The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (CYANO MET)
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| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y35 B; 1AJH A; 107M A; 4HRT A; 2AA1 A; 1LFQ A; 2MHB A; 5CNE A; 4MQG B; 4ROM B; 1MBI A; 4NXA A; 5JGG B; 1YEQ B; 1O1O B; 1YOG A; 1HGA A; 2M6Z A; 1PBX B; 3QM5 A; 2ZFO B; 3PI9 A; 3PI2 A; 2NSR A; 3WTG B; 3EOK B; 4HRR A; 4ODC B; 2Z6S A; 4U8U D; 1A0Z A; 2HHD A; 1BIJ A; 3ZOL A; 3M38 A; 4YU4 B; 1Y7Z A; 2QRW A; 1HSY A; 4PNJ A; 1DO3 A; 1BZZ B; 2QFN A; 1MLM A; 5C6E B; 1G0B B; 3D4X B; 2ZSP A; 3IXF A; 1YMA A; 4KMV A; 2GNV A; 2DXM B; 4NI1 A; 5EYS A; 2PEG A; 1HDB A; 1LFV B; 3ZJQ A; 1VHB A; 5HLU A; 1F65 A; 2QMB B; 2G0R A; 4C0N A; 3GOU B; 5CHQ A; 1CMY B; 5ILP A; 1XZU A; 1MLG A; 1GLI A; 3WFT A; 1OR6 A; 3BJ3 B; 1HBR B; 1UX8 A; 3O89 A; 1Y8I B; 2LH6 A; 3PI8 B; 1IWH A; 1Y5K A; 1RPS A; 1IBE A; 1DWT A; 5MBA A; 1HBG A; 3NL7 A; 1B86 A; 1J7S B; 3E5I A; 2VHB A; 1VRF A; 4IT8 A; 1YGF A; 3K9Z A; 1J41 B; 1MBA A; 5EQM A; 2QU0 A; 3K8B A; 1YE2 A; 1YEV B; 2MBW A; 1GZX B; 1Y5F A; 3D1K B; 1FN3 A; 1O1J B; 4OOD A; 2ZLX B; 1Y01 B; 1MLL A; 3UHT A; 1AJ9 B; 1HV4 A; 3OO5 B; 2MGC A; 1IOP A; 2V1G A; 2D6C A; 1MZ0 A; 1O1N B; 1Y8K B; 1A6N A; 1HBS B; 4X0L A; 1RQA A; 3QQR A; 106M A; 3AQ6 A; 3ODQ A; 2GL3 A; 5AB8 A; 4H0B A; 3M3A A; 3AT5 B; 111M A; 1Y0C B; 2ZLT A; 1LTW A; 3WCV A; 3BJ2 B; 1MBN A; 1Y45 A; 2BLH A; 1VWT B; 3WCU A; 2G0X A; 1NEJ A; 2WTH A; 1OR4 A; 3HXN A; 3WFU A; 2AUR A; 2VYW A; 1R1X A; 3P5Q B; 4AVE A; 1YG5 B; 4PQB A; 1YVT A; 4N7N B; 2ZLW A; 3TM3 A; 3ZJJ A; 1S69 A; 2GTL C; 1YZI A; 1XY0 B; 2HBD A; 3WCT D; 1X9F C; 2W72 C; 4M4A B; 1C40 B; 4HHB B; 1GCW B; 2QSS A; 5EE4 D; 4NK2 A; 3ZJM A; 1JZK A; 1CBM A; 1J3Z B; 1Y22 B; 1V4W B; 1YDZ A; 4H2L A; 3UI0 A; 1L2K A; 1LH1 A; 5CN9 A; 2IG3 A; 3HF4 B; 2MGE A; 1NS6 A; 2MGI A; 1LFT A; 1A4F A; 1Y8H A; 1NAZ A; 2H35 B; 1HBI A; 4MQJ A; 1S5X A; 3VRG A; 1MKO B; 2YRS B; 2HBG A; 1Y35 A; 4B3W A; 3D1A B; 3MN0 A; 3QQQ A; 4MQG A; 4L7Y B; 4ROM A; 4WJG 1; 3G52 A; 3H57 A; 5JGG A; 1YEQ A; 1O1O A; 3UHW A; 1PBX A; 2ZFO A; 3WTG A; 2ZSS A; 1Y4R B; 3EOK A; 4MQI B; 4ODC A; 1N9H A; 