The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
200
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sequence length |
544
|
structure length |
519
|
Chain Sequence |
MSIEQTLSQYLPSHPKPQGVTFTYGTAGFRMKADKLDYVTFTVGIIASLRSKYLQGKTVGVMITASNPPEDNGVKVVDPLGSMLESSWEKYATDLANASPSPEKNSLVEVIKNLVSDLKIDLSIPANVVIARDSRESSPALSMATIDGFQSVPNTKYQDFGLFTTPELHYVTRTLNDPDFGKPTEDGYYSKLAKSFQEIYTIEKIDITIDAANGVGAPKIQELLEKYLHKEISFTVVNGDYKQPNLLNFDCGADYVKTNQKLPKNVKPVNNKLYASFDGDADRLICYYQNNDNKFKLLDGDKLSTLFALFLQQLFKQIDPTKISLNIGVVQTAYANGSSTKYVEDVLKIPVRCTPTGVKHLHHEAENFDIGVYFEANGHGTVIFNPEAEKKIFDYKPNNDNEAKAIKVLQNFSQLINQTVGDAISDLLAVLIVVHYLKLSPSDWDNEYTDLPNKLVKVFKTTNAERLVPKGMQDEIDKLVAQYPNGRSFVRASAVRVYAEADTQNNVEELSKAVSELVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structures of N-Acetylglucosamine-phosphate Mutase, a Member of the {alpha}-D-Phosphohexomutase Superfamily, and Its Substrate and Product Complexes.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Phosphoacetylglucosamine mutase
|
| molecule tags |
Isomerase
|
| source organism |
Candida albicans
|
| total genus |
200
|
| structure length |
519
|
| sequence length |
544
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
5.4.2.3: Phosphoacetylglucosamine mutase. |
| pdb deposition date | 2006-04-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00408 | PGM_PMM_IV | Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, C-terminal domain |
| A | PF02878 | PGM_PMM_I | Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain I |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globin-like | ||
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | TATA-Binding Protein | Alpha-D-phosphohexomutase, C-terminal domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5JMV D; 2DKD A; 4BJU A; 5JN5 A; 2FKM X; 2DKA A; 2DKC A; 3C04 A; 3NA5 A; 4WXA A; 1PCM X; 4WX8 A; 5KL0 A; 1LXT A; 4QG5 A; 2H5A X; 3OLP A; 1KFI A; 1PCJ X; 5F9C A; 1K2Y X; 4MRQ A; 1KFQ A; 2Z0F A; 1C4G A; 2F7L A; 3PMG A; 4HJH A; 5HSH A; 1VKL A; 3ENO C; 3I3W A; 5EPC A; 1P5G X; 1K35 A; 1WJW A; 2H4L X; 1WQA A; 2JPI A; 1P5D X; 3BKQ X; 3PDK A; 3RSM A; 5BMN A; 3ENC A; 3UW2 A; 2FKF A; 5BMP A; 4IL8 A; 1C47 A; 2FUV A; 1TUO A; 1JDY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y8W