The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSDLSNLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha subunit
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| publication title |
A pH-Dependent Aquomet-to-Hemichrome Transition in Crystalline Horse Methemoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
53
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LH7 A; 5ILR A; 2E2Y A; 4NI1 A; 2ZSN A; 3NG6 A; 1SHR B; 1QXD A; 3HC9 A; 1XQ5 B; 5EQM A; 3WCT D; 3UHH A; 4WJG 1; 1TES A; 5C6Y A; 1HBS B; 3EDA A; 3QJB B; 1VXF A; 1SPG A; 3SZK B; 4F6F A; 2DN3 A; 2QSS A; 1YCB A; 2VYY A; 1Y35 A; 102M A; 4MQI B; 1MOD A; 3NL7 A; 1JY7 A; 3UH3 A; 1BIN A; 1YVQ B; 1KR7 A; 3O89 A; 1CG8 B; 3UHS A; 2EB8 A; 5HLX A; 1A4F A; 3OJ1 A; 2DXM A; 3S48 C; 1MYF A; 1HCO B; 1G09 B; 1XZ4 A; 2LH1 A; 3PEL B; 1S0H A; 1O1N A; 1YH9 A; 5EU2 A; 1BVC A; 2ZSR A; 2ZFB B; 1DO7 A; 1LFZ B; 1SI4 B; 2QLS B; 1G9V B; 1HGA A; 1MYM A; 3HEP A; 1QPW A; 3M3B A; 2H8F A; 1THB A; 1IWH B; 1C7C A; 1FSX B; 1J7W A; 2D2N D; 3EOK B; 3HXN B; 1CMY A; 1Y85 A; 3BOM B; 2ZST A; 1Y0W B; 5CN8 A; 2BLI A; 4OF9 A; 1DLY A; 1O1J B; 2B7H A; 1BZ0 B; 1HAB A; 3D17 A; 1LH1 A; 1G0A B; 5SW7 A; 1XZ5 B; 1A0Z A; 1YFF A; 1MLH A; 1J41 A; 4FH6 A; 3M39 A; 1XZV B; 3WCU B; 2W6X A; 2ZT0 A; 3GQP A; 1C7D B; 1DWR A; 1H1X A; 2KSC A; 1HGB B; 1V75 A; 1AJ9 A; 3UHU A; 3MYM A; 1MLS A; 1URY A; 1K1K B; 3HYU B; 3WCV B; 1LJW B; 4UUR A; 1VHB A; 2HCO B; 4M4B A; 4F68 A; 1A6G A; 2O5B X; 3UHI A; 4WJG A; 1HBH A; 112M A; 1HLB A; 3IC2 A; 1Y8W A; 1Y2Z B; 5KDQ A; 2HBS B; 1AJG A; 3D7O A; 1HSY A; 1Y22 B; 3BJ1 B; 3VRF A; 4HBI A; 5HLU A; 1MTI A; 3G4R A; 2HBE B; 2BMM A; 3P5Q B; 1VXG A; 4N7O B; 1XY0 A; 3FH9 B; 4OOD A; 3CIU A; 3V2Z A; 2NSS A; 2G0S A; 4NXA A; 1O1K B; 3EU1 B; 1R1X A; 3WI8 A; 2JHO A; 3UHY A; 3QQQ A; 1BZR A; 4HRT A; 1YE0 B; 1GVH A; 1XZ2 B; 1O1I A; 3S1I A; 3W4U A; 1V9Q A; 5JDO C; 1PBX A; 1M6M A; 1IRD B; 1LFV B; 2VLX A; 3ZOL A; 1OUU B; 2ZT3 A; 3HF4 A; 3NMM B; 2MGH A; 2XKG A; 2W6V A; 1CO9 A; 2ZS1 B; 3UHX A; 1CIO A; 3QJC A; 2VLZ A; 3NFE B; 1MZ0 A; 1LFQ A; 1AZI A; 3UHC A; 2BWH A; 3GYS A; 3PI9 A; 2ZSY A; 3GDJ B; 1RVW B; 1SDK B; 3ZJO A; 4N8T A; 1BZZ B; 1FHJ B; 1NQP B; 2MYB