2MGJ A; 4YU4 A; 3SDN A; 1BZZ A; 5C6E A; 1G0B A; 1NZ2 A; 1QI8 B; 3E5O A; 3D4X A; 3G4W A; 1Y4F B; 2ZLV B; 2DXM A; 2GNW A; 2NSS A; 1A6G A; 1LFV A; 3LQD B; 2QMB A; 1IDR A; 1CH1 A; 1Y7G B; 3GOU A; 1V4X B; 3DR9 A; 2HZ2 A; 2ZWJ A; 1CMY A; 2O5S X; 5E29 B; 1MBD A; 1BVC A; 3BJ3 A; 1HBR A; 1Y8I A; 3PI8 A; 1O1P B; 2G12 A; 4F6F A; 1DXV B; 3WHM B; 2EVP A; 4WCH D; 5HU6 B; 1DLW A; 1JP9 A; 1YEU B; 3WR1 B; 3OZW A; 1J7S A; 5M3S A; 1LHS A; 1GDL A; 1J41 A; 1BZ1 B; 1MBC A; 2D2M C; 3PEL B; 1YEV A; 1GZX A; 1O1I B; 3D1K A; 1VXH A; 2Z8A A; 1Y4G B; 1O1J A; 2ZLX A; 1AJ9 A; 1NS9 B; 1XZ5 B; 6HBW B; 4MQH B; 4M4B B; 3OO5 A; 3G4Y A; 1Y46 B; 3ZJH A; 2R4Z A; 3OJ1 A; 1O1N A; 1Y8K A; 1HBS A; 1JZL A; 2G0V A; 2W6Y A; 3UH6 A; 2D2N D; 4NI1 B; 2RAO B; 1YHU D; 4UIQ A; 4HSX A; 4SDH A; 3AT5 A; 1SWM A; 1Y0C A; 3GQR B; 4JYQ A; 1JL6 A; 110M A; 3BJ2 A; 1O1M B; 2HZ3 A; 1VWT A; 3BOM B; 1HAB B; 4G1V A; 1YIH B; 2ZSY A; 4G1B A; 1B0B A; 1YIE B; 5CNB A; 3P5Q A; 1VXE A; 1YG5 A; 4N7N A; 4TWV A; 5F2A A; 3LR7 A; 1XZ4 B; 1XY0 A; 2R1H B; 2ZS1 B; 3AG0 A; 1DXD A; 1OJ6 A; 4M4A A; 1C40 A; 4HHB A; 1XZ7 B; 1GCW A; 2MYD A; 4QAU A; 5EUI B; 2O5M X; 1LFZ B; 1DM1 A; 2BKM A; 3M39 A; 1NZ5 A; 1J3Z A; 1Y22 A; 1MTK A; 1V4W A; 2H8F B; 3HF4 A; 2ZS0 D; 3UHB A; 1RQA B; 1HCO B; 3ZOM A; 1FSX B; 2H35 A; 2V1K A; 1MKO A; 2YRS A; 5EET A; 3D1A A; 2MGB A; 3D17 B; 2GRF A; 1Y0A B; 4F6G A; 4L7Y A; 3UH5 A; 4DWU A; 1MNH A; 2MB5 A; 1YVQ B; 3UHK A; 4FH6 A; 1KD2 B; 1F63 A; 1Y4R A; 4MQI A; 2EB9 A; 3QM9 A; 5D5R A; 1M9P B; 3KUN A; 3QJB B; 3PIA B; 3S48 C; 3WCW C; 5ILM A; 1LFY B; 1QI8 A; 2VRY A; 1ABW B; 2HCO B; 1Y4F A; 2V1J A; 2ZLV A; 1K0Y B; 1SPG B; 1A9W E; 1VXC A; 5JOM A; 2G3H A; 2HBS B; 3LQD A; 3H58 A; 1LJW B; 3GDJ B; 2VYZ A; 1Y7G A; 1V4X A; 5MBN A; 2IN4 A; 5E29 A; 4IRO B; 3ZHW A; 3WCV C; 1Y0D B; 5B85 A; 1FLP A; 3MBA A; 3MYN A; 2C0K A; 2Z6N B; 1BJE A; 3A5B A; 4NI0 B; 1HDA B; 4MBN A; 1O1P A; 1DXV A; 3WCU C; 1JL7 A; 1A00 B; 3WHM A; 5HU6 A; 3S1J A; 2Z85 A; 2MYB A; 1YEU A; 3WR1 A; 2GDM A; 1VXA A; 2V1E A; 1HLM A; 1LH3 A; 1YOH A; 1Y4V B; 1BZ1 A; 2O5T X; 1NPF A; 4G51 B; 2VM0 A; 3PEL A; 4YU3 B; 3SZK B; 1O1I A; 1M6C A; 1Y4G A; 