The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGKVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically crosslinked hemoglobin: a structural study.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VRG B; 2DN1 A; 5SW7 B; 3GYS B; 4AVE A; 5JDO C; 1J7S A; 1Y0A A; 1HHO B; 4MQI B; 1VWT B; 3WCU B; 4ODC A; 1HBB B; 2R4Y A; 3BOM B; 3HF4 B; 5EYJ A; 1YEO A; 3NFE A; 2HHE A; 1DXV B; 2DN2 B; 1SDL A; 2RI4 B; 3ONZ A; 3ZJL A; 3MKB A; 1Y7G B; 2EVK A; 3QJC B; 1CBM A; 1YEQ B; 3S48 C; 4M4A B; 1XZ7 B; 4MQC A; 1URY A; 3GYS A; 1Y2Z B; 1HHO A; 4MQI A; 3WCU A; 1EBT A; 2EKU A; 2LH5 A; 1HBB A; 3BOM A; 3HF4 A; 3HXN B; 3ZJS A; 1MYJ A; 3UI0 A; 1YHR B; 1ASH A; 3ZJM A; 1GJN A; 1K1K B; 2RI4 A; 1DM1 A; 2VLY A; 2ZFO D; 1Y0T B; 4YU3 B; 1F65 A; 1V75 B; 1T1N B; 1Y7G A; 4N7N B; 3QJC A; 1YEQ A; 4HSW A; 1B0B A; 3RJ6 A; 3HEN A; 3M3A A; 1OBM A; 1HGA B; 1Y2Z A; 1BUW A; 1Y4V A; 1MLM A; 1Y8W B; 3ECL A; 3VRE B; 1LFT B; 3EOK A; 1MLK A; 4F6B A; 1YHR A; 2QSS A; 4XS0 B; 1YG5 B; 1G0B B; 1J3Y A; 1Y7C A; 1K1K A; 1C40 A; 109M A; 3QJB A; 3ZJP A; 4YU3 A; 1UX9 A; 1V75 A; 1AJG A; 4HRT B; 1IT3 A; 1U7R A; 4U8U D; 2BWH A; 5ILM A; 1CH2 A; 1HGA A; 2PGH B; 5EU2 A; 5EET A; 1O1I B; 1Y8W A; 1JW8 A; 1YEU B; 3P5Q B; 3VRE A; 2SPM A; 1G9V A; 5CHR A; 1YVT A; 3GDJ B; 3UHG A; 1YG5 A; 1CLS B; 4WJG A; 1XZV A; 1MYH A; 3WFT A; 4HRT A; 1R1X B; 1LUE A; 3UBV A; 3G4Q A; 1FSX B; 3WCT C; 1MLN A; 1DXT B; 4ROL B; 1CMY A; 1EBC A; 4JAC A; 1Y85 A; 4MQG A; 3OZW A; 1MTK A; 5AZR A; 3ARL A; 2PGH A; 3PI9 B; 1MLH A; 1O1I A; 2W72 C; 3PT7 B; 2D5Z A; 1J3Z B; 1A9W A; 3P5Q A; 5CNE A; 2V1G A; 5CNG A; 1FCS A; 5CN7 A; 2MYA A; 3GDJ A; 1O1O B; 2ZLW B; 1NPG A; 1CG8 A; 1CLS A; 1CH3 A; 5F0B A; 4ZVB A; 3HHB A; 1CH9 A; 2H35 B; 2PEG B; 1FSX A; 106M A; 1JDO A; 1DXT A; 1Y4Q B; 4ROL A; 3PI9 A; 3PI2 A; 3PT7 A; 3ECZ A; 3DUT B; 1LH2 A; 3KUN A; 3A0G B; 1MLQ A; 4FWX A; 1XXT B; 2ZT0 A; 3DHR A; 2R80 B; 4MU5 A; 3E55 A; 1C7B B; 1MLU A; 3QJE A; 1O1J B; 1DUK A; 2H35 A; 1GBU A; 1K0Y B; 2HBD B; 1VXC A; 1BBB B; 4N7O B; 3WCU C; 1UVY A; 2VYZ A; 1J7W B; 1A3N B; 1M6M A; 4DC7 A; 1WLA A; 1V4W B; 3DUT A; 112M A; 2ZSQ A; 3BCQ B; 3LB4 A; 1X9F A; 1C7B