The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKWGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| publication title |
Blocking the gate to ligand entry in human hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
60
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-06-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BZ1 A; 1A3O B; 3WCU A; 3QJE A; 1MNK A; 2ZT3 A; 3OO4 B; 1KR7 A; 5E29 A; 1LFT B; 1LUE A; 3DHR A; 1QXD B; 1UVX A; 2Z6N B; 1HBH A; 5AZQ A; 1RTE A; 4HBI A; 5CHR A; 3WR1 A; 3BJ1 A; 3BCQ A; 1HBA A; 4MBN A; 2QSP A; 2V1G A; 1V75 B; 2GKN A; 1XZ7 A; 3E5O A; 1YEO A; 3DUT A; 2QSS A; 3UH6 A; 2LH3 A; 1S0H A; 2MGM A; 1RQA B; 2HBF A; 1YE0 B; 3G4W A; 2V1F A; 1LH6 A; 1OJ6 A; 1O16 A; 1MOA A; 1JF4 A; 1THB A; 1F5P A; 1MBN A; 1N9F A; 2R1H B; 3MJU B; 3WCT B; 3HRW B; 2GNV A; 1AJG A; 2ZSR A; 1O1I B; 3ZJJ A; 3QM7 A; 3A9M A; 1V4W B; 1JPB A; 1Y2Z B; 2ZLT B; 1G0B A; 1Y4G A; 1MLH A; 1SI4 B; 1NZ4 A; 1BAB B; 1ABY B; 1CG8 A; 3LQD B; 2VLZ A; 3S1J A; 2D2M A; 2SPL A; 4MPM A; 3EDB A; 4YU3 A; 1O1O B; 1GBU A; 2ZST A; 3NG6 B; 1A4F B; 1LFZ B; 1HV4 B; 3A5A A; 5CNF A; 5MBN A; 2OHA A; 1J7Y A; 1EBT A; 2O5T X; 3ONZ B; 1JY7 B; 1Y0A A; 1OR4 A; 3HXN A; 2D5Z A; 3NL7 A; 1LH3 A; 103M A; 3QZX A; 1YGD B; 1GCV B; 2G14 A; 1SPG B; 3G53 A; 1CQ2 A; 1MLQ A; 2B7H A; 1PBX A; 3WTG A; 3CY5 B; 3A0G B; 1MYT A; 1NIH B; 1GZX A; 1XXT A; 1J52 A; 4MQC B; 2M6Z B; 5C6E A; 1JDO A; 5D5R A; 2H8F A; 2XKI A; 3ZJI A; 3UH7 A; 2HBS B; 3LR7 A; 109M A; 1BUW A; 2HBD A; 1J3F A; 2ZLV A; 1CH1 A; 4QAU A; 1Y8H A; 1VXD A; 2SPN A; 1YVQ A; 1MKO B; 2H35 B; 3ZJH A; 4WJG A; 1HGB B; 2ZSS A; 2W6V A; 1HBB B; 5E83 A; 2AUP A; 1DKE A; 1UX9 A; 1GDL A; 3WCV A; 1A9W A; 1LHT A; 4M4B A; 1YMB A; 1DXV B; 1YEQ B; 3LB3 A; 1V9Q A; 1WVP A; 1MYZ A; 5CN4 A; 2W72 C; 1GCW A; 1LFL A; 3D17 B; 2V1E A; 3BJ2 B; 1CG5 B; 4ROM A; 1YZI B; 1Y46 A; 3BJ3 B; 3ED9 A; 3VAU A; 2ZS0 C; 3KUN A; 2GLN A; 3AT6 B; 106M A; 1S5Y B; 3PT8 B; 3UHQ A; 3G4Q A; 1HCO B; 3BA2 A; 2MGC A; 1CP0 A; 1UFP A; 3R5I A; 3TM9 A; 3D1A B; 1HBG A; 1G0A A; 4ZVB A; 1Y4B A; 1S69 A; 2NSS A; 1YHU C; 1QSI A; 1O1L A; 1Y4Q A; 1X46 A; 4M4A A; 1B86 A; 1YOH A; 1SDK A; 3IA3 B; 3RJN B; 3LHB A; 