The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGKVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| publication title |
Genetically crosslinked hemoglobin: a structural study.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YH9 B; 5CHQ A; 1V4U B; 5B85 A; 1Y01 B; 1GZX B; 3ZJH A; 1CH5 A; 2V1H A; 2MYA A; 3WFW A; 1X3K A; 3PT7 A; 1AZI A; 5EUI B; 3LR7 A; 3QZZ A; 2ZS0 B; 3G4R A; 4F6B A; 1Z8U B; 4PQC A; 1K0Y A; 1TU9 A; 2ZSR A; 2D5Z A; 3H58 A; 1EBT A; 1I3D A; 2BMM A; 1MGN A; 7HBI A; 3KMF A; 2ZLU A; 1EBC A; 3A9M A; 1G0A B; 4U8U D; 2G14 A; 1IRD B; 1JEB B; 3PIA B; 1HRM A; 1O1J A; 1NEJ A; 3UBV A; 3WCT B; 3A5B A; 1Y45 B; 3GQR B; 4G51 B; 1BZ0 B; 3SDH A; 2EB9 A; 1V07 A; 3VRG A; 2ZFO D; 2W72 A; 3B75 A; 1C7B A; 3O7N A; 4GZG A; 1BBB B; 1CH3 A; 1KR7 A; 1MLH A; 1LFZ B; 1BIN A; 1Y4F A; 1HBR A; 4MXL A; 4N7P A; 1CP0 A; 1GLI A; 1RPS A; 2EKU A; 1XCH A; 3PI2 A; 4FH6 A; 3ZJM A; 4B4Y A; 4NXC A; 1Y5K A; 3GQP A; 3QM7 A; 1MLL A; 1FCS A; 1B86 B; 1YVT B; 1Y8I A; 1LUE A; 1FDH A; 1NZ2 A; 5JDO F; 2Z6N B; 3WCU D; 1YHU D; 1A0Z A; 1BVC A; 2D2M D; 2QLS B; 1A01 A; 3OO5 A; 2ZSO A; 2AV3 A; 1O1O B; 3MOU A; 3BJ2 A; 2MGF A; 4MQC A; 4KJT A; 1NZ3 A; 1MKO B; 2W6W A; 1YMC A; 1LA6 A; 1L2K A; 1BAB B; 3UHW A; 3BJ1 A; 3HEO A; 1HAB B; 2G0V A; 3UHD A; 1X46 A; 1XZ2 B; 2ZT1 A; 1O1N A; 1X9F B; 4HRR A; 3ZJP A; 3M38 A; 3MKB B; 2YRS A; 1XY0 B; 1B0B A; 2MYC A; 1MDN A; 5F0B A; 5HLX A; 2OLP A; 1EMY A; 3ZOM A; 1J7S B; 1O1K A; 2FAM A; 4HHB B; 1Y7Z A; 1VXG A; 1JY7 B; 1PBX A; 3OK5 A; 1UC3 A; 3NL7 B; 2R80 B; 2HBE A; 5CHR A; 3G4Y A; 3ZJL A; 1HAC B; 4G1V A; 2MBW A; 1A00 A; 3ODQ A; 1V9Q A; 1IDR A; 1YG5 B; 1ECN A; 1YIE A; 3AQ5 A; 1RSE A; 2V1F A; 1UIW B; 1A3N B; 1Y0W A; 1YCB A; 3OGB A; 1IBE B; 4X0L A; 1LFV B; 1CMY A; 1LHS A; 1S69 A; 3D17 A; 3SZK B; 4MPM A; 2VYW A; 1QXD B; 3PEL B; 2EF2 A; 1CP5 A; 3QJB A; 3UGZ A; 2O5T X; 1JDO A; 1RQ4 A; 5KDQ B; 4L7Y B; 2GTL D; 2WY4 A; 3DUT A; 2QFK A; 1JF4 A; 1R1Y A; 3V2V A; 4WCH D; 1FSX B; 2HBD B; 1Y83 B; 2ZS0 D; 1MLJ A; 1FLP A; 3KUO A; 2AV0 A; 3QZX A; 1YGF B; 1YGD B; 3FH9 B; 3NMM B; 3S65 B; 1V5H A; 2ZFB A; 1VXB A; 5E83 A; 5IKS A; 1GJN A; 3DHR B; 1OR6 A; 3HYU A; 