The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAFERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M38 A; 2ZS1 A; 1A3O A; 4JYQ A; 4X0L B; 1T1N A; 1FDH A; 3OGB A; 3NMM A; 2D5Z B; 1H1X A; 1Y5J A; 1ABW B; 3E4N A; 1FN3 A; 1J41 B; 1LFV B; 1XZ5 B; 1V9Q A; 2GTL C; 5HU6 B; 1HDS B; 1K1K B; 2DHB B; 3WHM A; 2OH8 A; 1YVQ B; 2HZ2 A; 1HAC A; 4IT8 A; 4NI0 A; 1URV A; 1XXT A; 1YMA A; 3M3A A; 1Y22 A; 3PI3 A; 1NZ5 A; 1N9H A; 1G09 A; 2MGD A; 1MYM A; 1Y85 A; 3S1J A; 2O58 X; 1J7W A; 1MBN A; 5D1V A; 1CO9 A; 1SPG A; 1TU9 A; 5CND A; 2R80 B; 3ZJR A; 1YDZ B; 1GDL A; 1BJE A; 3LB2 A; 1O1O B; 3GQP B; 4L7Y A; 2AA1 A; 3K9Z A; 3D17 A; 2ZSX A; 1Y5F B; 1XZ4 B; 1V4W B; 1Q1F A; 2BMM A; 2VEE A; 1S5Y A; 5JDO F; 4HHB A; 5EUI A; 3GLN A; 5E6E A; 2HZ3 A; 4MAX A; 2GL3 A; 1GBU B; 1GBV A; 5EE4 D; 1CMY B; 1FDH G; 1YEQ A; 1DKE B; 3IC2 B; 1Y45 B; 4F6I A; 1JP8 A; 2ZLU B; 1DO1 A; 1O1K A; 1FSX A; 1YFF A; 1Y46 A; 1OUU A; 3AT6 B; 2ZLT A; 1J40 A; 1DXU B; 1ABY A; 3PI1 A; 4F68 A; 4YU4 B; 1NZ2 A; 3MOU A; 3WCV A; 3ZJO A; 3E55 A; 1YGF A; 1MYJ A; 1CH3 A; 1LFZ B; 1XZ7 B; 4MQH A; 1BZ1 A; 5E29 A; 1BZ0 A; 2R4Z A; 1W92 A; 2ZSS A; 1Y8H B; 1SHR A; 4N7P A; 3D1A A; 3LB4 A; 1IT3 A; 1Y83 B; 1YE2 A; 3FS4 B; 3G4W A; 3MJU B; 2ZFO A; 3WTG B; 3OJ1 A; 4MQC A; 2V1K A; 2DN3 A; 2GNV A; 1HLM A; 2HBE B; 2VEB A; 5KER B; 4NI1 A; 4G1V A; 1YEU B; 3H58 A; 1GCW A; 1K0Y A; 2R4W A; 1V5H A; 2HHE A; 4G51 B; 5ILP A; 4ESA B; 2Z85 A; 1YE0 A; 1LH2 A; 1IDR A; 3A2G A; 1HAB B; 1YEV A; 1NWN A; 2VHB A; 5M3S A; 2XKH A; 1HDB B; 5EE4 C; 2BLI A; 1YOI A; 1DO3 A; 3SZK A; 4TWU A; 4F6D A; 2GTL A; 2D60 A; 4N7O B; 1Y31 B; 1PBX A; 5MBA A; 4ODC A; 1FLP A; 1CP0 A; 1Y7C A; 1O1P B; 2HBD B; 3WFW A; 1DO7 A; 1EBT A; 3K8B B; 2NRL A; 3DHR A; 2LH7 A; 4NXC A; 3BCQ A; 1EWA A; 5E83 B; 1Y8W A; 4OOD A; 3VRE B; 3EDB A; 2CMM A; 1YOH A; 3AG0 A; 4ROL A; 2EVP A; 2AV3 A; 1Y7Z B; 3HXN A; 1UMO A; 2HBC B; 3K3U A; 4PNJ A; 3ECL A; 1Y0A A; 1Y09 B; 1N9X A; 3MYM A; 4N7N B; 1HBH A; 3FH9 A; 1HHO A; 1GZX A; 1YHU B; 2IG3 A; 1MYI A; 3GK9 A; 4L2M A; 2OLP A; 3OO5 B; 3BOM B; 3E5I A; 5CMV A; 1JF4 A; 1MLK A; 1IRD A; 1UT0 A; 1Y4F B; 1YHU D; 