The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of photolysed carbonmonoxy-myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
59
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F63 A; 3ZJO A; 1T1N A; 1Y0W B; 1NZ3 A; 2W6V A; 1URV A; 1RQ4 A; 1N9F A; 3PI8 B; 1IRD A; 1YE0 A; 1MWD A; 2YRS A; 3FS4 A; 1BBB A; 1JEB A; 1MGN A; 3LR7 A; 1MZ0 A; 3CY5 A; 3ODQ B; 1QXE B; 1CQX A; 1COH B; 1X9F A; 3ZJR A; 2GRF A; 5HU6 A; 3ZHW A; 3S1J A; 2CMM A; 4SDH A; 5HBI A; 1YEN B; 1C7C B; 1OR6 A; 4NI0 B; 1Y8I B; 1OUU A; 2DXM B; 3UI0 A; 1BZ1 B; 1CG8 B; 1HBG A; 3G53 A; 2V1K A; 1MBC A; 2EF2 A; 3GKV A; 2MYE A; 3TM9 A; 1MYZ A; 2W72 A; 3RJ6 A; 3MYM A; 1A6N A; 2ZS0 D; 1S5Y B; 1LFY B; 1R1X B; 2ZSN A; 4F6G A; 2XYK A; 4DC7 A; 2ZLX B; 3QJC A; 3UHD A; 1Y4G A; 2DC3 A; 2GTL D; 2R80 B; 4BJA A; 1EBC A; 1DXV A; 2QLS B; 1DO4 A; 2VYY A; 1Y01 B; 2ZFO B; 2ZS0 B; 1M9P A; 1B86 B; 2G0X A; 2R50 A; 1GBU B; 1S69 A; 3EOK B; 2W72 C; 1A01 B; 1JW8 A; 1YMA A; 3EDA A; 3HRW A; 2ZWJ A; 3VRG B; 2G0R A; 1V9Q A; 1DLY A; 1CG5 B; 1NGK A; 2MBW A; 2D5Z B; 2ZSP A; 1DXT A; 3DUT B; 4NXA A; 1MYH A; 1BAB B; 2FAL A; 1AZI A; 2Z85 A; 1Y31 A; 5EYS A; 2G0Z A; 2AA1 A; 1G0A A; 4M4A B; 1IBE A; 1J7S A; 2MYC A; 1JZM A; 4HSX A; 2D5X B; 2R4Y A; 1LFQ A; 1LH1 A; 1CLS B; 4DC8 A; 3U3E A; 2G14 A; 5JGG A; 2GRH A; 1G08 B; 1Y0C B; 3GK9 A; 3G4R A; 1J3Y A; 1MYM A; 1DWT A; 1YGF B; 1S6A A; 1LFV A; 3ZJN A; 1HBS B; 1NZ5 A; 4C44 A; 4MPM A; 2ZS1 C; 3UHQ A; 1YE2 B; 1BZZ B; 2MGE A; 1KR7 A; 2G10 A; 5EU2 A; 3ASE A; 1BIJ B; 1R1Y B; 4MAX A; 1V07 A; 1M6C A; 3BJ2 A; 3BCQ A; 3M39 A; 2MGH A; 1HLM A; 2D2N C; 1Y0D B; 4HRT A; 3LQD B; 2O5S X; 2VHB A; 2DN2 B; 2BLJ M; 3GDJ B; 1MBN A; 1WLA A; 2LHB A; 1AJG A; 2ZLU B; 1XZV A; 4FWY A; 3BJ3 B; 1O1P B; 3E5I A; 4HRR A; 1PBX A; 1Y5K B; 1DUO A; 1Y45 A; 1CBM A; 1Y5F B; 1A9W E; 2D2M D; 3E5O A; 2QRW A; 4HHB B; 1DO7 A; 1V75 B; 5E29 B; 5HY8 B; 1IWH B; 2EB8 A; 1CP5 A; 1NZ4 A; 3ORD A; 4AVE A; 2DN1 A; 3GQR A; 6HBW B; 3RJN B; 1Y83 A; 2W31 A; 3D1K A; 1Y4V B; 1KFR A; 3GYS A; 5JDO F; 3G52 A; 1XZ4 A; 3PI9 A; 1QSH A; 4ESA B; 1NWN A; 3MVC A; 3WCT D; 2H8F A; 1YEQ B; 1O1I B; 2BWH A; 1U7R A; 2AUQ A; 1A6G