The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically crosslinked hemoglobin: a structural study.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
57
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1A3O B; 4PQ6 A; 1M6M A; 1YH9 A; 5JGG A; 2D2N D; 3LQD A; 3GK9 A; 4PNJ A; 1MBO A; 2H8F B; 2GDM A; 5CNB A; 1MWB A; 2MB5 A; 2GRH A; 5SW7 B; 1MLL A; 4YU3 A; 1HDB A; 3AT5 B; 2G0R A; 1JP8 A; 2YRS B; 3EDB A; 1JPB A; 1MTJ A; 4VHB A; 3WCT C; 1OR4 A; 2ZSO A; 1Y8I B; 1MLO A; 1RQ4 A; 4MQK A; 1XZU B; 1HBR B; 1YE2 A; 1YEU A; 1L2K A; 2HHB A; 1LFZ A; 1O1K B; 1JF4 A; 3PEL A; 1SDL B; 2MGA A; 3D7O A; 5CN8 A; 1BIJ B; 4UUR A; 2D2N B; 2HHD B; 2MYB A; 1SDK B; 3S66 A; 1MWD A; 1XZ5 B; 1Y7G A; 1HDS A; 3UI0 A; 1ABW A; 4O4Z A; 1DM1 A; 2Z6N B; 3V2V A; 1YE0 A; 4FH7 A; 1JW8 A; 4N7P A; 1O1O B; 1YZI B; 1CG8 A; 3NL7 B; 2VLZ A; 3HYU A; 2R1H A; 1RVW B; 4TWU A; 1YEO B; 1YDZ B; 2VYZ A; 5E6E A; 1XY0 A; 4B4Y A; 2ZLV A; 1NZ3 A; 2FAM A; 5JDO D; 112M A; 2V1F A; 3HHB A; 2BNL A; 6HBI A; 2MGH A; 1YHE A; 2D2M C; 3UHN A; 1Y4V A; 1K0Y A; 1N9I A; 1DXC A; 1DXT B; 1X9F A; 1C7D A; 4XS0 A; 3AQ5 A; 1GCV A; 1AZI A; 1XYE B; 3WCW A; 4ESA B; 1C7B A; 3D17 B; 4ZVB A; 2HBE B; 3UH6 A; 103M A; 4MBN A; 1GBU A; 1AJ9 B; 1V75 B; 1PBX B; 3OZU A; 3BA2 A; 2WTG A; 3A5A A; 1QPW B; 3BJ2 A; 110M A; 1GDK A; 1LFT B; 1HBB B; 1WVP A; 1Y8K B; 2W31 A; 1DO3 A; 1DTM A; 3BJ3 B; 4ROL B; 1GLI A; 1RQ3 B; 3QJC B; 3P5Q A; 1NS9 A; 1Y0T B; 2B7H A; 1CQX A; 1HCO B; 4FC3 A; 4HRT A; 4MQC B; 5EYJ A; 1YFF A; 106M A; 1H97 A; 1VRF A; 5CHR A; 1Y4F A; 1O1N B; 2EB9 A; 3D1K B; 3WFW A; 4IRO B; 1YMA A; 1YVQ A; 1LH2 A; 3GQP B; 2EKU A; 1CO9 A; 3MYN A; 1Y46 A; 1VXA A; 1CH1 A; 1SPE A; 3GKT A; 3A2G A; 3ZJS A; 2LH3 A; 1MGN A; 3B75 A; 1HSY A; 1MNI A; 3DUT B; 1IBE A; 1LHT A; 2W6W A; 5MBA A; 1YEU B; 2PEG B; 1MNO A; 1O1I A; 3EU1 A; 1RQA A; 3DHT B; 3KUN A; 2V1H A; 2NX0 A; 3G46 A; 2V1I A; 1VWT A; 3G53 A; 5EQM A; 3D7O B; 1LFV A; 1JP9 A; 4N7N B; 3A5B A; 2HBS B; 3UH3 A; 1RPS A; 1Y5K B; 3MJP A; 1UFJ A; 1DO7 A; 5AZQ A; 2VLX A; 3OZW A; 2QSS A; 5AZR A; 1OFJ A; 2DN3 A; 1LH3 A; 1YE0 B; 4M4A B; 3GYS A; 3ZJN A; 1JY7 A; 1CG8 B; 4MQJ A; 1LFQ B; 