2VM0 A; 1RSE A; 1OJ6 A; 1SDL B; 1MLL A; 2IN4 A; 2MGB A; 4X0L A; 1UFJ A; 2R4Y A; 2WTH A; 3ZOL A; 4F6F A; 2MGE A; 2D5Z A; 1RPS B; 2R4X A; 101M A; 3HC9 A; 1ABW A; 2MGJ A; 1J41 A; 1BZ6 A; 3S66 A; 1MOH A; 5HU6 A; 3IC0 A; 1K1K A; 2DHB A; 3MVC A; 3HEP A; 1YVQ A; 5CN7 A; 1J3Y B; 2MGG A; 2GKN A; 2BK9 A; 3ASE A; 1OBM A; 3PI2 A; 3UHI A; 3A0G B; 1Y5K A; 3LQD B; 2OHA A; 1U7S A; 1IT2 A; 2AUR A; 1U7R A; 4TWV A; 1NGK A; 2ZLV B; 2Z6T A; 2FRF A; 4O2G A; 1MLR A; 1I3E A; 2R80 A; 3UHD A; 5EU2 A; 2PEG B; 2SPM A; 1YDZ A; 2ZT3 A; 1Y4R A; 3ED9 A; 1DLW A; 2DXM B; 1XY0 B; 1O1O A; 3M39 A; 1I3D A; 5CN8 A; 1CH5 A; 3UHS A; 3EU1 B; 1Y5F A; 1XZ4 A; 1V4W A; 4HRT B; 1JL7 A; 1VXE A; 3QJD B; 4C0N A; 1YHU C; 4SDH A; 3LHB A; 2Z6S A; 4G1B A; 1GBU A; 1CMY A; 1Y0C B; 3IC2 A; 1Y45 A; 4MQJ B; 2ZLU A; 1COH B; 2AUP A; 3ONZ B; 1Y01 B; 2BWH A; 2QSP B; 3O89 A; 3AT6 A; 4YU4 A; 1NZ3 A; 1JY7 B; 5SW7 B; 1FAW B; 5AZR A; 1RQA B; 4FH7 A; 4WJG 1; 2GDM A; 1BZZ B; 1LFZ A; 1MBA A; 3UHB A; 2O5L X; 3DR9 A; 1GDK A; 3M3B A; 1XZ7 A; 3GKV B; 1GVH A; 1MKO B; 3GKT A; 4ILZ A; 1Y8H A; 1HV4 B; 1RTX A; 1CG5 B; 1Y83 A; 3FS4 A; 1J3F A; 2H8F B; 3MJU A; 2W6Y A; 3G52 A; 3D7O B; 4F6J A; 1A01 B; 1M9P B; 2HBE A; 5KER A; 104M A; 1G08 A; 5EV5 A; 1YEU A; 2QFK A; 1HDA B; 4PQB A; 1ECN A; 5CNF A; 4JAC A; 4G51 A; 2XKG A; 1Y4G B; 1HAB A; 1NPG A; 1NQP B; 3PI8 B; 1MBI A; 3NL7 B; 1YHR B; 3R5I B; 3QM5 A; 1HDB A; 1BVC A; 3WCU B; 1OR6 A; 1Y4V B; 2ZLW B; 3GYS B; 1C7B A; 1UFP A; 4N7O A; 1Y31 A; 1Y7G B; 3A59 B; 1RVW A; 2ZS0 B; 2HBD A; 1QI8 B; 5EQM A; 1HBG A; 3K8B A; 1GJN A; 5EOH A; 2MB5 A; 1AJG A; 3G53 A; 4BJA A; 3QMA A; 2MBW A; 5E83 A; 4UUR A; 1V07 A; 4NZI A; 2ZS0 D; 5KKK A; 2ZT2 A; 1MYT A; 2JHO A; 3VRE A; 1JL6 A; 1F5P A; 1VRE A; 3BJ1 A; 2R50 A; 1A6K A; 5EET A; 1Y7Z A; 2R1H B; 1BIN A; 3ZH0 A; 2ZSY A; 1HSY A; 1Y7D B; 2MGM A; 2ZT1 A; 2HZ1 A; 1Y09 A; 4N7N A; 1CH4 A; 1NIH B; 3MYN A; 1YHU A; 1O1N A; 1GDI A; 3OO5 A; 3BOM A; 1O1I B; 1LH7 A; 1DXV B; 3EOK B; 1YVT A; 2V1G A; 2NSS A; 4MQI B; 3HRW B; 1LH1 A; 2QU0 B; 2EF2 A; 1Y4F A; 2KSC A; 1ABS A; 4HRR B; 3QM8 A; 1SDL A; 3HEN A; 2MGH A; 1OUT A; 2OH9 A; 3KUO A; 