The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VEWTDAEKSTISAVWGKVNIDEIGPLALARVLIVYPWTQRYFGSFGNVSTPAAIMGNPKVAAHGKVVCGALDKAVKNMGNILATYKSLSETHANKLFVDPDNFRVLADVLTIVIAAKFGASFTPEIQATWQKFMKVVVAAMGSRYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN I
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| publication title |
The crystal structures of trout Hb I in the deoxy and carbonmonoxy forms.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Oncorhynchus mykiss
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| total genus |
57
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-06-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4H07 A; 2D5X B; 4XS0 B; 3ZJH A; 2V1H A; 5JGG A; 3S65 B; 3SDN A; 3IC0 B; 1VRF A; 3QJB A; 2ZS1 B; 2D2N D; 4F4O A; 3AG0 A; 3TM9 A; 3ZJS A; 1XZV A; 1RQA A; 3OO4 B; 1H1X A; 1XZ5 B; 2WTG A; 1JEB B; 4JYQ A; 3G4V A; 1FLP A; 3ZJQ A; 4YU3 A; 1HBA A; 3E55 A; 1GVH A; 3R5I A; 4O2G A; 3ZJN A; 3KUN A; 1O1L B; 2XYK A; 3BCQ B; 2AA1 B; 4N7P A; 5EUI A; 4MXK A; 1NWN A; 1VXB A; 2Z6S A; 1DO1 A; 3W4U B; 4U8U B; 1NIH B; 2MGD A; 1NS6 A; 1YVQ A; 2OHA A; 3VRF B; 1YHE B; 1LTW A; 5B85 A; 1CH5 A; 2G0S A; 1V9Q A; 3ZJR A; 5E29 A; 1Y5K A; 1FCS A; 1IRD B; 3HEP A; 1HGC B; 1DTM A; 2HCO A; 2O5S X; 2R80 B; 1DXD A; 3ARK A; 1JY7 B; 2R4X A; 4F68 A; 2EKU A; 2MGM A; 5E29 B; 3GDJ A; 1HDS B; 1MGN A; 1LFV B; 1Y31 B; 6HBW B; 1EBT A; 2FRF A; 3UGZ A; 3G4U A; 5CMV A; 3A59 B; 1ECA A; 1C7B A; 5D1V A; 1HAC B; 1RPS B; 1BUW B; 1CBM A; 1DO3 A; 4X0L A; 1O1J B; 4MU5 A; 5E6E A; 1XZ4 B; 1HSY A; 1NAZ A; 1FN3 A; 1R1X A; 4N8T A; 1GDJ A; 1X9F A; 1YEU B; 4IT8 A; 3GKV A; 1Y8I A; 1UFJ A; 3ORD A; 1A0Z B; 1MDN A; 1HLB A; 3P5Q A; 1VRE A; 4B4Y A; 1Y7C B; 1BZZ B; 3MN0 A; 1IRC A; 1O1P B; 4ROL A; 1OUU A; 2OIF A; 3WCW B; 1DXU A; 3IXF A; 1XZ2 A; 1V75 B; 1Y2Z A; 3D7O A; 2D2N C; 4NI0 B; 1SDK A; 3BJ3 B; 3UHN A; 1QSI A; 2G11 A; 1SPG A; 2QU0 A; 5JDO D; 3QQR A; 1T1N B; 1IBE A; 3OO5 A; 4KMV A; 3DUT B; 3OVU C; 1IDR A; 4NZI A; 1YIE A; 2DXM A; 1MLM A; 2XKI A; 4NK2 A; 1MLK A; 1YHU A; 1K0Y B; 2R4W A; 3UH7 A; 1NPG A; 2G0V A; 5HU6 A; 1DXV B; 5EET A; 4ODC B; 3UBC A; 1C7D B; 2BNL A; 4WCH D; 1MLN A; 1J7S B; 1YDZ B; 3WHM A; 1Y0C A; 4AVD A; 1XXT B; 5KDQ B; 3HYU B; 1Y7D A; 1BIJ A; 3WR1 