The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
165
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structure length |
165
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Chain Sequence |
ALVEDNNAVAVSFSEEQEALVLKSWAILKKDSANIALRFWLKIFEVAPSASQMFSFLRNSDVPLEKNPKLKTHAMSVFVMTCEAAAQLRKAGKVTVRDTTLKRLGATHLKYGVGDAHFEVVKFALLDTIKEEVPADMWSPAMKSAWSEAYDHLVAAIKQEMKPAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Non-symbiotic hemoglobin 1
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| publication title |
Role of phenylalanine B10 in plant nonsymbiotic hemoglobins.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Oryza sativa
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| total genus |
53
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| structure length |
165
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| sequence length |
165
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2W6V B; 3WTG B; 1K1K B; 5EET A; 2MGH A; 3EOK B; 1YGD B; 3NMM B; 3PT8 B; 1J3Y B; 1CLS A; 4NS2 A; 2XKI A; 3GQG A; 4U8U B; 1MLL A; 4L7Y B; 4MQH B; 1OUT B; 3DHR B; 3G4U A; 4H07 A; 2HBC A; 5CND A; 1R1X B; 1S5X B; 2QLS B; 1DUO A; 2EB9 A; 3ZHW A; 1LTW A; 1MWB A; 1HBR B; 1JL6 A; 2MGE A; 1RVW A; 5JDO F; 4DC7 A; 2RAO B; 1SDK B; 5CMV A; 4HSW A; 1FSX A; 1GLI B; 3K3U A; 2ZSO A; 4G51 B; 1F5O A; 3DHT B; 2GDM A; 3S66 A; 1G08 A; 109M A; 1BZ1 A; 4MQJ B; 3AT5 A; 1NPF A; 1SPE A; 1MYZ A; 3WCV A; 2HHB A; 1D8U A; 1C7D B; 2HBF B; 1JEB B; 2R4Z A; 4FC3 A; 3QM8 A; 1IBE A; 1EW6 A; 3E4N A; 1DXU A; 3QMA A; 1O1I B; 2BMM A; 4HSX A; 1HGC B; 1XZ5 B; 1Y5K A; 2VRY A; 1Y0W A; 1ECN A; 3OZW A; 4MAX A; 3HEN A; 3BJ2 A; 1A9W E; 1DLY A; 1YEO B; 2HHE B; 3OO5 B; 2AV3 A; 1DWT A; 1MOD A; 3FS4 B; 3UHE A; 4NI0 A; 4N7N A; 3BJ3 A; 1A6G A; 4MXL A; 3UBC A; 1HAC B; 2HBE B; 2DXM B; 5KDQ B; 3MOU A; 2M6Z B; 1AZI A; 2D2M A; 1BBB B; 1YE0 B; 4WJG 1; 2FAL A; 5F0B A; 2HBG A; 3UBV A; 1Y22 B; 1G09 A; 2QSS A; 1C7C B; 1XZ7 B; 3GQR A; 1FDH A; 4HRR A; 1Y8W B; 3AT6 A; 3UHH A; 1EBC A; 1LFL A; 3CY5 A; 1JP9 A; 1ITH A; 1IRC A; 1FHJ A; 3WHM A; 4C0N A; 1VXC A; 1XY0 A; 5E29 A; 2VYW A; 3UHB A; 1NPG A; 1ABW B; 1YEU A; 1CP5 A; 1YH9 A; 2D5X B; 1RTX A; 3GOU A; 1YIH B; 1O1M A; 1AJG A; 3S1I A; 4X0L B; 3AQ6 A; 1A0U B; 1V07 A; 1O1J B; 1X46 A; 3QZZ A; 4ZVA A; 3LB1 A; 2NSR A; 