The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGHAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
NEURAL HEMOGLOBIN
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| publication title |
Ligand Migration in the Apolar Tunnel of Cerebratulus Lacteus Mini-Hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
43
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1IDR A; 4G1V A; 5HU6 A; 1MKO A; 1CO8 A; 1LFL B; 3HYU A; 1G0A A; 3HHB A; 2SPN A; 1A6G A; 1S5Y A; 2NSS A; 1GCV A; 1XZ7 B; 3LR9 A; 1Y31 A; 1MOA A; 1U7S A; 3BOM A; 3WCV C; 1YFF B; 1WMU A; 1MLG A; 2EVK A; 1BZP A; 1B86 A; 2O5S X; 2R50 A; 1GBV B; 3K8B B; 1CH2 A; 1HBA B; 1A00 B; 1O1I B; 1Y0W A; 1MNI A; 2HBF B; 1BIJ A; 3P5Q A; 1Y46 B; 5ILP A; 1J7W B; 2GTL A; 1MOC A; 1MYH A; 3BA2 A; 1QXE A; 3E5I A; 1UVY A; 4C0N A; 1HGC A; 1ABW B; 1YHU C; 3LB2 A; 3OO5 B; 3MYM A; 3UGY A; 2H8D A; 1V4W B; 3O89 A; 3BJ3 B; 1Y7G B; 3IC2 B; 1A3O B; 1JZL A; 2ZSY A; 2GDM A; 1Y4B A; 1V4U A; 1J3F A; 1R1Y A; 1JZK A; 2MGK A; 5EE4 D; 1J3Z B; 2DN3 B; 3DHR B; 101M A; 3QM9 A; 3ZJQ A; 3RGK A; 2W72 C; 3HRW A; 1VXG A; 1LFY A; 1VHB A; 1ABS A; 3NMM A; 3OJ1 A; 106M A; 1RTX A; 1Y4V A; 3FS4 B; 3W4U A; 1IT2 A; 3WI8 A; 2ZLV A; 3AQ5 A; 2ZSZ A; 2VLY A; 1BIN A; 5KDQ B; 7HBI A; 2O58 X; 1OJ6 A; 1UIW B; 1W92 A; 3VRF B; 1RQ4 A; 4X0L A; 2KSC A; 1MNO A; 1MBD A; 3H58 A; 1MNK A; 1N9F A; 1R1X A; 5F2A A; 3KMF A; 1HDS A; 1YEO A; 1M9P B; 1Z8U B; 3OVU C; 1SPG A; 5CNG A; 2R4Z A; 5CNE A; 2GTL C; 1GDL A; 3A59 B; 2O5Q X; 3WCT B; 1CIK A; 2D5X B; 2EKT A; 1XZ2 B; 2OHB A; 2R80 A; 3DUT B; 2RI4 B; 1ECN A; 3R5I A; 2G14 A; 5M3S A; 1CBM A; 3LHB A; 1Y4Q A; 2ZT4 A; 1DXC A; 1X9F B; 1O16 A; 2QFK A; 4FH7 A; 4U8U A; 2XKH A; 2VRY A; 1RTE A; 3UHS A; 105M A; 2BLI A; 4QAU A; 1S5X A; 4OF9 A; 5CN6 A; 2FRF A; 1CP0 A; 1QPW B; 1Y4P B; 4TWU A; 2GNV A; 1NS9 A; 4F6J A; 1BZR A; 1EBT A; 3O7N A; 1XYE A; 2OH9 A; 3OO4 A; 1Y0A A; 1X46 A; 2HCO B; 1J40 A; 1Y8W B; 3IXF A; 4B3W A; 3B75 B; 1A9W E; 2O5O X; 1RQ3 B; 1V75 B; 3AQ7 A; 1LHT A; 2QSP A; 1NWI A; 1I3E A; 1S69 A; 2ZLU B; 1G9V B; 4XDI A; 3WCW A; 3WCV B; 3QZZ A; 3VRG B; 3QJE A; 1A6N A; 5JGG B; 1F5O A; 5EV5 A; 5CNC A; 1IT3 A; 1LFZ A; 3K9Z A; 4O4Z A; 3G4W