The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKAGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| publication title |
Regulating the nitrite reductase activity of myoglobin by redesigning the heme active center
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-01-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZS0 D; 1NZ3 A; 2GTL D; 2W6Y A; 1YDZ A; 1B86 B; 1Y4V A; 111M A; 3K3U A; 1HDA A; 1NAZ A; 4YU3 A; 3EU1 B; 1N9I A; 1UVX A; 3IC2 A; 3BA2 A; 1T1N A; 1J3Z A; 1JEB B; 1C7C A; 3ZOM A; 5HLU A; 1HGA B; 3SDH A; 2HCO B; 1G0A B; 2ZT0 A; 4MQG A; 1DM1 A; 4F6F A; 5MBN A; 3UHT A; 1B86 A; 3WFT A; 1F5O A; 1A3N B; 3EU1 A; 1EWA A; 2FAM A; 1UFP A; 1LFQ B; 1BVC A; 3QZX A; 5AZR A; 1JEB A; 1VXF A; 1DUK A; 2ZT4 A; 1QXE B; 1MZ0 A; 1HBI A; 2R4X A; 3KMF A; 1HGA A; 4LPI A; 4NI1 B; 3ZJP A; 1YH9 B; 3IC0 B; 2D2M B; 3PEL B; 1J7Y B; 2HCO A; 1G0A A; 1VXB A; 1O1M B; 1URV A; 1MYT A; 1BZZ B; 5MBA A; 103M A; 1A3N A; 3QJB B; 1COH B; 3ORD A; 104M A; 1S0H B; 1LFQ A; 1LH7 A; 1CIO A; 1QXE A; 4ESA B; 5KER B; 1ITH A; 1F65 A; 4B4Y A; 4NI1 A; 4O2G A; 4IT8 A; 1YH9 A; 3IC0 A; 1L2K A; 1YOI A; 1WVP A; 2D2M A; 1FHJ B; 3PEL A; 1J7Y A; 1ABS A; 1Y7Z B; 1O1M A; 2EVP A; 3G4W A; 5E29 B; 1GCW B; 1NPG A; 4FC3 B; 1YGF B; 1BZZ A; 1VRF A; 4OF9 A; 5CNE A; 5CHQ A; 3WR1 B; 1XY0 B; 3QJB A; 4FWY A; 1COH A; 4PNJ A; 1HBH B; 1S0H A; 1H1X A; 1XZ7 B; 3GKV B; 1HDS B; 4ROL B; 3AT6 B; 2V1K A; 3OO4 A; 4ESA A; 5KER A; 2VEB A; 3GQR B; 1FHJ A; 2MGK A; 1NEJ B; 2MGF A; 1Y7Z A; 3A0G B; 5E29 A; 1JL7 A; 1GCW A; 4U8U B; 3DUT B; 4FC3 A; 1A00 B; 1YGF A; 3WR1 A; 3M39 A; 1N9H A; 2R4Y A; 2V1J A; 1VWT B; 1XY0 A; 2VRY A; 1S5X B; 2D60 B; 1HBH A; 1M9P B; 2HBE B; 3U3E A; 1XQ5 B; 1XZ7 A; 3GKV A; 1HDS A; 1O1K B; 1CH2 A; 4ROL A; 1MYF A; 1NPF A; 3AT6 A; 5E6E B; 1JZK A; 3M3A A; 3D7O B; 3GQR A; 1GDI A; 1NEJ A; 1Y4R B; 3ZJN A; 3A0G A; 4DWU A; 2BMM A; 4AVD A; 4U8U A; 4PQ6 A; 3DUT A; 1A00 A; 4C0N A; 2NSR A; 1Y0D B; 1YEO B; 1VWT A; 1Z8U B; 1S5X A; 1UX9 A; 2D60 A; 1M9P A; 2HBE A; 1CO9 A; 1XQ5 A; 1EMY A; 1O1K A; 2VLY A; 1F5P A; 3G53 A; 3UHH A; 5E6E A; 1NWI A; 1OUT B; 2O5Q X; 4PQB A; 1Y4P B; 2ZFO B; 3D7O A; 1MLR A; 1Y4R A; 2DN3 B; 1Y45 B; 