2MGE A; 3A59 A; 1MOA A; 1THB B; 1Y7C A; 2WY4 A; 5JDO C; 1Y0C A; 1BZ6 A; 3GOU A; 1BUW A; 3HHB B; 1C7C A; 1Y2Z A; 1N9X A; 1MBA A; 2O5S X; 2ZT1 A; 1K0Y B; 3QJB A; 1C7D B; 4ZVA A; 3WCW B; 1SWM A; 3IC0 A; 1VXH A; 1C7B B; 2D5X B; 2RAO B; 3AT6 B; 1Y4B B; 4H07 A; 2DN1 B; 1DUK A; 2MYE A; 2D60 B; 2D6C A; 1NWI A; 1J7Y B; 2SPO A; 3ZJP A; 2LHB A; 2V1G A; 4F6J A; 3NML A; 2SPM A; 1MLK A; 2O5L X; 3NG6 A; 2G0Z A; 3EOK B; 1GLI B; 3P5Q B; 1Y35 A; 1A9W E; 3WTG A; 3QJE A; 2ZLW B; 2G10 A; 1XZV A; 2JHO A; 5CMV A; 5MBN A; 1IOP A; 2MBW A; 3UHQ A; 2ZST A; 1CLS A; 2QFK A; 1B86 A; 1HGA A; 1Y4F B; 1Y83 A; 2BW9 M; 3R5I A; 2MHB A; 3LB2 A; 1Y0D A; 4HHB B; 1CPW A; 1NPG A; 1O1P A; 2HHE B; 1DXD A; 3UHG A; 3WFX A; 2D2M A; 3B75 B; 1XZ4 A; 1MLS A; 1MLJ A; 5HAV A; 4O35 A; 1YEV A; 1YG5 B; 1O1M A; 3HRW A; 1A3O A; 5JDO E; 1JF3 A; 2DC3 A; 4JYQ A; 2E2Y A; 4F68 A; 2H8F A; 4UIQ A; 1O1L B; 1LTW A; 5SW7 A; 1NZ4 A; 1R1X B; 3NFE B; 2H8D B; 1FLP A; 3WCW C; 3QM9 A; 1A6N A; 1M9P A; 3IC2 B; 2YRS A; 1NQP B; 3PI8 B; 1MYG A; 4C0N A; 2R4Z A; 1CH5 A; 1Y8I A; 3QQR A; 1ABY A; 4HRR B; 1XZU A; 2MGK A; 1HBR A; 2AUQ A; 3D1A B; 1MLM A; 1O1K A; 1JL7 A; 2AV3 A; 1Y4P B; 3BOM B; 2AUP A; 1T1N A; 1BIJ A; 1Y22 B; 1MBI A; 3VRF B; 2D2N A; 2HHD A; 5KDQ B; 1SDK A; 1NEJ B; 2ZSS A; 4MPM A; 1BUW B; 1CQ2 A; 4OOD A; 1C7C B; 1Y2Z B; 2EKT A; 1MYM A; 5B84 A; 2DHB B; 3SZK B; 4AVE A; 1SPG B; 2V1K A; 3MKB B; 5EE4 C; 1CH9 A; 5CND A; 3UHH A; 2Z6N A; 4C44 A; 1YOI A; 2NRL A; 4FH6 A; 3UHX A; 1O1O A; 3NL7 A; 1YGF B; 4O2G A; 1LH1 A; 4L7Y B; 3UHB A; 5HLX A; 1RVW A; 4FWZ A; 2DXM B; 1A0Z B; 1OUT B; 2LH7 A; 1A9W A; 1BZR A; 1SHR B; 1HGC B; 5CNF A; 1QXE B; 2XYK A; 3QM5 A; 1YHU D; 2G14 A; 1BIN A; 1XZ2 B; 3U3E A; 1DXT A; 1LUE A; 1J7W B; 2G3H A; 1OBM A; 101M A; 4ESA A; 1Y35 B; 6HBW B; 2HBE A; 1IT2 A; 1N9H A; 1GVH A; 1YIE B; 1XZV B; 5JDO F; 1DLY A; 1AJ9 A; 1M6C A; 1CG5 B; 3ZOL A; 1TES A; 1PBX A; 5CN7 A; 3QMA A; 3LB3 A; 1QPW A; 1COH B; 1HLB A; 2FRK X; 3PI4 A; 1MOD A; 2MGB A; 1LFT A; 3UH5 A; 5CN9 A; 3OGB A; 3RJN B; 2ZT0 A; 1HBB A; 1Y8K A; 4ILZ A; 4M4B A; 3KUO A; 5ILP A; 2AA1 B; 2HBC A; 3R5I B; 4SDH A; 3BJ3 A; 4ROL A; 3D4X A; 1RQ3 A; 1YHU