A; 4FWZ A; 1DO1 A; 1CLS A; 1QSH B; 1DKE B; 2ZSN A; 1BJE A; 4M4B A; 1QSI B; 3EDA A; 5CN7 A; 1O1K A; 3DHT B; 1YHU B; 1XZ4 A; 3RJ6 A; 3WFU A; 1FHJ B; 1NQP A; 1G09 B; 1Y8I B; 5CNF A; 1HHO A; 1Y22 B; 4OOD A; 1J7S A; 2W72 B; 4N8T B; 1MKO B; 5KER A; 1YHR A; 3HYU B; 4DWT A; 1G0A B; 3ECX A; 3UHG A; 1S5Y B; 2LH7 A; 1NPF A; 3GYS A; 1Y31 B; 1MYJ A; 1URV A; 3WFT A; 3WCW C; 1DXV A; 3BJ2 A; 2MGC A; 1WMU B; 2ZS1 A; 3PT7 A; 2C0K A; 1Y5F B; 1VWT A; 4ODC B; 1MTI A; 1JPB A; 2D2M C; 1B86 B; 1HBI A; 2NX0 A; 3ZOL A; 2ZFO A; 2HBC A; 3PIA B; 1ABY B; 1Y0W B; 4HRR A; 2QSS A; 1BIJ B; 4IRO A; 3P5Q B; 4FWX A; 2GTL B; 3ASE A; 1S61 A; 5CMV A; 4G1B A; 1HV4 A; 3GQR A; 1QXE B; 1J7Y B; 1K0Y B; 1HGC B; 5D5R A; 4MQJ A; 1J3Y A; 1WVP A; 4FWY A; 1F63 A; 2H8D B; 3S65 B; 4MQK A; 6HBW A; 4F6F A; 2PGH A; 5JDO F; 3PI9 A; 1UC3 A; 3SZK A; 1DLY A; 1Y4B B; 1V4U B; 1CG5 A; 4F4O A; 2DXM B; 2IG3 A; 3UHT A; 1M6C A; 1BZZ A; 2MGF A; 1L2K A; 5C6E A; 1LFY B; 2ZS0 C; 1O1J B; 3NMM B; 1ECA A; 2MGG A; 4KN3 A; 2G0S A; 3AT5 B; 2O5L X; 2AUQ A; 1Y4V B; 3PEL A; 4PQB A; 4XS0 A; 1Y4F A; 1Y5J A; 2ZLV B; 3UHH A; 3WCP A; 1CH7 A; 1IWH B; 1LJW A; 1EWA A; 1C7D B; 3VAU A; 5CN5 A; 1A9W A; 3MN0 A; 1JL7 A; 1RQ4 B; 3AQ6 A; 1COH A; 4X0L B; 4FC3 A; 3MVC A; 1CMY B; 3FH9 A; 2H35 A; 1DXU A; 2R4Y A; 2D5Z B; 1YEO B; 2G0X A; 1SPG B; 3UHC A; 1MNJ A; 2G0R A; 1SWM A; 4F68 A; 2EF2 A; 3PT8 B; 2V1E A; 1LHS A; 2R80 B; 1DWS A; 3WCT D; 2VM0 A; 4MXK A; 3HEN A; 3R5I B; 2G10 A; 1RSE A; 3WCU A; 1A0Z A; 1Y8K A; 1Y4Q B; 1YZI A; 1YDZ A; 1BVC A; 2O5M X; 1XQ5 A; 4N7P B; 1CH5 A; 1S5X B; 4KJT A; 1HSY A; 1BAB A; 1CH3 A; 2MGM A; 1URY A; 4NZI A; 3A5A A; 1YIH A; 1NEJ A; 1BZ1 A; 2G12 A; 1MYG A; 2DN1 A; 2O5B X; 1NS9 B; 3OZW A; 1MLO A; 1XXT A; 2HBS A; 1HBH B; 4PNJ A; 3EU1 A; 3GKV B; 1ECD A; 3TLD A; 1XCH A; 3G4U A; 2MGB A; 1XYE B; 1Y0C A; 1YE0 B; 1CH9 A; 1LFT B; 1O1P A; 2PEG B; 1Y0A B; 103M A; 1RPS B; 1J40 B; 1MBN A; 2R4W A; 4O2G A; 1GVH A; 1THB B; 1SI4 B; 2QSP B; 2QU0 A; 3U3E A; 1NZ2 A; 1X9F C; 2W6X A; 1YOI A; 3WCW B; 4UUR A; 3AQ9 A; 1VXD A; 1O1O B; 1H97 A; 1O1L B; 1VXC A; 3WCV D; 1FDH G; 3QJE B; 1MLF A; 2GKN A; 3GKT A; 4MQI B; 1CH4 A; 3UHR A; 1A0U B; 1XZU B; 3LB4 A; 3WCU C; 1O1N A; 