B; 1IBE B; 3UHU A; 2R4Z A; 5C6E B; 4M4A A; 3HC9 A; 1MYM A; 2ZS1 D; 1RVW B; 1YHU B; 1AJG A; 1HDB A; 1YGD B; 2G10 A; 4NXA A; 1XYE A; 1YIH B; 1IOP A; 1OUT A; 3LR7 A; 2FRI X; 3AT5 A; 2ZSX A; 3GQR B; 1HBI A; 1YH9 A; 3ECL A; 1O1K B; 2W6V B; 2QFK A; 2ZFB A; 2R50 A; 4ROM A; 3VHB A; 1KD2 A; 2E2Y A; 3HXN B; 1DXT A; 1JZK A; 2ZST A; 4MQG B; 5CNB A; 1CPW A; 3ODQ B; 2ZLW B; 5JDO E; 3O7N A; 4FWZ A; 1HBS B; 1Y5J A; 4YU4 B; 1X46 A; 4KN3 A; 3LQD B; 1Y0A B; 1XY0 B; 1HLM A; 2VHB A; 3ZH0 A; 1OJ6 A; 2ZSQ A; 1JP9 A; 2D2M A; 1MKO B; 1A01 A; 1BZR A; 1Y09 B; 1FDH A; 5CNE A; 1FSX B; 1Y4B B; 1NGK A; 2MB5 A; 1HV4 B; 1CIK A; 1XQ5 B; 3WCU A; 2RAO A; 1CP0 A; 2ZLT B; 1YMC A; 2G12 A; 1A9W A; 3QJC B; 1A3O A; 3QZX A; 1Y5J B; 3S48 C; 1HHO A; 1HBH B; 2AUR A; 1O1M A; 2DC3 A; 2G0Z A; 1QPW B; 3M3B A; 3HEN A; 3HRW A; 1Y0W A; 1Y4P A; 1FAW B; 1HGB B; 4UUR A; 3D4X B; 4N7N B; 2LH1 A; 5SW7 B; 4DWU A; 4FWY A; 1LA6 B; 2PEG B; 1UC3 A; 3ZOL A; 1J7W A; 3PT7 A; 1GLI B; 1GCW A; 4MBN A; 3UHD A; 3IA3 B; 1Y4Q A; 3NML A; 3WCW D; 5EYS A; 3BJ1 B; 2ZT1 A; 3QJE A; 2LHB A; 4F6F A; 1URV A; 1CH9 A; 3PIA B; 3VRE B; 1O16 A; 1QXD B; 4ESA A; 3D1K A; 1B86 B; 3KUO A; 4NI1 B; 2KSC A; 2VYW A; 4TYX A; 3G4Y A; 1A6N A; 1R1Y A; 1Z8U B; 3BJ2 A; 1Y4R B; 4MXL A; 3D1A A; 1CH3 A; 3WCP B; 3RJN B; 1UX8 A; 3V2V A; 1MLQ A; 1U7S A; 1YE0 A; 5EV5 A; 2ZS0 A; 4BJA A; 1YGF A; 3CIU B; 4DC8 A; 1DUK A; 1HAB B; 1DWR A; 2G3H A; 5CND A; 1YCB A; 3UHK A; 2CMM A; 2QLS B; 1YE2 A; 1YEO B; 2HHD A; 1S61 A; 1M9P A; 1MBA A; 2Z8A A; 1NZ3 A; 4L7Y A; 1YHU D; 1MYI A; 3NL7 A; 3WCT A; 109M A; 1YOG A; 5CHQ A; 5AZR A; 1JL7 A; 1A6M A; 1X3K A; 4H0B A; 1THB B; 1Y0D B; 5E83 B; 2VLX A; 2PGH A; 1BZ6 A; 1CIO A; 1LFT A; 1Y4F B; 1CH2 A; 2VLY A; 1CQ2 A; 1BZP A; 1EBC A; 3UH3 A; 1V4X B; 1YHR A; 5ILE A; 1SHR A; 1YMB A; 1HDA A; 1N9F A; 1ABW A; 1Y8H A; 2HBS A; 1GDI A; 4G1V A; 2WY4 A; 2BLI A; 2Z6N B; 1MOD A; 3QJD A; 1QXE A; 5CN9 A; 1CH1 A; 5CNC A; 1LFY A; 1RTE A; 3MJU A; 3UHT A; 3QM7 A; 4M4B A; 2R1H A; 4TWV A; 1BZ0 A; 3EU1 B; 3R0G A; 1Y83 B; 3A0G B; 2R4Y A; 1PBX B; 2BLH A; 3OZU A; 1JP6 A; 4MQK B; 1HBB B; 3WCW C; 2EB9 A; 3VRG B; 5ILP A; 4F6B A; 2VYY A; 3OJ1 A; 4PNJ A; 3TLD A; 1X9F C; 4C44 A; 4HHB A; 1K1K A; 3AQ5 A; 3FH9 A; 2LH6 A; 1Y85 B; 3KMF A; 1ITH A; 1COH B; 2HBD