The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKTGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Structural and spectroscopic studies of azide complexes of horse heart myoglobin and the His-64-->Thr variant.
pubmed rcsb |
| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
54
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-10-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y22 B; 1N9I A; 3NFE B; 1Y0A B; 1HV4 B; 1Y0W B; 4FWX A; 2R4W A; 1LFV B; 2DN1 B; 2AUR A; 1KD2 A; 1BAB A; 3QM5 A; 1AJ9 A; 1XZV A; 1WMU A; 4MQG B; 1MCY A; 1QXD A; 1Z8U B; 4G51 B; 4ROL B; 2CMM A; 1LFY A; 3V2V A; 1PMB A; 3LB2 A; 2MGI A; 2AV3 A; 3OZW A; 2ZSY A; 1HAB B; 1UFJ A; 3DUT A; 1Y85 B; 3AT5 A; 4MQK A; 1Y8W B; 2O5B X; 3PI8 A; 3QM6 A; 5MBA A; 108M A; 5ILP A; 1CMY A; 2HBE A; 1T1N A; 2VM0 A; 3GQP A; 6HBI A; 1YEU A; 2QMB B; 3UHD A; 1JWN A; 3WCV D; 1DM1 A; 1BIJ A; 3ARJ A; 1Y09 B; 2V1G A; 1YH9 B; 3IC0 A; 4F68 A; 5AZR A; 2MGB A; 1Y5J A; 3QZX A; 1X9F C; 4FH7 A; 4BJA A; 1XZ2 A; 3PI9 A; 2IG3 A; 2W31 A; 1QSI B; 1QI8 B; 2GKM A; 1RQ3 A; 1G9V A; 1OUU B; 5M3S A; 1JEB B; 1BVD A; 2GTL D; 3A59 B; 4MQJ A; 1SHR B; 1S61 A; 1UX8 A; 1BZ0 A; 2ZLV A; 3OZU A; 2B7H A; 2QSP A; 4HBI A; 2O5S X; 5CN8 A; 5EUI A; 5HY8 A; 4MQH B; 1Y22 A; 1SI4 B; 1VXC A; 3NFE A; 1Y0A A; 3UHX A; 3QJB B; 3UH5 A; 3BJ1 B; 1HV4 A; 1DXD A; 3A9M A; 1Y0W A; 2V1E A; 2C0K A; 1LFV A; 1Y83 B; 2DN1 A; 1J40 B; 1BZZ B; 4MQG A; 4G51 A; 4ROL A; 1W92 A; 1VHB A; 2ZST A; 1N9F A; 1NS9 B; 2W72 B; 1HAB A; 1IT2 A; 2ZT3 A; 1Y85 A; 5CN6 A; 1Y8W A; 2ZLX B; 3UHK A; 1GBU B; 1Y2Z B; 2HHE B; 4NZI A; 1S5X B; 2NX0 A; 1ECA A; 1RQA B; 2QMB A; 3WCT D; 1Y09 A; 1YH9 A; 3G4U A; 1OR4 A; 3KMF A; 2VLX A; 3WCW B; 109M A; 2H8D B; 1A9W A; 1QSI A; 1QI8 A; 3BOM B; 1MYZ A; 1A00 B; 1OUU A; 3AQ5 A; 1JEB A; 2VLZ A; 3HF4 B; 3WFU A; 2ZT0 A; 2ZSN A; 3A59 A; 1HDB B; 1LH1 A; 1SHR A; 3UH3 A; 3WR1 B; 4F6B A; 1MNH A; 4HSX A; 1CH3 A; 1ECN A; 4GZG A; 2YRS B; 1MDN A; 2R50 A; 1JF3 A; 1G0A B; 4MQH A; 1HBG A; 1MLK A; 1SI4 A; 2LH3 A; 4DWT A; 4F6G A; 1A0Z B; 3QJB A; 3BJ1 A; 4MQC B; 2WTG A; 1DO3 A; 1Y83 A; 1G08 B; 2D2M D; 1J40 A; 3AQ7 A; 2BK9 A; 1U7R A; 3WFX A; 1BZZ A; 1HBI A; 3SZK B; 1YMB A; 1COH