A; 2HZ1 A; 3UHW A; 2G12 A; 1DXU A; 1CPW A; 1VXC A; 3O89 A; 3G4Q A; 1Y09 A; 2YRS B; 2WTG A; 5C6E B; 1BBB B; 1NPG A; 4F68 A; 3QM5 A; 1LFL B; 4MQJ A; 3S65 A; 1MBI A; 1JL6 A; 5CNG A; 3FH9 A; 3R5I A; 1N9H A; 4G51 A; 1MOC A; 1RPS B; 3K9Z A; 1HGC A; 1HRM A; 1OUU B; 1J7Y B; 1Y4Q A; 2XKG A; 4ROM B; 3AQ9 A; 1XZ2 A; 2HZ3 A; 2WY4 A; 2ZLW A; 1YGD A; 3HYU B; 1YCB A; 1VWT B; 1JL7 A; 3WCW C; 4G1B A; 2W72 B; 2ZFB A; 1YG5 A; 2ZLT A; 2MGL A; 5SW7 B; 1J40 B; 4HBI A; 2LH3 A; 2W6W A; 1DKE B; 1GCW B; 3HF4 B; 3PI8 A; 1JF4 A; 1B0B A; 2NSS A; 1MKO A; 1Y0A B; 1Y7C B; 2DN3 B; 1GDL A; 1UC3 A; 1NS6 B; 2W6Y A; 1M9P B; 3ODQ A; 1QXE A; 3QZX A; 3ZJH A; 1IT3 A; 3LHB A; 2EB9 A; 1Y7Z B; 2R1H B; 5EYJ A; 3UHC A; 1YCA A; 1JY7 B; 1C7C A; 3D17 B; 4NI0 A; 1Y8I A; 2ZS1 D; 2DXM A; 2E2Y A; 2ZSX A; 3H58 A; 1BZ1 A; 3AG0 A; 1ECN A; 1VXH A; 2MGD A; 1QPW A; 3EDB A; 2MYB A; 1A3N A; 4U8U C; 2SPN A; 1YOG A; 1LA6 B; 1UVY A; 2ZS1 B; 1JF3 A; 4FWZ A; 2D2N D; 1S5Y A; 3OO5 A; 1G9V A; 2AA1 B; 2C0K A; 1R1X A; 1YIH B; 2O5T X; 2ZLX A; 4F69 A; 1JP9 A; 2MGC A; 5EQM A; 3V2Z A; 2QLS A; 2BW9 M; 3WCP A; 3BJ1 A; 5JOM A; 2ZS0 A; 2D2N B; 4GZG A; 1B86 A; 3CIU B; 1GBU A; 1UMO A; 5HLX A; 3EOK A; 3D7O A; 2GTL A; 1LHS A; 1YIE B; 4OOD A; 1F65 A; 3MJU B; 1XXT A; 3AQ5 A; 3ED9 A; 3VRG A; 2GL3 A; 2AV3 A; 1CG5 A; 1AJH A; 1UFP A; 2SPM A; 2D5Z A; 4ROL B; 4FH6 A; 3G4V A; 4YU3 A; 3S48 C; 1NPF A; 1DTI A; 2ZS0 C; 3WTG A; 1Y46 B; 4O35 A; 4KMW A; 2HZ2 A; 3V2V A; 2GTL C; 2D5X A; 3ZJI A; 4N8T B; 1CLS A; 3QJE A; 1XZV B; 5D1V A; 3UHE A; 3SDH A; 3PIA B; 1G08 A; 2IN4 A; 1Z8U B; 1Y45 B; 3VRF B; 3NL7 A; 1YGF A; 2D60 A; 2IG3 A; 2ZSZ A; 1HBS A; 1YE2 A; 1XZ5 B; 2ZLV B; 1BZZ A; 3GQR B; 3A9M A; 1Y83 B; 3OVU C; 1WVP A; 1YVT B; 3R0G A; 5CN9 A; 1IDR A; 3PI9 B; 1QSH B; 3WCW D; 2H8F B; 1WMU B; 1HBI A; 2GNW A; 3UH6 A; 3WCU C; 5B85 A; 4MQC A; 1Y0D A; 1K1K A; 1MOA A; 1UT0 A; 2DN2 A; 1MBS A; 1URY A; 3GDJ A; 3WCW B; 4H07 A; 2ZLU A; 1CIK A; 1MCY A; 3BJ3 A; 4MQJ B; 1O1P A; 1MYF A; 3HXN B; 4MQG B; 1Y35 B; 1Y5F A; 4UIQ A; 1VHB A; 1V75 A; 3R5I B; 1RTX A; 5E29 A; 1HGC B; 1Y4Q B; 3QJB B; 1Y4P B; 1FHJ B; 4TYX A; 3ZJS A; 1DXD A; 4VHB A; 6HBW A; 1BUW A; 3QQR A; 2D2M A; 1BZP A; 3UHK A; 2B7H B; 3WCV C; 4B4Y A; 1V4X B; 1Y4V A; 3WFT A; 1GZX B; 2ZFB B; 1NIH B; 2HBS B; 4U8U D; 3D1A B; 5E6E A; 1AJ9 A; 1SWM A; 4ZVB A; 1SPE A; 2BMM A; 1MKO B; 105M A; 3HHB B; 5EOH A; 1V5H A; 4U8U B; 5C6E A; 3WCT A; 2Z6N B; 1MNO A; 2ZSR A; 5CHQ A; 1XYE B; 1LFL A; 1A00 A; 2D2M C; 3UHV A; 1KD2 B; 1O1N B; 4MBN A; 1FSL A; 2HHE B; 1SHR B; 1QSI A; 2LH6 A; 1YZI A; 1RPS A; 3DHR B; 5B84 A; 107M A; 1HV4 B; 1J7Y A; 4ROM A; 5CN6 A; 1H97 A; 3HYU A; 1QPW B; 1VWT A; 4NXC A; 1SDK A; 1A3N B; 102M A; 1MLJ A; 3WCT C; 1VXG A; 2HHB A; 2OLP A; 1C7D B; 5SW7 A; 1J40 A; 3M3A A; 3RGK A; 2HHD B; 2ZSS A; 3OO5 B; 1G9V B; 1DKE A; 2RAO B; 1MTI A; 1GCW A; 3W4U B; 3HF4 A; 3PEL A; 1RTE A; 2OH9 A; 1Y0A A; 1Y7C A; 1XZU A; 2DN3 A; 5CND A; 1HDB A; 4N7O A; 1SDL B; 1NS6 A; 3WCP B; 3BJ1 B; 2QFN A; 2M6Z B; 1HGA B; 1FDH G; 1Y7Z A; 2OIF A; 2R1H A; 4IRO B; 3D7O B; 2GTL B; 2ZSO A; 3PI3 A; 1JY7 A; 5E83 A; 111M A; 3D17 A; 1HBR B; 1XXT B; 1MOD A; 1NXF A; 4UUR A; 1CO9 A; 3DHT A; 1K0Y B; 4YU3 B; 1JDO A; 1LA6 A; 2ZS1 A; 3VAU A; 2LH1 A; 3WTG B; 3WCU D; 3UHR A; 1YIH A; 2HBF B; 3MKB A; 3QZZ A; 1YDZ A; 1MWB A; 1MWC A; 2BLI A; 3ZOM A; 3QJE B; 3NML A; 1A3O B; 1PMB A; 1YHR B; 2SPL A; 4WJG 1; 2FRK X; 3KMF C; 1CMY A; 1VXE A; 3WCU B; 2D2N A; 3SDN A; 3NL7 B; 3LB3 A; 4LPI A; 2D60 B; 3CIU A; 5CN4 A; 1GVH A; 1Y2Z A; 2LH5 A; 2VRY A; 1OFJ A; 1MLS A; 3TM3 A; 1YIE A; 3MJU A; 1VXB A; 2H8D A; 5AZR A; 4F6I A; 1HLB A; 4FC3 B; 3WCV D; 4HSW A; 1RSE A; 4KMV A; 4ROL A; 1S0H B; 3WR1 B; 3PI2 A; 3A5A A; 3ZOL A; 5D5R A; 1NAZ A; 1YVQ A; 4MQC B; 5IKS A; 1HSY A; 1MYI A; 1Y46 A; 1MYG A; 1O1L B; 4MQK B; 2VLZ A; 1K1K B; 4MU5 A; 5JDO E; 3WCV B; 2MHB B; 3GQP B; 2QMB B; 4N8T A; 4F6D A; 2V1I A; 3SZK A; 5HAV A; 1CQ2 A; 4O4T A; 3PIA A; 4XS0 B; 3VRF A; 1MLQ A; 1RQA B; 1JP8 A; 3A2G A; 1NQP B; 1JWN A; 3IC0 B; 4PQB A; 3UHU A; 3UHS A; 3ZJL A; 1XZ5 A; 2QU0 B; 2ZLV A; 3A0G B; 1BUW B; 2D2M B; 2O5L X; 1NEJ B; 3UHZ A; 3VRE B; 1VXF A; 3GOU B; 4KN3 A; 1YVT A; 3NMM A; 4B3W A; 3HC9 A; 1FCS A; 1SPG B; 4NS2 A; 1UVX A; 1WMU A; 3ZJQ A; 5E6E B; 3UGY A; 1Y22 A; 1Y8H B; 1AJ9 B; 2GRZ A; 1XCH A; 2NX0 A; 2FRF