The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
116
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sequence length |
285
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structure length |
282
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAFERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAFERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
|
| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
116
|
| structure length |
282
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| sequence length |
285
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1C7D B; 3O7N A; 1MYG A; 1J3Y A; 2DXM A; 1J3F A; 2VLX A; 1OFJ A; 1MBC A; 3MN0 A; 1YEN B; 2LH3 A; 3AQ5 A; 1CH1 A; 3BJ3 B; 2Z6N B; 3M38 A; 5HY8 A; 2BLJ M; 2ZFB B; 1DKE B; 1LFL B; 2OIF A; 1NIH B; 1FSX B; 1DXD A; 2Z6S A; 3BOM B; 2MGI A; 2LH5 A; 2DN2 B; 2HHE A; 5D1V A; 1DO3 A; 1Y5J B; 105M A; 1MLU A; 1YE0 B; 1PBX B; 4MQH A; 2DHB A; 1MKO A; 1XYE A; 1A9W A; 1V75 A; 2QFK A; 3HHB A; 3DHT B; 1UFJ A; 3D1A B; 1LFT B; 2XYK A; 1MNO A; 1LH3 A; 1Y35 B; 1Y4B B; 1IRC A; 3ORD A; 1A3O B; 2HHD A; 1J41 A; 1CBM A; 1MOC A; 1BZP A; 2D6C A; 1W92 A; 3UHV A; 1MLS A; 3KMF C; 4YU3 B; 5AZR A; 4YU4 B; 3GQP A; 4VHB A; 3G4W A; 3ASE A; 1SDK B; 112M A; 1C40 B; 5C6E A; 1Y0C B; 4MQC A; 3WCT C; 2G0Z A; 1NXF A; 1Y0T B; 4M4B B; 1YDZ B; 1GLI A; 3OO4 B; 1LFY A; 4G1V A; 3ARK A; 2O5B X; 1LA6 B; 4O4Z A; 3GQG A; 1QXE A; 1O1J B; 2ZS0 D; 3WCV C; 3IXF A; 3G4U A; 3A5B A; 1C7D A; 1CH4 A; 3LB1 A; 5CHQ A; 3QM5 A; 3HF4 B; 1JY7 B; 1MYI A; 1HLB A; 1YHE B; 2OH8 A; 1EBT A; 1SI4 B; 1YVT B; 3VAU A; 1YCB A; 1XXT A; 1MOD A; 3GLN A; 5ILP A; 2EF2 A; 1N9H A; 1DKE A; 1O1M A; 1ECA A; 1LFL A; 3MVC A; 1BZZ B; 1XZ2 A; 2W6V A; 3BOM A; 2D2N C; 1JP9 A; 1Y5J A; 3E55 A; 1YE0 A; 1GBV B; 3HEP A; 1SPG A; 2V1I A; 1Y4Q B; 3QJE B; 1Y0A B; 3V2Z A; 3CY5 B; 4U8U B; 3D1A A; 2MGM A; 2HBF B; 1LFT A; 5CNB A; 1GVH A; 1Y35 A; 2DN1 A; 1M9P B; 1Y4B A; 2GTL B; 1YEQ B; 1A3O A; 1J52 A; 1DM1 A; 3E4N A; 4B3W A; 4UIQ A; 3PIA B; 3UHS A; 4YU4 A; 1J7W A; 1C40 A; 1JF4 A; 1HAC B; 1Y0C A; 1EBC A; 1HDS A; 6HBI A; 1Y8W B; 1Y7Z B; 1O1O B; 4MQI B; 1MYZ A; 1XY0 A; 2D2M B; 1A6G A; 3QM9 A; 3B75 A; 1JEB B; 4O2G A; 1LA6 A; 5HLU A; 3M3B A; 1O1J A; 1LHT