The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Photolysis-induced structural changes in single crystals of carbonmonoxy myoglobin at 40 K.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-05-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4N7P B; 4JAC A; 4GZG A; 1FDH G; 4VHB A; 2GRF A; 1V75 A; 4TYX A; 1DXV A; 3GQG B; 3MVC A; 2ZLW B; 2D5X B; 2GTL D; 1BZZ B; 2R4Z A; 1HCO B; 1BUW A; 3BOM B; 5D5R A; 2ZSP A; 4ILZ A; 1DO3 A; 1O1K A; 2D5Z A; 2ZWJ A; 2VHB A; 3UHB A; 1HBS A; 2VYY A; 3OO4 B; 3PI9 B; 1X9F D; 1XXT B; 3K3U A; 1H97 A; 2MGH A; 3G4V A; 1OUT A; 1YGD B; 2AA1 A; 3ZH0 A; 1Y4P B; 2MGF A; 1ABS A; 3WFU A; 1BAB B; 2GNW A; 3EOK A; 1LJW B; 2D2M A; 1LFT B; 2FAM A; 4NI0 B; 1YCB A; 1MLO A; 2PGH A; 1DLW A; 1MLU A; 1HBR B; 1DKE B; 2HBS B; 3A59 A; 3MKB A; 1X46 A; 104M A; 1A9W E; 4F68 A; 1Y4B A; 5EYS A; 1MYF A; 1V4W B; 1YEN A; 2M6Z B; 2O5O X; 4PNJ A; 5EE4 C; 1K0Y B; 2R80 A; 2EVK A; 2V1K A; 1GDI A; 2ZFO B; 1A0U B; 2LH7 A; 2QSP A; 1NS6 A; 1Y5J B; 2HZ1 A; 5D1V A; 5JGG B; 3D1K A; 4N7P A; 2H35 A; 1CO9 A; 1O1P B; 3QM5 A; 4F6F A; 1MBC A; 3PT7 B; 1MYT A; 3GQG A; 2ZLW A; 2D5X A; 1BZZ A; 1HCO A; 5JDO E; 5CN4 A; 3BOM A; 1XZ7 B; 3UHG A; 1CP0 A; 4ROL B; 4MXK A; 3ZJH A; 3OZW A; 3PI9 A; 3OO4 A; 1YHU B; 2ZT0 A; 2LH6 A; 1XXT A; 3BJ2 B; 3OGB A; 102M A; 4DWT A; 1TU9 A; 1YGD A; 1LHS A; 1Y4P A; 4C0N A; 1EMY A; 1CPW A; 1YEQ B; 1UC3 A; 1EBC A; 1YMB A; 2QFK A; 1BAB A; 4N7N B; 4XS0 B; 1Y09 B; 1LJW A; 1LFT A; 1YMC A; 3WCU C; 4UIQ A; 3PI8 B; 4NI0 A; 3DUT B; 1O16 A; 1HBR A; 1DKE A; 2HBS A; 4H0B A; 2OLP A; 3CY5 B; 4MQJ B; 3UHZ A; 1NIH B; 4H07 A; 1V4W A; 1ECO A; 2M6Z A; 3NML A; 3HEN A; 5EE4 D; 1K0Y A; 2ZFO A; 1A0U A; 5EQM A; 1OJ6 A; 2WY4 A; 3AT6 B; 5JGG A; 1OFJ A; 1Y85 B; 2G11 A; 1AJG A; 1O1P A; 2MGJ A; 3LB4 A; 4M4A B; 3PT7 A; 2MYE A; 2W72 B; 1BIJ B; 1FLP A; 4MQC B; 3NMM B; 3ZOL A; 1XZ7 A; 2NSR A; 3PIA B; 1W92 A; 3S1J A; 1HLM A; 4DC8 A; 3NFE B; 4KJT A; 4ROL A; 1WVP A; 5F2A A; 1HBG A; 3LB3 A; 1A3N B; 1YHU A; 3BJ2 A; 3WCT C; 5EOH A; 1O1O B; 1CLS B; 2G10 A; 2QMB B; 2NSS A; 3WCW D; 1XZU B; 4NXA A; 1Q1F A; 1YEQ A; 2V1E A; 3V2V A; 3QM7 A; 5SW7 B; 1LFY B; 4XS0 A; 1Y09 A; 1Y0W