The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of myoglobin-ligand complexes at near-atomic resolution.
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Heme protein
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| total genus |
67
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NWI A; 4O1T A; 1Y0C A; 5CMV A; 1BAB B; 4N7P B; 1HBH B; 3LHB A; 1ABS A; 4L7Y A; 1Y5J A; 1KR7 A; 1MNH A; 3WFT A; 3OZW A; 1YIH A; 1HDS B; 1J7S B; 3UHG A; 1YVQ B; 4TWV A; 1HBA B; 1EBT A; 1IWH B; 3ZJO A; 1Y5F A; 2HHB A; 1BIN A; 3D4X A; 4B3W A; 1YH9 A; 2ZLX B; 1KFR A; 1Y0C B; 3HC9 A; 1J3Z A; 1RVW B; 1NZ2 A; 4L7Y B; 1IRD A; 1A3O A; 1Y5J B; 1MTI A; 1Y35 A; 3NML A; 1YIH B; 1MNI A; 1BZ0 A; 2FRK X; 1GDK A; 3PT8 A; 1S0H A; 3GYS B; 5CN5 A; 1RTX A; 1QSH A; 1Y5F B; 2XKI A; 2HHB B; 1YVT A; 3D4X B; 3UHZ A; 1YH9 B; 1N9H A; 3GQG B; 4JYQ A; 3CY5 A; 5KER A; 1MBS A; 5C6Y A; 1J3Z B; 2LH2 A; 4DC7 A; 1ECN A; 2W31 A; 3ORD A; 1IRD B; 1Y35 B; 3ARL A; 2EVK A; 1XZ2 A; 1BZ0 B; 1T1N A; 1S0H B; 2G11 A; 3WCU D; 4QAU A; 1QSH B; 4MQI A; 1YVT B; 5KER B; 5KKK A; 4F6J A; 3A59 A; 3O7N A; 1MYZ A; 1NZ3 A; 1K1K B; 4KMW A; 1MLS A; 1IRC A; 2GTL B; 1XZ2 B; 4FC3 B; 1T1N B; 2BLH A; 3HXN B; 4MQI B; 1HLM A; 2ZFO C; 3G53 A; 1MCY A; 2XKH A; 3WCW A; 6HBW A; 3UGZ A; 3A59 B; 3WCT D; 2VLZ A; 3HF4 A; 4ODC A; 2MGA A; 3S1J A; 2ZS0 A; 1JDO A; 3BA2 A; 2EKU A; 1CQ2 A; 5JDO D; 1BVC A; 2RI4 A; 1VXF A; 2ZLT B; 3ZJQ A; 2WTH A; 5MBN A; 1R1X A; 3PI9 B; 1HDB A; 4MQK A; 3ZJP A; 3UHK A; 3ZHW A; 1LFZ A; 3D1A A; 3KUN A; 3WCW B; 5CHQ A; 1XY0 A; 6HBW B; 1MOB A; 5MBA A; 5E29 A; 1D8U A; 5HBI A; 103M A; 102M A; 3EDB A; 1JP6 A; 3HF4 B; 2GDM A; 101M A; 1A6M A; 1HLB A; 3E5O A; 3ECL A; 5EYS A; 2WTG A; 1RQ3 A; 1UMO A; 2RI4 B; 3OO4 A; 1WLA A; 2BLI A; 1C40 A; 1R1X B; 1FDH A; 2ZSX A; 2G12 A; 4MQK B; 1HDB B; 2B7H A; 4PQB A; 3H58 A; 1DLW A; 2ZS1 D; 3E5I A; 1LFZ B; 1WMU A; 3D1A B; 1Y8I A; 2GL3 A; 1XY0 B; 4PQ6 A; 5E29 B; 1CPW A; 1FAW A; 2OH8 A; 1J3Y A; 2LH3 A; 1FCS A; 3S66 A; 1YHU A; 1RQ3 B; 1QPW A; 1COH A; 3OO4 B; 1C40 B; 2GLN A; 1HBS A; 2HBE A; 2B7H B; 1Y0A A; 1TES A; 1BVD A; 1S61 A; 1O1N A; 3UHE A; 2ZLV A; 1Y8I B; 2DN3 A; 2YRS A; 2FAL A; 