B; 1WVP A; 1YG5 B; 4VHB A; 3MYM A; 1DO1 A; 5E29 B; 1NS9 A; 2W72 A; 2ZSQ A; 4NS2 A; 4MXK A; 4YU4 B; 1UFP A; 1CP0 A; 2ZLX A; 1GBU A; 1Y2Z A; 4U8U B; 2HHE A; 1S5X A; 1DO4 A; 5CND A; 5HLU A; 2VLY A; 1RQA A; 3ZJP A; 1MOD A; 1M6C A; 1VXB A; 2GNW A; 3OVU C; 1GDJ A; 2MGF A; 3SDH A; 2H8D A; 3E4N A; 1A3O B; 4NK2 A; 1FHJ B; 3EDA A; 1A00 A; 1V07 A; 3VRG A; 3HF4 A; 2V1I A; 1VWT B; 2PGH A; 4FWY A; 1HDB A; 1YCA A; 1K0Y B; 1XZU B; 2BLH A; 1Y4V B; 3WR1 A; 5HLQ A; 3PI3 A; 1A9W E; 3UHZ A; 5HAV A; 2YRS A; 3HRW B; 4F4O B; 1G0A A; 1O1I B; 1YE2 B; 1A0Z A; 1MBA A; 1OUT B; 4MQC A; 3H57 A; 3TLD A; 3SZK A; 1Y31 B; 2M6Z B; 1COH A; 1YG5 A; 3E5I A; 3HHB B; 4M4A B; 1CQX A; 5E29 A; 2V1F A; 2GKN A; 1HLM A; 2EVK A; 4YU4 A; 1GDL A; 4U8U A; 4PQ6 A; 4XDI A; 2G0S A; 1LH3 A; 4C44 A; 3LR9 A; 3KMF C; 3NMM B; 5HBI A; 3MN0 A; 1LH5 A; 1HHO B; 1MWB A; 3HXN B; 3K8B B; 1MOB A; 2RAO B; 3G53 A; 4KMV A; 1Y8K B; 1A3O A; 3S66 B; 1FHJ A; 2ZSX A; 3A5B A; 104M A; 1MBO A; 1VWT A; 1EMY A; 2GLN A; 1IT3 A; 1YVQ B; 1YHR B; 1K0Y A; 1XZU A; 3WCP B; 3QM7 A; 3IA3 B; 5CNC A; 3ZOM A; 2RI4 B; 2ZLU B; 1ITH A; 2R4Y A; 4OF9 A; 3HRW A; 2GRF A; 4F4O A; 2VEB A; 1DKE B; 1CIK A; 1O1I A; 3TM9 A; 1YE2 A; 2FAL A; 1OUT A; 3D1A B; 1DLY A; 3ZJN A; 3S1I A; 1EBT A; 4PQC A; 1A0U A; 3HEO A; 4UZV A; 3UHI A; 2W72 C; 3LB1 A; 2FRF A; 3OO5 B; 1Y31 A; 2M6Z A; 1J3F A; 3LB4 A; 5ILR A; 3FH9 B; 3HHB A; 4M4A A; 2SPO A; 5JOM A; 1Y46 B; 1JF4 A; 1NWN A; 1J7W B; 2GDM A; 4YU3 B; 3VRF B; 103M A; 3WTG B; 1MGN A; 5C6E B; 4DC8 A; 3MBA A; 3WCV B; 3NMM A; 1J41 B; 2GRH A; 4DWU A; 2JHO A; 1DXT B; 1SPG B; 5CNF A; 1F5P A; 4F6F A; 1WLA A; 2ZS0 D; 3HXN A; 2XKG A; 2OHB A; 2BWH A; 2V1H A; 3E55 A; 3K8B A; 1MBD A; 3ASE A; 1K1K B; 2RAO A; 1MNO A; 3G4V A; 1MOH A; 1CLS B; 2HBF B; 3GOU B; 1VXA A; 2R4X A; 1Y8K A; 3D7O B; 3S66 A; 1BIN A; 4WCH D; 1YVQ A; 1LA6 B; 1YHR A; 1NPF A; 3QJC B; 2DXM B; 3WCP A; 1GJN A; 2ZT1 A; 1J52 A; 1A01 B; 2RI4 A; 3MKB B; 2ZLU A; 4FC3 B; 1B0B A; 1MYI A; 5JDO D; 5SW7 B; 2AUQ A; 3QZZ A; 1MLJ A; 1YZI A; 2NRM A; 3D1A A; 1UVY A; 5B85 A; 1JL7 A; 3PEL B; 1Q1F A; 1DUK A; 3GQR B; 2MYB A; 1BZR A; 5HY8 B; 3G52 A; 2V1K A; 3OO5 A; 3FH9 A; 1IOP A; 1Y5K B; 1NZ4 A; 4U8U C; 1UVX A; 4NI0 B; 