The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN A (CARBONMONOXY) (ALPHA CHAIN)
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| publication title |
A third quaternary structure of human hemoglobin A at 1.7-A resolution.
pubmed rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1992-04-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YGD A; 1Y5F A; 2LH3 A; 2DN1 B; 1Y7Z B; 1ECO A; 1RQ3 B; 1EMY A; 1YHE B; 1YDZ B; 4YU3 B; 2HHB A; 1AJ9 B; 4WCH D; 1ABW A; 5CMV A; 2W6V B; 1JEB B; 3PI2 A; 3ZOL A; 2NX0 A; 2MGH A; 3B75 B; 2HCO A; 110M A; 1NAZ A; 1LFL A; 1G08 B; 4NI0 A; 1YIE A; 1YH9 A; 4PQB A; 1HCO A; 3WFT A; 2HBE A; 4KMV A; 3G46 A; 3UBV A; 1B86 B; 2PEG B; 3SDN A; 2H8D A; 3OO4 B; 2H35 A; 1XZ4 B; 2GRF A; 3UGY A; 1HAB A; 3ODQ A; 3WCW D; 5ILR A; 1XCH A; 3K8B A; 1MYH A; 1OUU A; 1ECA A; 1DXC A; 1A6G A; 1QSH A; 1R1Y B; 2D60 A; 4U8U C; 1LH1 A; 4O35 A; 1XZ5 A; 2ZS1 C; 1G09 B; 1NS6 A; 3PEL A; 1YEO A; 3GQG A; 1NWN A; 2EKT A; 2M6Z A; 1NPF A; 1RPS A; 3WFU A; 1BVD A; 2HHE A; 1MNO A; 2LH1 A; 1NPG A; 1Y7G B; 1O1L A; 1CP5 A; 2DHB A; 1CIK A; 1DXU B; 1YGD B; 1X9F D; 4HBI A; 1YGF A; 3UH6 A; 2GRH A; 4C0N A; 3D1A A; 1CBM A; 2LH2 A; 1ABW B; 4G51 A; 1DO1 A; 2Z8A A; 4ESA A; 2ZLV A; 3AT6 A; 1YCB A; 2XKI A; 3LB4 A; 107M A; 2E2Y A; 2HCO B; 1Y5J A; 2GTL D; 1DXD A; 3BCQ A; 4NI0 B; 1YIE B; 1Y5K B; 3ECX A; 3ONZ A; 1BZ1 A; 2HBE B; 2JHO A; 3H57 A; 3QJE A; 2H8D B; 2H35 B; 103M A; 3UHD A; 1HAB B; 3ODQ B; 1S69 A; 2QSS A; 4G1B A; 4IT8 A; 3UHN A; 1F5P A; 1OUU B; 3DUT B; 2OH9 A; 5EE4 C; 1MYJ A; 1ITH A; 2D60 B; 1JDO A; 2MGA A; 2RI4 A; 1YHU C; 1CBL A; 1SDK B; 3NFE A; 5MBN A; 2HZ2 A; 5AZR A; 1LFZ A; 1NS6 B; 3PEL B; 1YEO B; 3GQG B; 4WJG A; 3S66 A; 1QI8 A; 3MJP B; 3HC9 A; 2QFN A; 3NG6 A; 1J7Y A; 1FN3 A; 2W31 A; 3QM8 A; 1MYF A; 1MOH A; 4MQJ B; 3GDJ A; 1JZL A; 5HY8 A; 4VHB A; 2DHB B; 3IXF A; 4MQC A; 1M9P A; 1COH A; 2DXM A; 3UHT A; 3GOU A; 2V1I A; 2G14 A; 3HF4 B; 3UHC A; 2DN2 B; 1CQ2 A; 3D1A B; 2FAL A; 4F6I A; 4ESA B; 1JZK A; 3M39 A; 1YVT A; 1XQ5 A; 1RSE A; 3PI8 A; 1HLM A; 3QM7 A; 3RJN B; 1BZZ B; 5F2A A; 1XY0 B; 5E6E B; 2GNV A; 3RGK A; 1C7D B; 3R5I A; 1A6K A; 1Y5J B; 1U7S A; 3BCQ B; 2W72 B; 2OHB A; 