The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHTVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Complex of myoglobin with phenol bound in a proximal cavity.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
62
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-09-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2E2Y A; 2B7H A; 2VM0 A; 5ILR A; 1DWS A; 1V75 A; 2ZS1 D; 2QSS B; 2QFK A; 1YOH A; 2WTG A; 1YH9 B; 4IRO B; 3KMF C; 3PIA B; 3G4U A; 3G4Y A; 1YEU B; 4F6G A; 1Y35 A; 3ZJJ A; 2G0X A; 1HSY A; 1OUT A; 1Y0T B; 1SDK B; 1BZ0 A; 3QJE B; 3S1I A; 1CQX A; 1N9X A; 1HGB A; 1T1N A; 1CBM A; 4G1B A; 4G51 A; 1CG8 B; 1Y22 B; 5EUI A; 1ITH A; 1XYE A; 5JGG B; 1LH1 A; 1FSL A; 2G12 A; 3WFX A; 1O16 A; 1VWT A; 2ZT2 A; 4MQI A; 1Y01 B; 1YMA A; 3PT7 B; 1MTK A; 5SW7 B; 1URY A; 2R4W A; 4ODC B; 2XKG A; 1UFJ A; 2R1H A; 1BBB B; 1MOH A; 1YZI A; 4MQC B; 1RPS A; 2Z6N A; 1V07 A; 1O1I A; 1HDS A; 1Y0W B; 3VRG A; 1RQ3 B; 1BIJ B; 5AZQ A; 5EQM A; 1MCY A; 3W4U B; 1LH2 A; 4MQH B; 2GLN A; 3UHQ A; 4MXK A; 1XZV B; 1HBH A; 3WCT A; 1JY7 B; 1C7B B; 1GBU A; 3QJC B; 2MYA A; 1A3N B; 1HGA A; 2ZSN A; 1YG5 B; 1YVQ A; 3D7O A; 1UIW B; 4MPM A; 3E5I A; 3WHM B; 1MTJ A; 4F68 A; 1Y8W B; 2VYY A; 1KFR A; 4F6I A; 4YU3 A; 3WCW D; 1MBI A; 1YOI A; 1BVD A; 4SDH A; 3D17 A; 1MYJ A; 1CP0 A; 2DN3 A; 1O1M A; 4XS0 A; 1JZL A; 1Y7D A; 3MJU B; 3UHT A; 3LR7 A; 2D5Z B; 3ZJQ A; 3DR9 A; 2D2M B; 2V1H A; 2MGC A; 1OJ6 A; 1MOA A; 2NRL A; 1J3Y B; 4N7O B; 3SDH A; 1YHU D; 1CO8 A; 2QU0 B; 2R80 B; 2MGJ A; 1Y45 B; 2VLY A; 1NPG A; 3WCU B; 4N7N A; 3M3A A; 2EVP A; 2MGA A; 1JEB A; 1B86 B; 4MBN A; 4MU5 A; 1JWN A; 2GNW A; 3OGB A; 3UGY A; 1O1O B; 1UVY A; 3GDJ B; 2W6W A; 2ZLW A; 1DLY A; 5EYS A; 1I3E A; 3QJB B; 1GBV A; 1S0H B; 2DXM B; 4NK1 A; 2V1F A; 1C7C A; 4AVD A; 1NWI A; 3TLD A; 1HLM A; 3K3U A; 2HZ2 A; 1S56 A; 1LFY A; 3ZJN A; 2VEE A; 2VYW A; 3DHT B; 3DHR B; 3UHZ A; 1GDK A; 1SPG B; 1MWB A; 1Z8U B; 1Y0C A; 2G0R A; 2GTL B; 4N8T A; 4B4Y A; 1MGN A; 4DC8 A; 1HBB A; 1X3K A; 2W72 C; 4YU4 B; 2ZFO C; 4KMV A; 3ZOM A; 1A6M A; 1OR6 A; 1X46 A; 1MZ0 A; 1Y35 B; 1NZ5 A; 1F5P A; 2MGE A; 1XZ5 A; 6HBW B; 2ZSP A; 1BZ0 B; 2LH5 A; 3AQ9 A; 2Z6S A; 1LH5 