4SDH A; 1K1K A; 2OHB A; 1RQA B; 2FRI X; 3D7O B; 3AT6 A; 4L2M A; 4MBN A; 4XDI A; 3WCP A; 1MBN A; 2H8D A; 1Y7C A; 2MHB B; 4YU4 B; 2NX0 A; 3P5Q A; 1UVY A; 2HBF B; 1KD2 A; 4NXA A; 1LFY A; 2QSP A; 2H8F A; 3AQ7 A; 1CQ2 A; 1QXE A; 5MBA A; 3EU1 B; 1T1N A; 4PNJ A; 2HHB B; 1YIH A; 1AJG A; 4ZVB A; 5EET A; 1ITH A; 2HBC B; 2QSS B; 2QU0 A; 4ESA B; 1DXC A; 1YFF A; 1Y35 B; 1AJ9 A; 1A0U B; 1BIJ B; 5CN8 A; 2SPL A; 2E2Y A; 4F6G A; 1IBE A; 1NS9 B; 1HBH A; 4F6J A; 1Y4G A; 1RTX A; 1J3Z A; 2ZT3 A; 1Y4Q A; 2ZS1 A; 3ZOL A; 3ECL A; 2MYD A; 3EOK A; 5CN6 A; 1V4W A; 1FHJ B; 3MJP B; 5E29 B; 5HY8 A; 3UI0 A; 1LH7 A; 3WHM B; 2OIF A; 4MAX A; 4U8U B; 1DLY A; 3WCV C; 3GQG B; 2MGK A; 3BOM A; 1DWR A; 3K8B A; 5JGG A; 2O5B X; 5JDO E; 2D6C A; 1A9W A; 3CIU B; 3OZU A; 1OBM A; 1C40 A; 1S5Y B; 1YVQ B; 4NI0 B; 4H2L A; 3LB4 A; 1C7D A; 3M3A A; 4MQH B; 1QI8 B; 4OF9 A; 2ZFO B; 1DXV A; 1J7W B; 2AUO A; 1HGA B; 2LH6 A; 1V75 A; 4FC3 B; 4VHB A; 3OVU C; 1PMB A; 1J40 A; 1RVW A; 4NI1 B; 3PI8 B; 1XZ7 A; 1Y4B B; 1CH7 A; 3E5O A; 2XKH A; 4YU3 B; 1DXU B; 2OH9 A; 4ROM A; 3S66 A; 4AVE A; 1U7R A; 3IA3 B; 2D2N D; 2G10 A; 1XXT B; 2MHB A; 2ZSS A; 2FRK X; 1THB B; 3HXN B; 1FAW B; 3WCU B; 4N7N A; 1YHU B; 1Y8K A; 1CG8 B; 2PGH A; 3D1K A; 1Y4R B; 1NPF A; 3W4U B; 5EV5 A; 3EU1 A; 3GDJ A; 1S5X A; 2HHB A; 2D5X B; 3GK9 A; 2VLZ A; 1CO9 A; 2QRW A; 1Y7D B; 3QJC A; 1O1P B; 5JDO C; 1SPG B; 1NIH B; 2AA1 A; 1XZU B; 3IC0 B; 4UUR A; 4MQK A; 1JZM A; 1ECA A; 1VXF A; 2MGH A; 1QPW B; 3QM5 A; 2LH3 A; 2BKM A; 3R0G A; 2ZLV A; 1NXF A; 1M6C A; 3M39 A; 2EKT A; 5AB8 A; 2GRH A; 1Y31 B; 2DN3 A; 1I3E A; 1URV A; 2XKG A; 1SDK A; 4F69 A; 2DHB B; 2MGB A; 2W6V B; 4MQH A; 2V1K A; 4NZI A; 5HU6 A; 1YEV A; 104M A; 1J7W A; 4MQJ A; 2HCO B; 3A0G A; 3BCQ A; 1XZ4 B; 4FC3 A; 2G0Z A; 3WCT C; 1Y85 A; 1MLO A; 2ZLT B; 2O5L X; 3ONZ B; 4IRO B; 3ZJS A; 1XZV B; 1RTE A; 3NG6 B; 1YEQ B; 2W6X A; 1LH1 A; 1C7C B; 3LQD A; 1DTM A; 1COH A; 1V4X B; 3WCW D; 1GBU A; 1YE0 A; 1XYE A; 3D4X B; 1NGK A; 1F63 A; 4AVD A; 1G09 A; 3QM8 A; 1J7Y A; 5HAV A; 1UT0 A; 2DXM A; 1RQ3 B; 2D60 B; 3HC9 A; 4N8T B; 3UH7 A; 1ECO A; 5C6E B; 1YHU A; 1CPW A; 1CG5 B; 1UMO A; 1WVP A; 1Y0C A; 2D2M A; 