106M A; 2G3H A; 1Y7C A; 1BZ1 B; 5KDQ A; 2MYA A; 2O58 X; 3TM3 A; 3PI3 A; 1SHR A; 1NEJ B; 4H0B A; 1K0Y A; 3UHE A; 2ZT4 A; 2D2N A; 2BWH A; 1V4W A; 1BVC A; 4UUR A; 3DHT A; 4XS0 A; 2HBF A; 3HEO A; 3WCV D; 1VXG A; 5SW7 A; 1FDH A; 2HBS A; 2D2M C; 2QMB A; 3D7O A; 4H07 A; 3OZU A; 1IRD B; 2MGE A; 1Y4P A; 2XYK A; 1YE2 A; 1LFZ B; 2Z6N A; 3ARK A; 1MLL A; 1QI8 B; 2LH7 A; 3RJ6 A; 1J7Y B; 4MPM A; 3NMM B; 3WI8 A; 3QQR A; 3GDJ B; 3MVC A; 1Y0A B; 4M4A A; 5HY8 B; 3HEP A; 1Y4R A; 2LH6 A; 1V9Q A; 1LFV B; 2DXM B; 4MBA A; 2HBC A; 3UHI A; 1VWT B; 3CIU B; 4N7O A; 1F65 A; 1A4F A; 3GKT A; 3AQ6 A; 1QXE B; 3WCW A; 3GQR A; 4FC3 B; 5E83 A; 3MOU A; 2HZ1 A; 109M A; 1YVT B; 1S6A A; 1IDR A; 3VRE A; 1BIJ A; 1VXE A; 3LQD B; 1DWR A; 2O5T X; 3R5I B; 3IC2 B; 2V1H A; 4M4B A; 4HRT B; 4L7Y A; 1Y4B A; 2MHB A; 4TWV A; 111M A; 1YEQ A; 5KDQ B; 102M A; 1GZX A; 3WCU D; 1MLU A; 3QM6 A; 1CMY A; 1RQ4 A; 2XKH A; 1SHR B; 4OOD A; 2GKN A; 1MLN A; 1BBB A; 4DWT A; 1N9F A; 4ROL B; 1Y83 A; 5CN9 A; 3OO5 B; 3PI9 A; 2W6W A; 1NIH A; 2VEE A; 1V4W B; 1X9F A; 2G0Z A; 4ILZ A; 2VRY A; 3DHT B; 4XS0 B; 1MYI A; 2NSR A; 1UFJ A; 4HHB A; 2MGM A; 3PT7 A; 4ODC B; 4DC7 A; 5CHR A; 5SW7 B; 3UHU A; 1GDL A; 2QMB B; 5CNG A; 1SDL B; 1Y4P B; 3WCT B; 3A59 A; 1YE2 B; 4MXL A; 1BAB A; 1FSX A; 1HBS B; 3BJ3 B; 1A00 A; 2GTL A; 3G4R A; 1DUK A; 2ZFO D; 3DHR A; 2R4W A; 2GL3 A; 4M4A B; 1Y0D B; 3E5I A; 1CLS A; 1QPW A; 1QXD A; 1LFQ A; 1G0A B; 1Y0T A; 2EF2 A; 4N7O B; 1GBU B; 1HGC B; 3A2G A; 3D1K B; 3WCW B; 1DKE B; 1XZV A; 4F6B A; 1Y31 A; 3GQR B; 4MQG B; 1LH6 A; 3UH7 A; 3ED9 A; 4MQH A; 4MQI B; 3MKB B; 2ZS0 B; 2BW9 M; 3OK5 A; 3VRE B; 1BIJ B; 3WFX A; 1YEV B; 2FAM A; 5EUI A; 1KD2 A; 2BMM A; 5E29 A; 2Z6S A; 5AB8 A; 2GRZ A; 1O1N A; 4M4B B; 4L7Y B; 1MOD A; 1Y4B B; 3ARL A; 2MHB B; 3UHX A; 2ZLX A; 1YEQ B; 1Y8K A; 3EDA A; 3GYS B; 1GDK A; 1GZX B; 4SDH A; 1CMY B; 1YIH B; 1S56 A; 3S1J A; 2MGL A; 1BBB B; 3SZK A; 1MOB A; 1LTW A; 3K3U A; 3QMA A; 4QAU A; 3PI9 B; 2D5X A; 1DXV B; 1LH3 A; 1NIH B; 4KN3 A; 1A0Z A; 2GLN A; 4HHB B; 3D17 A; 3ARJ A; 1JL6 A; 1A0U A; 1MLF A; 1NZ3 A; 2QRW A; 2H8F A; 1A3N A; 2VEB A; 4ROM B; 3A59 B; 4F6D A; 1BAB B; 1FSX B; 4PQ6 A; 3SDH A; 4AVD A; 1HSY A; 1HRM