B; 3WCU D; 1JWN A; 3PI8 A; 4N8T B; 4NK1 A; 3DUT A; 3G52 A; 1UX9 A; 3CY5 A; 4MQJ A; 3WFW A; 3WFT A; 1NIH A; 2SPM A; 3QZZ A; 1YIE B; 3ZJI A; 5M3S A; 1QSI B; 3OJ1 A; 1HBA B; 3OVU C; 1CH1 A; 3VRG B; 1GBV B; 1A6N A; 1MLR A; 1MYM A; 3AT6 A; 1VXC A; 1Y85 A; 5AZR A; 1Y7C B; 1QXE B; 1MTK A; 4M4A A; 1F63 A; 2ZLV B; 1SDL B; 3RJ6 A; 1GDK A; 2W72 A; 3MOU A; 1BIJ A; 3VHB A; 3UH6 A; 4MQC A; 1YOH A; 2MGE A; 3NMM A; 1MLQ A; 4AVE A; 1C7D B; 2ZSN A; 1IRD B; 3PIA A; 5EYJ A; 1VWT B; 3NFE A; 3WCP B; 2VLZ A; 1MLL A; 2MGG A; 1MYZ A; 5E6E B; 3UHT A; 1HGC B; 1A3N A; 3WCW B; 3GYS B; 4XDI A; 1O1O A; 2D2M C; 1MOH A; 2MGM A; 1CLS A; 1RQ3 B; 2QMB A; 3D17 B; 1V5H A; 1O1N B; 1LH1 A; 1AJH A; 1XZU A; 4MBA A; 2MGA A; 5SW7 A; 2OH9 A; 1MOA A; 1LFY A; 5EUI B; 1Y0W A; 3S65 B; 1J41 B; 4N8T A; 3UHQ A; 1IRC A; 3H58 A; 1O1I B; 2DHB A; 1YIE A; 3LHB A; 1QSI A; 1HBA A; 3E5O A; 3NG6 B; 2G14 A; 1YCA A; 3D1A B; 3ZJM A; 1YIH B; 1XY0 B; 1MLG A; 2H8D B; 3VRG A; 1GBV A; 1J3Z B; 1J7S B; 3ZOM A; 4O35 A; 1IBE B; 1Y7C A; 1CQ2 A; 2OIF A; 2VEE A; 2FRJ X; 5MBN A; 1URY A; 1S5X B; 1QXE A; 3AQ7 A; 4MQI B; 2ZLV A; 1SDL A; 5C6E B; 3KUN A; 1YDZ B; 3HRW B; 1C7D A; 1ABW B; 1IRD A; 3QZX A; 1F5P A; 1M9P B; 2V1F A; 1VWT A; 2MHB B; 3WCP A; 1ABY B; 1H1X A; 5E6E A; 111M A; 1HGC A; 5EV5 A; 3M3B A; 3WCW A; 4B3W A; 2ZS1 D; 3GYS A; 1RQ3 A; 5E83 B; 3D17 A; 1S56 A; 2HBG A; 3QQQ A; 3KMF A; 1LFZ B; 1O1N A; 5ILR A; 4F6G A; 1VXE A; 2D6C A; 4AVD A; 2O58 X; 2XKH A; 1Y0T B; 2NRM A; 4SDH A; 2GL3 A; 1UVX A; 4FWY A; 1LUE A; 5EUI A; 1IOP A; 3S65 A; 3ZJQ A; 3WHM B; 1NZ5 A; 5CNB A; 1J41 A; 2GDM A; 1JF3 A; 4NZI A; 1JP8 A; 2V1G A; 1LH6 A; 2MGI A; 2EB8 A; 1LFV B; 3GQP B; 2O5Q X; 1YZI B; 4O1T A; 1O1I A; 1Y8K B; 4OOD A; 1LA6 B; 3AQ6 A; 1DM1 A; 1QSH B; 3NG6 A; 3D1A A; 3H57 A; 1HAB B; 1YIH A; 1XY0 A; 3DHR B; 1EWA A; 1VHB A; 2H8D A; 3E55 A; 1J3Z A; 1J7S A; 2LH5 A; 1XZ4 B; 1KR7 A; 1IBE A; 2FAL A; 1THB A; 4MQI A; 3HHB B; 1MLJ A; 1YG5 B; 5C6E A; 1SWM A; 1HV4 B; 5CNE A; 1YDZ A; 3HRW A; 1ABW A; 1MBS A; 3HEP A; 1M9P A; 1JDO A; 5EET A; 1UVY A; 1FN3 B; 1ABY A; 2W6Y A; 1MBA A; 1Y0D B; 1Y5F B; 1CP5 A; 1Y7G B; 1MBO A; 3HYU B; 5E83 A; 1VXG A; 2H35 B; 