B; 1F63 A; 1MYF A; 2EB8 A; 1BBB B; 2GNW A; 3PI9 B; 1MYJ A; 4H2L B; 3GOU B; 106M A; 3UHH A; 3A5A A; 2Z6T A; 3WTG A; 1YG5 B; 1DKE A; 3MOU A; 4IRO A; 1GZX A; 1S69 A; 3UHE A; 1JF3 A; 1G09 B; 4MQH A; 4G51 B; 1LFL A; 1Y7Z B; 1NZ5 A; 1MLH A; 2HHB A; 2HZ2 A; 4HSW A; 1DLW A; 1RQ3 B; 1NEJ B; 1BAB A; 3K8B A; 4HSX A; 2WTH A; 3D17 B; 2H8D A; 4O1T A; 2QMB B; 3EDB A; 1BIN A; 1XZ7 B; 4MQJ A; 1J3Z A; 1S5X A; 2BK9 A; 1Y22 B; 1FDH G; 1YHU C; 3G46 A; 1C40 B; 2ZT4 A; 3FS4 B; 1GBU A; 3NFE A; 2GL3 A; 1UIW B; 1MOB A; 1VHB A; 3ZOM A; 2MYC A; 5KER A; 3ARJ A; 2DN2 A; 2ZFO A; 3PI8 B; 1ECO A; 1MOH A; 3MKB A; 1FSL A; 1MYG A; 5JGG B; 5HBI A; 1A3N A; 1SWM A; 2AV0 A; 1J40 A; 1J3Z B; 2HHE A; 3UHI A; 3QJB B; 3SZK A; 3DHR A; 105M A; 1FHJ A; 1G9V A; 1N9I A; 4F4O B; 2DN3 A; 3A5G A; 1XZV B; 5CN5 A; 1RQA B; 2HBG A; 2ZLV A; 1F5P A; 3WI8 A; 4YU3 B; 1HBA B; 1V4U A; 3R5I B; 3GKT A; 4N7P B; 5EUI B; 3TM3 A; 1LHS A; 3ZJM A; 1O1O A; 2MBW A; 1NS6 B; 2ZT2 A; 1YVQ B; 5F2A A; 3M38 A; 3GQP A; 3MVC A; 1MNO A; 3UHZ A; 1Y5K B; 2HBE A; 1V4U B; 2XKG A; 2MGL A; 2LH3 A; 1Y45 A; 2V1K A; 1MYH A; 2HCO B; 1MWD A; 1G0B A; 1PMB A; 3WCU C; 1U7R A; 2MYD A; 2GKM A; 3DHT A; 2OLP A; 3EOK A; 4HRT A; 2HBF A; 1CLS A; 1Y8K A; 2DN1 A; 1MLR A; 3G4W A; 2ZSO A; 3GDJ B; 4KJT A; 1A00 A; 2ZSY A; 1NQP A; 1EWA A; 2G0X A; 2NX0 A; 2RI4 A; 2NSS A; 3WCV A; 1J3Y A; 1C7B B; 2ZSZ A; 1QI8 A; 4X0L B; 5E6E B; 3UHY A; 2SPN A; 1R1X B; 1A4F A; 1FN3 B; 4N8T B; 1X9F B; 1EMY A; 1MYZ A; 2VLZ A; 2W72 A; 1ECN A; 4HRR A; 3UHX A; 3GKV B; 1Y8I B; 3AQ7 A; 1IWH A; 2ZT0 A; 3P5Q B; 4FH6 A; 2ZLU A; 4ROL B; 1OUU B; 1DXU B; 4LPI A; 1J7Y A; 1XZ2 B; 2O5O X; 1Y2Z B; 3D7O B; 1O1I A; 1SDK B; 4B3W A; 1SDL A; 2D5Z A; 1I3D A; 1QSI B; 2B7H A; 3LB1 A; 1HRM A; 1SPG B; 2D60 A; 2QU0 B; 3MYM A; 2VM0 A; 3OO5 B; 1XCH A; 1YIE B; 1HBR A; 5HY8 A; 2DXM B; 2BW9 M; 2ZSP A; 3B75 A; 2ZS0 C; 5HU6 B; 1QSH A; 1Y8W A; 2JHO A; 1V4W A; 1YMA A; 4DWT A; 1J41 A; 4O4T A; 3G4R A; 3WHM B; 1Y0C B; 1Y46 A; 1A6K A; 2B7H B; 3K3U A; 2DHB A; 2G14 A; 3WFT A; 2D60 B; 1ABS A; 1Y7D B; 1BIJ B; 1BJE A; 1AJ9 A; 2BKM A; 1ABY A; 1WVP A; 4PQC A; 4M4A B; 3H58 A; 3WCT C; 3GQG A; 1KFR A; 1MNI A; 5D5R A; 1Q1F A; 4O4Z A; 3B75 B; 5HLU A; 5AZQ A; 1HDB B; 1VWT A; 2GLN A; 1WLA A; 1BVD A; 1MOA A; 5EU2 A; 1XYE B; 