A; 3HEN A; 3UH5 A; 2D5Z B; 1YH9 A; 4WJG A; 1BZ1 B; 1MLH A; 3WCW B; 1YVT A; 1SI4 A; 1QSI B; 1CP0 A; 1NS6 B; 2W6W A; 1OUU B; 3KUN A; 3TLD A; 2ZLW B; 1NPG A; 1K1K B; 3EOK B; 1BZ0 A; 4FC3 B; 1GDL A; 3ECZ A; 1VXD A; 1HGA A; 1I3E A; 2GRH A; 1YGD B; 1ABW B; 2EB9 A; 1Y0W A; 4MQK B; 2QSS B; 1NZ2 A; 3ZJH A; 1N9I A; 1Y4Q A; 3M39 A; 1BBB A; 1JF3 A; 1UIW A; 3SDH A; 1G9V B; 1VXB A; 3CY5 A; 4X0L A; 1WLA A; 4U8U A; 2DN3 B; 2HBF A; 5D5R A; 3PT7 B; 1M9P A; 3NG6 A; 1MCY A; 1A9W E; 4NK2 A; 2W72 B; 1CIK A; 1O1K B; 1MDN A; 3BCQ B; 4ZVB A; 1MLF A; 3S1J A; 3MJU A; 3LB4 A; 1S5Y A; 3UHU A; 1IT2 A; 2AA1 B; 3M3A A; 5MBN A; 3K9Z A; 3OO5 B; 3ONZ B; 1O16 A; 1Y22 B; 1X9F B; 1Y8W A; 1V07 A; 4ROM B; 4MQI A; 1MNH A; 2V1E A; 2D2M A; 3UHX A; 1VRF A; 1Y4G A; 2ZT3 A; 1JEB A; 2M6Z B; 1O1P B; 2C0K A; 2D5Z A; 1QPW B; 3WHM B; 1MBI A; 3NL7 B; 1HBB B; 1BZ1 A; 3D1K B; 1Y01 B; 1YFF B; 4F6G A; 2SPO A; 3LB2 A; 4TWV A; 2ZFO A; 5KDQ A; 1BJE A; 3UHZ A; 5CNC A; 2QMB B; 1NS6 A; 1Y5K B; 1OUU A; 5JDO D; 1LH2 A; 2ZT4 A; 1K1K A; 1FDH G; 4H2L B; 2MYA A; 3VRE B; 2EVK A; 1YGF B; 3EDB A; 3W4U B; 3E5I A; 1NQP A; 1Y09 B; 2MGF A; 3QJB A; 3UHH A; 3AG0 A; 4MQK A; 2QSS A; 3WCU C; 4DC7 A; 2ZSN A; 4H07 A; 2R1H A; 1B0B A; 1G9V A; 3MYM A; 2OH9 A; 4FH6 A; 4U8U D; 1YG5 A; 2ZLU B; 2GKN A; 2DN3 A; 1DUO A; 3PT7 A; 2GTL D; 1MLR A; 1VXE A; 4QAU A; 2W72 A; 1O1K A; 1OBM A; 3BCQ A; 3ARJ A; 2MYE A; 1V5H A; 5ILR A; 108M A; 1VWT A; 3OO5 A; 2W6Y A; 3UGY A; 3ONZ A; 3WR1 A; 1Y22 A; 1X9F A; 2FAL A; 3S65 A; 1CO8 A; 1DWT A; 3PI9 B; 4ROM A; 2D2M D; 2ZSP A; 2BMM A; 2ZS1 B; 3BJ2 B; 1O1N B; 1SWM A; 2MGB A; 2M6Z A; 1O1P A; 1YIE A; 1CQ2 A; 7HBI A; 1M6M A; 1QPW A; 3WHM A; 3PI4 A; 1HBB A; 2ZS0 B; 1URY A; 1NAZ A; 1J3Z B; 3WCW D; 1LFZ B; 2H8F A; 3WFT A; 1J3Y B; 1MWC A; 2HZ2 A; 3FH9 A; 1IBE B; 4UZV A; 2QMB A; 1NZ5 A; 1CG5 A; 1BVC A; 1UVX A; 4H2L A; 3VRE A; 1YMC A; 1A0U B; 3W4U A; 1MLQ A; 4HRR A; 1Y09 A; 5HY8 B; 3ZJP A; 1Y2Z B; 2VYW A; 1XZ4 B; 1NZ3 A; 5CN6 A; 1C7C B; 2LH7 A; 2HHE B; 2YRS B; 1Y7C A; 2O5L X; 4PQB A; 5CN5 A; 2V1G A; 3OJ1 A; 1JWN A; 4NXC A; 1YEU B; 1LH5 A; 2BWH A; 2MYC A; 1GCV B; 1LH7 A; 3UHN A; 2HHD B; 110M A; 4IT8 A; 107M A; 4ESA B; 4MPM A; 3LR7 A; 1Y5F B; 1JP8 A; 3SDN A; 1X9F D; 3A59 B; 4MQC B; 1GLI B; 1S5X