1NS6 B; 3U3E A; 1XCH A; 1O1P A; 2H8F A; 5B84 A; 3OVU C; 1A6M A; 3GKT A; 1QI8 B; 3B75 B; 1SHR B; 2Z8A A; 1SI4 B; 1MLO A; 1YVQ A; 3NL7 A; 2H35 A; 2W31 A; 3A0G A; 3ZJO A; 3OZV A; 2LH7 A; 1JF3 A; 3HRW B; 1YG5 B; 1YCB A; 3LHB A; 4ROM B; 4FH7 A; 1JP6 A; 1TES A; 3ZJR A; 2SPM A; 1M9P B; 4FWY A; 1LFZ A; 1A00 B; 5SW7 A; 1MNI A; 2FRJ X; 5F2A A; 2R1H B; 3UHD A; 1HBG A; 5CNC A; 1CH4 A; 1Y2Z B; 6HBI A; 1LFT B; 3O7N A; 2D60 B; 3IA3 B; 4F6B A; 2OIF A; 2ZS1 D; 4O35 A; 1O1L A; 1MOH A; 3PIA B; 2VLX A; 3PT7 B; 2DHB B; 2BNL A; 3GQP B; 1GBV B; 2O5M X; 1CH2 A; 1FDH G; 1DXV A; 2ZLX A; 1MYM A; 3ED9 A; 2ZS1 B; 1Y35 A; 1MKO A; 3D7O A; 1MWD A; 6HBW A; 4HHB B; 4NXC A; 3G4Q A; 3MYN A; 1S69 A; 2GNW A; 5ILE A; 3QM6 A; 5C6E A; 1J3F A; 1IWH B; 1B86 A; 1QSI B; 1Y01 B; 2ZFB A; 1NIH A; 2ZSX A; 1GCW B; 3WFW A; 108M A; 1Y0D A; 1RQ3 B; 1ABS A; 1MYT A; 2R80 A; 4L2M A; 3QM5 A; 2MGG A; 1MBI A; 4O2G A; 1VWT A; 3ODQ B; 2PEG B; 1A6K A; 1A9W A; 3UH5 A; 3A5B A; 3GDJ B; 1J40 A; 1YVT B; 1CH9 A; 3BCQ B; 5D1V A; 3V2Z A; 2Z6N B; 2W72 C; 1YHE B; 2ZLT A; 1H97 A; 3UHG A; 2FAM A; 1MLM A; 3QZX A; 1XYE B; 1LFV A; 3QJC A; 1GCV B; 2DC3 A; 1O1N B; 2ZS0 D; 4GZG A; 3UHY A; 5EYS A; 1PBX A; 1ASH A; 1MCY A; 1A3O A; 3K8B B; 3MJU B; 4JAC A; 4F4O B; 1DO3 A; 3GK9 A; 1OUU A; 3DUT A; 1KD2 A; 3IC2 B; 4MQI A; 2NX0 A; 1XZ2 B; 1COH A; 2MGL A; 2MGF A; 3NFE B; 4B3W A; 1HDA A; 1HV4 A; 1BZZ A; 1CMY B; 1YFF B; 3ZJN A; 1SDL B; 3KUO A; 1NEJ A; 1HHO A; 3NG6 B; 2G12 A; 2ZLU A; 1V9Q A; 1YOH A; 3HF4 B; 3E5O A; 3PI9 B; 101M A; 1GDI A; 5MBA A; 3EDA A; 1C40 A; 1Y8K A; 2W6W A; 1NGK A; 2GRF A; 4AVE A; 2LHB A; 2MGM A; 2LH3 A; 3H57 A; 1YEV B; 1HBA B; 3ECZ A; 1KFR A; 2QU0 B; 1FAW A; 3IC0 B; 5EU2 A; 111M A; 4MPM A; 1Y7G B; 1G08 B; 1DKE A; 1Y0C A; 2G0R A; 3UH7 A; 1Y0A B; 2D5Z B; 1J7W B; 1Q1F A; 1H1X A; 3TLD A; 1JZL A; 3OZU A; 3HEO A; 3CIU A; 5CN4 A; 3WCV B; 1Y7D B; 1AJ9 A; 2HBD B; 1DUK A; 1IRD B; 2HBS B; 5HLX A; 4F6J A; 1VXD A; 1Y31 B; 2MBW A; 3SZK B; 1Y4F A; 3WCV C; 2MGK A; 1RQA B; 4ZVB A; 2ZFO A; 1NQP A; 1YZI A; 3UHN A; 1XZU A; 4C44 A; 2YRS A; 3BJ2 B; 1YHU D; 3PEL B; 3ORD A; 1CQX A; 1WLA A; 1Y0T A; 1MLJ A; 1HGA A; 5E6E B; 1BUW A; 1IDR A; 4TWV A; 2ZLW A; 1FSL A; 1QPW B; 3WI8 A; 3D1K A; 1A3N B; 1BZ0 A; 1DLW A; 3BJ3 B; 2MYD A; 3A59 A; 1VHB A; 1YHU B; 3LR9 A; 3O89 A; 4TYX A; 1CP0 A; 1MBA A; 3LQD A; 1BZP A; 