The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
A steric mechanism for inhibition of CO binding to heme proteins.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Oxygen storage
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molecule keywords |
PROTEIN (MYOGLOBIN)
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total genus |
66
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structure length |
153
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sequence length |
153
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 1998-11-02 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00042 | Globin | Globin |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BZ0 A; 1CG8 B; 4PQ6 A; 3UHY A; 1A01 A; 3WCW A; 1J40 A; 1EBC A; 1UMO A; 3G4U A; 1UX9 A; 1YEU B; 4H07 A; 1HCO B; 2HBC B; 2ZFO D; 2D2N B; 3DUT A; 1BZP A; 2O5B X; 2V1G A; 4ROM B; 1NWN A; 1KFR A; 1HV4 B; 1S69 A; 1NIH B; 1URY A; 3D1K B; 4MBN A; 1V4W B; 3UHK A; 5EYS A; 1DXV A; 1X9F A; 1RQA B; 2V1H A; 1NQP B; 1DXT A; 2XYK A; 2ZSR A; 1SDL A; 1Y4P A; 1JF3 A; 4MU5 A; 1XZ7 B; 1LFY A; 1JP9 A; 2QSP B; 1BZZ B; 1HGC B; 1LH2 A; 1BVC A; 3WTG B; 3PI9 B; 3WCV C; 3IC2 A; 4NI0 A; 1A9W E; 4F6I A; 3VAU A; 4YU3 A; 3VRF B; 1BZ1 A; 2OHA A; 3VRE B; 3LR9 A; 1NPF A; 1Y85 A; 1J3Z A; 1CH9 A; 3DHR A; 2HBS B; 1MWB A; 1HRM A; 3PI8 A; 1JL6 A; 3HF4 B; 1SHR B; 1XZ4 B; 4NI1 A; 1YGF B; 4NK2 A; 4ROL B; 1MLM A; 2NRM A; 2GNV A; 2MGD A; 1MTI A; 3TM9 A; 1DXU B; 2MGL A; 2ZFO C; 2ZFB B; 1XZV A; 1LFZ B; 1IOP A; 3M38 A; 3WFX A; 1J41 B; 1UVY A; 1FHJ A; 2AUP A; 1Y7G A; 5ILP A; 1A3O B; 2V1F A; 4MQG B; 1HGA A; 1JWN A; 3OGB A; 3OZW A; 1V4X A; 3K8B A; 1C40 A; 4M4A A; 1KD2 B; 1O1P A; 1Y8I A; 1Y01 B; 2VEB A; 1HBB B; 2RAO A; 1MGN A; 5KDQ A; 2ZS1 B; 1MYT A; 2DN2 A; 1G08 B; 2ZSN A; 1MLF A; 1HBR B; 4MQC A; 5CN6 A; 3KMF A; 1A4F B; 1YEO A; 2ZWJ A; 2O58 X; 2AA1 A; 1HBS B; 2W31 A; 1QSI B; 1N9X A; 110M A; 3VRG A; 1MLL A; 2QRW A; 1VHB A; 2M6Z A; 1ECD A; 3P5Q A; 3PT7 B; 2BWH A; 5F2A A; 2GRF A; 2H35 B; 1CP5 A; 2W6X A; 1IWH B; 3OO5 A; 3ECZ A; 2HZ1 A; 3ZJN A; 1FN3 B; 1FAW B; 1JPB A; 2HBF B; 2FRK X; 2Z6S A; 107M A; 3NG6 A; 2D5X B; 3UH7 A; 2V1I A; 3ED9 A; 1J3Y B; 1RSE A; 1FDH A; 2MGG A; 3LR7 A; 3GDJ B; 2D2M A; 1HHO B; 3AQ5 