A; 1YCA A; 3G4V A; 2G10 A; 1QSI A; 5EOH A; 1K0Y A; 2HBD A; 3UHY A; 4N7O A; 2ZT4 A; 1XZ5 B; 5HU6 B; 1GBV B; 1A9W E; 1J7W A; 1A3N A; 1FDH A; 2ZT3 A; 1GVH A; 3BJ2 A; 4WCH D; 2NSR A; 4H2L B; 1V4W A; 5CMV A; 2ZSX A; 3BJ1 B; 2ZS0 D; 2LH1 A; 1H1X A; 4YU4 A; 2ZLU B; 1GLI B; 2EKT A; 1GCW B; 1QXD A; 2LH7 A; 1Y35 B; 3ZJQ A; 5HAV A; 4F6J A; 5AB8 A; 1O1P A; 1XZ5 A; 1A3O B; 5HU6 A; 1VRE A; 1QI8 B; 1RTE A; 3UHC A; 1HAB B; 2GNV A; 2QRW A; 3A2G A; 1CH5 A; 4H2L A; 3BJ1 A; 1VXF A; 1DO3 A; 1NS6 B; 2ZLU A; 1GLI A; 1DXD A; 1BZZ B; 1GCW A; 3A5G A; 4JYQ A; 1QXE A; 4MPM A; 1Y35 A; 1QSH B; 3PT8 B; 4KMW A; 3K3U A; 1SDK A; 3TM3 A; 3ZJJ A; 3WCW A; 2D60 A; 3CIU B; 1IBE B; 1HBS B; 4FH6 A; 1HAB A; 2MGB A; 2ZSO A; 5D5R A; 3VRF B; 1D8U A; 1NGK A; 3QZX A; 3ZOL A; 1NS6 A; 3HYU A; 1FSL A; 1BZZ A; 1LH3 A; 1PMB A; 2BLJ M; 4PQ6 A; 1BIN A; 4FWZ A; 2ZST A; 1V4U B; 1HAC A; 1QSH A; 2GTL D; 3UHD A; 1JEB B; 1HRM A; 1IBE A; 1HBS A; 1NIH B; 3HEO A; 1J40 B; 3ZJO A; 3QMA A; 2W6Y A; 4G51 A; 4FC3 B; 1YDZ A; 1N9H A; 2WTH A; 1R1Y B; 3QQR A; 2VM0 A; 3FH9 B; 1LFZ A; 1SPG B; 3LHB A; 3PI4 A; 3V2Z A; 4HRR B; 1S61 A; 2MYC A; 4FH7 A; 1AJH A; 1HV4 B; 4AVD A; 1JEB A; 1Y31 B; 3AT6 B; 3PI1 A; 5HY8 A; 3MVC A; 2GKM A; 1NIH A; 1J40 A; 3D17 B; 2NSS A; 1SHR B; 4FC3 A; 2MHB A; 1KD2 B; 2WTG A; 1R1Y A; 2DC3 A; 5M3S A; 3UHK A; 1HGB B; 1JZM A; 3FH9 A; 1SPG A; 1CP0 A; 1HDS B; 1MBC A; 3SDH A; 1ITH A; 1MGN A; 4HRR A; 1YFF A; 1JZL A; 1N9F A; 1HV4 A; 4MXL A; 2O5B X; 1EW6 A; 1HBH B; 1Y31 A; 2HBF A; 1L2K A; 3D17 A; 1NWN A; 4F6F A; 1SHR A; 2R4W A; 1SPE A; 2ZFB B; 3ZJH A; 1KD2 A; 5CN6 A; 3QM5 A; 1OR6 A; 1MYZ A; 3GOU A; 1MLO A; 2M6Z B; 4MQJ B; 1HGB A; 2MGM A; 1MOB A; 2MGC A; 5JDO E; 1MBD A; 1CH1 A; 2HZ3 A; 1J3F A; 1VXE A; 1DXU B; 4O4Z A; 1CH7 A; 3UH6 A; 5KDQ A; 3QM6 A; 2BNL A; 1DTI A; 2VRY A; 4ZVA A; 2O5T X; 4F6I A; 2ZS1 B; 3G46 A; 3AQ5 A; 1BZ0 A; 2ZFB A; 3IC0 B; 2BLH A; 4B4Y A; 4F4O B; 5D1V A; 1DUO A; 2QSP B; 4MQJ A; 3UHT A; 3HRW B; 3QZZ A; 2ZSZ A; 1G09 B; 1BZ1 B; 1S5X B; 4HBI A; 3EDB A; 1RTX A; 1C7C B; 4NZI A; 1Y8K B; 1CG5 B; 5IKS A; 2V1J A; 2W72 A; 1UMO A; 1Y09 B; 4F6G A; 2ZS1 A; 1RPS B; 3OO5 B; 5EV5 A; 4O35 