1O1N A; 1OUT B; 2XKH A; 3AQ6 A; 3AT5 B; 1YH9 B; 1UFP A; 1CP5 A; 1LFZ A; 1IT2 A; 1YFF A; 2GRF A; 5ILR A; 1WMU A; 2SPO A; 3UH6 A; 2ZFB B; 1DLY A; 4ROM B; 3PI2 A; 1A0U A; 1KD2 B; 3UHV A; 2EVK A; 1LH6 A; 2GTL A; 1DXT B; 1GDK A; 1S6A A; 1BZ1 A; 4NXC A; 2VRY A; 3A2G A; 1MYT A; 1GJN A; 2V1G A; 3PEL A; 1XZU A; 2D2M B; 3HHB A; 3RGK A; 1A01 B; 5KKK A; 1YVT A; 2IG3 A; 1RTX A; 1CBL A; 2BWH A; 3MYN A; 3WCU B; 2RAO B; 3UHS A; 3ONZ A; 2GRZ A; 3RJ6 A; 3KMF C; 4FC3 A; 4ZVB A; 2V1J A; 1S56 A; 5HLX A; 4DC7 A; 1A3O B; 3ARL A; 2OHB A; 3E5O A; 3UBV A; 1HHO B; 1N9X A; 1DWS A; 1O1M B; 3HHB B; 1HCO A; 1MNJ A; 3HRW B; 1ASH A; 1Y0W B; 3ZJI A; 2MHB A; 1X9F D; 1Y4P B; 3QM9 A; 3OGB A; 1S5Y A; 1OR6 A; 1YZI A; 1Y0T A; 3BOM A; 1J7W B; 3PT7 B; 4KMW A; 1GCW B; 3M3A A; 5AB8 A; 1Y4Q B; 1VXD A; 5HLQ A; 1NS9 A; 1Y7G A; 3QJE B; 3WFW A; 1Y4G A; 3U3E A; 4ESA B; 3D1K B; 1CMY A; 1URY A; 1DO4 A; 4UZV A; 1TES A; 2ZFO C; 1Y4V A; 1YEN A; 1SPE A; 4HBI A; 1HJT A; 3PT8 A; 1R1Y B; 3BJ2 B; 3GYS A; 3D1A B; 1MLL A; 1S0H A; 1YE0 B; 2ZS0 B; 1YGF B; 1MBS A; 4UIQ A; 1VXC A; 1RQ4 A; 3IC2 A; 3K9Z A; 1J3F A; 2MGA A; 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1CQX A; 1NIH A; 1BAB B; 1MLO A; 3K8B B; 3G52 A; 3VRF A; 2H8D B; 1KR7 A; 2W31 A; 104M A; 1YHE A; 4MQJ B; 1S5X B; 1MBN A; 3PI3 A; 2V1E A; 1NZ4 A; 1GBU B; 3NFE B; 4QAU A; 1IRD A; 5KER B; 1HGC A; 2NRL A; 2DN2 B; 2ZFO B; 5CN4 A; 2R80 A; 3LB3 A; 3MKB B; 5CN8 A; 1A3N B; 1JY7 A; 2W6X A; 1J40 B; 2ZS0 D; 2HHE B; 3SZK B; 1W92 A; 1A9W E; 1BVC A; 2OH8 A; 1AJH A; 3DHR B; 1HDS A; 1FHJ B; 1G9V B; 107M A; 2DN3 B; 1LFV A; 1Y31 A; 1LHT A; 6HBW A; 1IT3 A; 3DR9 A; 2ZLV B; 3A59 A; 103M A; 1HAC A; 1RPS A; 1BUW A; 1O1J A; 3WCT D; 1XZ4 A; 3QM8 A; 2D2M C; 1H97 A; 1YEU A; 2OH9 A; 4PQB A; 1CG5 A; 1O1O B; 2GTL C; 1A0Z A; 3QMA A; 1Y7C A; 1BZZ A; 1O1P A; 1UVY A; 2O5B X; 4NS2 A; 3GQP B; 1MNH A; 3WCW A; 3UGY A; 2MYE A; 2HBE B; 1MTI A; 1V75 A; 1YOH A; 2GDM A; 4NI0 A; 1Y45 B; 3BJ3 A; 1Y01 B; 4TWU A; 4WJG A; 1Y5F A; 4G1B A; 2V1F A; 1CG5 B; 2MGH A; 1G0B B; 3A5B A; 5B84 A; 1T1N A; 2NSR A; 3DHT B; 3DUT A; 1GDL A; 3EOK B; 4HRT B; 2HBF B; 3UHR A; 1CLS B; 1Y8K B; 5M3S A; 2FAL A; 2MGB A; 2DN1 B; 5IKS A; 1K0Y A; 1V5H A; 7HBI A; 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