1V4U A; 1YHU C; 2OH8 A; 2IG3 A; 2ZSY A; 1HBB B; 4MQG B; 1Y4Q A; 2D2M C; 1VXH A; 3V2V A; 1V75 B; 3ARL A; 2AA1 A; 1GZX A; 1LA6 A; 3E55 A; 3UHT A; 1YMA A; 1DWS A; 1MBO A; 3OK5 A; 4YU4 B; 1GDK A; 2VM0 A; 3G4W A; 2GNV A; 3ZJP A; 1FN3 B; 2QFN A; 3AQ8 A; 1UVY A; 2C0K A; 3UI0 A; 2ZT2 A; 2O5T X; 1XXT A; 1YH9 B; 3ZJS A; 3R5I B; 1CG8 A; 3GOU B; 1LFY A; 1DWR A; 3D4X A; 3UHR A; 1RPS A; 2BKM A; 2VYZ A; 4NXA A; 2HZ3 A; 2HCO A; 1Y5F B; 3KMF A; 3PI2 A; 1YGF A; 1LH2 A; 2V1H A; 1QXD A; 1UX9 A; 1XZ4 A; 1MTK A; 3LB2 A; 1HBH B; 1NAZ A; 1LFQ A; 1Y4R A; 2O5Q X; 1Y5J A; 3W4U B; 1MYI A; 1RQ4 A; 3A5G A; 4DWT A; 2HZ1 A; 1NZ2 A; 3RJN B; 2ZSR A; 3GYS A; 1YMB A; 2CMM A; 3A5A A; 1YDZ A; 2EB8 A; 3S48 C; 4HBI A; 3UHQ A; 1V4W B; 1Y4P B; 3P5Q A; 1FCS A; 103M A; 3HC9 A; 4UZV A; 1G9V A; 4H2L B; 1VRF A; 1Y7Z B; 1MDN A; 1Y7C B; 4MQC B; 1IOP A; 2AV0 A; 3LB4 A; 1MTI A; 5CN7 A; 1MYF A; 5HLU A; 1GBU A; 2D2N B; 3ASE A; 3HYU B; 5B85 A; 3HXN B; 1J3Z A; 5HU6 B; 1JZM A; 1BIJ B; 3D1A A; 5EUI B; 2ZWJ A; 5MBN A; 2D2N C; 4WCH D; 3QJD A; 1UIW A; 4M4B A; 1HDB A; 1LHT A; 1YEN B; 1Y85 B; 7HBI A; 5CNB A; 1Y8I B; 1BIN A; 1Y83 A; 2RI4 A; 1DXT A; 2LH5 A; 2NSS A; 3G53 A; 3VRG B; 2O5O X; 2FRF A; 2ZLV A; 2G0V A; 1MLF A; 1DO1 A; 4ESA B; 1THB A; 2AUO A; 1Y8H A; 3KUN A; 3S65 A; 3PI4 A; 3QJB B; 1F65 A; 4N7P A; 1HRM A; 1Y4G B; 2NRM A; 3UH6 A; 4LPI A; 3ZOL A; 1IT3 A; 1MOA A; 1Y4V A; 1URV A; 2V1K A; 1XZV B; 3OO4 A; 1X9F D; 2O58 X; 1A0Z A; 2QRW A; 3R0G A; 5CHR A; 1GDL A; 2DN3 A; 3QM9 A; 3PI1 A; 1XQ5 B; 1CH3 A; 1NXF A; 1YE2 A; 1MLU A; 1X9F B; 4M4A B; 3HHB A; 3MJP B; 3ONZ B; 1MLQ A; 4XS0 B; 1V4X A; 1EMY A; 3MN0 A; 3K9Z A; 1OFK A; 1MBC A; 3TM9 A; 1A01 B; 1QXE B; 2BLH A; 105M A; 2WTG A; 1LJW A; 1JW8 A; 3PI8 A; 2MGC A; 4F6F A; 1UFJ A; 5JOM A; 1X9F C; 3VRE A; 1KD2 B; 5E83 A; 2GRZ A; 4O4T A; 1CG5 B; 1BAB B; 3M3B A; 1WMU A; 3ZJL A; 2O5L X; 1HDA B; 1HDS A; 2GTL B; 2W6V A; 1K1K A; 3EOK A; 1YGD A; 2R4X A; 4YU3 A; 1O1O B; 2AUP A; 4B4Y A; 4MQK B; 3NMM A; 3WCP B; 2BLI A; 3PT8 A; 1J3Y A; 1JY7 B; 4U8U A; 1I3E A; 2MYA A; 2GTL C; 4L7Y A; 3WR1 B; 1NZ5 A; 1OUT A; 3DHR A; 2OH9 A; 1R1X A; 4ROL A; 5JGG B; 1S5X A; 1OBM A; 3WCU B; 1O1K B; 1Y09 B; 1JDO A; 4O4Z A; 5HY8 B; 1K0Y B; 1S0H B; 2GLN A; 5KER B; 3AQ9 A; 4HRT B; 1HCO B; 2G0Z A; 4ODC B; 4F6D A; 3VRF B; 1HLB A; 3RGK A; 1HGB B; 3UHW A; 3WCU C; 1BJE