1Y31 A; 3GQR A; 3HF4 B; 1K0Y A; 4UIQ A; 1XYE B; 3ECX A; 3SZK A; 3QJD B; 2D6C A; 4IRO B; 4ZVA A; 3HYU B; 3WFX A; 1NZ5 A; 1MBA A; 1A3O A; 3UBV A; 1DWR A; 3OO4 A; 1MNO A; 1FDH A; 1UIW B; 1BZ1 B; 2QRW A; 3WCU B; 2Z6N A; 2R4W A; 1KD2 A; 4U8U C; 3DHR B; 3ZJR A; 3UHS A; 1FCS A; 3UHN A; 2BKM A; 1IT3 A; 2PEG A; 3WI8 A; 1VXG A; 3WCV D; 3BCQ B; 2G0R A; 1FLP A; 3MVC A; 5HLU A; 3ZJO A; 1XZ7 B; 1YG5 B; 3LR9 A; 1YEO B; 2GL3 A; 2QSS B; 3GQP A; 1QSH B; 1LFY B; 1JL7 A; 1Y4V B; 1S0H B; 3ARL A; 2FAM A; 1NZ3 A; 3OZU A; 4F4O B; 2XYK A; 3ZOL A; 1BVC A; 112M A; 3MJU A; 4XS0 B; 3WCT A; 1CLS B; 3HRW A; 3GKV A; 1HDA B; 3MKB A; 3WFT A; 1V4W A; 2R50 A; 1Y2Z A; 1NWN A; 2ZLT A; 1SI4 A; 1BAB A; 1ABY A; 2IN4 A; 1VXA A; 3LQD A; 2YRS B; 1G0B B; 1Y4G B; 1Y45 B; 1O1O A; 2VRY A; 2MGD A; 5HBI A; 1F65 A; 1ABW B; 3G4Y A; 1DXD A; 1M6C A; 5B84 A; 1URV A; 3UH5 A; 2D2M B; 3ZJP A; 1LFQ A; 4YU3 B; 1A4F A; 1LFZ A; 1J7W A; 3E5I A; 3ONZ A; 3G52 A; 1HSY A; 2BW9 M; 1Y7G B; 1ECD A; 3K8B A; 3UHE A; 1BIJ B; 2OH8 A; 3QM9 A; 4L2M A; 1J7Y B; 4F6I A; 5CND A; 1SPG A; 3HXN B; 2D5Z B; 3NL7 B; 3IC2 A; 1C7D A; 4NXA A; 1J7S A; 3CY5 A; 1GDK A; 3GDJ B; 3A0G A; 3PT7 B; 5EV5 A; 2B7H B; 1PBX B; 4NXC A; 1NQP B; 3WTG B; 5CN5 A; 1A3N B; 3O89 A; 5AZR A; 1NAZ A; 1GZX B; 1XXT B; 1V4X A; 4FWY A; 2ZS1 C; 5B85 A; 1Y85 B; 6HBI A; 2ZLW A; 5C6E B; 3V2V A; 1NZ2 A; 3PIA B; 3HEN A; 3IXF A; 3WFW A; 3AT5 A; 4G51 A; 1DO1 A; 3GK9 A; 1BUW B; 1Y8I B; 2ZLV B; 1MKO A; 2H35 A; 1HGB A; 1Y8H B; 4GZG A; 1GLI B; 2OIF A; 3QMA A; 1HBB A; 2WTG A; 5EE4 C; 3WCT D; 4JYQ A; 1UFJ A; 3KUO A; 1MBO A; 2EVK A; 5JGG A; 5MBA A; 1DKE B; 3OK5 A; 2AV0 A; 3KMF C; 2MGG A; 3QQQ A; 1CH3 A; 3D17 A; 2ZLU B; 1FAW B; 2WTH A; 3BJ3 A; 1LFL B; 5ILR A; 2FRI X; 4PQC A; 3AT6 A; 1S5Y A; 3ZHW A; 1YEV B; 1JEB B; 1HCO A; 3NML A; 4ODC B; 2D2N C; 4N7N B; 4SDH A; 1XZV A; 5JDO E; 1R1Y A; 1YVT A; 2HHB A; 2RI4 A; 3G4R A; 5HLQ A; 1BZ6 A; 3S65 B; 1MYM A; 1DLY A; 2HHD B; 4FC3 B; 3HEP A; 5IKS A; 1A6K A; 2W31 A; 2GTL C; 1BJE A; 2HCO B; 1QSI B; 3HF4 A; 3QJB B; 3UHR A; 1XYE A; 4IRO A; 4M4A B; 1MCY A; 5JOM A; 1J3Y B; 1YFF B; 1VXH A; 3HYU A; 1Y31 B; 3GQR B; 5E6E A; 1K0Y B; 1X3K A; 2MGF A; 4HHB A; 1LA6 B; 110M