1A3O B; 1LFZ A; 5C6Y A; 1Y4G B; 1Y83 B; 1MTJ A; 4NK2 A; 1IWH B; 2DN1 B; 2FRF A; 1MYI A; 1RSE A; 1J7W B; 1Y0T A; 1JP9 A; 1MLK A; 1JP6 A; 5B84 A; 3WHM A; 1BIN A; 3QM9 A; 1QPW B; 1HDA B; 3GLN A; 1LFV A; 3PI1 A; 3GQP A; 1YZI A; 3E5I A; 5ILE A; 1Y8K A; 1Z8U B; 3BA2 A; 1LA6 A; 2LH1 A; 3M38 A; 1QSH A; 1HAB A; 2HBD A; 3DHR A; 2R50 A; 3CIU B; 3U3E A; 1NZ2 A; 1YEV B; 1CH9 A; 1XZ4 A; 1HDS B; 2G3H A; 5JDO D; 4F4O B; 1JZM A; 2Z6S A; 4IRO B; 3HHB A; 1YG5 A; 1HV4 A; 1MKO B; 1FSX B; 4FWZ A; 5HLQ A; 2Z85 A; 5KKK A; 1YHR B; 1NZ3 A; 4FC3 B; 1FN3 A; 1Y0D A; 1Y5F A; 1HBB B; 1Y7G A; 2MYA A; 3HF4 B; 2O5S X; 1A6K A; 3HYU A; 2ZLU B; 2GTL B; 1FDH A; 1MTI A; 1MCY A; 1A3O A; 5HU6 B; 1KFR A; 1Y4G A; 1KD2 B; 1Y83 A; 1MOC A; 1IWH A; 2DN1 A; 1EBT A; 4ZVB A; 1LH3 A; 1DTI A; 1Y7Z B; 4C44 A; 1GLI B; 2ZT4 A; 1OFK A; 1SI4 B; 1X9F B; 4U8U C; 1CH7 A; 1J7W A; 1R1X B; 1YH9 B; 105M A; 4MQG B; 2EF2 A; 1J40 B; 1QPW A; 1HDA A; 1M6M A; 5JOM A; 3G4W A; 3ED9 A; 1AZI A; 4F6B A; 1FSL A; 1SHR B; 4HRT B; 5JDO F; 3G53 A; 2QU0 B; 3CIU A; 3OZV A; 3ARJ A; 1FHJ B; 4ESA B; 2R4Y A; 1ASH A; 2HZ2 A; 1YEV A; 5CN5 A; 3MN0 A; 1HDS A; 2LHB A; 3LR7 A; 4F4O A; 1F5O A; 5CNG A; 1LH7 A; 2D2N C; 2G0R A; 3GK9 A; 4IRO A; 1O1M B; 3WFX A; 4KMW A; 1NXF A; 2R4X A; 1MKO A; 1ECD A; 1FSX A; 3P5Q B; 3KMF C; 1YHR A; 3EDB A; 4FC3 A; 2GRH A; 2MYC A; 2WTH A; 2IN4 A; 1JZK A; 3R0G A; 1HBB A; 1UIW B; 4MU5 A; 3HF4 A; 2ZLU A; 2GTL A; 1WLA A; 3A9M A; 1A9W A; 4ZVA A; 2ZSR A; 1T1N B; 5HU6 A; 1KD2 A; 3UHC A; 3LB1 A; 1Y31 B; 2AV0 A; 2D60 B; 1Y7Z A; 1GLI A; 4U8U D; 1SI4 A; 1X9F A; 3IC2 B; 1JY7 B; 1R1X A; 1YH9 A; 3PI2 A; 3BCQ B; 2G0Z A; 3GOU B; 4NS2 A; 3WCV C; 4MQG A; 1J40 A; 2HBF B; 1MLN A; 3LB2 A; 3D7O B; 1Y8I B; 1VXH A; 5KDQ B; 1J3F A; 1XZ2 B; 1SHR A; 1O1L B; 1RQA B; 4HRT A; 1RVW B; 2Z6T A; 3ASE A; 1GDL A; 1RPS B; 3VRF B; 2QU0 A; 2MB5 A; 3FS4 B; 2AUP A; 3OK5 A; 4ESA A; 1FHJ A; 2EKT A; 2MGC A; 1S61 A; 4PQC A; 3UHR A; 1MLS A; 1NEJ B; 2V1H A; 3WR1 B; 2ZS0 C; 2D2N D; 1Y8W A; 3FH9 A; 106M A; 1NGK A; 1O1M A; 1MBD A; 2SPL A; 1GZX A; 1DUO A; 2DHB B; 3IA3 B; 3P5Q A; 2XKG A; 3A2G A; 1HAC B; 1RTX A; 2NRL A; 1G08 B; 1X3K A; 1MNH A; 2VLY A; 1J7Y