1MLO A; 1XCH A; 1Y0D B; 3AQ7 A; 1BAB B; 1C7D B; 1RPS A; 4F69 A; 6HBW B; 1LJW B; 1Y8K B; 1JZK A; 3WCU C; 3UHE A; 5JDO E; 2MGC A; 2NX0 A; 1A9W E; 2G11 A; 2LH5 A; 3UI0 A; 3MKB B; 1N9F A; 1Y8I A; 2ZS0 C; 1IBE B; 1DWS A; 3UH7 A; 5C6E B; 1YHE A; 4QAU A; 2G0R A; 3LQD A; 1MZ0 A; 2ZLV A; 3A5G A; 1HJT A; 3VRF B; 1NS9 B; 1FHJ B; 1O1J B; 4F4O A; 3DHT A; 3WCW B; 4F6B A; 2H8D B; 2WTG A; 2PEG A; 2H35 B; 2DXM A; 2EB9 A; 2O5B X; 4MXL A; 2SPL A; 1S0H B; 1Y0W B; 3WCW D; 3EU1 A; 5CN9 A; 1MLJ A; 4O4T A; 1THB B; 1JWN A; 1G9V B; 2D6C A; 4HRT A; 2MYB A; 5KDQ B; 1CH1 A; 2HHD B; 1A0U B; 4H2L B; 1MOB A; 1LFL B; 1G0A B; 1AZI A; 1JDO A; 1SPE A; 1Y0C A; 4GZG A; 1MOD A; 2ZSN A; 5CN5 A; 3H57 A; 4UIQ A; 4MQJ A; 2HBF B; 1COH A; 3ONZ A; 2W6X A; 2QSP A; 3WR1 B; 2MYA A; 4H07 A; 110M A; 1B86 B; 3HYU A; 1JY7 A; 2E2Y A; 5SW7 A; 1R1Y B; 5CNC A; 3TLD A; 1FAW A; 3PT7 B; 1S61 A; 1RQA A; 1XZU B; 1LA6 B; 4YU3 B; 1BZZ A; 2WY4 A; 1Y2Z B; 1QSI B; 1YG5 B; 3GKV A; 1MKO A; 106M A; 1S6A A; 4NS2 A; 1HV4 A; 3UHW A; 1HGA B; 2QLS B; 1CG5 A; 1CBM A; 2H8F A; 2RAO B; 4AVD A; 2ZSZ A; 1YH9 B; 2LH6 A; 1G0B B; 3D7O A; 1AJH A; 2LHB A; 1A01 A; 1M9P A; 3LB3 A; 1MTK A; 3GOU B; 3WCW C; 1HDA A; 1VXG A; 3IA3 B; 5F2A A; 4H0B A; 1MYF A; 1NEJ B; 1OFK A; 2B7H B; 2V1I A; 3NG6 B; 4MQK B; 1QXE B; 1Y4G A; 1NQP A; 3PI8 A; 4ZVA A; 3P5Q B; 1VXF A; 1XYE B; 1YHR A; 3R5I A; 5HLX A; 2AV0 A; 4DC7 A; 1VXH A; 1V75 B; 3WCU A; 1VWT B; 3WCP B; 4C44 A; 2W72 B; 3W4U B; 1Y4V A; 4UZV A; 2ZLW A; 3UBV A; 3GYS A; 2D5X B; 2FRK X; 3NFE B; 2VLZ A; 4MQG B; 1NXF A; 1Y0T B; 1Y7G A; 1Y4Q B; 1J3Z B; 3A59 A; 2ZFB B; 2ZS0 A; 3OO4 B; 1RQ4 B; 1XZ2 B; 1A6G A; 1QI8 A; 1KFR A; 5AZQ A; 5AB8 A; 2G12 A; 1HBB B; 2DN1 B; 2XKI A; 3AT5 B; 4WJG A; 1XZV A; 1V4X B; 1UX8 A; 1LH5 A; 3G4Q A; 1BZR A; 2ZSR A; 1XQ5 B; 4FWZ A; 2FAL A; 1MGN A; 2ZS1 B; 1A3O B; 2G0S A; 1T1N B; 2R1H A; 2BLH A; 1LFQ B; 1CQ2 A; 2D2M B; 3RGK A; 3NMM B; 1WLA A; 1NWI A; 3SDN A; 1Y5J B; 1Y7D A; 1BVD A; 2MGI A; 3GQG B; 1NIH A; 2D2M D; 1DUO A; 3UH6 A; 1BBB B; 1O1I A; 1DXV A; 1DXT B; 1LFV A; 1XZ5 A; 3EOK A; 4FWX A; 1DUK A; 4MQI A; 1HDS A; 2MHB B; 4MPM A; 2VLY A; 