A; 3UHV A; 2QLS A; 3ZJO A; 1DWS A; 1GLI A; 3ECL A; 1JEB A; 4HRT A; 2KSC A; 3QM6 A; 4JAC A; 3OO4 A; 1TES A; 1DWR A; 1LFV A; 3G46 A; 4X0L B; 4O4T A; 1G09 B; 3MOU A; 4KN3 A; 1Y31 A; 3S65 B; 5AB8 A; 1G0A A; 1Y7C A; 1O1O B; 4IRO B; 1Y4Q A; 1JZK A; 3NL7 A; 1O1J B; 3GQP B; 3MKB A; 2MYB A; 3GKT A; 2ZT3 A; 1J7W B; 1ABY B; 1YHU B; 2Z6T A; 1YIH A; 4F69 A; 5KER B; 1Y8H A; 1XY0 B; 1XZ5 A; 2GL3 A; 2EVK A; 5ILR A; 1ECO A; 1SPE A; 4ESA A; 1GCV B; 3A5G A; 2PEG B; 3MJU A; 3PEL B; 5CND A; 3QZZ A; 1DKE B; 5CN4 A; 3IXF A; 1AJ9 A; 1ECA A; 1DTM A; 1XZU A; 1MLK A; 3VHB A; 1YOG A; 3CY5 A; 3GOU A; 3HHB A; 3EDA A; 3WCU A; 1CBL A; 3UBC A; 3UI0 A; 1S5X A; 1JDO A; 1SPG A; 3CIU B; 1B86 B; 1CG8 A; 2Z6N B; 2OH8 A; 2W6Y A; 3QMA A; 5CHR A; 2W72 B; 1YMB A; 1YEU A; 1HCO A; 1YG5 B; 4C44 A; 2HBC A; 2D2N A; 4HRR B; 5CNE A; 3TLD A; 1K0Y B; 1Y7Z B; 2H8F A; 3ORD A; 3SZK B; 1MLS A; 3E5I A; 4ROM A; 2HHD B; 2G0S A; 4U8U D; 1HV4 A; 1NIH A; 3D1K A; 1V4W A; 1PBX B; 4NXA A; 2O5T X; 1RQA A; 3WCV B; 2OH9 A; 3HEO A; 1O1N B; 1XZ7 A; 1LHT A; 1RQ4 B; 1RPS B; 1BZZ A; 1HGC A; 1F65 A; 3HEP A; 1NGK A; 2ZLX B; 3WTG A; 3PI9 A; 5F0B A; 1VRE A; 4N7O B; 1Y4V B; 2CMM A; 3LHB A; 3VRF A; 2QFK A; 3VRE A; 1YHE B; 1VXA A; 1C7D B; 2HBS A; 2ZFO B; 1SHR A; 1JW8 A; 1CQ2 A; 1XZ4 A; 1YGF A; 3ZJI A; 4ROL A; 4F4O B; 2BNL A; 1Y09 B; 5D1V A; 4KMW A; 2MYA A; 2SPN A; 1DXU A; 3PI1 A; 1LFZ A; 1YHR B; 2FAM A; 1A0Z B; 1Y35 B; 1V07 A; 1NZ3 A; 4U8U C; 1A3O A; 4MQG A; 4H2L B; 3S1I A; 1CH4 A; 3UHG A; 1HDS B; 5EU2 A; 1HBB A; 3D17 B; 102M A; 2ZS1 A; 3D4X B; 3BJ2 B; 2ZLU B; 1G08 A; 1HBR A; 3ZH0 A; 4HSW A; 1YFF B; 4OOD A; 1A00 B; 1A4F A; 2AUR A; 2MHB B; 1Y7D B; 1HBS A; 3HRW B; 1QSI A; 2ZS0 D; 2JHO A; 4HBI A; 2HZ2 A; 1VWT B; 4DWT A; 2E2Y A; 3PT7 A; 1CLS B; 1V9Q A; 2D60 B; 3ZOM A; 2GKN A; 2H35 A; 1S5Y A; 2ZSP A; 2EB9 A; 3MN0 A; 3QJB B; 3RGK A; 3A2G A; 1FN3 A; 1FAW A; 2QSS B; 4FC3 B; 2D5X A; 1FSX B; 1GZX B; 2AUQ A; 1V75 A; 3WFU A; 3GDJ A; 1HHO A; 5CN5 A; 1YVT B; 3UGZ A; 1MYM A; 1N9F A; 3UHC A; 1KR7 A; 4FWZ A; 3AT5 A; 3PT8 B; 2ZLT B; 3OJ1 A; 1YVQ B; 1DO3 A; 3EU1 B; 4WCH D; 2DHB B; 1HBI A; 3V2Z A; 2R4Y A; 2QFN A; 1MOA A; 4YU4 B; 4X0L A; 1MYZ A; 2MGK A; 1G09 A; 2G14 A; 3WCP B; 3HXN A; 3S65 A; 3LB4 A; 2DC3 A; 3MYM A; 1CH7 A; 1O1O A; 