The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIYIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKQGVRVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural dynamics of ligand diffusion in the protein matrix: A study on a new myoglobin mutant Y(B10) Q(E7) R(E10).
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
64
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-06-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NSS A; 1XZ4 A; 5CN5 A; 1AJ9 A; 5HBI A; 1Y4P A; 3WCV A; 1X9F D; 2GL3 A; 2HBF B; 3CY5 B; 4U8U D; 3E5I A; 1ASH A; 4KMV A; 2HBE A; 1YEQ A; 1B86 A; 1Y8K B; 1R1X B; 2MGE A; 3QM5 A; 1J7Y A; 1X9F A; 2IN4 A; 4U8U A; 1Y4F B; 1JW8 A; 1MLK A; 1M9P A; 3UHU A; 2Z6N B; 1XZV A; 1XQ5 B; 1Y4G A; 4MAX A; 1O1M A; 3K9Z A; 1YH9 A; 1KD2 A; 1BJE A; 3ZJJ A; 3BJ2 A; 2VYW A; 3GQR A; 5HU6 A; 2FRJ X; 1SI4 A; 3A2G A; 1R1Y B; 2HBC A; 4ROM B; 3DHR B; 1XY0 A; 4MQC B; 1Y0T A; 3UHD A; 2W72 A; 2QFN A; 1Y4R B; 1YEV A; 1OR6 A; 2D60 A; 1Y7Z A; 3S66 A; 2LH7 A; 4X0L A; 3SZK B; 3NFE B; 2W31 A; 2VLZ A; 1AZI A; 1LJW B; 3UBV A; 1Y35 A; 5CND A; 1MBC A; 1DO3 A; 3GOU B; 1RQ3 B; 4SDH A; 2MYA A; 2YRS B; 5E6E B; 4B3W A; 3UHQ A; 1X3K A; 1YGD A; 1LH3 A; 1HDA A; 1G08 B; 5CHQ A; 3ED9 A; 2HZ1 A; 5CN4 A; 5EUI A; 4HHB B; 3G4W A; 3MJU B; 3WR1 A; 1YG5 A; 2OHA A; 3CIU A; 2QSP B; 1NS6 A; 3H57 A; 3A5A A; 1DXV B; 2V1H A; 3WFW A; 1MLO A; 1HGB B; 1MNJ A; 1A00 A; 3OO4 B; 5EE4 D; 3ODQ A; 1DXT B; 1A6K A; 1CH7 A; 1SDK B; 2G14 A; 3EDA A; 3PEL A; 1DTI A; 1DXU A; 5F0B A; 1HBH B; 1YCA A; 1GBV A; 1V4U B; 3UBC A; 4C0N A; 1O1L A; 3G46 A; 2W6X A; 3QJE B; 3WCU D; 4KMW A; 3ONZ B; 3WCU A; 2SPM A; 4VHB A; 3WCP A; 1HBB A; 3IXF A; 3WHM B; 3ZJM A; 5ILR A; 2ZLW A; 3UHT A; 2HBD A; 1EMY A; 4XDI A; 3QZX A; 1Y2Z B; 2ZFO B; 3EU1 B; 1EBC A; 2R80 A; 4HRR A; 1RTE A; 4HRT A; 4MQJ B; 1S5Y B; 1LH5 A; 5E29 A; 2BW9 M; 3VRF A; 4NI0 A; 3PT7 B; 3WFX A; 2HBS B; 1DKE A; 1Y7D A; 1HBR B; 1C7C A; 2BWH A; 3NG6 A; 2AUO A; 1HBG A; 1D8U A; 3QJC A; 4YU3 A; 3KMF C; 1LH2 A; 1VXG A; 1CP0 A; 3S65 B; 4HSW A; 1Y09 A; 1A6M A; 1Y31 A; 3OO5 B; 3GKT A; 2EVK A; 1JL7 A; 1XZ5 B; 1A0Z B; 2HHE A; 5EET A; 1DO1 A; 1LHT A; 4WCH D; 2B7H B; 1NZ2 A; 2VYZ A; 1V4X A; 1MNO A; 2ZSZ A; 1BZP A; 1PBX A; 2AA1 B; 1IBE A; 1IDR A; 1Y8W B; 2ZFO D; 1UMO A; 1MNI A; 1O1N A; 3MYN A; 5CN8 A; 1YCB A; 3PI9 A; 1O1O A; 5EU2 A; 1MGN A; 2O58 X; 3BCQ B; 1Y5K B; 1HGA A; 3G52 A; 1THB A; 1J40 A; 3GYS B; 3WCV C; 1FSL A; 2H35 B; 3G4V A; 1YVQ B; 3PT8 B; 1JWN A; 1QPW B; 1X9F C; 4U8U C; 1HDB B; 1HGC B; 1Y4V A; 4B4Y A; 3LQD A; 2LH6 A; 4NK2 A; 1FSX A; 3UHX A; 1Y8I A; 4TWU A; 2ZSQ A; 5B85 A; 1MLG A; 1M6C A; 1MYH A; 1H97 A; 1JZM A; 4FH7 A; 1J7S A; 1NQP B; 4F68 A; 1I3D A; 3AG0 A; 3GQG B; 4NS2 A; 1MTJ A; 2ZT4 A; 1IWH B; 1LFV A; 1O1P B; 1YMA A; 1JZK A; 2VLX A; 1OUU A; 1WVP A; 1CMY B; 1BZ0 A; 5CN9 A; 1VRE A; 1RSE A; 2ZSP A; 5MBN A; 108M A; 2ZST A; 1XZ7 A; 1Y85 B; 1YIH B; 5HAV A; 1MNK A; 3IC0 A; 2PGH A; 3WCW D; 1MOA A; 2D5Z B; 5CN6 A; 1C40 A; 3AQ7 A; 2ZSX A; 1MBS A; 2H8D B; 2XYK A; 1MYM A; 2BK9 A; 1V75 B; 103M A; 1VXH A; 3WCW A; 1BZZ A; 1RPS B; 3D1A B; 1MLS A; 1K1K B; 1FAW B; 3ZHW A; 2ZSR A; 3PI1 A; 1UIW B; 2QU0 B; 2HCO B; 1F5O A; 3FH9 B; 1SHR B; 2NRL A; 1HBI A; 1SPG B; 2DN2 A; 1LFQ A; 2ZT1 A; 3AQ8 A; 3UGY A; 1MYT A; 2EKT A; 2R4X A; 4N7N B; 1ABS A; 2MGH A; 1Y0D B; 2BLI A; 1C7B B; 2ZT3 A; 1F63 A; 5EQM A; 4N7P B; 4N8T B; 3QQR A; 3BJ3 B; 2MGM A; 4WJG 1; 1A01 B; 3W4U B; 1GCV B; 1BUW B; 2ZLU A; 1G09 B; 1DLW A; 1YIE B; 1HV4 A; 5EE4 C; 1YFF B; 3WCT D; 3M3B A; 1NWN A; 3MKB B; 1VWT B; 3UHI A; 1GZX B; 2MGA A; 4NI1 B; 1YDZ B; 3WCT A; 6HBW A; 1FHJ B; 3NMM B; 3MVC A; 4PQB A; 2E2Y A; 2QLS B; 4PQC A; 2H8F B; 2ZS1 A; 3NL7 A; 2AUR A; 3WCU C; 2D2N A; 3ZJO A; 1UX8 A; 1T1N B; 1QSI A; 3UHG A; 1GDI A; 1GDJ A; 2HHD A; 1O1J A; 1Y22 A; 2ZSY A; 4F6G A; 4L2M A; 1G0B B; 1QXE A; 1JY7 B; 2HZ2 A; 3AT6 A; 1LFT B; 1AJG A; 5CN7 A; 4L7Y A; 2D5X A; 1L2K A; 2LH1 A; 1YZI B; 1Y7G A; 1YE2 A; 3A5B A; 1XZ4 B; 5AZQ A; 3IC2 A; 1GDL A; 1AJ9 B; 5EYS A; 1Y4P B; 1YHU D; 4O1T A; 3WCV B; 1CH9 A; 1QXD A; 2QFK A; 1GDK A; 2HBE B; 1YEQ B; 1B86 B; 1BZR A; 3OGB A; 2ZT0 A; 1J7Y B; 1YHU A; 1Z8U B; 1X9F B; 4U8U B; 2HZ3 A; 1WMU A; 4IT8 A; 2LH5 A; 1M9P B; 3HXN A; 2ZSO A; 2QRW A; 3VRE A; 1XZV B; 1Y83 A; 1Y4G B; 1FN3 A; 1O1M B; 1MKO A; 1YH9 B; 1KD2 B; 2DXM A; 2ZLV B; 2O5O X; 2OHB A; 3G53 A; 3BJ2 B; 1BAB A; 3GQR B; 5HU6 B; 1BVD A; 1YMC A; 1SI4 B; 1MOH A; 1ABW A; 