A; 1HDB B; 3AT6 A; 5AZQ A; 1MLQ A; 1FLP A; 1RQA B; 3LHB A; 3QZX A; 3A59 B; 1HAC B; 5ILM A; 3OGB A; 2FRF A; 1VWT A; 1DXT A; 3PIA A; 4PQ6 A; 3OO4 B; 1MBA A; 3QMA A; 4QAU A; 4F69 A; 2G3H A; 1XXT A; 3S1J A; 4HHB B; 2ZT4 A; 1Z8U B; 1HV4 B; 1MYH A; 1YEV B; 3DHT B; 2YRS B; 1CH7 A; 1MKO B; 1Y0D B; 1JZK A; 4L2M A; 3MYN A; 1YDZ A; 3WR1 B; 4M4A B; 2M6Z A; 3MJU B; 1MNK A; 1NZ3 A; 3GOU A; 1Y4Q B; 3AQ7 A; 2ZS1 C; 2QFN A; 4G51 B; 4UIQ A; 2ZT1 A; 1U7S A; 4F6D A; 1MBI A; 2MYE A; 3ASE A; 1Y45 A; 2GRH A; 1T1N A; 3GKV B; 3ZJJ A; 1MYG A; 2HHD B; 1MOH A; 2VYZ A; 4MPM A; 1MNI A; 3WCP A; 1HHO B; 1Y8I A; 1Y0C B; 1K0Y B; 1BZ1 A; 3ZJM A; 3A9M A; 1ABW B; 1EMY A; 4L7Y A; 1BVD A; 3AG0 A; 1YEO A; 3PT8 B; 1Y7G B; 1COH B; 1JL7 A; 1X3K A; 1S5Y B; 1HBA A; 1GBU B; 3OO5 B; 3D1A A; 5EUI B; 1NZ5 A; 1YIE A; 3D1K A; 1Y5K A; 2W31 A; 1Y83 A; 2WY4 A; 2D2M A; 1KD2 B; 2RI4 B; 5CN5 A; 5HU6 A; 3IXF A; 1MLM A; 3VAU A; 1MYT A; 4MQG B; 1Y31 A; 1LUE A; 2C0K A; 2V1G A; 2H35 B; 2HBF A; 2AUO A; 1GDI A; 2WTG A; 3ECX A; 1OUT B; 1VXD A; 2GKM A; 2NRM A; 1OFJ A; 1DWT A; 1MOA A; 1O16 A; 1J7Y A; 1A9W E; 3WHM A; 1Y09 B; 1GCV B; 2VHB A; 4YU4 A; 5JDO D; 1CBL A; 1MNH A; 3PT7 B; 3WCV D; 3UHT A; 2PEG B; 4IRO B; 1Y8K B; 1HBB B; 1JL6 A; 1Y0A A; 3S65 A; 2GNW A; 1C7B B; 2FRI X; 1LHT A; 1QXE B; 1YMC A; 3WCW A; 1BIJ B; 3PI1 A; 3ODQ A; 1A3N B; 1Y4G A; 1V5H A; 1ECO A; 3HHB A; 1Y4V A; 1LFT B; 3TM3 A; 1Y7Z A; 3WTG B; 2DHB A; 111M A; 2EKU A; 3UH5 A; 1GDK A; 2D60 A; 2ZLW B; 2QSP B; 2ZLV B; 1JZM A; 1NIH B; 2HBC B; 1MBO A; 1JF4 A; 5B85 A; 3G52 A; 2ZLT B; 2HHE B; 1J3Y B; 1V4W B; 4JYQ A; 1CO8 A; 1BBB A; 2DC3 A; 1Y01 B; 3R5I B; 1IDR A; 2MGD A; 1YHR B; 4ROM A; 3MKB B; 5E83 B; 3G4W A; 1WLA A; 2MGK A; 5HY8 B; 3LR9 A; 2DN1 B; 1Y46 A; 1Y5F A; 2QMB B; 1ABY B; 1Y7D B; 1CLS A; 3TM9 A; 1YEQ B; 2ZS1 D; 1NEJ A; 1BZ6 A; 1Y5J B; 3B75 B; 1FSL A; 2G11 A; 1MBD A; 3UHD A; 1KFR A; 3QJE A; 2EVK A; 4FWX A; 1HDA A; 3WCW C; 4BJA A; 2LH2 A; 4MU5 A; 3RJN B; 1J7S B; 1UX8 A; 2FAM A; 2ZS0 B; 1LFL B; 1UIW A; 2ZSS A; 1CH4 A; 2ZSO A; 1S5X B; 1V4X A; 1CG5 A; 3CY5 B; 1YG5 B; 3U3E A; 1A3O A; 3H58 A; 1YEU B; 4MQJ A; 3ARK A; 3G4Q A; 1O1L B; 1X46 A; 2PGH A; 3FS4 B; 5EV5 A; 1Y7C A; 1VXB A; 