B; 3ED9 A; 1XCH A; 4PQC A; 1BZP A; 1Y0T A; 4LPI A; 1HCO A; 1MBS A; 3G4U A; 3MOU A; 2VM0 A; 2O5B X; 2HBG A; 1G0A B; 1CH2 A; 4AVD A; 3O89 A; 1J3F A; 1FDH A; 5ILM A; 1O1N A; 3D1K A; 4IRO A; 1J3Y A; 3GQP A; 1MWC A; 1XXT A; 3UHW A; 1Y7Z A; 4X0L B; 3VAU A; 1M9P B; 1ITH A; 4NXC A; 3DUT A; 1NWN A; 3S48 C; 3G4V A; 3MJU B; 1ABY B; 1UIW A; 1YHR A; 1A6G A; 2PEG A; 3A5G A; 1MCY A; 1DWT A; 3DHT A; 3UH7 A; 3VRG A; 1U7R A; 1V07 A; 2W6V B; 1MYZ A; 4N7N A; 1T1N B; 1V4U B; 2HBS A; 1Y5K A; 1YEN A; 4F6G A; 1YOH A; 3ZH0 A; 3WCP B; 1OJ6 A; 1PMB A; 3UHY A; 1DTI A; 2MGM A; 2HBD A; 1Y31 B; 1HJT A; 4H2L B; 1F5P A; 4M4A A; 2KSC A; 1DXV B; 4GZG A; 5HY8 B; 1LFQ A; 1JDO A; 4MXK A; 1THB A; 3H57 A; 1YHU C; 3WR1 B; 3E5O A; 1Y45 B; 1MBC A; 4PQB A; 1Y8W A; 5F2A A; 2ZLT B; 4G51 B; 1Y09 B; 1AJH A; 1K1K B; 2D5X A; 2RAO A; 3AT6 A; 2O5M X; 1Y4B A; 1QSH A; 4TYX A; 2ZT2 A; 4NI1 B; 2DN1 A; 1LFL A; 2D60 A; 1Y5F A; 3WI8 A; 2M6Z B; 2ZSY A; 1J7Y A; 5HLU A; 4HSW A; 3K8B A; 4MQH A; 4M4B B; 1UVX A; 5B85 A; 1DXU B; 2HBC B; 3ONZ B; 3MN0 A; 5CHQ A; 2GL3 A; 1V4X B; 3EOK A; 3D4X B; 1VXD A; 2BLJ M; 3QZZ A; 3UHS A; 2WTH A; 1EBC A; 1MBN A; 3WFU A; 2HCO A; 2ZLW A; 2O5T X; 3ARK A; 2ZFB B; 2D5Z B; 2EF2 A; 1W92 A; 1CH3 A; 5M3S A; 109M A; 1HRM A; 2D2N C; 3DR9 A; 1QSI A; 3CY5 A; 2ZS0 D; 1JP6 A; 1J3Y B; 7HBI A; 4HHB A; 4B3W A; 1Y5J B; 3G4Y A; 1MLF A; 1XXT B; 1JL6 A; 3AQ8 A; 5C6E B; 1NAZ A; 1NS6 A; 2HHE A; 1IDR A; 1Y7Z B; 3QJD B; 2ZFO D; 3WCU D; 3M39 A; 1NPF A; 1S5X B; 2SPL A; 4WJG 1; 3G52 A; 2C0K A; 1YG5 A; 1BAB B; 1F5O A; 1DKE A; 1UIW B; 1YHR B; 1YOG A; 5CNE A; 3E5I A; 5JOM A; 2OHB A; 3VRG B; 1HAC B; 1O1L A; 1G09 B; 3UGY A; 1RTE A; 1LA6 B; 1MLQ A; 1MNJ A; 1R1X A; 2GTL D; 2ZS0 B; 3NFE A; 2H8D A; 1YEN B; 1O1J B; 3IC2 A; 1J41 A; 1NQP A; 3PI8 A; 1BZ1 B; 1NZ2 A; 2ZFO B; 2HBD B; 3WCU B; 4HRR A; 3OJ1 A; 5D1V A; 1LH5 A; 1GCW A; 1MTI A; 3D1A A; 2EB8 A; 1HGB B; 5IKS A; 1Y4P A; 2ZSP A; 3BOM A; 1VXF A; 1EMY A; 3KMF A; 2SPN A; 2QSP B; 3ZJR A; 1Y4Q B; 1Y22 A; 4KMV A; 3LR7 A; 1URY A; 3VRF A; 5KDQ A; 1NEJ A; 3UGZ A; 1S69 A; 2GTL B; 2DHB A; 3SZK A; 2CMM A; 3QZX A; 1SPG A; 3CIU B; 1HBA B; 1Y8W B; 3MKB A; 3IXF A; 