 B; 1NS6 A; 1UX8 A; 2D2M A; 4XS0 B; 5EUI A; 4G1B A; 3TM3 A; 4MBN A; 1DWT A; 2AV3 A; 3NFE B; 2IG3 A; 3QJE A; 2GTL B; 3D7O B; 3QQR A; 1XQ5 B; 3EDA A; 1HGC A; 2R80 B; 1SDL B; 5CHR A; 3ECZ A; 3ARL A; 1IWH A; 2BNL A; 1K1K B; 1LFY A; 3A0G A; 2MGL A; 2OHB A; 3LB4 A; 2Z6N B; 1O1N A; 3P5Q A; 2PEG A; 2W72 B; 1GLI A; 3ZJH A; 3HHB A; 4NI0 A; 4HHB B; 3ASE A; 1QXE A; 3R5I A; 4FC3 B; 2G3H A; 2D5Z A; 1RPS A; 4MU5 A; 1Y7C B; 1WMU A; 3CIU B; 1QXD A; 3UHC A; 2HBF A; 4ESA B; 3UH5 A; 2BKM A; 3WCU A; 1IT2 A; 1S5Y B; 2V1H A; 5EYJ A; 2FRJ X; 5C6E A; 2ZS1 A; 3S66 A; 3PT7 A; 2QLS B; 1Y4Q A; 3BJ3 B; 1LFV B; 1ASH A; 1YIE B; 2MHB A; 3GQG B; 1XZ4 B; 1BIN A; 1YMB A; 1MYI A; 2GKN A; 2ZLV B; 1MBA A; 1JZL A; 4H0B A; 1MLJ A; 1O1K A; 4ROL B; 1NEJ A; 1G0B B; 2CMM A; 2GRF A; 3BJ1 B; 2OH8 A; 4WCH D; 1Y5F B; 1KR7 A; 1YIH B; 3LR7 A; 1YE0 B; 4O4Z A; 3DUT A; 1JP6 A; 2EB9 A; 1OUU B; 5CHQ A; 1GDK A; 1XZV A; 3GKV A; 3EDB A; 1EBT A; 2DN3 A; 2GKM A; 2ZSR A; 2ZT0 A; 1YGF A; 3K3U A; 3OGB A; 2ZLX A; 1Y2Z A; 1CP0 A; 1QI8 A; 1GJN A; 2RI4 A; 1NQP A; 4VHB A; 3ZJS A; 1D8U A; 1V5H A; 2SPO A; 1MLS A; 1B0B A; 1NWN A; 1N9F A; 3UHN A; 3OVU C; 1LH5 A; 3M3A A; 1LJW B; 5MBA A; 1CIK A; 2YRS A; 3ONZ B; 4MQK A; 1QSI A; 2WTG A; 1AJH A; 2VEE A; 1HGC B; 1TES A; 5AB8 A; 2MGH A; 5SW7 A; 1IWH B; 1X9F C; 2V1K A; 3MJP A; 3ED9 A; 4KMV A; 1ECN A; 3D1A A; 3ZJR A; 3A2G A; 1XZU A; 5KDQ A; 3QMA A; 1URY A; 1A9W A; 3GLN A; 2EB8 A; 2ZLW A; 102M A; 1YEU A; 2PEG B; 3P5Q B; 1GLI B; 4MBA A; 1GZX B; 1Y8K B; 2H35 A; 1O1P A; 2GRH A; 1JF4 A; 1YE2 B; 1BZ0 A; 1XYE B; 3IXF A; 1O1M B; 1QXD B; 1YFF B; 3BOM A; 3LB2 A; 1Y83 A; 3AT6 A; 1J41 A; 1Y0C B; 1B86 A; 1G09 A; 1YEV A; 4JAC A; 4M4A A; 1CQ2 A; 5C6E B; 3S66 B; 1A6K A; 1G0A A; 3PT7 B; 1Y4Q B; 3LB3 A; 5JDO C; 5CNF A; 5KER A; 2ZSN A; 3W4U A; 1Y0A A; 2BLI A; 1SDK B; 1R1X B; 1S5X A; 2MHB B; 1FSL A; 2HBC A; 2G11 A; 1EBC A; 3EU1 A; 3LQD B; 1A3N B; 2R4W A; 1CG5 A; 5CN9 A; 2ZT4 A; 4ROM