The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of mutant human carbonmonoxyhemoglobin C (betaE6K) at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN ALPHA CHAIN
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| total genus |
54
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-09-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WFW A; 2BLJ M; 3A5A A; 1VXG A; 2G3H A; 1Y4Q B; 2FAM A; 1NPG A; 3GKT A; 1J3Z A; 4KJT A; 5E83 A; 3WCW B; 1GCV A; 1NZ2 A; 2DN2 B; 2G0R A; 4PQ6 A; 1HBH A; 5KER A; 3A59 B; 4G51 B; 1NS6 A; 2QFN A; 2FAL A; 3QQR A; 5E29 A; 2O5L X; 2W72 A; 1J52 A; 2LH6 A; 4MQH A; 4WJG A; 1QXD A; 1SPG A; 1YH9 B; 3WTG B; 3ECL A; 1C7D A; 2GNW A; 4N7P A; 1YHU B; 4OOD A; 1SPG B; 2D2N C; 1YH9 A; 3ARJ A; 3AT5 B; 1YHE A; 2G10 A; 4DWT A; 1GDJ A; 1YHE B; 3BCQ A; 2B7H B; 2HBD A; 1JP8 A; 3WCV C; 3GDJ A; 5HAV A; 4UIQ A; 1N9F A; 1BUW A; 3PI1 A; 105M A; 1IRD A; 1S5Y A; 2FRJ X; 4M4A A; 2OHA A; 1SDL A; 2VYW A; 2O5O X; 1A9W E; 3PI3 A; 1YMA A; 1XZ7 B; 1BVC A; 2ZLX A; 1LFQ B; 3HEN A; 3HF4 A; 1BZ1 A; 4NI1 A; 1AJH A; 3ZJJ A; 1UX8 A; 1O1O B; 3QM5 A; 3UHX A; 5JOM A; 1CH4 A; 2MGF A; 4YU3 B; 2VHB A; 5CND A; 1JZK A; 2OHB A; 1DO3 A; 4ROL B; 2GRF A; 1V4W B; 5CN8 A; 3UHD A; 4L7Y B; 3WCV D; 3PI8 B; 3VRG B; 1J7W A; 1G08 B; 1RTE A; 5EV5 A; 5HLU A; 1B0B A; 1RQ4 A; 4NS2 A; 2G12 A; 3DR9 A; 3MN0 A; 1QPW B; 1CH5 A; 1HSY A; 106M A; 2D6C A; 1K0Y A; 1MLN A; 1MLQ A; 2QSP B; 4TWU A; 3BJ1 B; 1X46 A; 4NK2 A; 5EE4 C; 2OIF A; 3ZOL A; 3ZJP A; 4NXC A; 2ZS1 A; 3B75 B; 2G0V A; 4G1V A; 2SPM A; 3WCP A; 1NQP B; 1HLM A; 3QZZ A; 5E83 B; 3WCW A; 3AT6 B; 5CNB A; 1NZ4 A; 1S0H A; 3OO5 B; 2MGI A; 1LFZ B; 2VEE A; 1NGK A; 3IC0 A; 1V4X A; 4MQJ B; 5CN9 A; 2QLS A; 3NML A; 2RAO B; 1Y8I A; 2SPO A; 2MGM A; 3MJP B; 1Y5J A; 1YEO A; 2GKM A; 4AVE A; 2GTL C; 3GQG B; 2NSS A; 1Y8K A; 1XY0 B; 2XYK A; 1Y45 B; 2HHB B; 2YRS A; 3E4N A; 4F6D A; 1YGF A; 3W4U A; 1MNK A; 1BBB A; 2LH1 A; 3G46 A; 1A0U A; 1CO9 A; 1A0U B; 1V4U B; 2V1E A; 1EW6 A; 1FSX A; 4N7N B; 4MXL A; 3A0G A; 3EDA A; 5CN5 A; 3UHY A; 3VHB A; 3HHB A; 1DWS A; 1AZI A; 1HHO B; 1U7R A; 4HHB B; 104M A; 1VXA A; 2Z6S A; 1CPW A; 1R1Y A; 1LFQ A; 1LUE A; 3ZOM A; 1QSI B; 