3A5G A; 5E6E A; 2RAO B; 1G0B B; 1QSI B; 3E55 A; 2AA1 A; 1DKE B; 1MCY A; 4H07 A; 1F65 A; 3A5A A; 1XZU A; 3NG6 B; 1RQ3 A; 1YOG A; 5JGG A; 1SPE A; 1QXD B; 2BLH A; 1A0U A; 1HBS A; 5EOH A; 1LA6 A; 3G53 A; 1SPG B; 2DN3 B; 4MQI A; 1O1M B; 1G08 B; 4ZVB A; 2D5Z A; 2MYD A; 1Y35 B; 4HSX A; 1CH9 A; 2MGJ A; 4ODC A; 3EDB A; 1JY7 B; 4ESA A; 2ZLU B; 1EW6 A; 1VXC A; 2H8D A; 4ILZ A; 1UX9 A; 3MN0 A; 3OVU C; 2DXM B; 2OH8 A; 3PEL A; 1Q1F A; 4JAC A; 3UHQ A; 1XZ4 B; 1VXA A; 1UVX A; 2ZS0 C; 3AT5 A; 4H0B A; 1O1N B; 1YH9 B; 5CNG A; 1IRC A; 3GQR A; 1FCS A; 1LFZ A; 2R80 B; 2V1H A; 1YVT A; 1YGF A; 5JDO E; 1C40 A; 3QJD A; 1HGA B; 2ZFO C; 2IN4 A; 1QPW B; 1Y0T A; 2H8F B; 1YE2 A; 2DN2 A; 3VRG A; 1THB B; 1Y0W A; 2XKI A; 3GQG A; 1J7W B; 3K8B A; 1CMY B; 2MHB B; 1LFY B; 3ECZ A; 2V1J A; 1Y4F B; 1Y4B A; 1NAZ A; 2HBD A; 3QQR A; 1HAB B; 1YHU A; 3G46 A; 1L2K A; 5SW7 B; 3ZJP A; 1A0Z B; 1YFF B; 3ZH0 A; 3WCU A; 1XZ7 A; 1J41 B; 2GKN A; 4F4O A; 1CH2 A; 3D4X B; 3GQP B; 2QU0 A; 3E5I A; 1YCA A; 1AJ9 B; 1NWN A; 4KMV A; 1X9F A; 1BUW A; 2GRF A; 1GBV B; 3PI3 A; 2BKM A; 1VRE A; 3ZHW A; 4FC3 A; 2O5T X; 1HBI A; 2HBS A; 3IC2 B; 1GDL A; 1Y8W B; 2SPO A; 4MQC A; 3D7O B; 3WCW D; 3UHZ A; 2AV3 A; 2HBE A; 1JZL A; 2R1H B; 1UC3 A; 1BAB A; 4YU3 A; 1LH6 A; 2XKH A; 1VXE A; 3HEO A; 1W92 A; 2W72 A; 2BLJ M; 2O5L X; 1GCW B; 1XY0 B; 1BJE A; 3CIU B; 4O4Z A; 3UHR A; 1V07 A; 3M3A A; 1NZ2 A; 1R1Y B; 1YHU C; 4PQC A; 1QSH A; 103M A; 4DC7 A; 4HRT B; 1XZ2 A; 2MYA A; 2ZSP A; 2EF2 A; 2VEE A; 1HBR B; 1MDN A; 1Y8H A; 2G0R A; 1YZI A; 110M A; 108M A; 4GZG A; 1PBX B; 3QM7 A; 3LR7 A; 2GTL A; 1GZX A; 3NMM A; 1GLI B; 3HF4 B; 2W6V B; 1IOP A; 5EE4 C; 3LQD B; 3QJC B; 1LFQ B; 3BCQ A; 3ARJ A; 3BJ2 A; 3PI9 B; 1MBC A; 1CIK A; 4HRR A; 1IBE B; 3BJ3 A; 2ZS0 D; 1MYJ A; 4N8T B; 1MBS A; 1RQA A; 4HSW A; 5ILE A; 3AT6 B; 3ONZ A; 107M A; 3A59 A; 1CH5 A; 1HAC A; 4G1B A; 1J3Z A; 1RQ4 A; 2W72 C; 1MTJ A; 3OO4 A; 4H2L A; 2O5M X; 2SPM A; 1CQX A; 3UHV A; 1VWT B; 3GLN A; 1DXT B; 3PIA B; 2SPL A; 2ZFO D; 1YMA A; 2R4Z A; 4ROL A; 1HGC A; 3R0G A; 4PQB A; 4DWU A; 2HHB A; 2QFK A; 1XXT B; 4FWZ A; 4AVD A; 3WCT A; 6HBI A; 3KUO A; 4XS0 A; 1HRM A; 1RPS A; 5CN4 A; 2ZLX A; 2HZ3 A; 3AQ6 A; 1YDZ B; 1RTE