The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GSHMEATKRYLCLYLKESQEKFISNWKKRILVHEHDPYKNEIIKNGTHLLHVFTMYMREEINLQDIEDISKKIAQERMDAKVNIADFIYNTNEGKKEILNTLFLLNPTGQECKVVIEQINLFFDHLIYSTIYSYYKLKKEYIHSYYELKKKYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Lipid binding protein
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| molecule keywords |
Conserved domain protein
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| publication title |
Structural Insights into Inhibition of Bacillus anthracis Sporulation by a Novel Class of Non-heme Globin Sensor Domains.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus anthracis
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| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-11-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09385 | HisK_N | Histidine kinase N terminal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globin-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3PMD A; 3PMC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3S48 C; 107M A; 1QXD B; 1GH0 B; 2C7J A; 2ZFO A; 3VAU A; 5CN4 A; 2C7J B; 1X9F B; 2ZFO B; 4GXE B; 2OLP A; 2JL9 A; 2D5X B; 1JF4 A; 1XYE A; 3BCQ A; 2QFK A; 1RH1 A; 4F6F A; 1V75 B; 1XG0 C; 3K8B A; 1A9W E; 3IXF A; 1A3N A; 3LQD A; 1CG5 B; 1MLG A; 1N9I A; 1I7Y B; 4DC8 A; 1Q1F A; 1OUT A; 3HC9 A; 1KN1 A; 1OUT B; 3ZOM A; 1EYX A; 3QJD A; 3QJD B; 1HBI A; 1Y8K A; 1HI0 P; 1Y0T B; 1CH1 A; 1Y8K B; 1CPC A; 1KD2 A; 4A8Y A; 1U7S A; 4FC3 A; 4FC3 B; 3K9Z A; 3A0G A; 1A00 A; 1YFF B; 2SPN A; 1EWA A; 3AT6 B; 5B13 A; 1XCH A; 4XXI A; 3RGK A; 1NWI A; 2Z6S A; 2ZST A; 2CMM A; 1O1I A; 1YHU B; 1HBR A; 3QJB B; 1V07 A; 1O1I B; 2HBG A; 1VRF A; 1Y8W A; 2MYD A; 2HZ1 A; 1QXE A; 1Y8W B; 5E29 A; 1SDL A; 3QQQ A; 2NRL A; 2FRF A; 2ZS1 D; 1SDL B; 1Y7C B; 2GKN A; 1EMY A; 3ZH0 A; 2R80 A; 3TM3 A; 1MOH A; 2ZT1 A; 3R0G A; 1PMB A; 1ABY A; 5HBI A; 3S66 B; 1JZK A; 3UHD A; 3UHG A; 1UVM A; 3FS4 A; 2VJH A; 1LFL B; 1NS6 A; 1Y4V B; 2QLS A; 3M38 A; 1DLY A; 1YGF B; 1NS6 B; 2AUQ A; 4AVD A; 1QPW A; 2QLS B; 4F69 A; 1Y7G A; 2VYY A; 2V8A A; 1QPW B; 1Y7G B; 2V8A B; 5ILM A; 1HGC A; 1X9F D; 1XXT A; 4MQI A; 2ZFO D; 3HYU B; 3KMF C; 1CII A; 4SDH A; 5HLU A; 2H35 A; 1J3Y A; 3MJP A; 3K3U A; 3MJP B; 1TOX A; 2DC3 A; 3MOU A; 4G1B A; 1O1M A; 1HDA A; 1R1X A; 6HBI A; 4Q70 A; 1UVK A; 2DN1 A; 1J41 B; 4N7P B; 1MTI A; 1WAC A; 1HDS B; 2DN1 B; 1Y46 A; 1MLF A; 1B86 A; 1FAW A; 1G0A A; 1B86 B; 1VXH A; 3VRG A; 1FAW B; 1HHS A; 1G0A B; 110M A; 1CBM A; 3D1A B; 3VRG B; 3NL7 A; 1V9Q A; 5F2A A; 2D2N A; 3WCV C; 1ABW A; 5CHQ A; 1BVD A; 2ZS0 A; 1YE0 A; 2MGD A; 2D2N B; 2ZS0 B; 1MBO A; 1YE0 B; 2ZLW B; 4NZI A; 4O4T A; 3ZJJ A; 1QSI B; 3GKV A; 4F6G A; 3GKV B; 3GOU B; 4FWX A; 4OOD A; 1S5Y B; 4O4Z A; 4L7Y A; 1LFV A; 1A6N A; 1YHU D; 1NWN A; 1LFV B; 4F0T A; 1UIW A; 3UHT A; 1IDR A; 1MTJ A; 3A2G A; 1J3F A; 2C0K A; 3LB2 A; 1A01 B; 1DWS A; 2R4X A; 3WTG A; 3BA2 A; 3UHQ A; 4NXA A; 4F6J A; 2ZSR A; 2Z85 A; 2BKM A; 3WI8 A; 4ESU A; 5ILE A; 3BJ1 B; 3NMM A; 1Y45 A; 4HRR A; 1GBU A; 1Y4G B; 1EBT A; 1GBU B; 2G0X A; 4F6D A; 3NFE B; 1VRE A; 1UT0 A; 2O5T X; 3ZJI A; 1NY9 A; 2GRH A; 1XZ5 B; 3EDB A; 2R4W A; 1IRD B; 5E83 B; 3IC2 A; 1O1N A; 1Y35 A; 2VM0 A; 1CBL A; 2DN3 A; 1O1N B; 1Y35 B; 3AQ6 A; 2GL3 A; 2DN3 B; 3ORD A; 1Y5K A; 3QM6 A; 3L0F A; 1Y85 A; 2AV3 A; 2HHB B; 1Y5J A; 1CO9 A; 2UUL A; 3DHT A; 3GIO A; 1K1K A; 3CY5 A; 1Y5J B; 1HI8 A; 3OO4 B; 2VLZ A; 1LTW A; 3DHT B; 1NS9 A; 1K1K B; 3R5I A; 3GYS A; 2RAO A; 4N7O A; 2ZFO C; 1NS9 B; 1Y4B A; 3R5I B; 5HU6 A; 2RAO B; 4KMW A; 3E5O A; 1Y4B B; 4YU3 A; 3RQR A; 5HU6 B; 5CND A; 5F0B A; 2FAL A; 2QFN A; 1UX9 A; 1CQX A; 2ZS0 D; 103M A; 2D5Z A; 1LH6 A; 4KN3 A; 1C40 A; 3UHB A; 1THB A; 4ETT A; 1IT2 A; 4JAC A; 4NK1 A; 1C40 B; 1THB B; 1YH9 A; 1MBI A; 4KJT A; 1YH9 B; 4H2L A; 2BLH A; 4H2L B; 1TU9 A; 1MYH A; 4N6S A; 2SPO A; 4N6S B; 5EET A; 3PI4 A; 1NZ2 A; 1YOG A; 1Y0C B; 5KDQ B; 1MBS A; 1LJW A; 3EU1 A; 2MGK A; 3AQ8 A; 2R4Y A; 1LJW B; 3EU1 B; 1CP0 A; 1MLR A; 4UZV A; 1LFY B; 1B33 A; 2HBC A; 1J7Y B; 3UHE A; 4ZVB A; 4IT8 A; 1B33 B; 2HBC B; 1XY0 A; 1ASH A; 1XY0 B; 3MWN A; 3A5A A; 1ALL A; 1DXT A; 1OJ6 A; 4MQG