A; 3G4R A; 4MBA A; 2B7H B; 2QSP B; 3UHV A; 2RAO A; 1SDK A; 5EYJ A; 4BJA A; 1BZ6 A; 1MOB A; 2R4Y A; 1GLI A; 1R1Y B; 1NZ3 A; 1S5Y B; 4G51 A; 4IRO B; 3EU1 B; 1L2K A; 1Y46 B; 1OR6 A; 4N7O B; 2MB5 A; 1NQP B; 1RTE A; 2MGB A; 3BOM B; 1C7D A; 2HBF A; 1Y4B A; 2MHB B; 1MLS A; 1LH6 A; 2ZSS A; 1MTJ A; 2ZFO C; 4NK2 A; 2G10 A; 5KKK A; 1MBS A; 1URY A; 5CN5 A; 1J7Y B; 3D1K B; 1VXB A; 1HGC A; 1XZ5 A; 1YHR B; 3BJ1 B; 1NS9 B; 3WCW B; 2PGH B; 1HAB B; 1W92 A; 1T1N A; 2HHE A; 3OO5 A; 2G11 A; 2EVP A; 3FS4 A; 2W72 B; 3WCT D; 2ZSP A; 3WCW C; 2HHD B; 1JF4 A; 1HBS B; 1MNK A; 1C7B B; 3MKB B; 3NML A; 2DN2 B; 104M A; 2HBE A; 1YEQ B; 2DXM A; 2DN1 B; 1DXD A; 2AA1 B; 5KDQ A; 2M6Z A; 2OHA A; 4NI1 B; 1YCA A; 1ABY B; 1BBB A; 3WCT B; 1YE0 A; 1SPG B; 3FH9 B; 4N8T B; 1UT0 A; 2EF2 A; 2QMB B; 1VXA A; 5ILR A; 1Y22 A; 3LB3 A; 3MYM A; 1C7C A; 1G0A B; 1XZ7 A; 3D17 B; 4VHB A; 2FRK X; 3ECL A; 3LR7 A; 2H8D B; 1Y8W A; 3WCT C; 1XXT B; 2VEB A; 4F6G A; 4KJT A; 2ZSN A; 1PMB A; 2MYB A; 3ZJI A; 5JDO D; 1CLS B; 1VXF A; 1U7R A; 3EDB A; 3GQG B; 2LH2 A; 2SPL A; 1ABW A; 2HBC B; 2D5X A; 2ZT4 A; 1A6N A; 1O16 A; 1WVP A; 3IXF A; 1YIH A; 5CHQ A; 1CBM A; 2G3H A; 3HEP A; 3WFT A; 1HJT A; 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1MLR A; 1O1M B; 2VHB A; 1ECD A; 4F6I A; 2W6Y A; 1BVD A; 1O1P B; 2H8F B; 3UHK A; 3K8B A; 3MJU A; 2ZS0 A; 4YU3 B; 4F4O A; 5EOH A; 5CNG A; 5D5R A; 1MLG A; 3IC2 A; 4PQC A; 4OF9 A; 3VHB A; 5EE4 D; 4OOD A; 1YVQ B; 1YIE A; 1XZ2 A; 2Z6T A; 3NFE A; 3NL7 B; 2H35 B; 4PQB A; 3A0G B; 1DM1 A; 2MGJ A; 1CMY A; 4ROL B; 1YFF A; 1A4F A; 1SDL A; 3NG6 A; 1OJ6 A; 2WTH A; 2XKG A; 1MNH A; 4U8U C; 3SDH A; 3HF4 A; 3PI9 A; 1LFZ B; 5SW7 B; 1UC3 A; 2D2N D; 2OHB A; 2Z6S A; 4UUR A; 5EE4 C; 1YEV A; 3A2G A; 1HBA A; 1J41 A; 3BA2 A; 2QU0 A; 2O5S X; 1O1L B; 3IC0 A; 1N9H A; 110M A; 1Y7G A; 1Y0A A; 2D5Z A; 2BK9 A; 1J7W A; 2LH1 A; 2V1F A; 1Y7D A; 1DXV B; 2ZLX B; 1CO8 A; 1Y4B B; 2HBD A; 1Y35 B; 1Z8U B; 1MKO B; 3D7O B; 5CNE A; 4FWX A; 6HBW B; 1IRD A; 2HBS A; 2BLJ M; 2GKM A; 4SDH A; 4G1V A; 1Y31 A; 1N9F A; 3SZK A; 1MLH A; 5C6E B; 1B86 B; 1RQA A; 1NWN A; 2ZFB B; 1NIH B; 4F68 A; 3ZJQ A; 2R4W A; 1Y0D B; 1BZR A; 1S61 A; 3PEL A; 1ECO A; 1G0B A; 1T1N B; 2R80 B; 5E6E A; 4QAU A; 1VWT B; 1QPW A; 1A3N A; 1CH1 A; 1J40 B; 2MYC A; 102M A; 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