2MYB A; 1XZU B; 3MOU A; 3WCU B; 1HBG A; 1V75 B; 2ZFO C; 1U7S A; 1DXU A; 2MGA A; 4ROL A; 3A5B A; 2VLZ A; 4HSW A; 1VWT A; 2AUQ A; 1MYI A; 1AJG A; 3OZV A; 3PI4 A; 4H0B A; 2D5Z A; 2ZS1 C; 3NFE B; 1DXC A; 1HRM A; 3U3E A; 3UHT A; 5CN6 A; 1VXB A; 2ZSZ A; 2D5Z B; 2R1H A; 1Y35 A; 3UHV A; 1JWN A; 4N7P B; 1DO7 A; 1AJ9 B; 1O1L B; 4N7O A; 2ZLT B; 3MKB B; 5MBA A; 1YGD A; 1FDH A; 1XZ2 A; 3MKB A; 1A4F B; 1MCY A; 1EBC A; 1CH3 A; 2HBS B; 2V1G A; 1F65 A; 3WR1 B; 1OUU B; 5CNF A; 1X3K A; 3NG6 A; 2HBS A; 1LH6 A; 2HCO A; 5CHQ A; 3IC2 B; 2EKU A; 1V07 A; 3G4Y A; 2D5X A; 2G11 A; 4G1B A; 4WJG 1; 2HBF B; 1RVW B; 3OO5 A; 2R4X A; 3HC9 A; 3QZX A; 1NAZ A; 3BJ3 B; 3UHI A; 1ECA A; 1LH5 A; 3G4W A; 1CH7 A; 1YE2 A; 1HBR A; 1QXE B; 1Y85 B; 2D2N D; 3ZJS A; 3VRF B; 5CHR A; 1DXT A; 1Y85 A; 1COH A; 1O1J B; 1MLK A; 1JP6 A; 3UI0 A; 2NRL A; 2SPL A; 1Y0D A; 1BZR A; 2G0Z A; 4ZVA A; 4B4Y A; 2ZSN A; 1G09 A; 4AVD A; 1DTI A; 1V4W A; 3E5I A; 1SHR A; 1YVQ B; 4F4O A; 4MQI B; 2H35 B; 1NWN A; 3DUT B; 1FAW A; 2RI4 A; 1YEN A; 1FAW B; 3GOU A; 3OK5 A; 1I3D A; 3D1K A; 3A5G A; 1QPW A; 1J3F A; 4HHB A; 1MOH A; 5JDO E; 1CQ2 A; 3BJ1 A; 3G4V A; 1Y8H B; 3ZJL A; 1A0Z B; 4O2G A; 4YU4 A; 1FN3 A; 1Y2Z B; 1NIH A; 1XYE B; 3HEP A; 1D8U A; 2ZSR A; 1CO8 A; 1YZI A; 3SDH A; 1K1K A; 2PGH A; 3GQR A; 1NQP A; 3CIU B; 1YIE A; 3M3A A; 1YZI B; 2MBW A; 3K8B B; 1BZ0 B; 2GKN A; 1Y5F A; 4DC7 A; 2EF2 A; 1G9V A; 1IBE A; 3OO4 A; 1YOH A; 1Y22 A; 3IA3 B; 1MBC A; 2NRM A; 1O1M B; 1GDI A; 4HRT B; 1QXD B; 3BJ2 B; 3S1I A; 1NXF A; 1THB A; 4H07 A; 1YOI A; 3GQG A; 2ZLT A; 1YGD B; 5KDQ B; 3V2V A; 2ZLV A; 1MWC A; 3UHB A; 1LFT A; 1YE0 A; 2R80 B; 1H1X A; 3ZJN A; 1MLG A; 2B7H A; 2QSS B; 3DHT B; 2OH9 A; 2HBD B; 1IDR A; 1O1I A; 1GDL A; 1DO1 A; 3SZK A; 3IC2 A; 1S6A A; 2V1K A; 2HZ3 A; 2AV3 A; 1C40 A; 1SDK B; 4ROM B; 1IRC A; 1HDA A; 3BOM B; 5EYS A; 3S1J A; 109M A; 2MYE A; 5CMV A; 1HJT A; 1FLP A; 3WHM A; 3UHQ A; 3ECZ A; 4HSX A; 2H8D B; 4F6I A; 3EU1 B; 2MYA A; 1MOD A; 3ED9 A; 5B84 A; 1UVY A; 3QJD B; 1MWB A; 4U8U B; 3GKV A; 3WCU C; 3GYS B; 1A3O B; 1A6K A; 3AQ8 A; 3GKV B; 1HGA A; 1Y0T A; 1A3O A; 1N9H A; 5ILE A; 1Y46 A; 3PIA A; 3ODQ A; 3ODQ B; 1CH1 A; 1O1N A; 3HRW B; 1DXV A; 2LHB