The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
65
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
myoglobin
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| publication title |
Probing substates in sperm whale myoglobin using high-pressure crystallography.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
65
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-08-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GBU B; 1FAW A; 1S5X B; 1SPG B; 2ZFO A; 5KDQ B; 5AZQ A; 1BIJ A; 4TYX A; 1O1L A; 1ASH A; 1XZU A; 2HZ2 A; 3GOU B; 1BJE A; 3NL7 A; 4JYQ A; 4ROM B; 1YCB A; 3HF4 B; 1A00 B; 4F4O A; 1YEV B; 2W6W A; 4PQ6 A; 1V4W A; 3HHB B; 4C0N A; 2OHB A; 1A9W A; 3QZX A; 1YGD B; 1Y22 A; 1SHR A; 5ILP A; 111M A; 1EBT A; 1Y7D A; 3NG6 B; 1YIE A; 1Y4G B; 2G11 A; 1TES A; 3NMM A; 1YE2 B; 3HEN A; 3BJ1 B; 3ECL A; 2DC3 A; 3ARK A; 5EV5 A; 4MQK B; 2ZLT A; 2GTL C; 2MYC A; 2FAL A; 110M A; 3ZOL A; 5AZR A; 4NK2 A; 2ZFO D; 5CN8 A; 1Y85 A; 3MKB A; 3A59 B; 1HGC B; 1D8U A; 1YEU A; 1YMA A; 1YE0 B; 3EDB A; 3QJC B; 1Y7C B; 2LH3 A; 1K0Y B; 1BBB B; 2HHD A; 3BA2 A; 2ZLU B; 2BLH A; 1Y5K B; 109M A; 2ZFB B; 1GJN A; 1YH9 B; 1JY7 A; 2GNV A; 4YU4 A; 2V1G A; 3LB1 A; 4MQJ B; 1GDK A; 3AT5 B; 3H57 A; 2H8D A; 1A3O A; 3QM9 A; 2Z6N B; 4YU3 A; 1CG8 B; 3G4Q A; 1YHU B; 1CG5 A; 1Y4Q A; 1A6K A; 4HSW A; 5JDO C; 1HGB B; 1MTK A; 5CN4 A; 2BW9 M; 5EYJ A; 3W4U A; 3VRE A; 2VLZ A; 3OZU A; 4MQC A; 4OOD A; 2O5S X; 1HLB A; 3A9M A; 3ZOM A; 1YEQ A; 3GQG A; 1G09 B; 1U7R A; 3MJU B; 1BAB B; 4B3W A; 3GKV B; 5HU6 A; 3WR1 A; 4MQH B; 1URY A; 1RQ4 A; 2Z8A A; 1V4X B; 3OO4 B; 1T1N B; 4N7P B; 2ZSP A; 1LJW B; 1MOB A; 2G14 A; 1I3E A; 3MBA A; 2KSC A; 1LA6 A; 1VRF A; 2EB9 A; 4AVE A; 4UZV A; 1V4U B; 3QM6 A; 2G10 A; 1Y4V A; 1FCS A; 2B7H B; 1Y0W A; 1CMY B; 2ZS0 D; 3EDA A; 4ESA B; 3HYU B; 2VHB A; 4G1B A; 5F2A A; 1NQP B; 1VHB A; 1LFT B; 3S66 A; 1IT3 A; 4FC3 A; 4M4B A; 1HAB A; 1Y8K A; 3HXN A; 5D1V A; 3SZK A; 4ROL B; 1Y31 B; 1Y09 A; 1K1K B; 3WCP A; 3GYS A; 3BJ2 B; 2IG3 A; 4MXK A; 3PI1 A; 1A01 A; 3HRW A; 2ZSY A; 1XZ5 A; 5HLQ A; 3ASE A; 1J7Y B; 1RQA A; 1BVC A; 1JP9 A; 2XKG A; 5EOH A; 2LH2 A; 1THB A; 1LFV B; 1DXD A; 3PI8 B; 2EVP A; 2MGM A; 3HEO A; 3IC2 B; 