The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Human carboxyhemoglobin at 2.2 A resolution: structure and solvent comparisons of R-state, R2-state and T-state hemoglobins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN)
|
| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
54
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-05-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F63 A; 1N9X A; 3UHK A; 4MQH A; 4ROL B; 1O1M A; 3M39 A; 1Y4G A; 2IN4 A; 3ZJN A; 1L2K A; 3KMF A; 1YG5 B; 2ZFO A; 1LFV B; 4ZVA A; 2W72 A; 108M A; 4C44 A; 3UHG A; 1NZ3 A; 2R50 A; 1S5X A; 1A9W A; 1S69 A; 3S66 A; 2KSC A; 3WCV A; 4PQB A; 3QJC B; 1XY0 B; 1Y0A B; 3R0G A; 1JF4 A; 3ZJL A; 5D5R A; 1Y5F B; 3VRF B; 1J7Y A; 1V75 A; 3D4X A; 3ODQ A; 1JEB B; 1MDN A; 3H57 A; 1HBA A; 4H07 A; 1NS9 A; 3ONZ B; 4ESA A; 2LH1 A; 5F0B A; 4B3W A; 2ZS0 C; 2GRZ A; 1SDK A; 2BLH A; 2VLY A; 3B75 A; 1RPS B; 1C40 B; 3MJP A; 3ZJS A; 2QLS B; 1R1Y B; 1NXF A; 1O1J A; 2AA1 B; 3UGY A; 1S5Y A; 1ECA A; 3WCT C; 1CLS B; 3GQG A; 1D8U A; 3PI9 B; 2R4X A; 3A0G B; 1QXE A; 1U7S A; 1S0H A; 2DN3 A; 3QZZ A; 1M6M A; 1YEO A; 2ZLV B; 3G53 A; 3E5O A; 1SI4 A; 3QM7 A; 2HZ2 A; 3GDJ B; 2WTG A; 3HEN A; 3D17 A; 1GDK A; 1LA6 A; 1TU9 A; 4HHB B; 1O1I A; 1GCV A; 1QSI B; 5EE4 D; 2BLI A; 1O1K A; 2HZ1 A; 1UX9 A; 4NI1 B; 5HLX A; 1MBI A; 2GDM A; 2AUR A; 3QJD B; 1NAZ A; 3G46 A; 2Z6N B; 4WCH D; 5EV5 A; 4O1T A; 3OGB A; 1YFF B; 4UIQ A; 1JW8 A; 1YMA A; 4HBI A; 5ILM A; 2ZSP A; 1XCH A; 3UHD A; 1R1X B; 1JP9 A; 1GDI A; 1FDH A; 1OUU B; 4MPM A; 1HDA A; 1M9P B; 2VEE A; 1XZV B; 1HBS B; 1ABW B; 4KMW A; 5KKK A; 4FWY A; 3BJ2 A; 2MYE A; 1HAB B; 2D2M D; 2WTH A; 4OF9 A; 1PMB A; 4B4Y A; 5E83 A; 4IRO B; 1JP8 A; 2ZSR A; 2MGD A; 3OVU C; 2R4Y A; 1JY7 A; 1Z8U B; 3ARJ A; 1FAW B; 2OH9 A; 2B7H B; 1Y5J A; 2DN1 A; 3K8B B; 1J41 B; 1MKO A; 1FLP A; 4HSX A; 2ZT0 A; 3MKB A; 1QSH A; 1Y2Z A; 3SDN A; 3KUN A; 1GZX B; 1AJH A; 1LFQ B; 3WCP A; 1UVX A; 4QAU A; 1JZM A; 1JL6 A; 3ZJR A; 4M4B B; 1RQ4 A; 3MYM A; 1MYG A; 1IWH A; 5SW7 B; 1Y5K B; 3SDH A; 4MQI A; 1KR7 A; 1A01 B; 3K9Z A; 3UHV A; 1VXH A; 1XQ5 A; 3M3B A; 1K1K A; 1CO8 A; 1O1M B; 3EDA A; 3WCU A; 1MNI A; 1NGK A; 1YOH A; 3ZJP A; 1Y4G B; 1Y31 B; 1MYT A; 1YHU A; 1FHJ B; 1CBM A; 2MGH A; 1OUT B; 4MQJ A; 1EW6 A; 4GZG A; 3WHM A; 1B86 B; 2V1K A; 1YEN A; 4G1B A; 1NWI A; 1S5X B; 1CO9 A; 1MBA A; 4F6D A; 3S66 B; 2RAO A; 1MOD A; 1BIN A; 1BVD A; 3WCV B; 1DXT B; 2DN2 A; 2HBD B; 2ZST A; 1CMY A; 2QSS B; 5CN6 A; 2ZLU B; 4PQ6 A; 1V75 B; 112M A; 1Y85 B; 2XYK A; 2W6V B; 2BMM A; 1DO4 A; 5CNB A; 1NS9 B; 4ESA B; 3EU1 B; 1HGC A; 1DO1 A; 5EOH A; 1JZL A; 2QRW A; 1DXU A; 1SDK B; 1HBH A; 1WMU A; 1HGA A; 2HBC B; 1W92 A; 3B75 B; 4WJG A; 1GLI A; 3MJP B; 5EYS A; 3KMF C; 1BZ6 A; 1J7W A; 2ZFO C; 1OR6 A; 1Y8I A; 2W72 C; 1S5Y B; 1Y7Z B; 5CN9 A; 1YHR A; 2M6Z A; 2NX0 A; 1S0H B; 2DN3 B; 1YEO B; 2ZS0 D; 2QFK A; 2FRF A; 3BJ1 B; 4MAX A; 1MLK A; 3GYS A; 5HY8 B; 1J52 A; 2ZLT A; 1FCS A; 1QXD A; 3AQ6 A; 1GDJ A; 2HHB A; 1GCV B; 1CG5 A; 4ODC A; 2ZSQ A; 3ZHW A; 2R1H B; 2V1F A; 4NXA A; 1O1K B; 3MBA A; 1V9Q A; 2HHD A; 107M A; 3WCT D; 3LB1 A; 3WI8 A; 2D2N A; 1HJT A; 5AZQ A; 110M A; 2BKM A; 1YEV B; 3IC0 B; 1Y83 A; 1HBR A; 1MWB A; 1Q1F A; 2G10 A; 1LHT A; 3UHI A; 2G0S A; 2Z85 A; 1HCO A; 1NPF A; 3VAU A; 2HHE A; 3A9M A; 1FN3 A; 2H8D A; 1CH3 A; 1TES A; 5JDO D; 1AJG A; 1MLR A; 1NQP B; 2QFN A; 1BZ0 B; 3TM3 A; 1HSY A; 5CN7 A; 1DUO A; 1O16 A; 3E55 A; 1C7B A; 3NML A; 1RQ3 A; 1Y4P A; 3UI0 A; 5CN8 A; 1LH7 A; 2YRS A; 1JY7 B; 2R4W A; 2D2M B; 7HBI A; 2VYW A; 1ASH A; 4SDH A; 2MHB A; 1YGD A; 2MGL A; 5KER A; 1NZ5 A; 3EOK B; 1F65 A; 1MLQ A; 3PIA A; 2LH5 A; 2EKT A; 4XDI A; 3WTG A; 1FSX B; 2AUP A; 2QSP A; 3A5B A; 2VYY A; 1IWH B; 1XZ4 A; 1Y0C A; 4MQI B; 3HEP A; 1XQ5 B; 2O5B X; 1MBO A; 1GDL A; 4KMV A; 1K1K B; 5CND A; 3WCU B; 1MLS A; 1X46 A; 2Z6T A; 2EF2 A; 1YHU B; 4JAC A; 1DKE A; 3UBV A; 105M A; 1MYI A; 3D1K A; 2MGF A; 4N7P B; 3WHM B; 1YZI B; 1Y0D A; 2FAL A; 1A6G A; 2RAO B; 1YE2 A; 4NI0 A; 1XZ5 A; 1EBC A; 1MYH A; 5AB8 A; 1CMY B; 4FC3 A; 3EDB A; 1X9F B; 4LPI A; 1XZ7 A; 6HBW A; 3UHZ A; 3QQQ A; 3HYU A; 1A6K A; 4ROM A; 3S1I A; 1DXV B; 1HLM A; 3M38 A; 2VM0 A; 3S65 B; 1YH9 A; 3O89 A; 3K3U A; 1HHO A; 1WMU B; 3UBC A; 4G1V A; 1Y7C B; 4O35 A; 5E6E B; 5EUI A; 2ZSS A; 4MQC B; 4N7N A; 1J7W B; 1UIW B; 1Y8I B; 1IT2 A; 2DHB B; 1NIH A; 4N7O A; 3SZK A; 1J3Y A; 3ARK A; 1Y4Q A; 4MBA A; 1XYE B; 3ZJH A; 1IRD A; 