The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structures of manganese- and cobalt-substituted myoglobin in complex with NO and nitrite reveal unusual ligand conformations.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
59
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J3Z A; 1HDS A; 3A5B A; 4AVE A; 2ZSY A; 4MBN A; 1YG5 B; 1HGC A; 3UHU A; 1OBM A; 6HBI A; 1A4F A; 2GDM A; 6HBW B; 1XYE A; 1IBE A; 3WCT A; 4UIQ A; 3ARJ A; 3WCU B; 1SI4 B; 2ZSN A; 2H8F B; 1O1J A; 1O1M A; 2HBG A; 1HCO A; 1VRF A; 5EE4 D; 1YOH A; 1DXC A; 2MGA A; 2VYY A; 2R4X A; 2DC3 A; 1XQ5 B; 2B7H A; 1LFQ A; 3CIU B; 2HBD A; 2GRF A; 2ZS1 B; 3UHH A; 2ZT2 A; 2MGH A; 3EOK B; 1MLJ A; 3U3E A; 3IC2 B; 1CO9 A; 3QJE B; 1YEO B; 4X0L B; 3UH6 A; 3UH3 A; 3WCT D; 2GNW A; 2ZSX A; 2VYW A; 1YHR B; 2DN3 A; 1GLI B; 1K0Y B; 2ZS0 C; 2ZFO A; 3R0G A; 1XZ4 B; 1Y4Q A; 1LFT A; 2R50 A; 1Y83 A; 5CNF A; 1J7Y B; 1HBH A; 1FHJ A; 2VRY A; 4C0N A; 4TYX A; 1YVT A; 1F65 A; 1OR6 A; 3G46 A; 3EU1 A; 3AQ6 A; 2R1H B; 1DKE A; 2ZSZ A; 1RQA B; 5JDO C; 1A6K A; 2MGF A; 1O1I A; 1CG5 A; 1HSY A; 3WCV B; 1TU9 A; 1HLB A; 4F6D A; 4YU4 B; 4O4T A; 3S1I A; 1DWT A; 1HHO B; 1Y7G A; 4HSX A; 1O1L A; 1XZU B; 2W6Y A; 3G4Q A; 2AUP A; 1IT2 A; 1QSI B; 1MLO A; 1YOG A; 5EYS A; 3QQQ A; 1SWM A; 2O5B X; 1AJH A; 2C0K A; 1OR4 A; 4F4O A; 4FWX A; 2EKU A; 2ZWJ A; 4HRT A; 3OO5 B; 1C7D B; 2QFN A; 1JP6 A; 3MYN A; 1V4W B; 3PIA B; 1JDO A; 1NWI A; 2ZSS A; 1VXB A; 1QPW A; 4H0B A; 3CY5 A; 3OVU C; 3OZW A; 1J41 B; 4N8T B; 5CNE A; 3HXN B; 1UFJ A; 4H2L B; 2HBC B; 2VEE A; 2G3H A; 3BOM A; 1A3O A; 2QMB A; 1YE2 A; 3WR1 A; 5CN4 A; 2V1E A; 1BZ1 A; 1OUU B; 1BAB A; 4ZVA A; 3ODQ B; 1ABS A; 3BJ2 A; 5SW7 B; 1QXE A; 3QJC A; 1J3Z B; 2R4Y A; 2ZT1 A; 1M6M A; 1Y4F B; 2MGG A; 4FH6 A; 1MBS A; 1G0B A; 1HGC B; 1HAC A; 2BLJ M; 4F6G A; 1OJ6 A; 1O1N A; 3UHG A; 1MNI A; 1IBE B; 3WCT B; 2MYE A; 1JF4 A; 2FRK X; 1O1J B; 1O1M B; 2DHB A; 3QM7 A; 1IDR A; 1O1K A; 1UT0 A; 109M A; 4U8U C; 4F68 A; 1UC3 A; 2W6W A; 3VRG B; 2B7H B; 3ARL A; 2EVP A; 2EF2 A; 1S69 A; 2WTG A; 3E55 A; 3ECX A; 3LB2 A; 1MOH A; 3AT6 A; 1BIN A; 3GOU A; 3ZJH A; 1GCW B; 1ECO A; 3KUO A; 1YOI A; 1DXT A; 1CBM A; 2LH6 A; 4HHB