A; 4DC7 A; 7HBI A; 5EQM A; 1NPG A; 1J3Z B; 3UH3 A; 1N9I A; 4DWT A; 1DM1 A; 2VYZ A; 2ZFO C; 4F6J A; 1XZ5 B; 2QFN A; 4F6D A; 1KD2 B; 2QMB A; 3ZJM A; 1A0Z A; 3ZH0 A; 1YG5 A; 2BNL A; 5HLX A; 4NK1 A; 1QI8 B; 2PEG B; 1QSH A; 1HLB A; 1LFY A; 2DXM B; 1Y4V A; 2ZS0 B; 3M3B A; 4F4O A; 4YU4 A; 4XS0 A; 1CLS A; 1MBS A; 1HBR B; 3GQP B; 2FAL A; 1MBC A; 1HDA A; 3M3A A; 3MYN A; 1YEU B; 2O5L X; 3GKV B; 1Y7D B; 3MKB B; 1YHU B; 2YRS A; 4KN3 A; 1Y45 A; 2C0K A; 1MYG A; 1ABW A; 3OO5 A; 1F5O A; 1HHO A; 1Y4R A; 2O5Q X; 2R80 B; 1NS9 B; 2VLX A; 3FH9 A; 1MNJ A; 5EOH A; 1LFQ B; 1EBC A; 1Y0W B; 1Y7G A; 1BZP A; 1FDH G; 1IOP A; 1BIJ A; 1YH9 B; 1J7W B; 2V1J A; 3ODQ B; 1ASH A; 4O35 A; 3QQR A; 2ZFO A; 1HAB B; 3K8B B; 2DC3 A; 3EOK A; 3GDJ A; 1GBV A; 1LJW B; 4X0L B; 1MLK A; 3PT7 A; 1MZ0 A; 3K3U A; 3IC2 B; 1C7D B; 1YEN A; 1NQP A; 3WCU D; 1J7S B; 4HRR B; 1A3N A; 1GDI A; 1O1J A; 4UUR A; 2MHB A; 1IBE A; 3GOU A; 1NS6 B; 1Y85 A; 3ASE A; 3PIA A; 4B3W A; 4KMW A; 2GRZ A; 1V4X B; 1EW6 A; 2ZLW B; 1Y8I A; 4MQI A; 1CMY A; 5EUI A; 2MYC A; 2ZSY A; 3PI3 A; 3WCW C; 1GLI A; 3AT5 B; 4G51 B; 3GQG B; 5EU2 A; 5JDO F; 1Y0T A; 1RQ3 A; 2ZSX A; 2AV3 A; 1MOD A; 4DWU A; 2H8D B; 1VHB A; 1Y8W A; 4F6B A; 3FS4 A; 1BZZ B; 1Y5K B; 1LH1 A; 3AG0 A; 1BZR A; 3O7N A; 4MQG A; 2D60 A; 4O1T A; 5JGG B; 1Y5J A; 5JDO C; 2ZLU A; 1FAW A; 5CNE A; 2R4Y A; 102M A; 2D2M D; 1DLW A; 5EYS A; 1CH7 A; 5KER B; 1OR6 A; 1XZ2 B; 2BLI A; 2R4X A; 1MDN A; 1SPE A; 1YEV A; 1MNI A; 2G0V A; 1JEB A; 4ODC A; 4N7N A; 4NI1 B; 1DO7 A; 1X9F C; 3G4V A; 2ZFO D; 1SHR B; 4PNJ A; 3S65 A; 2ZSQ A; 1MOH A; 1XZV B; 1LTW A; 1R1Y B; 2RI4 B; 1YVT B; 2HHB B; 2MYB A; 2PGH A; 2LH7 A; 2HHD A; 4TWV A; 4FC3 A; 1IDR A; 2Z6S A; 1Y0D B; 1Y7Z A; 1YHE A; 2HCO A; 3QJB A; 3CIU B; 3A5B A; 2O58 X; 2HZ2 A; 1J3Y A; 1YFF A; 1HRM A; 1OFK A; 2O5S X; 3M38 A; 2Z8A A; 3PI1 A; 2NSR A; 1DUO A; 2WY4 A; 1I3E A; 1LA6 A; 3PI9 B; 2LH6 A; 2BMM A; 4NK2 A; 4N7P A; 5E6E B; 1V4U B; 1J3Z A; 3NMM A; 3TLD A; 4HHB B; 3AQ5 A; 4ILZ A; 4NZI A; 4ESA A; 1MWD A; 1IRC A; 2W72 A; 1XZ5 A; 1ABS A; 2W6Y A; 1IT2 A; 4F69 A; 5EET A; 3R0G A; 2O5B X; 2NRM A; 3IC0 B; 1QI8 A; 1MLJ A; 1JP8 A; 2DXM A; 1LHS A; 2QMB B; 2ZS0 A; 1A0Z B; 4FH6 A; 