1Y46 A; 1CPW A; 1GBV B; 2D60 B; 1J7W A; 3ZJM A; 3BJ3 B; 2Z85 A; 3UHG A; 4YU3 A; 3VRF A; 3WTG A; 1S5Y B; 3S65 B; 2VYW A; 1Y01 B; 1MLU A; 5C6E A; 1YIE A; 3WCT B; 1LFQ B; 3WCV A; 2ZSS A; 1J41 A; 5KDQ B; 2R1H B; 1DXT A; 1SPG A; 3G46 A; 1A6K A; 1K1K A; 1L2K A; 1Y4P B; 1NZ5 A; 2OIF A; 1CLS A; 2MB5 A; 2LH2 A; 2HBF A; 2MYE A; 3GOU A; 3M38 A; 2NRL A; 1HBH B; 2ZFO D; 2LH6 A; 1V9Q A; 1I3D A; 3D7O A; 3QMA A; 3OGB A; 2Z6S A; 3OK5 A; 4UIQ A; 5CNG A; 3QM9 A; 1LA6 A; 4MBN A; 2FRI X; 3QJC A; 2DXM A; 3M3B A; 4LPI A; 5JDO E; 4MXL A; 3ZJL A; 1A01 A; 1NPG A; 3MKB A; 3R5I B; 4FC3 A; 1Y7G B; 1HBS B; 2MGC A; 5SW7 A; 5EE4 D; 1DLW A; 3MJU B; 4G1B A; 2D2M B; 5HU6 B; 1YEN A; 1CG5 A; 4NXA A; 2R80 A; 1Y0T B; 1HJT A; 1JL6 A; 1Y8H B; 4N7O B; 3PEL A; 1ECD A; 3GQR A; 1MYG A; 1BJE A; 4XS0 B; 1V4X B; 2GL3 A; 1PBX B; 1DWR A; 1XZ4 B; 1Y5K A; 2Z6T A; 3WCU C; 4F69 A; 1THB B; 5AZQ A; 4NI0 A; 1GBV A; 2D60 A; 4O2G A; 3SDN A; 2HHB B; 2QSS B; 5EET A; 1CG8 B; 3BJ3 A; 1HBR B; 1Y8I B; 2D5Z B; 2ZSR A; 1YOH A; 2O5L X; 1JZK A; 1S5Y A; 1MNI A; 3S65 A; 2IN4 A; 3OJ1 A; 2NSS A; 4ZVB A; 3WCT A; 1LFQ A; 4HSW A; 3GKV B; 4O1T A; 1MNK A; 4KMW A; 3UHC A; 3WHM A; 2R1H A; 5KDQ A; 1NWI A; 4N8T B; 1MBC A; 3UHS A; 3AG0 A; 5JDO C; 3AQ8 A; 3O7N A; 3OZV A; 3ZJS A; 1YFF B; 1Y4P A; 1Y5F B; 2Z6N B; 2VHB A; 1XY0 B; 111M A; 1HBH A; 2LH5 A; 1VRF A; 1D8U A; 1Y4Q B; 1V75 B; 110M A; 2DN3 B; 1OBM A; 2ZS1 D; 4ZVA A; 1J7Y B; 2D5X B; 4F6J A; 4TWV A; 1MWC A; 3R5I A; 1MLM A; 1Y7G A; 1HBS A; 4FWZ A; 3VRG B; 2PGH B; 3ZH0 A; 3DR9 A; 3MJU A; 1MLG A; 3G4Y A; 2D2M A; 2EKU A; 5HU6 A; 1Y4B B; 3WI8 A; 1R1Y B; 1Y0T A; 2AV0 A; 3E5O A; 1Y8H A; 6HBW B; 4N7O A; 4NI1 B; 1NQP B; 4XS0 A; 1I3E A; 1V4X A; 3EU1 B; 2FRK X; 1ABY B; 1PBX A; 5HLX A; 3TM3 A; 3UH7 A; 1XZ4 A; 3ED9 A; 5EYS A; 1THB A; 3UHR A; 1A3N B; 1QXE B; 1AJG A; 1GZX B; 3WCV C; 2HHB A; 2QSS A; 1CG8 A; 2QU0 B; 1FSX B; 1HBR A; 1YDZ B; 3LHB A; 1Y8I A; 1MLF A; 2D5Z A; 1O1O B; 3U3E A; 3CY5 B; 1XYE B; 3CIU B; 2HBS B; 3PT8 B; 2MGG A; 3GKV A; 2G12 A; 1IRC A; 1XZ5 B; 3VHB A; 1MTJ A; 2FAM A; 1IWH B; 4N8T A; 1FLP A; 1AJH A; 2R4Z A; 4DC7 A; 2GTL C; 3UHB A; 5EE4 C; 3NL7 A; 2BLJ M; 1MNJ A; 4H07 A; 1YFF A; 3RJ6 A; 1Y5F A; 2Z6N A; 