The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
149
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structure length |
149
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Chain Sequence |
HEHCCSEEDHRIVQKQWDILWRDTESSKIKIGFGRLLLTKLAKDIPEVNDLFKRVDIEHAEGPKFSAHALRILNGLDLAINLLDDPPALDAALDHLAHQHEVREGVQKAHFKKFGEILATGLPQVLDDYDALAWKSCLKGILTKISSRL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Lumbricus erythrocruorin at 3.5 a resolution: architecture of a megadalton respiratory complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Extracellular globin 4
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| total genus |
50
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| structure length |
149
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| sequence length |
149
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| chains with identical sequence |
G, K
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5CNB A; 3GQG B; 4IT8 A; 1Y0D B; 3WCV C; 3QJE A; 1A00 A; 3UHH A; 5ILP A; 1A9W E; 1NXF A; 1XQ5 A; 2ZSS A; 1ECA A; 2ZS1 B; 1CO8 A; 1DTM A; 1XZ2 B; 3FH9 A; 1LH3 A; 1JY7 A; 1Y7D A; 1IWH B; 1HAC A; 1HGC A; 1SDL B; 2MGM A; 2M6Z A; 1BUW B; 4U8U D; 1MOH A; 3WHM A; 2C0K A; 2EVK A; 5JGG B; 1K0Y A; 1HBA A; 4H07 A; 3NL7 B; 1JL7 A; 1J7W B; 2VLY A; 3IC2 A; 2ZSX A; 1B0B A; 1T1N A; 4U8U B; 1Y09 B; 3BOM A; 3OO5 A; 2MGI A; 2DXM A; 1BVD A; 2HBD B; 3G46 A; 4YU3 A; 4MBN A; 1N9I A; 4F6F A; 1MLH A; 1Y2Z A; 1G09 A; 1G08 B; 1OR4 A; 1VXB A; 1JY7 B; 1LFV A; 4O4Z A; 1HBG A; 1OR6 A; 2M6Z B; 3A59 A; 4N7N A; 2SPO A; 3KMF A; 2ZS0 D; 3WHM B; 3WCW A; 1K0Y B; 1F63 A; 4ZVB A; 2OHB A; 3UHB A; 2GTL D; 4SDH A; 1N9F A; 2EF2 A; 1PBX A; 1T1N B; 1CG8 A; 3M38 A; 1QXE B; 1S0H A; 2ZS0 B; 4X0L B; 1YE2 B; 2G10 A; 2DXM B; 3OK5 A; 1KD2 A; 1Y4R A; 2GTL B; 2D2N A; 3KUN A; 4YU3 B; 1DXU A; 2ZT0 A; 1DKE A; 3ZJO A; 1RQ3 A; 1OJ6 A; 2Z6N A; 1GDI A; 3ONZ A; 1GCV B; 4XS0 A; 4FC3 B; 1LFV B; 2ZST A; 1MLQ A; 3MN0 A; 5HU6 A; 3HYU A; 3GYS A; 1MGN A; 2RI4 A; 3IC0 A; 3A59 B; 3VHB A; 1YIE B; 2H8F A; 2SPL A; 4NS2 A; 1O1J A; 1FDH A; 3HF4 B; 3AQ7 A; 3AT6 B; 1CH2 A; 1JEB B; 2D2N D; 3MKB A; 3GQP A; 1DO1 A; 3H58 A; 1PBX B; 104M A; 1O1L B; 4FWY A; 2BKM A; 3HEN A; 1I3D A; 1LFZ A; 2YRS A; 2D60 B; 2BWH A; 2D2N B; 1DXU B; 5JDO F; 2LHB A; 3S66 A; 3EDA A; 4HHB