B; 2Z6T A; 1YEQ A; 1QNE A; 2GTL C; 1MGN A; 1YEQ B; 2QLS A; 1JP8 A; 1Y5K A; 1MNH A; 1Y22 A; 1Y5K B; 2QLS B; 1CP5 A; 3TM9 A; 2BV8 A; 2Z85 A; 2BV8 B; 1BVD A; 3NML A; 4BJA A; 4N8T A; 2DN2 B; 4N8T B; 1JL7 A; 5EE4 C; 2W6W A; 1BZ6 A; 1MBN A; 1C7C A; 3O7N A; 1MCY A; 1C7C B; 1CPW A; 4N7P A; 4IT8 A; 4N7P B; 2OLP A; 1QN4 A; 2HZ1 A; 1DO4 A; 1MKO B; 1OR6 A; 3O89 A; 3CW7 A; 4F6B A; 3BJ2 A; 110M A; 1QSH A; 1YMC A; 3BJ2 B; 1QSH B; 2MGD A; 1DXD A; 1FSX A; 4HBI A; 2D0A A; 1FSX B; 2W72 A; 1MOD A; 1UVI A; 2W72 B; 1MYI A; 4C44 A; 3PI2 A; 1Y83 A; 3UHR A; 1A01 A; 4ROL A; 1YCA A; 1Y83 B; 1A01 B; 4ROL B; 3ARJ A; 2BMM A; 2BNL A; 1KFR A; 1O1O A; 1O1O B; 3IXF A; 1MNO A; 2KSC A; 4PNJ A; 2JHJ A; 1MLS A; 4F6D A; 1NVP A; 1Y4F A; 4UIQ A; 1JF4 A; 1Y4F B; 1M9P A; 1M9P B; 3AT5 A; 2JLG A; 1YHU C; 2PEG A; 3AT5 B; 2XHI A; 2GTL D; 3OGD A; 2PEG B; 2FUV A; 4DUL A; 2UUL C; 4ROM A; 3A5G A; 4ROM B; 5EU2 A; 4EJY A; 3A5A A; 2OH9 A; 5F2A A; 3LR9 A; 3WCT C; 2UUN A; 1Y5F A; 2WTH A; 2DC3 A; 1Y5F B; 2LH1 A; 4FH6 A; 1MWB A; 3O18 A; 1HGA A; 4AE1 A; 3O18 B; 1HGA B; 1UX9 A; 2JOI A; 3HEP A; 1J3F A; 1K1K A; 5KL0 A; 1K1K B; 1XZ2 A; 3PEL A; 1R4X A; 2HHE A; 1XZ2 B; 2G10 A; 2ZLX A; 3PEL B; 2HHE B; 2ZLX B; 2FAM A; 1YOI A; 1Y01 B; 1JW8 A; 1RM1 A; 3QJD A; 3B75 A; 1C4G A; 3QJD B; 3B75 B; 5JGG A; 1WVP A; 3WCV A; 3MKB A; 1WQA A; 1FAW A; 4O2G A; 5JGG B; 3OCI A; 1GBU A; 3WCV B; 3MKB B; 5CNC A; 1FAW B; 1GBU B; 1NGK A; 2XKH A; 4PQ6 A; 1LWY A; 4JAC A; 3AQ5 A; 1VTL E; 2O5M X; 3GLN A; 3UHW A; 2FRI X; 4O4T A; 1HDB A; 3DHR A; 1MBD A; 2Z8A A; 2LAE A; 1HDB B; 2SPN A; 1LFY A; 5MBA A; 111M A; 1HGB A; 1LFY B; 1XQ5 A; 1HGB B; 1XQ5 B; 4HJH A; 1AJ9 B; 2O5O X; 2NOE A; 1SI4 A; 1SI4 B; 1Y0W A; 4F6F A; 1Y0W B; 3ECZ A; 4F0U A; 2CMM A; 2VLY A; 4F0U B; 1I3E A; 1JFI C; 5HLQ A; 5CNB A; 2G0Z A; 4XXI A; 1SPG A; 2EKU A; 2MGI A; 3KTU A; 2ZT4 A; 1O1J A; 1YHU D; 1EBT A; 1O1J B; 1K35 A; 3D1K A; 1JWN A; 2V1I A; 1YFF A; 3GKT A; 3D1K B; 2EB8 A; 5EUI A; 1D8U A; 1DXT A; 2WCQ A; 1YFF B; 2ZSN A; 1UT4 A; 1EW6 A; 5EUI B; 1DXT B; 3SNS A; 2MGA A; 3WCT D; 4DWU A; 3WCP A; 1V4W A; 3G4Q A; 3WCP B; 1V4W B; 2H5A X; 3S65 B; 2R4Y A; 2UUM A; 5HAV A; 4MQH A; 2ZT2 A; 3ARL A; 2UUM B; 1W92 A; 4MQH B; 3ZJM A; 1UT0 A; 3UBC A; 1BBB A; 1MWD