A; 1JF4 A; 1HGB B; 1T1N B; 1X9F A; 4G51 B; 2DHB A; 2H8F A; 4M4B B; 5ILM A; 5EUI B; 1MWC A; 4F6J A; 1XYE B; 3ARL A; 1Y7Z B; 4HRT A; 4JAC A; 3B75 A; 1VWT B; 1MNI A; 3TM3 A; 1YEV B; 4MQI B; 3G4W A; 1J3F A; 1Y31 A; 1MBO A; 4PQB A; 2EKT A; 2M6Z A; 2R1H B; 1VXD A; 1YZI B; 3ARJ A; 3UHN A; 1RPS B; 2Z6N B; 2SPO A; 2EVK A; 3ONZ B; 1O1I B; 1HDS B; 1Y5F A; 3VRG B; 1A00 A; 4O35 A; 1HHO A; 5M3S A; 5D1V A; 3UHS A; 4NS2 A; 3LHB A; 2HHE B; 3WFU A; 3UHY A; 1VXC A; 1HBH B; 1MDN A; 1GBU B; 1MNK A; 1Y8H A; 2V1E A; 2W6X A; 3MVC A; 4FH7 A; 1HGA B; 3UHC A; 3A5A A; 1YVQ B; 3KUO A; 1ECA A; 1JL7 A; 3MKB A; 1A3O B; 3BCQ A; 1UFP A; 4YU3 B; 2ZS0 C; 2OH8 A; 2R50 A; 3QZX A; 3UHG A; 2BWH A; 1A01 A; 1XZ2 A; 1S6A A; 1NGK A; 1FDH G; 3D17 B; 3ZJO A; 1LJW B; 4ROM A; 3UBV A; 3WCT D; 2ZS1 A; 1O1M B; 4XS0 B; 5CNE A; 1Y7D B; 1V4X A; 2ZFB A; 2D5X A; 4TWU A; 3HYU A; 2AV0 A; 1JZM A; 1V5H A; 2GRF A; 1UVX A; 3QZZ A; 1HDB B; 1YE0 A; 1WLA A; 2OHA A; 4WJG A; 4N7N B; 4MBA A; 2QSP A; 1ECN A; 1JEB B; 1DWT A; 4NI1 A; 1MLF A; 3UH6 A; 2ZSX A; 1HCO A; 2ZLW B; 1GZX A; 2RI4 A; 1GBV B; 105M A; 1DKE A; 5JOM A; 3A59 A; 2D2N C; 1XY0 A; 3ZH0 A; 1Y4G B; 3NFE A; 1DO4 A; 1LFY B; 2BW9 M; 3AQ5 A; 1CH2 A; 1A6K A; 2FRK X; 1QI8 B; 1Y0C B; 1AJH A; 1MYG A; 4ESA A; 1YEQ A; 2H8D A; 4N8T B; 1YHR B; 1K1K A; 4H07 A; 1M9P A; 1Y5K A; 1V4U A; 1Y46 A; 4UUR A; 2DN2 A; 1B0B A; 2LH7 A; 5JDO C; 5KER A; 2QMB A; 2MGB A; 1RVW A; 1Y8K A; 1LFL A; 1NIH A; 2O5L X; 3A9M A; 3WCV C; 1YE2 A; 3A0G A; 4UZV A; 1XZ5 B; 1QXD A; 2MGH A; 1U7S A; 1MOB A; 3GQR A; 3MBA A; 3WFT A; 1QXE A; 1X9F B; 2DHB B; 1KR7 A; 2H8F B; 1A9W E; 3ECZ A; 2BLH A; 1YHE A; 2MGG A; 3NML A; 5CNF A; 1O1L A; 3ZHW A; 1S5Y A; 1Y4R A; 4U8U D; 1HBI A; 3B75 B; 5HLU A; 1VXA A; 3VHB A; 5CNB A; 5EET A; 1Y31 B; 1HBR B; 1YHU A; 2M6Z B; 3ZJP A; 3BOM B; 1Y5F B; 1THB B; 1A00 B; 2OHB A; 1HHO B; 1C7D B; 1VXG A; 4L2M A; 1LHT A; 1MLS A; 3BJ2 A; 3NMM A; 1ABY B; 1BIN A; 4M4A A; 1GCW B; 4MAX A; 1JL6 A; 1O1K A; 1Y8H B; 1O1N B; 2GRZ A; 1CMY A; 3HEP A; 109M A; 4UIQ A; 3UHK A; 1EBC A; 3PI8 A; 1C40 A; 1CH3 A; 4C44 A; 1D8U A; 3MKB B; 2PGH A; 3IA3 B; 2Z85 A; 3ZJI A; 3BCQ B; 3QMA A; 4FH6 A; 2BLI A; 1FN3 A; 5EYJ A; 3A2G A; 