5EQM A; 3CIU A; 1FAW B; 3G4U A; 3G4V A; 3DHT A; 4N7N A; 2D2M D; 1MOH A; 1GBV A; 1FHJ A; 1YHU B; 1MOC A; 1Y5K A; 5M3S A; 2O5L X; 1JZL A; 1COH B; 1MYH A; 1GCW A; 3OVU C; 4MQJ A; 1WVP A; 1DKE A; 1G09 B; 1HBS B; 2HBE B; 1QXD A; 1VXD A; 4U8U A; 3MJU A; 1O1N B; 2ZLV B; 1Y31 B; 3M3A A; 2O5S X; 1W92 A; 2DN3 B; 2YRS B; 3OZV A; 3TM9 A; 1J7Y A; 4ILZ A; 5EYJ A; 107M A; 1A6G A; 3ECX A; 1G08 B; 1HBR A; 3DHT B; 4N7N B; 2QFK A; 1XZ5 A; 3GKV B; 2ZLW A; 1MLK A; 1Y5K B; 1NWN A; 3IC2 A; 1O1L A; 4MQJ B; 3UHX A; 5HLX A; 1DKE B; 1UFJ A; 2FRI X; 1QXD B; 2O58 X; 1JZM A; 1Y4B A; 2G0Z A; 4U8U B; 2QSP A; 3MJU B; 4O35 A; 1UIW A; 1J40 B; 1J7Y B; 3ZOL A; 2ZT4 A; 3RGK A; 4G1V A; 1HBR B; 1DWR A; 3BCQ A; 1XZ5 B; 1YGD A; 3E55 A; 1O1I A; 2VRY A; 2HBC A; 2ZLW B; 4HRT B; 1S69 A; 4BJA A; 3IC2 B; 1O16 A; 3UHR A; 3A5G A; 3G4W A; 3ODQ A; 1O1L B; 5JDO E; 1A01 B; 3VRE A; 1Y4B B; 4MQG A; 1SHR A; 1YCB A; 2QSP B; 2HBS A; 1UIW B; 3V2Z A; 1VHB A; 4TYX A; 3UGY A; 4UIQ A; 1OUT A; 4FH6 A; 1HJT A; 1X46 A; 4MQC A; 1XQ5 A; 3BCQ B; 2DN1 A; 1DO3 A; 1NXF A; 1YGD B; 2ZS0 C; 1O1I B; 2HBC B; 3TM3 A; 1X9F A; 2QMB A; 3ODQ B; 1MOA A; 1DWT A; 4HBI A; 1UX9 A; 3VRE B; 4MQG B; 1MOD A; 1SHR B; 3WCT C; 2HBS B; 2HHD A; 1NS9 A; 1Y0W A; 1YEQ A; 2MGC A; 3HHB A; 1DM1 A; 1OUT B; 3GK9 A; 4MQC B; 5JDO C; 2CMM A; 1XQ5 B; 2DN1 B; 1HAC B; 2OLP A; 1YHR A; 4WCH D; 1X9F B; 2QMB B; 1GDI A; 2AUO A; 5D1V A; 2C0K A; 4ZVB A; 1NAZ A; 3OJ1 A; 3M39 A; 1FDH G; 1O1J A; 1Y4R A; 2HZ2 A; 1ECA A; 2GNV A; 1MLM A; 3E4N A; 3ZOM A; 3WCP A; 1NS9 B; 1Y0W B; 3WTG A; 2ZFO D; 1F5O A; 1YEQ B; 1V4X A; 1Q1F A; 4HSX A; 3HRW A; 2MYD A; 3QZX A; 2E2Y A; 3MBA A; 2DXM A; 3BJ3 A; 1YOH A; 3WR1 A; 2BW9 M; 1YHR B; 1MBD A; 1CIO A; 1MLG A; 4FWZ A; 1YHU C; 1HGC A; 1XYE A; 1F63 A; 2BNL A; 1BZP A; 1O1J B; 1Y4R B; 1OFJ A; 4XDI A; 2G0V A; 3A0G A; 1BIJ A; 1A3N A; 1UVY A; 2VLX A; 3HRW B; 2DXM B; 3BJ3 B; 1EMY A; 3WR1 B; 1Y4Q A; 3D7O A; 3G4Q A; 3LQD A; 3UHI A; 1HDA A; 1OBM A; 4F6F A; 5CHR A; 1QI8 A; 1DO4 A; 1HGC B; 1JY7 A; 5C6E A; 1HBB A; 1XYE B; 1HAB A; 3QJE A; 1CG8 A; 1A6N A; 3QMA A; 3SZK A; 3D1K A; 4U8U C; 1G0B A; 1LH3 A; 2GNW A; 3MOU A; 2D2M C; 3A0G B; 3U3E A; 1BIJ B; 1A3N B; 