A; 1YHR A; 1VXC A; 1BBB B; 1YHR B; 1C7B A; 5ILR A; 4KJT A; 3EOK A; 3U3E A; 1C7B B; 3EOK B; 1XCH A; 1Y0D A; 2JHO A; 2HL9 A; 1HDA A; 2IV8 A; 3UHN A; 1UFP A; 1LFQ A; 1JZK A; 1LFQ B; 2IV9 A; 2DKD A; 4EJZ A; 1YIH A; 1H97 A; 3BOM B; 1QNA A; 1YIH B; 1UIW A; 2UUM X; 1ABW A; 1UIW B; 1CH2 A; 1ABW B; 3V57 A; 1AJG A; 1YTB A; 1KN1 A; 1XF6 C; 2MYA A; 3AG0 A; 1F65 A; 1KN1 B; 2WTG A; 2LHB A; 1HV4 A; 5ILE A; 1HV4 B; 1VXF A; 3OVU C; 1VXB A; 1VXH A; 4C0N A; 1HAC A; 2AUP A; 1DO1 A; 1HAC B; 1LXT A; 5AQD M; 1E42 A; 2DN3 A; 5FVB M; 1LWV A; 2DN3 B; 3UHE A; 1N9H A; 1PZD A; 2EVP A; 1FSL A; 4H0B A; 4F69 A; 1M3Q A; 3NA5 A; 4BJU A; 3CWS A; 1MLL A; 4HRR A; 2VJR A; 1S56 A; 4HRR B; 2E2Y A; 1MNI A; 1VXD A; 2HBE A; 2VJR B; 1Y4G A; 4YJJ A; 1Y4G B; 2OHB A; 1MYF A; 1Y7C A; 1Y7C B; 1MLJ A; 3IC2 A; 4NK1 A; 3IC2 B; 4FWX A; 1LFT A; 4L7Y B; 1LFT B; 1N9I A; 1O16 A; 1MWC A; 3OZW A; 1O1N A; 1V4X B; 3DR9 A; 1O1N B; 2NOB A; 1XZ7 B; 3OSE A; 2ZT1 A; 1VOL B; 5AQD A; 1RQA A; 2UUL B; 1VKL A; 5HSH A; 2H4L X; 2NLV A; 1RQA B; 2HCO A; 3UHX A; 1Y4V A; 2HCO B; 1MLF A; 1Y4V B; 2ZLT A; 1TGH A; 2ZLT B; 5AZQ A; 3M3A A; 3UHU A; 5IYC P; 1F63 A; 1RH1 A; 2G11 A; 1J7Y B; 4H07 A; 1B8D A; 3UGY A; 1G08 A; 2MYB A; 3WR1 A; 1XDT T; 1K2Y X; 1G08 B; 3UHG A; 2D5X A; 3KUN A; 3G4R A; 2D5X B; 1GBV A; 1PBX A; 1NH2 A; 1GBV B; 1MDN A; 1PBX B; 4ROC B; 3OSM A; 2AUR A; 3BCQ A; 3BCQ B; 2ZT0 A; 1MP9 A; 1CH4 A; 2BW9 M; 1HLB A; 2DKA A; 1A0U A; 5IKS A; 1A0U B; 3ZJS A; 2HBD A; 3D7Q A; 3GIO A; 3G52 A; 3UHC A; 4A8S A; 2IG3 A; 1N39 A; 1PCZ A; 3BA2 A; 3HRW A; 1B33 A; 1P5G X; 4MXK A; 2W72 C; 3HRW B; 3N89 A; 4TMA B; 3WFW A; 2C0K A; 1B33 B; 4LMX B; 2FRK X; 2D2N D; 3A5B A; 1G0B A; 1QN7 A; 1CDW A; 1G0B B; 4QAU A; 1JPB A; 2BLH A; 2R80 A; 3QJC A; 3QJC B; 2R80 B; 3HS9 A; 3UH3 A; 1MOC A; 109M A; 1COL A; 2C7K A; 4DC8 A; 3QQQ A; 1CH9 A; 1AZI A; 3E55 A; 1MLM A; 1OFJ A; 1QPW A; 2O58 X; 1QI8 A; 1QPW B; 3GKV A; 4CFF A; 1QI8 B; 3GKV B; 4NXA A; 1OBM A; 1JZM A; 1BIN A; 4FH7 A; 1XZ5 A; 1TBA B; 2DHB A; 1DTM A; 1J7S A; 1XZ5 B; 2DHB B; 1QNC A; 1J7S B; 1VXE A; 4O1T A; 1CBL A; 3WTG A; 1F99 A; 1T6A A; 1CH1 A; 3WTG B; 1Y8K A; 1XSZ A; 1F99 B; 1Y8K B; 1C9B B; 1J7W A; 1S0H A; 2R5X A; 1A3O A; 4IL8 A; 1A3O B; 4HH1 A; 2H8F A; 2H8F B; 2ZSO A; 1O1L A; 2VLZ A; 5IYD P; 2QRW