4NXC A; 1MYF A; 2G11 A; 1A01 B; 3FH9 A; 1DXC A; 3MOU A; 2ZT0 A; 4ROM B; 1JP8 A; 2ZS1 B; 4LPI A; 3PT8 A; 1V4X B; 2ZFB B; 2D5X B; 2OH9 A; 1A4F A; 5C6Y A; 3HYU B; 1ABW A; 1J7S A; 4FC3 A; 3S66 A; 1VRE A; 3E4N A; 1BZP A; 4F6D A; 4MQG B; 1YE0 B; 2W31 A; 2QSP B; 3UH3 A; 1EW6 A; 1NS6 A; 1F63 A; 3D1K A; 5E29 A; 3AQ8 A; 5C6E A; 1HCO B; 4PQ6 A; 4X0L A; 3U3E A; 2O5M X; 1XZ7 B; 3PI4 A; 1LH7 A; 1DKE B; 3KUN A; 2HBE A; 3A59 B; 1Y4B A; 2PEG A; 3UI0 A; 1MBN A; 3WFW A; 2OLP A; 1Y4V A; 1XY0 B; 1I3D A; 1OFJ A; 3NFE B; 2QFN A; 1RQA A; 1YIH A; 1GCV A; 5HAV A; 1BVC A; 1F5O A; 3H57 A; 4ESA B; 1Y09 A; 1YEQ B; 2H8D B; 1YVT B; 1O1P B; 1Y4Q A; 1K1K B; 1VXE A; 4PNJ A; 1Y5K B; 4O2G A; 1ABS A; 1V4U B; 1CLS B; 1GVH A; 1OBM A; 1NEJ A; 5KER B; 2QMB B; 1MLL A; 3WCW B; 1RVW B; 1Y8K B; 3NL7 A; 1NIH B; 1DXU B; 1YE2 B; 1QXD B; 3HXN B; 1JF3 A; 2V1G A; 3E5O A; 2MGL A; 1FDH A; 3GQR B; 2NSS A; 1KD2 A; 4F6B A; 1QXE B; 3ED9 A; 1DXV A; 3K9Z A; 4ZVB A; 1HAB A; 1JP9 A; 2HZ1 A; 1NQP A; 1LH6 A; 1YHE B; 3S65 A; 4MQK A; 5IKS A; 3ODQ A; 1PBX B; 1YFF A; 1O1L B; 2O5B X; 1Y4R B; 1YEO A; 2V1I A; 2AV3 A; 1GDI A; 2R4Z A; 3CY5 A; 4JYQ A; 3AQ6 A; 1YHU B; 3AQ7 A; 1DM1 A; 2KSC A; 2W6V A; 7HBI A; 1G0B A; 2VYZ A; 5CN9 A; 1GLI A; 3HEN A; 1MLJ A; 1YEN A; 3WR1 A; 1WMU B; 3EOK B; 4M4A B; 1LFT B; 1DXD A; 1O1K B; 2O5O X; 5EV5 A; 1V9Q A; 5HU6 A; 1CIK A; 1GDL A; 1CMY B; 3AG0 A; 3PI8 B; 2PGH B; 2AA1 B; 1MYI A; 1YIE A; 1FN3 B; 1MNO A; 1Y8I A; 2D2M C; 3NG6 A; 1AZI A; 103M A; 1Y7G A; 1QSI A; 3FH9 B; 1HRM A; 1JZK A; 1K0Y A; 1IDR A; 2VLZ A; 1O1J A; 3V2V A; 1MKO A; 3EU1 A; 3WCU C; 1MWD A; 2D2N A; 3GYS A; 3PT8 B; 1MLH A; 3EDB A; 2XKI A; 1ECO A; 3GKV A; 1A4F B; 1BZR A; 3QM9 A; 1XQ5 A; 3LR9 A; 1ABW B; 1J7S B; 4FC3 B; 3MYM A; 3A5B A; 3QM5 A; 2B7H B; 2ZSS A; 1V75 B; 1HGC A; 1A0U A; 1MLU A; 1UMO A; 3BJ3 A; 4O1T A; 1NS6 B; 5E83 A; 1MLK A; 2ZLT A; 5CNG A; 3D1K B; 1JDO A; 3S48 C; 1MLM A; 1Y0D A; 5C6E B; 1Y4F A; 2ZT4 A; 1XZU A; 4U8U A; 4X0L B; 6HBI A; 3V2Z A; 1LFV A; 1Y4B B; 2PEG B; 4WJG 1; 1LUE A; 2C0K A; 2GTL C; 4XDI A; 1OUT B; 2MYB A; 1Y4V B; 1Y83 A; 2O5T X; 5HLX A; 3IC0 A; 1G9V A; 1MLQ A; 1RQA B; 1SHR A; 1YIH B; 1GCV B; 2ZFO D; 1NWN A; 1L2K A; 