1URY A; 2ZSN A; 1FLP A; 1Y4Q B; 3LQD B; 1TU9 A; 1HDA B; 4FH7 A; 1QI8 B; 2ZWJ A; 1JY7 B; 1Y45 A; 3IXF A; 1HBB B; 4G51 A; 1HAB B; 1XZV A; 2ZSQ A; 3UH6 A; 2VM0 A; 1VWT A; 3FH9 A; 3SZK B; 3D1K B; 1G0B B; 3DUT B; 3PI4 A; 4MBN A; 2G0X A; 2O5B X; 2WY4 A; 4NK1 A; 3MJP A; 3K3U A; 1RVW A; 4H07 A; 1OUU B; 4UZV A; 5CNB A; 1EWA A; 1IOP A; 4XS0 A; 1RTE A; 1Y45 B; 3GYS A; 4G51 B; 1XZV B; 1YMC A; 1NEJ A; 5CNC A; 1VXB A; 1VWT B; 1YGF A; 1Z8U B; 3V2V A; 1Y01 B; 3FH9 B; 3G4R A; 3GKT A; 3ZJH A; 3GQG A; 3WCV A; 3MJP B; 1LUE A; 1DTM A; 1MLJ A; 2NRM A; 3NMM A; 1GZX A; 1QXE A; 1MWC A; 1NPG A; 3ZJS A; 4IT8 A; 1IBE A; 5HLQ A; 4XS0 B; 1VXH A; 2MGL A; 1F5P A; 3OK5 A; 3UHN A; 1JEB A; 2EF2 A; 1F65 A; 2V1H A; 1NEJ B; 1YGF B; 2VYZ A; 3WFU A; 3WCV B; 3ZJR A; 1NQP A; 1LFL A; 3NMM B; 1GZX B; 1DXC A; 1QXE B; 3QM6 A; 4MQH B; 1K1K A; 2SPM A; 1GVH A; 1IBE B; 2GTL A; 3VRG A; 3D17 A; 3A5B A; 1CH2 A; 5EOH A; 4FWY A; 4FC3 A; 3QQR A; 1HBG A; 1A6K A; 1JEB B; 3HXN A; 4VHB A; 1A0Z B; 1N9F A; 1ECO A; 1MWD A; 1NQP B; 1YMA A; 1CMY A; 1LFL B; 4AVE A; 2HBG A; 1SDL A; 5CN4 A; 4F69 A; 5EU2 A; 1V75 B; 5EE4 D; 3WCW D; 2OHB A; 4NI0 A; 5CN8 A; 3VRG B; 1K0Y A; 3IA3 B; 4GZG A; 3S1I A; 3D17 B; 1QSI A; 2HZ3 A; 1N9X A; 2MGJ A; 2ZLT A; 1XCH A; 2ZS0 D; 1MYI A; 4O4Z A; 3NG6 A; 2MGF A; 3QJD A; 4N7O A; 3PI9 A; 1V4U B; 3S65 B; 1CH1 A; 1S56 A; 5CNE A; 2ZSR A; 1GDJ A; 3A5A A; 5JGG A; 1CMY B; 1SDL B; 2MGG A; 1MKO A; 3AG0 A; 2EB8 A; 1UC3 A; 1EBC A; 4NI0 B; 5E6E B; 1K0Y B; 1Y7G A; 1QSI B; 1G0A A; 4FWX A; 4HHB A; 1UFP A; 3NG6 B; 3UBV A; 3QJD B; 4N7O B; 4ESA B; 1L2K A; 1Y7C A; 3WCU B; 5JGG B; 1MLO A; 1MKO B; 3G52 A; 1HHO A; 2HZ1 A; 1Y7G B; 1CBL A; 1G0A B; 1XZ7 A; 4HHB B; 5B84 A; 3BJ2 A; 1O1O A; 108M A; 1YHU D; 1R1Y A; 1O1P A; 4B4Y A; 1JPB A; 1Y7C B; 1BZZ B; 3KMF A; 2R4Z A; 4NS2 A; 3AQ8 A; 2V1G A; 3SDH A; 1HBI A; 1HHO B; 1DTI A; 1A00 A; 2GKN A; 1XZ7 B; 3BJ2 B; 1G09 A; 1O1O B; 3BOM A; 1MYJ A; 1R1Y B; 4X0L A; 1O1P B; 4F6D A; 1A4F A; 1Y31 A; 5CN9 A; 1MGN A; 4MU5 A; 3WCV C; 1RSE A; 4U8U D; 1MWB A; 3H57 A; 1G08 A; 1VRF A; 1BZ1 A; 1DXT A; 1THB A; 3GKV A; 1A00 B; 4F6G A; 1Y4P A; 3MYN A; 2D5X A; 2EKT A; 2QLS A; 4MAX A; 1DO1 A; 1Y22 A; 