B; 1DXT B; 1C7C A; 3GQP A; 4Z8K B; 2ZSX A; 1C7C B; 1X3K A; 2W31 A; 1AJ9 B; 1JY7 A; 3RJ6 A; 3PI1 A; 4O35 A; 3HEO A; 1DTI A; 3A59 B; 1M9P A; 4XS0 A; 3MN0 A; 1OUU B; 1MBC A; 2W72 A; 1M9P B; 4XS0 B; 2M6Z A; 1YE2 B; 1Y2Z A; 1HBA A; 2M6Z B; 1A3O A; 1GJN A; 3UHY A; 2HHD A; 1YIE A; 1VXC A; 1Y2Z B; 1HBA B; 1A3O B; 2HZ3 A; 4F68 A; 1YIE B; 3PEL B; 3ECX A; 4LM6 B; 1F63 A; 2G0Z A; 1U7R A; 1BZR A; 1FDH A; 2C7K A; 1N9X A; 1MYT A; 3UGY A; 3WCW B; 1YGD A; 1RPS A; 3P5Q A; 1DO7 A; 1YGD B; 5EYS A; 4B3W A; 3P5Q B; 2MGB A; 3S1J A; 2GRF A; 1GCW A; 1Y22 A; 3ARK A; 3MBA A; 1UC3 A; 1Y22 B; 1NGK A; 1J7S A; 2SPL A; 2MGL A; 1L2K A; 2MGF A; 5C6E A; 1JDO A; 2JHO A; 5AQD M; 2NX0 A; 1MKO A; 4U8U B; 1NEJ A; 1F0L A; 1MKO B; 4L1E A; 1CLS A; 4OF9 A; 1NEJ B; 5CNF A; 4L1E B; 4F0U B; 1NZ3 A; 2MGM A; 3LB4 A; 2D6C A; 3TLD A; 2BW9 M; 2D2M B; 1BUW B; 3WR1 B; 1MLJ A; 3UHS A; 1PHN B; 1VXF A; 2XYK A; 4H0M A; 3GQG B; 5E6E A; 1NPG A; 2UUM X; 1NZ5 A; 2V1F A; 2D2N C; 1YHE B; 5E6E B; 1O1L B; 2ZS0 C; 3GDJ A; 5ILP A; 1Y0W A; 3ARL A; 2W6X A; 3OZW A; 1ECD A; 1Y7D A; 1Y0W B; 3OZV A; 1H1X A; 3HEN A; 4PQ6 A; 2ZLU A; 5EOH A; 1Y7D B; 1MLM A; 2ZLU B; 3G4Q A; 1FSX B; 1BJE A; 1NIH A; 3KVS A; 4MBA A; 3ZJO A; 5CHR A; 2DXM B; 2G14 A; 2G0R A; 1YEN A; 3A9M A; 1YEN B; 2HZ2 A; 2DKA A; 2BMM A; 1MZ0 A; 2ZS1 A; 3DBJ A; 1HAB A; 1LFQ B; 3DBJ B; 1HAB B; 1HBH A; 1MLU A; 3EOK A; 1C7B A; 4AE0 A; 2AA1 B; 3WCU B; 1C7B B; 3WCW D; 2V1G A; 2EKT A; 1OR6 A; 1YEO B; 1DO4 A; 2QSS A; 2QSS B; 5JOM A; 1K0Y B; 3HRW A; 1QXD A; 3HRW B; 1J40 B; 2PEG B; 1HAC A; 1Y4F A; 1UFP A; 1X9F A; 1HAC B; 1Y4F B; 2AV0 A; 2GRZ A; 4ODC B; 1CMY B; 4GXE A; 4FWZ A; 4U8U D; 2D5X A; 4HRT A; 4VHB A; 1JZM A; 1JZL A; 1V4U A; 4HRT B; 1V75 A; 1URY A; 1V4U B; 2O5L X; 3SDN A; 4NS2 A; 3UHV A; 5HLQ A; 1CG5 A; 2UUL C; 1SPE A; 1YZI B; 2D2M D; 5EUI A; 1I7Y A; 1C7D B; 3TM9 A; 1GDJ A; 2MB5 A; 5EUI B; 3D4X B; 3UHN A; 1HBG A; 3O2C B; 4B4Y A; 1JEB B; 2UUM A; 2BLJ M; 3SZK B; 4PNJ A; 1G09 B; 2UUM B; 2MYA A; 2YRS A; 1Y0T A; 5CMV A; 1RQA B; 2LHB A; 3MJU A; 1XDT T; 2YRS B; 1LIA B; 3MJU B; 1FCS