4BJA A; 3HF4 A; 2ZLT B; 3V2V A; 2ZS0 B; 1YHE A; 4ODC B; 1SDL B; 2ZFO D; 1VXF A; 1J7S A; 1CH9 A; 1Y09 B; 5EU2 A; 1Y46 B; 3DUT A; 2HHD B; 1DWS A; 1J3Z B; 1MCY A; 1UFJ A; 3ZJO A; 1Y4R A; 3WCT B; 2G14 A; 2HBF A; 1HBR B; 3WCV D; 2WY4 A; 2H8D B; 3R5I A; 1A3N A; 1VXB A; 3GK9 A; 1G08 A; 1HGB B; 1YVQ A; 1MOC A; 1SHR A; 1OJ6 A; 1O1L A; 3AT6 B; 1ITH A; 4G51 A; 1MOH A; 3UHW A; 1G9V B; 1MYM A; 1MLO A; 2XKI A; 1RSE A; 1YGF A; 2OHA A; 1COH A; 1Y0T A; 1RQ3 B; 3BCQ B; 4UUR A; 2YRS B; 1LFT A; 1YEQ A; 5AZR A; 1LH2 A; 1A4F A; 1YEU B; 3ED9 A; 1V4X B; 3MOU A; 5MBA A; 1YGD B; 3QJB B; 5KER B; 1Y45 A; 1YE0 B; 1XZ2 B; 3E4N A; 5EYJ A; 3PIA B; 1Y8H A; 2D2N C; 1MOA A; 1G0B B; 4FH6 A; 5C6E A; 3WR1 A; 2D5X B; 1HDS B; 2DC3 A; 3PI2 A; 1Y4V B; 1YDZ A; 1QI8 A; 3CY5 B; 1CQX A; 2H35 B; 1B0B A; 4YU4 B; 1LFZ A; 1A3O A; 1THB A; 1IRC A; 3UHB A; 3DHR A; 1O1N B; 2QMB A; 3UHN A; 3LB2 A; 2HCO B; 3MJU B; 2EVK A; 1YIH A; 3GQP A; 1U7R A; 2GTL A; 4VHB A; 3OJ1 A; 1IBE A; 3RGK A; 1Y22 B; 1YE2 B; 1Y35 A; 3GKV B; 3O7N A; 2VLZ A; 1A6M A; 1NWN A; 1G09 A; 1ABY A; 2G11 A; 2DXM A; 2RI4 B; 1DXD A; 1KFR A; 4FC3 B; 2OH8 A; 2ZSO A; 3HRW A; 3QJE A; 1RQA A; 1G0A A; 6HBW B; 2O5M X; 3DHT A; 1FSL A; 3HYU B; 1BAB B; 1MOB A; 1MZ0 A; 3WFT A; 1N9F A; 1XZU B; 3ECX A; 1K0Y A; 2D5Z B; 1CQ2 A; 1YH9 B; 1CP0 A; 3QMA A; 1O1P B; 3OO5 B; 2NSS A; 2QU0 A; 3WCW A; 2SPO A; 3NL7 A; 3PT7 B; 4U8U A; 1YIE A; 1HHO B; 1CIO A; 3AQ8 A; 1DUK A; 1F5O A; 3UHX A; 2MYD A; 4F6F A; 1MWC A; 4N7N B; 1BVC A; 2EVP A; 4KN3 A; 1UC3 A; 1A0U B; 5ILE A; 2R80 B; 5EQM A; 4N7O B; 3SZK B; 2MYC A; 1Y4Q B; 1Y7D B; 4MQG A; 101M A; 1NEJ A; 1NZ2 A; 2O5L X; 3GKT A; 1QPW B; 1YVT A; 1BZ1 A; 1LFY B; 3VRG B; 1JF3 A; 1A00 B; 2FRI X; 3WCU D; 3UHR A; 3A59 B; 1GBV A; 1YHU D; 1EWA A; 2BW9 M; 1PBX A; 4H0B A; 1EBT A; 1BBB A; 2HBG A; 1J7S B; 1NS6 A; 4MQH B; 1MTK A; 1HDB A; 1MNH A; 1BZP A; 4ILZ A; 2ZFO B; 5JDO E; 1MLG A; 1CG8 A; 2W72 B; 4NXC A; 3D7O A; 2MGA A; 1XXT A; 3UH3 A; 4MXK A; 2ZWJ A; 3BJ3 A; 3R5I B; 1X9F D; 1ECD A; 1G08 B; 3HC9 A; 2AUO A; 5CHQ A; 2XKG A; 1O1L B; 1J7Y B; 3ZJJ A; 2HBS A; 3D4X B; 3OZW A; 3ODQ B; 1HBA B; 1A6N A; 4O4T A; 3FH9 A; 4DWU A; 4HRR A; 2PGH A; 1H97 A; 4H2L A; 3U3E A; 1YEQ B; 1A4F B; 1LFL A; 1VWT A; 2GL3 A; 3MYN A; 2HZ3 A; 4M4A A; 1JL7 A; 3QM5 A; 1Y0W A; 4F4O A; 1O1J B; 1Y8H B; 1MLL A; 1DO3 A; 1MNO A; 3UHH A; 3GQG B; 2MYA A; 4XS0 A; 4F68 A; 1QXE B; 3WR1 B; 2G12 A; 1CP5 A; 2ZS1 A; 2ZFB A; 3FS4 A; 3S1J A; 3PI8 A; 1YDZ B; 1QI8 B; 4MQK A; 5CN4 A; 1SI4 B; 2MGI A; 1Y7G A; 1MLN A; 1C7C A; 2D60 A; 1A3O B; 3D17 B; 1LA6 B; 1O1I B; 1DO7 A; 2D2N D; 1C7D A; 1S6A A; 3DHR B; 2ZSX A; 2GKN A; 2QMB B; 1DLW A; 3PI3 A; 4L2M A; 2ZT3 A; 3KUO A; 4HSW A; 2O5T X; 1YIH B; 2Z8A A; 4DC8 A; 3GQP B; 2PEG A; 3VHB A; 2GTL B; 3NG6 A; 1AJ9 A; 1YMC A; 5C6Y A; 2V1E A; 104M A; 5CNE A; 1LH3 A; 5JGG A; 1HDA B; 3IC2 A; 4TWU A; 1LFV A; 1RTE A; 3HRW B; 4MBN A; 3DHT B; 2JHO A; 4L7Y A; 5HLU A; 1SWM A; 3BJ2 B; 3LQD A; 3ZOL A; 1K0Y B; 5CNC A; 5E83 B; 1RVW A; 2O5S X; 3NL7 B; 3QJC A; 1YCA A; 1Y01 B; 1V5H A; 1OBM A; 2EKU A; 1VRE A; 1Y5J B; 2SPL A; 2DN1 B; 2V1J A; 1MNJ A; 1MKO B; 3MKB B; 1QSH B; 1OR4 A; 1Y2Z B; 3E5I A; 1A0Z A; 2MB5 A; 3ONZ A; 3UH6 A; 5KDQ A; 2GTL C; 2V1G A; 3G4U A; 3MVC A; 3WCP B; 3UHE A; 5JDO F; 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1MGN A; 3ZJM A; 2LH6 A; 1HAC A; 5SW7 A; 2OHB A; 1Y5K A; 2G0X A; 2D2N B; 3QM8 A; 2MBW A; 1AZI A; 2MYB A; 1MTJ A; 2LHB A; 2PEG B; 3NG6 B; 1AJ9 B; 1JP6 A; 4N8T A; 1A01 A; 1Y83 B; 2R4Z A; 2MGG A; 1OFJ A; 5JGG B; 1MNK A; 1HCO B; 1Y31 A; 2BWH A; 4DC7 A; 2HHE B; 1DTM A; 1FHJ A; 1FN3 B; 3IC2 B; 2AV3 A; 2O58 X; 1BZZ A; 1OUT A; 3LB4 A; 1B86 A; 3BA2 A; 1DM1 A; 5ILR A; 4L7Y B; 2ZS1 C; 1LJW A; 3LQD B; 2W31 A; 3A5G A; 3G52 A; 1RVW B; 1C7B B; 1UFP A; 3CIU A; 1VXD A; 1Y4P B; 2VEB A; 1DXT A; 3UH7 A; 3M3A A; 1DTI A; 5D1V A; 5F2A A; 2HBD A; 2QSS A; 1MBD A; 1VXG A; 2ZLU A; 2OLP A; 1Y85 A; 2MHB B; 109M A; 1Y8K A; 2W6V A; 3ZJQ A; 3AQ7 A; 1A0Z B; 3EU1 A; 5KDQ B; 3WTG B; 2LH3 A; 4F6B A; 5E29 B; 2VHB A; 2QSP B; 5HU6 B; 1LHS A; 2HBC A; 5HAV A; 1CH5 A; 1O1O B; 3H58 A; 3LB3 A; 1UT0 A; 2OIF A; 2MGM A; 1XZ4 B; 1KD2 A; 111M A; 1Y0C B; 4ZVB A; 2W6Y A; 1Y7Z A; 1T1N B; 1CH1 A; 1URV A; 2G3H A; 4X0L A; 1NZ4 A; 2W6X A; 5CMV A; 3ECZ A; 1V4W A; 4F6J A; 1WLA A; 2GTL D; 5B84 A; 3LR7 A; 1DKE B; 2GKM A; 1VRF A; 3BJ1 A; 2MGC A; 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