4C44 A; 3QMA A; 4F6F A; 2HBC B; 1O1K A; 1XY0 B; 1Y0T B; 7HBI A; 2G0S A; 2W72 B; 3ZJI A; 1CH3 A; 3ECX A; 1A4F A; 2Z85 A; 1YEV B; 4TWV A; 2D60 B; 1Y7Z B; 1OUT A; 3S66 B; 4N7O A; 4X0L B; 5SW7 A; 1LFL A; 1EBT A; 2SPL A; 5CHR A; 2DN3 A; 1ECA A; 1Y0C A; 1CLS A; 2MYC A; 1LA6 B; 4MXK A; 1Y35 B; 5AZR A; 1G9V A; 2GDM A; 4KJT A; 3LB3 A; 1IRC A; 4H07 A; 1VXE A; 4M4B A; 1HAC A; 1YGD B; 1URY A; 1HDA B; 1X46 A; 2GRF A; 2GNV A; 3HC9 A; 1QI8 A; 3UHY A; 1OFK A; 2PEG A; 2GLN A; 1MZ0 A; 1MDN A; 4G1B A; 5EUI B; 1J41 A; 3D17 A; 3P5Q A; 2ZFB A; 3WR1 B; 2QSS A; 1YG5 B; 3CIU B; 1NS6 B; 2HHB A; 2MYE A; 1XXT A; 3PI8 A; 1Q1F A; 1Y45 A; 1A00 B; 1ECN A; 3A59 A; 2MGL A; 3ODQ B; 2MGD A; 3ORD A; 3WCW C; 1XZU A; 3LR9 A; 4F4O B; 5M3S A; 3VHB A; 3UHV A; 2W6V A; 3A0G A; 1MLH A; 2ZS0 D; 3PEL B; 4PQ6 A; 1DXU B; 2ZS0 A; 1GBV B; 1J7W A; 4MQI A; 5JGG A; 1O1L B; 3UI0 A; 3VAU A; 5MBA A; 2GRH A; 2VYY A; 3UHB A; 3V2V A; 1YGF A; 2R4Z A; 3E5O A; 2G0R A; 3WCU B; 4NXC A; 3WCP B; 1DUK A; 1HBB B; 2NX0 A; 1JEB A; 2ZLW B; 2G11 A; 2HBD B; 3KUO A; 3S48 C; 2R80 B; 4HRR B; 3SDN A; 4HRT B; 5ILP A; 1A9W A; 2FRI X; 5E29 B; 1YHE A; 3VRF B; 1URV A; 3A5G A; 4NI0 B; 5KDQ A; 3PIA A; 2DN1 A; 4HBI A; 4ODC A; 1DKE B; 2LHB A; 1Y7D B; 1C7C B; 3NG6 B; 3OZV A; 1S0H A; 1JDO A; 3QJC B; 4YU3 B; 3UH6 A; 1U7S A; 2ZSN A; 3WCT C; 2MGC A; 3PI3 A; 2G0Z A; 4G1V A; 1Y09 B; 1Y4Q A; 1Y31 B; 2ZLX A; 4NZI A; 1RQ4 A; 1VXB A; 2HBG A; 3M3A A; 1LFZ A; 1I3E A; 2D2N C; 1IOP A; 2HHE B; 4F6B A; 2MGF A; 3G4Q A; 1YEN A; 4MXL A; 1V4X B; 1PBX B; 3K8B A; 4O4Z A; 3BA2 A; 1IBE B; 1MLR A; 1JZL A; 1Y0A A; 2XKH A; 5D5R A; 1BIJ A; 3ZOM A; 1O1N B; 1Y46 A; 2O5Q X; 1JF3 A; 2BKM A; 2EB8 A; 1MWD A; 3PI9 B; 1O1O B; 3EOK A; 4DWT A; 2CMM A; 2FAL A; 1RVW A; 1C7D A; 3MOU A; 1HGA B; 3ASE A; 1THB B; 1J40 B; 4ZVB A; 1NIH A; 4F6I A; 2MHB A; 2XKI A; 3QM7 A; 1YHU C; 1Y4V B; 1YHR A; 3LQD B; 4ROL A; 3FS4 A; 1FSX B; 1Y8I B; 1VXF A; 1MLF A; 2VEB A; 1DWS A; 2FAM A; 2RAO A; 2AUP A; 4FWZ A; 3DHT A; 1MWB A; 1JP8 A; 2XKG A; 1J7S B; 1IT3 A; 5JDO D; 1YE0 A; 1J3Y A; 1CQX A; 3EDB A; 1N9I A; 1GLI A; 2GTL A; 3ECL A; 1LFV B; 5IKS A; 1HBS A; 1Y7C A; 1SDL A; 1OUU B; 3BOM A; 1J3F A; 3OK5 A; 1Y8H A; 1H1X A; 3WFU A; 1BZ0 B; 1JF4 