A; 5CMV A; 5EQM A; 2Z8A A; 3GQP A; 3D4X A; 1Y4Q B; 4QAU A; 7HBI A; 4F6B A; 5JOM A; 2SPO A; 1Y83 B; 1HBR A; 3AQ8 A; 2ZSO A; 4N7N B; 5AB8 A; 1QI8 B; 1HBH B; 1FHJ B; 3TM9 A; 1GDJ A; 1C7B A; 5ILE A; 1YVT B; 2M6Z A; 3RJN B; 5CNB A; 2VLZ A; 1HDB B; 3UH7 A; 4JYQ A; 3ZJM A; 1ABY B; 1CIO A; 1X9F C; 4MBA A; 1SPE A; 3GYS A; 3G4R A; 1CG5 B; 2D2M C; 2D2N C; 2MYB A; 2GTL A; 1U7R A; 2EB9 A; 3ARK A; 3UHX A; 1SPG A; 1V4U A; 3PI3 A; 1LH1 A; 1VXD A; 2QSS B; 2RI4 A; 2ZLW A; 2VEB A; 4XS0 A; 5EOH A; 1MBO A; 1VXG A; 1Y4G B; 3A59 A; 2ZT4 A; 1HBB A; 2MHB A; 2ZFB B; 4HRT B; 1Y7D A; 1MYG A; 1Y35 B; 1YMB A; 1O1P A; 3ORD A; 4MQJ B; 1LFY A; 1NPG A; 1QPW B; 2GTL D; 3E5I A; 3G4V A; 1LUE A; 3UHY A; 5E83 A; 1MCY A; 4L2M A; 3CY5 B; 1MTK A; 3G4Y A; 3VAU A; 1GDK A; 4TWU A; 1HJT A; 3GDJ A; 1A3O B; 2QMB B; 1JZM A; 1YE2 B; 4OOD A; 1BZ1 B; 1SI4 A; 1BAB B; 2AV0 A; 4DWU A; 3B75 B; 2H8F A; 1DO7 A; 1S0H A; 1JW8 A; 1QXE B; 3QJC B; 3D7O A; 1YHU A; 1MKO A; 2RAO A; 1NPF A; 2ZS1 A; 3ONZ B; 3ZJQ A; 3OO4 A; 1UVX A; 3QJE A; 2EB8 A; 1VXH A; 2DHB B; 4HBI A; 2EKT A; 1I3E A; 2OIF A; 2Z6T A; 1VHB A; 2E2Y A; 5EV5 A; 2Z85 A; 3FS4 A; 3K9Z A; 4HRR A; 1DO3 A; 3D17 A; 1YHU D; 4ODC B; 1J3F A; 3K3U A; 1Y01 B; 5HAV A; 3NL7 A; 3G53 A; 3K8B A; 5B85 A; 1CMY B; 4G1V A; 2MYD A; 1N9I A; 3M39 A; 3GOU B; 1MNO A; 1R1Y B; 1GCV A; 3QMA A; 1KFR A; 2OHA A; 2PGH A; 1J52 A; 3GQP B; 5JGG A; 1A9W A; 3D4X B; 2R1H A; 1F5O A; 2NX0 A; 5JDO E; 3UHE A; 4FC3 B; 1HBR B; 4TWV A; 4ROL B; 2IG3 A; 2ZSP A; 1XZ5 A; 2NRL A; 3MOU A; 3ZJI A; 4YU4 A; 1FSX B; 4MPM A; 1IOP A; 5CNC A; 1C7B B; 1XZU A; 2M6Z B; 3UGZ A; 1YE0 A; 1MBA A; 1QSI A; 5EUI B; 3OZV A; 5M3S A; 3KMF C; 3WCU C; 2V1I A; 2SPM A; 2H8D A; 4MQH A; 3MJU B; 1JL7 A; 1WLA A; 2GLN A; 1YIH A; 1JWN A; 2HHD A; 1BZ0 A; 1LFL A; 1HAB A; 2GTL B; 5AZR A; 1EWA A; 1A6N A; 1L2K A; 1SPG B; 1X46 A; 1V4U B; 4SDH A; 2RI4 B; 1HBA B; 2VHB A; 1BZR A; 2V1K A; 3TM3 A; 4O1T A; 4XS0 B; 3QZX A; 1J41 A; 3A59 B; 1HBB B; 4H2L A; 1S5X A; 3G4U A; 104M A; 1OUU A; 2G12 A; 4O35 A; 1HDA A; 4B3W A; 3WCP A; 1WMU A; 4DC8 A; 1BUW A; 3DUT B; 3HRW B; 3ZJJ A; 5E83 B; 4MXL A; 1JL6 A; 1Y8I A; 3GK9 A; 1Y4F A; 1Y8H B; 4M4B A; 5CNG A; 