2HBE B; 2W6X A; 1UFJ A; 1NS9 A; 1XZ5 A; 6HBW A; 1GCV B; 2LH7 A; 4M4B A; 4MQH A; 5EV5 A; 1HHO B; 1Y46 A; 1ECD A; 3OK5 A; 1A3N B; 1GDK A; 2EF2 A; 3G4U A; 7HBI A; 3ARJ A; 2RAO A; 1UMO A; 2HHB B; 5JDO C; 4KMW A; 3GQR A; 2VLX A; 2EVK A; 5CN4 A; 4MXL A; 1O1M A; 1YCA A; 1XCH A; 1NXF A; 3SDH A; 4ROL B; 3BOM A; 1HAB A; 5HLX A; 1YIH A; 1N9X A; 1YIE A; 2ZFO C; 3UHZ A; 1ECA A; 3GKT A; 2FRI X; 4U8U B; 1KFR A; 2OHB A; 2GTL D; 4OF9 A; 5SW7 B; 1XZ4 A; 2WY4 A; 2R1H A; 2ZS1 A; 1X9F D; 1MLK A; 1Y5J B; 4AVD A; 3E4N A; 1RTX A; 3A5A A; 1XZ7 A; 5EUI A; 1SDK B; 3IC2 B; 1LFZ A; 5ILR A; 1D8U A; 3WFW A; 1JZM A; 2H8F A; 1X46 A; 1C7C B; 2XKG A; 3QZX A; 1MOB A; 2ZST A; 3BJ1 B; 1CO8 A; 1HCO A; 2MGF A; 1FSX A; 1CG5 B; 4FWX A; 3HYU B; 1UVX A; 2GTL B; 2HHE B; 3LR9 A; 1SDL B; 3D17 A; 4H07 A; 4ZVB A; 1Y0A A; 1X9F B; 1YEN B; 2W72 B; 2FAM A; 1HBB B; 1Y0T B; 1DTM A; 2MYE A; 3ZJO A; 4N8T B; 2XKI A; 1RTE A; 1YVQ A; 1CP0 A; 1AJG A; 1SPE A; 4GZG A; 1KD2 A; 3VRF B; 3NMM B; 2VYY A; 2ZT1 A; 4O4Z A; 1ABY B; 1J7Y B; 3QJB A; 1M9P A; 1J40 B; 3PIA A; 2D5Z B; 1S56 A; 1LFY A; 1MNO A; 5E6E B; 1ABW A; 2Z6T A; 2HCO A; 1H1X A; 3GYS B; 1K0Y A; 1SPG A; 4KN3 A; 2R4Y A; 1JPB A; 5JDO E; 1N9I A; 3ZJL A; 2HBS A; 2G10 A; 3R5I B; 1LJW A; 3MVC A; 2HBF B; 3GDJ A; 2GKM A; 1Y85 A; 2AV0 A; 4IRO A; 1C7B B; 1Y0D A; 3GKV B; 2Z6N A; 4NI0 A; 1Y8W B; 1HDA A; 4O4T A; 104M A; 5KER B; 1HDS B; 1A00 A; 2PGH B; 1U7R A; 4ESA B; 4MQK B; 1BUW B; 1N9F A; 2O5O X; 1Y4V A; 3WCT B; 2D2M D; 1CH3 A; 3A2G A; 4G51 A; 1ASH A; 2SPM A; 5CN8 A; 4YU3 A; 3SZK A; 2E2Y A; 3RGK A; 2HBE A; 1VXG A; 1YHE B; 1GCV A; 1HBA B; 1HHO A; 1MLU A; 1A3N A; 1MNI A; 3RJ6 A; 1RQ4 B; 1QPW B; 2FRJ X; 2HZ1 A; 4TYX A; 2DN2 B; 2ZSR A; 3UH7 A; 4DWT A; 4XS0 B; 1VRE A; 5CN7 A; 3QJC B; 3PI1 A; 2HHB A; 1BVD A; 2RI4 B; 1DUK A; 1BZP A; 1CBL A; 3LB4 A; 1F5P A; 2H8D B; 1O16 A; 2MGH A; 3A9M A; 2D5X A; 4ZVA A; 4ROL A; 3ECX A; 1G09 B; 1LUE A; 4WJG A; 1LFL A; 1QSH B; 5F0B A; 3W4U B; 1ECN A; 2DN1 B; 2V1I A; 4U8U A; 3FS4 B; 1LH6 A; 5CND A; 1MTI A; 2MGL A; 3WI8 A; 4FWZ A; 5HY8 B; 1MLH A; 4PQ6 A; 5SW7 A; 4FC3 B; 3HEO A; 3ED9 A; 1FAW B; 1Y5J A; 3UHQ A; 2R80 B; 