The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structures of the nitrite and nitric oxide complexes of horse heart myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
60
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y4G B; 1OJ6 A; 4OOD A; 4DWU A; 2H8F A; 1BZZ A; 2SPM A; 2ZSZ A; 1LHS A; 1VWT B; 1X3K A; 1Y5F B; 2AUP A; 1JF3 A; 2DHB A; 1Y01 B; 3QM9 A; 5KER B; 1YEN A; 5EUI B; 3QM7 A; 5CN9 A; 4FC3 A; 1BZZ B; 1UFJ A; 1HBH A; 3AG0 A; 1NEJ A; 3P5Q A; 1LH1 A; 3ZOL A; 5JDO F; 1BZ0 A; 1HDB A; 1C40 A; 1YEN B; 2ZS1 C; 4G1V A; 2V1H A; 3MJU A; 1KD2 B; 5EQM A; 5EE4 D; 1MTI A; 3CIU B; 4FC3 B; 1JW8 A; 1GBV A; 1HBH B; 1LUE A; 2G3H A; 1BZ0 B; 3WCV A; 2OH8 A; 1HDB B; 1C40 B; 3BOM A; 5JGG A; 1A01 A; 1Y4F A; 3UHE A; 2VLY A; 2HZ3 A; 3MJU B; 1O1O B; 1QSI A; 1WVP A; 1GBV B; 1ABW A; 1C7D A; 1A9W A; 1ECN A; 1YOH A; 1OBM A; 4UUR A; 2ZS0 B; 4KMV A; 3ZJQ A; 3WCV B; 3BOM B; 1YZI A; 5JGG B; 1A01 B; 1UIW A; 3G52 A; 1HBB A; 2ZSY A; 3LR9 A; 1HLB A; 1Y8W A; 2IN4 A; 3MN0 A; 3HYU B; 1ABW B; 1C7D B; 1MLG A; 1IOP A; 1BVC A; 3U3E A; 2WTH A; 2R1H A; 4NI0 A; 1EBT A; 1IBE A; 2Z8A A; 1YZI B; 1LH3 A; 1NZ2 A; 1CG8 A; 2O58 X; 2OIF A; 5EV5 A; 1Y8W B; 3WCU C; 1QXD A; 1XXT A; 3WR1 B; 1CH5 A; 1HBS A; 2R1H B; 4NI0 B; 1DXT A; 2QFK A; 3WCP A; 2W72 A; 1LJW A; 3IC2 A; 1YEU A; 1CG8 B; 3UH7 A; 1OR4 A; 1QXD B; 1YEQ A; 1HDS A; 1XXT B; 1Y8I B; 4LPI A; 5HBI A; 3NMM B; 5AZQ A; 3TM9 A; 1DXT B; 1ABY A; 2W72 B; 1LJW B; 5D1V A; 5AZR A; 1UVY A; 1YEU B; 3OGB A; 2ZLV A; 1NS9 A; 1J52 A; 5HLQ A; 6HBW A; 1MTK A; 1EMY A; 2V1G A; 2MGK A; 3A0G A; 1YEQ B; 1HDS B; 2HCO B; 1JL6 A; 1LFV B; 1HJT A; 1A6M A; 1YHU C; 3ASE A; 3RGK A; 1A6N A; 1OR6 A; 3QMA A; 2BKM A; 2ZLV B; 1NS9 B; 1XZ2 A; 4WJG A; 3O7N A; 1LH2 A; 5KKK A; 1I3D A; 3UH5 A; 6HBW B; 3KMF C; 1MBA A; 5CNE A; 1IWH B; 2MBW A; 3A0G B; 3HEN A; 107M A; 2ZT4 A; 1BIJ A; 3HRW A; 1FN3 A; 1O1P B; 3UHT A; 1SPE A; 3UHB A; 1G9V A; 1XZ2 B; 2ZSX A; 5HY8 A; 3QZZ A; 1ECA A; 1BIJ B; 3HRW B; 1O1N B; 1FN3 B; 1SHR B; 1EWA A; 4F6D A; 3WCU A; 1HBR B; 1TES A; 3WCV D; 3QJE A; 1G9V B; 2ZLX B; 1ASH A; 1DWT A; 3ORD A; 2W6W A; 3GYS A; 1GZX A; 2MHB A; 2FRK X; 3GK9 A; 1YVQ A; 2AV0 A; 2DXM A; 1NIH A; 3WCU B; 1EBC A; 3B75 A; 1G09 A; 1S0H B; 1LFZ B; 1MWD A; 3A5B A; 1MBS A; 3ZJI A; 1DO4 A; 5HAV A; 112M A; 3GYS B; 1GZX B; 1XZV A; 2OLP A; 2MHB B; 1YVQ B; 2DXM B; 1NIH B; 3G4V A; 1MYF A; 3B75 B; 1G09 B; 1YH9 A; 2NRM A; 1IT2 A; 4QAU A; 2R4Z A; 1Y09 A; 1YHU A; 1RTE A; 1MGN A; 1FSL A; 1COH A; 1Z8U B; 1HAC A; 3D17 B; 2AA1 B; 3UHZ A; 1AJG A; 2GLN A; 1Y09 B; 1YHU B; 4NZI A; 4JAC A; 3D4X B; 2MGC A; 1YMA A; 1COH B; 3MVC A; 1U7R A; 2GRF A; 3AT5 B; 1HAC B; 2W6Y A; 1HDA A; 2DC3 A; 1S5Y A; 1C7B A; 1MLL A; 4FH6 A; 3PT7 A; 1YEV B; 1Y35 A; 5EE4 C; 1S61 A; 1A3N A; 4MQK A; 1JF4 A; 1MBI A; 1J7Y A; 1SDL A; 1QSH A; 1HDA B; 1S5Y B; 4F6F A; 1UMO A; 1C7B B; 1HV4 A; 3NG6 A; 3PT7 B; 1Y35 B; 3G4U A; 1DLW A; 1A3N B; 4MQK B; 4GZG A; 4ROM A; 2FRJ X; 1J7Y B; 3ED9 A; 1O16 A; 4ZVA A; 2KSC A; 3TM3 A; 1JEB A; 3BJ2 B; 1S69 A; 3NG6 B; 1YCA A; 4MQJ A; 5B84 A; 3OK5 A; 111M A; 106M A; 4ROM B; 1HGB B; 2VEE A; 3A2G A; 2IG3 A; 1FCS A; 3G46 A; 1YFF A; 3UHU A; 1Y8K A; 2R4X A; 1DXD A; 1Y0W A; 4MQJ B; 3WCU D; 3CY5 A; 3IXF A; 2GRZ A; 1MTJ A; 2EVK A; 1MOA A; 2G0V A; 2MGF A; 4HSX A; 1YFF B; 1V9Q A; 3UGY A; 1GCV A; 1Y8K B; 2FAM A; 1Y0W B; 2R80 A; 1HHO A; 2ZSS A; 4HSW A; 3CY5 B; 1F5O A; 4MXK A; 4O35 A; 5B85 A; 1GCV B; 3LQD B; 1JZM A; 3ZJO A; 2R80 B; 1HHO B; 2MGG A; 1JZK A; 2EF2 A; 2V1E A; 1K1K A; 4OF9 A; 2HBD A; 7HBI A; 1Y8H A; 2XKG A; 2BLJ M; 1YIE B; 1SPG A; 4F68 A; 1DXU B; 101M A; 1Y7D B; 4ROL A; 5CN5 A; 4NK1 A; 4MAX A; 3ZJM A; 1K1K B; 4H2L A; 1Y8H B; 4O4Z A; 2SPN A; 1SPG B; 4B3W A; 2QRW A; 4IRO A; 3QM5 A; 3E5O A; 2HBF A; 2GRH A; 1BAB A; 1CP5 A; 1IDR A; 4H2L B; 2M6Z A; 1M6C A; 1S5X B; 2ZLT A; 3SDN A; 1GLI A; 1YVT B; 104M A; 3QJD A; 5EU2 A; 1MYG A; 5CMV A; 1SDK A; 3WCV C; 2HBF B; 3KUN A; 1BAB B; 1RQA A; 1O1I A; 1CPW A; 2MYC A; 1CO9 A; 2QSP A; 2ZWJ A; 3M38 A; 2ZLT B; 1BZ1 B; 3GQG A; 3QJD B; 2B7H A; 1RTX A; 1NQP A; 3NL7 A; 1SDK B; 108M A; 1YG5 A; 2G0X A; 1O1K B; 1X9F A; 4DWT A; 1RQA B; 1O1I B; 2O5L X; 2QSP B; 1CO8 A; 3QJB B; 3PI3 A; 1DLY A; 3GQG B; 2B7H B; 5KDQ A; 1NQP B; 1OUU A; 3NL7 B; 2HBC A; 3OO4 A; 1YG5 B; 1HGA A; 5JDO D; 1X9F B; 1S6A A; 2ZSP A; 1Y4Q B; 1GCW