B; 2ZS1 A; 3BJ2 A; 1LFY B; 1D8U A; 1O1N A; 2BW9 M; 4L7Y A; 1LHS A; 1MNJ A; 3H57 A; 3DR9 A; 1QXE B; 1U7S A; 1MLG A; 2ZSQ A; 1J3Z A; 4F6J A; 3WTG A; 3CIU A; 1LFZ A; 1IBE A; 5CNE A; 1HGB A; 1HLM A; 1FAW B; 1A4F B; 2QU0 B; 1IOP A; 4M4A A; 4MQG B; 2GRZ A; 2SPM A; 1AJ9 B; 1DO1 A; 1XXT B; 3MOU A; 1JP6 A; 2ZSY A; 1A0U A; 2ZT2 A; 3GKT A; 1XCH A; 3ZJI A; 1O1M B; 2G0R A; 1Y2Z A; 1XZ4 A; 3K3U A; 1GDK A; 1XZ2 B; 2W6V B; 4AVD A; 1C7C A; 1CBL A; 1DWR A; 2YRS A; 3WI8 A; 3UHK A; 2ZSR A; 1HHO A; 1SPG B; 1URV A; 2AV0 A; 1MWD A; 5EE4 D; 4N7N B; 1FSL A; 3QM8 A; 1YEU A; 1HDB A; 5CMV A; 1QSH B; 1JL6 A; 4MXK A; 3G4V A; 1GCV A; 1GZX A; 3AQ8 A; 2DN1 B; 2HBE B; 3MYN A; 2V1K A; 2ZLT A; 3ZJN A; 5EYJ A; 4ESA A; 1Y4R A; 2EVP A; 3UHD A; 1AJH A; 1Y5F A; 1J7W B; 3AT6 A; 2XKI A; 2ZT1 A; 5CN4 A; 1QXD B; 3A59 A; 1V4X B; 2ZSS A; 3UGZ A; 1OUT B; 1GBU A; 2O5T X; 1GJN A; 1HDS B; 111M A; 3ECL A; 1Y46 B; 3A5G A; 1NEJ B; 3IC2 B; 4FWX A; 2ZS1 D; 2NSR A; 1S5X A; 1XY0 B; 4HBI A; 1YZI A; 3R0G A; 1V4W A; 3B75 B; 3V2V A; 5ILM A; 5JOM A; 1G09 B; 3EDA A; 1YH9 B; 2ZSX A; 1UX8 A; 2MGD A; 2ZLV A; 1K0Y A; 3UHW A; 1LFQ A; 3HRW A; 1HBH B; 2GKM A; 1UX9 A; 1MOH A; 3G4R A; 1FAW A; 1Y31 A; 5AZQ A; 1A4F A; 2QU0 A; 1YOG A; 6HBW A; 4MQG A; 1VHB A; 1AJ9 A; 1J7Y A; 2BLH A; 1G0A A; 106M A; 1HGC A; 2G14 A; 1YMB A; 4F6I A; 1BZ0 B; 1A3N A; 2IG3 A; 3WFX A; 1C7B A; 4TWU A; 4NI0 B; 1DO7 A; 2HHB B; 1HGA B; 1LFV A; 2ZLX B; 4F6D A; 1Y4P B; 1F5O A; 1RSE A; 1H1X A; 1Y0W B; 1JZM A; 1BBB B; 1UIW B; 1H97 A; 4N7N A; 4ODC B; 4X0L B; 4DWU A; 1A6K A; 4F4O B; 4HRT B; 1QSH A; 5MBA A; 2OHA A; 1UMO A; 1YHU B; 2HBE A; 3NG6 B; 1CQX A; 3ZOL A; 4C0N A; 4N7O B; 3MKB A; 5JDO C; 2RAO A; 1QI8 B; 3MJU B; 3BA2 A; 1S5Y B; 1N9F A; 2D5X B; 1QXD A; 1V4X A; 1OUT A; 3UHY A; 1O1I B; 2O5S X; 1Y46 A; 4F6B A; 1NEJ A; 1R1Y A; 3IC2 A; 2AUP A; 1ECN A; 1ABS A; 4HHB A; 1ECO A; 5JGG B; 3UBC A; 1THB B; 1Y4G B; 3QJC B; 1KR7 A; 2VYY A; 1G09 A; 2HZ3 A; 3QM7 A; 4N8T A; 1DXC A; 4KMW A; 1IWH B; 3PI8 B; 1OJ6 A; 1LUE A; 4U8U C; 3ZJM A; 1IRD B; 1HBH A; 1CH3 A; 1VXA A; 2AUQ A; 1G0B B; 3WFU A; 2GTL C; 1XQ5 B; 2ZFO B; 5KDQ B; 2O58 X; 2MGC A; 2CMM A; 2VLZ A; 2MGG A; 3LQD A; 2W31 A; 3RJ6 A; 1HBR A; 3ODQ B; 1U7R A; 1MLJ A; 3UHB A; 1NQP B; 4NI0 A; 3RJN B; 