B; 1YMA A; 2O58 X; 1O1K B; 2AUR A; 3OZV A; 1MYM A; 4B3W A; 3GYS B; 2DXM B; 1UX9 A; 1MLH A; 1MOD A; 1HDS B; 1J3F A; 1DUK A; 3ECL A; 2GNW A; 3UHD A; 3D1K B; 3ZJM A; 2G0X A; 3WCV A; 2ZLT B; 3MJU A; 3UGZ A; 1V4U A; 3B75 A; 3G4U A; 2RAO A; 3DUT B; 4F6F A; 3MKB A; 3VRG B; 1MOA A; 4NK2 A; 3IC0 A; 5JGG A; 1HAB B; 1HLM A; 1I3E A; 1LH3 A; 3PT8 B; 2O5S X; 5CNG A; 2MYE A; 1Y85 B; 4ODC A; 2HHE A; 1V4W A; 1Y4G B; 1A00 B; 3AG0 A; 3QM5 A; 1NZ2 A; 1F65 A; 1YG5 A; 1CG8 A; 2EKT A; 3G4Q A; 1Y2Z B; 3PIA B; 4BJA A; 1QI8 B; 3QJB B; 2H8D B; 109M A; 3ODQ A; 4FWX A; 3IC2 A; 1HDB B; 2DN2 B; 1Y22 B; 1NIH A; 1RTE A; 1EWA A; 3WTG B; 1Y01 B; 1YHE A; 2V1F A; 1DO1 A; 1QSI B; 3HEP A; 1ABY A; 3AQ8 A; 1Y5J A; 4PQB A; 5CNE A; 2QU0 A; 3MBA A; 5IKS A; 1MYJ A; 1YZI A; 1I3D A; 1O1L A; 3WCT C; 3H57 A; 4L7Y B; 1RQ3 B; 1IT3 A; 3D1A B; 1A0Z A; 1Y0W B; 4N7O B; 6HBW B; 3UHR A; 2ZLW B; 4HRR A; 1YEU B; 3PI8 A; 1HGB A; 1J7S B; 1ECA A; 3ZHW A; 1BBB A; 3ZJL A; 1MBD A; 4MQH A; 1Y45 B; 2GTL C; 3WHM A; 2ZST A; 1VXE A; 4MQC A; 1A6G A; 1X3K A; 3WCW D; 1BZ0 B; 4C0N A; 1MNI A; 1YVQ A; 3ARJ A; 2FRF A; 3G53 A; 3BOM B; 3OZU A; 1Y83 B; 3AT6 B; 1YEQ A; 1S56 A; 1YEV B; 1VWT B; 3QM7 A; 3ECX A; 1BAB A; 5CN5 A; 3UBC A; 4FH7 A; 4M4A B; 2W72 C; 2LH3 A; 1LA6 B; 1IRD B; 2H8F A; 5KER B; 3R0G A; 3W4U B; 1Y0A B; 1MYZ A; 3A59 A; 4DC7 A; 3QJD B; 3UHW A; 2HCO A; 1F63 A; 1JP9 A; 2QMB A; 1CG5 B; 3BCQ B; 1J3Y A; 101M A; 2EVK A; 2D60 A; 2Z6T A; 1XZ5 B; 5EE4 D; 1KD2 A; 1THB A; 3AQ7 A; 2MGB A; 1HBB B; 3CY5 B; 3OO5 B; 4F6D A; 3MJU B; 3E4N A; 4U8U A; 3QJC B; 2M6Z A; 1MWB A; 111M A; 1DKE B; 1MCY A; 2AA1 A; 3WFU A; 1HBH A; 1YH9 B; 1GCW A; 2VYW A; 2AUO A; 1XZ7 A; 1BUW A; 3DHR A; 3HEO A; 3AQ9 A; 1IRC A; 4H07 A; 1HHO A; 4KJT A; 3ZJP A; 1VHB A; 3H58 A; 4TWV A; 106M A; 3GOU A; 4DWT A; 3M38 A; 3RJ6 A; 3ODQ B; 1A01 A; 4MXK A; 3PI4 A; 5D5R A; 4IT8 A; 1NIH B; 1Y4F B; 1YHU D; 1BVD A; 2ZLU B; 2NSR A; 2JHO A; 5E29 B; 1DTM A; 3M39 