A; 1O1L B; 2Z6S A; 4ETU A; 5AN4 A; 2D6C A; 3VRG A; 1KFI A; 5EYJ A; 3HXN B; 3VRG B; 3HS8 A; 1A4F A; 3LB1 A; 3TE5 A; 1BZ0 A; 3HC9 A; 1A4F B; 1BZ0 B; 3LB4 A; 2JL9 A; 3QM8 A; 7HBI A; 3MVC A; 3MBA A; 1A3N A; 1YGD A; 3WCV C; 1A6N A; 1A3N B; 1YGD B; 2G30 A; 2RAO A; 3PIA A; 1MOH A; 3NUH B; 2MGG A; 3PIA B; 3ZTA A; 3R5I A; 3R5I B; 3TDH A; 3RSM A; 4NZI A; 1Y85 A; 5KER A; 3GYS B; 5KER B; 1RTX A; 3KVS A; 3KVS B; 2AUQ A; 3WFT A; 5CNF A; 3AQ7 A; 2GKM A; 1HI8 A; 1MLN A; 1ITH A; 1MTI A; 3G4U A; 4F6G A; 2B7H A; 4U8U A; 2B7H B; 4A8M P; 1BAB A; 3AQ9 A; 1BAB B; 1Y4B A; 2GL3 A; 1Y4B B; 5EV5 A; 3CWT A; 2BWH A; 1OFK A; 4D7R A; 2AV0 A; 1LA6 A; 1QXD A; 3ZJH A; 1RQ4 A; 3FH9 A; 1LA6 B; 1QXD B; 1RQ4 B; 3FH9 B; 2VM0 A; 1KFQ A; 1DWR A; 1GDJ A; 2F7L A; 1SHR A; 1CH5 A; 1SHR B; 1S69 A; 2GNW A; 5HY8 A; 5HY8 B; 1A87 A; 4TYX A; 5HLU A; 1YDZ A; 1YDZ B; 1LH2 A; 1Y0A A; 3QJB A; 1Y22 B; 1A6G A; 1Y45 A; 1Y0A B; 3QJB B; 1HAB A; 1NZ3 A; 1Y45 B; 3OGB A; 1BZR A; 1FDH G; 1HAB B; 3S48 C; 2EVK A; 1QN6 A; 1Q1F A; 1N3A A; 3WCU A; 3WCV D; 3WCU B; 4MQG A; 5B85 A; 4MQG B; 1GDK A; 3VRF A; 1KY6 A; 3VRF B; 5F9C A; 1M3H A; 4H0M A; 4H0M B; 3ZJI A; 3PI8 A; 3UHT A; 3PI8 B; 1O1M A; 1UX8 A; 1O1M B; 2MGJ A; 3R0G A; 1IDR A; 2HHB A; 2HHB B; 2C7J A; 1YE0 A; 1ON7 A; 3PI9 A; 1YE0 B; 1ON7 B; 3PI9 B; 1VRE A; 5HLX A; 1B9K A; 2HBC A; 1S5Y A; 2HBC B; 1S5Y B; 1QXE A; 1QXE B; 3UHV A; 4ILZ A; 5HU6 A; 1URV A; 1X3K A; 4ZIZ A; 5HU6 B; 4ZIZ B; 2R4Z A; 1CII A; 1MLH A; 2YA3 A; 1I3D A; 2HBF A; 2HBF B; 3UGZ A; 1VXA A; 1HBS A; 3ZJL A; 3K3U A; 1HBS B; 3DPT A; 6HBI A; 3UHH A; 1NWN A; 3I0X A; 4FC3 A; 3MN0 A; 2ZSZ A; 4FC3 B; 1Y4Q A; 2V92 A; 3KRM A; 1Y4Q B; 1JP9 A; 1GH0 A; 2UUN B; 5EE4 D; 3OO5 A; 4TWU A; 1S6A A; 2LH2 A; 1DLY A; 2V1K A; 3OO5 B; 4Q70 A; 5JDO E; 4Q70 B; 4FWZ A; 3GQR A; 3D7O A; 2QFK A; 3GQR B; 3D7O B; 4PQC A; 2XYK A; 1MLG A; 1Q9U A; 3CVS A; 3M3B A; 3OLP A; 1DXC A; 1YMB A; 2MYD A; 4ROE B; 1MYG A; 1LH6 A; 2D60 A; 2V9J A; 1MBC A; 2D60 B; 3UHS A; 4C7P A; 1YVQ A; 2FKF A; 1YVQ B; 3E5O A; 1KYD A; 1YGF A; 4GXE A; 1YGF B; 1NXF A; 1BJE A; 2XKI A; 1CG8 A; 1CG8 B; 1PVS A; 3FEW X; 3GK9 A; 5C6Y A; 3IC0 A; 3IC0 B; 2WY4 A; 4TWV A; 3DHR B; 1ECN A; 1XZV A; 1XZV B; 1HRM A; 4PO5 A; 2VYZ A; 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