A; 3ZJP A; 1MLK A; 1A00 B; 1WMU B; 1XZ2 A; 3LR7 A; 1A01 B; 1LH7 A; 3S48 C; 2HHD A; 2ZLW A; 1D8U A; 3G4W A; 1CO8 A; 2ZWJ A; 1CLS B; 1QXD B; 1LFQ B; 1DLW A; 3UI0 A; 1IBE B; 1RVW A; 5HLU A; 1Y0T B; 3NML A; 1XZV B; 1Y31 B; 1A9W E; 1HGA B; 2AUQ A; 2QU0 A; 3A5A A; 1LFT A; 1J41 A; 5EUI B; 3WCV A; 1YCA A; 2MGF A; 5E29 B; 4NS2 A; 2G12 A; 2XKG A; 1MLG A; 1UX8 A; 1Y01 B; 2W72 C; 3ORD A; 4PNJ A; 1O1N B; 1YE0 A; 1NZ4 A; 1VXA A; 1S5Y A; 4N7N B; 2EB9 A; 3U3E A; 5HLQ A; 1Z8U B; 2ZLX B; 2MGG A; 1Y8K B; 1FSL A; 1J7S A; 3W4U A; 2AA1 B; 4C44 A; 3UHY A; 1A3O B; 2HBD B; 1FHJ A; 1HBR A; 3MN0 A; 3SZK B; 3QZX A; 1SPE A; 1EBT A; 1CO9 A; 2D5X B; 3AG0 A; 1OFJ A; 5EE4 D; 1A0U B; 2ZSS A; 2QSP A; 4NK1 A; 2H8F B; 2R4Z A; 1MTK A; 3HXN A; 5EOH A; 1V4U A; 101M A; 4JYQ A; 1NQP A; 2ZT3 A; 1HBH A; 1XZ2 B; 1CP0 A; 1Y0C A; 1SPG B; 1FLP A; 2MYC A; 3EOK B; 1O1P A; 2ZLW B; 1OR4 A; 1GCW A; 1Y4G B; 1HDB A; 1GVH A; 3O89 A; 1RVW B; 4MAX A; 5HAV A; 3MJU A; 1Y46 A; 108M A; 1Q1F A; 1CIO A; 1J40 A; 1UVX A; 3OZW A; 1XXT B; 1HDS A; 4HRR A; 2QU0 B; 3PT8 A; 3G4U A; 2G10 A; 1LFT B; 1J41 B; 3WCP A; 1Y5F B; 1BUW A; 1LJW A; 1PBX A; 1YG5 A; 1NZ2 A; 1THB A; 2HHB B; 1Y4F A; 3KUN A; 1JPB A; 1YE0 B; 1S5Y B; 1HJT A; 1HBB A; 4BJA A; 4IRO A; 2W6Y A; 1NS9 A; 1R1X A; 1J7S B; 4HSW A; 1GCV A; 1MGN A; 1LFL B; 1F5O A; 2EVK A; 3UHG A; 1EWA A; 2ZFO A; 1FHJ B; 3LB2 A; 1YH9 B; 3AQ5 A; 1DLY A; 2BLJ M; 1O1J A; 1HCO B; 3IA3 B; 2V1E A; 1MNI A; 5D1V A; 2O5O X; 3BOM A; 2WTH A; 2AUR A; 3WTG A; 2RAO A; 2B7H A; 2D2M D; 5KKK A; 1Y45 A; 3WCT C; 1Y8W A; 3K8B B; 1V4U B; 2O5L X; 2V1K A; 1QSH B; 1Y4Q A; 1LA6 A; 4TYX A; 1HBH B; 1J3Y A; 1IWH A; 1XZ5 B; 1Y0C B; 4F69 A; 2GKM A; 1CH7 A; 5AZQ A; 2KSC A; 1HDB B; 2M6Z B; 3LB3 A; 1AZI A; 1RPS B; 5CND A; 2HHE B; 3MJU B; 3DR9 A; 3WCW C; 1MTI A; 1WVP A; 3GKV A; 1VXC A; 1O1L B; 1MLH A; 1MLM A; 4HRR B; 3PT8 B; 2ZS0 C; 3WCP B; 1MBI A; 1BUW B; 3IC0 A; 1PBX B; 3A5G A; 1Y8I A; 2SPM A; 1YGF B; 4WJG 1; 1BZR A; 1THB B; 1LH2 A; 1Y4F B; 3E4N A; 4G51 B; 2ZLV B; 1Y4V A; 3AT6 B; 5CNB A; 3G4Q A; 1R1X B; 105M A; 1MDN A; 3MYN A; 1AJH A; 1Y85 A; 1CH3 A; 3ONZ B; 3ZJS A; 1ASH A; 3QJE B; 3KMF C; 3UHW A; 3WTG B; 2RAO B; 2B7H B; 1MCY A; 1LFY