1IBE B; 1CO8 A; 2GRH A; 1XZU B; 4WJG A; 1CG8 B; 2V1H A; 2MGH A; 1Y0D A; 1YEO A; 1JP9 A; 4C44 A; 1NZ4 A; 1MLG A; 2VYZ A; 1JW8 A; 1BZ0 B; 1N9F A; 1O1I B; 3LR7 A; 2HHD B; 4TWV A; 3RJN B; 4DC7 A; 2ZSR A; 3H58 A; 1OUT A; 3PT8 B; 4ZVB A; 3UH5 A; 1Y4P A; 1VXC A; 2ZFO A; 1UT0 A; 1J7W B; 1RVW B; 1MYI A; 2IN4 A; 2DN3 A; 3GQG B; 1Y45 A; 2XYK A; 2MBW A; 1S69 A; 1BAB B; 1Y5J B; 3SZK B; 1IBE A; 1XZU A; 1CG8 A; 1JZL A; 4H0B A; 3AQ5 A; 2R80 B; 2HBG A; 1JZM A; 1Y8I B; 5HU6 B; 2BLJ M; 6HBI A; 1LH3 A; 1BZ0 A; 2HBD B; 1O1I A; 2MGG A; 2HHD A; 1BJE A; 3PI2 A; 1A6M A; 1BVD A; 3PT8 A; 1MOB A; 4L7Y B; 1THB B; 4ILZ A; 3PI4 A; 2BLH A; 1J7W A; 1RVW A; 102M A; 2G0Z A; 1FDH G; 1GVH A; 3GQG A; 3TLD A; 1BAB A; 1Y5J A; 3SZK A; 1B0B A; 3PIA B; 2VHB A; 4ROM B; 2Z85 A; 2ZSP A; 2R80 A; 1BBB B; 1Y8I A; 1MWB A; 5HU6 A; 1LUE A; 1MNK A; 3HYU B; 2GNV A; 2OHA A; 2HBD A; 3KUO A; 1LH6 A; 3WCW D; 4F6D A; 4NZI A; 3LB3 A; 3UGY A; 1THB A; 4L7Y A; 3ECZ A; 3WCU D; 2D2N B; 1YEQ B; 1YHU D; 3QM5 A; 4FH6 A; 1PBX B; 3VRG B; 3IA3 B; 3S1I A; 3PIA A; 1A6N A; 1HBG A; 4ROM A; 2GL3 A; 3NL7 B; 1MOA A; 1BBB A; 2ZLW B; 3HYU A; 5CN5 A; 1YE0 B; 1ECO A; 1O1N B; 2LH3 A; 1MOC A; 2VLZ A; 5CND A; 3D17 B; 1O1O B; 2DHB B; 4O4T A; 1SI4 B; 2D2N A; 5HBI A; 1YEQ A; 2R4W A; 3VRG A; 1PBX A; 1RPS B; 3UHG A; 3NL7 A; 1HHO B; 1YEN B; 2ZLW A; 1YE0 A; 2BNL A; 3SDN A; 1MTJ A; 1YEU B; 5KKK A; 3ZJQ A; 2HHB B; 4YU4 A; 3D17 A; 1YHU C; 1O1O A; 2DHB A; 1MLF A; 1SI4 A; 1DLY A; 3BJ2 B; 2O5S X; 1RPS A; 3ZJM A; 1XYE B; 3UHN A; 3GYS B; 1X9F C; 3H57 A; 1GDK A; 1MLN A; 1HHO A; 1YEN A; 1SHR B; 3ECX A; 1Y8W B; 4UZV A; 2OIF A; 4MQI B; 1XCH A; 1YEU A; 3LHB A; 1MLL A; 2HHB A; 1VXG A; 2FRK X; 3OZU A; 1YG5 B; 3QZZ A; 3HEO A; 3LQD B; 3BJ2 A; 5EUI B; 1MOH A; 3WCT B; 1MNI A; 1XYE A; 3FH9 B; 3E5O A; 1YCB A; 2HHE A; 3GYS A; 3WFW A; 1SHR A; 1DXC A; 1X3K A; 1Y8W A; 4MQI A; 1CIK A; 1XZ2 B; 2W72 C; 4HBI A; 5ILM A; 5HAV A; 1OR4 A; 3WI8 A; 1YG5 A; 2O5T X; 3R0G A; 3LQD A; 5EUI A; 3DHT B; 3WCT A; 1AJ9 B; 1JL6 A; 2PGH B; 1YEV B; 2KSC A; 3FH9 A; 1RQ4 B; 4NXA A; 3UHD A; 5AB8 A; 1V4W B; 1CBM A; 4F69 A; 1HBA B; 1SWM A; 5CN6 A; 2MGC A; 1CH7 A; 2H35 B; 4KMW A; 5CMV A; 1MOD A; 1OFJ A; 