A; 4MBA A; 2D5Z A; 1S5X A; 1YHU A; 2Z6N B; 4NI1 B; 1GBV A; 5HU6 B; 1BZ0 A; 1IRD A; 3HYU B; 3A0G A; 3UHX A; 3UHZ A; 2H8F B; 3ZJI A; 2IN4 A; 2D2M C; 3G52 A; 3K8B B; 2AUR A; 5F2A A; 1AJH A; 4F6I A; 1S56 A; 1SWM A; 3AQ8 A; 2QRW A; 5CNF A; 1F5O A; 1HDA A; 1UVY A; 3EU1 A; 5EQM A; 1R1X B; 1HBB A; 1YHU D; 4MXL A; 3OVU C; 1G0B A; 3BJ3 B; 4GZG A; 5CN9 A; 3LQD A; 3PEL A; 4BJA A; 1NS9 B; 2ZLT A; 3NML A; 2W72 A; 2SPM A; 4F6G A; 1S5X B; 1MYF A; 1YHU B; 5CN5 A; 1URY A; 5E29 B; 1XZ7 B; 1NEJ B; 2V1K A; 1DLY A; 2LH5 A; 1OUU B; 3ZJH A; 1IRD B; 1HSY A; 1Y8W B; 5B85 A; 1BAB B; 2AA1 A; 1MOB A; 3WI8 A; 3PT8 B; 2ZS0 C; 2RAO B; 3H57 A; 1HGA B; 1A3O A; 3OZV A; 3MOU A; 3ZOL A; 3G53 A; 1HBB B; 2VRY A; 3QZZ A; 3UHV A; 3ZH0 A; 1AZI A; 1BZP A; 1Y7C B; 1TES A; 2ZLT B; 1GLI A; 3LR7 A; 4WJG A; 3D4X A; 2BLH A; 6HBI A; 2GRF A; 1UX9 A; 1HV4 A; 1Y45 B; 1MOC A; 2ZFO A; 1MDN A; 2AA1 B; 1Y35 B; 1UIW B; 1CQX A; 1YMC A; 1A3O B; 3HEP A; 3UHR A; 2R1H B; 5JOM A; 2MGB A; 4DC8 A; 4MPM A; 1Y5K A; 2HHE A; 3PI3 A; 3PI9 B; 1F5P A; 1YIH B; 3QMA A; 1RQA A; 3DUT B; 2VLZ A; 1C7D A; 3GQR A; 2HZ1 A; 1GLI B; 1LFT B; 1FSL A; 3PIA A; 1X9F D; 3UHW A; 5EV5 A; 2Z8A A; 2MGG A; 3WFT A; 3HHB B; 4DC7 A; 102M A; 5CN4 A; 3WTG B; 4JYQ A; 1SDK B; 5EUI A; 3RGK A; 4N8T A; 3VAU A; 3G4V A; 1X9F B; 1VXE A; 2G0X A; 2MGJ A; 2R80 B; 1UFJ A; 5HLX A; 2QSP A; 3ZOM A; 1Y4V B; 4N7P A; 3SDH A; 2HHE B; 3EOK A; 1YMB A; 1YEU A; 1IBE A; 1L2K A; 1RQA B; 4O2G A; 1JZK A; 1Y8I B; 1V75 A; 3MVC A; 3GKT A; 2HBS A; 1HBS B; 2ZSY A; 3VRF A; 4MQK B; 4OF9 A; 3PIA B; 4MQH B; 2ZSR A; 1VWT B; 1YGF B; 4KMV A; 5CNE A; 1MBC A; 1Y46 B; 5EUI B; 4N8T B; 1WMU A; 3FS4 A; 3WCU A; 3NG6 A; 3GDJ A; 3WCT A; 2QSP B; 3LR9 A; 1NPF A; 3PI8 B; 3UHI A; 4VHB A; 1YEU B; 1IBE B; 1H97 A; 1MBS A; 1Y8K A; 1MTK A; 2QLS A; 1Y7G A; 3M3A A; 4IRO A; 1DXV B; 4G1V A; 3WCU D; 1YVT A; 3WCT D; 5CN8 A; 2VYW A; 5JDO E; 3OZW A; 3D1K B; 1B86 B; 1CH7 A; 1G0A A; 1WMU B; 1VXH A; 3ODQ A; 1YFF B; 2GDM A; 4H2L A; 1COH A; 3WCU B; 3UHD A; 3WCT B; 3UHE A; 2HBG A; 3UGY A; 3W4U A; 5C6E A; 3QM5 A; 1O1O B; 1SHR B; 5CND A; 4NZI A; 1XZV B; 3GOU B; 1IT2 A; 1VXC A; 1LA6 B; 2QLS B; 2IG3 A; 2FRJ X; 2GNV A; 3V2V A; 1DXD A; 3HEO A; 1LFY B; 1C7C A; 1LHT A; 1YVT B; 1Y0W B; 1J7S A; 4G51 A; 1Y8H A; 1ABW A; 2H8D B; 1DM1 A; 2MGA A; 4KN3 A; 5HLQ A; 5MBN A; 5C6E B; 1YEV A; 3ZJJ A; 3DHT B; 1O1N B; 1HDS A; 2DN2 A; 1Y85 B; 1YEQ B; 4L7Y A; 1NIH A; 2ZSO A; 1WVP A; 2VEE A; 2W6V B; 1CP0 A; 4C44 A; 1C7C B; 1JPB A; 1GDL A; 3U3E A; 1FSX A; 1A01 B; 2VYZ A; 5E83 A; 2HBE A; 4G51 B; 4QAU A; 1MWD A; 1ABW B; 3ECX A; 3WFX A; 1NGK A; 1MLO A; 2MHB A; 1XYE A; 1CH4 A; 4WJG 1; 4MQG A; 1YE0 A; 1A6M A; 3CIU A; 1YGD A; 1HDS B; 3AQ5 A; 3DHR A; 2BLJ M; 2ZSZ A; 3OZU A; 1AJG A; 1SI4 B; 1MNI A; 4PNJ A; 5EE4 C; 1HBI A; 2VYY A; 3D1A B; 3HRW A; 1O1I B; 2DHB A; 1Y0C A; 5E83 B; 2HBC A; 1HRM A; 1V4U B; 2HBE B; 1G9V B; 1CLS B; 1LJW B; 3PT7 B; 5E6E B; 4FH7 A; 1EWA A; 1LH2 A; 3UH3 A; 3ASE A; 3G4Q A; 1XYE B; 3ECL A; 3GLN A; 3GKV B; 1J3Y B; 1JF3 A; 2ZLW B; 2V1H A; 4F68 A; 3CY5 A; 3DHR B; 4MQI B; 1ASH A; 1CH9 A; 1YOG A; 1QXD A; 111M A; 3QJE B; 1A00 B; 4DWT A; 4YU4 A; 5JDO D; 2OH8 A; 105M A; 1XQ5 B; 4PQC A; 1JWN A; 2DHB B; 1GDJ A; 4B4Y A; 2R50 A; 2ZLU A; 3FH9 B; 1SPG A; 1A0Z A; 1Y7D B; 1HGC B; 1HAC B; 2ZT1 A; 1X46 A; 2Z6T A; 3LB4 A; 1CO9 A; 1Y01 B; 2V1G A; 1Z8U B; 2KSC A; 1NQP A; 1MCY A; 1Y4B A; 1HBA B; 3IC2 B; 1EBT A; 1RVW A; 3VRG A; 2VHB A; 3CY5 B; 1LFQ A; 1YZI A; 1MZ0 A; 3ZJS A; 4C0N A; 1BZ1 A; 3BOM B; 1A4F A; 1Y31 A; 3OO5 B; 1Y22 A; 1J7Y A; 3S65 A; 3D7O A; 4G1B A; 3WCW D; 1O1P A; 1Y2Z B; 1G09 B; 2HZ3 A; 2ZLU B; 3A5A A; 1XXT A; 2MYC A; 1HCO A; 1QSH A; 1CP5 A; 1YOI A; 2MYB A; 1BJE A; 1HLM A; 3KUO A; 3QJD A; 1LTW A; 1ECN A; 4N7N B; 2ZLV A; 2AV3 A; 3WCW B; 1Y5J A; 3E5I A; 4PQB A; 1CIO A; 3AT5 A; 4MU5 A; 4N7O A; 1THB A; 5D1V A; 2BMM A; 1CG5 A; 3VRG B; 1MNJ A; 1CG8 B; 1GZX A; 1S0H B; 2ZS1 C; 2W31 A; 1YDZ A; 1NZ5 A; 2O5L X; 1Y22 B; 1KD2 B; 1Y4R B; 1A6N A; 1OBM A; 1DKE B; 3OJ1 A; 3RJN B; 3TM9 A; 1RQ3 B; 2NX0 A; 5HAV A; 3NMM A; 5HBI A; 2QSS A; 1HCO B; 3ONZ B; 4XS0 B; 1Y4G A; 2GNW A; 1XZU A; 3GYS B; 2RI4 B; 3IC0 B; 1S61 A; 4U8U C; 1MLM A; 2HHB A; 1J40 A; 1O1J B; 1Y83 A; 1YCB A; 2H35 A; 4KJT A; 1DWT A; 3MKB B; 2LH2 A; 3GQP B; 4HRT A; 1GZX B; 1YVQ A; 2WTH A; 4TWU A; 2XKH A; 1DXT A; 3UHS A; 1LFZ B; 2YRS B; 4NK2 A; 5JDO C; 3S66 B; 4HHB B; 2D5Z B; 3BJ1 A; 2FAL A; 1CH5 A; 1Y4G B; 1RQ4 A; 3P5Q A; 1XY0 A; 1GBV B; 1BZ0 B; 3ARL A; 3R5I A; 1D8U A; 1A0U A; 3A0G B; 1GBU A; 4NI0 A; 1LHS A; 1MLN A; 2HHB B; 5CNC A; 1GCW A; 1C40 A; 1HJT A; 2V1I A; 3UI0 A; 2GTL C; 1HDA B; 3EU1 B; 3R0G A; 109M A; 2NSS A; 1G0B B; 3LQD B; 3PEL B; 1FDH G; 106M A; 2QU0 A; 