A; 5CNG A; 1HSY A; 2ZSO A; 3HF4 B; 1YFF A; 2ZT4 A; 4TWU A; 1DXV A; 1Y09 A; 4M4B A; 3AT6 A; 1DUO A; 3QZZ A; 2ZFB A; 1DXV B; 1Y09 B; 4M4B B; 2ZFB B; 3W4U A; 1YHU A; 3QJB A; 3DR9 A; 3W4U B; 3UHR A; 1JBO A; 3AT5 B; 1JBO B; 1LA6 B; 5EE4 D; 112M A; 1Y7C A; 3UHW A; 2WCR A; 1HA7 A; 3FH9 B; 3PI8 A; 3VRF B; 2FAM A; 1YDZ A; 1HA7 B; 3DHR B; 3PI8 B; 1R1Y A; 1YDZ B; 3S66 A; 1R1Y B; 2VJT A; 3WCU D; 1SHR A; 3UHZ A; 1LFL A; 5MBA A; 1OFJ A; 2VJT B; 1Y4V A; 2FRJ X; 1SHR B; 1YGF A; 3O7N A; 1S6A A; 3QM7 A; 1MYM A; 4YU4 A; 2GNW A; 5CN6 A; 5AZR A; 2W72 C; 4MXL A; 4YU4 B; 4M4A A; 5JDO D; 4ERT A; 4M4A B; 1MYI A; 1YCB A; 3HYU A; 1RSE A; 1MLS A; 2VJR A; 1BIJ A; 1M6M A; 2VJR B; 4FH6 A; 1BIJ B; 1MLN A; 2V1H A; 1HGA A; 1J41 A; 4N7P A; 2BLI A; 5EU2 A; 1HDS A; 1HGA B; 3M3A A; 4NK2 A; 3BJ3 B; 3OGB A; 1BAB A; 4WJG A; 3D1A A; 3ZTA A; 4F4O A; 1BAB B; 1MLQ A; 1Y7Z B; 3G4V A; 3ONZ B; 4F4O B; 3WFT A; 1A4F A; 3QZX A; 4XXK A; 1A4F B; 2HBE B; 1S69 A; 2R4Z A; 4A8Q A; 2ZLW A; 1QSI A; 2BNL A; 2LH3 A; 3GOU A; 3DUT B; 2GTL D; 4NI0 B; 2MGJ A; 2QU0 B; 3ZJQ A; 1S5Y A; 3QM8 A; 1XQ5 B; 1J52 A; 3M3B A; 5M3S A; 1MNJ A; 1MWC A; 1BBB A; 5AZQ A; 1Y01 B; 2MHB B; 2R1H B; 1BBB B; 2VYW A; 1MLH A; 3WFX A; 1VXE A; 1OR4 A; 3E5I A; 1QI8 B; 3UI0 A; 2OH8 A; 3WFW A; 1A01 A; 3ZJH A; 4QAU A; 1JP9 A; 1O1P A; 3A5B A; 1YVT A; 3WCT A; 3IA3 B; 1O1P B; 4G51 A; 3CIU A; 1YVT B; 4TWV A; 3WCT B; 3BJ1 A; 4G51 B; 1WMU A; 3CIU B; 1Y4G A; 1WMU B; 4HSX A; 3WCP A; 4PQC A; 1IWH B; 3WCP B; 1SDK B; 3NFE A; 4A8K A; 1RQ3 A; 3M39 A; 3HEP A; 1GDL A; 3GKT A; 2GDM A; 1RQ3 B; 1DO1 A; 3ZJL A; 3UHX A; 1XZ5 A; 3ZJM A; 1IRD A; 1NXF A; 2WCQ A; 1Y4P A; 2ZS1 C; 5E83 A; 1Y4P B; 2VLY A; 1NAZ A; 1YG5 B; 1YIH A; 4BJA A; 1YIH B; 3V57 B; 1HRM A; 2XKI A; 1N9H A; 3G4U A; 2OH9 A; 1S56 A; 2MBW A; 3PI9 B; 4IRO A; 1IBE A; 1AJG A; 4IRO B; 2AUR A; 1IBE B; 3PIA B; 5KKK A; 1CH7 A; 1ECN A; 2HHB A; 4F6B A; 4JYQ A; 2GLN A; 3OO4 A; 4MXK A; 1W92 A; 2MGG A; 4ZIZ A; 1MWD A; 4ZIZ B; 3MYM A; 1X9F C; 2OIF A; 3UHC A; 3AQ7 A; 2FRI X; 2BK9 A; 5CN5 A; 2VYZ A; 2G0V A; 4MQH A; 2B7H A; 1UVI