4IRO A; 4MQJ B; 2ZS0 C; 1VXD A; 1NZ4 A; 1O1J A; 2SPO A; 3HEN A; 2D5Z B; 1MLN A; 1HLB A; 1MZ0 A; 3FH9 B; 3GK9 A; 5C6E B; 1J7W A; 1Y0W A; 1ABY A; 1Y22 B; 1FDH G; 1HBA B; 1YHU A; 2LH1 A; 1MBC A; 1YOI A; 1MLJ A; 3GQG B; 5KER A; 1NAZ A; 1OR6 A; 1XY0 A; 4PNJ A; 1RVW B; 1IRD B; 1NPG A; 1QI8 B; 1UVX A; 1GCV A; 1MOB A; 3FS4 B; 3UHN A; 2PEG A; 3GYS B; 3PEL A; 1JZM A; 2BLJ M; 2W6W A; 4UUR A; 1VXG A; 3IA3 B; 2QMB B; 3UBV A; 2W72 C; 5C6Y A; 4MXL A; 1XCH A; 1BIJ B; 2VYW A; 3BJ1 B; 1CIK A; 1DXD A; 1BUW B; 2DN1 B; 3A5A A; 1COH B; 1Y2Z B; 3CIU A; 1B86 A; 2Z6N A; 3WR1 B; 1BBB B; 1YG5 A; 1Y46 B; 1JL7 A; 4HRR A; 1K0Y A; 1FSL A; 4F68 A; 1YEQ B; 4ODC B; 4F6F A; 2HHD A; 1JY7 B; 1QXD A; 3GQR B; 5HY8 B; 1BZ6 A; 1Z8U B; 1W92 A; 2YRS B; 1EMY A; 2Z8A A; 1X46 A; 1PBX A; 3NMM A; 1QPW B; 1JF4 A; 1YE2 B; 3H57 A; 1IBE B; 5CN7 A; 3WCV A; 4L2M A; 5CN8 A; 1DTI A; 1O1N A; 1MBD A; 4F6B A; 2MB5 A; 1NS6 B; 1PMB A; 1QXE B; 1RQ4 A; 1HDB B; 1MKO B; 2D6C A; 3A5B A; 1O1M A; 2ZLX A; 4ZVA A; 3ARJ A; 4MQI B; 4N7O A; 1O1K B; 1Y4V A; 2ZT1 A; 4VHB A; 1IT2 A; 1YHE A; 1C7D A; 1BZR A; 2ZFO A; 1A3N B; 2W6V B; 1NZ5 A; 1H1X A; 3BOM B; 3KUO A; 4U8U B; 5MBA A; 4F4O A; 4NK1 A; 1N9I A; 1Y09 A; 4M4B B; 2GRH A; 2VLZ A; 1YHR A; 1A0Z A; 1LFQ B; 4QAU A; 4N8T B; 1C7B B; 3TM3 A; 3H58 A; 3UHX A; 4H2L A; 2O5S X; 2ZLW B; 3QQQ A; 3QZX A; 3EOK B; 4MQH B; 1HDS A; 2R50 A; 1L2K A; 1XZ2 B; 5HU6 B; 1Y8W A; 1MNJ A; 2B7H B; 1X3K A; 3BJ2 A; 4JYQ A; 2ZLU A; 1V4U B; 1GJN A; 1YZI B; 1Y45 B; 5EQM A; 2MGB A; 2G0Z A; 1A6N A; 1YFF A; 3E4N A; 1A00 A; 3BJ3 B; 3QJE B; 5JDO F; 3UHR A; 2IG3 A; 3HRW A; 2WTG A; 3MJP B; 1MNK A; 3BA2 A; 2MGH A; 1OBM A; 3V2V A; 1CLS A; 2D60 A; 3AQ6 A; 2ZSO A; 1F5O A; 4PQB A; 2WTH A; 3WFW A; 4HSX A; 4UIQ A; 3QJB A; 3UHT A; 1T1N B; 3PI4 A; 2QSS A; 1Y0D B; 2LH2 A; 4FC3 A; 3A59 B; 3ZJJ A; 1LUE A; 2H8D B; 2V1K A; 1GBV A; 1FSX A; 1GZX A; 1LH6 A; 1YVT A; 1MBN A; 1HBH B; 1IRC A; 3SDN A; 1HAC B; 3PT8 A; 3ZJS A; 2ZLT A; 4FH6 A; 4F6G A; 1K1K B; 1YVQ A; 3EU1 A; 1MCY A; 1YDZ B; 2DHB A; 4YU4 A; 2ZS0 B; 1Y83 A; 3B75 A; 3WCP A; 1RQ3 B; 2FRJ X; 2HBD B; 1WMU B; 4MAX A; 3ODQ B; 5CMV A; 3WI8 A; 1ECN A; 3DHT B; 2HBE B; 3UGY A; 1LH5 A; 4MQJ A; 1GDJ A; 2NRL A; 1IDR A; 2D5Z A; 5C6E A; 1YOH A; 5HLQ A; 2ZT2 A; 1Y22 A; 1HBA A; 