1AJ9 A; 5CHQ A; 1R1Y A; 5HY8 A; 101M A; 2DN1 A; 3O89 A; 1Y0A A; 1Y4Q B; 1LFZ A; 3CIU A; 3P5Q A; 1Y4P A; 1NEJ B; 2MGF A; 2H35 A; 1EMY A; 3PI2 A; 1CH9 A; 1XXT A; 5F2A A; 3NL7 B; 1VRF A; 1BZ1 A; 1BJE A; 1S5X A; 4GZG A; 2V1J A; 2ZSO A; 5KDQ A; 3H58 A; 3HF4 A; 3WCT B; 4L7Y A; 2NX0 A; 3OZW A; 3UH7 A; 2XKH A; 1NQP B; 1CQ2 A; 3S65 B; 3RJN B; 3ZJL A; 3ODQ B; 3D7O B; 2HHB A; 1ASH A; 1MYH A; 1YEO B; 3PI3 A; 3GOU A; 1HDA A; 2Z8A A; 3CY5 B; 3WTG A; 2SPN A; 1DXT A; 3LQD A; 107M A; 3OO5 A; 1DO3 A; 2W6V B; 1NZ4 A; 1G0B B; 1IOP A; 2DN3 B; 2EF2 A; 1GLI B; 5EE4 C; 5B84 A; 1H97 A; 1H1X A; 4DWU A; 1YEN B; 3OVU C; 4G1V A; 2ZS0 D; 4H2L A; 2GKM A; 2O58 X; 1MLG A; 5HU6 B; 2MBW A; 1HBA A; 112M A; 3G4V A; 3QQR A; 3UHU A; 1S69 A; 1NS9 A; 4NXA A; 1YIE B; 3KMF A; 2VRY A; 1Y8I B; 3OJ1 A; 4FWX A; 2G0S A; 3NG6 B; 1MYT A; 1Y7G B; 3QQQ A; 1QSI B; 2GRH A; 2O5Q X; 3UHV A; 2YRS A; 1K0Y B; 4ROL A; 2VEB A; 3EU1 B; 1XCH A; 2GNV A; 3DUT A; 1C7C B; 2QSS A; 1CBL A; 3AT5 A; 1XQ5 B; 1GJN A; 1Y5J A; 3PIA A; 1HBG A; 1YEU A; 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1MLN A; 2MGI A; 1DO7 A; 2ZS1 C; 5CND A; 1NS9 B; 1J7Y A; 4NI1 B; 2W72 A; 3LB4 A; 2ZFO A; 1J40 A; 1TU9 A; 1DTM A; 1GZX B; 2RI4 B; 2YRS B; 2BNL A; 2GTL A; 4ROL B; 2AUP A; 4MXL A; 2D60 A; 3IXF A; 3DUT B; 1G0A A; 1CH1 A; 3AT5 B; 2AUQ A; 2V1K A; 1Y5J B; 4YU4 A; 5D5R A; 1HAC A; 2QLS A; 2AUO A; 4N7P A; 4HHB A; 2BMM A; 3RGK A; 4HRR A; 1XZ4 A; 1HV4 B; 2SPL A; 6HBW A; 3D4X A; 1CH4 A; 1M9P B; 1N9I A; 1Y7C B; 1OUU A; 1TES A; 1EWA A; 1Y46 B; 2DN2 B; 1IWH A; 4M4B A; 1Y7Z A; 2ZT3 A; 1J7W A; 2G0Z A; 2HHD A; 1YEV A; 1LFL B; 1HBS A; 3A0G B; 4KJT A; 4O4T A; 3QJD B; 3PEL A; 2D6C A; 1DTI A; 5E6E B; 2BLJ M; 3ONZ A; 4F4O A; 1YMC A; 5CMV A; 4DC7 A; 1FSX B; 1BZ6 A; 1VXF A; 1R1X B; 1HJT A; 1NZ3 A; 1IRD A; 1FCS A; 1BZZ B; 1S5Y B; 4QAU A; 2ZS0 A; 3FS4 A; 3WCW C; 3VRF A; 104M A; 3LB3 A; 2HHE A; 3M39 A; 3WI8 A; 2HBC B; 1N9H A; 3QM6 A; 1DO1 A; 2ZLU B; 1FLP A; 2MGK A; 3HRW A; 4FWY A; 110M A; 1A3O A; 1LA6 B; 4HSX A; 1CH7 A; 3HHB A; 1J52 A; 3GQP A; 3WCP A; 3BJ2 B; 3NMM B; 1YHU C; 3MN0 A; 5MBA A; 1IBE A; 3D1A B; 3UHX A; 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