3QJB B; 2HHB A; 1XZ7 A; 3EU1 B; 1RPS A; 2ZLX A; 4XDI A; 1GCW A; 2H8D A; 1Y4P A; 4O35 A; 2QRW A; 2D2M C; 3QJD A; 5EV5 A; 1XZV A; 1KD2 B; 3H58 A; 2LHB A; 3UHQ A; 1MBS A; 2R50 A; 2R1H B; 1MTI A; 2BLI A; 4ODC A; 3ZJS A; 4F4O A; 1YG5 B; 4HRT A; 3WCW C; 3D17 B; 3VRF B; 1YHU A; 4OF9 A; 3R5I A; 3D7O A; 2QFN A; 3GOU B; 3S1I A; 4N7O A; 5M3S A; 1QI8 A; 3UHR A; 1S61 A; 2D5X A; 1BZR A; 1VWT B; 1O1I A; 3UHE A; 2HBG A; 3WR1 B; 4G51 A; 3S65 B; 5HLX A; 1Y7G B; 5JGG A; 1THB A; 3QJC A; 1F63 A; 1YIE B; 2D60 B; 4FH7 A; 3ZJL A; 2G0V A; 4N7P A; 3KUO A; 1IWH A; 3PI8 A; 2GNW A; 1IRD A; 2BKM A; 1G0B A; 2OHB A; 2V1J A; 3QZX A; 1DUK A; 1XQ5 A; 2H8F B; 2W72 C; 1IDR A; 3FH9 B; 3G4Y A; 1NWI A; 2GDM A; 1LH6 A; 5B85 A; 1CG5 B; 1YIH A; 3MJP B; 1CP5 A; 1WMU B; 5CN9 A; 3ODQ A; 1MWB A; 2R4X A; 4HRR B; 1YEO B; 1X9F C; 4HSW A; 3EU1 A; 1JPB A; 1Y8K A; 2WY4 A; 2E2Y A; 1Y83 B; 1MYH A; 2HBD B; 1DXU B; 4JYQ A; 4MAX A; 1L2K A; 3SZK B; 3UI0 A; 1YCA A; 1V4U B; 1KD2 A; 1Y7C B; 2ZSZ A; 2WTH A; 1F5P A; 3G46 A; 1KFR A; 1HAB B; 2MHB B; 1YHU D; 4F69 A; 3D17 A; 3VRF A; 1CH2 A; 2FRI X; 1HJT A; 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2HBS B; 1Y4R B; 1MLN A; 1DO4 A; 2HCO A; 3UHC A; 3PI3 A; 1AZI A; 3HXN B; 3AT6 B; 2R4Y A; 1GBU B; 1COH A; 3ZHW A; 2EB8 A; 1CMY B; 2MGL A; 1NPF A; 2BK9 A; 1DXT A; 3WCP A; 1YZI B; 1V4W B; 3FS4 A; 2QLS A; 1J40 B; 2HBC A; 1NGK A; 1O1L A; 1V9Q A; 2ZLV B; 1K0Y B; 3NMM A; 1LFQ B; 2B7H A; 3HRW B; 1T1N A; 5JDO F; 3ZJR A; 1OR6 A; 1YOI A; 1Y31 B; 4F6F A; 6HBW B; 2EKU A; 1S69 A; 1J7Y B; 1HBA A; 4MBN A; 1G0A B; 1R1X A; 4ROL A; 1HGC B; 1UC3 A; 1A3N B; 1SHR B; 3IC0 B; 1C7B B; 2QSP A; 1JL7 A; 1XZ5 A; 1LFV B; 1YEV A; 3S66 A; 3GYS A; 3D4X A; 1MBA A; 1NS9 A; 1FHJ A; 5CNG A; 3DHR A; 2VLY A; 3QZZ A; 1DLW A; 1MNK A; 1BZ6 A; 1RQ3 A; 1HV4 A; 1RVW A; 3GKV B; 1CH7 A; 3WCT B; 3G4Q A; 2SPN A; 4GZG A; 1VRE A; 2G3H A; 2LH1 A; 1B86 A; 4MBA A; 109M A; 3MKB B; 2RAO B; 2HBS A; 3WCV B; 1CH9 A; 3ZJJ A; 3HXN A; 3HC9 A; 3HYU B; 3AT5 B; 2AV3 A; 1X3K A; 1CMY A; 1R1Y B; 1UFP A; 4HHB B; 3MBA A; 102M A; 2V1F A; 1OR4 A; 4WJG 1; 1UVY A; 1J40 A; 4N8T B; 2MGK A; 5CNF A; 5CN8 A; 4UUR A; 2D2N B; 4O4T A; 1Y4F A; 3LR9 A; 1CLS B; 3ZJO A; 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