B; 4B4Y A; 2OHA A; 1A6M A; 1V9Q A; 3ZJR A; 1UIW A; 1BJE A; 3A5A A; 2YRS B; 3G4Y A; 2WTG A; 1SPG B; 1Y0C B; 1T1N A; 1Y31 A; 2ZSZ A; 2MBW A; 3MJU B; 2D60 A; 1J3Y B; 3IC2 A; 1JY7 A; 3OO5 B; 1HDB B; 103M A; 3BCQ A; 2VYZ A; 1FAW B; 1COH B; 2W6V B; 2DN2 B; 3GOU A; 1LH5 A; 1MYG A; 3WCV D; 4FH6 A; 2R4W A; 4DWU A; 1CH4 A; 3WCT D; 2HBF A; 3UH7 A; 1VRE A; 2Z8A A; 3D7O A; 2G12 A; 1Y8I A; 3A5G A; 5KDQ A; 1XZ2 A; 1O1L A; 1RQA A; 3WCU B; 1RVW A; 1ITH A; 1WMU B; 1RPS A; 3VRF A; 3FS4 A; 2RAO B; 1UT0 A; 2ZSO A; 1BZR A; 1MWB A; 112M A; 1N9H A; 1MWD A; 1CH3 A; 1DO1 A; 3AQ8 A; 1NEJ A; 5ILM A; 1D8U A; 1YOG A; 2E2Y A; 2ZS0 D; 3WR1 A; 2W6W A; 4HRR B; 1TES A; 1A01 B; 4MAX A; 1Y7D B; 3PEL B; 2MGB A; 1HAC A; 2BW9 M; 1MBI A; 1G08 A; 2BLH A; 1J7Y A; 5HBI A; 3TLD A; 2YRS A; 5HLX A; 1I3E A; 1V4U B; 2DXM B; 2DC3 A; 108M A; 3ECZ A; 1SPG A; 1Y0C A; 1FCS A; 2W31 A; 1THB B; 3QJD B; 3IXF A; 1NS9 B; 2C0K A; 1A0Z B; 3K9Z A; 3MJU A; 1DWS A; 1J3Y A; 1Y45 B; 3UBV A; 3WCT B; 1GBU B; 1YFF B; 3OO5 A; 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3UHS A; 1UFP A; 1DXT B; 1G0B A; 2ZFO D; 3DHT A; 1SDK A; 7HBI A; 2AUO A; 1XYE A; 1S5Y A; 1U7R A; 4TWU A; 1CG5 A; 3UHD A; 1C7B A; 3AT5 A; 3BJ1 B; 3S66 A; 1A6G A; 1YVT A; 1I3D A; 2ZSX A; 5EU2 A; 1O1J B; 2HHE B; 2W72 C; 5B85 A; 1CG8 B; 1MNI A; 3QJE A; 2FRK X; 4N7O A; 1MYJ A; 3IC0 B; 1BBB A; 2PEG B; 3MJP A; 2HHD B; 1Y01 B; 1S0H A; 1DO7 A; 1YHU D; 1CQX A; 1Y4Q A; 2HCO A; 1B86 B; 3PI3 A; 1NWN A; 2ZS1 A; 1RTE A; 2XKI A; 1EW6 A; 1OUU A; 3TM3 A; 2W6X A; 3MYN A; 1Y4R B; 4YU3 B; 1MNK A; 1GCW A; 1ECN A; 2BKM A; 1MWC A; 2CMM A; 4MXL A; 1JEB A; 1BZP A; 1GCV A; 1LHT A; 4KMV A; 4MQK A; 1DLY A; 1XZV A; 2AV3 A; 5E29 B; 2NX0 A; 3SDH A; 1S69 A; 2ZFB B; 1Y2Z B; 2AUR A; 2SPO A; 1YE0 B; 3UHE A; 2RI4 B; 3PT8 B; 5HY8 A; 1NQP B; 4OF9 A; 1CMY B; 1DXT A; 3W4U B; 1BVC A; 1YVQ B; 4L7Y B; 1A00 B; 2BWH A; 1Y8H B; 5CN9 A; 1N9F A; 2GLN A; 2LH3 A; 3BJ1 A; 3VRE B; 1LFL B; 1O1J A; 3GKV B; 5AB8 A; 2HHE A; 1CG8 A; 1V07 A; 1RQ4 B; 3SZK B; 3IC0 A; 2BNL A; 1Y5K B; 2PEG A; 1Y4F B; 2HHD A; 5AZQ A; 1MNJ A; 1YMA A; 1J52 A; 1Y8W B; 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