2AUR A; 4M4B B; 1YMA A; 1CPW A; 1BZ6 A; 2FRJ X; 3ZHW A; 1YEN A; 5AB8 A; 1XZ4 B; 1HBB A; 5JDO C; 1FN3 A; 3ONZ A; 1CG8 A; 3HC9 A; 1YHU D; 1YVQ A; 2D2N A; 1LH5 A; 1K1K A; 1YGF A; 1Y4G A; 2ZWJ A; 3WFX A; 4NI0 A; 1GZX B; 2VLX A; 4NXC A; 4AVD A; 2NSR A; 4N7N B; 3QJC A; 3D17 A; 2ZS0 B; 3LQD A; 2ZSP A; 1YHR B; 1HGB A; 1GBU A; 1Y35 A; 1JZM A; 4ESA B; 2GRF A; 1YCA A; 4FH6 A; 3NFE A; 1UT0 A; 3MJU A; 4N7O B; 3GYS B; 1C7B A; 1TU9 A; 1Y4R B; 3BJ2 B; 2ZS1 B; 4C44 A; 1VWT B; 3VHB A; 1KFR A; 2MYC A; 3D4X B; 1MLN A; 1Y2Z A; 2HHB A; 1YEV B; 1CH1 A; 4HRR B; 2EB9 A; 1X3K A; 3ZJI A; 3HXN A; 4DWU A; 1HV4 B; 3QJB A; 3IC0 B; 2AUO A; 1MYT A; 2MBW A; 2GTL D; 1XZV A; 4PQ6 A; 5B84 A; 1G08 A; 1ECO A; 4F6G A; 1J3Y B; 1PBX A; 3ZJL A; 4NXA A; 4ROM A; 3UH7 A; 2PGH B; 2D2N C; 3SZK B; 2GNW A; 2AV0 A; 1CG5 B; 4F4O B; 3BJ1 A; 1DLW A; 5E6E A; 3WTG A; 1HAB A; 1MOB A; 2MYE A; 2W6V A; 3GOU A; 1LTW A; 2AA1 A; 1Y0D A; 5C6E B; 2HHD A; 3CIU A; 2W6Y A; 1Y7C B; 1I3D A; 4XS0 B; 2QLS A; 3WCP B; 3QQR A; 1YGD A; 1LJW B; 2LH1 A; 2HBD A; 2RAO A; 1Y45 A; 2VYZ A; 4JAC A; 1KD2 A; 1NZ5 A; 3FH9 B; 2H35 B; 2Z6N A; 4WCH D; 3CY5 A; 5MBA A; 3MKB A; 1YEU A; 4MU5 A; 1G0B A; 1HBS A; 104M A; 2WTH A; 2V1G A; 3UHN A; 2MGA A; 5C6Y A; 1XY0 A; 1C40 A; 1Y0T A; 3D7O B; 1Y7Z A; 2MGD A; 3QMA A; 3AT6 B; 111M A; 1UX8 A; 1ITH A; 2MYB A; 3ORD A; 3WCU B; 2ZSS A; 1JY7 A; 1A0Z B; 4MQH A; 4YU4 A; 3PI8 A; 1Y8K B; 1YZI B; 2R1H A; 3OGB A; 3UBC A; 1YDZ B; 109M A; 3AQ8 A; 1NIH A; 2Z6T A; 2Z85 A; 1DWR A; 1XQ5 B; 108M A; 1A3N A; 1HLB A; 3KMF C; 1BAB B; 1LFV B; 1JDO A; 1YIH B; 2FAM A; 1BZ1 B; 4WJG A; 3ZJR A; 2DN1 B; 1SDL A; 1C7C B; 4MQC A; 1XXT B; 1YE2 A; 1BZ0 A; 1NS6 B; 2HBS B; 1CBL A; 5EUI A; 1Y0C B; 3NG6 A; 3ZJM A; 1O1P B; 3S66 A; 5KKK A; 3GK9 A; 1LA6 A; 1T1N A; 3E5O A; 3A0G A; 1HAC B; 1SPE A; 1MTK A; 3QM8 A; 2QU0 B; 2EB8 A; 1GDJ A; 3D1K B; 1KR7 A; 3V2Z A; 1XZ5 B; 4U8U C; 4PQC A; 3WHM A; 1DXT A; 2MGI A; 3WCW D; 1JWN A; 1NZ3 A; 3SDH A; 1CIO A; 1F5P A; 1OUU B; 2G11 A; 2D2M D; 1BUW A; 4ZVA A; 1FCS A; 3UHI A; 4HSX A; 1N9X A; 1V07 A; 2HHE A; 3QM6 A; 2BLJ M; 1GCW A; 1PMB A; 1DWT A; 110M A; 5HU6 B; 4UIQ A; 1MDN A; 1NPG A; 1HBB B; 1XZ7 A; 4O1T A; 3HHB B; 1FN3 B; 3ONZ B; 1CG8 B; 2GRH A; 1YVQ B; 1OBM A; 2D2N B; 4TYX A; 1GCV B; 1K1K B; 1YGF B; 1Y4G B; 2E2Y A; 3SDN A; 3EOK A; 3BOM B; 4NI0 B; 2H8F A; 1A00 A; 3QJC B; 3D17 B; 3LQD B; 1DXD A; 2ZSX A; 1Y46 A; 1LH6 A; 1HGB B; 2ZS0 D; 3UHU A; 1Y35 B; 3ODQ A; 1JP6 A; 3UHE A; 3MJU B; 1QI8 A; 2FAL A; 3OO5 A; 1FSL A; 1MTJ A; 1MLJ A; 4YU3 A; 1Y7G A; 1A3O A; 1MBS A; 2B7H A; 2HHB B; 3DHR A; 1JEB A; 1R1Y B; 3UHK A; 2VLZ A; 2HBG A; 3PI4 A; 2YRS A; 4NS2 A; 3FS4 A; 3HRW B; 1H1X A; 1Y09 A; 2ZLX A; 5KDQ A; 1JF4 A; 1YHE A; 3W4U B; 1UIW A; 4ROL A; 3KUO A; 4ROM B; 1UMO A; 2LH5 A; 3PI1 A; 1RQA A; 2G0V A; 2ZFB A; 3BJ1 B; 4B4Y A; 4NI1 A; 5E6E B; 4O4T A; 1HAB B; 2ZS1 C; 2MB5 A; 2AA1 B; 1YG5 A; 1R1X B; 1HDS B; 1HBR A; 3KUN A; 3CIU B; 2ZFO C; 1DUO A; 2QLS B; 1SDK A; 5HLQ A; 2W31 A; 5ILM A; 1XZ2 A; 1JP8 A; 1Y45 B; 3DUT A; 2RI4 A; 1JW8 A; 3OZU A; 2D6C A; 1RVW A; 3UI0 A; 1KD2 B; 4H07 A; 2Z6N B; 2JHO A; 3CY5 B; 3VRE A; 1CO9 A; 3QZX A; 1YVT A; 1GDK A; 2G0Z A; 1A4F A; 1HBS B; 1J41 A; 1BBB A; 4U8U B; 1X9F D; 3TM9 A; 3EDB A; 1C40 B; 1Y0T B; 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2HBC B; 2MHB A; 1YIE A; 1S0H A; 2ZST A; 5ILE A; 3ODQ B; 2QSS B; 4IRO B; 1HDB A; 3ED9 A; 1J7Y A; 1K0Y A; 6HBI A; 1QI8 B; 2HZ3 A; 3GQR B; 2CMM A; 4F69 A; 1LH3 A; 3S65 A; 1VXA A; 2D60 A; 4YU3 B; 4SDH A; 4O35 A; 4MQJ B; 5HY8 A; 2B7H B; 2ZLW A; 2XYK A; 4MQK B; 1MLQ A; 6HBW B; 3AG0 A; 1IOP A; 2O5T X; 1MBO A; 3PI9 B; 2ZSQ A; 3K3U A; 1CQX A; 1UFJ A; 4MQG A; 1UFP A; 1Y8H A; 1JEB B; 1VXF A; 2DXM A; 3A9M A; 1MYI A; 2NRL A; 5JOM A; 2V1K A; 1O1J A; 3AT5 A; 2YRS B; 4AVE A; 1BZZ B; 2QMB A; 1HLM A; 1Y09 B; 112M A; 2ZLX B; 1IWH A; 2EVP A; 3R0G A; 2MGE A; 2V1I A; 1C7D A; 1YHE B; 3PEL B; 1Q1F A; 3ECZ A; 1A01 A; 3MYN A; 3NML A; 2ZLT A; 1Y4F B; 1Y5J B; 4ROL B; 2R4X A; 4MBA A; 1RQA B; 1CMY A; 5SW7 A; 1SHR A; 2M6Z A; 2ZFB B; 1N9I A; 1LFQ A; 2D5Z A; 4NI1 B; 1COH B; 4FC3 B; 1D8U A; 5HLU A; 4HSW A; 2NRM A; 2VEE A; 5HBI A; 5EE4 C; 1DXU B; 1YG5 B; 1VXH A; 5CN9 A; 1HBR B; 3WFW A; 107M A; 1MGN A; 4HRT A; 2ZT0 A; 1SDK B; 1U7R A; 1Y85 A; 4NK1 A; 3PT8 A; 102M A; 3LR7 A; 1AJ9 A; 2QRW A; 1YEQ A; 5E83 A; 1MOD A; 1RVW B; 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