A; 6HBW A; 3ZJJ A; 2AUO A; 3ZJO A; 1Y8W B; 2QSS B; 1VXH A; 3A9M A; 4N8T A; 3MBA A; 1Y4Q B; 1Y35 A; 5HU6 A; 1J3Y B; 2VYZ A; 1JWN A; 1IWH B; 1G0B A; 2RI4 B; 4B3W A; 1IOP A; 4FWY A; 3NFE B; 1J52 A; 1DO7 A; 1UC3 A; 5C6E A; 3PIA A; 1HBA A; 3UH5 A; 3S66 B; 5JGG A; 1RTE A; 3WR1 A; 3QJB A; 1YFF A; 3NG6 B; 1FN3 B; 3OVU C; 1ABS A; 3GKV B; 3UGZ A; 1C40 A; 5IKS A; 5KER A; 4MQC B; 1M9P B; 1COH B; 3D4X A; 2VM0 A; 2GNW A; 1MLR A; 3GOU B; 3IC0 B; 1BZP A; 1SI4 A; 1S5X A; 1BZ0 A; 2V1G A; 2MGI A; 4NI1 A; 3VRG A; 3HHB A; 1HGB A; 3WFW A; 1FAW A; 1XQ5 B; 5EQM A; 3PI8 B; 2R80 A; 4GZG A; 4F68 A; 2ZT0 A; 3G52 A; 2MGC A; 1HBI A; 2G0R A; 1CG8 A; 4FH7 A; 2SPO A; 1Y7C B; 1VRE A; 4FH6 A; 2VHB A; 3ZJR A; 1K0Y B; 3LB1 A; 1LFY B; 2D2N B; 1TES A; 4F6F A; 1MTJ A; 2HBF B; 2BNL A; 2HBS B; 1J3Z A; 2R4X A; 1JW8 A; 1YEN A; 3D7O B; 3QQQ A; 1HDA A; 1PMB A; 4X0L A; 5C6E B; 1V07 A; 1ABY A; 3PIA B; 1MWD A; 1RTX A; 3UHV A; 2CMM A; 2Z6N B; 3BA2 A; 3ECZ A; 5JGG B; 1Y0W A; 1CG5 A; 1WLA A; 1MLJ A; 3NL7 A; 1F63 A; 1V4X A; 1IT3 A; 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2ZFB B; 4L2M A; 6HBI A; 2PGH B; 1Y22 A; 1DXU A; 1V75 A; 1EBC A; 1MYZ A; 1O1K A; 2ZT2 A; 1HHO B; 2D6C A; 1IT2 A; 1C7B B; 2MYB A; 3WCT D; 4UIQ A; 1DUO A; 1Y7D B; 1HV4 B; 2DN3 A; 1A0Z B; 1JP9 A; 1J7W B; 3D17 B; 2HZ3 A; 1DTI A; 1JL7 A; 1YHU D; 1O1I B; 3QM5 A; 1Y5K A; 3AQ8 A; 4F4O A; 1A3N B; 1UX9 A; 3G53 A; 1CH9 A; 3BJ2 A; 1SWM A; 2O5M X; 3QJD A; 4G1V A; 4O1T A; 2MYE A; 3S65 A; 3BJ1 B; 2WTG A; 1OR6 A; 1L2K A; 3V2Z A; 4JAC A; 2HHD B; 4MXK A; 2MYD A; 2ZLT A; 3M3A A; 2YRS B; 3FS4 B; 2G0V A; 2ZS0 D; 3DUT A; 3LR9 A; 3WCU A; 2LHB A; 1MWB A; 2FRK X; 3GLN A; 1MKO B; 1SDK A; 1UMO A; 3A0G A; 1HBG A; 3P5Q B; 3HRW B; 2R4Y A; 4NXC A; 2OHA A; 3G4Y A; 3MJP A; 3WCV B; 1YMB A; 1C7C A; 4MQJ A; 4KMW A; 4DWU A; 2D5Z A; 1DM1 A; 1NXF A; 1QSI A; 2OH8 A; 1Y22 B; 3W4U B; 1V75 B; 3E5O A; 1O1K B; 2NRM A; 3HF4 A; 2C0K A; 1GJN A; 5CNE A; 1KFR A; 2DN2 A; 1M6C A; 1HBR B; 3MYM A; 2OLP A; 2D2N C; 2V1J A; 2BKM A; 2DN3 B; 3PI4 A; 1BZZ A; 1JP6 A; 1H97 A; 5EV5 A; 2ZSO A; 1XY0 A; 5E6E A; 1C7D A; 3ZJL A; 3QJC A; 2ZST A; 4MBN A; 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