2QFK A; 2GKN A; 1BZZ A; 6HBW A; 4HBI A; 2W72 B; 3B75 A; 1TU9 A; 1A3N A; 2FAM A; 2HHD A; 1VXG A; 3BJ1 B; 3ED9 A; 2O5M X; 1JZM A; 4HRR A; 1J3F A; 1LH6 A; 5HY8 A; 3R5I B; 2G0V A; 4NXC A; 1RPS A; 2EKU A; 4NI0 B; 4MAX A; 1V4X A; 1MWB A; 5CHQ A; 3QZX A; 1DLW A; 1IOP A; 4LPI A; 2JHO A; 1JP6 A; 4MQJ A; 2D5X A; 3OO4 A; 2D2N C; 5ILE A; 4JAC A; 5KDQ A; 1MOA A; 1MKO A; 1C7B A; 2QU0 B; 1CIK A; 6HBW B; 3AQ9 A; 2EVP A; 1BZ6 A; 1H1X A; 2ZFO D; 2HHD B; 2BNL A; 2NRM A; 2ZWJ A; 2MGH A; 3D4X B; 1MLR A; 1HHO A; 4HRR B; 3ZHW A; 5ILM A; 1HV4 B; 2ZFO B; 3QM7 A; 3UBC A; 1RPS B; 1HLB A; 1S69 A; 1V4X B; 3E55 A; 2QFN A; 2G0R A; 1LUE A; 2W6Y A; 3OGB A; 2OH9 A; 1Y5K B; 1HGB A; 1ABY A; 2O5S X; 4ROM A; 1YHU C; 1O16 A; 5MBA A; 1C7D B; 3GQR B; 1FAW A; 1C7B B; 4UIQ A; 2EB8 A; 4M4A A; 3TM3 A; 4ILZ A; 1LH1 A; 4O1T A; 1Y4Q A; 1V5H A; 2MB5 A; 1S6A A; 1BIJ A; 3MJU A; 1ABS A; 2R4Y A; 3QM8 A; 1N9H A; 4N7P B; 1NZ2 A; 1Y4P A; 3WCV A; 4MQC A; 1HGB B; 3EOK B; 2HBF A; 3G4U A; 1XZ5 A; 1HAB A; 1HBR A; 3AG0 A; 1V75 B; 3QJC A; 2HBS B; 1K1K A; 1FAW B; 3VRF B; 3A2G A; 2O5B X; 1FCS A; 1Y4F A; 2HZ2 A; 3BA2 A; 1NAZ A; 1Y5F A; 2PGH A; 1MTI A; 2DN3 A; 3ECZ A; 3FS4 B; 4M4B A; 1YH9 A; 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3QM6 A; 3WR1 B; 1MBA A; 3WCU C; 1J7W A; 3WCT C; 1IDR A; 1FSX B; 1YG5 A; 4U8U A; 1Y09 A; 2D2M A; 1FLP A; 3IXF A; 1Y7Z B; 2HBD A; 1Y0T B; 3LHB A; 2MHB B; 2BW9 M; 1MYT A; 1CBM A; 4MQG B; 1YE0 B; 1G08 A; 3CIU B; 1YGD B; 2MGD A; 7HBI A; 2SPN A; 5M3S A; 5CMV A; 1M6C A; 2W6W A; 2W6X A; 4B3W A; 2D2M D; 2AUQ A; 1DUO A; 3HRW B; 2ZFB A; 3A5G A; 1DO4 A; 2MYE A; 1Y0C B; 1YG5 B; 3LB3 A; 1QXE A; 2HBC B; 2ZS0 A; 4X0L A; 2D2M B; 4HSW A; 1YE2 A; 4ROL A; 2WY4 A; 2G3H A; 2AV0 A; 1J3Z A; 2GTL A; 1Y0A A; 3E5O A; 1MNK A; 2G0Z A; 3O89 A; 1GCV A; 4FC3 A; 5B84 A; 1YOH A; 1YMA A; 2O5T X; 1IT3 A; 2CMM A; 1YIE A; 1QXD B; 3PI2 A; 2GRZ A; 4YU4 B; 3HF4 A; 2LH3 A; 2ZSP A; 1DO3 A; 3AT6 A; 2MGK A; 1JEB A; 2ZFB B; 1KR7 A; 2PEG A; 3WFU A; 2ZSN A; 2E2Y A; 1O1L A; 1SPG B; 2R4Z A; 5EOH A; 1A0Z B; 2DC3 A; 4ROL B; 1V07 A; 1MLG A; 2D60 A; 1BVC A; 1J3Z B; 1Y0A B; 1LH7 A; 3ZJR A; 1NQP B; 3MYN A; 1Y4B B; 1WLA A; 1A6K A; 5SW7 A; 3TLD A; 5HLU A; 3MYM A; 1RVW B; 3S1J A; 1YHE A; 5CNG A; 1LFQ B; 1YZI B; 3ZJN A; 4NI1 A; 1BZ1 B; 2G11 A; 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