3UHT A; 1B0B A; 1MOD A; 3QJB A; 1CG8 A; 4N7P A; 3NMM A; 1Y4V A; 1Y46 B; 1A0U A; 3GDJ B; 2GNV A; 1DM1 A; 1NAZ A; 1O16 A; 4NXA A; 4G51 B; 5MBN A; 2HBE A; 1Y85 B; 1KR7 A; 1S0H B; 1MNH A; 2BKM A; 1OUT A; 3D7O B; 3OGB A; 1YHU B; 1BBB B; 3RJ6 A; 3VRG A; 1V07 A; 1MKO B; 3LR9 A; 2NRM A; 1Y31 B; 2RAO B; 3WCV C; 5B84 A; 3AQ5 A; 2W72 A; 3OO4 B; 2MYC A; 2HBS A; 3MKB B; 4MXK A; 2G14 A; 5JDO D; 3P5Q A; 2VYZ A; 1GCW A; 4PQ6 A; 2IN4 A; 2JHO A; 3FS4 B; 3AG0 A; 4F69 A; 1A6G A; 4HRR B; 2MGD A; 3ZJN A; 3D17 B; 1GBV A; 4FH7 A; 4NK1 A; 3HC9 A; 3NL7 B; 3WCW C; 4N7O A; 3K8B B; 2ZSR A; 4N7N A; 1G0A A; 2BMM A; 2O5M X; 4MQK A; 4ILZ A; 1QI8 A; 2HHB A; 2MGK A; 2W6X A; 3AQ7 A; 3UHZ A; 1ABW B; 3LR7 A; 1LH3 A; 2WY4 A; 1OFK A; 2V1G A; 4IT8 A; 1MDN A; 1GCV B; 2PGH B; 1YMA A; 1HDB A; 5JGG B; 1MLN A; 1ABY A; 3UHN A; 4F6J A; 1UMO A; 3QJD A; 4F6F A; 1XZ5 B; 1LFZ A; 1VWT A; 1HRM A; 1MTI A; 1AZI A; 5AZQ A; 2GKM A; 1A01 A; 2QSS A; 2HZ1 A; 1YE0 B; 4BJA A; 4DC7 A; 1Z8U B; 1A00 B; 3WCT C; 1Y4G A; 4O4Z A; 1SHR B; 2H8D B; 1MYZ A; 4MQH B; 2ZFB A; 2VLX A; 1Y5K A; 2ZT0 A; 1YFF A; 1YIH B; 2HHD B; 5HU6 A; 1BZ0 B; 1Y35 A; 3BA2 A; 1LFL B; 1HAB B; 1IT3 A; 1BZZ A; 1FAW B; 5HLU A; 4MQJ A; 1GDI A; 1J7S A; 2H35 A; 3GKV A; 1NXF A; 3V2Z A; 1MWC A; 4LPI A; 1BIJ B; 110M A; 4PQC A; 1NZ3 A; 1YEU A; 4U8U D; 1F5P A; 4KN3 A; 3SDH A; 3G52 A; 1JZL A; 1NZ4 A; 1S5X B; 1HGA B; 3RGK A; 4NXC A; 1LTW A; 1CH5 A; 1HDA B; 3B75 A; 3WCP B; 1WMU B; 2ZFO C; 2D5X A; 1MYH A; 1CLS B; 1J40 A; 1N9X A; 1BUW B; 2ZLT A; 1Y8I B; 3O89 A; 2AV3 A; 2GKN A; 4M4B B; 2ZLU A; 4JAC A; 3QJB B; 2GRH A; 1CG8 B; 4N7P B; 3NMM B; 1Y4V B; 1A0U B; 1Y7Z B; 102M A; 3ONZ A; 3WTG B; 1JY7 A; 2CMM A; 2HBE B; 1J3Y B; 1RTX A; 1MYJ A; 1ASH A; 1NS9 B; 1Y22 A; 3A9M A; 1OUT B; 5ILM A; 3VRF B; 1V5H A; 3UHQ A; 1JPB A; 3A0G B; 1S5Y A; 3KUN A; 2MBW A; 4ODC A; 1MLL A; 2HCO B; 2W72 B; 1MBN A; 2MB5 A; 4NS2 A; 2G0V A; 2HBS B; 1CMY A; 3P5Q B; 1X9F D; 1Y0A B; 1R1Y A; 3BJ3 B; 2NSS A; 3ZJR A; 1JZK A; 1XCH A; 3PT8 B; 2MYA A; 1GBV B; 1DWR A; 3G4W A; 4HSW A; 1YMC A; 4FC3 A; 4ROL A; 4N7O B; 1MYF A; 1G0A B; 4MQI A; 4MQK B; 5HBI A; 1CQ2 A; 2HHB B; 1RPS A; 1FSX A; 3MN0 A; 3D1A B; 1LA6 