1MGN A; 3UHX A; 3VHB A; 1XZ2 A; 1JDO A; 4MBA A; 2WTH A; 2OH9 A; 2MYD A; 3UBC A; 3UGZ A; 3RJ6 A; 4ODC B; 2ZS1 C; 2MGI A; 1VXD A; 3QJE B; 3QMA A; 1KD2 B; 3MYN A; 3DHT A; 3A59 B; 2G12 A; 5D1V A; 3TM9 A; 2G11 A; 2Z6S A; 1AJ9 A; 3A5B A; 2PGH A; 1YEV A; 4G1V A; 1RQ4 A; 3GDJ B; 2D2M D; 2ZSS A; 1V4W A; 3WCV C; 1HAB B; 1HBA A; 3MKB B; 1FAW A; 2H35 A; 3UH7 A; 2QRW A; 2QU0 B; 5EOH A; 1Y0W B; 2MGE A; 1A3O B; 3KMF C; 4ODC A; 3OZV A; 3D1K A; 3QJE A; 1GZX B; 1KD2 A; 3A59 A; 4WJG 1; 1R1X A; 1DXT B; 3GDJ A; 3HRW B; 1HAB A; 1HGB B; 3MKB A; 1NQP B; 4VHB A; 4JAC A; 4L2M A; 2DC3 A; 2ZSY A; 2QU0 A; 1Y0W A; 1A3O A; 3ZJL A; 1TU9 A; 2ZS0 C; 2GTL C; 1I3D A; 1GZX A; 2D2M C; 1UVY A; 3MJU B; 4DWT A; 1NS9 B; 1Y22 B; 1DXT A; 1Y85 B; 3HRW A; 3MYM A; 2YRS B; 1NZ5 A; 1HGB A; 2HZ3 A; 1M6M A; 3WHM B; 2O5M X; 4HRR B; 1NQP A; 4U8U D; 3MVC A; 3UBV A; 3OO4 B; 1J40 B; 1ABY B; 3ASE A; 1MWC A; 1Y01 B; 3MJU A; 3BJ3 B; 4N8T B; 1NS9 A; 1O1L B; 1XZ4 B; 1Y22 A; 1Y85 A; 3QJC B; 2BK9 A; 7HBI A; 1LFL B; 2YRS A; 3WHM A; 3WFX A; 3PI9 B; 5JOM A; 4HRR A; 2VYY A; 1HLB A; 5KDQ B; 1X46 A; 1MKO B; 4O4Z A; 3S1J A; 1MBA A; 1XZV B; 1J40 A; 1ABY A; 2V1I A; 4KN3 A; 2VYW A; 3ZOL A; 3ZJS A; 3WCP B; 1D8U A; 3UHZ A; 3BJ3 A; 4N8T A; 1O1L A; 1XZ4 A; 1W92 A; 1BUW B; 1MBI A; 2ZFO D; 3QJC A; 1LFL A; 3S66 B; 3EOK A; 3PI9 A; 4O1T A; 3UHB A; 1DXD A; 3ECL A; 3QM6 A; 5KDQ A; 1MKO A; 2MGA A; 2IG3 A; 1LFY B; 1Y4B B; 3QM7 A; 1RQ3 B; 4XS0 B; 1YFF B; 1XZV A; 1MDN A; 2ZLV B; 1HRM A; 4BJA A; 1GLI A; 2G10 A; 1VXE A; 4G1B A; 4O35 A; 3WCP A; 1DXV B; 1S5Y B; 1SDL B; 1BUW A; 1CBL A; 3S66 A; 2GKN A; 1C7D B; 1LFY A; 1Y4B A; 4AVE A; 5ILR A; 1RQ3 A; 3AQ9 A; 4XS0 A; 4NXC A; 1YFF A; 5CN9 A; 2ZLV A; 5B84 A; 4TWU A; 3ONZ B; 2MYB A; 5HLQ A; 1RTE A; 5ILE A; 4MQC B; 2ZFO C; 2FRI X; 3QM9 A; 5HLX A; 1DXV A; 1S5Y A; 1YOH A; 2V1G A; 3G4V A; 3AQ7 A; 1SDL A; 2ZT1 A; 2ZSN A; 4N7N A; 1LHS A; 6HBW B; 1J3Y B; 3ZJR A; 1C7D A; 1YMC A; 2DN2 B; 4H07 A; 3LB2 A; 1HLM A; 1A6K A; 1GCV A; 3ONZ A; 3K9Z A; 1UIW B; 4MQC A; 1Y7C B; 3OO5 B; 1ECN A; 2EVK A; 1NIH B; 2W31 A; 1C40 A; 1SPE A; 1BZ6 A; 6HBW A; 2QLS B; 1J3Y A; 1FSL A; 2D2N D; 1AZI A; 2QFN A; 2BWH A; 3MOU A; 4N7O B; 2DN2 A; 