A; 3IC0 A; 2YRS B; 1HJT A; 1C7D B; 3NL7 B; 2QSP A; 1HBA B; 3MJP B; 1MYG A; 4ESA B; 3TLD A; 1BZ1 A; 1Y5J B; 1DTM A; 3UHR A; 1C7C A; 3NML A; 1N9I A; 2OHB A; 3NMM B; 1JP6 A; 5KER B; 1YH9 B; 2AUQ A; 3DR9 A; 1MKO B; 1JY7 B; 4MQK A; 111M A; 2Z6T A; 1BVC A; 2GDM A; 5HBI A; 1LH1 A; 3ASE A; 1LFV A; 3OO5 A; 3TM9 A; 1V4X A; 4F69 A; 2B7H B; 3LQD A; 2YRS A; 2QFN A; 2HCO B; 1C7D A; 3AQ7 A; 3NL7 A; 4X0L B; 1A01 B; 1YIH B; 2GRF A; 1HBA A; 3A59 B; 1KR7 A; 3VRG A; 3S1J A; 1F63 A; 5SW7 A; 5HLX A; 4ESA A; 1IDR A; 1MBO A; 4MBA A; 3M38 A; 1VWT A; 3NMM A; 5KER A; 1YH9 A; 1OJ6 A; 4H0B A; 1A6G A; 4O4T A; 1MKO A; 2DN3 B; 1JF3 A; 1JY7 A; 5EUI B; 1Y4R B; 1DXV A; 5F2A A; 2DN2 A; 2MGJ A; 2GTL B; 1HBG A; 1YEV B; 1NZ3 A; 2D6C A; 4NK2 A; 2V1H A; 2AUR A; 3AG0 A; 1HDA B; 4M4A A; 2HCO A; 1XZ7 A; 110M A; 1IRD B; 1A01 A; 3A59 A; 3M3B A; 4TWU A; 4WJG 1; 3GK9 A; 3WCV D; 1OUU B; 1YVQ B; 3HXN A; 1XCH A; 1Y83 B; 2DN3 A; 2MB5 A; 1Y7D B; 2HHD B; 2Z6N B; 4MXK A; 5EUI A; 1Y4R A; 1HCO B; 1JF4 A; 3MYM A; 2GTL A; 5CN5 A; 1Y0T A; 2LHB A; 1Y8H B; 1T1N A; 1FHJ B; 4N7N A; 1HDA A; 2QLS B; 3AT5 B; 104M A; 4SDH A; 1HBR B; 2ZSN A; 3ARJ A; 1BJE A; 2O5S X; 1NPF A; 1LFT A; 5JDO F; 1YVQ A; 2G0S A; 1UT0 A; 4XS0 A; 2HHD A; 1G0B A; 2Z6N A; 1LH5 A; 3E5O A; 5CN9 A; 2D2M B; 1HBI A; 1DO7 A; 4UIQ A; 1Y8H A; 1IWH B; 3UH3 A; 5EE4 D; 1FHJ A; 1FDH G; 5MBA A; 1UFJ A; 1Y45 B; 2QLS A; 1NS9 B; 1HBR A; 2SPL A; 1BAB B; 2BMM A; 1EMY A; 3WFW A; 1A0Z B; 2O5M X; 3EU1 B; 3K9Z A; 1YEU A; 4KJT A; 1B86 B; 2W6V B; 1MWC A; 1YMC A; 1YIE B; 2ZS1 C; 1KFR A; 2FAM A; 3UHH A; 3D4X B; 2D2M A; 1R1X A; 4ILZ A; 1Y45 A; 1G0A B; 1NS9 A; 3MBA A; 2SPN A; 2VYW A; 1BAB A; 1OFK A; 1O16 A; 2V1K A; 3M39 A; 1UFP A; 5EYS A; 1V5H A; 1A0Z A; 3ZOM A; 4G1B A; 1OFJ A; 1J3Z A; 2W6V A; 4MAX A; 3ZJN A; 3GQP B; 4L7Y B; 3ODQ B; 1NZ5 A; 5HLU A; 1YIE A; 1O1O A; 2ZLW A; 3GQR B; 4TYX A; 1NEJ B; 1A6M A; 5EQM A; 4IRO B; 2PEG A; 4OF9 A; 1G0A A; 1MOD A; 1Y4Q A; 1MLS A; 5B84 A; 1XZU B; 2MGD A; 4GZG A; 2RAO B; 1CO8 A; 1MOC A; 1A4F B; 1Y8I B; 1CO9 A; 1YZI B; 3A0G A; 3ODQ A; 5C6E B; 1XXT A; 108M A; 2R80 A; 1O1J A; 1ABW B; 4KN3 A; 3OK5 A; 7HBI A; 2R1H B; 4IRO A; 