B; 1MLK A; 3LR7 A; 1OUT B; 5HU6 B; 1EW6 A; 2BLH A; 3M3A A; 1VXG A; 2H8D A; 5KDQ B; 2D2N A; 1OUU B; 2HBC B; 2H8F B; 5CN4 A; 2W72 C; 1HGA B; 2G11 A; 1YE0 A; 3AT6 A; 4O2G A; 2DHB B; 4ILZ A; 4WJG 1; 1G08 A; 1B0B A; 1DWS A; 1D8U A; 1NEJ B; 3P5Q B; 1YE0 B; 3ARJ A; 2VLX A; 3AT6 B; 3LB1 A; 3WI8 A; 1YDZ A; 1MLU A; 3HF4 A; 1IRD A; 4F6J A; 4FWX A; 1A4F A; 2VEB A; 1G08 B; 1MLN A; 1YOI A; 1VXB A; 1Y31 A; 3BJ1 A; 3EOK A; 1CH3 A; 1YDZ B; 1J40 A; 1F63 A; 1V75 A; 2LHB A; 3BA2 A; 3HF4 B; 1Y4F B; 1IRD B; 1UX9 A; 1MLO A; 1AJH A; 1QSI B; 5CND A; 4B4Y A; 1YHE A; 5ILE A; 1Y31 B; 1YGD A; 3EOK B; 1LFQ A; 2G12 A; 1MNK A; 1J40 B; 5CN7 A; 1V75 B; 1UIW B; 5CNF A; 1CG5 A; 1HBB B; 1JY7 A; 4F69 A; 4WCH D; 1Y5J A; 4YU4 A; 1Y7G A; 2OHA A; 1Y45 A; 4KN3 A; 2MB5 A; 2ZT3 A; 2LH3 A; 1WMU A; 1LFQ B; 2MGL A; 2EB8 A; 1HBA A; 4SDH A; 1IBE B; 4MQI A; 1CG5 B; 1JY7 B; 4MPM A; 2YRS A; 1GDL A; 1Y5J B; 1Y7G B; 3UBV A; 1QXE A; 2WTG A; 4N7P A; 1LH5 A; 3MYN A; 1WMU B; 1X9F D; 1HBS B; 3WCP B; 1HBA B; 4PNJ A; 4MQI B; 3IC2 B; 3PI2 A; 5F2A A; 3PIA A; 3G53 A; 2GNW A; 1YMB A; 3HC9 A; 3PI8 A; 2QLS A; 2YRS B; 1NZ5 A; 3WTG A; 5C6E A; 1O1M A; 1QXE B; 1XY0 A; 3ZHW A; 1UVX A; 4N7P B; 1BIN A; 1DO1 A; 1ECO A; 1NZ3 A; 1ABY B; 2EVP A; 2NSR A; 2EB9 A; 3UHH A; 3QQQ A; 1JDO A; 3PI8 B; 1MDN A; 2QLS B; 2D2N D; 3D7O A; 3WTG B; 5C6E B; 1O1M B; 1DKE A; 3HXN A; 4U8U D; 1NS6 A; 2JHO A; 5CNB A; 1FHJ A; 3MKB A; 1PBX A; 1JPB A; 2G10 A; 3D7O B; 1VXE A; 4JYQ A; 1DKE B; 3HXN B; 1NS6 B; 3VRG A; 3DHR A; 3FS4 A; 3KUO A; 1FLP A; 2LH6 A; 1K0Y A; 3PEL A; 5ILM A; 4M4A A; 3ZH0 A; 1PBX B; 4HRR A; 5HY8 B; 1A0Z A; 3WHM A; 4G51 A; 3GLN A; 3VRG B; 3DHR B; 3FS4 B; 1FDH G; 4PQC A; 4C0N A; 2WY4 A; 1Y4P A; 3PEL B; 3H58 A; 3QJE B; 4FH7 A; 1M9P A; 2GTL A; 3AQ6 A; 3WCT A; 4HRR B; 1A0Z B; 3WHM B; 1HSY A; 1YCB A; 4G51 B; 4N7O A; 3QM8 A; 1GVH A; 2BWH A; 3VRF A; 3IC0 A; 1A00 A; 4DC8 A; 5JOM A; 2GL3 A; 2ZT2 A; 1M9P B; 5MBA A; 3PI9 A; 1XZ5 A; 3S1J A; 5JDO C; 3HEP A; 1CBM A; 2QSS A; 1XZV B; 1YOG A; 3OZU A; 2AUO A; 4N7O B; 2E2Y A; 2FRI X; 1DUO A; 1Y46 A; 1JWN A; 1Q1F A; 3MJP A; 4KMW A; 3IC0 B; 2W31 A; 1YH9 B; 2ZT1 A; 2W6X A; 1QPW A; 1SI4 A; 1XZ5 