1YHU C; 4F6J A; 2DN3 A; 1CH5 A; 2HBS A; 1O1N A; 3ZH0 A; 1QPW B; 1R1Y A; 1YGF B; 3UGZ A; 4G51 B; 1Y01 B; 1AZI A; 4MQG A; 1Y8W A; 1YFF B; 3AT6 B; 3UHH A; 5C6E A; 1HGA A; 1IRD B; 4F6I A; 1MYM A; 5IKS A; 1SWM A; 2ZLV B; 1GDJ A; 1J41 B; 3ZJO A; 1HBA B; 2GKM A; 5EE4 C; 1VWT B; 3ZJP A; 3P5Q A; 1YIH A; 2HBG A; 2BK9 A; 2CMM A; 1BVD A; 1OUT A; 2ZWJ A; 2VYW A; 5JGG B; 1MLQ A; 1CH1 A; 1NEJ A; 1J3Z B; 2GRF A; 1CH3 A; 1C7B B; 1A0Z B; 1WLA A; 1MBN A; 1FHJ A; 1J7W B; 4WCH D; 2HHE A; 1DXT B; 1MBA A; 4F6F A; 3QM8 A; 1DTI A; 3PIA B; 1EBC A; 5CNF A; 1HBB B; 2SPN A; 2D2N A; 3D1K B; 1R1X A; 2VLX A; 3A0G A; 1V75 B; 4X0L B; 1YVQ B; 5HLX A; 2R4X A; 1LH2 A; 1UVY A; 1UFJ A; 1A3N A; 1FDH A; 2ZT1 A; 1J52 A; 1Y2Z B; 1MBD A; 2Z85 A; 3QJB B; 2QSP A; 3BOM B; 3ARL A; 3LB3 A; 3R5I B; 4PNJ A; 2HCO B; 1HDB A; 2HBD A; 2R80 A; 1TU9 A; 1WVP A; 101M A; 1A0U A; 1FAW B; 2ZFO B; 1UX9 A; 1NZ5 A; 2G3H A; 2MHB A; 2IN4 A; 1O1L B; 1J40 B; 1RPS B; 2MGG A; 1XZU B; 1S0H B; 1BUW A; 1QSH A; 1RVW A; 4HHB A; 3NL7 B; 3PI9 A; 3UH5 A; 1X3K A; 1DLY A; 3A5A A; 2PGH A; 2ZT2 A; 2HBE B; 3UHC A; 4F4O B; 2WY4 A; 1V4W B; 1G0A A; 1CLS A; 4MQI B; 4HRR A; 5MBA A; 3KMF A; 1Y22 B; 1CO8 A; 7HBI A; 3QM5 A; 2ZLW A; 1Y7D B; 3BJ3 A; 3D7O A; 3WCT D; 3WCU A; 1YIE B; 1MOA A; 1LFY A; 3MJP A; 1GBV A; 3NMM B; 1A4F A; 2ZSQ A; 1XZ4 A; 1LFZ B; 3ED9 A; 1V9Q A; 2AUP A; 4NK1 A; 2HZ3 A; 1VXA A; 3K9Z A; 1LFL A; 1Y4P A; 1Y4B A; 3B75 B; 4XS0 B; 2HHD B; 4DC7 A; 3S65 A; 5HY8 A; 2OH9 A; 1G08 A; 1JY7 B; 1MLO A; 4YU4 B; 2ZS0 B; 2H8D B; 4YU3 B; 1BZ6 A; 1FSX A; 1O1J A; 2OIF A; 1Y8H B; 3WCU D; 1YEO A; 3BCQ A; 4FWZ A; 3PT8 B; 3GLN A; 4F68 A; 1HHO A; 4IRO A; 2ZFO C; 3VRE B; 4MQC B; 1M6C A; 1Y0C B; 2HHB A; 2PEG A; 1QXE A; 4FH7 A; 1YEQ B; 1MYH A; 1MYG A; 2G0Z A; 3LHB A; 1MNH A; 1NWI A; 5HU6 B; 1LFQ A; 3WR1 B; 1JWN A; 1RQ4 B; 3OO5 A; 2MGB A; 3EU1 B; 1MLK A; 1M9P B; 2GRZ A; 3G4V A; 1OBM A; 2RI4 A; 1SI4 A; 3OVU C; 1OR6 A; 1UC3 A; 2D60 B; 1Y4V B; 3EOK A; 1DXC A; 1Y0W B; 1O1O A; 1Y46 A; 3UGY A; 3G4Y A; 1WMU B; 2G0X A; 2OHA A; 1N9H A; 4ZVA A; 1MYJ A; 4F6D A; 3MN0 A; 3PI4 A; 1MLG A; 1XZ7 B; 3S66 B; 2M6Z A; 1NGK A; 4FC3 B; 2AA1 B; 2R4Y A; 1HAB B; 5F0B A; 2D5Z B; 1Y8K B; 2XYK A; 1JP8 A; 3HXN B; 3QQQ A; 5ILM A; 2QU0 A; 3ODQ A; 3SZK B; 5ILR A; 1Y09 B; 2ZLX A; 4JAC A; 2SPO A; 1DKE A; 1YOH A; 1MWB A; 3WCP B; 4HRT A; 3DUT A; 1XZV A; 1MOC A; 4F69 A; 1GCV B; 1LTW A; 1A01 B; 3HRW B; 1RTE A; 1QXD A; 1XZ5 B; 1O1P A; 1MDN A; 1RQA B; 2EF2 A; 2MYB A; 3WCW A; 1MOD A; 1Y35 A; 3VRF A; 1EWA A; 4MAX A; 2ZS0 C; 1SDK A; 1THB B; 3D17 B; 5EET A; 2ZST A; 1O1M A; 3O89 A; 1NAZ A; 1HAC B; 1MNJ A; 2DN3 B; 1O1N B; 2ZT4 A; 1R1Y B; 3M3B A; 1QI8 A; 1NZ2 A; 2MGL A; 1HCO B; 1V5H A; 3VRG A; 3HEP A; 1GDL A; 1IBE A; 1XXT A; 2MGF A; 5C6E B; 1HBH B; 1HGA B; 1C7D A; 1DO7 A; 3S1J A; 5AB8 A; 2AUQ A; 3M3A A; 1MYF A; 3GDJ A; 3QJD B; 1JZL A; 3UHS A; 1KD2 B; 4O4T A; 1C40 A; 3PI3 A; 1YHE A; 1VXF A; 3R0G A; 2HBF B; 3S1I A; 1LUE A; 3WCV A; 1YIH B; 1DXU B; 1DO4 A; 3WCW D; 1OUT B; 4MBA A; 2ZS1 A; 5MBN A; 1LH1 A; 1NEJ B; 1NXF A; 2QSS A; 1Y83 A; 1JZK A; 3KUO A; 1OFK A; 1UMO A; 3ZJH A; 1JPB A; 5B85 A; 3ZJS A; 4H2L A; 5D5R A; 1FHJ B; 1HBI A; 1LH6 A; 2HHE B; 1B86 A; 1VXG A; 2R4Z A; 3M38 A; 4KMW A; 2VLY A; 3PI2 A; 1YZI A; 4LPI A; 2JHO A; 2SPL A; 2HBC A; 1CH4 A; 3A0G B; 1VXB A; 1O1K A; 108M A; 1MBO A; 1O16 A; 3LQD A; 1A3N B; 1YVT A; 4FH6 A; 4M4A A; 3WCV D; 112M A; 2HZ1 A; 3WCT B; 2QSP B; 2VYY A; 3G46 A; 3FS4 A; 1YEN A; 1Y0T B; 1JEB B; 1CIO A; 1Y8I A; 2ZS1 D; 2R80 B; 1BZR A; 3O7N A; 1A0U B; 1HDS A; 1XYE A; 2W31 A; 2RAO A; 2MHB B; 3ECX A; 3WFW A; 2BMM A; 2V1F A; 1CBL A; 1BUW B; 2O58 X; 4HHB B; 1QSH B; 1RVW B; 4PQB A; 2DN1 B; 1GLI A; 1ABW B; 3WFT A; 5EUI A; 2MGI A; 1JL6 A; 4UIQ A; 1JF4 A; 2PGH B; 2D2M A; 2C0K A; 2O5M X; 1G0A B; 1CLS B; 3ZJJ A; 1G9V A; 1MNO A; 4HRR B; 1F5P A; 1AJH A; 4DC8 A; 2WTH A; 1GBU A; 1CQX A; 1S5Y A; 3OGB A; 2ZLW B; 3D7O B; 4N7O A; 3WCU B; 1LFY B; 2V1J A; 3ORD A; 1A4F B; 2W6Y A; 1DXV A; 1XZ4 B; 3QQR A; 3U3E A; 1YMB A; 3V2Z A; 3WHM B; 3HF4 A; 1COH B; 3D4X A; 3HHB A; 4XDI A; 1O1I B; 2AUO A; 1Y4B B; 1YGD A; 3SDN A; 1N9X A; 1YDZ B; 1Y5F B; 1IWH A; 5HY8 B; 3S65 B; 2MBW A; 3WFX A; 1ABY B; 1YMC A; 3NG6 A; 3GQP A; 3M39 A; 2W6V A; 3A5G A; 1Y4G A; 5CHR A; 4VHB A; 1PMB A; 1YE2 A; 3IC0 A; 2BLJ M; 1G08 B; 1CQ2 A; 3WFU A; 3WCT C; 1V07 A; 3K8B A; 1PBX A; 6HBI A; 1J7S B; 1FSX B; 1O1J B; 2MGA A; 3BCQ B; 1ECA A; 5EQM A; 107M A; 1JDO