1BVD A; 3RGK A; 2AUO A; 1YGF A; 3ZJL A; 1QSH B; 4L7Y A; 1HBG A; 2DXM A; 1UT0 A; 1LFL B; 1A0Z A; 1OUT A; 1Y4R B; 1BBB B; 1Y5F B; 5CN5 A; 1SHR A; 1HGC A; 3UHE A; 1QXE A; 1A0U B; 1ASH A; 2R50 A; 3E4N A; 3K8B B; 4MQH B; 1CP5 A; 2EVP A; 2QU0 B; 1XZ2 A; 3OVU C; 1J7W A; 1G0B B; 2MGL A; 1F65 A; 2HCO B; 6HBW A; 1YMB A; 1YIE A; 3GKV A; 2BK9 A; 1CG5 A; 1OR6 A; 2W72 B; 2Z8A A; 1COH A; 2ZS0 C; 4WCH D; 1QSI B; 3CY5 B; 1FDH G; 2AA1 A; 1CP0 A; 1Y8H B; 2GNW A; 2G0S A; 3A9M A; 4F6F A; 1MOC A; 4U8U D; 2ZFO C; 2W6X A; 1YHU A; 1WMU B; 3SDH A; 3ZOM A; 1NS6 B; 3EDA A; 3GQR B; 2G11 A; 1HDA A; 3LR9 A; 2V1J A; 4OF9 A; 1D8U A; 2PGH A; 2V1E A; 3WCV D; 1I3E A; 3PT8 A; 1G0A A; 4DC8 A; 1LFY B; 1DKE B; 1MOH A; 4MAX A; 1Z8U B; 4HBI A; 5EET A; 3ARJ A; 102M A; 3GQG A; 3OO5 A; 3HC9 A; 1GBV B; 1Y01 B; 2GTL C; 1EWA A; 3DHR B; 3RJ6 A; 1YGD B; 3UHC A; 3PIA A; 1AJG A; 3GLN A; 4X0L A; 1KFR A; 1MKO B; 1J41 B; 4U8U B; 3UHD A; 3FH9 B; 5ILR A; 1J7S B; 3ARL A; 3MJU A; 1J40 B; 4G1B A; 108M A; 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2HBF B; 4NZI A; 1KD2 B; 1DO4 A; 3PT7 A; 3GQG B; 3M3B A; 3OO5 B; 1Y5J A; 1JZL A; 3WHM B; 4NK1 A; 5C6E A; 3PIA B; 1QI8 B; 2MYC A; 3BCQ B; 3QJD A; 5CN6 A; 3O7N A; 2OH9 A; 5E83 B; 1S5X A; 1BAB A; 1NIH A; 1MDN A; 1RSE A; 3PI9 B; 2AUR A; 3TLD A; 1FSL A; 3ZHW A; 1GZX A; 3ZJH A; 1GDI A; 1HAC A; 4NXA A; 3ASE A; 1G09 A; 2VEB A; 1LA6 A; 1EW6 A; 1BZ0 B; 4ROM A; 2ZSZ A; 1Y4G B; 2ZS0 A; 1VXE A; 1HLM A; 1O1J A; 2R80 B; 1BZ1 A; 4L2M A; 1MOB A; 5EU2 A; 1LH7 A; 1MTK A; 2ZFO A; 1FSX B; 3WCU A; 3ODQ A; 3HF4 B; 1Y85 B; 1C40 B; 2ZLX B; 1IWH B; 3BJ1 B; 3AG0 A; 1HGB A; 3ECX A; 1UX8 A; 2GKN A; 2LH1 A; 1GJN A; 1V4W B; 2QSP A; 1Y4Q A; 1LJW B; 2ZT3 A; 1MZ0 A; 3IA3 B; 4MQG B; 2H35 A; 1MLR A; 1DO1 A; 2NSS A; 2GTL A; 2EVK A; 1HBA A; 3CIU A; 3AQ9 A; 1YCB A; 1A3N B; 3QM7 A; 1CBM A; 2W6Y A; 3AQ6 A; 1CMY A; 1FHJ B; 1S0H B; 1CO8 A; 1CIO A; 4JAC A; 3M38 A; 2GRF A; 104M A; 5HLQ A; 1HBS B; 1MYH A; 5AB8 A; 1Y4R A; 1BBB A; 5EV5 A; 1OUU B; 1A0U A; 1HV4 B; 1FAW B; 2QU0 A; 2ZS1 D; 1HAB B; 3SDN A; 3UBV A; 3UHK A; 1MLN A; 3G4W A; 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