A; 4MQH B; 5CN7 A; 2B7H B; 1SPG A; 1ECO A; 1GDI A; 3QJC A; 1SPG B; 3QJC B; 1EW6 A; 4MBN A; 1G08 B; 2IN4 A; 2BWH A; 1IRC A; 1Y0C A; 1Y83 A; 5KDQ A; 1V4X A; 1Y83 B; 1Y8I A; 4A8W A; 1HV4 B; 1V4X B; 1LHS A; 1BZ1 B; 3VNC A; 1Y8I B; 1MOD A; 108M A; 3UBC A; 1QGW C; 1LFY A; 1A6K A; 2Z6N A; 1J7Y A; 1MBA A; 1CO8 A; 1LH5 A; 3LB3 A; 1HGB A; 2Z6N B; 4MU5 A; 2QSP A; 1HGB B; 3WCT D; 1Y4Q B; 2QSP B; 3ODQ B; 1YEU B; 4MQG A; 3LQ9 A; 4Z8K A; 1LH3 A; 1SWM A; 1CIO A; 2DKD A; 1YHU C; 1QSH B; 1AJ9 A; 1CH9 A; 3BJ2 B; 3PT7 A; 3U3E A; 5KER B; 3A59 A; 1A6M A; 3PT7 B; 2ZSN A; 4WCH D; 1OUU A; 3MYN A; 1MYJ A; 1Y8H A; 2LH7 A; 1UVJ A; 1MTK A; 1Y8H B; 1YE2 A; 1XZV A; 3UHK A; 1XZV B; 106M A; 1J7W B; 3PEL A; 4C0N A; 4MQK A; 1BZ6 A; 3OZU A; 4MQK B; 1YCA A; 1WVP A; 2O5M X; 1O1K B; 3WCW A; 2G10 A; 1JL7 A; 1T1N B; 2NRM A; 3GQR A; 4WJG 1; 3KUN A; 1BZ0 B; 2SPM A; 7HBI A; 1CH3 A; 3GQR B; 1KTP A; 3KMF A; 1HI1 A; 4FWY A; 1BVC A; 1KTP B; 1DXD A; 1JWN A; 3S65 B; 3QM9 A; 1Y31 A; 3VRE B; 5AQD A; 1Y31 B; 1G9V B; 3UH6 A; 2H8D B; 4U8U A; 1NQP B; 3D7O B; 1HLB A; 2ZSZ A; 1YVQ A; 2ZWJ A; 4F0U A; 4HHB A; 1YVQ B; 2ZSS A; 4HHB B; 1NPF A; 2D2M A; 1BUW A; 3WR1 A; 1PHN A; 3ARJ A; 1EBC A; 3GQG A; 1O1O A; 2QRW A; 3WCV B; 1GVH A; 4GY3 B; 1O1O B; 1YHE A; 3HHB A; 1O1L A; 2PGH B; 1B0B A; 3HHB B; 4TMA B; 3AQ5 A; 2ZSY A; 5B13 G; 2HBS A; 2UUN B; 2V1K A; 2HBS B; 2MGI A; 1YMB A; 5JGG A; 2Z6T A; 5MBN A; 2BV8 A; 5JGG B; 1MLO A; 1UVL A; 2BV8 B; 2HHE B; 1GCV A; 1UFJ A; 5B85 A; 2X4A A; 1FSX A; 1GCV B; 1ON7 B; 1YEQ B; 5C6Y A; 1A87 A; 4HBI A; 1XZ7 A; 2Z8A A; 2DXM A; 1GDK A; 5HY8 B; 1XZ7 B; 5SW7 B; 1A6G A; 1YOI A; 2HBD A; 1PBX A; 1S0H A; 1BZZ A; 2HBD B; 1COH B; 1PBX B; 1S0H B; 3BRP B; 2IG3 A; 1BZZ B; 5CN9 A; 2O5O X; 1X46 A; 4ILZ A; 3WCT C; 1LFQ A; 2RI4 B; 1HCO B; 2EKU A; 3GLN A; 1DO3 A; 2O5Q X; 1DM1 A; 3D1K B; 1XZU B; 4HSW A; 1UVN A; 2W6V A; 2AA1 A; 3WCU A; 3E4N A; 2W6V B; 1YEO A; 1DKE B; 5JDO F; 4ESA A; 4L2M A; 5AB8 A; 4KMV A; 3WHM B; 4ESA B; 3G53 A; 1K0Y A; 1SI4 B; 1MBN A; 1J40 A; 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