A; 1HLM A; 1Y7C A; 1HHO B; 1J3F A; 1LHT A; 4IRO B; 1K0Y A; 1ECO A; 2NSR A; 1FN3 A; 1UX8 A; 4O4Z A; 3H58 A; 2PEG B; 3S48 C; 2GL3 A; 3AG0 A; 1BZZ B; 1W92 A; 5E83 A; 1LFQ B; 1IOP A; 1MLR A; 1EW6 A; 4KN3 A; 3OO5 B; 2ZSS A; 1MGN A; 3G4U A; 102M A; 1CP0 A; 2R4W A; 2VM0 A; 1HBS A; 1MLM A; 2VRY A; 2Z6N A; 3PEL A; 5EYS A; 1CG8 A; 3GKT A; 2RI4 B; 4H0B A; 1NS9 A; 1YHU A; 3G52 A; 2ZSZ A; 2O5Q X; 3AQ9 A; 1Y0D B; 2QMB B; 4NI0 B; 3LR7 A; 3EOK B; 1O1O B; 3WCU C; 1UFP A; 4U8U A; 1MWC A; 3UHN A; 5HLU A; 2DHB B; 3UHU A; 3MJU A; 1ABS A; 1BZ1 B; 4BJA A; 4N8T B; 3GKV A; 1BIN A; 3GQR B; 1A6N A; 2W72 A; 1T1N A; 3ZHW A; 2H35 B; 1XZ2 A; 1Q1F A; 3IA3 B; 2QU0 B; 1YG5 A; 3ODQ B; 5E6E A; 2AUR A; 2ZLX B; 2O5T X; 2MGC A; 1DKE B; 1ECD A; 1BIJ B; 4HRT B; 3DUT B; 1XZV B; 5KER A; 1V4U A; 1RQ3 A; 5CN5 A; 3SDH A; 4L7Y A; 1NWN A; 1QXD B; 2XKI A; 2D2N D; 1O1P B; 1OR4 A; 1MLS A; 3WCW B; 1Y35 B; 3VRF B; 2NRM A; 3UHE A; 1KR7 A; 3ONZ A; 3QJE A; 2MGD A; 1GDI A; 1DTM A; 1O1M B; 1CPW A; 1SHR B; 4U8U D; 2AV3 A; 1QI8 B; 3UHD A; 2DXM A; 2BWH A; 1Y31 A; 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1JF3 A; 3GYS B; 1VXD A; 1G9V B; 2EB8 A; 3UHI A; 4N7N A; 1CH2 A; 1MKO A; 1MYZ A; 1DLW A; 1DM1 A; 1S5Y B; 3K3U A; 5JDO E; 4N7O B; 2ZS1 C; 104M A; 1J40 A; 1RPS A; 1S0H A; 1DXV B; 2Z6S A; 2HBS B; 1LHS A; 2MGE A; 2SPM A; 1IRC A; 4F6G A; 2HBE A; 2O5L X; 2MGJ A; 4MQG B; 5CNE A; 3D4X B; 1GZX A; 1Y8W B; 3GK9 A; 4MQI A; 1BZ0 A; 4NXC A; 3UHG A; 5E29 A; 1MLN A; 1IWH B; 4NS2 A; 3GQP B; 2W6V B; 1C7C A; 1DWS A; 1S56 A; 1SPE A; 3IC0 B; 3VAU A; 1L2K A; 2W6X A; 1Y7Z A; 2GLN A; 1LFZ A; 3K8B B; 3UHR A; 3P5Q B; 2NRL A; 1PBX B; 2D5X A; 3UHQ A; 3HC9 A; 3ZJQ A; 1HJT A; 4TWV A; 1F63 A; 1FN3 B; 3B75 A; 4XS0 A; 3MYN A; 1DWR A; 1VXE A; 3OK5 A; 1S61 A; 2QFK A; 1Y4F A; 2V1I A; 5E83 B; 1NIH A; 1HBR A; 3CY5 A; 3ZJN A; 1HBS B; 1VXC A; 2D2M C; 2ZS0 A; 2R1H A; 3UBC A; 2D2N B; 3PEL B; 1VXH A; 1R1X B; 1Y8H A; 2VEB A; 1NS9 B; 3CIU A; 3PT8 A; 3MOU A; 103M A; 3ZJR A; 4U8U B; 1Y0C A; 5KKK A; 1HDA A; 1MLL A; 2GTL A; 3UHV A; 5CNG A; 3WTG A; 2LH7 A; 1MTI A; 2V1K A; 1HDB B; 2HBD B; 2W72 B; 3EU1 A; 1A6G A; 1M9P A; 2OLP A; 1XZ2 B; 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