A; 2ZFO A; 2NX0 A; 4MQJ B; 2D2N D; 3V2V A; 1LFT B; 1XXT A; 3HXN A; 4HBI A; 1MTK A; 1NS9 A; 1GBU A; 1Y7G A; 2D2N C; 2D2M D; 2G0R A; 3ZJJ A; 1C7B A; 3K8B B; 1UMO A; 4HRR B; 4N8T A; 2E2Y A; 1HBA A; 3ORD A; 4G51 A; 1FCS A; 1BBB B; 3G4V A; 4MQH B; 1Y4V A; 2MBW A; 2W6Y A; 4MQC B; 1JEB A; 2XYK A; 3UI0 A; 1NGK A; 1C40 A; 1H97 A; 1R1Y B; 3FH9 A; 4PNJ A; 1DXC A; 1SPG A; 3D4X A; 1BAB B; 1JW8 A; 1HAC B; 3KUN A; 1OUT B; 2EF2 A; 2HHD A; 4HSX A; 1Y7D A; 2VYZ A; 3E55 A; 4DWU A; 1MLK A; 1U7R A; 5HBI A; 3HYU A; 1V4X A; 3WCU D; 1NXF A; 1O1J A; 3UHT A; 1J3Y B; 2ZS0 D; 2ZS1 D; 1MNH A; 4N7N A; 3S65 B; 1YOH A; 1SI4 A; 4ZVB A; 3SDN A; 3TM9 A; 2HBS B; 105M A; 1MBN A; 2AA1 B; 3NL7 A; 4H2L B; 1GCW B; 3WI8 A; 1BUW B; 2HHB B; 1MLM A; 3WCW B; 1JY7 B; 2OH9 A; 4PQ6 A; 1FDH G; 2WTH A; 4KMW A; 1M6M A; 104M A; 2VLY A; 1UIW B; 3D17 A; 1BZ1 B; 2QSP B; 3HRW B; 1Y4R B; 2ZFB A; 1GBV B; 5ILE A; 4YU4 A; 2XKG A; 2V1E A; 1RQ4 A; 1CLS B; 2AUP A; 1CP5 A; 3PI9 B; 2R50 A; 4PQC A; 1DTI A; 3GDJ A; 3LHB A; 2ZS0 A; 4IRO B; 2FRI X; 1HBS B; 1VXD A; 1C7B B; 5CND A; 1Y8W B; 3WR1 B; 1YEO A; 3UHI A; 2MGK A; 1V9Q A; 2PGH A; 5E6E B; 1OBM A; 5JDO E; 5CNB A; 112M A; 1J7W A; 2ZSY A; 2GL3 A; 4G1V A; 1SHR A; 1UVX A; 1PMB A; 2NSS A; 4F4O A; 1A4F A; 1F5P A; 1HDA A; 1FSX A; 4WJG 1; 1COH B; 1MBO A; 4MQG A; 3D4X B; 2MGF A; 1CPW A; 1F5O A; 1Y8H A; 2ZT2 A; 1FN3 B; 2VLX A; 2NRL A; 3PEL A; 2HHD B; 1SPE A; 103M A; 1Y0T A; 1A0U A; 2MYD A; 3GQR B; 4MQI B; 1YHU B; 1NZ5 A; 1O1I A; 2MGI A; 1V4X B; 1Y35 B; 1O1J B; 1YHR B; 3MVC A; 2D2N B; 1O1O B; 1HBI A; 1S6A A; 4WJG A; 2XKI A; 1NS6 B; 2D2M B; 5EUI B; 2LHB A; 3GQP A; 1CH7 A; 1CMY A; 1Y09 A; 2O5O X; 5HAV A; 3UHX A; 2D5X A; 3VAU A; 1YEN A; 1UT0 A; 2FAM A; 1DXU A; 3QJE B; 3UGY A; 2VEB A; 2OLP A; 5CNC A; 4N7P A; 1XY0 A; 2BLJ M; 3ZOM A; 3RJN B; 3A5G A; 1JWN A; 1MLN A; 3KMF A; 1LFY B; 3A0G B; 3UHE A; 3WCV D; 2R4Y A; 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