A; 1MNH A; 4ZVA A; 1YEU B; 5KDQ A; 3WCW A; 3WCT B; 1MLN A; 3UHN A; 1M6M A; 3PT7 A; 3QMA A; 1UX8 A; 1A00 B; 4L7Y A; 3HXN A; 4MQG A; 1Y35 A; 3P5Q A; 1SI4 B; 4KJT A; 2ZT0 A; 1QSI B; 1GDK A; 1YZI B; 1RQ3 B; 3NFE B; 3QJB A; 1Y4P A; 1ASH A; 1FHJ A; 2FRI X; 2MB5 A; 1CH7 A; 1MYT A; 2B7H A; 1L2K A; 1V4X A; 1SDK B; 1GZX A; 3UH5 A; 1NIH A; 1HGB A; 2HBS A; 2HHB B; 2MGK A; 1YHU C; 5AB8 A; 1S56 A; 4O1T A; 3D1A A; 2MGB A; 3AT6 B; 1FAW B; 2ZT1 A; 2MYD A; 3K3U A; 3PEL B; 4XDI A; 1CBL A; 3HHB A; 1YH9 A; 1EMY A; 1XZU B; 1HDB B; 4U8U A; 2PEG B; 112M A; 4N7O B; 2Z6N A; 1XYE A; 1HAC B; 3WFX A; 2AUO A; 1KD2 A; 1O1N A; 1UFJ A; 1MLM A; 2HHE A; 1SHR A; 1YMB A; 5E83 B; 1C7B B; 5CNF A; 3DHR A; 3PT8 B; 4H0B A; 1HV4 A; 106M A; 1XY0 A; 5CN8 A; 2OHA A; 3DHT B; 1NZ2 A; 1Y4F A; 1MYJ A; 4QAU A; 1LUE A; 1C7D A; 2FRJ X; 4IT8 A; 2R4Z A; 1Y8W A; 2HHD A; 3LB4 A; 2MGM A; 2RAO A; 1D8U A; 3MKB B; 2MGJ A; 1LH5 A; 1O1K B; 3UHX A; 1YDZ B; 3W4U A; 1N9I A; 3UHG A; 3S1I A; 1BJE A; 5ILM A; 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3UH3 A; 1NEJ A; 3WFW A; 3VRE A; 1MLG A; 2G0V A; 1OR4 A; 3GOU A; 1Y8K B; 1CH4 A; 1C40 A; 1HGB B; 1GJN A; 3M3B A; 2MGG A; 2V1G A; 2VYZ A; 1SPG A; 1J7W B; 2R4W A; 1HCO A; 4ODC B; 3MOU A; 1Y8H A; 3H57 A; 101M A; 1VRE A; 3WHM A; 1YH9 B; 1YEU A; 3BOM B; 1G0B B; 2VEE A; 4F6F A; 1H1X A; 4PNJ A; 1MLL A; 3UBV A; 1MNJ A; 3K8B B; 2XKH A; 1SI4 A; 1XQ5 A; 2RI4 B; 4AVD A; 1CO8 A; 1U7S A; 4F6B A; 1NS9 A; 1RQ3 A; 3NFE A; 1XY0 B; 1YFF A; 1V4W A; 1UX9 A; 2ZT2 A; 2V1F A; 4NZI A; 1Y4F B; 2BNL A; 3NG6 B; 1F5P A; 1J52 A; 1Y8W B; 2O5O X; 1BVC A; 1MTJ A; 3AT6 A; 1FAW A; 1CH2 A; 1IOP A; 2VEB A; 5M3S A; 3G4Y A; 3IXF A; 1J3F A; 1Q1F A; 2MGI A; 2PEG A; 3QM7 A; 2EVK A; 1HAC A; 1X9F C; 2ZFO D; 2ZSY A; 1UIW A; 1QI8 B; 5F0B A; 110M A; 2W6X A; 3UHY A; 1C7B A; 2AV0 A; 5EE4 C; 1HDA A; 3PT8 A; 1FSX B; 3ZJJ A; 3KMF A; 2HBE B; 1V4U B; 4WCH D; 1NWI A; 4F4O B; 1J41 A; 2MGF A; 4TWU A; 2D6C A; 4NI1 A; 1I3E A; 1IT2 A; 4JYQ A; 2BKM A; 1Y4R B; 1YEO B; 1MBO A; 3A5B A; 3OJ1 A; 109M A; 1YMC A; 2BK9 A; 2R4X A; 3OZV A; 1ABW A; 3A59 A; 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