A; 3PI9 A; 5D1V A; 5EUI A; 3M3A A; 1CBL A; 2DXM A; 4ESA A; 1CP5 A; 1AJG A; 3UHK A; 4IRO B; 1FN3 B; 1YGD A; 1RTE A; 3MJU A; 3QJD B; 1LFZ B; 1OFJ A; 1VWT B; 1S6A A; 1UX9 A; 3ZHW A; 4U8U B; 1MLG A; 1A01 B; 1HBA A; 1EBT A; 1V4X A; 1DXU B; 1ECN A; 1ECA A; 3ZOM A; 3UH5 A; 1PMB A; 3LB4 A; 1Y5K B; 2NSR A; 1YFF B; 1THB A; 2BK9 A; 2O5O X; 1W92 A; 5HU6 B; 4ZVB A; 3R5I B; 1BZZ B; 1Y09 B; 1BZ6 A; 1J7S B; 3TLD A; 2H35 B; 3GKV B; 5C6E A; 2DN2 B; 2Z6S A; 3DUT A; 1GZX B; 3HRW A; 1YCB A; 4M4A A; 3WFT A; 2LH3 A; 3PT7 B; 1YEU B; 3LQD B; 1Y8H A; 2D6C A; 1JP8 A; 1Y46 A; 1DTM A; 1YH9 A; 4G51 A; 5CHQ A; 4UUR A; 1Y85 A; 3BCQ A; 2BLI A; 3UHB A; 2D5Z A; 2D5X B; 5E6E A; 1J7W A; 1GBU B; 4YU3 A; 1J40 B; 1VXC A; 1CH9 A; 3DHR A; 2ZLT B; 1BBB A; 1UIW B; 3ZJP A; 108M A; 2ZLU B; 1Y31 A; 3IXF A; 1X9F B; 2OH8 A; 3NML A; 1LH6 A; 1JY7 B; 3MKB A; 2G11 A; 1YHE A; 3EDA A; 1Y22 B; 2FRI X; 3VHB A; 4NI1 A; 4AVD A; 2HZ2 A; 1S56 A; 1DLW A; 1S5Y B; 1DUK A; 1C7C A; 2BLH A; 3MYM A; 3PI1 A; 1YDZ A; 2GTL C; 1U7S A; 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1MOA A; 2QU0 A; 1JP9 A; 1LH2 A; 2R4W A; 2V1H A; 1YHE B; 2HHE A; 2QFK A; 1Y0A A; 2LH5 A; 4NI1 B; 1YVQ B; 5CN6 A; 1JEB B; 3UHD A; 1NWN A; 3BJ3 A; 2OLP A; 3ASE A; 1YEV B; 1MLQ A; 3PT8 A; 3QM9 A; 1C7C B; 1CQX A; 3WFX A; 1RQ4 A; 1YDZ B; 1LH5 A; 4UZV A; 2ZSQ A; 2HZ3 A; 2O5Q X; 2O5L X; 4O2G A; 2LHB A; 2BW9 M; 2O58 X; 3ZJL A; 1GDL A; 1Y4B A; 3D1A A; 1MLK A; 4PNJ A; 1YEQ B; 1Y45 A; 3LB3 A; 1Y4R B; 1NIH B; 1Y8W B; 3HEO A; 3ED9 A; 3S1J A; 1MLH A; 1CO8 A; 2FAL A; 3HF4 A; 1XZ7 B; 3HEP A; 1MGN A; 1LHS A; 1NS6 B; 3BJ1 A; 3VRE B; 1YGF B; 1A0Z B; 4IRO A; 1FN3 A; 1HBG A; 1UFP A; 5EE4 C; 3PEL B; 4G1B A; 1MNJ A; 5HLX A; 103M A; 2R80 B; 2EVK A; 1A6M A; 112M A; 1YZI B; 1KD2 A; 3IC0 B; 4U8U A; 2GL3 A; 1SDK B; 3ZH0 A; 1DXU A; 2G0R A; 1UX8 A; 2ZFO D; 3E4N A; 2BWH A; 1Y5J B; 1EBC A; 1Y0C B; 2QLS A; 3UHI A; 1QXD B; 2AA1 B; 3R5I A; 1Y0W A; 3AT5 B; 2DN1 B; 3ZJO A; 1Y09 A; 1VXF A; 2MGM A; 2PEG A; 1ITH A; 1NEJ B; 4XDI A; 2DN2 A; 1GZX A; 1T1N B; 2ZS0 B; 3PT7 A; 1Y4P B; 3S65 A; 1Y8K B; 2W72 C; 2W31 A; 1MTJ A; 3S66 A; 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