1GBV A; 1J3Y A; 2GTL B; 2M6Z A; 1Y09 A; 2HBS A; 1F5P A; 2SPO A; 1DKE B; 3PI4 A; 1DO3 A; 5SW7 A; 3WCV A; 2HBG A; 1D8U A; 3VRF A; 3ARK A; 3IXF A; 1YEO A; 4M4A B; 1MLF A; 2GRZ A; 1ASH A; 1DM1 A; 1F65 A; 1HSY A; 3UHU A; 2MGA A; 5AZQ A; 2BK9 A; 1G0B B; 3VAU A; 2MYB A; 4BJA A; 1MOA A; 1Y22 B; 3UHG A; 3E55 A; 4O35 A; 1HGB B; 1URY A; 4M4B B; 103M A; 1Y8W B; 2PEG B; 3LB3 A; 5EOH A; 3HHB B; 2GNW A; 2W6Y A; 2GRF A; 5E6E B; 3UHZ A; 1YE2 B; 1X9F C; 4UZV A; 1YEU A; 3G46 A; 1J41 B; 2HHD A; 3GKV B; 1HHO A; 1HBB A; 3VHB A; 3UHK A; 1BZ6 A; 3GYS B; 1YEN A; 3GKT A; 1CBM A; 3AQ8 A; 2R1H A; 1A9W E; 2V1E A; 1A4F B; 1LJW B; 3IC2 A; 4WJG A; 4MQG B; 1M9P B; 2DC3 A; 2RI4 B; 1UFJ A; 3TM9 A; 2V1J A; 1UFP A; 3GOU A; 2GKN A; 5CN9 A; 112M A; 1YDZ B; 1GCV B; 1Y46 B; 2GLN A; 1NZ4 A; 1IRC A; 1QSH A; 4ROL B; 2B7H B; 3QQR A; 1RQ3 A; 3HEN A; 1VWT B; 4ODC B; 3UHQ A; 1IWH A; 2HZ3 A; 1JZL A; 1YH9 A; 4FWZ A; 3UHE A; 1MWD A; 1V4U A; 108M A; 4TYX A; 3R5I B; 1GZX A; 1CIK A; 1YZI B; 3PI9 B; 2R50 A; 3O89 A; 3UH3 A; 1CH9 A; 3WR1 B; 1G9V B; 2ZS1 C; 3WTG B; 1HBS B; 2QFN A; 3WI8 A; 2BNL A; 3WFT A; 5EUI A; 2ZS0 A; 1WMU B; 1Y0D B; 3A59 B; 3MN0 A; 2NSR A; 4TWV A; 5EYS A; 1G0B A; 4F6I A; 4PQ6 A; 1XQ5 B; 1G0A A; 1N9X A; 2NSS A; 3PI3 A; 1IRD A; 1JEB A; 1Y8H B; 1BUW B; 3NFE B; 2FRF A; 3PIA A; 3WCT A; 1Y45 A; 3ARL A; 1OFJ A; 2G0S A; 3GQR A; 4G51 A; 1BZ0 A; 2D2N B; 1MYF A; 4OOD A; 5E6E A; 2BLJ M; 4KN3 A; 2MGM A; 1A6K A; 1IT3 A; 2G11 A; 3CY5 B; 1MOH A; 6HBW B; 2G12 A; 1BBB A; 3ZJQ A; 1LFZ A; 101M A; 3UHX A; 1ABY B; 2ZSX A; 1YHR B; 1MNK A; 3RJN B; 1CH4 A; 2VYY A; 3ZJR A; 2XKI A; 3H57 A; 1JW8 A; 4FH7 A; 1LFL B; 1B86 A; 1YVT A; 2O58 X; 2ZT0 A; 1MLM A; 1MZ0 A; 1GDK A; 2Z6N A; 3HRW B; 1HBA B; 3AQ6 A; 5CMV A; 2QLS A; 2WTG A; 4C0N A; 3K3U A; 1O1O A; 1MYG A; 1Y5J B; 1HCO B; 3UHY A; 1MTK A; 1GCW B; 1A6M A; 1LH2 A; 1LFQ B; 3DHT B; 1MKO A; 1CLS B; 2R4Z A; 1MLU A; 1BAB A; 1NZ5 A; 2BWH A; 1Y4P B; 1HAB A; 2DN1 B; 2VLX A; 1XZ2 A; 3E4N A; 3QQQ A; 2R4Y A; 1VRF A; 1ABW B; 1X9F A; 1MYI A; 1VRE A; 3MKB A; 4U8U C; 2SPM A; 4UIQ A; 1BZZ B; 1XY0 A; 3RJ6 A; 2FRJ X; 2EVP A; 2VHB A; 1DXT B; 1NS6 B; 1J7S A; 4HHB A; 2DN2 B; 