3LB4 A; 3BOM B; 4X0L B; 3QM8 A; 5CN6 A; 2AA1 A; 1A4F B; 1C7B A; 1J40 A; 1A9W A; 1FSX B; 4ZVA A; 2G14 A; 1YDZ A; 2W72 A; 3EOK B; 1YEN A; 1BZ1 B; 3MN0 A; 1CH9 A; 1DXT B; 1THB B; 1ABW A; 2AUQ A; 1BBB A; 1CO9 A; 1Y4P B; 1IDR A; 2ZSP A; 4HRT A; 1VRE A; 2GTL C; 2ZT0 A; 2D5X B; 2QLS B; 1AZI A; 4IRO B; 1Y22 B; 1HCO A; 1DWS A; 1A01 A; 1AJ9 A; 2AA1 B; 1C7B B; 2R80 A; 4PNJ A; 2QU0 B; 5HU6 A; 1GJN A; 3ONZ A; 4DWT A; 1O1M A; 1LA6 A; 3R5I A; 1YDZ B; 3QM7 A; 1SPE A; 2R50 A; 2W72 B; 1YEN B; 1RQA A; 5EUI B; 1ABW B; 1BBB B; 4M4A A; 1MDN A; 4O2G A; 3AQ6 A; 4H2L B; 3UHC A; 1LH1 A; 1HCO B; 4UUR A; 1LFY B; 1X9F D; 1AJ9 B; 1C7D A; 1J41 A; 3ZJI A; 2R80 B; 5HU6 B; 1OR6 A; 2GRF A; 3ONZ B; 1O1M B; 2JHO A; 1LA6 B; 5EE4 C; 3WCW C; 3R5I B; 1RQA B; 1MNO A; 2HCO A; 2D2N A; 1HAC A; 1VXC A; 4M4A B; 5HLU A; 5ILR A; 1HV4 B; 1VXE A; 2MYB A; 2DC3 A; 3ARK A; 3PI8 B; 1GCV A; 1M6M A; 2LH1 A; 1HGA A; 1Y2Z A; 5AZQ A; 1UVX A; 5AB8 A; 1UT0 A; 1C7D B; 1J41 B; 1JP9 A; 3S48 C; 2MHB A; 3TLD A; 2BLJ M; 1CP0 A; 105M A; 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1Y09 B; 1MLU A; 2DHB A; 2KSC A; 2R1H A; 4MQH A; 1RQ4 B; 2D2N C; 3GQP B; 5ILE A; 2H35 A; 3HYU A; 1X9F C; 3QZZ A; 2BMM A; 2GTL D; 1A0Z A; 2W6V A; 5AZR A; 2ZSY A; 1LHT A; 1Y4V A; 1LH5 A; 3NL7 B; 3NFE B; 1FN3 B; 3B75 A; 2R4X A; 2DHB B; 1V75 A; 2SPO A; 3LB3 A; 3QM9 A; 3UHQ A; 2R1H B; 2D5Z A; 2H35 B; 3HYU B; 5ILP A; 5ILM A; 1S5Y A; 2ZT1 A; 2O5M X; 3ZJJ A; 3K9Z A; 3WHM A; 2H8D A; 112M A; 1OR4 A; 1V4U A; 1BZR A; 3S65 A; 2W6V B; 1A3O B; 2O5O X; 1Y4V B; 2NX0 A; 2W6X A; 2LH6 A; 3B75 B; 3PT8 B; 1RPS A; 106M A; 2MYA A; 1N9I A; 4HRR A; 2NSS A; 3EU1 A; 2HBD A; 1MYF A; 1ASH A; 2QFN A; 2D5Z B; 5E6E A; 1BJE A; 1S5Y B; 3UHB A; 3CY5 B; 3RJN B; 2MYE A; 1LFT A; 3WHM B; 1SPG A; 2H8D B; 4ESA A; 3AQ5 A; 1SWM A; 3UH7 A; 2AV3 A; 4O4T A; 3QJC A; 2H8F A; 3WCU A; 2XKG A; 1H97 A; 4L2M A; 1Y46 A; 4NI1 A; 1RPS B; 1UX8 A; 4HRR B; 3O89 A; 1MBO A; 3EU1 B; 2HBD B; 2EB9 A; 4LPI A; 1XZU A; 4YU4 A; 3DHR A; 1S5X A; 1Y8K A; 2MGH A; 4G1B A; 1PBX A; 1LFT B; 3UHS A; 5EV5 A; 5HAV A; 1SPG B; 5SW7 A; 4H0B A; 2D60 A; 3K8B A; 4HSW A; 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