B; 2D2M D; 1YIH A; 1L2K A; 4BJA A; 2QSS B; 4L2M A; 3OVU C; 1HAB A; 1Y46 B; 3LB4 A; 3MJP B; 1BVD A; 1MYZ A; 2SPO A; 3GKV A; 1QPW B; 2GNV A; 3HEO A; 5E83 A; 3ZOM A; 4AVE A; 3UHW A; 3S66 A; 2PEG A; 2D5Z A; 2VRY A; 1HAB B; 5M3S A; 5CNG A; 2LH1 A; 3MBA A; 1JP9 A; 2QMB A; 1MNO A; 1VXA A; 1Y0D A; 3GKV B; 1RPS A; 1J7W A; 2HBG A; 4G1B A; 5E83 B; 1SDL B; 1T1N A; 2ZFO D; 3S66 B; 2PEG B; 1BZR A; 2D5Z B; 1QSH B; 2EKT A; 4UIQ A; 2QMB B; 1HV4 B; 3GKT A; 3EDB A; 1Y0D B; 1LHT A; 6HBI A; 3OZV A; 2AV3 A; 3AQ5 A; 3K9Z A; 1CMY A; 2BNL A; 3ARK A; 1Y4R A; 3UH3 A; 1Y5K A; 3S48 C; 1MLQ A; 2HZ2 A; 3W4U A; 1YMC A; 2NRL A; 1LA6 A; 1JEB B; 1J41 A; 4HHB A; 1Y85 A; 5ILR A; 2BMM A; 1CMY B; 3DUT A; 1GJN A; 2MGM A; 2CMM A; 3D1K A; 3A9M A; 3SZK A; 1Y5K B; 1M6M A; 2ZT0 A; 3OO5 A; 3W4U B; 1LA6 B; 4PQB A; 5E29 A; 1Y83 A; 1V07 A; 1S56 A; 2AUQ A; 1Y2Z A; 2GDM A; 3WFU A; 4HHB B; 3G4Y A; 1OFJ A; 1DO7 A; 3DUT B; 4ESA A; 2GTL D; 1DO3 A; 3D1K B; 3WCT D; 3SZK B; 1X9F C; 3OO5 B; 1RQ3 A; 3QQR A; 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1U7S A; 3ECZ A; 4U8U B; 4F6I A; 3UHY A; 1ABS A; 3GQP B; 1IT3 A; 1V4W B; 1ECD A; 2VYZ A; 1LFL A; 4NXA A; 3GOU A; 1VRE A; 1BUW B; 1XZ4 B; 1JP6 A; 1O1O A; 3D1A B; 5IKS A; 3VRE A; 3LB3 A; 3WFX A; 3AQ7 A; 2ZS0 A; 3UHK A; 1LFL B; 3A59 A; 3GOU B; 2ZFO C; 1G0B A; 4N7N A; 3M39 A; 3ZJL A; 1A4F B; 1NAZ A; 2G0Z A; 3HHB A; 5ILP A; 3HYU A; 3ODQ A; 3E5I A; 3RJ6 A; 3H57 A; 3VRE B; 1SWM A; 4FWY A; 3BJ1 B; 1MYM A; 1J3Z A; 1MKO A; 3A59 B; 3M3B A; 1VXC A; 3ECL A; 1MBD A; 1G0B B; 2ZSQ A; 4N7N B; 1Y7C A; 1V4U A; 3HHB B; 3ODQ B; 3PI4 A; 1Y0C A; 2W6V A; 1CQ2 A; 2HHE A; 1YHE B; 3FH9 A; 2MYD A; 1YGD B; 1RQ4 A; 3WR1 A; 2ZSR A; 1H97 A; 1J3Z B; 1MKO B; 2ZSO A; 1YEO A; 1LH7 A; 2G0S A; 4F4O A; 3BCQ A; 1GDJ A; 2O5S X; 3K8B A; 1Y7C B; 2D2M A; 1MZ0 A; 1V4U B; 2DN2 A; 2V1I A; 2MGB A; 1Y0C B; 2W6V B; 4YU4 B; 2HHE B; 1Y45 B; 3FH9 B; 4XS0 A; 1Y8I A; 1RQ4 B; 2DN1 A; 2GTL C; 3NMM A; 4UZV A; 1A3O A; 3WCT C; 1YEO B; 4F4O B; 3BCQ B; 3AQ9 A; 3S1I A; 3A5A A; 3K8B B; 2ZSN A; 1THB A; 2D2M B; 1LFY A; 1DTI A; 1MOH A; 1CLS A; 2DN2 B; 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