3RJN B; 5EYJ A; 1XY0 A; 1Y4Q A; 1HBB A; 1V75 A; 1MKO B; 1MBN A; 2MHB A; 2DN3 A; 3HEP A; 4HRR A; 4L2M A; 1J7Y A; 2D5X A; 1MBI A; 1JDO A; 2ZSO A; 1JP6 A; 2AUP A; 3A2G A; 4H2L B; 4PQB A; 3FS4 B; 1O1J B; 1YEV B; 1N9X A; 1Y4B A; 1ECO A; 5EOH A; 1R1Y A; 1VXH A; 5AB8 A; 3UHV A; 6HBW A; 4NI1 A; 1NQP A; 1MOC A; 1Y7Z B; 2QFN A; 3WFT A; 1UIW B; 3EU1 A; 1ABY A; 1QPW B; 3ONZ B; 5E83 B; 2EB8 A; 1IBE B; 1LH2 A; 1A3N A; 1HGC A; 3HC9 A; 1Y35 B; 1QXE A; 4O35 A; 102M A; 3WCT C; 1GZX A; 2BLI A; 3WCW D; 1A0U B; 1NGK A; 2QU0 A; 105M A; 1FSX A; 1M6M A; 1YDZ A; 1O1O A; 1UX9 A; 3CY5 A; 1XYE A; 3CIU A; 2HBS A; 1Y7C B; 3MOU A; 3PT8 A; 2ZS0 B; 2MGH A; 1XZ5 A; 2E2Y A; 4IT8 A; 1IWH A; 2BKM A; 1MTK A; 3D17 B; 1DO7 A; 4UUR A; 4WJG A; 1FCS A; 1RQ4 B; 1Y4F B; 3VAU A; 1YEQ A; 3UHQ A; 3WCU B; 5IKS A; 3G4R A; 4B3W A; 2VYZ A; 3NG6 B; 1HAC A; 1CH4 A; 2HCO B; 1A6G A; 3GQG B; 5CN4 A; 1H1X A; 1MKO A; 4M4B B; 3HYU B; 2MGK A; 1KR7 A; 1TES A; 4ESA B; 1DWT A; 1CH9 A; 1N9H A; 4HHB B; 2VEE A; 1R1X B; 3ZJR A; 1J3Z B; 2D2M C; 2XKH A; 1MLO A; 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1BBB A; 2MBW A; 1YHE A; 1YE0 B; 1OR6 A; 2W6Y A; 3K9Z A; 1RPS A; 1Y4G B; 4FH6 A; 3ZJQ A; 3ECL A; 1BZ6 A; 3G4Q A; 2H8F B; 3UBV A; 3S48 C; 1A6N A; 2H35 B; 2DC3 A; 4X0L A; 2EVP A; 2O5M X; 1J3Y B; 3GKT A; 2ZFO A; 3MVC A; 5CN5 A; 106M A; 1V4U B; 2G14 A; 1LUE A; 1O1P A; 3WHM B; 1J7S B; 4IRO B; 1UT0 A; 3GDJ A; 2ZS1 B; 1YHU C; 2HHD A; 3HEN A; 3UGY A; 4MQI A; 3W4U A; 3PT7 A; 1LFL A; 4HRT B; 2W6W A; 3P5Q A; 3O89 A; 2GTL A; 1SDL B; 3PI2 A; 4O4T A; 1YMA A; 1O1K A; 1S69 A; 3H58 A; 1OJ6 A; 112M A; 1SDK A; 3AQ9 A; 1V4W A; 5ILM A; 3DHT A; 1G0B A; 3B75 B; 2G10 A; 5CHQ A; 2D2N C; 2VRY A; 3BA2 A; 3MJP B; 5KER A; 3A0G B; 3IC2 A; 5CHR A; 5E6E B; 1XQ5 A; 1BZ1 B; 3EOK B; 3ZJJ A; 2ZS0 C; 1LHS A; 1YE0 A; 1ABS A; 1NIH B; 5EV5 A; 1Y4G A; 2H8F A; 2BW9 M; 1YVT B; 2V1J A; 2O5T X; 2H35 A; 1J3Y A; 1O1M B; 1MYM A; 2ZFB B; 1A4F B; 1HCO B; 1GCV B; 1V4U A; 3QJD B; 1U7S A; 1CQ2 A; 3K3U A; 1YOI A; 1J7S A; 4IRO A; 4MAX A; 2ZS1 A; 1C7D B; 3NL7 B; 1RSE A; 2EKT A; 1JP8 A; 3PI1 A; 4ODC B; 4HRT A; 2AUO A; 3ORD A; 1SDL A; 1HBB B; 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