1COH A; 1HBR A; 6HBW A; 1EMY A; 2D2N B; 3HHB B; 1YEU A; 4YU4 B; 1VXB A; 1OUU B; 1Y7D A; 3UGY A; 1WMU B; 3MOU A; 1Y09 B; 1YHU A; 1R1X A; 3HEO A; 2VEE A; 3ARJ A; 2GTL B; 5KKK A; 1MOC A; 2AUQ A; 1LH7 A; 2E2Y A; 4N7O A; 2ZLX B; 4JAC A; 2R80 A; 3ORD A; 1NS9 A; 3OO5 B; 2G10 A; 1DTI A; 5ILE A; 1YCA A; 1YMA A; 1HGC B; 1CH2 A; 1HHO B; 1Y4R B; 4AVE A; 1Y4F A; 1Y0W A; 2IG3 A; 3UGZ A; 1YH9 A; 1U7R A; 5HAV A; 3FH9 B; 3ODQ A; 3A59 A; 1OBM A; 1MYH A; 1MGN A; 1HAB A; 3G46 A; 1A0U B; 4OOD A; 4O4Z A; 3OJ1 A; 2XKG A; 3TM3 A; 4ROL A; 3V2Z A; 1QXE A; 2MGE A; 4U8U A; 1LJW A; 2ZFO B; 3UHT A; 4X0L A; 2FRF A; 1K1K B; 1D8U A; 2MYE A; 5CNB A; 2AUO A; 4HRR A; 3EOK B; 3DR9 A; 1GBV B; 4N8T B; 1MOB A; 1VWT B; 1AJH A; 1CH9 A; 1URY A; 2VM0 A; 1YEN B; 1NS6 A; 1FSX B; 1G08 A; 1YOG A; 1O1J B; 2MHB B; 1IBE B; 1YGF B; 3GOU B; 3S66 A; 3UHC A; 3MN0 A; 5ILM A; 2HZ1 A; 1YOI A; 1CQX A; 1A9W E; 1MWC A; 3ZJS A; 1CIO A; 2ZS0 D; 3AQ8 A; 1M6M A; 2MGH A; 3GQG A; 4MQJ A; 4MQI B; 1CMY B; 5EUI B; 1VXF A; 3UHV A; 4MQK A; 3DHT A; 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4KJT A; 1O1M B; 2HBE B; 1NEJ A; 2W72 B; 3IC0 A; 5CNC A; 3PI8 B; 1JL6 A; 5CHQ A; 1UMO A; 1LH2 A; 1YHR A; 1ECN A; 3E4N A; 1A00 A; 1F63 A; 3OZV A; 1G09 B; 2D2N A; 3HHB A; 2OLP A; 2R4Z A; 2DN2 B; 3ECZ A; 4F6G A; 1COH B; 1X9F B; 1MTI A; 1OUU A; 4DC8 A; 3VHB A; 6HBW B; 1HDS A; 1WMU A; 1Y09 A; 2V1K A; 2FRK X; 2G0X A; 3WHM B; 1YIE B; 101M A; 1S6A A; 4O2G A; 1ECO A; 1J40 B; 1CPW A; 2GTL A; 4BJA A; 1R1X B; 4B4Y A; 2MGK A; 5AB8 A; 2ZLX A; 3UHG A; 3NFE A; 2ZS1 D; 2DHB A; 4FWX A; 2ZT2 A; 4N7O B; 1HGC A; 1YDZ A; 1BZ0 B; 2MGL A; 1YE2 B; 3MBA A; 3VRE B; 1Y4F B; 2ZT1 A; 1A0U A; 1Y4P B; 3RGK A; 1T1N A; 5CN6 A; 1YIH A; 2JHO A; 1VRF A; 1WLA A; 3UHH A; 1S5X B; 3A59 B; 5EE4 D; 1CBM A; 1L2K A; 1K1K A; 1HAC B; 4ROL B; 3BOM B; 2ZWJ A; 1QXE B; 4MU5 A; 4VHB A; 3WCV C; 4U8U B; 4WCH D; 4N8T A; 3AQ9 A; 1VWT A; 2MBW A; 1FN3 A; 1VRE A; 1FSX A; 2SPM A; 1DXU A; 1NGK A; 1NXF A; 1NPF A; 1YGF A; 3UHK A; 1JW8 A; 1G08 B; 3D7O A; 2ZSN A; 2AA1 B; 3QM6 A; 1O1N B; 3AQ7 A; 2DN1 B; 3S66 B; 3QJC B; 2GRH A; 5KDQ A; 1YCB A; 1MLS A; 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