A; 2O5B X; 2W6W A; 1XZ7 B; 1YOI A; 1BZ1 A; 1S5X A; 5CMV A; 3IC0 B; 2PGH B; 1C40 B; 3K3U A; 1WLA A; 1MLL A; 3S1I A; 3WCW B; 1BZZ B; 3HHB A; 3D7O A; 4HSX A; 1LFY A; 1OR4 A; 3PI4 A; 3TLD A; 2RI4 A; 3QJB A; 1RQA A; 2ZSS A; 5C6E B; 4DC7 A; 1NWI A; 3QJD A; 3D1K A; 1ITH A; 1U7R A; 5AB8 A; 3UH7 A; 2DN2 B; 2OH8 A; 1LFQ B; 1MBD A; 1FLP A; 2BNL A; 3AT5 A; 1CIO A; 3V2Z A; 4AVD A; 1NEJ A; 1GBU A; 4MPM A; 1A3N A; 2G0X A; 1Y01 B; 2W72 C; 2ZLU B; 3ARK A; 1XYE A; 1HV4 B; 3UHH A; 4ESA A; 3ZJN A; 2MGG A; 4ZVA A; 2DHB A; 1LHS A; 2ZS0 C; 3A9M A; 3WCT B; 3WTG A; 6HBI A; 1MYJ A; 6HBW B; 1CH4 A; 2ZS1 B; 1Y5J A; 3NL7 B; 4MBN A; 2G3H A; 1NZ4 A; 2GKM A; 3ZOL A; 3GKV A; 1CG8 A; 2D2N B; 1A3O A; 1QSI B; 3DUT A; 1GJN A; 3DR9 A; 1S56 A; 1MOC A; 2HHD B; 3MN0 A; 1O1J B; 1J52 A; 1Y22 B; 3BJ1 A; 104M A; 2Z6S A; 1QXE B; 101M A; 3VRG A; 3AT6 B; 1KFR A; 2JHO A; 4L7Y B; 2D5X B; 2DC3 A; 1Y7G B; 1YE2 B; 4JAC A; 2NRM A; 1HSY A; 4DWU A; 1IRD A; 1JPB A; 3IC2 B; 1SPE A; 5CNE A; 4TYX A; 1V4W A; 3ZJQ A; 3UHZ A; 1QXD B; 2SPN A; 1CH1 A; 1UX9 A; 3GQP A; 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1XZU B; 2W6V B; 1O16 A; 3A0G B; 3LB2 A; 1K0Y A; 3NML A; 1FDH G; 1HCO A; 4FC3 A; 2ZS0 B; 1J7W B; 4MQI B; 5JGG B; 1N9F A; 1NS9 A; 4AVE A; 3AQ9 A; 1CIK A; 1TU9 A; 3IA3 B; 1EWA A; 4XS0 A; 5ILM A; 4QAU A; 1YGF B; 2AUQ A; 2R1H A; 4JYQ A; 1NPF A; 1JEB B; 1QSH A; 3HYU A; 2QMB A; 4MQK A; 1HAB A; 5EYJ A; 2M6Z A; 1YHE B; 3B75 A; 3QM6 A; 4UUR A; 3TM3 A; 5KDQ B; 3MJP A; 3PIA B; 2DN1 B; 1O1I A; 4FWX A; 4ODC B; 105M A; 1S0H B; 2ZLV A; 1ABY A; 1F65 A; 1DO7 A; 1J3Z A; 1CG5 A; 4IRO A; 3PI2 A; 1Y4Q B; 2ZLX B; 3S1J A; 5E83 A; 1RQ4 B; 1LFZ B; 1UVY A; 1BBB A; 3RGK A; 1NZ3 A; 111M A; 1YEN B; 1VXA A; 1B0B A; 3K8B B; 2MGJ A; 1COH A; 1Y0A B; 1BIJ B; 1Y46 B; 1LA6 A; 2HBF A; 3CY5 A; 5JDO E; 3EOK B; 1Y8K A; 1R1X A; 1RVW B; 3G4R A; 1C7D B; 2O5M X; 2V1F A; 1Y4F A; 1S61 A; 2G10 A; 2Z6N A; 1CPW A; 1NIH B; 1XQ5 A; 1YOH A; 4OOD A; 2MHB B; 1LH6 A; 5EV5 A; 1YHR B; 4ROL B; 3FS4 B; 3M38 A; 2W6Y A; 3LR7 A; 2LH2 A; 2ZS1 C; 2RAO B; 2EB9 A; 4UIQ A; 1R1Y A; 3DHT B; 4ROM A; 3DHR A; 2O5S X; 4MQC A; 3HEP A; 3HEO A; 1MLQ A; 1YE0 B; 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