1XXT B; 3HRW A; 2QU0 A; 1MYH A; 3CIU B; 3PEL B; 4HRR A; 1HBS B; 4PQC A; 2EKU A; 1HBR B; 2HBG A; 1MWD A; 1X3K A; 4MBA A; 1MNH A; 5HLQ A; 1QXD B; 1CIK A; 1A0Z B; 1Y0D A; 1D8U A; 3ARK A; 1KD2 B; 1C7D A; 1DWR A; 1BIJ B; 3QZX A; 2MGF A; 1LJW A; 1LH3 A; 1Y8K A; 5CNE A; 6HBW A; 2GKM A; 2W72 C; 3G4V A; 3S1I A; 3UGY A; 3G4R A; 4F6G A; 1YIE B; 1MBS A; 3MKB A; 1C7C B; 2ZLX B; 3GQP A; 4IRO B; 2VYY A; 5C6E A; 1MLN A; 3ZJQ A; 1MBC A; 1DM1 A; 3VHB A; 1YEQ B; 3G4Y A; 3VRF A; 1NS9 A; 1FHJ A; 1O1J A; 3WCW A; 1O1K B; 2H8D A; 1LUE A; 1F5O A; 3UHU A; 1DKE A; 2ZS1 C; 1A00 B; 2Z8A A; 2VRY A; 2D2M C; 1DO4 A; 2HHB B; 1DXU A; 2G3H A; 1THB A; 1G9V A; 1CLS B; 3ZJI A; 1MNK A; 5KDQ A; 5CN6 A; 2LH1 A; 1A0U A; 4H2L A; 1YIH B; 1LFL A; 1G0A A; 1WVP A; 1IRC A; 3MJP B; 1DXC A; 1UIW B; 3ZJH A; 2HCO B; 1NZ4 A; 3D1A B; 1A3N B; 1HCO B; 1DTM A; 1YOG A; 3UH5 A; 2HBF A; 3CY5 B; 4KMW A; 1B86 A; 2FAM A; 1O1L B; 4NI1 B; 1R1Y A; 3PT7 A; 3WTG A; 1XZU A; 1K0Y B; 1LA6 A; 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1O1M B; 3BA2 A; 3PI4 A; 1Z8U B; 1J52 A; 3S48 C; 1Y35 B; 1XQ5 A; 3ARJ A; 1YCB A; 1GLI B; 2NSR A; 1URY A; 4XS0 B; 5B85 A; 1EW6 A; 1LFQ A; 2D2M A; 1BUW B; 5JGG B; 5C6Y A; 4VHB A; 2Z6N B; 3ZJJ A; 2AUO A; 1LFY B; 3GQG A; 5D5R A; 1CQX A; 3S66 B; 3IC0 B; 2ZSO A; 1BBB A; 1DXT A; 1C40 B; 2ZT0 A; 2MHB A; 3CIU A; 3RJ6 A; 3PEL A; 2RI4 B; 1Y5K B; 5MBN A; 1HBS A; 1Y4B B; 3A5A A; 4ZVB A; 3U3E A; 1J3Y A; 1HBR A; 3QQR A; 2DN2 B; 1QXD A; 1A0Z A; 4U8U C; 1KD2 A; 3A0G A; 1BIJ A; 3QQQ A; 1Y4R B; 2MGK A; 2QSS B; 2VLX A; 5HLU A; 4NK1 A; 1YIE A; 3AQ9 A; 2V1F A; 1HBA B; 3HF4 B; 1C7C A; 1DWT A; 2ZLX A; 3PT8 B; 1MWB A; 2BNL A; 1XY0 A; 4IRO A; 2M6Z B; 2MYC A; 3KUN A; 4MBN A; 5HBI A; 1MOC A; 1VHB A; 3QJD A; 5JDO D; 1YZI B; 2LH3 A; 3BJ2 B; 1NS6 B; 2ZSQ A; 5CNG A; 5EYJ A; 102M A; 107M A; 4KN3 A; 1VRF A; 1UVY A; 2MYE A; 3HEO A; 4M4B B; 1CH9 A; 3OZW A; 1A00 A; 3PIA B; 1M6C A; 3A5B A; 2HHB A; 1MLH A; 2ZSP A; 2O5Q X; 1MLU A; 1CLS A; 1HGB B; 3HHB B; 1IWH B; 1YIH A; 1VXB A; 3AQ6 A; 3MJP A; 1R1X B; 1CH2 A; 4ROM B; 1MTI A; 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