3FH9 B; 1UT0 A; 1G9V B; 4NZI A; 1MLR A; 1SDK A; 3GK9 A; 1MGN A; 3IC2 A; 5EU2 A; 1YE0 B; 2O58 X; 1QXD B; 1SI4 B; 1V07 A; 3O7N A; 1XZV B; 3HRW B; 1C7C A; 1GBU B; 1MTJ A; 1DLY A; 1COH B; 3BJ1 A; 1RQ3 B; 1MYH A; 1CG5 A; 4KJT A; 1G0A B; 1J52 A; 3HYU A; 3DHR B; 3PT7 B; 2GTL A; 3UHY A; 3QZZ A; 3TM9 A; 2HHE A; 1SDL A; 1HRM A; 1MYZ A; 1X9F A; 1YEN A; 2W72 A; 1HBB A; 1Y0T A; 4MBA A; 1URV A; 1BAB B; 4N8T A; 3LHB A; 2JHO A; 3EDA A; 1FCS A; 3VRF A; 1HAC B; 3NMM A; 1A6M A; 3A0G B; 1ABY A; 1J7Y A; 1GVH A; 3WCW D; 1J40 A; 1YMB A; 2D5Z A; 2EKT A; 2AV3 A; 1FDH G; 2QFK A; 5E6E A; 1MNK A; 4F68 A; 5ILE A; 3GYS A; 1BBB B; 1JP6 A; 1Y2Z B; 3UHN A; 2D2N B; 5HBI A; 1YHU B; 1MWD A; 3R5I A; 2ZSX A; 2QLS B; 2EKU A; 2HBF A; 2ZLU B; 3MJU B; 4NXC A; 1JEB B; 3IA3 B; 1A01 B; 3WCV D; 1C7B A; 3BCQ B; 1CPW A; 3GKV A; 4F69 A; 1Y8W A; 1CLS B; 3GLN A; 1R1Y B; 108M A; 3ASE A; 3UHS A; 3WCU D; 1HDS A; 5KER A; 2PGH A; 2XYK A; 3WCW B; 5E83 B; 1EW6 A; 1MLJ A; 4ESA A; 3G4Q A; 4MQK A; 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1WMU B; 2AUQ A; 3ZJP A; 1G0A A; 3OO4 B; 1YMC A; 1VXB A; 3DHR A; 3PT7 A; 3UHX A; 3VAU A; 3MJP B; 2V1F A; 1UVY A; 1J3Y B; 2BLI A; 1RVW B; 2BWH A; 3K3U A; 1S5Y B; 1CIK A; 1UIW B; 1DTI A; 1V9Q A; 2D5X B; 2VLY A; 1DO7 A; 4UUR A; 2FRK X; 1BAB A; 1THB B; 1HBH B; 1YH9 B; 3UHH A; 1AZI A; 1A0U B; 3QJD B; 3OVU C; 1LFL B; 3UHU A; 1HAC A; 3WFX A; 1V4U B; 2BLJ M; 3UHG A; 3A0G A; 1EWA A; 2ZSQ A; 1MYI A; 1YOI A; 2VLZ A; 3UGZ A; 2LHB A; 3KMF A; 2R4W A; 1BBB A; 1Y2Z A; 2G11 A; 1MLS A; 3D7O B; 2D2N A; 1YHU A; 3B75 B; 3AT6 B; 2SPL A; 2QLS A; 1MOC A; 2ZLU A; 3MJU A; 1F5O A; 3CIU B; 3R0G A; 3NG6 B; 1JEB A; 3GQG B; 1A01 A; 1JWN A; 3BCQ A; 4HBI A; 5B84 A; 105M A; 3TLD A; 1O1L B; 1CLS A; 1ECO A; 1R1Y A; 3LB1 A; 2OHA A; 3E55 A; 1MBO A; 1O1K B; 4XDI A; 4N7P B; 1CH4 A; 4L2M A; 3AQ9 A; 3WCW A; 4B4Y A; 5E83 A; 4U8U C; 4BJA A; 3MOU A; 3VHB A; 1Y4B B; 4F6B A; 3UGY A; 2QSP B; 5AZR A; 1XXT A; 1OUT B; 3AQ7 A; 2DC3 A; 2OH8 A; 1CO9 A; 4F4O A; 1GBV A; 1OUU A; 1LH5 A; 5CMV A; 3G4V A; 1YGD A; 3UHC A; 1CH7 A; 2DHB B; 1Y83 B; 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