A; 101M A; 2M6Z B; 4DC8 A; 3S66 A; 3AQ5 A; 1DXV B; 2R4Y A; 3SDH A; 1LH5 A; 1EBC A; 2BW9 M; 3QZZ A; 1MOC A; 2GNV A; 1NXF A; 1Y45 B; 1J52 A; 4X0L A; 5EYJ A; 1T1N B; 4KN3 A; 4VHB A; 3M38 A; 3K3U A; 5JDO F; 3DR9 A; 1LH7 A; 1A00 A; 4N7N A; 4MQK A; 2MB5 A; 1DTI A; 3WCP B; 4F6G A; 1Y8I B; 1BZ1 B; 1J40 A; 4MBN A; 1O1O A; 1OJ6 A; 3PT8 A; 4L7Y B; 2LH3 A; 1YEO B; 2D2N A; 3OZV A; 4F6J A; 1HBA B; 3AQ9 A; 1QI8 B; 3D1A B; 3MJP A; 5C6E A; 1YIE B; 1RTX A; 1A6N A; 2O58 X; 1KD2 A; 1Y5K B; 1MNO A; 2RI4 A; 1Y83 B; 4G1V A; 5KER A; 2D2M B; 5HU6 B; 1O1P B; 1I3D A; 1B86 B; 3G4Y A; 2Z6T A; 3LB4 A; 3WCT C; 3ZJN A; 2HBF B; 106M A; 1A01 B; 5CHQ A; 1OUT A; 1YHU D; 1MOB A; 2D6C A; 4FH7 A; 1J7Y B; 3WHM B; 5KKK A; 1GCV A; 3UHE A; 5CNB A; 4YU4 B; 3UHB A; 2MBW A; 2R50 A; 1YEN A; 2AUP A; 2SPN A; 2G0V A; 1HDS A; 3WFU A; 2OIF A; 1Y0A B; 3S65 B; 3PI2 A; 3DUT A; 1DXU B; 3UBC A; 3UGY A; 1M9P B; 3WCW B; 3VRE A; 2D5X A; 1A9W A; 2OHA A; 3NML A; 1YIH A; 3ODQ B; 1B0B A; 2VLY A; 1XYE B; 5D1V A; 1Y4G B; 1LFT A; 1N9X A; 1SDL B; 3WTG A; 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1N9H A; 2D5Z B; 3WFT A; 1HCO A; 104M A; 1A4F B; 1G09 A; 4B3W A; 4ODC B; 2ZLU A; 105M A; 4ESA B; 1S0H B; 2H8D B; 2IG3 A; 1AJH A; 2FRJ X; 2ZFB A; 3OZU A; 1SI4 A; 2QLS A; 5D5R A; 1G9V A; 1LH3 A; 3AT5 B; 1H97 A; 1MNJ A; 2R80 A; 3GQR B; 3OK5 A; 1OFK A; 1CPW A; 3UBV A; 1IWH A; 1FSX A; 2MGM A; 3EOK A; 3BOM A; 1YOH A; 3HXN A; 1YVT B; 1C7C B; 1YGF B; 2MGI A; 1HJT A; 1Y85 B; 1O1J A; 1C40 B; 3QJD B; 1ECD A; 1BZ0 A; 1RSE A; 3UHG A; 1Y0T B; 1YE2 B; 2MHB A; 1LFY A; 2DN2 B; 3VRG B; 2B7H B; 1G0A A; 3GQG B; 1Y4F A; 3K8B B; 2D2M D; 1XZ5 A; 3D17 B; 2AUR A; 1Y4B B; 2HBD B; 3MVC A; 1XZV A; 3KMF C; 2V1F A; 1YHU B; 1WVP A; 1C7D A; 4TWV A; 1S56 A; 3ZJH A; 1HGB A; 2ZT2 A; 1XZ7 B; 3ED9 A; 109M A; 1V75 B; 1K1K A; 3D4X A; 1JP6 A; 3HYU A; 4F4O B; 1J3F A; 3WCV A; 1LJW A; 1HBG A; 2HCO A; 2QU0 B; 3QM6 A; 2HBG A; 4M4B B; 3SDN A; 1GJN A; 1X9F B; 1CQ2 A; 1HBH B; 1Y2Z A; 1GBV A; 2NX0 A; 1BUW B; 4MXL A; 5KDQ B; 1UFP A; 1Y22 A; 1ASH A; 3KUN A; 3BJ1 A; 4FC3 B; 2OLP A; 3OZW A; 3VRF B; 5F2A A; 4LPI A; 3P5Q A; 2GDM A; 4N7O A; 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