1OUT B; 2MGG A; 2MYE A; 1BBB A; 3WCT D; 1MNI A; 1XZU A; 2RAO A; 3D1A B; 1EWA A; 3A5A A; 3BJ3 B; 3KMF A; 1DWT A; 2ZSS A; 3G4Y A; 3GQG B; 1A4F A; 1BZR A; 1JP9 A; 1Y8I A; 4NXC A; 2GTL C; 3BCQ A; 1YZI A; 5C6E A; 1RVW B; 1N9X A; 4B3W A; 5ILE A; 2EVP A; 2NRL A; 4F68 A; 2R1H A; 3VAU A; 1MOA A; 1MNJ A; 1ABS A; 2D2N D; 2ZFO B; 1Q1F A; 2W31 A; 3LB2 A; 3WHM B; 1GBV A; 1CH4 A; 1U7S A; 107M A; 1DO4 A; 3BJ3 A; 3GQG A; 1MDN A; 1WMU B; 1S5Y B; 1MWD A; 1YOH A; 1XQ5 B; 4LPI A; 1RVW A; 2D5X B; 1O1N B; 1GDL A; 3WCV B; 3D7O B; 1GDK A; 3E4N A; 3DHT B; 2G11 A; 3UHI A; 4H07 A; 2BKM A; 2ZFO A; 4C0N A; 2LH2 A; 1GCV B; 1A3O A; 1QI8 A; 1XY0 B; 4HHB B; 1A6K A; 4U8U B; 1BZP A; 2FAL A; 1MLJ A; 1DKE B; 2O5L X; 1WMU A; 1BIJ B; 1S5Y A; 2D2M C; 1Y4B B; 3LR9 A; 2MGH A; 1XQ5 A; 3MJU B; 2GKN A; 2D5X A; 1O1N A; 3MN0 A; 2O5O X; 3QM7 A; 5JOM A; 3PT8 A; 1GZX B; 1MBN A; 3FS4 B; 4BJA A; 2ZT1 A; 2G3H A; 3UHQ A; 3CIU A; 2LH6 A; 1Y0W B; 1GCV A; 2EB8 A; 1O1L B; 1XY0 A; 4HHB A; 3VRF A; 4U8U A; 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2D2N B; 2XKI A; 1GDJ A; 5C6Y A; 1FN3 A; 2BK9 A; 4F4O A; 1X9F D; 3WCV C; 3D1K A; 4ODC B; 3G4R A; 2GRH A; 4M4B B; 4NI1 B; 1RQ3 B; 3HRW A; 2ZWJ A; 105M A; 1G09 A; 2Z6S A; 1S5X A; 3NFE B; 2AV0 A; 2ZS0 A; 4O1T A; 1XZ4 A; 2XKG A; 1Y8K A; 1CG5 A; 4NXA A; 1AZI A; 4ROM B; 3WCP B; 3WFU A; 4IT8 A; 4U8U C; 4MQC B; 2HZ2 A; 1PBX A; 2XYK A; 1Y09 A; 1MTJ A; 2D2N A; 1RPS A; 1A6N A; 1X3K A; 1IT2 A; 2FRK X; 1SI4 B; 4KMV A; 1LA6 B; 2JHO A; 3WI8 A; 2BW9 M; 1IOP A; 4M4B A; 4NI1 A; 1RQ3 A; 3MJP A; 3HEP A; 2G0Z A; 1Y5J A; 5CN4 A; 3G4U A; 3LB1 A; 1J52 A; 1YCB A; 2W6W A; 5EE4 C; 4ROM A; 3WCP A; 1Y01 B; 3PI8 B; 1MNO A; 1ABY B; 3UHE A; 2OIF A; 1CIK A; 2HBC B; 1ECO A; 4DC8 A; 3G52 A; 1BUW B; 1IRC A; 2B7H A; 1Y4V B; 1SI4 A; 1LA6 A; 1URV A; 2EF2 A; 3EOK B; 4X0L A; 1MWB A; 4VHB A; 1YIH A; 4C44 A; 2G0V A; 2QSS B; 3E5I A; 3VHB A; 1QPW B; 2KSC A; 1J3Y B; 1Y7C B; 1VXH A; 2ZT2 A; 3WCW D; 1C40 B; 1Y22 B; 3QJB B; 1VRF A; 3PI3 A; 1Z8U B; 2MYB A; 3PI8 A; 1ABY A; 3S1I A; 2AUO A; 3KUO A; 2O58 X; 1ECN A; 6HBW B; 1YEV A; 2HBC A; 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