A; 2D2N B; 2GDM A; 1GCW B; 3S66 A; 1YHR B; 1O1K A; 4BJA A; 3WTG A; 1YHU D; 4JYQ A; 1C7D B; 2ZLW A; 1YMC A; 2AA1 B; 2O5Q X; 4PQC A; 3D1A B; 1XZ2 B; 1O16 A; 2D60 B; 3AT5 A; 3D1A A; 1FN3 B; 1NIH B; 1HBB B; 3WR1 A; 1Y7G A; 1BZZ B; 4SDH A; 4DC8 A; 5JDO F; 1A00 B; 1Y8W A; 4C44 A; 1Y7D A; 5B85 A; 5EOH A; 2FRI X; 3UH3 A; 4NXA A; 3H57 A; 1Y7D B; 4L2M A; 1Y4P B; 2G0S A; 1M6C A; 1IBE B; 3OGB A; 1GJN A; 1DXD A; 1Y8I B; 4TWV A; 1S5X A; 3UHN A; 1VXF A; 3HF4 B; 1Y7C A; 3UGZ A; 5E6E B; 1HBS B; 3ZHW A; 3LB2 A; 1DO4 A; 1MGN A; 3UHS A; 2FRF A; 1Y7C B; 1Y45 A; 2YRS B; 2HBC B; 3ZJQ A; 1XZV B; 1BZP A; 1OJ6 A; 2QMB B; 3OJ1 A; 4F6F A; 1Y4G B; 1SHR B; 3RJN B; 2ZT4 A; 1EWA A; 2GNV A; 2MHB B; 3VRG A; 1HDA B; 7HBI A; 3BOM A; 1J7W B; 1G08 A; 2NSR A; 3LHB A; 2VLY A; 3AQ5 A; 1FHJ A; 1XZ5 A; 1SPE A; 3EU1 A; 1XZ5 B; 2DN1 B; 1J40 A; 1M9P A; 3EDB A; 3UHW A; 5EQM A; 4H2L A; 1K0Y B; 2NX0 A; 5HLX A; 1O1P A; 1C7C A; 1Y2Z A; 1Y7Z A; 3G52 A; 4MU5 A; 4U8U A; 2MGH A; 3K3U A; 1J7Y B; 1HBA B; 1QI8 A; 2CMM A; 1ECD A; 4O1T A; 3WFX A; 1ABW B; 3PIA B; 1MKO B; 1H97 A; 1YHU C; 1WMU A; 2O5T X; 4XDI A; 1LFV A; 2BK9 A; 1F63 A; 1GLI B; 3HYU B; 3WCT C; 4PQB A; 3LR9 A; 1GLI A; 1X9F B; 3A9M A; 3A59 A; 4G51 A; 3UH7 A; 3FS4 B; 2W6X A; 1JW8 A; 5SW7 A; 3WCV A; 1MLH A; 1VXE A; 5SW7 B; 2MGK A; 3FH9 B; 2ZFO D; 1ABS A; 1YG5 B; 2V1F A; 1G0A B; 3PT7 B; 2WY4 A; 5JDO C; 2AUR A; 1G0A A; 2MGC A; 1QSH B; 5HU6 B; 1URV A; 1RQA A; 2IN4 A; 3BCQ B; 4VHB A; 2ZSP A; 1Y83 A; 1NEJ A; 2XKG A; 1RQA B; 1JL7 A; 1Y4F B; 3QJE A; 1Y4B A; 1QI8 B; 1RSE A; 1Y4F A; 2QFK A; 3ZH0 A; 1S5Y B; 1T1N A; 111M A; 1YCA A; 110M A; 1MLR A; 1C7B B; 1JEB B; 1MYF A; 2DXM A; 2HHD A; 5CN7 A; 3UHH A; 4FWY A; 4IRO A; 4XS0 A; 1G0B A; 1V75 A; 3MBA A; 3MYM A; 5AB8 A; 1DUO A; 1DXU B; 3S65 A; 2Z6N B; 2ZT3 A; 4NI0 A; 1DUK A; 4O4Z A; 1CG5 A; 1DLY A; 3QQQ A; 1YIH B; 2W6W A; 2W72 B; 1DWR A; 3GOU B; 1CBM A; 3WCT B; 1F5P A; 5D1V A; 1YHU A; 3WCT A; 3ARK A; 2M6Z B; 2AUO A; 1DM1 A; 5AZQ A; 1LH3 A; 3NMM A; 1CIO A; 1HDB B; 1O1L A; 2LH7 A; 2D60 A; 1N9X A; 3NMM B; 1UIW A; 2ZT2 A; 3UH5 A; 1XQ5 B; 5EUI A; 1Y7G B; 3O7N A; 1Y4V A; 3UHR A; 1UT0 A; 3HEO A; 1HAC A; 3MJU B; 1NZ5 A; 2BNL A; 1A3N A; 2BLI