3WCW B; 2ZFO C; 1BJE A; 2D2N A; 1LTW A; 1Y5F B; 1JY7 A; 5EE4 C; 2RAO B; 3M3B A; 3NL7 A; 2R80 A; 1IT2 A; 2BW9 M; 2LH1 A; 1CBL A; 2LH2 A; 1HAC A; 1DWT A; 5F2A A; 2ZSP A; 1YG5 A; 3WFU A; 1IOP A; 3QJD B; 1HDA B; 1S56 A; 1UIW A; 1A3N A; 4HRT B; 1NQP B; 1S0H B; 4XS0 B; 1FDH G; 1LFV A; 3WCU C; 3D1A B; 5M3S A; 1YHU C; 3QM6 A; 3SZK A; 1Y0A B; 2D2M C; 3MYN A; 2ZT4 A; 1XZ5 B; 1QXD A; 3PEL A; 4N7O B; 4O1T A; 3LHB A; 2MGD A; 3HRW A; 2GNV A; 5EQM A; 5KDQ A; 3FS4 B; 4L7Y A; 1Y5J A; 5KER B; 1NWI A; 1FN3 B; 1LFQ A; 1O1I B; 1SDL B; 1FSX A; 2HBD A; 1Y83 A; 1NWN A; 1OJ6 A; 1MNH A; 1OUU B; 2Z6S A; 1VXD A; 3OO4 B; 4ZVA A; 1MBO A; 1YGF A; 2NRM A; 3AT5 B; 1YGD A; 3FH9 A; 3NMM A; 3S65 A; 3BJ3 B; 2ZSQ A; 3UHS A; 1MBS A; 1QSI B; 1A3O B; 3DHR A; 1MWC A; 1LFT B; 1DO1 A; 4FWY A; 1VXA A; 1RQA A; 1NS6 A; 1Y2Z B; 3D7O A; 3UHC A; 1VXH A; 4O4Z A; 1HBI A; 1VXE A; 2ZLX B; 4YU4 A; 1HDS B; 1J52 A; 2HBF A; 1MLN A; 1BZ1 B; 1Y4V B; 3PT8 B; 1Y7G B; 1O1L B; 2VYZ A; 3G53 A; 4MQI B; 1HV4 B; 1M6M A; 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1MLR A; 1Y7D A; 3LR9 A; 2AUQ A; 4MQC B; 1O1P A; 1SPG A; 2LHB A; 1NIH A; 2ZST A; 1LA6 B; 1XZU A; 3IC0 A; 3BJ1 B; 1UX9 A; 2FAL A; 5HLQ A; 1H1X A; 1N9I A; 1QPW A; 1O1N B; 2H35 A; 1DUK A; 4HRR B; 3UHH A; 1ECD A; 1MOB A; 2SPN A; 3VRE B; 2YRS B; 1LHT A; 3HEP A; 5ILM A; 3QMA A; 1YCA A; 1F5O A; 5ILP A; 1FSL A; 1Y31 A; 1O1K B; 2G0R A; 1Y7Z B; 4F4O A; 1NAZ A; 2DHB A; 2W6V A; 1MBD A; 3UHR A; 1PBX B; 1MYJ A; 2HBE B; 1R1X A; 2HCO A; 1DWS A; 1XZ4 A; 2ZLT A; 3G4W A; 3ONZ A; 4IRO A; 2D2N C; 1A00 B; 3ODQ B; 5EE4 D; 2MGI A; 1XZV A; 3NG6 A; 1YEQ A; 2OH8 A; 1C7C A; 1YIE B; 1V4X A; 1Y0W B; 1NPG A; 2MGG A; 3D4X A; 3NML A; 2GL3 A; 3UHV A; 2R4X A; 4X0L B; 1OUT A; 1CMY B; 1HDB B; 2D60 A; 4N8T A; 3AG0 A; 3D17 B; 5C6E A; 2HHE A; 2ZWJ A; 3ZJJ A; 3HF4 A; 1YMA A; 4F6D A; 4KMW A; 3G4V A; 1CG5 A; 1MBA A; 2HZ2 A; 2BLH A; 4ILZ A; 2GTL A; 3QJB B; 1JL7 A; 1DKE A; 1RQ4 B; 4O4T A; 3DUT B; 1R1Y B; 4F6F A; 3TM3 A; 3GLN A; 4LPI A; 5B84 A; 4M4A A; 2KSC A; 3WCV D; 3UH5 A; 3K9Z A; 5EU2 A; 5CND A; 3ORD A; 4HSW A; 1Y22 A; 4NK1 A; 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