1Y0C B; 5ILM A; 3GQG A; 3WCT D; 3NFE B; 2R4X A; 3IC0 B; 1CPW A; 1QI8 A; 1GBU B; 4WJG 1; 1DO1 A; 1S0H B; 1CO8 A; 3FS4 A; 3GYS A; 112M A; 5JOM A; 1YEN B; 1MBA A; 3LQD B; 1SDK B; 1LTW A; 1Y0A B; 3QQR A; 2QMB A; 2O5Q X; 4G1V A; 1LFT B; 2MGA A; 2VYY A; 1BIJ A; 108M A; 3AQ9 A; 111M A; 3BJ1 A; 1S61 A; 1EBT A; 1MLH A; 3QM8 A; 4G1B A; 2VLY A; 1NQP A; 2XKH A; 4YU3 B; 3S66 B; 2O5O X; 1BUW A; 2DN1 A; 1COH A; 1Y2Z A; 3D7O B; 3MYN A; 2QSP A; 4FH7 A; 1NS9 B; 1VXB A; 5JDO E; 4WJG A; 1OUU B; 2RI4 B; 3WR1 A; 4N7N B; 4NI1 B; 1BBB A; 3AQ8 A; 1GCW B; 1OUT B; 1LH7 A; 4FWX A; 1Y46 A; 2DXM B; 4ILZ A; 2BLH A; 3AQ7 A; 1TU9 A; 1A0U B; 4ODC A; 105M A; 3HYU B; 1JY7 A; 1MBI A; 1D8U A; 3GQR A; 1Y5J B; 1HGB B; 1BAB B; 2YRS A; 1MYI A; 1Y4B B; 4XS0 B; 1JP6 A; 1GVH A; 4IT8 A; 2HZ3 A; 2G0R A; 1M6M A; 1M9P B; 2O5L X; 3UHH A; 3UHD A; 1QPW A; 3HF4 A; 1MYF A; 1YE2 A; 1VXC A; 1IBE A; 4TYX A; 1V4X B; 5SW7 B; 3WCT C; 4DC7 A; 3D1A B; 2GLN A; 3R0G A; 3PI2 A; 3OK5 A; 1SI4 B; 1NS6 A; 1O1I B; 1QXE A; 3UHE A; 2ZFB A; 1Y4G B; 1HDB A; 1MKO A; 4MPM A; 1O16 A; 3G52 A; 1J41 A; 2G12 A; 2EF2 A; 4MQI A; 3MBA A; 5CHQ A; 1O1K A; 3K3U A; 1KD2 A; 4FWY A; 1A9W A; 1DO4 A; 1CO9 A; 5JGG B; 1BJE A; 1S56 A; 4NS2 A; 1S6A A; 2GKM A; 1A3N A; 4MBA A; 4GZG A; 1G9V B; 2W6V A; 2VYZ A; 3BOM A; 1UX8 A; 4U8U A; 2GTL D; 5CNG A; 3S48 C; 2XKG A; 4M4B A; 2MYD A; 1HJT A; 1LFQ A; 2G3H A; 4N8T A; 1R1Y B; 2EB8 A; 1C7B A; 1MBO A; 3UH5 A; 1J7Y B; 1DM1 A; 1DUK A; 2R1H B; 1IWH A; 2ZLW A; 3G4Y A; 1HAB B; 2QLS B; 3WCW D; 5E29 B; 2LHB A; 3A0G B; 1G0B B; 2NX0 A; 1GLI B; 3EOK A; 2HBF A; 2HHE B; 3BCQ B; 2GDM A; 1XZ2 A; 3OO4 B; 109M A; 3QM5 A; 1J3Y A; 1V4U A; 1YZI A; 1Y45 A; 3AG0 A; 106M A; 1J7S B; 3BJ3 A; 3QJE A; 1ASH A; 2MGC A; 2G0X A; 3OZV A; 3MJP A; 1X9F D; 3O89 A; 1OFJ A; 2MGM A; 1XXT B; 3QJD B; 3OVU C; 4MQK B; 1LHS A; 1JP8 A; 3E55 A; 1HDA B; 1YCB A; 2ZSS A; 1Y4F B; 4KMV A; 3ZHW A; 1A6K A; 1CG5 B; 104M A; 1Y0D A; 3A59 A; 1Y5F B; 1EW6 A; 2GTL C; 2H8D A; 2ZLV B; 3WHM B; 1YIH B; 4B4Y A; 3G4V A; 2MGF A; 4MXK A; 3LB1 A; 4N7P B; 4KJT A; 1Y4R B; 3GQP A; 3ZJH A; 3AT6 B; 2DN3 B; 103M A; 2G11 A; 1HBH A; 1URV A; 1H97 A; 1UC3 A; 4O4Z A; 1HAC A; 3DR9 A; 3WCW C; 1MTJ A; 1K1K A; 1VXE A; 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