A; 2DN3 A; 2MGE A; 2R4W A; 3HXN B; 2BKM A; 1LFV B; 1BAB B; 3G4U A; 3UHE A; 3K8B A; 1CG8 A; 3SDN A; 3CY5 B; 4MQC A; 5ILR A; 1CG8 B; 1YEV A; 2FRK X; 3TM3 A; 1ECO A; 1LH7 A; 3QJB A; 4UUR A; 1S5X B; 1O1O A; 2ZSO A; 3GQP A; 1MLU A; 4ILZ A; 1MTI A; 1S56 A; 3ASE A; 2ZLX B; 2E2Y A; 1HGB A; 3M38 A; 1XCH A; 4KN3 A; 4YU3 A; 3ZJM A; 2AV0 A; 4MAX A; 3VAU A; 1LA6 A; 1CMY B; 1SWM A; 3DUT A; 2LH2 A; 1MOA A; 3PI8 A; 1CIK A; 1C40 B; 1ABY B; 1FHJ B; 1L2K A; 5M3S A; 2ZWJ A; 3D1K B; 1JZM A; 4UZV A; 2WTG A; 2Z6T A; 1YDZ A; 3EOK B; 1MBN A; 2EB9 A; 5HY8 B; 1TES A; 1MNI A; 1MNJ A; 1Y31 B; 3QJD A; 4YU4 B; 2KSC A; 1UX9 A; 1EMY A; 2EB8 A; 1GBU A; 3WCP B; 2Z6N A; 112M A; 1J41 B; 4FC3 B; 3WCW C; 1Y0T B; 2PGH B; 2W72 C; 2GRH A; 3B75 A; 1Y4Q A; 1B86 A; 107M A; 4OF9 A; 3MYN A; 1O1N B; 1KD2 B; 1YEU A; 1GCV B; 4ESA B; 1Y22 B; 4TYX A; 1BIN A; 2GTL A; 1MWD A; 2GRZ A; 2HZ1 A; 1GBV B; 2R1H B; 1Y4R A; 1BIJ B; 3D17 A; 1Y8K B; 2VM0 A; 1Y4R B; 2AA1 A; 1DWT A; 2O5M X; 1JY7 A; 5F0B A; 1VXC A; 3WCT D; 4F69 A; 2SPN A; 1JY7 B; 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1COH B; 4GZG A; 1MYG A; 3E55 A; 2HBC A; 3KUN A; 2ZFB A; 1A9W A; 1KR7 A; 3P5Q A; 1QSH A; 1Y0W A; 1MYM A; 3W4U B; 5KKK A; 1MLF A; 101M A; 4FWZ A; 4DWU A; 1FSX B; 2OH8 A; 5IKS A; 3WCU D; 2EKT A; 2H8F B; 3PI2 A; 3UBV A; 3WI8 A; 4U8U C; 1BZ6 A; 1YCB A; 1JDO A; 3HHB B; 1HHO A; 1Y8H A; 3R5I A; 2ZS0 A; 2Z8A A; 102M A; 1W92 A; 3VRE A; 1XYE A; 1R1Y B; 5CNG A; 1BVD A; 4KMW A; 2IG3 A; 3DHR A; 3VRE B; 1JPB A; 2DXM B; 2HHD B; 3D4X B; 2VYZ A; 1HGC B; 1GBU B; 1YIE B; 1J7Y A; 3CIU A; 1GVH A; 1HGC A; 1HLB A; 1LHT A; 1Y5F B; 1S0H B; 2MB5 A; 3WCW D; 1VRF A; 2R4Y A; 2ZSY A; 2R50 A; 2XKI A; 6HBW A; 2HZ2 A; 3NFE A; 3LR7 A; 2HHE A; 6HBW B; 3WCV B; 1M6M A; 4HRT A; 3ZJR A; 1X9F C; 2R80 A; 1YG5 A; 2HBE A; 1IT2 A; 1UIW B; 2ZLV B; 4C0N A; 2O5S X; 1Y0C A; 3SZK B; 1NS9 B; 1VXH A; 1A3N B; 2QSS A; 2VEB A; 2GTL D; 3D7O B; 3R0G A; 1MYT A; 5JGG A; 1HAB A; 3TM9 A; 1IOP A; 1RVW A; 1LFL B; 108M A; 4IT8 A; 4MPM A; 1UMO A; 1QXE A; 5CNC A; 1UFJ A; 1RTX A; 2Z85 A; 3UBC A; 1XZ7 A; 2G0X A; 3PI9 B; 4O35 A; 2ZT1 A; 1IT3 A; 4NK1 A; 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