2VM0 A; 3W4U B; 1YVT A; 1UIW A; 3E5I A; 1JPB A; 2D5Z B; 3HEP A; 3NML A; 1HAC B; 1Y7C A; 3MJP B; 3OO5 A; 1Y5K B; 1V9Q A; 1GBV B; 1Y4G B; 1NIH A; 2QSP A; 2Z6N B; 4NS2 A; 105M A; 1EW6 A; 1JF4 A; 1YMA A; 2QLS A; 1BZP A; 1A6G A; 2SPL A; 1YMB A; 1DLW A; 4N7O A; 2HZ1 A; 1LJW B; 5EE4 D; 2GKM A; 1N9X A; 2ZT2 A; 1V4X B; 109M A; 3W4U A; 1Y5F B; 5CN8 A; 2D5Z A; 1HAC A; 1G08 B; 3MJP A; 1A01 B; 1Y5K A; 1K1K B; 2NSS A; 1O16 A; 1GBV A; 5EV5 A; 1Y4G A; 2LH6 A; 2Z6N A; 4ZVA A; 1LFZ B; 3E55 A; 3ZJH A; 2MYC A; 3GOU B; 2SPO A; 1RTX A; 1MLM A; 1CH5 A; 1G09 B; 1LJW A; 1Q1F A; 3UI0 A; 2E2Y A; 1CH9 A; 1V4X A; 1C7B B; 3CIU B; 1U7R A; 4YU4 B; 1Y5F A; 1G08 A; 1ECA A; 1A01 A; 2H8D B; 1K1K A; 1IRD B; 1SDK B; 1Y4F B; 1LFZ A; 1Y83 B; 3GOU A; 5SW7 B; 1K0Y B; 3WCW C; 3D4X B; 5EE4 C; 1IT2 A; 5EYJ A; 1MBC A; 2W6V B; 106M A; 3WCT D; 1G09 A; 3QQR A; 3A5G A; 1A0Z B; 3WCU C; 1C7B A; 1MLU A; 3CIU A; 1A9W A; 4QAU A; 2H8D A; 1XZ5 B; 1IRD A; 1PMB A; 1SDK A; 1LHT A; 2R50 A; 1CQ2 A; 2G0V A; 1Y4F A; 5F0B A; 1Y83 A; 5SW7 A; 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1VHB A; 1MNJ A; 3WTG A; 3D1A B; 2GLN A; 3LR9 A; 1MBS A; 4F4O B; 4NK2 A; 4KJT A; 2MHB A; 3DHR A; 1YOG A; 3NMM B; 5E83 B; 3WCV B; 2MGD A; 1I3E A; 3HXN A; 1DTI A; 3BCQ A; 2H8F B; 4MQJ B; 1BZ1 A; 3P5Q B; 1MLK A; 1V75 A; 1QSI A; 3UHS A; 3LB1 A; 2GDM A; 1YGD A; 2ZSQ A; 1MLJ A; 1DXU A; 2ZS1 A; 3FS4 A; 4JYQ A; 2Z6T A; 4WCH D; 1G0B B; 1MBO A; 1HDB B; 3D1A A; 2HZ2 A; 1LH2 A; 4F4O A; 3S48 C; 5CNG A; 3NMM A; 4HSX A; 1SPG B; 5E83 A; 1F63 A; 3WCV A; 1WMU B; 1MLQ A; 1CH1 A; 2W6W A; 3V2Z A; 2H8F A; 2DN1 B; 4MQJ A; 2DXM B; 3E4N A; 3P5Q A; 3UH6 A; 4H2L B; 1MWD A; 2AV0 A; 5D5R A; 3BOM B; 1YIE B; 3UHE A; 2ZS0 B; 4UUR A; 1S6A A; 2GTL B; 1G0B A; 1HDB A; 2HBS B; 2V1F A; 1AJG A; 1FCS A; 2GRF A; 2G0S A; 1SPG A; 3IXF A; 3R5I B; 1EBT A; 1R1Y B; 1WMU A; 2DN1 A; 2NRM A; 2C0K A; 2DXM A; 4M4B B; 2G0R A; 1HGC B; 4XDI A; 4H2L A; 3GQP B; 3BOM A; 110M A; 1EBC A; 1YIE A; 2R1H B; 3GLN A; 3EOK B; 2GNW A; 1WLA A; 1S56 A; 2ZS0 A; 2GTL A; 4F6I A; 2HBS A; 3K8B B; 2FAL A; 1GLI B; 1DTM A; 1HCO B; 5JDO D; 3R5I A; 2AA1 B; 5CNC A; 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